Изобретение относится к области биотехнологии и касается способа приготовления геномных библиотек ограниченных выборок локусов из деградированной ДНК. Способ включает проведение гидролиза геномной ДНК эндонуклеазой рестрикции, формирующей фрагменты с 5'-липким концом, и частичное тупление концов полимеразной реакцией в присутствии неполного набора дезоксирибонуклеозидтрифосфатов.