Настоящее изобретение относится к фармацевтической промышленности, а именно к фармацевтической композиции для лечения неонатальных поражений головного мозга, содержащей метионин. Представлена фармацевтическая композиция для лечения неонатального поражения головного мозга в форме порошка для диспергирования в водном разбавителе c определенной концентрацией наночастиц, состоящих из мелатонина в качестве активного ингредиента в смеси с одним или более фосфолипидами, имеющими чистоту, равную или более 99%, выбранными из группы, состоящей из фосфатидилхолинов, фосфатидилглицеринов, фосфатидилэтаноламинов, фосфатидилсеринов, фосфатидилинозита и лецитинов, при определенном соотношении между мелатонином и фосфолипидом, и где один из указанных фосфолипидов адсорбирован на поверхности мелатонина; смеси маннита и трегалозы в качестве криопротектора в определённой концентрации и соотношении.