Патенты автора Трофимов Дмитрий Юрьевич (RU)

Изобретение относится к медицине, биотехнологии, вирусологии, иммунологии. Представлено комбинированное лекарственное средство (КЛС), обладающее противовирусным эффектом в отношении коронавируса SARS-CoV-2 и родственных вирусов при условии тождественности генетической мишени, против которой направлен специфический компонент данного препарата. Комбинированное лекарственное средство для профилактики или лечения коронавирусной инфекции, вызываемой SARS-CoV-2, содержит: (i) эффективное количество молекул миРНК, направленных против генома вируса SARS-CoV-2, представленных в виде двух комплементарных цепей, характеризующихся структурой (+G)GAAGGAAGUUCUGUUGAA(+T)(+T)dT и UUCAACAGAACUUCCUUCC(+T)(+T)dT, (ii) дендримерный катионный пептид, обладающий трансфекционной активностью и характеризующийся структурой R8K4X4K2H2KZC, где R - аргинин; K - лизин; X - SEQ ID NO 3; Н - гистидин; Z - фенилаланин (F); С - цистеин или цистеинамид, (iii) фармацевтически приемлемое вспомогательное средство (растворитель). Изобретение обеспечивает подавление репликации вируса SARS-CoV-2, что дает новую возможность для лечения инфекции COVID19, вызываемой данным вирусом. 3 н. и 11 з.п. ф-лы, 9 пр., 12 ил.

Изобретение относится к области биотехнологии. В ходе работы было проведено полногеномное секвенирование ДНК изолятов М. tuberculosis из коллекции, анализ in silico полиморфизмов генов вирулентности, выявление корреляции между мутациями в генах вирулентности и иммунодефицитом пациента, в ходе которого были обнаружены мутации в генах pks15 и ре_pgrs54, являющиеся маркерными для изолятов, поражающих людей с иммунодефицитами различного генеза, а также разработаны праймеры для их детекции. Предлагаемый метод позволяет определить высокую патогенность микобактерий для людей со сниженным иммунитетом в режиме ПЦР, и, с минимальными адаптациями, ПЦР в реальном времени, мультилокусной ПЦР с последующим секвенированием, в том числе в системе MiSeq («Illumina», США) и GS Junior («Roche», Швейцария). 2 ил., 2 табл., 2 пр.

Изобретение относится к биотехнологии. Изобретение представляет собой способ определения в гене галактозо-1-фосфатуридилтрансферазы человека мутации Q188R, rs35742686. Способ может быть использован при скрининге носительства моногенных заболеваний. Способ включает снятие кривых плавления с флуоресцентно-меченными аллель-специфичными олигонуклеотидными пробами. Используют общую для всех аллелей пару праймеров, отличающиеся для каждого аллеля флуоресцентно-меченные аллель-специфичные олигонуклеотидные пробы и универсальный олигонуклеотид, меченный гасителем флуоресценции, следующего нуклеотидного состава:GALT-s GGTCAGGAGGGAGTTGACTTGGGALT-as CCACAGTGCTGGCTCAGACTCAGCGALT-p1 CCACTGCCAGGTAAGG-FAMGALT-p2 CACTGCCGGGTAAGG-VICGALT-р3 BHQ1- GTGTCAGGGGCTCCAGTGG-P,где FAM означает флуоресцентный краситель FAM, VIC означает флуоресцентный краситель VIC, BHQ1 означает присоединенный к 5'-концевому нуклеотиду темновой гаситель флуоресценции. Относят образец к гомозиготе или гетерозиготе по данному аллелю по анализу форм кривых плавления ДНК, а именно по максимуму первой производной графиков флуоресценции. Предложенное изобретение позволяет более доступно проводить определение в гене галактозо-1-фосфатуридилтрансферазы человека мутации Q188R, rs35742686. 1 ил., 1 табл., 1 пр.

Предложенная группа изобретений относится к области медицины, в частности акушерству и медицинской генетике. Предложены способы определения источника анеуплоидных клеток по крови беременной женщины. Путем анализа данных секвенирования проводят отбор фракции фрагментов свободно циркулирующей (внеклеточной) ДНК короче 150-200 п. н. Для полученной фракции определяют долю плодовой ДНК (ffX). В случае возрастания доли плодовой ДНК при уменьшении длины отобранных для анализа фрагментов внеклеточной ДНК предполагают плодовое происхождение анеуплоидий. В случае отсутствия возрастания доли плодовой ДНК - наличие анеуплоидий в клетках матери. Предложенная группа изобретений обеспечивает повышение достоверности лабораторного исследования за счет выявления случаев анеуплоидий самой матери, в том числе мозаичных форм, являющихся причиной ложноположительных результатов ДНК-скрининга. 2 н.п. ф-лы, 1 ил., 2 пр.

Изобретение относится к области медицины, в частности к гинекологии. Предложен способ оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Измеряют уровень экспрессии мРНК генов человека MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, ESR1, PGR, BCL2, ВАХ, BAG1, NDRG1, PTEN, CD68, SCUBE, PTGS2 в образцах из мест поражений. Полученные в ходе реакции значения подставляют в формулу. Если значение р менее или равно пороговому значению (р≤cut-off), делают заключение об отсутствии риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплази. Если значение р>cut-off, делают заключение о высоком риске прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Изобретение позволяет оценить вероятность риска прогрессии цервикальной интраэпителиальной неоплазии и последующей малигнизации. 2 ил., 2 пр.

Предложенное изобретение относится к области биотехнологии. Предложен способ валидации температурных, фотометрических и спектральных характеристик приборов для ПЦР-исследований. Предложенный способ включает использование раствора с молекулярными зондами - двуцепочечными молекулами ДНК, одна из цепей которых ковалентно связана с флуорофором, а другая - с гасителем флуоресценции, которые помещают в пробирки или планшеты для ПЦР-исследований и устанавливают в прибор для ПЦР-исследований. В предложенном способе отсутствует необходимость проведения амплификации, проводится только плавление молекулярных зондов с разными температурами плавления и мониторинг зависимости сигнала флуоресценции для каждого молекулярного зонда от температуры с определением температурных характеристических точек, при этом кинетика изменения сигнала флуоресценции используется для расчета фотометрических и спектральных параметров. Предложенный способ может быть использован в биотехнологии для оптической и температурной валидации приборов для ПЦР-исследований в режиме реального времени.

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии и предназначено для определения генотипа человека по полиморфизму в гене цитохрома Р450 CYP2D6*6 (1707delT) rs5030655. Используют пару праймеров, флуоресцентно-меченые аллель-специфичные олигонуклеотидные пробы и универсальный олигонуклеотид, меченный гасителем флуоресценции. Отнесение образца к гомозиготе или гетерозиготе по данному аллелю оценивается по форме кривых плавления ДНК, а именно по максимуму первой производной графиков флуоресценции. Изобретение обеспечивает возможность проводить исследование в одной пробирке, что снижает затраты на исследование. 1 ил., 2 табл.

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии и предназначено для определения генотипа человека по полиморфизму в гене цитохрома Р450 CYP2D6*4 (1846G>A) rs3892097. Используют пару праймеров, флуоресцентно-меченые аллель-специфичные олигонуклеотидные пробы и универсальный олигонуклеотид, меченный гасителем флуоресценции. Отнесение образца к гомозиготе или гетерозиготе по данному аллелю оценивается по форме кривых плавления ДНК, а именно по максимуму первой производной графиков флуоресценции. Изобретение обеспечивает возможность проводить исследование в одной пробирке, что снижает затраты на исследование. 1 ил., 2 табл.

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии и предназначено для определения генотипа человека по полиморфизму в гене цитохрома Р450 CYP2D6*9 (2615-2617delAAG) rs5030656. Используют пару праймеров, флуоресцентно-меченые аллель-специфичные олигонуклеотидные пробы и универсальный олигонуклеотид, меченный гасителем флуоресценции. Отнесение образца к гомозиготе или гетерозиготе по данному аллелю оценивается по форме кривых плавления ДНК, а именно по максимуму первой производной графиков флуоресценции. Изобретение обеспечивает возможность проводить исследование в одной пробирке, что снижает затраты на исследование. 1 ил., 2 табл.

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии и предназначено для определения генотипа человека по полиморфизму в гене цитохрома Р450 CYP2D6*3 (2549delA) rs35742686. Используют пару праймеров, флуоресцентно-меченые аллель-специфичные олигонуклеотидные пробы и универсальный олигонуклеотид, меченный гасителем флуоресценции. Отнесение образца к гомозиготе или гетерозиготе по данному аллелю оценивается по форме кривых плавления ДНК, а именно по максимуму первой производной графиков флуоресценции. Изобретение обеспечивает возможность проводить исследование в одной пробирке, что снижает затраты на исследование. 1 ил., 2 табл.

Изобретение относится к области биохимии и молекулярной биологии, в частности к набору синтетических олигонуклеотидов. Указанный набор предназначен для определения последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов (HLA-A и HLA-DRB1) методом ПЦР и состоит из следующих праймеров: dr1in6s 5’-GGATCCTCCTCCAGCTCCTG-3’, dr1in2a 5’-CCGCTCCGTCCCATTGAAGA-3’, A1in1s 5’-CTCCGAACCCTCCTCCTGCTA-3’, A1in2a 5’-GCTGTCGAACCGCACGGACTG-3’. Изобретение позволяет определять последовательности 1 интрона, примыкающей ко 2 экзону, генов системы HLA I и II классов. 1 ил.

Изобретение относится к медицине, а именно к акушерству, гинекологии, иммунологии и молекулярной биологии, и может быть использовано для оптимизации диагностики при постановке диагноза «послеродовый эндометрит». Способ оценки вероятности развития послеродового эндометрита (ПЭ) характеризуется тем, что в содержимом лохий определяют уровни экспрессии мРНК генов TNF, CD45, CD69, CD 166, а также индексы отношений уровней экспрессии мРНК генов , и , рассчитывают значение индекса воспаления (ИВ) согласно формуле: ИВ=1/(1+e-z)*100%, где z - значение классифицирующей функции, рассчитывают по формуле:, если значение индекса воспаления более 51%, делают заключение о высокой вероятности развития послеродового эндометрита, при значении индекса воспаления ≤51%, делают заключение об отсутствии послеродового эндометрита. 3 ил., 2 пр.

Изобретение относится к области медицины, а именно к акушерству, гинекологии, неонатологии, микробиологии, молекулярной генетике, клинической лабораторной диагностике. Cпособ нацелен на выявление возбудителей оппортунистических инфекций и маркеров их патогенности у женщин репродуктивного возраста и новорожденных детей. Для исследования у женщин используют соскобы эпителиальных клеток из влагалища (заднебоковые своды) и цервикального канала, биоптат эндометрия, метроаспират, содержимое абсцесса, экссудат брюшной полости, кровь, мочу. Для исследования у новорожденного используют соскобы со слизистых оболочек желудочно-кишечного тракта (кал, зев), отделяемое глаз, содержимое везикул, отделяемое пупочной ранки, кровь, мочу, содержимое венозного катетера. Выполняют ПЦР в режиме реального времени. В образцах биоматериала определяют общую бактериальную массу, количество геномов представителей условно-патогенной микрофлоры, относящихся к одиннадцати таксонам: семейство Enterobacteriaceae, роды: Streptococcus, Enterococcus, Staphylococcus, Candida, виды: Streptococcus agalactiae, Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Gardnerella vaginalis, Candida albicans, и наличие восемнадцати маркерных локусов, ассоциированных с патогенностью основных условно-патогенных микроорганизмов: G. vaginalis sialidase, G. vaginalis lacZ, G. vaginalis fucA, S. agalactiae sialidase, S. agalactiae ST-17, S. agalactiae ST-19/23, S. aureus tsst, S. aureus lukS, S. aureus lukF, S. aureus icaA, S. aureus icaD, E. faecalis cylA, E. faecalis cylB, E. coli cnf1, E. coli vat, E. colipapC, E. coli stx1, E. coli stx2. В зависимости от наличия/отсутствия возбудителя, его количества и маркерных генов патогенности проводят оценку уровня патогенности возбудителей инфекций и дают прогноз течения и развития осложнений заболевания. В соответствии с прогнозом осуществляют тактику ведения пациента. 7 табл., 3 пр.

Изобретение относится к области медицины, в частности к гинекологии, и предназначено для лечения вагинальной атрофии у женщин в постменопаузе с учетом состояние биоценоза влагалища. Биоматериал берут с помощью вагинального или уретрального зонда путем соскоба влагалища. Методом ПЦР в режиме реального времени с помощью комплекта реагентов «Фемофлор-16» определяют количество геном-эквивалентов микроорганизмом и их долю в общей бактериальной массе. Если доля Lactobacillus spp. больше 80%, диагностируют нормоценоз, характеризующийся доминированием нормофлоры. Если доля Lactobacillus spp. менее 80%, диагностируют дисбиоз. При вагинальной атрофии на фоне нормоценоза назначают гормональную терапию. При вагинальной атрофии на фоне дисбиоза назначают гормональную терапию и препараты, содержащие лактокультуру. Изобретение обеспечивает разработку индивидуальных подходов лечения вагинальной атрофии у женщин в постменопаузе с учетом состояния биоценоза влагалища. 5 табл., 3 пр.

Изобретение относится к области медицины, в частности к акушерству, и предназначено для определения доли плодовой ДНК в плазме крови беременной женщины с помощью методов высокопроизводительного секвенирования. Используют 53 однонуклеотидных полиморфизма (ОНП), расположенных на 1-12 хромосомах с частотой встречаемости гетерозиготы 40-50%, и специфические праймеры к ним. Долю плодовой ДНК определяют как медиану значений доли плодовой ДНК для всех информативных ОНП. Изобретение обеспечивает эффективное определение доли плодовой ДНК в плазме крови беременной женщины вне зависимости от пола плода. 4 табл., 2 пр.

Изобретение относится к области медицины, в частности к репродуктивной медицине и вспомогательным репродуктивным технологиям, а также к области науки, в частности к молекулярной биологии и эмбриологии. Способ определения персонального «окна имплантации» у женщин включает измерение уровней экспрессии мРНК функциональных генов человека РАЕР, DPP4, HLA-DOB, MSX1 в образцах тканей эндометрия, полученных путем пайпель-биопсии на 7-8 день после пика лютеинизирующего гормона. Далее полученные значения уровней экспрессии мРНК используют для вычисления индекса рецептивности эндометрия. Если значение индекса рецептивности эндометрия менее или равно пороговому значению, делают заключение о несоответствии эндометрия стадии «окна имплантации»; если значение индекса рецептивности эндометрия больше порогового значения, делают заключение о соответствии эндометрия стадии «окна имплантации», при этом пороговое значение определяют исходя из экспериментальных данных с помощью ROC-анализа. Изобретение обеспечивает интегральную оценку нарушения фертильности и дает возможность определения персонального «окна имплантации» за счет исследования только одного биологического образца, а именно ткани эндометрия, с использованием только одного метода исследования – полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. 3 ил., 1 пр.

Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложены штаммы Gardnerella vaginalis ВКМ B-3001D (I генотипа) и Gardnerella vaginalis ВКМ B-3003D (III генотипа), обладающие выраженным патогенным потенциалом, способностью колонизовать слизистую влагалища женщин репродуктивного возраста и вызывать выраженные клинические симптомы бактериального вагиноза, и штамм Gardnerella vaginalis ВКМ B-3002D (II генотипа), обладающий меньшим патогенным потенциалом и колонизирующей способностью, что ассоциируется с бессимптомным течением бактериального вагиноза, а также коллекция, содержащая эти штаммы. Коллекция предназначена для подбора сайтспецифичных праймеров при создании диагностической ПЦР-панели, позволяющей выявлять все три генотипа и оценивать патогенный потенциал Gardnerella vaginalis непосредственно в образцах вагинального отделяемого. Группа изобретений позволяет повысить точность диагностики вагиноза. 4 н.п. ф-лы, 3 ил., 3 пр., 1 табл.

Изобретение относится к области медицины, а именно к микробиологии, клинической лабораторной диагностике, молекулярной биологии, акушерству, гинекологии и неонатологии. Cпособ выявления возбудителей нозокомиальных оппортунистических инфекций и маркеров их резистентности к бета-лактамным антибиотикам и гликопептидам у женщин репродуктивного возраста и новорожденных детей заключается в том, что выполняется ПЦР в режиме реального времени и определяются следующие показатели: наличие геномной ДНК человека, общая бактериальная масса, наличие ДНК УПМ, относящихся к восьми таксонам (семейство: Enterobacteriaceae, роды: Staphylococcus, Enterococcus, Acinetobacter, комплекс видов: Burkholderia cepacia, виды: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia), а также 15 маркеров резистентности микроорганизмов к антибиотикам: mecA, vanA, vanB, blaTEM, blaSHV, blaCTX-M blaOXA23-подобные гены, blaOXA40-подобные гены, blaOXA48-подобные гены, blaOXA51-подобные гены, blaOXA58-подобные гены, blaNDM, blaVIM, blaKPC, blaIMP и по полученным данным осуществляют оптимальный выбор антибактериальных препаратов. 5 табл., 3 пр.

Изобретение относится к биотехнологии и стоматологии и клинико-лабораторной диагностике. Описан способ оценки состояния пародонта человека на предмет устойчивости к развитию хронического генерализованного пародонтита, вызываемого Treponema denticola и/или Tannerella forsythensis. Согласно изобретению в качестве специфического маркера используется уровень обсемененности пародонта бактерией-пародонтопротектором Streptococcus sanguinis, определяемый методом полимеразной цепной реакции в реальном времени с использованием специфических праймеров и зонда. Высокая обсемененность пародонта пациента S. sanguinis свидетельствует о его высокой устойчивости к гиперколонизации такими пародонтопатогенами, как Tannerella forsythensis и Treponema denticola, и в меньшей степени Porphyromonas gingivalis и Prevotella intermedia. Низкая представленность S. sanguinis в микробиоценозе пародонта конкретного пациента или его полное отсутствие является прогностическим признаком, свидетельствующим о повышенном риске сверхкритической колонизации пародонта патогенами и последующем развитии хронического генерализованного пародонтита (ХГП). Наибольшей эффективности при оценке состояния пародонта можно добиться за счет параллельного измерения представленности в микробиоценозе пародонта патогенов: Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Tannerella forsythensis и Treponema denticola [1-5] и S. sanguinis. Данный подход позволяет прогнозировать динамику развития заболевания и производить оценку результативности курса лечения, пройденного пациентом. 2 з.п. ф-лы.
Изобретение относится к медицине и представляет собой способ диагностики вагинита у девочек в возрасте до 8 лет, заключающийся в том, что используют ПЦР в режиме реального времени с определением в образце числа геномов Lactobacillus spp. и Gardnerella vaginalis в мазке-соскобе со слизистой оболочки влагалища, рассчитывают индекс lgL/G, где lgx - десятичный логарифм численного соотношения геномов микроорганизмов, L соответствует числу геномов Lactobacillus spp., a G - числу геномов Gardnerella vaginalis в образце и при значениях индекса более -0,5 диагностируют вагинит. Способ позволяет повысить информативность лабораторного обследования у девочек периода детства с нарушением биоценоза слизистой влагалища, оценить эффективность проводимой терапии. 3 пр.

Настоящее изобретение относится к медицине. Предложен способ диагностики локального иммунного статуса пародонта. Предложенный способ включает измерение уровня мРНК генов TNFα, MMP8 и MMP9 с использованием методов обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции в “реальном времени”, с дальнейшим вычислением отношения полученных уровней генетических маркеров. В случае, если отношение уровней маркеров TNFα/MMP8/MMP9 находится в диапазоне 1/(1±0,2)/ (1±0,2), следует диагностировать нормальный статус локального неспецифического иммунитета в обследуемой точке пародонта, в случае, если отношение уровней маркеров выходит за пределы указанного диапазона, следует диагностировать наличие нарушения в работе неспецифического иммунитета. Предложенный метод обеспечивает чувствительную и объективную оценку локального иммунного статуса пародонта, что позволяет оценить риски локального воспаления, и может быть использован в клинико-лабораторной диагностике. 1 табл.

Изобретение относится к клинико-лабораторной диагностики. В частности, к определению степени устойчивости пародонта к инфекции патогенными бактериями Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia и Tannerella forsythensis за счет наличия бактерии-пародонтопротектора Veillonella parvula. Определение обсемененности пародонта V. parvula достигается с помощью ПЦР в реальном времени. Предметом изобретения является комплексная тест-система для определения V. parvula, а также принцип использования порогового значения, позволяющего установить относительную долю V. parvula в бактериальном консорциуме пародонта путем нормировки сигнала со специфическими праймерами на сигнал общей бактериальной ДНК и отличить нормальный уровень обсемененности пародонта (способный сдерживать патологическую гиперколонизацию пародонтита патогенными бактериями P. gingivalis, P. intermedia и Т. forsythensis) от дисбиотического сдвига, приводящего к поражению пародонта или склонности к развитию хронического генерализованного пародонтита (ХГП). Изобретение может быть использовано для оценки склонности индивидуального пациента к инфекции пародонта патогенными бактериями P. gingivalis, P. intermedia и Т. forsythensis с целью выявления причины возникновения ХГП у индивидуального пациента, оценки риска возникновения у него этого заболевания в будущем и эффективности лечения как агрессивного, так и хронического пародонтита. Новый способ интерпретации результатов полимеразной цепной реакции в реальном времени для определения в смывах пародонта конкретного вида бактерии, включая V. parvula, заключается в том, что определяют относительное значение Ct для образца по следующему алгоритму: из усредненного по двум или большему числу независимых определений абсолютного значения Ct (определяется программным обеспечением термоциклера с оптической детекцией) для специфического набора праймеров и зонда вычитают усредненную величину Ct общей бактериальной массы для того же образца серии, после чего идентифицируют нормальную степень обсемененности пародонта V. parvula при условии, что величина относительной Ct не превышает 15. 2 з.п. ф-лы.

Изобретение относится к области медицины и предназначено для диагностики раннего неонатального сепсиса (РНС) у новорожденных первых суток жизни. В клетках буккального соскоба измеряют уровни экспрессии генов IL12A и CD68 относительно представленности мРНК референсных генов В2М, GUS, ТВР или HPRT. На основании полученных уровней экспрессии вычисляют значение канонической линейной дискриминантной функции (КЛДФ) по формуле. Если значение КЛДФ<0,45, делают заключение об отсутствии инфекционно-воспалительных заболеваний. Если значения КЛДФ>0,45, определяют РНС. Изобретение обеспечивает эффективную неинвазивную диагностику РНС. 3 табл., 2 пр.

Изобретение относится к области биохимии, клинико-лабораторной диагностики, в частности к определению степени обсемененности пародонта патогенными бактериями с помощью ПЦР в реальном времени. Описан способ применения комплексной тест-системы для определения Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Tannerella forsythensis и Treponema denticola, а также принцип использования порогового значения, позволяющего отличить патологическую обсемененность пародонта (способную служить причиной возникновения пародонтита) от нормальной, встречающейся у лиц без выраженного поражения пародонта или склонности к нему. Способ включает ПЦР в реальном времени для определения в смывах пародонта патогенов. Определяют относительное значение Ct для образца по следующему алгоритму: из усредненного по двум или большему числу независимых определений абсолютного значения Ct (определяется программным обеспечением термоциклера с оптической детекцией) для специфического набора праймеров и зонда вычитают усредненную величину Ct общей бактериальной массы для того же образца серии, после чего идентифицируют патологическую обсемененность пародонта при условии, что величина относительной Ct не превышает 15. Изобретение может быть использовано для выявления причины возникновения хронического пародонтита у индивидуального пациента, оценки риска возникновения у него этого заболевания в будущем и эффективности лечения как агрессивного, так и хронического пародонтита. 6 ил.

Изобретение относится к области медицины, стоматологии, молекулярной биологии и клинико-лабораторной диагностики. Описан способ определения выраженности нагноения (гноетечения) тканей пародонта. Способ основан на измерении в соскобах с пародонта уровня РНК гена интерлейкина-8 (IL-8) относительно представленности референсной РНК или ДНК. Полученные показатели используют для вычисления отношения уровней для каждого конкретного образца. Значение полученного показателя интерпретируется как маркер нагноения. Изобретение может быть использовано для определения гноетечения у индивидуальных пациентов с агрессивным и хроническим пародонтом, в том числе после потери зуба, в тех случаях, когда интенсивность этого процесса не позволяет осуществлять визуальное обнаружение гноя, а также в тканях, соприкасающихся с имплантами и другими ортодонтическими конструкциями. Использование метода обеспечивает высокочувствительную и объективную количественную характеристику степени нагноения исследуемого участка пародонта, что позволяет оценивать риск возникновения острого локального воспаления и разрушения пародонта в будущем, приживаемость имплантов и других ортодонтических конструкций, оценивать эффективность лечебных мероприятий. 2 з.п. ф-лы, 4 табл.

Изобретение относится к области медицины, а именно к способу оценки микробного спектра эндометрия для этиологической диагностики хронического эндометрита (ХЭ), заключающейся в том, что производят забор фрагмента слизистой оболочки полости матки, далее методом ПЦР в реальном времени количественно оценивают значение контроля взятия материала, при снижении данного показателя ниже 104 ГЭ/образец результат считают недостоверным, общей бактериальной массы, положительный результат при значении более 103 ГЭ/образец, определяют количество геном-эквивалентов микроорганизмов и сравнивают его с пороговым значением (ПЗ), применяя диагностическую панель, включающую Lactobacillus spp., абсолютно- или условно-патогенные микроорганизмы, такие как Eubacterium spp., Enterobacteriaceae, Escherichia coli, Streptococcus spp., Streptococcus agalactiae, Staphylococcus spp., Staphylococcus aureus, Enterococcus spp., Peptostreptococcus spp., Prevotella bivia/Porphyromonas spp., Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae, Mycoplasma hominis, Ureaplasma spp., Candida spp., Trichomonas vaginalis, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Herpes simplex 1 и 2 типов, Cytomegalovirus; при выявлении абсолютно- или условно-патогенных микроорганизмов в количестве, превышающем пороговое значение, делают заключение о потенциальном значении данного микроорганизма в этиологической диагностике хронического эндометрита. Предложенный способ позволяет в течение 1-2 суток качественно и количественно охарактеризовать микробный спектр в слизистой оболочке полости матки у женщин, что повышает точность этиологической диагностики ХЭ. 4 табл., 3 пр.
Изобретение относится к области медицины, в частности к акушерству и гинекологии, и предназначено для диагностики воспалительного процесса вульвы и влагалища бактериальной этиологии у девочек в возрасте от 0 до 8 лет. У пациента производят забор биоматериала путем мазка-соскоба с боковой стенки слизистой влагалища за гименом и проводят ПЦР в режиме реального времени с анализом качественного и количественного состава микроорганизмов и уровня экспрессии мРНК гена CD45. В случае обнаружения геном-эквивалентов на образец микроорганизмов в заданных интервалах и мРНК гена CD45 не менее 0,5 единиц относительно референсных генов, у девочек в возрасте от 0 до 8 лет диагностируют воспалительный процесс вульвы и влагалища бактериальной этиологии. Изобретение обеспечивает комплексную оценку микробиоты слизистой влагалища совместно с маркером воспалительной реакции на основе использовании метода количественной ПЦР в режиме реального времени. 3 пр.

Изобретение относится к области медицины, молекулярной биологии и биотехнологии. Предложен способ определения полиморфизма гена GP6 человека, кодирующего гликопротеин VI, по полиморфной позиции rs 1613662, основанный на снятии кривых плавления с флуоресцентно-мечеными аллель-специфичными олигонуклеотидными пробами. Благодаря увеличению надежности определения вариабельных позиций и возможности проводить определение в одной пробирке на стандартном оборудовании способ может быть эффективно использован для диагностики наследственных предрасположенностей человека с регистрацией результатов ПЦР в реальном времени. 1 ил.
Изобретение относится к области медицины, а именно к гинекологии, и может быть использовано при оценке риска возникновения побочных эффектов на фоне применения гормональной контрацепции - этинилэстрадиол+дроспиренон. Способ заключается в том, что перед назначением контрацепции определяют полиморфный локус rs936306 гена CYP19A1. При наличии генотипа G/A диагностируют транзиторные нарушения в первые 6-6,5 месяцев приема контрацепции, а при наличии генотипа А/А диагностируют побочные эффекты, начиная с 7 месяца применения контрацептивов. Способ изобретения позволяет снизить развитие побочных эффектов от гормональной контрацепции, прогнозирования переносимости и безопасности гормональных контрацептивов и возможного влияния на функцию печени, систему гемостаза и липидный спектр крови. 3 пр.
Изобретение относится к области медицины и предназначено для диагностики вагинита у женщин репродуктивного возраста. Во влагалищных соскобах измеряют уровни экспрессии мРНК генов TNF, IL18, GATA3 и TLR4. Определяют индексы отношений уровня экспрессии мРНК генов TLR4/GATA3 и TNF/IL18 и на основании значений пороговых циклов определяют вероятность вагинита по формуле. В случае если значение Р≤57% для небеременных женщин или Р≤68,5% для беременных женщин, делается заключение об отсутствии вагинита. Если значение Р≥57% для небеременных женщин или Р≥68,5% для беременных женщин, ставят диагноз вагинит. Изобретение обеспечивает эффективную диагностику вагинита у женщин репродуктивного возраста. 3 табл., 5 пр.

Изобретение относится к медицине, а именно к акушерству и гинекологии, репродуктологии, и может быть использовано для оптимизации программы экстракорпорального оплодотворения (ЭКО) с учетом молекулярно-генетических характеристик гамет при селективном переносе эмбрионов (ПЭ). Способ заключается в том, что на основании данных ПЦР-амплификации исследуемых и референсных генов, полученных в день трансвагинальной пункции яичников (ТВП) методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), об уровне экспрессии мРНК генов факторов роста (AREG, EREG, IGF1, IGFBP4), ингибитора апоптоза (BIRC5) в клетках фолликулярной жидкости, соотношения уровня экспрессии мРНК протаминов (PRM2:PRM1) в сперме получают значения пороговых циклов (Ср) накопления продуктов реакции, вычисляют значение канонической линейной дискриминантной функции (КЛДФ) по формуле, и если значение КЛДФ>0,22, делают заключение о благоприятном прогнозе наступления беременности. Изобретение позволяет выбирать эмбрион, имеющий высокий потенциал к имплантации, с целью снижения частоты многоплодных беременностей, а также прогнозировать наступление беременности в программе ЭКО при селективном переносе эмбрионов. 1 пр., 3 ил.
Изобретение относится к области гинекологии и представляет собой способ оценки состояния микрофлоры влагалища у девочек в возрасте от 0 до 3 лет, который отличается тем, что производят забор биоматериала со слизистой боковой стенки влагалища путем мазка-соскоба с помощью ПЦР в режиме реального времени определяют количество геном-эквивалентов представителей условно-патогенной микрофлоры и сравнивают с центильным интервалом соответствующей группы микроорганизмов; нормоценозом будет считаться общая бактериальная обсемененность в центильном интервале от 105,1 до 106,2 ГЭ/образец с представительством определенных микроорганизмов в установленных интервалах. Изобретение обеспечивает упрощение и ускорение анализа, а также разработку критериев его количественной и качественной оценки. 3 пр.

Изобретение относится к области медицины, а именно к гинекологии и молекулярной биологии, и может быть использовано для оценки риска развития рака шейки матки при цервикальной интраэпителиальной неоплазии и носительстве вируса папилломы человека (ВПЧ) у женщин репродуктивного возраста. Для этого берут клетки с поверхности экзоцервикса, выделяют из них РНК и измеряют уровни экспрессии мРНК генов: MKI67, CDKN2A, PGR, ВАХ. На основании соотношений уровней экспрессии мРНК вычисляют значение линейной дискриминантной функции (ЛДФ): ЛДФ=l,2*lg[CDKN2A]/[ВАХ]-lg[PGR]/[MKI67]-1, где [CDKN2A]/[ВАХ] - отношение уровней экспрессии мРНК CDKN2A и ВАХ, [PGR]/[MKI67] - отношение уровней экспрессии мРНК прогестеронового рецептора и MKI67, и если значение ЛДФ≤0, делают заключение о низком риске неопластической трансформации; при значении ЛДФ>0 риск неопластической трансформации определяют как повышенный. Способ позволяет оценить риск развития рака шейки матки по представленности мРНК референсных генов. 2 ил., 1 пр.

Изобретение относится к области биотехнологии и медицины. Представлен способ, основанный на измерении в вагинальных соскобах уровня экспрессии мРНК генов интерлейкинов IL1B, IL8, IL10 и IL18 относительно представленности мРНК референсных генов B2M, GUS, TBP или HPRT; на основании полученных уровней экспрессии вычисляется значение канонической линейной дискриминантной функции (КЛДФ) следующим образом: Y=1,09*IL1B-0,61*IL8+0,21*IL10-0,11*IL18-0,91 (формула 1), где IL1B - относительный уровень экспрессии IL1B, IL8 - относительный уровень экспрессии IL8, IL10 - относительный уровень экспрессии IL10, IL18 - относительный уровень экспрессии IL18; IL=2^(Cpmin-Cpil)/NF (формула 2), где IL - относительный уровень экспрессии гена интерлейкина, Cpmin - коэффициент минимального значения уровня экспрессии, для IL1B Cpmin=17,9; IL8 Cpmin=16,6; IL10 Cpmin=28,8; IL18 Cpmin=23,3; Cpil - значение порогового цикла соответствующего IL в образце, определяемого автоматически; NF - фактор нормировки, вычисляется по формуле 3: (формула 3), где NF - фактор нормировки, вычисляемый как среднее геометрическое 4 факторов нормировки для референсных генов (см. формулу 4); NFref=2^(Cpmin-Cpref) (формула 4), где NFref - фактор нормировки для референсного гена, Cpmin - коэффициент минимального значения уровня экспрессии референсного гена, Cpref - показания прибора порогового значения в образце; значения Cpmin для референсных генов следующие: GUS Cpmin=26,5; HPRT Cpmin=26,8; B2M Cpmin=18,9; ТВР Cpmin=28,4; при этом, если значение КЛДФ≤0,1, делается заключение об отсутствии вагинита, значения КЛДФ>0,1 соответствуют вагиниту. Изобретение позволяет объективно выявить наличие вагинита у беременной женщины. 1 з.п. ф-лы, 1 ил., 3 табл., 3 пр.
Изобретение относится к области медицины. Предложен способ прогнозирования риска нарушений фертильности у мужчин с ожирением, включающий отбор венозной крови, проведение аллель-специфичной полимеразной цепной реакции с использованием флуоресцентно-меченного олигонуклеотидного зонда и анализа кривой плавления. При выявлении аллеля А полиморфных вариантов rs2414096 и rs749292 гена ароматазы CYP19A прогнозируют риск нарушения фертильности у мужчин с ожирением. Изобретение обеспечивает новые прогностические критерии для оценки риска нарушений фертильности у мужчин с ожирением. 8 табл.

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к способу оценки степени пролиферации лимфоцитов с помощью маркерных генов методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР РВ)

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к набору синтетических олигонуклеотидов для осуществления генетического скрининга мутаций гена BRCA1
Изобретение относится к области биотехнологии и вирусологии

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии и может быть использовано в качестве дополнительного метода обследования пациентов при ранней диагностике воспалительного процесса при раннем ревматоидном артирите
Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к набору синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК возбудителя человеческого моноцитарного эрлихиоза (МЭЧ) - патогенных представителей рода Ehrlichia методом полимеразной цепной реакции

Изобретение относится к микробиологии, биотехнологии и медицине

Изобретение относится к области молекулярной биологии и биотехнологии и может быть использовано для разработки систем анализа дезоксирибонуклеиновых кислот

Изобретение относится к области медицины, биологии и биотехнологии

 


© Патентный поиск, поиск патентов на изобретения - FindPatent.RU 2012-2024
Политика конфиденциальности
Наверх