Изобретение относится к области медицины, а именно к лабораторной диагностике, и может быть использовано для прогнозирования реализации гестационных осложнений с ранних сроков беременности. Способ включает определение наличия угрозы прерывания настоящей беременности и носительства полиморфизмов генов фолатного обмена, а также относительного содержания CD54+-лимфоцитов, уровня лактоферрина и β-субъединицы хорионического гонадотропина (β-ХГЧ) в венозной крови женщины в период с момента наступления беременности до конца первого триместра.