Патенты автора Дементьева Екатерина Игоревна (RU)
Настоящее изобретение относится к биотехнологии, микробиологии и медицине и представляет собой сконструированный плазмидный вектор, содержащий ген, кодирующий β-лактамазу расширенного спектра действия, способную гидролизовать пенициллины и цефалоспорины, и предназначенный для репликации в клетках Escherichia coli и Neisseria gonorrhoeae. Плазмида содержит плазмидную ДНК pblaTEM-135 N. gonorrhoeae, из которой вырезан фрагмент гена bla и заменен на аналогичный фрагмент гена bla с мутацией GGT→AGT, приводящей к замене глицина на серии в кодоне 238 (Gly238Ser), что позволяет экспрессировать β-лактамазу расширенного спектра действия ТЕМ-20, способную гидролизовать пенициллины и цефалоспорины. Изобретение также раскрывает способ конструирования плазмидного вектора. Настоящее изобретение позволяет получить плазмидный вектор для оценки устойчивости N. gonorrhoeae к β-лактамным антибиотикам, включая препараты выбора для лечения гонококковой инфекции - цефалоспорины III поколения. 2 н. и 2 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой способ идентификации мутаций в гене пенициллинсвязывающего белка 2 penA возбудителя гонореи Neisseria gonorrhoeae, приводящих к устойчивости к бета-лактамным антибиотикам (пенициллины, цефалоспорины). Способ включает обеспечение биологического микрочипа с иммобилизованными олигонуклеотидными зондами, мультиплексную амплификацию фрагментов гена penА, гибридизацию амплифицированных флуоресцентно-меченных продуктов на биочипе, регистрацию и интерпретацию результатов гибридизации. 4 з.п. ф-лы, 2 пр., 3 табл., 6 ил.
Изобретение относится к области биотехнологии, биохимии, молекулярной биологии, микробиологии и медицине. Предложен ДНК-чип и набор для идентификации генетических детерминант резистентности микроорганизмов - возбудителей инфекций, приводящих к нарушению репродуктивных функций человека: Treponema pallidum, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealiticum, Atopobium vaginae, Enterococcus faecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris, Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, к антимикробным препаратам, включающим антибиотики пенициллинового ряда, цефалоспорины, тетрациклины, фторхинолоны, макролиды, нитроимидазолы, спектиномицин. Изобретение может быть использовано в медицине для эффективной персонифицированной терапии заболеваний, клинической лабораторной диагностике, эпидемиологии. 2 н.п. ф-лы, 22 ил., 4 табл., 2 пр.
Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложены олигонуклеотидный биочип для идентификации генетических детерминант резистентности N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам, включающим фторхинолоны, антибиотики пенициллинового ряда, цефалоспорины, тетрациклины, макролиды, спектиномицин, а также набор олигонуклеотидов для иммобилизации на биочипе. Биочип представляет собой подложку с объединенными в группы элементами, содержащими 2 ячейки, не содержащие зондов, для вычисления фонового сигнала, 3 ячейки с иммобилизированным маркером для правильного позиционирования биочипа, а также ячейки с иммобилизованными олигонуклеотидами, устанавливающими принадлежность анализируемой ДНК к виду N. Gonorrhoeae, и олигонуклеотидами, обеспечивающими идентификацию генетических детерминант, ассоциированных с резистентностью возбудителя к антимикробным препаратам, причем олигонуклеотиды имеют последовательности SEQ ID NO: 1-43. Изобретения позволяют за короткое время точно определять генетические детерминанты резистентности N. gonorrhoeae к антибактериальным препаратам в клиническом материале. 2 н.п. ф-лы, 16 ил., 2 табл., 2 пр.
Изобретение относится к области молекулярной биологии, микробиологии и медицины. Описан способ одновременной таргетной амплификации фрагментов геномов возбудителей инфекций органов репродукции человека, включающих Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum, Atopobium vaginae, Enterococcus faecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris, Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, Treponema pallidum, с целью одновременной идентификации возбудителей. Мультиплексная ПЦР проводится в едином реакционном объеме в два этапа с использованием по меньшей мере двух пар праймеров, последовательности которых комплементарны последовательностям сегментов гена 16S рРНК возбудителей. ПЦР включает два последовательных профиля амплификации, различающихся температурами отжига пар праймеров. Способ обладает устойчивостью к контаминации ПЦР-продуктами, высокой аналитической чувствительностью и существенно уменьшает время и трудоемкость анализа. Изобретение включает также набор праймеров для осуществления способа. 2 н.п. ф-лы, 16 ил., 1 табл., 1 пр.
Изобретение относится к области молекулярной биологии, вирусологии, ветеринарии и медицине и касается способа идентификации РНК вирусов гриппа А и В с одновременным определением вариантов гемагглютинина и нейраминидазы вируса гриппа А, а также генетических маркеров патогенности и устойчивости к противогриппозным препаратам, на биологических микрочипах. Способ основан на проведении реакции обратной транскрипции для получения кДНК с использованием вирусной РНК в качестве матрицы, полимеразной цепной реакции (ПЦР) и последующей гибридизации полученного одноцепочечного флуоресцентно-меченного ПЦР-продукта на биологическом микрочипе. Биологический микрочип представляет собой подложку с упорядоченно расположенными гидрогелевыми элементами, содержащими ковалентно иммобилизованные олигонуклеотидные зонды, которые обеспечивают гибридизацию со специфическими участками генома вируса гриппа, определяющими его тип, субтип и генетические маркеры, включая детерминанты устойчивости к противовирусным препаратам. 3 н. и 2 з.п. ф-лы, 27 ил., 4 табл., 3 пр.
Изобретение относится к области молекулярной биологии. Предложен способ автоматизированного выделения с одновременной очисткой нуклеиновых кислот из двух и более биологических образцов. Способ выделения с одновременной очисткой нуклеиновых кислот осуществляют в отдельном для каждого образца одноразовом модуле на вращающейся платформе. Причём выделение с одновременной очисткой нуклеиновых кислот включает стадию лизиса с использованием сухой реакционной смеси лизирующего буфера, содержащего лизоцим, стадию лизиса клеток, микроорганизмов и вирусных частиц с использованием сухой реакционной смеси лизирующего буфера, содержащего хаотропный агент, протеолитический фермент и детергент, добавление спирта к полученному лизату, связывание нуклеиновых кислот на твердофазном сорбенте, растворение сухой реакционной смеси промывочного буфера, отмывку нуклеиновых кислот от примесей, элюцию нуклеиновых кислот. Изобретение обеспечивает быстрое проведение с высоким выходом процедуры одновременного выделения и очистки нуклеиновых кислот двух или более биологических образцов, а также исключение контакта персонала с инфекционным образцом в процессе выделения нуклеиновых кислот. 8 з.п. ф-лы, 6 ил., 1 табл., 4 пр.
Изобретение относится к области биохимии и медицины, в частности к аналитической химии и иммунохимическому анализу, и описывает способ обработки образца сыворотки или плазмы крови. Способ характеризуется тем, что перед проведением иммуноанализа производят удаление иммуноглобулинов G из образца, в частности, путем взаимодействия образца с сорбентом, специфически связывающим иммуноглобулины G, затем проводят иммунологический анализ аллерген-специфических и общих иммуноглобулинов Е с использованием аллергенов или смесей аллергенов и антител против иммуноглобулинов Е, иммобилизованных в элементах биологического микрочипа, представляющего собой массив трехмерных гидрогелевых элементов, содержащий элементы с ковалентно иммобилизованными аллергенами и антителами против иммуноглобулина Е, при этом элементы массива представляют собой микрокапли, полученные методом полимеризационной иммобилизации. Предложенный способ характеризуется снижением неспецифических сигналов, увеличением соотношения «сигнал/фон», увеличением воспроизводимости измеряемых специфических сигналов и увеличением чувствительности и воспроизводимости при проведении анализа определения общих и аллерген-специфических иммуноглобулинов. Изобретение может использоваться в аналитической биохимии, иммунологии и медицине, в частности при проведении диагностики и мониторинга лечения аллергий. 2 з.п. ф-лы, 2 ил., 2 табл., 2 пр.
Изобретение относится к молекулярной биологии и медицине
Изобретение относится к биохимии и молекулярной биологии, в частности к иммунохимическому анализу
Изобретение относится к области медицины, а именно к аналитической биохимии и количественному иммунохимическому анализу, и касается способа количественного обнаружения различных биологических токсинов иммунохимическим методом с использованием биологических микрочипов
