Патенты автора Прудникова Елена Юрьевна (RU)
Изобретение относится к биотехнологии. Описана минигеномная система вируса Пуумала для оценки противовирусной активности ингибиторов РНК-зависимой РНК-полимеразы, включающая рекомбинантные плазмиды nStem-IRES-PUUV_L, nStem-IRES-PUUV_N, nStem-PUUV_S_DsRed, обеспечивающие экспрессию искусственных генов за счет промотора бактериофага Т7, а также за счет внутреннего сайта посадки рибосом вируса энцефаломиелита (IRES). Изобретение позволяет воссоздать репликативную машинерию вируса Пуумала in vitro. Рекомбинантные плазмиды nStem-IRES-PUUV_L, nStem-IRES-PUUV_N предназначены для внутриклеточного синтеза вирусных белков, составляющих репликативную машинерию вируса Пуумала. Рекомбинантная плазмида nStem-PUUV_S_DsRed предназначена для оценки функциональной активности минигеномной системы. Изобретение расширяет арсенал инструментов для исследования вируса Пуумала, позволяя проводить скрининг ингибиторов РНК-зависимой РНК-полимеразы, направлено модифицировать сегменты вирусного генома для функционального изучения доменов вирусных белков, а также для прототипирования рекомбинантных вакцин с контролируемым циклом репликации. 7 ил., 3 пр.
Группа изобретений относится к генетической конструкции для экспрессии генов mNG_CD4-CXCR4, рекомбинантной плазмиде, кодирующей кДНК копию генома репликационно-дефектного вируса везикулярного стоматита, и рекомбинантному вирусу везикулярного стоматита, экспонирующему на своей поверхности рецепторы CD4 и CXCR4 человека. Предложена генетическая конструкция для экспрессии генов mNG_CD4 и CXCR4, образованная последовательностями флуоресцентного белка mNeonGreen и слитого через Р2А-пептид рецептора CD4 и корецептора CXCR4 человека и имеющего нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1. Предложена рекомбинантная плазмида rVSV_mNeonGreen [CD4-CXCR4], кодирующая рецепторы CD4 и CXCR4 человека в составе кДНК копии генома рекомбинантного вируса везикулярного стоматита (ВВС), имеющая размер 15260 п.н., и содержащая вышеуказанную генетическую конструкцию. Также предложен рекомбинантный штамм rVSV_mNG_CD4-CXCR4, содержащий вышеуказанную рекомбинантную плазмиду и обеспечивающий таргетный виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности белки gp120/gp41 ВИЧ-1 тропрости Х4. Штамм депонирован в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций, риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора под номером V-1108. Группа изобретений обеспечивает расширение спектра генетических конструкций для экспрессии генов mNG_CD4-CXCR4, рекомбинантных плазмид и рекомбинантных репликационно-дефектных вирусов, обеспечивающих виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности gp120/gp41 ВИЧ-1 тропности Х4. 3 н.п. ф-лы, 8 ил., 4 табл., 9 пр.
Группа изобретений относится к генетической конструкции для экспрессии генов mNG_CD4-CCR5, рекомбинантной плазмиде и рекомбинантному вирусу везикулярного стоматита (ВВС), экспонирующему на своей поверхности рецепторы CD4 и CCR5 человека. Предложена генетическая конструкция для экспрессии генов mNG_CD4 и CCR5, образованная последовательностями флуоресцентного белка mNeonGreen и слитого через P2A-пептид рецептора CD4 и корецептора CCR5 человека и имеющего нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1. Предложена рекомбинантная плазмида rVSV_mNeonGreen [CD4-CCR5], кодирующая рецепторы CD4 и CCR5 человека в составе кДНК копии генома рекомбинантного вируса везикулярного стоматита (ВВС), имеющая размер 15259 п.н. и содержащая вышеуказанную генетическую конструкцию. Также предложен рекомбинантный штамм ВВС rVSV_mNeonGreen [CD4-CCR5], содержащий вышеуказанную рекомбинантную плазмиду и обеспечивающий виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности белки gp120/gp41 ВИЧ-1 тропности R5. Штамм депонирован в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций, риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора под номером V-1107. Группа изобретений обеспечивает расширение спектра генетических конструкций для экспрессии генов mNG_CD4-CCR5, рекомбинантных плазмид и штаммов вирусов, обеспечивающих виролизис клеток, экспонирующих на своей поверхности белки gp120/gp41 ВИЧ-1 тропности R5. 3 н. п. ф-лы, 10 ил., 4 табл., 9 пр.
Изобретение относится к биотехнологии. Описан ген, кодирующий структурные гликопротеины вируса Крым-Конго геморрагической лихорадки. А также описана рекомбинантная плазмида, обеспечивающая экспрессию указанного гена за счет цитомегаловирусного (CMV) промотора, а также его интеграцию в геном клеток млекопитающих. Изобретение может быть использовано в биотехнологии, молекулярной биологии, генетической инженерии и медицине. Техническим результатом заявленного изобретения является создание рекомбинантной плазмиды, обеспечивающей интеграцию и экспрессию структурных гликопротеинов вируса Крым-Конго геморрагической лихорадки. Указанный технический результат достигается путем создания гена, кодирующего открытую рамку считывания М-сегмента вируса ККГЛ, который представлен последовательностью SEQ ID NO: 1 длиной 5052 п.н. Создана плазмида pSB3delta-GPC, которая имеет размер 11495 п.н. и содержит в соответствии с физической и генетической картой, представленной на фиг. 4, целевой ген, кодирующий открытую рамку считывания М-сегмента вируса ККГЛ, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 длиной 1683 а.к.о. 2 н.п. ф-лы, 7 ил., 4 табл.
Изобретение относится к штамму hCoV-19/Russia/Omsk-202118-1707/2020 вируса SARS-CoV-2, иммуносорбенту, содержащему цельновирионный антиген, полученный с использованием указанного штамма, и тест-системе ИФА для выявления антител классов М, G и А к коронавирусу SARS-CoV-2 и может быть использовано в медицинской вирусологии. Техническим результатом предлагаемого изобретения является повышение чувствительности набора реагентов для двухстадийного твердофазного непрямого иммуноферментного анализа (ИФА) с использованием цельновирионного антигена, полученного на основе заявляемого штамма hCoV-19/Russia/Omsk-202118-1707/2020 вируса SARS-CoV-2. Указанный технический результат достигается получением штамма hCoV-19/Russia/Omsk-202118-1707/2020 вируса SARS-CoV-2, депонированного в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций и риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора. Указанный технический результат достигается также получением иммуносорбента, содержащего цельновирионный антиген вируса SARS-CoV-2, используемого в качестве компонента иммуноферментной тест-системы для выявления антител классов М, G и А к вирусу SARS-CoV-2. Указанный технический результат достигается также изготовлением иммуноферментной тест-системы для выявления антител классов М, G и А к вирусу SARS-CoV-2, содержащему вышеуказанный иммуносорбент. 3 н. и 1 з.п. ф-лы, 11 табл., 7 пр.
Изобретение относится к биотехнологии. Описан ген, кодирующий РНК-зависимую РНК-полимеразу вируса ККГЛ, имеющий нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1 длиной 11838 п.н. Также описана рекомбинантная плазмида pSB3delta-RdRp, предназначенная для интеграции и экспрессии гена РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса ККГЛ, имеет размер 18270 п.н. и содержит в соответствии с физической и генетической картой целевой ген, кодирующий РНК-зависимую РНК-полимеразу вируса ККГЛ, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 длиной 3945 а.к.о., и состоит из следующих элементов: ген β-лактамазы (координаты с 17218 по 18078 п.н.) под контролем промотора (координаты с 18079 по 18183 п.н.), в качестве генетического маркера, определяющего устойчивость к ампициллину клеток бактерии E.coli; точка начала репликации ori плазмидного вектора pUC (координаты с 16459 по 17047 п.н.); 5'-ITR и 3'-ITR инвертированные повторы, имеющие координаты с 17 по 288 п.н. и с 15990 по 16214 п.н. соответственно, обеспечивают интеграцию участка плазмиды, заключенного между ними, в геном клеток млекопитающих при помощи транспозазы Sleeping Beauty (SB); промотор и энхансер CMV - обеспечивает экспрессию гена по п. 1 в клетках млекопитающих (координаты с 855 по 1438 п.н.); chimeric intron - химерный интрон, обеспечивающий эффективную транскрипцию, стабильность и транспорт транскрипта из ядра клетки (координаты с 1574 по 1706 п.н.); Т7 promoter - нуклеотидная последовательность промотора бактериофага Т7, необходимая для in vitro транскрипции (координаты с 1751 по 1769 п.н.); L protein (RdRp) - открытая рамка считывания гена РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса ККГЛ по п. 1 (координаты с 1783 по 13620 п.н.); IRES2 - внутренний сайт посадки рибосом вируса энцефаломиелита, обеспечивающий экспрессию гена устойчивости к пуромицину (координаты с 13854 по 14240 п.н.); PuroR - ген устойчивости к пуромицину, кодирующий N-ацетил трансферазу (координаты с 14241 по 14843 п.н.); bGH poly(A) signal - сигнал полиаденелирования (координаты с 14874 по 15098 п.н.). Изобретение расширяет арсенал средств для борьбы с ККГЛ. 2 н.п. ф-лы, 8 ил., 4 табл., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии. Описан искусственный ген Stbl_RBD_TrM_SC2, используемый для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, кодирующий искусственный белок-иммуноген, представляющий собой бицистронную структуру, состоящую из последовательностей рецепторсвязывающего домена (RBD) гликопротеина S коронавируса SARS-CoV-2, гетерологического сигнального пептида гемагглютинина (HA) вируса гриппа А, трансмембранного региона, линкера, P2A-пептида для расщепления полипротеина во время трансляции и гликопротеина G с мутацией M(1)>P(1), предотвращающей альтернативную инициацию трансляции, представленных в SEQ ID NO:1 длиной 2463 п.н. Описана рекомбинантная плазмида pStem-rVSV-Stbl_RBD_TrM_SC2, имеющая молекулярную массу 8,92⋅106 дальтон, размер 14417 п.н., представленная на Фиг. 2. Представлен штамм rVSV-Stbl_RBD_TrM_SC2 рекомбинантного вируса везикулярного стоматита, полученный с использованием рекомбинантной плазмиды pStem-rVSV-Stbl_RBD_TrM_SC2, обеспечивающий независимый синтез коронавирусного антигена (рецепторсвязывающий домен гликопротеина S SARS-CoV-2 с трансмембранным регионом) и белка G вируса везикулярного стоматита, используемый для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2 и депонированный в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций, риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора под номером V-983. Техническим результатом является улучшение фолдинга трансмембранного иммуногена, повышение стабильности целевого трансгена и иммуногенных/антигенных свойств заявляемого рекомбинантного вируса. 3 н.п. ф-лы, 4 ил., 2 табл., 5 пр.
Изобретение относится к биотехнологии, молекулярной биологии, генетической инженерии и медицине. Описан искусственной ген, кодирующий эктодомен гликопротеина S коронавируса SARS-CoV-2 c С-концевым тримеризующим доменом, имеющий SEQ ID NO:1 длиной 3723 п.н. Также представлена рекомбинантная плазмида pStem-rVSV-EctoS_SC2, обеспечивающая экспрессию указанного искусственного гена, представленная на физической и генетической карте на Фиг. 2, а также рекомбинантный штамм вируса везикулярного стоматита rVSV-Stbl_EctoS_SC2 для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, экспрессирующий антигены коронавируса SARS-CoV-2, индуцирующий специфический иммунный ответ к SARS-CoV-2, депонированный в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций, риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора под номером V-982. Техническим результатом является повышение уровня экспрессии трансгена, улучшение фолдинга и обеспечение синтеза полноразмерного эктодомена гликопротеина S SARS-CoV-2. 3 н.п. ф-лы, 4 ил., 4 пр.
Изобретение относится к биотехнологии, молекулярной биологии, генетической инженерии и медицине. Описан искусственнй ген, используемый для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, кодирующий искусственный белок-иммуноген, представляющий собой бицистронную структуру, состоящую из последовательностей рецептор-связывающего домена (RBD) гликопротеина S коронавируса SARS-CoV-2, гетерологического сигнального пептида гемагглютинина (HA) вируса гриппа А, линкера, P2A-пептида для расщепления полипротеина во время трансляции и гликопротеина G с мутацией M(1)>P(1), предотвращающей альтернативную инициацию трансляции, представленных в SEQ ID NO:1, длиной 2355 п.н. Представлена рекомбинантная плазмида pStem-rVSV-Stbl_RBD_SC2, используемая для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, имеющая молекулярную массу 8,85⋅106 дальтон, размер 14309 п.н. и содержащая в соответствии с физической и генетической картой, представленной на Фиг. 2, целевой ген по п. 1, кодирующий искусственный белок-иммуноген RBD гликопротеина S коронавируса SARS-CoV-2, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 и находящийся под контролем вирусного промотора, обеспечивающего его экспрессию в клетках млекопитающих. Получен штамм rVSV-Stbl_RBD_SC2 рекомбинантного вируса везикулярного стоматита, полученный с использованием рекомбинантной плазмиды pStem-rVSV-Stbl_RBD_SC2, обеспечивающий независимый синтез коронавирусного антигена (рецептор-связывающий домен гликопротеина S SARS-CoV-2) и белка G вируса везикулярного стоматита, используемого для создания вакцины против коронавируса SARS-CoV-2 и депонированного в Государственной коллекции возбудителей вирусных инфекций, риккетсиозов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора под номером V-984. Техническим результатом является улучшение фолдинга и повышение инфекционного титра рекомбинантного вируса, стабильности целевого трансгена и иммуногенных/антигенных свойств заявляемого рекомбинантного вируса. 3 н.п. ф-лы, 5 ил., 3 табл., 5 пр.
Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и касается перевиваемой гибридной сублинии клеток A4C2/9к SUS SCROFA. Представленная сублиния клеток A4C2/9к обладает высокой чувствительностью к вирусу АЧС. В качестве ростовой среды используется среда Игла - MEM с 10% сыворотки крови свиньи. Посевная концентрация 80-100 тыс. клеток/мл. Митотический индекс к 2-3 суткам культивирования составляет 25-35. Сублиния клеток депонирована в Специализированной коллекции клеточных культур сельскохозяйственных и промысловых животных при Всероссийском научно-исследовательском институте экспериментальной ветеринарии под №87. Охарактеризованное изобретение позволяет выделить вирус африканской чумы свиней без предварительной адаптации в реакции гемадсорбции и обеспечивает его накопление в титре до 6,0-6,5 lg ГАЕ50/см3. 1 табл., 3 пр.
