Патенты автора Борисова Марина Эдуардовна (RU)

Изобретение относится к области биотехнологии и касается способа приготовления геномных библиотек ограниченных выборок локусов из деградированной ДНК. Способ включает проведение гидролиза геномной ДНК эндонуклеазой рестрикции, формирующей фрагменты с 5'-липким концом, и частичное тупление концов полимеразной реакцией в присутствии неполного набора дезоксирибонуклеозидтрифосфатов. Лигирование фрагментов с адаптерами с липким концом, комплементарным модифицированному частичным туплением липкому концу целевого фрагмента, отбор целевых фрагментов совместно селекцией по длине фрагментов и амплификацией с праймерами, комплементарными адаптерам. Последовательный гидролиз геномной ДНК можно проводить двумя эндонуклеазами рестрикции, формирующими различные липкие концы фрагментов, - сначала чувствительной к химической модификации нуклеотидов эндонуклеазой рестрикции, затем ее нечувствительным к модификации изошизомером. При амплификации фрагментов библиотеки используют праймеры, содержащие: участок, комплементарный адаптерам, участок, комплементарный остатку сайта узнавания эндонуклеазы рестрикции, и участок специфического удлинителя длиной 1-4 нуклеотида на 3' конце праймера для ограничения выборки локусов библиотеки. Представленное изобретение позволяет получать геномные библиотеки образцов деградированной ДНК за небольшое время и с высокой селективностью в отношении целевых фрагментов. 2 ил.

 


Наверх