Изобретение относится к сельскому хозяйству, мелиорации и биотехнологии и может быть использовано для получения органического удобрения на основе сплавины, извлеченной из водоемов при их очистке. Способ получения органического удобрения из сплавины, извлеченной при очистке водоемов, включает ее компостирование в буртах в естественных условиях вегетационного периода с добавлением фосфоритной муки, мочевины и штамма целлюлозоразлагающих микроскопических грибов Trichoderma sр.