Патенты автора Беспятых Юлия Андреевна (RU)
Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ выявления микобактерий туберкулеза Центрально-Азиатского эпидемического кластера генотипа Beijing, согласно изобретению выявляют наличие специфической вставки элемента IS6110 в локусе генома Rv1359-Rv1360 с использованием ПЦР с тремя праймерами (5'-CGTACTCGACCTGAAAGACG, 5'-GGATGGTCCTTGCTGGGTG, 5'-GTATGAGCACAAGACACCGC), последующей оценкой результатов путем электрофореза продуктов ПЦР в горизонтальном агарозном геле и сравнения с маркером молекулярных масс и при амплификации фрагмента ДНК длиной 559 пн судят о принадлежности изолята Mycobacterium tuberculosis к Центрально-Азиатскому эпидемическому кластеру генотипа Beijing. Изобретение позволяет быстро и надежно детектировать микобактерии туберкулеза Центрально-Азиатского эпидемического кластера генотипа Beijing. 3 ил., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии, а именно к способу идентификации микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148. Применяют полимеразную цепную реакцию для амплификации фрагментов ДНК М. tuberculosis с подобранными праймерами P1, Р2 и Р3, последовательности которых представлены SEQ ID NO 1, 2, 3, соответственно, в режиме амплификации 98°C - 10 мин, 30 циклов: 98°C - 30 с, 64°C - 30 с, 72°C - 50 с, 72°C - 10 мин, 4°C. Проводят разделение продуктов амплификации электрофорезом в 2% агарозном геле. В случае получения фрагмента размером 1021 пн определяют штамм микобактерий туберкулеза кластера Beijing B0/W148. Предложенное изобретение позволяет быстро и с высокой специфичностью идентифицировать микобактерии туберкулеза кластера Beijing B0/W148. 3 ил.
Изобретение относится к биохимии. Изобретение обеспечивает способ одновременной (мультиплексной) амплификации и флуоресцентного маркирования ДНК нескольких сегментов генома микобактерий туберкулезного комплекса (Mycobacterium tuberculosis, M. bovis, M. bovis BCG, M. africanum и M. microti). Далее проводится гибридизационный или электрофоретический анализ последовательностей данных сегментов. Мультиплексная ПЦР осуществляется в едином реакционном объеме с использованием специфичных и адаптерных праймеров, флуоресцентного субстрата, встраиваемого в растущую цепь ДНК в ходе ПЦР и геномной ДНК в качестве матрицы. Мультиплексная ПЦР включает два последовательных профиля амплификации, различающихся температурами отжига специфичных и адаптерных праймеров не менее чем на 10°С. Изобретение позволяет проводить анализ последовательностей данных генов на выявления мутаций, ассоциированных с устойчивостью к противотуберкулезным препаратам. Способ по изобретению сокращает число стадий амплификаций для получения одноцепочечных флуресцентно-меченных ПЦР-продуктов, исключает перенос ДНК-матрицы из одного реакционного объема в другой, что повышает устойчивость процедуры к контаминации ПЦР-продуктами и существенно снижает время и трудоемкость анализа. 4 ил., 1 табл., 1 пр.
