Изобретение относится к фармацевтической промышленности, а именно к способу получения водорастворимых фракций маннопротеинов и β-глюкана. Способ получения водорастворимых фракций маннопротеинов и β-глюкана, заключающийся в том, что биомассу дрожжей предварительно подвергают механической активации в активаторах или мельницах, к полученному механокомпозиту добавляют раствор ферментного комплекса, проявляющий β-глюканазную или протеазную активность, проводят гидролиз, полученный гидролизат разделяют на маннопротеиновую и β-глюкановую фракции, которые подвергают последующей очистке, при определенных условиях.