Патенты автора БУЕНРОСТРО Джейсон (US)
Изобретение относится к биотехнологии, а именно к способу захвата и амплификации избранной последовательности и набору для его осуществления. Способ включает получение субстрата, представленного твердофазной подложкой, содержащего первую и вторую популяции связанных с поверхностью олигонуклеотидов, где данные олигонуклеотиды распределены случайным образом относительно друг друга на субстрате. Гибридизируют первый член первой популяции с синтетическим олигонуклеотидом отбора, содержащим участок, который гибридизируется с первым членом, и участок, который содержит геномную последовательность. Удлиняют первый член первой популяции для получения дуплекса, который содержит связанный с подложкой праймер отбора, содержащий последовательность, комплементарную геномной последовательности. Удаляют олигонуклеотид отбора путем денатурации, оставив удлиненный, связанный с подложкой праймер отбора. Гибридизируют связанный с подложкой праймер отбора с фрагментированным геномом, содержащим фрагмент нуклеиновой кислоты, включающий геномную последовательность. Удлиняют связанный с подложкой праймер отбора для получения продукта удлинения, который содержит последовательность, комплементарную фланкирующей последовательности, где фланкирующая последовательность фланкирует геномную последовательность. Амплифицируют геномный продукт на субстрате с помощью мостиковой ПЦР с использованием неудлиненных членов первой и второй популяции связанных с поверхностью олигонуклеотидов, для получения продукта ПЦР. Предложенное изобретение позволяет осуществить обогащение мишени непосредственно на субстрате, используемом для секвенирования. 2 н. и 17 з.п. ф-лы, 18 ил., 4 табл., 1 пр.
