Изобретение относится к области физиологии растений. Способ включает комплексный анализ морфологических и биометрических характеристик растений. Черенки испытуемой пары растений помещают совместно в емкость с дистиллированной водой, выдерживают их в условиях, обеспечивающих эффективный режим формирования корней. Одновременно такие же черенки помещают порознь в отдельные емкости с водой, проводят периодическую оценку морфологических и биометрических характеристик корней по мере их роста и развития. По результатам сравнительного анализа динамики формирования корней изучаемых пар растений с контрольными образцами испытуемых растений, выдерживаемых порознь в отдельных емкостях, оценивают уровень аллелопатического взаимодействия растений по числу образования придаточных корней по сравнению с контролем. Способ позволяет повысить чистоту эксперимента. 3 ил., 1 табл.