Патенты автора Леденева Маргарита Леонтьевна (RU)
Изобретение относится к генной инженерии, микробиологии, вирусологии. Предложен рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli JM 109 2-428, предназначенный для использования в качестве положительного контроля при оценке эффективности амплификации кДНК West Nile virus 2 генотипа. Штамм является продуцентом рекомбинантной плазмиды pWNV2protC, несущей фрагмент генома West Nile virus 2 генотипа размером 428 п.н., представляющий собой последовательность 5'-нетранслируемой области генома и участок гена полипротеина West Nile virus, кодирующего капсидный белок. Штамм депонирован в Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Роспотребнадзора под номером КМ 2050. Изобретение обеспечивает эффективную репликацию и выделение рекомбинантной плазмиды pWNV2protC с высоким выходом. 2 ил., 3 пр.
Изобретение относится к генной инженерии. Предложен рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli JM 109 1-430, предназначенный для использования в качестве положительного контроля при оценке эффективности амплификации кДНК West Nile virus 1 генотипа. Штамм является продуцентом рекомбинантной плазмиды pWNV1protC, несущей фрагмент генома West Nile virus 1 генотипа размером 430 п.н., представляющий собой последовательность 5'-нетранслируемой области генома, и участок гена полипротеина West Nile virus, кодирующего капсидный белок. Штамм депонирован в Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Роспотребнадзора, номер КМ 2049. Изобретение обеспечивает эффективную репликацию и выделение рекомбинантной плазмиды pWNV1protC с высоким выходом. 2 ил., 3 пр.
Изобретение относится к области генной инженерии, микробиологии, вирусологии. Предложен рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli JM 109 4-162, предназначенный для использования в качестве положительного контроля при оценке эффективности амплификации кДНК West Nile virus 4 генотипа и являющийся продуцентом рекомбинантной плазмиды pWNV4protC. Указанная плазмида pWNV4protC несет фрагмент генома West Nile virus 4 генотипа размером 162 п.н., представляющий собой участок гена полипротеина West Nile virus, кодирующего капсидный белок. Предложенный штамм депонирован в Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ Российского научно-исследовательского противочумного института «Микроб» Роспотребнадзора под номером КМ 2051. Изобретение может использоваться для конструирования и производственного изготовления наборов реагентов для выявления и дифференциации генотипов West Nile virus. Изобретение обеспечивает эффективную репликацию и выделение рекомбинантной плазмиды pWNV4protC с высоким выходом. 2 ил., 3 пр.
Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной биологии. Предложен набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации РНК возбудителей сапа Burkholderia mallei и мелиоидоза Burkholderia pseudomallei на основе транскрипционной амплификации NASBA в режиме реального времени. Изобретение может быть использовано для выявления РНК возбудителей сапа Burkholderia mallei и мелиоидоза Burkholderia pseudomallei в пробах чистых культур, биологическом материале и объектах окружающей среды для нужд здравоохранения, службы Роспотребнадзора и в научных исследованиях. 1 ил., 1 табл., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии, молекулярной биологии, эпидемиологии. Изобретение может быть использовано для внутривидовой дифференциации штаммов Histoplasma capsulatum специалистами референс-центров по мониторингу за возбудителями инфекционных болезней, а также научно-исследовательских организаций эпидемиологического и микробиологического профиля. Целью настоящего изобретения является разработка набора олигонуклеотидных праймеров для внутривидового типирования микромицетов Н. capsulatum методом амплификации дифференцирующих участков геномной ДНК. Цель достигается конструированием набора специфичных олигонуклеотидов для внутривидового типирования штаммов возбудителя гистоплазмоза путем амплификации 7 дифференцирующих фрагментов ДНК Н. capsulatum, обладающих активностью прямого и обратного праймеров в реакции амплификации, имеющих следующую структуру:
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR3 длиной 504 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR7 длиной 199 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR8 длиной 172 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR9 длиной 166 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR10 длиной 188 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR11 длиной 173 п. н.;
для амплификации дифференцирующего фрагмента HcDFR12 длиной 134 п. н. Разработанный набор олигонуклеотидных праймеров для типирования штаммов возбудителя гистоплазмоза Histoplasma capsulatum методом амплификации дифференцирующих фрагментов ДНК позволяет проводить внутривидовое генетическое типирование штаммов Н. capsulatum с высокой воспроизводимостью и разрешающей способностью, а также относительно низкой стоимостью. В предлагаемом методе используется только оборудование для проведения ПЦР с соответствующими реагентами, что может способствовать широкому внедрению данного молекулярно-генетического подхода в научно-исследовательских организациях и специализированных лабораториях эпидемиологического и микробиологического профиля. 2 ил., 2 табл., 3 пр.
Изобретение относится к области биотехнологии, молекулярной биологиии. Представлен набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченого зонда для идентификации ДНК возбудителей кокцидиоидомикоза С. immitis и С. posadasii методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией результатов, содержащего пару олигонуклеотидов, обладающих активностью прямого и обратного праймеров, и зонд с комплементарными концевыми последовательностями по типу «молекулярного маяка», имеющих следующую структуру:
Использование разработанного набора олигонуклеотидных праймеров CimMBP3s/CimMBP4as и флуоресцентно-меченого зонда Pf-MBP-1 позволяет в короткий срок с высокой чувствительностью и специфичностью проводить идентификацию ДНК возбудителей кокцидиоидомикоза С. immitis и С. posadasii в пробах чистых культур, биологическом материале и объектах окружающей среды. 1 ил., 1 табл., 3 пр.
Изобретение касается набора флуоресцентно-меченых олигонуклеотидных зондов для типирования штаммов Burkholderia mallei. Входящие в состав набора зонды имеют структуру «шпильки» с флуорофором и гасителем флуоресценции на концах и обладают комплементарностью к продуктам реакции амплификации с праймерами. Разработанный набор гибридизационных зондов может быть использован для флуоресцентной детекции результатов типирования возбудителя сапа методом амплификации дифференцирующих фрагментов генома при осуществлении эпидемиологического надзора за сапной инфекцией и обеспечивает возможность одновременного анализа девяти DFR-локусов. 2 ил., 1 табл., 3 пр.
Изобретение относится к области биохимии. Заявлен набор олигонуклеотидных праймеров для амплификации участка генома патогенных буркхольдерий, последовательность которого гомологична фрагменту генома В. mallei ВМАА1526, для выявления с помощью секвенирования изменения количества тандемных повторов ДНК штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза. Изобретение позволяет выявлять изменения генома штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза, культивированных при различных условиях на питательных средах и пассированных на лабораторных животных. 2 ил., 2 пр.
Изобретение относится к области биохимии. Заявлен набор олигонуклеотидных праймеров для амплификации участка генома патогенных буркхольдерий, последовательность которого гомологична фрагменту генома В. mallei ВМАА0090, для выявления с помощью секвенирования изменения количества тандемных повторов ДНК штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза. Изобретение позволяет выявлять изменения генома штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза, культивированных при различных условиях на питательных средах и пассированных на лабораторных животных. 2 ил., 2 пр.
