Патенты автора Шаскольский Борис Леонидович (RU)
Настоящее изобретение относится к биотехнологии, микробиологии и медицине и представляет собой сконструированный плазмидный вектор, содержащий ген, кодирующий β-лактамазу расширенного спектра действия, способную гидролизовать пенициллины и цефалоспорины, и предназначенный для репликации в клетках Escherichia coli и Neisseria gonorrhoeae. Плазмида содержит плазмидную ДНК pblaTEM-135 N. gonorrhoeae, из которой вырезан фрагмент гена bla и заменен на аналогичный фрагмент гена bla с мутацией GGT→AGT, приводящей к замене глицина на серии в кодоне 238 (Gly238Ser), что позволяет экспрессировать β-лактамазу расширенного спектра действия ТЕМ-20, способную гидролизовать пенициллины и цефалоспорины. Изобретение также раскрывает способ конструирования плазмидного вектора. Настоящее изобретение позволяет получить плазмидный вектор для оценки устойчивости N. gonorrhoeae к β-лактамным антибиотикам, включая препараты выбора для лечения гонококковой инфекции - цефалоспорины III поколения. 2 н. и 2 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой способ идентификации мутаций в гене пенициллинсвязывающего белка 2 penA возбудителя гонореи Neisseria gonorrhoeae, приводящих к устойчивости к бета-лактамным антибиотикам (пенициллины, цефалоспорины). Способ включает обеспечение биологического микрочипа с иммобилизованными олигонуклеотидными зондами, мультиплексную амплификацию фрагментов гена penА, гибридизацию амплифицированных флуоресцентно-меченных продуктов на биочипе, регистрацию и интерпретацию результатов гибридизации. 4 з.п. ф-лы, 2 пр., 3 табл., 6 ил.
Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано в медицине. Изобретение касается способа выявления нуклеотидных замен в генах, влияющих на метаболизм химиотерапевтических препаратов. Изобретение включает биологический микрочип (биочип), набор олигонуклеотидных зондов и праймеров для осуществления способа. Идентификация полиморфизмов осуществляется путем амплификации фрагментов генов с полиморфными локусами с использованием набора праймеров и последующей гибридизацией продуктов амплификации на биочипе с иммобилизованными олигонуклеотидными зондами. 3 н. и 2 з.п. ф-лы, 5 ил., 2 табл., 2 пр.
Изобретение относится к области биотехнологии, биохимии, молекулярной биологии, микробиологии и медицине. Предложен ДНК-чип и набор для идентификации генетических детерминант резистентности микроорганизмов - возбудителей инфекций, приводящих к нарушению репродуктивных функций человека: Treponema pallidum, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealiticum, Atopobium vaginae, Enterococcus faecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris, Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, к антимикробным препаратам, включающим антибиотики пенициллинового ряда, цефалоспорины, тетрациклины, фторхинолоны, макролиды, нитроимидазолы, спектиномицин. Изобретение может быть использовано в медицине для эффективной персонифицированной терапии заболеваний, клинической лабораторной диагностике, эпидемиологии. 2 н.п. ф-лы, 22 ил., 4 табл., 2 пр.
Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложены олигонуклеотидный биочип для идентификации генетических детерминант резистентности N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам, включающим фторхинолоны, антибиотики пенициллинового ряда, цефалоспорины, тетрациклины, макролиды, спектиномицин, а также набор олигонуклеотидов для иммобилизации на биочипе. Биочип представляет собой подложку с объединенными в группы элементами, содержащими 2 ячейки, не содержащие зондов, для вычисления фонового сигнала, 3 ячейки с иммобилизированным маркером для правильного позиционирования биочипа, а также ячейки с иммобилизованными олигонуклеотидами, устанавливающими принадлежность анализируемой ДНК к виду N. Gonorrhoeae, и олигонуклеотидами, обеспечивающими идентификацию генетических детерминант, ассоциированных с резистентностью возбудителя к антимикробным препаратам, причем олигонуклеотиды имеют последовательности SEQ ID NO: 1-43. Изобретения позволяют за короткое время точно определять генетические детерминанты резистентности N. gonorrhoeae к антибактериальным препаратам в клиническом материале. 2 н.п. ф-лы, 16 ил., 2 табл., 2 пр.
Изобретение относится к области молекулярной биологии, микробиологии и медицины. Описан способ одновременной таргетной амплификации фрагментов геномов возбудителей инфекций органов репродукции человека, включающих Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum, Atopobium vaginae, Enterococcus faecalis, Trichomonas vaginalis, Escherichia coli, Mobiluncus mulieris, Streptococcus anginosus, Fusobacterium nucleatum, Staphylococcus epidermidis, Bacteroides fragilis, Treponema pallidum, с целью одновременной идентификации возбудителей. Мультиплексная ПЦР проводится в едином реакционном объеме в два этапа с использованием по меньшей мере двух пар праймеров, последовательности которых комплементарны последовательностям сегментов гена 16S рРНК возбудителей. ПЦР включает два последовательных профиля амплификации, различающихся температурами отжига пар праймеров. Способ обладает устойчивостью к контаминации ПЦР-продуктами, высокой аналитической чувствительностью и существенно уменьшает время и трудоемкость анализа. Изобретение включает также набор праймеров для осуществления способа. 2 н.п. ф-лы, 16 ил., 1 табл., 1 пр.
Изобретение относится к области молекулярной биологии, вирусологии, ветеринарии и медицине и касается способа идентификации РНК вирусов гриппа А и В с одновременным определением вариантов гемагглютинина и нейраминидазы вируса гриппа А, а также генетических маркеров патогенности и устойчивости к противогриппозным препаратам, на биологических микрочипах. Способ основан на проведении реакции обратной транскрипции для получения кДНК с использованием вирусной РНК в качестве матрицы, полимеразной цепной реакции (ПЦР) и последующей гибридизации полученного одноцепочечного флуоресцентно-меченного ПЦР-продукта на биологическом микрочипе. Биологический микрочип представляет собой подложку с упорядоченно расположенными гидрогелевыми элементами, содержащими ковалентно иммобилизованные олигонуклеотидные зонды, которые обеспечивают гибридизацию со специфическими участками генома вируса гриппа, определяющими его тип, субтип и генетические маркеры, включая детерминанты устойчивости к противовирусным препаратам. 3 н. и 2 з.п. ф-лы, 27 ил., 4 табл., 3 пр.
Изобретение относится к биотехнологии
