Патенты автора КОТЕЛЬНИКОВА Екатерина Александровна (RU)
Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к способу поиска белков-мишеней, запускающих процесс канцерогенеза, в образцах тканей индивидуального пациента, для последующей противоопухолевой фармакотерапии. Определяют методом секвенирования транскриптомные данные об уровнях экспрессии генов в образцах. Получают набор активированных генно-регуляторных сетей, состоящих из центрального гена регулятора и регулируемых им генов. Определяют из транскриптомных данных дифференциально экспрессированные гены. Определяют методами секвенирования изменения в последовательностях ДНК, представленных в виде набора однонуклеотидных полиморфизмов в образцах. Определяют среди найденных генетических вариантов гены-драйверы. Проводят поиск канонических сигнальных путей, значимо обогащенных ранее найденными центральными генами регуляторами экспрессии, дифференциально экспрессированными генами, генами с идентифицированными однонуклеотидными полиморфизмами и инделами, генами-драйверами. Проводят поиск методом перебора в составе идентифицированных сигнальных путей существующих белков-мишеней для лекарственных препаратов, предназначенных для противоопухолевой терапии. Предложенное изобретение позволяет с высокой эффективностью найти белки-мишени, запускающие процесс канцерогенеза, в образцах тканей индивидуального пациента. 1 ил., 5 табл.
