Патенты автора Купрюшкин Максим Сергеевич (RU)
Изобретение относится к нуклеотидам и олигонуклеотидам, которые могут быть использованы для исследований in vitro и in vivo. Предложено соединение формулы (I)
где Z выбран из -О- и -S-; R1 выбран из -NR1AR1B, -OR3, -Н; R2 выбран из -NR2AR2B; R3 выбран из -C1-10алкила; где R1A, R1B, R2A и R2B выбраны из -Н, -С1-10алкила; или необязательно R1A и R2A образуют алкиленовую цепь длиной 2-4 атома; необязательно R1A и R1B или R2A и R2B вместе с атомом, с которым они связаны, образуют 5-членный гетероцикл; X выбран из 5'-конца нуклеозида, олигонуклеотида; Y выбран из 3'-конца нуклеозида, олигонуклеотида, -ОН или -O-PG; или Y выбран из 5'-конца нуклеозида, олигонуклеотида, и X выбран из 3'-конца нуклеозида, олигонуклеотида, -ОН или -O-PG; олигонуклеотид содержит 2-500 нуклеотидов, PG представляет собой флуоресцентную метку или остаток гасителя флуоресценции. Предложен олигонуклеотид из 2-500 нуклеотидов, в котором хотя бы одна межнуклеотидная фосфатная группа модифицирована в соответствии с формулой FVII
где показывает место присоединения соответствующих олигонуклеотиду заместителей, R1 выбран из -NR1AR1B, -OR3, -Н; R2 выбран из -NR2AR2B; R3 выбран из -C1-10алкила; R1A, R1B, R2A и R2B выбраны из -Н, -С1-10алкила; необязательно R1A и R2A вместе образуют алкиленовую цепь длиной 2-4 атома; необязательно R1A и R1B или R2A и R2B вместе с атомом, с которым они связаны, образуют 5-членный гетероцикл. Предложен способ получения соединения формулы (I), включающий реакцию Н-фосфоната, полученного согласно Н-фосфонатному методу олигонуклеотидного синтеза, или фосфита, полученного согласно амидофосфитному методу олигонуклеотидного синтеза, с соответствующим имино производным общей формулы HN=CR1R2 или RSi3SiN=CR1R2 в присутствии окислителя, где R1 и R2 указаны выше, RSi является алкилом или арилом. Предложен способ получения соединения формулы (I), включающий реакцию фосфита, полученного согласно амидофосфитному методу олигонуклеотидного синтеза, с органическим азидом, выбранным из формул где противоион выбран из Cl-, Br-, I-, CF3SO3-, п-толуолсульфоната C7H7SO3-, PO2Cl2-, ClO4-, BF4-, BPh4-, PF6-, где R1A, R1B, R2A, R2B, R2 определены выше, необязательно в присутствии силилирующего реагента и/или основания. Предложены новые олигонуклеотиды и способы их получения, пригодные в биомедицинских исследованиях. 6 н.п. ф-лы, 47 пр., 8 ил.
СПОСОБ АМПЛИФИКАЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ФОСФОРИЛГУАНИДИНОВЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ // 2698134
Изобретение относится к биотехнологии. Изобретение может быть использовано в разработке и оптимизации ПЦР и ОТ-ПЦР систем, применяемых для выявления нуклеиновых кислот, в том числе при диагностике генетических, вирусных и других заболеваний. Предложен способ матричного ферментативного синтеза ДНК. Способ отличается тем, что в качестве праймеров при проведении полимеразной цепной реакции (ПЦР) и ПЦР в сочетании с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) используют нейтральные производные олигонуклеотидов, а именно фосфорилгуанидины. Фосфорилгуанидины содержат одну или более фосфатных групп, в которых на атоме фосфора введен остаток гуанидина или замещенного гуанидина. Техническим результатом является повышение достоверности, чувствительности и специфичности выявления анализируемых последовательностей нуклеиновых кислот, а также упрощение способа матричного синтеза ДНК. 6 з.п. ф-лы, 16 ил., 14 пр.
Изобретение относится к области биоорганической химии
