Штамм бактерий serratia plymuthica, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа а (его варианты)
Владельцы патента RU 2551316:
Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор") (RU)
Изобретение относится к биотехнологии. Предложены штамм бактерий Serratia plymuthica В-1288, штамм бактерий Serratia plymuthica В-1297, штамм бактерий Serratia plymuthica В-1296 и штамм бактерий Serratia plymuthica В-1285. Указанные штаммы депонированы в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»». Штаммы обладают противовирусной активностью в отношении вируса гриппа типа А. При использовании препаратов на основе предложенных штаммов индекс нейтрализации вируса гриппа типа А составляет 2,5-6,5 lg при исходной концентрации вируса 102.5-6.5 lg ТЦД50/мл. 4 н.п. ф-лы, 5 табл., 13 пр.
Изобретение относится к новым штаммам бактерий рода Serratia, выделенных из различных источников и отобранных по признаку наибольшей нуклеазной активности для производства препаратов, обладающих противовирусной активностью, и может быть использовано в медицине, микробиологии и биотехнологии.
Известны данные об антивирусной активности панкреатической рибонуклеазы в отношении ряда РНК- и ДНК-содержащих вирусов, а также об их применении в клинике для лечения вирусных заболеваний. Рядом исследователей изучаются антивирусные свойства нуклеаз, выделенных из микроорганизмов, которые обладают более выраженными антивирусными свойствами, чем панкреатическая рибонуклеаза [Шапот В.С. Нуклеазы, М., 1968; Нуклеазы микроорганизмов, под ред. A.M. Безбородова, М., 1974 Nucleuses, ed. by S.M. Linn, R.J. Roberts, Cold Spring Harbour, 1982].
Известны сообщения об антивирусной, в частности, антигриппозной активности веществ, имеющих природное происхождение. Так, авторы И.Д. Макаренкова и др. (2010) сообщают о способности сульфатированного полисахарида - фукоидана из морской бурой водоросли Laminaria japonica подавлять продукцию высокопатогенного вируса гриппа птиц A/H5N1 в течение 24 ч инфекции при профилактической и лечебно-профилактической схемах применения [Противовирусная активность сульфатированного полисахарида из бурой водоросли LAMINARIA JAPONICA в отношении инфекции культур клеток, вызванной вирусом гриппа А птиц (H5N1) Макаренкова И.Д., Дерябин П.Г., Львов Д.К., Звягинцева Т.Н., Беседнова Н.Н. Вопросы вирусологии. 2010. Т.55. №1. С.41-45].
Показана противовирусная активность препаратов грибного происхождения [Разумов И.А., Косогова Т.А., Казачинская Е.В., Пучкова Л.И., Щербакова Н.С., Горбунова И.А., Михайловская И.Н., Локтев В.Б., Теплякова Т.В. Противовирусная активность водных экстрактов и полисахаридных фракций, полученных из мицелия и плодовых тел высших грибов. // Антибиотики и Химиотерапия, т.55, №9-10, 2010].
Рибонуклеазы обладают выраженной противовирусной активностью в отношении таких РНК-содержащих вирусов, как вирусы гриппа, полиомиелита, клещевого энцефалита, бешенства [Грибенча С.В. Противовирусная активность РНКазы Bacillus intermedius у морских свинок и кроликов, зараженных вирусом бешенства // Вопросы вирусологии, 2006, №5, с.41-43]. Дезоксирибонуклеазы тормозят синтез и размножение ДНК-содержащих вирусов, осповакцины, аденовируса, герпеса.
Одним из наиболее изученных энзимов этого класса является секретируемая эндонуклеаза Serratia marcescens. Грамотрицательные бактерии рода Serratia, в культуральной жидкости отдельных штаммов которых обнаружены высокие РНК-азная и ДНК-азная активности широко известны как продуценты различного рода препаратов [Габдуллина Г.К. Действие нуклеазы Serratia marcescens на клетки и рост асцитной опухоли Эрлиха: Афтореф. дис… канд. биол. наук. - Казань, 1980. - 20 с.; Патент РФ №2148645, МПК C12N 9/20, опубл. 10.05.2000 г. «Штамм бактерий Serratia marcescens-продуцент липазы»]. Фермент тормозит размножение вирусов везикулярного стоматита и осповакцины в культуре клеток куриных фибробластов.
Известен штамм Serratia marcescens В-10 М-1 продуцент дезоксирибонуклеазы наиболее часто используемой в лабораторных условиях. [Нуклеазы микроорганизмов и их практическое использование. Рига, 1989, с.3. 2. Биосинтез микроорганизмами нуклеаз и протеаз М.: Наука, 1979, с.7].
Первый созданный на основе эндонуклеазы Serratia marcescens противовирусный препарат получил название эндонуклеаза бактериальная. В настоящее время нуклеазы из бактерий Sarratia marcescens используют для лечения вирусных заболеваний пчел [Патент РФ №2038776, МПК A01K 51/00, опубл. 09.07.1995 г. «Средство “Эндоглюкин” для профилактики и лечения вирусных заболеваний пчел и стимуляции развития пчелиных семей»].
Наиболее близким аналогом (прототипом) является штамм Serratia marcescens, опубликованный в патенте на средство на основе культуральной жидкости, полученной с использованием указанного штамма [патент РФ №2420309, МПК A61K 39/00, опубл. 10.06.2011 г.].
Однако не известны опубликованные данные о том, что выше приведенные аналоги, в том числе и прототип, обладают ингибирующим действием против высокопатогенного вируса гриппа птиц A/H5N1 и человека A/H3N2.
Техническим результатом заявляемого решения является выявление бактериальных штаммов, обладающих противовирусными свойствами, в отношении вируса гриппа птиц A/H5N1 и гриппа человека (H3N2).
Указанный технический результат достигается тем, что получен штамм бактерий Serratia plumuthica Dg-91, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером B-1288.
Указанный технический результат достигается также получением штамма бактерий Serratia plumuthica Dg-98, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером B-1297.
Указанный технический результат достигается также получением штамма бактерий Serratia plumuthica Bp-868, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером B-1296.
Указанный технический результат достигается также получением штамма бактерий Serratia plumuthica Az-372, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером B-1285.
Заявляемые штаммы изолированы при высеве исследуемых образцов на среду РПА (pH 7,0-7,2, температура инкубирования 30-37°C). Характеристика заявляемых штаммов, связанная с источниками их выделения, представлена в таблице 1.
| Таблица 1 | |||
| Характеристика бактериальных изолятов (штаммов) по месту выделения | |||
| № п/п | Штамм | Колл. номер | Источник выделения |
| 1 | Serratia plumuthica Bp-868 (Bp-868) | В-1296 | Донные осадки Байкала |
| 2 | Serratia plumuthica Dg-91 (Dg-91) | В-1288 | Грунт Долины гейзеров (Камчатка) |
| 3 | Serratia plumuthica Dg-98 (Dg-98) | В-1297 | -«- |
| 4 | Serratia plumuthica Az-372 (Az-372) | В-1285 | Выделен из аэрозоля атмосферного воздуха |
Определение таксономической принадлежности бактериальных изолятов.
Для определения таксономической принадлежности бактерий Вр-868, Dg-91, Dg-98 и Az-372, выделенных из природных источников, стандартными методами исследовали их фенотипические признаки и определяли нуклеотидные последовательности продуктов ПНР, соответствующие гену 16S рРНК штаммов. Определение исследуемых бактерий до вида проводили по Бердже [“Bergey′s Manual of Systematic Bacteriology”. 8 th ed. / Ed. John G. Holt. - Baltimore-London, Williams and Wilkins, 1986. - V.1-2. - 1105 p.].
Для получения геномных характеристик выделяли суммарные ДНК из чистых культур и проводили ПНР с универсальными праймерами, соответствующими гену 16S рРНК эубактерий: 5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′ и 5′-CGGCTACCTTGTTACGACTT-3′. Нуклеотидные последовательности продуктов ПЦР определяли с использованием BigDye 3,1 Terminator Cycle Sequencing Kit и автоматического анализатора ДНК модели ABI 3130xl (Applied Biosystems, США), в Межинститутском Центре секвенирования ДНК СО РАН (г. Новосибирск). Филогенетический анализ выполняли с использованием программы MEGA версии 4 для нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК, определенных в данной работе, и близкородственных видов из базы данных GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov).
При культивировании применяли питательную среду “S” (Пептон, NaCI, MgCl2×6H2O, Трис-аминометан, pH 8.0) или “LB” (“Difco”, США) состава: дрожжевой экстракт, пептон, NaCI, pH 7,2.
Хранение штаммов: Штаммы хранили в лиофильно-высушенном состоянии, в 30%-ном растворе глицерина при температуре минус 65°C и при периодических пересевах на агаризованную среду LB.
Морфологические и биохимические признаки штаммов
Грамотрицательные, неспороносные, подвижные или неподвижные клетки штаммов Вр-868, Dg-91, Dg-98 и Az-372 представлены палочками, в основном укороченными, размером 0,5-0,8×1,0-2,5 мкм (табл.2).
| Таблица 2 | |||
| Морфология клеток и колоний исследуемых штаммов, Вр-868, Dg-91, Dg-98 и Az-372. | |||
| Штамм | Среда выделения | Морфология | |
| Клеток | Колоний | ||
| Вр-868 | РПА | Грамотрицательные разрозненные палочки, много укороченных до коккобацилл, 0,6-0,8×1,0-2,5 мкм. Подвижные, капсулированные | Белесые, круглые, край ровный, непрозрачные, блестящие, компактные. |
| Dg-91 | РПА | Грамотрицательные капсулированные, укороченные, разрозненные. 0,5-0,8×1,0-1,8 мкм. | Белесые, непрозрачные, компактные, круглые, край ровный. |
| Dg-98 | РПА | Грамотрицательные капсулированные, укороченные, разрозненные. 0,8×1,0-2,0 мкм. | Белесые, непрозрачные, компактные, круглые, край ровный. |
| Az-372 | РПА | Грамотрицательные капсулированные, укороченные, разрозненные. 0,8×1,0-2,0 мкм. | Белесые, непрозрачные, компактные, круглые, край ровный. |
Штаммы являются факультативными анаэробами, хорошо растут при температуре 30-37°C. Согласно результатам определения нуклеотидной последовательности 16S рРНК бактерии данной группы отнесены к роду Serratia.
Показано, что штаммы Вр-868, Dg-91, Dg-98 Az-372 в соответствии с признаками представителей рода Serratia, отрицательны в тестах по уреазе, на индол, сероводород, амилазу; образуют ДНКазу, гидролизуют желатин, утилизируют цитрат, восстанавливают нитрат, с образованием кислоты гидролизуют сахарозу, лактозу, манит, мальтозу, глюкозу. Все культуры, за исключением штамма Az-372, были отрицательны в тесте с метиловым красным. В реакции Фогес-Проскауэра штаммы имеют отличия допустимые в рамках признаков бактерий рода Serratia (табл.3).
Совокупные данные по фенотипическим и геномным признакам позволяют идентифицировать штаммы Dg-91, Dg-98, Bp-868, Az-372, как принадлежащие к виду Serratia plumuthica.
| Таблица 3 | |||||||||||||||||||
| Биохимические признаки штаммов | |||||||||||||||||||
| Штамм | Идентификация по н.п. p16S РНК (род/вид) | Признак | |||||||||||||||||
| Уреаза | Вост. нитратов | Индол | Коагулаза | Амилаза | Подвижность | FP | MR | Гидролиз углеводов | |||||||||||
| сахароза | мальтоза | лактоза | манит | глюкоза | |||||||||||||||
| К | Г | К | Г | К | Г | К | Г | К | Г | ||||||||||
| Вр-868 | Serratia plumuthica | - | + | - | - | - | + | + | - | + | + | + | + | + | + | ± | ± | + | + |
| Dg-91 | Serratia plumuthica | - | + | - | - | - | + | - | - | + | + | + | + | + | + | + | + | ± | ± |
| Dg-98 | Serratia plumuthica | - | + | - | - | - | + | - | - | + | + | + | + | + | + | + | + | ± | ± |
| Az-372 | Serratia plumuthica | - | + | - | - | - | + | - | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ± | ± |
| Обозначения: + положительная реакция; - отрицательная реакция; ± слабо выраженное проявление признака. |
Посевной материал получали при выращивании штаммов на среде LB, на агаризованной среде LB (0,25% LB, 1,7% агара) и среде А (0,7% пептона, 0,4% рыбного гидролизата, 0,5% NaCl, 1,7% агара). Значение pH всех сред составляло 7,0-7,2.
Для получения образцов культуральной жидкости (КЖ) штаммы культивировали в среде “S” или “LB” в течение 18 ч при температуре 37°C с последующим центрифугированием в течение 20 мин при 8000 об/мин на центрифуге JA-21 (Beckman, США). Полученные образцы КЖ и биомассы хранили до использования в замороженном состоянии при температуре минус 20°C.
Для получения клеточных экстрактов (КЭ) бактериальные клетки разрушали ультразвуком в стерильной дистиллированной воде на дезинтеграторе MSE (Великобритания). Степень разрушения контролировали на спектрофотометре при длине волны 560 нм.
Ниже приведены данные по исследованию нуклеазной активности штаммов.
Количественное определение РНКазной и ДНКазной активности проводили по превращению субстратных нуклеиновых кислот: суммарной дрожжевой РНК (НИКТИ БАВ ГНЦ ВБ «Вектор») и ДНК из молок лосося (Медиген, Новосибирск) во фрагменты, которые растворимы в 4%-ной HClO4, с появлением кислоторастворимого материала с адсорбцией при 260 нм.
В процессе работы нами показано, что все эти штаммы бактерий обладают не только РНКазной, но и ДНКазной активностью и гидролизуют не только ДНК из молок лосося, но и ДНК фага λ и ДНК фага Т7.
Подготовка к тестированию штаммов вируса гриппа и культуры клеток.
Для оценки противовирусной эффективности полученных препаратов использовали высокопатогенный вирус гриппа птиц A/chicken/Kurgan/05/2005 (A/H5N1) из коллекции ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор, наработанный на 10-суточных развивающихся куриных эмбрионах (РКЭ). Концентрация вируса составила: 103,5-6,5 lg ТЦД50/мл. Вирус гриппа человека A/Aichi/2/68(A/H3N2) (из коллекции ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор»), титр 102,5-6,5 lg ТЦД50/мл вирусаллантоисной жидкости (ВАЖ)). Для тестирования токсичности и противовирусной активности препаратов использовали перевиваемую культуру клеток MDCK.
Определение токсичности препаратов. Для определения токсических доз препараты разводили в 2, 5, 10, раз средой Axcevir-MDCK, вносили по 150 мкл в соответствующие лунки планшета с клетками MDCK и ставили в термостат при температуре 37°C, 5% CO2 и 100% влажности на 2 суток.
Через 2 суток с помощью инвертированного микроскопа оценивали наличие токсического действия в монослоях клеток MDCK, инкубированных с разными концентрациями препаратов.
Для определения противовирусной активности препаратов использовали максимально переносимые концентрации (МПК).
Определение противовирусной активности препаратов. Для определения противовирусной активности препаратов готовили десятикратные разведения ВАЖ от 1 до 8 с использованием среды Axcevir-MDCK, содержащей 2 мкг/мл трипсина. В монослой культуры клеток MDCK вносили по 50 мкл выбранного разведения препарата и 100 мкл от 1 до 8 разведения ВАЖ. Клетки инкубировали 2 суток при температуре 37°C в атмосфере 5% CO2 в термостате ТС-1/80 СПУ (Россия). Через 2 суток в каждой лунке с помощью инвертированного микроскопа регистрировали ЦПД в монослое клеток и определяли наличие вируса в среде культивирования по реакции гемагглютинации (РГА) с 1% эритроцитами петуха. Ниже приведены примеры конкретного применения заявляемых штаммов.
Определение наличия нуклеолитической и противовирусной активности штаммов Serratia plumuthica Bp-868, Serratia plumuthica Dg-91, Serratia plumuthica Dg-98, Serratia plumuthica Az-372 относительно вирусов гриппа человека A/Aichi/2/68, а штаммов Serratia plumuthica Dg-91, Serratia plumuthica Az-372 (H3N2) относительно птичьего гриппа A/chicken/Kurgan/05/2005 (A/H5N1), проводится впервые, в связи с чем можно сделать вывод о соответствии предлагаемых штаммов критериям изобретения «новизны» и «изобретательский уровень».
| Таблица 4 | |||||
| Определение противовирусной активности бактериальных штаммов | |||||
| № Образца | Штамм | С белка мг/мл | Активность (РНК-азная) ед/мл | Контроль вируса | Индекс нейтрализации вируса |
| Вирус: A/Aichi/2/68 (H3N2) | |||||
| 11-13 | Вр-868 КЭ | 3,6 | 332,2 | 2,5±0,08 lg | 2,5 lg |
| 12-01 | Dg-91 КЖ | 12,2 | 220,5 | 6,5±0,1 lg | 6,5 lg |
| 12-16 | Dg-91 КЭ | 7,4 | 574,75 | 6,5±0,1 lg | 6,5 lg |
| 12-25 | Az-372 КЖ | 10,25 | 108,9 | 6,5±0,1 lg | 3,0 lg |
| 12-20 | Dg 98 КЭ | 4,6 | 465,3 | 3,5±0,08 lg | 3,5 lg |
| Вирус: A/chikenKurgan/05/2005 (H5N1) | |||||
| 11-41 | Az 372 КЖ | 8,8 | 185,3 | 3,5±0,05 lg | 3,5 lg |
| 12-01 | Dg 91 КЖ | 12,2 | 220,5 | 6,5±0,08 lg | 6,5 lg |
| 12-54 | Dg 91 KK | 9,1 | 129,8 | 6,5±0,08 lg | 6,5 lg |
| 12-55 | Dg 91 КЭ | 13,5 | 926,2 | 6,5±0,08 lg | 6,5 lg |
| 12-16 | Dg 91 КЭ | 7,4 | 574,75 | 6,5±0,08 lg | 6,5 lg |
Изобретение подтверждено следующими примерами практического применения.
Получение образцов (препаратов).
Пример 1. Получение препарата (образец 11-13), на основе экстракта клеток (КЭ) штамма Serratia plumuthica. Bp-868.
Биомассу клеток штамма (0,4 г), полученную после культивирования в «LB» и последующего центрифугирования и освобождения от надосадочной жидкости, ресуспендировали в 4 мл дистиллированной воды и обрабатывали 4 раза по 30′′ с интервалом 30′′, на ультразвуковом (УЗ)-дезинтеграторе (с амплитудой 18), добиваясь максимально возможного разрушения клеток. После УЗ-обработки разрушенные клетки осаждали центрифугированием 10 мин при 12000 об/мин на микроцентрифуге “Eppendorf”, КЭ отбирали и стерилизовали ультрафильтрацией через Whatman фильтр с размерами пор 0,2 мкм. Полученный препарат хранили до использования при температуре минус 20°C. Концентрация белка в образце составила 3,6 мг/мл, активность РНКазы 332,2 ед/мл или 3322 ед/г влажной биомассы.
Пример 2. Испытание противовирусного действия препарата №11-13, приготовленного на основе КЭ штамма Serratia plumuthica Bp-868 (в профилактической схеме) на вирусе гриппа человека (A/H3N2).
Для испытания препарат №11-13 развели в 5 раз и внесли на клетки MDCK в объеме 50 мкл на лунку 96-луночного планшета. Инкубация 2 часа. Удалили препарат, затем в лунки внесли среду RPMI-1640 без сыворотки и без трипсина. Добавили вирус A/Aichi/2/68 (H3N2) с -1 по -7 по 50 мкл на лунку. Инкубация 2 сут. Учет с 1% эритроцитами петуха.
Планшеты с обработанными клетками и вирусом помещали в термостат при температуре 37°C, 5% CO2 и 100% влажности на 2-3 суток до образования монослоя. Индекс нейтрализации составил 2,5 lg при исходной концентрации вируса 102,5 lg ТЦД50/мл (табл.4).
Пример 3. Получение препарата (образца) 12-16, на основе экстракта клеток (КЭ) штамма Serratia plumuthica Dg-91.
Биомассу клеток штамма Serratia plumuthica Dg-91. (0,4 г), полученную после культивирования в «LB» и последующего центрифугирования и освобождения от надосадочной жидкости, ресуспендировали в 4 мл стерильной дистиллированной воды и обрабатывали 4 раза по 30′′ с интервалом 30′′, на ультразвуковом (УЗ)-дезинтеграторе. После УЗ-обработки разрушенные клетки осаждали центрифугированием 10 мин при 12000 об/мин на микроцентрифуге “Eppendorf”, КЭ отбирали и стерилизовали ультрафильтрацией через Whatman фильтр с размерами пор 0,2 мкм. Полученный препарат хранили до использования при температуре минус 20°C. Концентрация белка в образце составила 7,4 мг/мл, активность РНКазы 574,75 ед/мл., а ДНКазы - 463,1 ед/мл.
Пример 4. Испытание противовирусного действия КЭ штамма Serratia plumuthica Dg-91 на вирусе гриппа человека A/Aichi/2/68(A/H3N2). Анализ противовирусной активности штамма как в примере 2.
Клеточный экстракт (КЭ) штамма Serratia plumuthica Dg-91 (препарат №12-16) проверили в профилактической схеме на противовирусную активность. Индекс нейтрализации составил 6,5 lg при исходной концентрации вируса 106,5 lg ТЦД50/мл (табл.4).
Пример 5. Получение препарата (образца) 12-01 на основе культуральной жидкости (КЖ) штамма Serratia plumuthica Dg-91.
Суспензию клеток готовили с использованием культуры штамма Serratia plumuthica Dg-91, наработанного на агаризованной среде «LB» в течение 18 часов при температуре 28-30°C. Суспензию вносили в количестве 2% в колбы с 50 мл среды LB и культивировали в течение 24 часов на термостатированной качалке (КТ 104, Россия). Для приготовления препарата на основе культуральной жидкости полученную КЖ штамма Serratia plumuthica Dg-91 центрифугировали при 10000 об/мин в течение 30 мин на центрифуге JA-21. Осветленную надосадочную жидкость стерилизовали ультрафильтрацией через Whatman фильтр с размерами пор 0,2 мкм и использовали для испытания в качестве противовирусного препарата в профилактической схеме. РНКазная активность в КЖ составила 220,5 ед/мл. Хранили препарат до использования при температуре минус 20°C.
Пример 6. Испытание противовирусного действия КЖ штамма Serratia plumuthica Dg-91 на вирусе гриппа человека A/Aichi/2/68(A/H3N2). Анализ противовирусной активности штамма как в примере 2.
Культуральную жидкость штамма Serratia plumuthica Dg-91 (препарат №12-01) проверили в профилактической схеме на противовирусную активность. Индекс нейтрализации составил 6,5 lg при исходной концентрации вируса 106,5 lg ТЦД50/мл (табл.4).
Пример 7. Испытание противовирусного действия КЖ штамма Serratia plumuthica Dg-91 на вирусе гриппа птиц A/chicken/Kurgan/05/2005 (A/H5N1). Для испытания препарат №12-01 развели в 5 раз и внесли на клетки MDCK в объеме 50 мкл на лунку 96-луночного планшета. Инкубация 2 часа. Удалили препарат, затем в лунки внесли среду RPMI-1640 без сыворотки и без трипсина. Добавили вирус A/Aichi/2/68 (H3N2) с -1 по -7 по 50 мкл на лунку. Инкубация 2 сут. Учет с 1% эритроцитами петуха.
Планшеты с обработанными клетками и вирусом помещали в термостат при температуре 37°C, 5% CO2 и 100% влажности на 2-3 суток до образования монослоя. Индекс нейтрализации составил 6,5 lg (табл.4) при исходной концентрации вируса 106,5 lg ТЦД50/мл.
Пример 8. Получение препарата (образца) 12-25 на основе культуральной жидкости (КЖ) штамма. Serratia plumuthica. Az-372.
Образец 12-25 получен как в примере 5.
Испытание противовирусного действия препарата 12-25 на вирусе гриппа человека (A/H3N2) (профилактическая схема) как в примере 8. Индекс нейтрализации составил 3,0 lg при исходной концентрации вируса гриппа человека (A/H3N2) 106,5 lg ТЦД50/мл Концентрация белка составила 10,2 мг/мл., РНКазная активность - 108,9 ед/мл кж. (табл.4).
Пример 9. Испытание КЖ Serratia plumuthica. Az-372 на вирусе гриппа птиц (A/H5N1). Препарат (образец) штамма под №11-41 получен как в примере 5 на среде «S». Концентрация белка составила 8,8 мг/мл, а РНКазная активность - 185,3 ед/мл. Индекс нейтрализации вируса гриппа (A/H5N1) составил 3,5 lg при исходной концентрации вируса 103,5 lg ТЦД50/мл (табл.4)
Пример 10. Получение препарата (образца) 12-54 на основе культуральной жидкости (КЖ) штамма Serratia plumuthica Dg-91.
Образец получали, как в примере 5, за исключением того, что клетки культивировали на среде «S».
Для приготовления препарата полученную КЖ штамма Serratia plumuthica Dg-91 центрифугировали при 10000 об/мин в течение 30 мин на центрифуге JA-21. Осветленную надосадочную жидкость стерилизовали ультрафильтрацией через Whatman фильтр с размерами пор 0,2 мкм и использовали для испытания в качестве противовирусного препарата. Хранили препарат до использования при температуре минус 20°C. РНКазная активность в КЖ составила 129,8 ед/мл.
Испытание противовирусного действия образца 12-54 проводили на вирусе гриппа птиц A/chicken/Kurgan/05/2005 (A/H5N1) как в примере 7. Индекс нейтрализации составил 6,5 lg при исходной концентрации вируса 106,5 lg ТЦД50/мл (табл.4).
Пример 11. Образец (12-20) получали как описано в примере 1. За исключением того, что использовали штамм Serratia plumuthica Dg-98. Осадок клеток штамма, полученный после центрифугирования и освобождения от надосадочной жидкости, как в примере 1, ресуспендировали в 4 мл дистиллированной воды и обрабатывали 4 раза по 30′′ с интервалом 30′′, на ультразвуковом (УЗ)-дезинтеграторе. Процент разрушения 90%. После УЗ-обработки разрушенные клетки осаждали центрифугированием при 10000 об/мин на микроцентрифуге “Eppendorf”, КЭ отбирали и стерилизовали ультрафильтрацией через Whatman фильтр с размерами пор 0,2 мкм. Полученный препарат хранили до использования при температуре минус 20°C.
Полученный КЭ после размораживания разводили в 2 раза дистиллированной водой и использовали для испытания на противовирусное действие на вирусе гриппа человека A/Aichi/2/68(A/H3N2): Индекс нейтрализации составил 3,5 lg при исходной концентрации вируса 103,5 lg ТЦД50/мл (табл.4).
Пример 12. Для испытания использовали чистые стерильные среды «LB» и «S» в качестве противовирусного агента. Испытание проводили для исключения влияния компонентов среды на вирусы гриппа. Обработку клеток проводили как в примере 2. Данные среды не оказывали противовирусного эффекта и не влияли на культуру клеток MDCK. Титр вирусов не изменился по сравнению с контролем и составил: A/chikenKurgan/05/2005 (H5N1) 103,5-6,5 lg ТЦД50/мл, а вируса гриппа человека A/Aichi/2/68(A/H3N2): 102,5-6,5 lg ТЦД50/мл в зависимости от эксперимента.
Пример 13. КЖ штамма Serratia plumuthica Dg-91 (образец 12-01) и КЭ (образец 12-16), а также КЭ штамма Serratia plumuthica Dg-91 хранились в течение 4-5 месяцев (время наблюдения) при температуре -20°C. Определение противовирусной активности проводили, как в примерах 7-8. Титр вируса (A/H3N2) в lg ТЦД50/мл через 48 ч обработки препаратом (профилактичекая схема) равен 0 при концентрации вируса в контроле 103,5 lg ТЦД50/мл (Табл.5).
| Таблица 5 | |||
| Определение противовирусной активности образцов бактериальных штаммов после хранения при -20°C. | |||
| Образец | Штамм | Условия хранения | Титр вируса в lg ТЦД50/мл через 48 ч (профилактическая схема) |
| A/Aichi/2/68 (H3N2) | |||
| 12-01 | Dg 91 | 5 мес при -20°C | 0 |
| 12-16 | Dg 91 | 4 мес при -20°C | 0 |
| 12-20 | Dg 98 | 4 мес при -20°C | 0 |
| Контроль вируса | 3,5±0,08 |
Таким образом, из приведенных таблиц 4 и 5 видно, что заявляемые штаммы обеспечивают достижение технического результата, а именно обладают противовирусными свойствами, в отношении вируса гриппа птиц A/H5N1 и гриппа человека (H3N2).
1. Штамм бактерий Serratia plymuthica, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером В-1288.
2. Штамм бактерий Serratia plymuthica, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером В-1297.
3. Штамм бактерий Serratia plymuthica, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером В-1296.
4. Штамм бактерий Serratia plymuthica, обладающий противовирусной активностью в отношении вирусов гриппа типа A и депонированный в коллекции бактерий, бактериофагов и грибов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»» под регистрационным номером В-1285.
