Il-13 связывающие агенты
Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой антитела, которые специфически связываются с IL-13. Также представлены нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела, вектора экспрессии, содержащие последовательности указанных нуклеиновых кислот, а также клетки, содержащие такие вектора. Кроме того представлены способ диагностирования связанного с IL-13 нарушения, способ получения молекулы рекомбинантного антитела, способ лечения расстройства, связанного с активностью IL-13, способ определения IL-13 в образце и способ лечения субъекта, демонстрирующего симптом астмы. Изобретение может эффективно применяться в диагностировании и лечении опосредованных IL-13 нарушений. 32 н. и 84 з.п. ф-лы, 16 ил., 4 табл.
Текст описания приведен в факсимильном виде.
1. Очищенная молекула антитела, включающая вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина и вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, которая связывает IL-13 с Kd меньше, чем 10-7 М, причем вариабельный домен тяжелой цепи включает последовательность аминокислот, выбранную из:
(i) G-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-H (SEQ ID NO:48) в CDR1,
(ii) (WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-G (SEQ ID NO: 49) в CDR2, и (iii) SEENWYDFFDY (SEQ ID NO:17) в CDR3;
и при этом вариабельный домен легкой цепи содержит последовательность аминокислот:
(i) (RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS) (SEQ ID NO: 25) в CDR1,
(ii) K(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-S(SEQ ID NO: 27) в CDR2, и
(iii) Q-(GSA)-(ST)-(HEQ)-I-P(SEQ ID NO: 28) в CDR3,
причем CDR 1-3 вариабельных доменов тяжелой и легкой цепи определены согласно AbM.
2. Очищенная молекула антитела, которая содержит вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина и вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, которая связывает IL-13 с КD меньше, чем 10-7 М,
причем вариабельный домен тяжелой цепи содержит последовательность
аминокислот, выбранную из:
GFNIKDTYIH (SEQ ID NO: 15) в CDR1,
RIDPANDNIKYDPKFQG (SEQ ID NO: 16) в CDR2, и
SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 17) в CDR3; последовательность
вариабельного домена легкой цепи содержит:
RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO: 18) в CDR1,
KVSNRFS (SEQ ID NO: 19) в CDR2, и
FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 20) в CDR3, причем CDR 1-3 вариабельных
доменов тяжелой и легкой цепи определены по АbМ.
3. Молекула антитела по п.1 или 2, которое имеет одно или более из следующих свойств:
(a) молекула антитела конкурирует за связывание с IL-13 человека с моноклональным антителом, имеющим вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133, причем IL-13 человека включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 124;
(b) молекула антитела связывается с одним или более остатком аминокислоты последовательности IL-13, выбранным из группы, состоящей из остатков 116, 117, 118, 122, 123, 124, 125, 126, 127 и 128 последовательности IL-13 отличного от человека примата (SEQ ID NO: 24), или IL-13 человека (SEQ ID NO: 178);
(c) молекула антитела содержит вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит ту же самую каноническую структуру в гипервариабельных петлях 1, 2 или 3, что и моноклональное антитело, имеющее вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133; или
(d) молекула антитела вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит ту же самую каноническую структуру в гипервариабельных петлях 1, 2 или 3, что и моноклональное антитело, имеющее вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133.
4. Молекула антитела по п.3, отличающаяся тем, что гипервариабельные петли вариабельного домена тяжелой цепи молекулы антитела имеют те же самые канонические структуры, что и гипервариабельные петли 1, 2 и 3 моноклонального антитела, имеющего вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133.
5. Молекула антитела по п.1, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи содержит последовательность аминокислот:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGQGLEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 83),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-H, WVRQAPGQRLEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 84),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQATGQGLEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTMTRNTSISTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 85),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGQGLEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 86),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWMG(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCATSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 87),
QMQLVQSGAEVKKTGSSVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGQALEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTITRDRSMSTAYMELSSLRSEDTAMYYCARSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 88),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGQGLEWMG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 89),
QMQLVQSGPEVKKPGTSVKVSCKASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQARGQRLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRVTITRDMSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAASEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 90),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 91),
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAK DSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 92),
QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWIRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 93),
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTTSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 94),
EVQLVESGGGWRPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYHCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 95),
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 96),
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-1-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 97),
QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 98),
QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 99),
EVQLVESGGVWQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNSKNSLYLQMNSLRTEDTALYYCAKDSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 100),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRDEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 101),
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWFRQAPGKGLEWVG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDGSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCTRSEENWYDFFDY(SEQ ID NO: 102),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEYVS-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNSKNTLYLQMGSLRAEDMAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 103),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 104),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GKATISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 105),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 106),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 107),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GKATISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 108),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 109),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 110),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVA-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISRDNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 111),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWVG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 112),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 113),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTGSG-(YF)-(NT)-1 -K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 114), или
EVQLQQSGAELVKPGASVKLSCTGSG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVKQRPEQGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GKATITADTSSNTAYLQLNSLTSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 115),
или консервативную замену аминокислоты в каркасном участке в одном или более из положений 2, 4, 6, 25, 36, 37, 39, 47, 48, 49, 72, 79, 93, 94, 103, 104, 106 и 107, в соответствии с нумерацией Kabat.
6. Молекула антитела по п.2, которое имеет каркасный домен тяжелой цепи, содержащий последовательность аминокислот:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYC ARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 50),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQRLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 51),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQATGQGLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTMTRNTSISTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 52),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 53),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCATSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 54),
QMQLVQSGAEVKKTGSSVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQALEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTITRDRSMSTAYMELSSLRSEDTAMYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 55),
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 56),
QMQLVQSGPEVKKPGTSVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQARGQRLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRVTITRDMSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAASEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 57),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 58),
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKDSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 59),
QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWIRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 60),
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTTSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 61),
EVQLVESGGGWRPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYHCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 62),
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 63),
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 64),
QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 65),
QVQLVESGGGWQPGRSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 66),
EVQLVESGGWVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNSKNSLYLQMNSLRTEDTALYYCAKDSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 67),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRDEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 68),
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGFNIKDTYIHWFRQAPGKGLEWVGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDGSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCTRSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 69),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEYVSRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNSKNTLYLQMGSLRAEDMAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 70),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 71),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGKATISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 72),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 73),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 74),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGKATISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 75),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 76),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 77),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIDPANDNIKYDPKFQGRFTISRDNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 78),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYC ARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 79),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80),
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTGSGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 81), или
EVQLQQSGAELVKPGASVKLSCTGSGFNIKDTYIHWVKQRPEQGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGKATITADTSSNTAYLQLNSLTSEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 82).
7. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи включает последовательность аминокислот:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80), или EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASG-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-HWVRQAPGKGLEWIG-(WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-GRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 113).
8. Молекула антитела по п.1, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи содержит последовательность аминокислот:
DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYLQKPGQSPQLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 39),
DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WFQQRPGQSPRRLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 40),
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYLQKPGQSPQLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 41),
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYLQKPGQPPQLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 42),
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYLQKPGQSPQLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 43),
DIVMTQTPLSSPVTLGQPASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-YEDNQYAS)WLQQRPGQPPRLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGAGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 44),
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYQQKPGKAPKLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 45), или
DVLMTQTPLSLPVSLGDQASISC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)WYLQKPGQSPKLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P (SEQ ID NO: 46),
или консервативную замену аминокислоты в каркасном участке в одном или более из положений 2, 4, 6, 35, 38, 44, 47, 49, 62, 64-69, 85, 87, 98, 99, 101 и 102, в соответствии с нумерацией Kabat.
9. Молекула антитела по п.2, которая имеет вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот:
DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYТ (SEQ ID NO: 30),
DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWFQQRPGQSPRRLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYT(SEQ ID NO: 31),
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 32),
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQPPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 33),
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYТ (SEQ ID NO: 34),
DIVMTQTPLSSPVTLGQPASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWLQQRPGQPPRLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGAGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYТ (SEQ ID NO: 35),
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCFQGSHIPYT(SEQ ID NO: 36),
DWMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVYSDGNTYLNWFQQRPGQSPRRLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 37), или
DVLMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQKPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCFQGSHIPYТ (SEQ ID NO: 38).
10. Молекула антитела по любому из пп.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи включает последовательность аминокислот:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 36),
или
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC-(RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS)-WYQQKPGKAPKLLIYK-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-SGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCF-Q-(GSA)-(SIT)-(HEQ)-(IL)-P(SEQ ID NO: 45).
11. Молекула антитела по п.1, отличающаяся тем, что указанное антитело характеризуется одним или более из следующих признаков:
(a) вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина содержит последовательность аминокислот GFNIKDTYIH (SEQ ID NO: 15) в CDR1; RIDPANDNIKYDPKFQG (SEQ ID NO: 16) в CDR2 или SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 17) в CDR3;
(b) вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина содержит последовательность аминокислот RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO: 18) в CDR1; KVSNRFS (SEQ ID N0:19) в CDR2 или FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 20) в CDR3;
(c) вариабельный домен тяжелой цепи кодирует нуклеиновая кислота, которая гибридизуется в жестких условиях с комплементом нуклеиновой кислоты, включающей последовательность нуклеотидов SEQ ID NO: 154 (V2.1), SEQ ID NO: 156 (V2.2), SEQ ID NO: 158 (V2.3), SEQ ID NO: 160 (V2.4), SEQ ID NO: 162 (V2.5), SEQ ID NO: 164 (V2.6), SEQ ID NO: 166 (V2.7), SEQ ID NO: 168 (V2.8), SEQ ID NO: 170 (V2.10) или SEQ ID NO: 172 (V2.11);
(d) последовательность вариабельного домена легкой цепи иммуноглобулина кодирует нуклеиновая кислота, которая гибридизуется в жестких условиях с комплементом нуклеиновой кислоты, включающей последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 152 (V2.11);
(e) последовательность вариабельного домена тяжелой цепи иммуноглобулина содержит последовательность аминокислот, которая является, по меньшей мере, на 90% идентичной последовательности аминокислот вариабельного домена тяжелой цепи V2.1, (SEQ ID NO: 155). V2.2 (SEQ ID NO: 157); V2.3 (SEQ ID NO: 159), V2.4 (SEQ ID NO: 161), V2.5 (SEQ ID NO: 163), V2.6 (SEQ ID NO: 165), V2.7 (SEQ ID NO: 167), V2.8 (SEQ ID NO: 169), V2.10 (SEQ ID NO: 171) или V2.11 (SEQ ID NO: 173);
(f) последовательность вариабельного домена легкой цепи иммуноглобулина содержит последовательность аминокислот, которая является, по меньшей мере, на 90% идентичной последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 153);
(g) молекула антитела конкурирует за связывание с IL-13 человека с антителом MJ2-7, которое имеет вариабельный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130 и вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133, причем указанный IL-13 человека содержит остатки аминокислот SEQ ID NO: 124;
(h) молекула антитела вступает в контакт с одним или более аминокислотным остатком IL-13, выбранным из группы, состоящей из остатков 116, 117, 118, 122, 123, 124, 125, 126, 127 и 128 последовательности IL-13 отличного от человека примата (SEQ ID NO: 24) или последовательности IL-13 человека (SEQ ID NO: 178);
(i) вариабельный домен тяжелой цепи указанной молекулы антитела имеет такую же каноническую структуру, как гипервариабельные петли 1, 2 и/или 3 антитела MJ2-7, причем вариабельный домен тяжелой цепи антитела MJ2-7 содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130;
(j) вариабельный домен указанной молекулы антитела легкой цепи имеет такую же каноническую структуру, как гипервариабельные петли 1, 2 и/или 3 антитела MJ2-7, причем вариабельный домен легкой цепи антитела MJ2-7 содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133;
(k) вариабельный домен тяжелой цепи и/или последовательность легкой цепи вариабельного домена указанной молекулы антитела содержит каркасные области FR1, FR2 и FR3 из VH сегментов, кодируемых генами зародышевой линии DP-54 и DPK-9 соответственно, или последовательность, по меньшей мере, на 95% идентичную VH сегментам, кодируемым генами зародышевой линии DP-54 и DPK-9;
(l) молекула антитела, которая препятствует взаимодействию при связывании между IL-13 и IL-13 Rα1, причем указанное взаимодействие при связывании включает взаимодействие остатка Phe107 IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13Rα1 и взаимодействия Ван-дер-Ваальса остатков Arg11, Glu12, Leu13, Ile14, Glu15, Lys104, Lys105, Leu106, Phe107 и Arg108 последовательности IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13 Rα1; и/или
(m) молекула антитела препятствует взаимодействию связывания между IL-13 и IL-13 Rα1, причем указанное взаимодействие связывания включает взаимодействие остатков Leu319, Cys257, Arg256, и Cys320 IL-13Rα1 (SEQ ID NO: 125) с IL-13 и взаимодействие Ван-дер-Ваальса между Ile254, Ser255, Arg256, Lys318, Cys320 и Туг321 последовательности IL-13Rα1 (SEQ ID NO: 125) с IL-13.
12. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, отличающаяся тем, что является очищенной.
13. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, отличающаяся тем, что представляет собой рекомбинантную молекулу IgG, которая содержит Fc домен.
14. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, отличающаяся тем, что представляет собой Fab, F (ab') 2, Fv, Fd, dAb или scFv.
15. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, отличающаяся тем, что содержит каркасные области, которые, по меньшей мере, на 90% идентичны каркасным областям зародышевой линии человека.
16. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, отличающаяся тем, что содержит каркасные области человека, Fc область человека или и то и другое.
17. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 11, в которой гипервариабельные петли последовательности вариабельного домена тяжелой цепи имеют такую же каноническую структуру, как гипервариабельные петли антитела MJ2-7, а последовательность вариабельного домена тяжелой цепи содержит, по меньшей мере, четыре аминокислотных остатка антитела MJ2-7, которые вступают в контакт с IL-13.
18. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что каркасные области последовательности вариабельного домена тяжелой цепи содержат:
(i) Gly в положении, соответствующем 49;
(ii) Ala в положении, соответствующем 72;
(iii) Ile в положении, соответствующем 48, и Gly в положении, соответствующем 49;
(iv) Ile в положении, соответствующем 48, и Gly в положении, соответствующем 49, и Ala в положении, соответствующем 72;
(v) Lys в положении, соответствующем 67, Ala в положении, соответствующем 68, и Ala в положении, соответствующем 72; и/или
(vi) Ile в положении, соответствующем 48, Gly в положении, соответствующем 49, Ala в положении, соответствующем 72, и Ala в положении, соответствующем 79.
19. Молекула антитела по п.1, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи содержит последовательность аминокислот:
GFNIKDTYIH (SEQ ID NO: 15) в CDR1,
RIDPANDNIKYDPKFQG (SEQ ID NO: 16) в CDR2 и
SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 17) в CDR3,
где CDR1-CDR3 определены согласно АbМ.
20. Молекула антитела по п.1, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи содержит последовательность аминокислот:
RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO: 18) в CDR1,
KVSNRFS (SEQ ID NO: 19) в CDR2 и
FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 20) в CDR3,
где CDR1-CDR3 определены согласно АbМ.
21. Выделенное рекомбинантное антитело IgG против IL-13, которое содержит:
легкую цепь, которая содержит вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 36);
и тяжелую цепь, которая содержит вариабельный домен, который содержит последовательность аминокислот:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80).
22. Выделенное рекомбинантное антитело IgG по п.11 или 21, отличающееся тем, что тяжелая цепь дополнительно содержит домен Fc.
23. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 21, которая уменьшает способность IL-13 связывать IL-13 Rα1.
24. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9 или 21, которая связывает IL-13 независимо от присутствия полиморфизма в положении 130 последовательности SEQ ID NO: 24.
25. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 11 или 21, которая связывает один или более пептид, выбранные из группы, состоящий из последовательности:
FVKDLLVHLKKLFREGQ130FN(SEQ ID NO: 1);
FVKDLLVHLKKLFREGR130FN (SEQ ID NO: 2);
FVKDLLLHLKKLFREGQ130FN (SEQ ID NO: 3);
FVKDLLVHLKKLFREGR130FN (SEQ ID NO: 4);
FVKDLLVHLKKLFREG (SEQ ID NO: 5) и
FVKDLLLHLKKLFREG (SEQ ID NO: 6),
в изолированной форме или включенной в последовательность аминокислот IL-13.
26. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 11 или 21, которая имеет одно или более свойств, выбранных из следующих:
(i) уменьшает способность IL-13 связывать IL-13 Red или IL-13Rα2;
(ii) ингибирует одну или более активность, ассоциированную с IL-13 с IC50 от 50 до 5 рМ;
(iii) имеет кинетику диссоциации в диапазоне 10-2-10-6 s-1 при измерении с применением BIACORE; или
(iv) имеет Kd меньше, чем 10-8 М, 10-9 М или 10-10 М, при измерении с применением поверхностного плазмонного резонанса (SPR).
27. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела представляет собой изолированное, рекомбинантное антитело IgG, которое содержит две цепи полипептида: легкую цепь, которая включает вариабельный домен легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36) и тяжелую цепь, которая включает вариабельный домен тяжелой цепи V2.1 (SEQ ID NO: 71), V2.3 (SEQ ID NO: 73), V2.4 (SEQ ID NO: 74), V2.5 (SEQ ID NO: 75), V2.6 (SEQ ID NO: 76), V2.7 (SEQ ID NO: 77) или V2.11 (SEQ ID NO: 80).
28. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, кодированную последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более отмывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 80).
29. Молекула антитела по любому из пп.1, 2 или 28, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, кодированную последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более отмывкой в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36).
30. Молекула антитела по п.29, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела содержит каркасную область вариабельного домена легкой цепи 4 (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 47.
31. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что указанный вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 80).
32. Молекула антитела по п.31, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36).
33. Молекула антитела по п.28 или 31, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает каркасную область вариабельного домена тяжелой цепи 4 (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 116 или SEQ ID NO: 117.
34. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что указанный вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36).
35. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 80.
36. Молекула антитела по п.35, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина дополнительно включает каркасную область 4 вариабельного домена тяжелой цепи (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 116 или SEQ ID NO: 117.
37. Молекула антитела по п.34, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 36.
38. Молекула антитела по п.35, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина дополнительно включает каркасную область 4 вариабельного домена тяжелой цепи (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 117.
39. Молекула антитела по п.37, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина дополнительно включает каркасную область 4 вариабельного домена легкой цепи (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 47.
40. Молекула антитела по п.38, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает константный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 128.
41. Молекула антитела по п.39, отличающаяся тем, что молекула антитела включает константный домен легкой цепи, включающий остатки 134-219 из последовательности SEQ ID NO: 177.
42. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 36.
43. Молекула антитела по п.42, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина дополнительно включает каркасную область вариабельного домена легкой цепи (FR4), включающую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 47.
44. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 95% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36).
45. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 95% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 80).
46. Изолированная, рекомбинантная молекула IgG антитела против IL-13, которая включает:
легкую цепь, которая содержит вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 36); и
тяжелую цепь, которая включает вариабельный домен тяжелой цепи, включающий аминокислотную последовательность:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80),
отличающаяся тем, что тяжелая цепь дополнительно включает мутированный Fc домен человека, включающий аминокислотную последовательность:
STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEALGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMBEALHMWTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 128).
47. Изолированная, рекомбинантная молекула антитела против IL-13, которая включает:
(i) две легких цепи, которые содержат последовательность аминокислот SEQ ID NO: 177; и
(ii) две тяжелых цепи, которые содержат последовательность аминокислот SEQ ID NO: 176.
48. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает легкую цепь, которая содержит последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 95% идентична последовательности аминокислот каркасной и константной области SEQ ID NO: 177.
49. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает тяжелую цепь, которая включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 95% идентична последовательности аминокислот каркасной и константной области SEQ ID NO: 176.
50. Молекула антитела по п.1 или 2, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает легкую цепь, которая включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 177.
51. Молекула антитела по любому из пп.1, 2, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела включает тяжелую цепь, которая включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 176.
52. Молекула антитела по любому из пп.1 или 2, отличающаяся тем, что молекула антитела представляет собой биспецифичную или мультиспецифичную молекулу антитела.
53. Молекула антитела по любому из пп.1 или 2, отличающаяся тем, что молекула антитела связана с токсином, радиоизотопом, цитотоксическим агентом или цитостатическим агентом.
54. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот GFNIKDTYIH (SEQ ID NO: 15) в CDR1;
RIDPANDNIKYDPKFQG (SEQ ID NO: 16) в CDR2 или SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 17) в CDR3.
55. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO: 18) в CDR1; KVSNRFS (SEQ ID NO: 19) в CDR2, или FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 20) в CDR3.
56. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина кодирует нуклеиновая кислота, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации с комплементом нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи V2.1, V2.3, V2.4, V2.5, V2.6, V2.7 или V2.11, причем указанная нуклеиновая кислота содержит последовательность нуклеотидов SEQ ID NO: 154 (V2.1), SEQ ID NO: 156 (V2.2), SEQ ID NO: 158 (V2.3), SEQ ID NO: 160 (V2.4), SEQ ID NO: 162 (V2.5), SEQ ID NO: 164 (V2.6), SEQ ID NO: 166 (V2.7), SEQ ID NO: 168 (V2.8), SEQ ID NO: 170 (V2.10), или SEQ ID NO: 172(V2.11).
57. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина кодирует нуклеиновая кислота, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации с комплементом нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен легкой цепи V2.11, причем указанная нуклеиновая кислота включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 152.
58. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи V2.1, (SEQ ID NO: 155), V2.2 (SEQ ID NO: 157); V2.3 (SEQ ID NO: 159), V2.4 (SEQ ID NO: 161), V2.5 (SEQ ID NO: 163), V2.6 (SEQ ID NO: 165), V2.7 (SEQ ID NO: 167), V2.8 (SEQ ID NO: 169), V2.10 (SEQ ID NO: 171) или V2.11 (SEQ ID NO: 173).
59. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 153).
60. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что молекула антитела конкурирует с антителом MJ2-7, имеющим вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130 и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133 за связывание с IL-13 человека, причем IL-13 человека включает остатки аминокислот SEQ ID NO: 124.
61. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела связывается с одним или более остатками аминокислоты последовательности IL-13, выбранным из группы, состоящей из остатков 116, 117, 118, 122, 123, 124, 125, 126, 127, и 128 последовательности IL-13 отличного от человека примата (SEQ ID NO: 24) или IL-13 человека (SEQ ID NO: 178).
62. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи и/или вариабельный домен легкой цепи последовательности молекулы антитела содержит каркасные области FR1, FR2 и FR3 из сегментов VH, которые кодируют гены зародышевой линии DP-54 и DPK-9 соответственно, или последовательность которых, по меньшей мере, 95% идентична сегментам VH, кодированным генами зародышевой линии DP-54 и DPK-9.
63. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела препятствует взаимодействию связывания между IL-13 и IL-13Rα1, причем указанное взаимодействие связывания включает взаимодействие остатка Phel07 IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13Rα1 и взаимодействия Ван-дер-Ваальса остатка Arg11, Glul2, Leul3, Ilel4, Glul5, Lysl04, Lysl05, Leul06, Phel07 и Argl08 последовательности IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13Rα1.
64. Молекула антитела по п.11, отличающаяся тем, что указанная молекула антитела препятствует взаимодействию связывания между IL-13 и IL-13Rα1, причем указанное взаимодействие связывания включает взаимодействие остатков Leu319, Cys257, Arg256, и Cys320 IL-13Rcd (SEQ ID NO: 125) с IL-13 и взаимодействия Ван-дер-Ваальса остатков Ile254, Ser255, Arg256, Lys318, Cys320 и Тyr321 IL-13 Rα1 (SEQ ID NO: 125) с IL-13.
65. Молекула антитела, включающая вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина и вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, которые формируют антиген связывающий участок, которая связывает с IL-13 с Kd меньше, чем 10-7 М, причем указанная молекула антитела:
(i) препятствует взаимодействию связывания между IL-13 и IL-13 Rα1, включающим взаимодействие остатка Phel07 IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13 Rα1 и остатка Leu319, Cys257, Arg256 и Cys320 IL-13 Rαd (SEQ ID NO: 125) с IL-13; и (ii) нейтрализует одну или более активность, ассоциированную с IL-13.
66. Молекула антитела по п.65, отличающаяся тем, что взаимодействие связывания включает взаимодействия Ван-дер-Ваальса остатка Argl1, Glul2, Leul3, Ilel4, Glul5, Lysl04, Lysl05, Leul06, Phel07 и Argl08 последовательности IL-13 (SEQ ID NO: 124) с IL-13Rαl; и указанное взаимодействие связывания включает взаимодействия Ван-дер-Ваальса остатков Ile254, Ser255, Arg256, Lys318, Cys320 и Туг321 IL-13Rα1 (SEQ ID NO: 125) с IL-13.
67. Очищенная молекула антитела, включающая вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина и вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, которая связывает с IL-13 с Kd меньше, чем 10-7 М, причем вариабельный домен тяжелой цепи включает последовательность аминокислот:
GFSLTGYGVN (SEQ ID NO: 121) в CDR1,
IIWGDGSTDYNSAL (SEQ ID NO: 122) в CDR2 и
DKTF YYDGFYRGRM DY (SEQ ID NO: 123) в CDR3; и причем
последовательность вариабельного домена легкой цепи включает:
QASQGTSINLN (SEQ ID NO: 118) в CDR1,
GASNLED (SEQ ID NO: 119) в CDR2 и
LQHSYLPWT (SEQ ID NO: 120) в CDR3,
причем CDR 1-3 вариабельных доменов тяжелых и легких цепей определены согласно АbМ.
68. Молекула антитела по п.67, которое имеет одно или более из следующих свойств:
(a) молекула антитела конкурирует с моноклональным антителом, имеющим вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот ID SEQ NO: 139 за связывание с IL-13 человека, причем IL-13 человека включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 124;
(b) молекула антитела связывается с одним или более остатками аминокислоты последовательности IL-13, выбранным из группы, состоящей из остатков 116, 117, 118, 122, 123, 124, 125, 126, 127 и 128 из последовательности IL-13 отличного от человека примата (SEQ ID NO: 24) или IL-13 человека (SEQ ID NO: 178);
(c) молекула антитела имеет вариабельный домен тяжелой цепи, который имеет ту же каноническую структуру гипервариабельных петель 1, 2 или 3, что и моноклональное антитело, имеющее вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 139;
(d) молекула антитела имеет вариабельный домен легкой цепи, который имеет ту же каноническую структуру гипервариабельных петель 1, 2 или 3, что и моноклональное антитело, имеющее вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 139;
(e) молекула антитела, которая представляет собой изолированное, рекомбинантное антитело IgG, которое включает две цепи полипептида:
легкую цепь, которая включает вариабельный домен легкой цепи С65 (SEQ ID NO: 139), и тяжелую цепь, которая включает вариабельный домен тяжелой цепи С65 (SEQ ID NO: 136);
(f) молекула антитела включает вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, включающий последовательность аминокислот, кодируемую последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется при жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, а 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи С65 (SEQ ID NO: 135).
(g) молекула антитела имеет вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, включающий последовательность аминокислот, кодируемую последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи С65 (SEQ ID NO: 138);
(h) молекула антитела имеет вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, включающий последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи С65 (SEQ ID NO: 136);
(i) молекула антитела имеет вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, включающий последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности аминокислот каркасной области вариабельного домена легкой цепи С65 (SEQ ID NO: 139);
(j) молекула антитела имеет вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, который включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 136; и
(k) молекула антитела имеет вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 139.
69. Изолированная молекула рекомбинантного IgG антитела против IL-13, которая включает:
легкую цепь, которая включает вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот:
DVQMIQSPSSLSASLGDIVTMTCQASQGTSINLNWFQQKPGKAPKLLIFGASNLEDGVPSRFSGSRYGTNFTLTISSLEDEDMATYFCLQHSYLPWTFGGGTKLEIK (SEQ ID NO: 139); и
тяжелую цепь, которая включает вариабельный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот:
QVQLKESGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLTGYGVNWVRQPPGKGLEWLGIIWGDGSTDYNSALKSRLIINKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTARYFCARDKTFYYDGFYRGRMDYWGOGTSVTVSS (SEQ ID NO: 136),
причем тяжелая цепь дополнительно включает мутированный Fc домен человека, который содержит последовательность аминокислот:
STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEALGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMBEALHMWTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 128).
70. Изолированная молекула рекомбинантного антитела против IL-13, которая включает:
(i) две легких цепи, которые включают вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 139; и
(ii) две тяжелых цепи, которые включают вариабельный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 136.
71. Очищенная молекула антитела, включающая вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина и вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, которая связывает IL-13 с KD меньше, чем 10-7 М, причем указанная молекула антитела имеет одно или более из следующих свойств:
(i) конкурирует с моноклинальным антителом, имеющим вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130 или ID SEQ NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, который содержит последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133 или SEQ ID NO: 139 за связывание с IL-13 человеком, причем указанный IL-13 человека включает последовательность аминокислот SEQ ID NO: 124;
(ii) связывается с одним или более остатками аминокислот последовательности IL-13, выбранным из группы, состоящей из остатков 116, 117, 118, 122, 123, 124, 125, 126, 127 и 128 последовательности IL-13 отличного от человека примата (SEQ ID NO: 24) или IL-13 человека (SEQ ID NO: 178);
(iii) имеет вариабельный домен тяжелой цепи, которая имеет ту же каноническую структуру гипервариабельных петель 1, 2 или 3, что моноклональное антитело, которое содержит вариабельный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130 или SEQ ID NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, включающей последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133 или SEQ ID NO: 139; или
(iv) имеет вариабельный домен легкой цепи, которая имеет ту же каноническую структуру гипервариабельных петель 1, 2 или 3, что и моноклональное антитело, которое содержит вариабельный домен тяжелой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 130 или SEQ ID NO: 136, и вариабельный домен легкой цепи, включающий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 133 или SEQ ID NO: 139.
72. Молекула антитела согласно любому из пп.1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 11, 30, 32, 36-41, 43, 46, 47, 54-70 или 71, которая является рекомбинантным IgG, содержащим Fc фрагмент.
73. Молекула антитела по пп.11, 21, 30, 32, 36-41, 43, 46, 47, 54-70 или 71, отличающаяся тем, что Fc домен видоизменен, чтобы уменьшить одно или более из следующего: связывание рецептора Fc; гликозилирование антитела; число остатков цистеина; функции эффекторной клетки или функции комплемента.
74. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен содержит мутированный домен СН2.
75. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен представляет собой Fc домен человека с естественной или мутированной последовательностью аминокислот.
76. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен содержит мутацию, которая уменьшает функцию эффекторной клетки.
77. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен имеет, по меньшей мере, две мутации: в L234A и G237A.
78. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен содержит одну или более мутацию, выбранную из группы, состоящей из: L234A, L235A, G237A, N297A и их комбинации.
79. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен включает последовательность аминокислот:
STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEALGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMBEALHMWTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 128).
80. Молекула антитела по п.73, отличающаяся тем, что Fc домен включает последовательность аминокислот:
STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMBEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 141).
81. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, причем указанная последовательность нуклеотидов гибридизуется в жестких условиях гибридизации с комплементом нуклеиновой кислоты, которая кодирует вариабельный домен тяжелой цепи V2.1, V2.3, V2.4, V2.5, V2.6, V2.7 или V2.11, причем указанная нуклеиновая кислота включает последовательность нуклеотидов SEQ ID NO: 154 (V2.1), SEQ ID NO: 156 (V2.2), SEQ ID NO: 158 (V2.3), SEQ ID NO: 160 (V2.4), SEQ ID NO: 162 (V2.5), SEQ ID NO: 164 (V2.6), SEQ ID NO: 166 (V2.7), SEQ ID NO: 168 (V2.8), SEQ ID NO: 170 (V2.10), или SEQ ID NO: 172 (V2.11).
82. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, отличающаяся тем, что указанная последовательность нуклеотидов включает последовательность нуклеотидов SEQ ID NO: 154 (V2.1), SEQ ID NO: 156 (V2.2), SEQ ID NO: 158 (V2.3), SEQ ID NO: 160 (V2.4), SEQ ID NO: 162 (V2.5), SEQ ID NO: 164 (V2.6), SEQ ID NO: 166 (V2.7), SEQ ID NO: 168 (V2.8), SEQ ID NO: 170 (V2.10), или SEQ ID NO: 172 (V2.11).
83. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, отличающаяся тем, что указанная последовательность нуклеотидов гибридизуется в жестких условиях гибридизации с комплементом нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен легкой цепи V2.11, причем указанная нуклеиновая кислота включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 152.
84. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина V2.11, причем указанная последовательность нуклеотидов включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 152.
85. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, отличающаяся тем, что вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, кодированную последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 80).
86. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина V2.11 (SEQ ID NO: 80).
87. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, отличающаяся тем, что указанный вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина включает последовательность аминокислот, кодированную последовательностью нуклеотидов, которая гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом последовательности нуклеотидов, кодирующей вариабельный домен легкой цепи V2.11 (SEQ ID NO: 36).
88. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина V2.11 (SEQ ID NO: 36).
89. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую легкую цепь молекулы антитела по любому из пп.1-80.
90. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую тяжелую цепь молекулы антитела согласно любому из пп.1-80.
91. Нуклеиновая кислота, которая содержит последовательность нуклеотидов, которая кодирует вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, который содержит последовательность аминокислот:
(i) G-(YF)-(NT)-I-K-D-T-Y-(MI)-H (SEQ ID NO: 48) в CDR1,
(ii) (WR)-I-D-P-(GA)-N-D-N-I-K-Y-(SD)-(PQ)-K-F-Q-G (SEQ ID NO: 49) в CDR2, и
(iii) SEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 17) в CDR3; и
при этом указанная последовательность нуклеотидов
(a) кодирует последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи, который содержит последовательность EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIG RIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80); или
(b) гибридизуется при жестких условиях гибридизации с последовательностью, комплементарной последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи, который содержит последовательность аминокислот:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWIGRIDPANDNIKYDPKFQGRFTISADNAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSEENWYDFFDY (SEQ ID NO: 80).
92. Нуклеиновая кислота, которая содержит последовательность нуклеотидов, которая кодирует вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, который включает последовательность аминокислот:
(i) (RK)-S-S-Q-S-(LI)-(KV)-H-S-(ND)-G-N-(TN)-Y-L-(EDNQYAS) (SEQ ID NO: 25) в CDR1,
(ii) K-(LVI)-S-(NY)-(RW)-(FD)-S (SEQ ID NO: 27) в CDR2 и
(iii) Q-(GSA)-(ST)-(HEQ)-I-P (SEQ ID NO: 28) в CDR3; и
при этом указанная последовательность нуклеотидов
(a) кодирует последовательность аминокислот, которая, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности каркасной области вариабельного домена легкой цепи, которая включает последовательность аминокислот DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC FQGSHIPYT (SEQ ID NO: 36); или
(b) гибридизуется при жестких условиях гибридизации с последовательностью, комплементарной последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен легкой цепи, который включает последовательность аминокислот DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRSSQSIVHSNGNTYLEWYQQKPGKAPKLLIYKVSNRFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCFQGSHIPYT (SEQ ID NO: 36).
93. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи иммуноглобулина, причем указанная последовательность нуклеотидов:
(i) гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен тяжелой цепи С65, причем указанная нуклеиновая кислота включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена тяжелой цепи SEQ ID NO: 135; или
(ii) включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена тяжелой цепи SEQ ID NO: 135.
94. Нуклеиновая кислота, включающая последовательность нуклеотидов, кодирующую вариабельный домен легкой цепи иммуноглобулина, причем указанная последовательность нуклеотидов:
(i) гибридизуется в жестких условиях гибридизации в 6Х SSC при приблизительно 45°С с последующей одной или более промывками в 0.2Х SSC, 0,1% SDS при 65°С с комплементом нуклеиновой кислоты, кодирующей вариабельный домен легкой цепи С65, причем указанная нуклеиновая кислота включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 138; или
(ii) включает последовательность нуклеотидов вариабельного домена легкой цепи SEQ ID NO: 138.
95. Вектор экспрессии, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты согласно любому из пп.81-94.
96. Вектор экспрессии, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую вариабельный домен тяжелой цепи и вариабельный домен легкой цепи по п.95.
97. Клетка-хозяин для получения молекулы антитела, которая содержит одну или более нуклеиновую кислоту согласно любому из пп.81-94.
98. Клетка-хозяин для получения молекулы антитела, которая содержит одну или более последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих вариабельный домен легкой и/или тяжелой цепи молекулы антитела по любому из пп.1-80.
99. Клетка-хозяин по п.97 или 98, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой клетку млекопитающего.
100. Фармацевтический состав для связывания IL-13, который сдержит молекулу антитела по любому из пп.1-80, включающую последовательность вариабельного домена тяжелой цепи иммуноглобулина и последовательность вариабельного домена легкой цепи иммуноглобулина, которая связывает с IL-13 с Kd меньше, чем 10-7 М и фармацевтически приемлемый носитель, совместно с одним или более дополнительным терапевтическим агентом, выбранным из группы, состоящей из:
вдыхаемые стероиды; бета агонисты; антагонисты лейкотриенов или рецепторов лейкотриенов; ингибиторы IgE; ингибиторы фосфодиэстеразы; ксантины; антихолинергические препараты; агенты, стабилизирующие мастоциты; ингибиторы IL-4; ингибиторы IL-5; ингибиторы эотоксина/ССК3; антигистамины; антагонисты TNF; антагонисты фермента TNF; антагонисты TGFp; интерферона гамма; префендион; химиотерапевтические агенты; NSAIDs; иммуномодуляторы; ингибиторы р38; и ингибиторы NFKB.
101. Фармацевтический состав для связывания IL-13, который содержит эффективное количество молекулы антитела по любому из пп.1-80 и фармацевтически приемлемый носитель.
102. Фармацевтический состав по п.101, который пригоден для подкожного, ингаляторного или местного назначения.
103. Способ диагностирования нарушения, связанного с IL-13, который включает:
введение субъекту молекулы антитела по любому из пп.1-80; и
обнаружение формирования комплекса между указанной молекулой антитела и IL-13.
104. Способ получения молекулы рекомбинантного антитела, который включает:
обеспечение клетки хозяина по любому из пп.97 или 98; и
поддержание указанной клетки хозяина в условиях, при которых происходит экспрессия указанной молекулы антитела.
105. Способ по п.104, который дополнительно включает выделение молекулы антитела из клетки-хозяина или из среды, в которой поддерживали клетку-хозяина.
106. Способ по п.104, который дополнительно включает получение выделенной молекулы антитела в качестве фармацевтического состава.
107. Способ лечения расстройства, связанного с активностью IL-13, который включает:
введение субъекту, который имеет указанное расстройство или риск развития расстройства, эффективного количества молекулы антитела по любому из пп.1-80.
108. Способ по п.107, отличающийся тем, что расстройство, связанное с активностью IL-13, выбирают из группы, включающей: астматическое расстройство, атопическое расстройство, хроническое обструктивное заболевание легких (COPD), состояния, включающие воспаление дыхательных путей, эозинофилию, фиброз и гиперпроизводство слизи, воспалительное заболевание, аутоиммунное заболевание, опухоль и онкологическое заболевание, вирусную инфекцию и подавление экспрессии защитных иммунных ответов 1-го типа.
109. Способ по п.108, отличающийся тем, что расстройство представляет собой астматическое расстройство, язвенный колит, болезнь Крона, эозинофилию или аллергический ринит.
110. Способ по п.107, отличающийся тем, что расстройство представляет собой воспалительное заболевание кишечника.
111. Способ по п.107, отличающийся тем, что расстройство представляет собой хроническое обструктивное заболевание легких (COPD).
112. Способ по п.107, отличающийся тем, что расстройство представляет собой атопическое расстройство.
113. Способ по п.107, отличающийся тем, что белок назначают подкожно, в виде ингаляции или местно.
114. Способ определения присутствия IL-13 в образце, включающий:
(i) приведение в контакт указанного образца с молекулой антитела против IL-13 по любому из пп.1-80; и
(ii) определение IL-13 в образце при помощи указанной молекулы антитела против IL-13.
115. Способ по п.114, отличающийся тем, что образец представляет собой образец от субъекта.
116. Способ лечения субъекта, демонстрирующего симптом астмы, выбранный из группы, включающей: свистящее дыхание, затруднение дыхания, бронхостеноз, гиперреактивность дыхательных путей, снижение функции легких, фиброз, воспаление дыхательных путей и производство слизи, включающий назначение пациенту молекулы антитела по любому из пп.1-80, причем указанная молекула антитела связывает IL-13 и препятствует образованию функционального сигнального комплекса IL-13.
