Патенты автора Танас Александр Сергеевич (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии. Представлен способ выявления и анализа аномально метилированных геномных участков в биологических материалах пациентов с острым миелоидным лейкозом. Способ предусматривает выделение геномной ДНК, гидролиз выделенной ДНК метилчувствительной эндонуклеазой рестрикции, метилчувствительную полимеразную цепную реакцию с разделением каждого образца на три части с образованием трех пулов, которые амплифицируют с разными группами праймеров, с последующей детекцией аномального метилирования фрагментов ДНК с помощью аналитического гель-электрофореза, что приводит к формированию системы маркеров дифференциального метилирования ДНК. Изобретение позволяет идентифицировать все молекулярные подтипы острого миелоидного лейкоза и обеспечивает высокую чувствительность метода по отношению к выявлению аномального метилирования в избытке нормального биологического материала. 7 з.п. ф-лы, 3 ил.

Изобретение относится к области биотехнологии и касается способа приготовления геномных библиотек ограниченных выборок локусов из деградированной ДНК. Способ включает проведение гидролиза геномной ДНК эндонуклеазой рестрикции, формирующей фрагменты с 5'-липким концом, и частичное тупление концов полимеразной реакцией в присутствии неполного набора дезоксирибонуклеозидтрифосфатов. Лигирование фрагментов с адаптерами с липким концом, комплементарным модифицированному частичным туплением липкому концу целевого фрагмента, отбор целевых фрагментов совместно селекцией по длине фрагментов и амплификацией с праймерами, комплементарными адаптерам. Последовательный гидролиз геномной ДНК можно проводить двумя эндонуклеазами рестрикции, формирующими различные липкие концы фрагментов, - сначала чувствительной к химической модификации нуклеотидов эндонуклеазой рестрикции, затем ее нечувствительным к модификации изошизомером. При амплификации фрагментов библиотеки используют праймеры, содержащие: участок, комплементарный адаптерам, участок, комплементарный остатку сайта узнавания эндонуклеазы рестрикции, и участок специфического удлинителя длиной 1-4 нуклеотида на 3' конце праймера для ограничения выборки локусов библиотеки. Представленное изобретение позволяет получать геномные библиотеки образцов деградированной ДНК за небольшое время и с высокой селективностью в отношении целевых фрагментов. 2 ил.

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к способу формирования систем маркеров метилирования ДНК

 


Наверх