Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы

Авторы патента:


Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы
Способ получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы

 


Владельцы патента RU 2553538:

СЕНТОКОР ОРТО БАЙОТЕК ИНК. (US)

Настоящее изобретение касается способа получения популяции клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы. Представленный способ предусматривает следующие стадии (а) получение популяции клеток, экспрессирующих маркеры HNF-3β, GATA-4, Mixl1, CXCR4, и SOX-17, характерные для линии сформированной эндодермы, и (b) культивирование популяции клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, в среде с добавлением активина А и лиганда Wnt и IGF-1 или инсулина, трансферрина и селена, где культивируемые клетки экспрессируют маркеры линии сформированной эндодермы и маркеры плюрипотентности. Охарактеризованное изобретение позволяет получать клетки, способные культивироваться в условиях гипоксии, не требующие линий питающих клеток, покрытий из сложных белков матрикса и сохраняющие потенциал дифференцировки. 15 з.п. ф-лы, 39 ил., 9 табл., 32 пр.

 

ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Настоящее изобретение относится к плюрипотентным стволовым клеткам, которые легко выращиваются в культуре в полистироловой посуде для культивирования тканей и не требуют линии питающих клеток. В настоящем изобретении также предлагаются способы производства линии плюрипотентных стволовых клеток из эмбриональных стволовых клеток человека.

ПРЕДПОСЫЛКИ СОЗДАНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Достижения в области клеточной заместительной терапии сахарного диабета 1-го типа и нехватка трансплантируемых островков Лангерганса заставили обратить внимание на разработку источников инсулинпродуцирующих клеток, или β-клеток, подходящих для трансплантации. Одним из подходов является формирование функциональных β-клеток из плюрипотентных стволовых клеток, таких как, например, эмбриональные стволовые клетки.

При эмбриональном развитии позвоночных, плюрипотентные стволовые клетки дают начало группе клеток, формирующих три зародышевых листка (эктодерму, мезодерму и эндодерму) в ходе процесса, именуемого гаструляцией. Ткани, из которых состоят, например, щитовидная железа, тимус, поджелудочная железа, кишечник и печень, будут развиваться из эндодермы через промежуточную стадию. Промежуточной стадией данного процесса является образование сформированной эндодермы. Клетки сформированной эндодермы экспрессируют ряд маркеров, таких как HNF-3 beta, GATA-4, Mixl1, CXCR4 и SOX-17.

Формирование поджелудочной железы происходит при дифференцировке сформированной эндодермы в панкреатическую эндодерму. Клетки панкреатической эндодермы экспрессируют ген панкреатическо-дуоденального гомеобокса, PDX-1. При отсутствии PDX-1 развитие поджелудочной железы не идет дальше формирования вентрального и дорзального зачатков. Следовательно, экспрессия PDX-1 является важным этапом органогенеза поджелудочной железы. Зрелая поджелудочная железа содержит, среди других типов клеток, экзокринную ткань и эндокринную ткань. Экзокринная и эндокринная ткани образуются при дифференцировке панкреатической эндодермы.

Клетки, обладающие свойствами островковых клеток, как сообщалось, были получены из эмбриональных клеток мыши. Например, в публикации Lumelsky et al. (Science 292:1389, 2001) сообщается о дифференцировке мышиных эмбриональных стволовых клеток в инсулин-секретирующие структуры, сходные с островками поджелудочной железы. Soria et al. (Diabetes 49:157, 2000) сообщают, что инсулин-секретирующие клетки, полученные из мышиных эмбриональных стволовых клеток, нормализовали гликемию у мышей с диабетом, вызванным стрептозотоцином.

В одном примере, в публикации Hori et al. (PNAS 99: 16105, 2002) описывается, что обработка мышиных эмбриональных стволовых клеток ингибиторами фосфоинозитид 3-киназы (LY294002) приводила к образованию клеток, сходных с β-клетками.

В другом примере, Blyszczuk et al. (PNAS 100:998, 2003) сообщается о получении инсулин-продуцирующих клеток из мышиных эмбриональных стволовых клеток с конститутивной экспрессией Pax4.

Micallef et al. сообщают, что ретиноевая кислота может регулировать способность эмбриональных стволовых клеток формировать PDX-1-положительную панкреатическую эндодерму. Ретиноевая кислота с наибольшей эффективностью индуцирует экспрессию PDX-1 при добавлении в культуру на 4 день дифференцировки эмбриональных стволовых клеток в течение периода, соответствующего концу гаструляции эмбриона (Diabetes 54:301, 2005).

В публикации Miyazaki et al. сообщается о линии мышиных эмбриональных стволовых клеток со сверхэкспрессией PDX-1. Эти результаты показывают, что экспрессия экзогенного PDX-1, очевидно, повышает экспрессию генов инсулина, соматостатина, глюкокиназы, нейрогенина 3, P48, Pax6 и HNF6 в образующихся дифференцированных клетках (Diabetes 53: 1030, 2004).

В публикации Skoudy et al. сообщается, что активин-A (входящий в суперсемейство TGFβ) повышает экспрессию экзокринных панкреатических генов (p48 и амилаза) и эндокринных генов (PDX-1, инсулин и глюкагон) в эмбриональных стволовых клетках мыши. Максимальный эффект наблюдался при использовании активина-A в концентрации 1 нМ. Также эти авторы наблюдали, что на уровень экспрессии мРНК инсулина и PDX-1 не влияла ретиноевая кислота; однако обработка раствором FGF-7 с концентрацией 3 нМ приводила к повышению уровня транскрипта PDX-1 (Biochem. J. 379: 749, 2004).

В работе Shiraki et al. изучались эффекты ростовых факторов, специфически ускоряющих дифференцировку эмбриональных стволовых клеток в PDX-1-положительные клетки. Эти авторы наблюдали, что TGFβ2 приводил к воспроизводимому увеличению доли PDX-1-положительных клеток (Genes Cells. 2005 Jun; 10(6): 503-16.).

В публикации Gordon et al. продемонстрирована индукция образования эндодермальных клеток brachyury+/HNF-3 beta+ из эмбриональных стволовых клеток мыши в отсутствии сыворотки и в присутствии активина в сочетании с ингибитором сигнального пути Wnt (US2006/0003446A1).

В публикации Gordon et al. (PNAS, Vol 103, page 16806, 2006) говорится: “Для образования передней первичной полоски требовались, одновременно, сигнальные пути Wnt и TGF-beta/nodal/активин”.

Однако модель развития эмбриональных стволовых клеток на мышах может не имитировать в точности программу развития у высших млекопитающих, как, например, у человека.

Thomson et al. выделяли эмбриональные стволовые клетки из человеческих бластоцист (Science 282:114, 1998). Параллельно, Gearhart и соавторы получили клеточные линии человеческих эмбриональных зародышевых клеток (чЭЗ) из ткани половых желез эмбриона (Shamblott et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:13726, 1998). В отличие от эмбриональных стволовых клеток мыши, воспрепятствовать дифференцировке которых можно путем простого культивирования с фактором торможения лейкемии (Leukemia Inhibitory Factor, LIF), человеческие эмбриональные стволовые клетки должны культивироваться в очень специфических условиях (США, патенты № 6200806; WO 99/20741; WO 01/51616).

D'Amour et al. описывают производство обогащенных культур сформированной эндодермы, производной от человеческих эмбриональных стволовых клеток, в присутствии высокой концентрации активина и низкой концентрации сыворотки (D'Amour KA et al. 2005). Трансплантация этих клеток под почечную капсулу мышей приводит к их дифференцировке в более зрелые клетки, обладающие характерными особенностями некоторых эндодермальных органов. Клетки сформированной эндодермы, производные от человеческих эмбриональных стволовых клеток, могут подвергаться дальнейшей дифференцировке в PDX-1-положительные клетки после добавления FGF-10 (US 2005/0266554A1).

В публикации D'Amour et al. (Nature Biotechnology - 24, 1392-1401 (2006)) говорится: “Мы разработали процесс дифференцировки, преобразующий человеческие эмбриональные стволовые клетки (чЭС) в эндокринные клетки, способные синтезировать гормоны поджелудочной железы, инсулин, глюкагон, соматостатин, панкреатический полипептид и грелин. Данный процесс имитирует органогенез поджелудочной железы in vivo, проводя клетки через фазы, напоминающие образование сформированной эндодермы, эндодермы кишечной трубки, панкреатической эндодермы и превращение предшественников эндокринных клеток в клетки, экспрессирующие эндокринные гормоны”.

В другом примере, Fisk et al. сообщают о системе для производства островковых клеток поджелудочной железы из человеческих эмбриональных стволовых клеток (заявка на патент US2006/0040387A1). В данном случае процесс дифференцировки был разделен на три стадии. Сначала человеческие эмбриональные стволовые клетки были дифференцированы до эндодермы с помощью сочетания н-бутирата и активина-А. Далее клетки культивировались с антагонистами TGFß, такими как Noggin, в сочетании с EGF или бетацеллюлином с получением PDX-1-положительных клеток. Окончательная дифференцировка запускалась никотинамидом.

В одном примере, Benvenistry et al. сообщают: “Мы сделали вывод, что сверхэкспрессия PDX-1 увеличивала экспрессию панкреатических обогащенных генов, а для индукции экспрессии инсулина могут потребоваться дополнительные сигналы, присутствующие только in vivo” (Benvenistry et al, Stem Cells 2006; 24:1923-1930).

Имеющиеся способы культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток требуют применения или белков экстраклеточного матрикса, или слоя питающих фибробластов, или добавления экзогенных ростовых факторов, таких как, например, bFGF.

В одном примере Cheon et al (BioReprod DOI:10.1095/biolreprod.105.046870, October 19, 2005) описывают не содержащую питающих клеток и сыворотки культуральную систему, в которой эмбриональные стволовые клетки поддерживаются в некондиционированной, заменяющей сыворотку среде (SR), обогащенной различными факторами роста, способными запустить самообновление эмбриональных стволовых клеток.

В другом примере, Levenstein et al (Stem Cells 24: 568-574, 2006) описывают способы длительного культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток в отсутствие фибробластов или кондиционированной среды, с применением среды, обогащенной основным фактором роста фибробластов (bFGF).

В другом примере, в заявке на патент US 2005 0148070, описывается способ культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток в среде с определенным составом без сыворотки и без питающих клеток-фибробластов, где данный способ включает: культивирование стволовых клеток в культуральной среде, содержащей альбумин, аминокислоты, витамины, минеральные вещества, по меньшей мере один трансферрин или заменитель трансферрина, по меньшей мере один инсулин или заместитель инсулина, культуральную среду, в основном, не включающую эмбриональную сыворотку млекопитающих и содержащую по меньшей мере около 100 нг/мл фактора роста фибробластов, способного активировать сигнальный рецептор фактора роста фибробластов, причем фактор роста происходит из источника, иного, чем просто слой питающих клеток-фибробластов, среду, поддерживающую пролиферацию стволовых клеток в недифференцированном состоянии без слоя питающих клеток или кондиционированной среды.

В другом примере, в заявке на патент US20050233446, описывается среда с определенным составом, которая может быть использована при культивировании стволовых клеток, включая недифференцированные зародышевые стволовые клетки приматов. В растворе среда является существенно изотонической относительно культивируемых стволовых клеток. В данной культуре указанная среда содержит основную среду и количество bFGF, инсулина и аскорбиновой кислоты, достаточное для поддержки роста зародышевых стволовых клеток без существенной дифференцировки.

В другом примере, в заявке на патент US6800480, отмечается: “В одном варианте осуществления предлагается культуральная среда для выращивания зародышевых стволовых клеток приматов в существенно недифференцированном состоянии, включающая основную среду с низким содержанием эндотоксина и низким осмотическим давлением, которая эффективно поддерживает рост зародышевых стволовых клеток приматов. Основная среда объединяется с питательной сывороткой, способной поддерживать рост зародышевых стволовых клеток приматов, и субстратом, выбираемым из группы, включающей питающие клетки и экстраклеточный матрикс, полученный из питающих клеток. Упомянутая среда также включает в себя заменимые аминокислоты, антиоксидант и первый фактор роста, выбираемый из группы, включающей в себя нуклеозиды и соль-пируват.”

В другом примере, в заявке на патент US20050244962, говорится: “В одном аспекте, в изобретении предлагается способ культивирования эмбриональных стволовых клеток приматов. Стволовые клетки культивируются в культуре, существенно свободной от эмбриональной сыворотки млекопитающих (предпочтительно также существенно свободной от сыворотки любых животных) и в присутствии фактора роста фибробластов, полученного из источника, иного, чем просто слой питающих фибробластов. В предпочтительной форме, слой питающих фибробластов, ранее необходимый для поддержания культуры стволовых клеток, становится необязательным вследствие добавления достаточного количества фактора роста фибробластов”.

В другом примере, в заявке на патент WO2005065354, описывается изотоническая культуральная среда определенного состава, в основном не содержащая питающих клеток и сыворотки, включающая: a. базальную среду; b. количество bFGF, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих; c. количество инсулина, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих; и d. количество аскорбиновой кислоты, достаточное для поддержки роста главным образом недифференцированных стволовых клеток млекопитающих.

В другом примере, в заявке на патент WO2005086845, описан способ поддержания недифференцированных стволовых клеток, причем упомянутый способ включает в себя воздействие на стволовые клетки одним из членов семейства белков трансформирующего ростовой фактор-бета (TGFβ), одним из членов семейства белков фактора роста фибробластов (FGF) или никотинамидом (NIC) в количестве, достаточном для поддержания клеток в недифференцированном состоянии в течение периода времени, достаточного для получения желаемого результата.

Кроме того, для формирования панкреатических эндокринных клеток, клеток, экспрессирующих гормоны поджелудочной железы, или клеток, секретирующих гормоны поджелудочной железы из эмбриональных стволовых клеток человека, может потребоваться проведение генетических манипуляций с человеческими эмбриональными стволовыми клетками. Трансфицирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с применением традиционных технологий, таких как, например, липофектамин или электропорация, не дает нужного эффекта.

В публикации WO2007027157 описывается способ, включающий в себя: (a) получение эмбриональной стволовой (ES) клетки; и (b) формирование линии клеток-предшественников из этой эмбриональной стволовой клетки; причем линия клеток-предшественников отбирается на основе способности к самообновлению. Предпочтительно, по данному способу проводится отделение от соматических клеток, на основе их неспособности к самообновлению. Предпочтительно, линия клеток-предшественников формируется или определяется в отсутствие со-культуры, предпочтительно, в отсутствие питающих клеток, которые, предпочтительно, отделяются от эмбриональных стволовых клеток. При необходимости, способ также включает (d) получение дифференцированной клетки из линии клеток-предшественников.

Следовательно, насущной потребностью по-прежнему остается разработка условий для создания стабильных линий плюрипотентных стволовых клеток, способных расти для решения текущих клинических задач и сохраняющих потенциал дифференцировки в панкреатические эндокринные клетки, в клетки, экспрессирующие гормоны поджелудочной железы, или в клетки, секретирующие гормоны поджелудочной железы.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ

В настоящем изобретении предлагается популяция клеток, обладающих характеристиками человеческих эмбриональных стволовых клеток, способных легко расти в культуре при низком содержании сыворотки, не требующих линии питающих клеток или покрытия из сложных белков матрикса, способных пересеваться в виде суспензии одиночных клеток, трансфицироваться с очень высокой эффективностью и культивироваться в условиях гипоксии. Такое сочетание уникальных свойств отличает описанные клетки, составляющие предмет настоящего изобретения, от прототипа.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. получение клеток; и

b. культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.

Клетки могут представлять собой человеческие эмбриональные стволовые клетки или клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы. Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии.

Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода и обрабатываться ингибитором Rho-киназы. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии и обрабатываться ингибитором Rho-киназы.

Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут культивироваться в условиях гипоксии.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции клеток, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток,

b. дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, и

c. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток, и

b. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, ингибитор Rho-киназы, активин-А, Wnt-лиганд и IGF-1.

Клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, способны расти в культуре в условиях гипоксии, на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ выращивания клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, включающий этапы культивирования клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся обработке белком или экстраклеточным матриксом. В одном варианте осуществления клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, получают из плюрипотентных клеток, формируемых способами, составляющими предмет настоящего изобретения.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А, Wnt-лиганд и ингибитор GSK-3B.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

На Фиг. 1 показана экспрессия CXCR4 (CD 184, ось Y) и CD9 (ось X) в человеческих эмбриональных стволовых клетках линии H9, пассаж 54, которые были дифференцированы в сформированную эндодерму после обработки средой с низким содержанием сыворотки + Activin-A + WNT-3A в течение 4 дней.

На Фиг. 2 показан анализ способом ПЦР в реальном времени человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 54, на 4 и 6 день протокола дифференцировки в сформированную эндодерму, описанного в Примере 5. На панели a) показана экспрессия AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7. На панели b) показана экспрессия SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta.

На Фиг. 3 показан протокол выделения, использованный для получения клеток EXPRES из эмбриональных стволовых клеток в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.

На Фиг. 4 показана морфология выращенных клеток EXPRES на стадии P0, день 11, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A (панель a) или 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A (панель b). На панели c показана морфология клеток EXPRES, пассаж 3.

На Фиг. 5 показан анализ способом ПЦР в реальном времени выращенных клеток EXPRES, культивируемых в 2-5% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A на протяжении трех пассажей. На панели a) показана экспрессия AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7. На панели b) показана экспрессия SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta.

На Фиг. 6 показано влияние добавления Wnt-3A на экспрессию генов в клетках EXPRES. На панели a) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-17, GATA-4 и HNF-3 beta. На панели b) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии AFP, Bry, CXCR4, GSC и SOX-7.

На Фиг. 7 показано влияние IGF-1, Wnt-3A и активина-A на экспрессию генов в клетках EXPRES. На панели a) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-17, GATA-4, HNF-3 beta, Bry, CXCR4 и GSC. На панели b) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии SOX-7 и AFP. На панели c) показаны данные ПЦР в реальном времени для экспрессии OCT-4.

На Фиг. 8 показана морфология выращенных клеток EXPRES, полученных из линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H9, пассаж 54, культивированных в a) 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, b) 2% ЭТС + DMEMF12 + 100 нг/мл AA, c) 2% ЭТС + DMEM-F12 + 50 нг/мл IGF-I.

На Фиг. 9 показан потенциал роста клеток EXPRES 01 и 02, культивируемых на полистироле для тканевой культуры в условиях гипоксии. Клетки EXPRES 01 культивировались в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, при этом клетки EXPRES 02 культивировались в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A.

На Фиг. 10 показана морфология клеток EXPRES, полученных из одиночно-клеточной суспензии недифференцированных эмбриональных стволовых клеток на TCPS (полистирол для тканевой культуры) в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 50 нг/мл IGF-I.

На Фиг. 11 показана экспрессия белков, определяемая способом сортировки клеток с возбуждением флуоресценции (FACS) в клетках EXPRES 01, пассаж 24. На панели a) показаны уровни экспрессии E-кадгерина, на панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, на панели c) показаны уровни экспрессии CD9, на панели d) показаны уровни экспрессии CD117, на панели e) показаны уровни экспрессии CD30, на панели f) показаны уровни экспрессии LIF-рецептора, на панели g) показаны уровни экспрессии TRA 1-60, на панели h) показаны уровни экспрессии TRA 1-81, на панели i) показаны уровни экспрессии SSEA-1, на панели j) показаны уровни экспрессии SSEA-3, на панели k) показаны уровни экспрессии SSEA-4 и на панели l) показаны уровни экспрессии CD56.

На Фиг. 12 показана экспрессия белков, определяемая способом сортировки клеток с возбуждением флуоресценции (FACS) в клетках EXPRES 02, пассаж 21. На панели a) показаны уровни экспрессии E-кадгерина, на панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, на панели c) показаны уровни экспрессии CD9, на панели d) показаны уровни экспрессии CD117, на панели e) показаны уровни экспрессии CD30, на панели f) показаны уровни экспрессии LIF-рецептора, на панели g) показаны уровни экспрессии TRA 1-60, на панели h) показаны уровни экспрессии TRA 1-81, на панели i) показаны уровни экспрессии SSEA-1, на панели j) показаны уровни экспрессии SSEA-3, на панели k) показаны уровни экспрессии SSEA-4 и на панели l) показаны уровни экспрессии CD56.

На Фиг. 13 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 10, культивируемых в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) Nanog, панель c) совместное окрашивание DAPI (синий) и Oct-4 (зеленый), панель d) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели e, панель e) SOX-2 и панель f) совместное окрашивание DAPI (синий) и HNF-3 beta (зеленый).

На Фиг. 14 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 02, пассаж 9, культивируемых в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) HNf3B, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) OCT-4, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) SOX-2, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) NANOG.

На Фиг. 15 показана экспрессия генов, определенная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, EXPRES 02, клеток EB, полученных из клеток H9, клеток SA002, культивированных на MATRIGEL в MEF-CM, и для недифференцированных клеток H9, культивированных на MATRIGEL в MEFCM. Все уровни экспрессии нормализованы к недифференцированным клеткам H9. На панели a) показана экспрессия SOX-1, на панели b) показана экспрессия FOXD3, MYOD1, POU5F1 и ZFP42, на панели c) показана экспрессия ABCG2, коннексина 43, коннексина 45 и цитокератина 15, на панели d) показана экспрессия нестина, SOX-2, UTF1 и виментина, на панели e) показана экспрессия GATA-2, Brachyury, TERT и тубулина-бета III, на панели f) показана экспрессия CFC1 и GATA-4, на панели g) показана экспрессия AFP и FOXA2 и на панели h) показана экспрессия IPF1A и MSX1.

На Фиг. 16 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в a) клетках EXPRES 01, пассаж 5, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, а затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A, b) клетках EXPRES 02, пассаж 4, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, а затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A.

На Фиг. 17 показана измеренная способом ПЦР в реальном времени экспрессия генов a) в клетках EXPRES 01 и b) в клетках EXPRES 02, обработанных средой с низким содержанием сыворотки, плюс AA + WNT-3a.

На Фиг. 18 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 5, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) GATA-4, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) SOX-17, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) HNF-3 beta, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) OCT-4.

На Фиг. 19 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 02, пассаж 4, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A и 20 нг/мл WNT3A в течение 2 дней, затем еще 2 дней в DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) GATA-4, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) SOX-17, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) HNF-3 beta, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) OCT-4.

На Фиг. 20 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в a) клетках EXPRES 01, пассаж 19, и b) клетках EXPRES 02, пассаж 14, культивированных на полистироле для тканевой культуры в среде для культивации, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX и 20 нг/мл WNT3A в течение 4 дней.

На Фиг. 21 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 19, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I, и клеток EXPRES 02, пассаж 14, культивированных в 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A, затем в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX и 20 нг/мл WNT-3A в течение 5 дней. Панель a) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b, панель b) HNF-3 beta, панель c) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели d, панель d) GATA-4, панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) SOX-17, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) HNF-3 beta, панель i) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели j, панель j) GATA-4, панель k) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели l, панель l) SOX-17.

На Фиг. 22 показана измеренная способом ПЦР в реальном времени экспрессия генов a) в клетках EXPRES 01 и в клетках EXPRES 02, обработанных средой с низким содержанием сыворотки, плюс AA + WNT3a + GSK-3B-ингибитор IX в течение 5 дней. На панели a показана экспрессия AFP, Brachyury, CDX2, Mox1, OCT3/4, SOX-7 и ZIC1, на панели b показаны уровни экспрессии CXCR4, GATA-4, Goosecoid, HNf3B и SOX-17.

На Фиг. 23 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, посеянных с плотностью 5000-40000 клеток/см2 на полистирол для культивирования ткани в культивационной среде, затем культивировавшихся в DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX в течение четырех дней в условиях гипоксии. На панели а) показаны уровни экспрессии AFP, Brachyury, SOX-7 и OTX2. На панели b) показаны уровни экспрессии CXCR4, HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cerb и GSC.

На Фиг. 24 показаны результаты анализа длины теломеров в клетках с пониженным контролем теломеров (полоса 1), клетках EXPRES 01, пассаж 24 (полоса 2), клетках EXPRES 02, пассаж 17 (полоса 3), недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках H1, пассаж 40 (полоса 4) и в клетках с повышенным контролем теломеров (полоса 5).

На Фиг. 25 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01, пассаж 21, дифференцированных в клетки эндодермы передней кишки (S3), клетки панкреатической эндодермы (S4) и панкреатические эндокринные клетки (S5).

На Фиг. 26 приведены иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01, пассаж 35, культивированные по Примеру 18. Панель а) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели b), панель b) анти-1 трипсин, панель c) HNF-3 beta (зеленый), альбумин (красный), панель d) альбумин (красный) и DAPI (синий), панель e) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели f, панель f) PDX-1, панель g) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели h, панель h) SOX-17, панель i) изображение с окраской DAPI, соответствующее панели j, панель j) CDX-2.

На Фиг. 27 показаны диаграммы рассеяния данных с биочипов, где сравниваются, панель a) клетки EXPRES 01 (ось y) с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9 (ось x), панель b) клетки EXPRES 02 (ось y) с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9 (ось x), панель c) клетки EXPRES 01 (ось y) с клетками EXPRES 02 (ось x), панель d) клетки EXPRES 01 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x), панель e) клетки EXPRES 02 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x), панель f) недифференцированные человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9 (ось y) с человеческими эмбриональными стволовыми клетками линии H9, дифференцированными в сформированную эндодерму (ось x).

На Фиг. 28 показана морфология телец EB, образованных клетками EXPRES 01.

На Фиг. 29 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени, для клеток линии EXPRES 01, клеток линии EXPRES 02 и человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 43, через пять недель после трансплантации под почечную капсулу мышей NOD-SCID. На панелях a-e показаны маркеры мезодермы. На панелях f & g показаны маркеры эктодермы. На панелях h и i показаны маркеры эндодермы. На панели j показаны дополнительные маркеры эмбриональной эндодермы. На панелях k-m показаны маркеры плюрипотентности.

На Фиг. 30 показана пролиферация и состояние клеточного цикла клеток EXPRES 03, измеренная по включению бромдезоксиуридина (BRDU). Клетки EXPRES 03 культивировались в 2% ЭТС/DMEM/F12, с добавлением: панель a) активина-A (100 нг/мл) и wnt3a (20 нг/мл), панель b) активина-A (100 нг/мл) и wnt3a (20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Показаны также другие клетки, панель c) чЭС клетки (H9p43), панель d) клетки амниотической жидкости (AFDX002) и панель e) клетки МЭФ (мышиные эмбриональные фибробласты), обработанные митомицином. На панели f) для разных изученных популяций клеток показана встречаемость клеток, находящихся в фазе S, G1 и G2/M клеточного цикла.

На Фиг. 31 показана эффективность трансфекции и экспрессия EGFP в клетках EXPRES 01 и в человеческих эмбриональных стволовых клетках, которые сеялись либо в виде одиночно-клеточных дисперсий, либо клеточных кластеров. Клетки были проанализированы через 24 часа при помощи флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии. На панели A) показаны данные, полученные на клетках EXPRES 01. На панели B) показаны данные, полученные на одиночно-клеточной суспензии человеческих эмбриональных стволовых клеток, на панели C) показаны данные, полученные на кластерах человеческих эмбриональных стволовых клеток.

На Фиг. 32 показаны, как функция количества клеток, усредненные данные по оптической плотности (OD), измеренные с помощью MTS-теста и отражающие активность фермента дегидрогеназы для a) клеток EXPRES 01, культивированных в атмосфере кислорода воздуха (около 21%), b) клеток EXPRES 01, культивированных в 3% O2, c) клеток EXPRES 02 культивированных в атмосфере кислорода воздуха (около 21%), d) клеток EXPRES 02, культивированных в 3% O2.

На Фиг. 33 показана экспрессия генов, измеренная способом ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01 P27, посеянных с плотностью 10000 клеток/см2 на полистирол для культивирования ткани в среде DMEMF12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX. На панели a показаны уровни экспрессии AFP, Brachyury, SOX-7 и OTX2. На панели b показаны уровни экспрессии CXCR4, HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cer1 и GSC.

На Фиг. 34 показана измеренная способом FACS экспрессия CXCR4 (ось Y) и CD9 (ось x) в клетках EXPRES 01 P27, культивированных на полистироле для культивирования ткани в среде DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора-IX для трех пассажей.

На Фиг. 35 показано влияние трансфекции малых интерферирующих РНК (миРНК) на экспрессию GSK-3B и бета-катенина. Клетки EXPRES были проанализированы путем флуоресцентной микроскопии и количественными способами ОТ-ПЦР. A) Флуоресцентная микроскопия клеток, трансфицированных i) миРНК, меченными с помощью CY3 и ii) миРНК, меченными флуоресцином. B) Нокдаун целевого гена, выраженный в процентной доле оставшейся активности, в клетках, трансфицированных олигонуклеотидными последовательностями миРНК для i) GSK3b и ii) бета-катенина.

На Фиг. 36 показан кариотип двух клеточных линий, полученных в соответствии со способами, представляющими предмет настоящего изобретения. Панель a: клеточная линия EXPRES 01. Панель b: клеточная линия EXPRES 02.

На Фиг. 37 показана морфология клеток EXPRES 15, пассаж 0, через 24 часа культивирования в среде a) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF или b) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF + 10 мкМ ингибитора Rho-киназы Y-27632.

На Фиг. 38 показан кариотип клеток EXPRES 15, культивированных в 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF + 10 мкМ ингибитора Rho-киназы Y-27632 для 12 пассажей.

На Фиг. 39 показана пролиферация, измеренная способом A490 для клеток EXPRES 11, культивированных в базальной среде с добавлением IGF, активина-A, Wnt-3A и GSK-ингибитора IX в обозначенных концентрациях, на момент 24 ч (панель a), 48 ч (панель b) и 96 ч (панель c).

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ

Для ясности описания, а не для ограничения изобретения, подробное описание изобретения разделено на следующие подразделы, описывающие или иллюстрирующие определенные особенности, варианты осуществления или области применения настоящего изобретения.

Определения

Стволовые клетки представляют собой недифференцированные клетки, определяющиеся по их способности на уровне единичной клетки самообновляться и дифференцироваться с образованием клеток-потомков, таких как самообновляющиеся предшественники, необновляющиеся предшественники и окончательно дифференцированные клетки. Стволовые клетки также характеризуются способностью дифференцироваться in vitro в функциональные клетки различных линий, происходящих из нескольких зародышевых листков (эндодермы, мезодермы и эктодермы), а также после трансплантации давать начало тканям, происходящим от нескольких зародышевых листков, и вносить существенный вклад в формирование большинства, если не всех, тканей после инъекции в бластоциты.

По потенциалу развития стволовые клетки классифицируются следующим образом: (1) тотипотентные, т.е. способные давать начало всем эмбриональным и внеэмбриональным типам клеток; (2) плюрипотентные, т.е. способные давать начало всем эмбриональным типам клеток; (3) мультипотентные, т.е. способные давать начало группе клеточных линий, в пределах конкретной ткани, органа или физиологической системы (например, гематопоэтические стволовые клетки (ГСК) могут давать таких потомков, как ГСК (самообновление), олигопотентные предшественники, ограниченные клетками крови, и все типы клеток и клеточных элементов (таких как тромбоциты), являющиеся нормальными компонентами крови); (4) олигопотентные, т.е. способные давать начало более ограниченному набору клеточных линий, чем мультипотентные стволовые клетки; и (5) унипотентные, т.е. способные давать начало единственной клеточной линии (например, сперматогенные стволовые клетки).

Дифференцировка представляет собой процесс, при помощи которого неспециализированная (“некоммитированная”) или малоспециализированная клетка приобретает свойства специализированной клетки, например, нервной или мышечной. Дифференцированная клетка или клетка с индуцированной дифференцировкой представляет собой клетку, занявшую более специализированное (“коммитированное”) положение в линии клеточной дифференцировки. Термин “коммитированная”, применительно к процессу дифференцировки, обозначает клетку, дошедшую в ходе дифференцировки до стадии, от которой, в нормальных условиях, она продолжит дифференцироваться до определенного типа клеток или набора типов клеток, и не сможет, в нормальных условиях, дифференцироваться в иной тип клеток или вернуться к менее дифференцированному типу. Дедифференцировкой называется процесс, в ходе которого клетка возвращается к менее специализированной (или коммитированной) позиции в линии дифференцировки. В настоящем документе линией дифференцировки клеток называется наследственность клетки, т.е. от каких клеток она происходит и каким клеткам может дать начало. В линии дифференцировки клетка помещается в наследственную схему развития и дифференцировки. Маркером, специфичным для линии дифференцировки, называется характерная особенность, специфически ассоциированная с фенотипом клеток конкретной линии дифференцировки, которая может использоваться для оценки дифференцировки некоммитированных клеток в данную линию дифференцировки.

Термин “AFP” или “белок альфа-фетопротеин” в настоящем документе означает антиген, образующийся в начальной стадии развития печени. AFP также может экспрессироваться во внезародышевых клетках.

“Альбумин” представляет собой растворимый мономерный белок, составляющий у взрослых около половины всех сывороточных белков.

“β-клеточной линией дифференцировки” называются клетки, положительные по экспрессии гена транскрипционного фактора PDX-1 и по меньшей мере одного из следующих транскрипционных факторов: NGN-3, Nkx2.2, Nkx6.1, NeuroD, Isl-1, HNF-3 beta, MAFA, Pax4 и Pax6. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для β-клеточной линии дифференцировки относятся β-клетки.

Термин “Brachyury” в настоящем документе означает члена семейства генов T-бокс. Он является маркером клеток первичной полоски и мезодермы.

Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: SOX-17, GATA-4, HNF-3 beta, GSC, Cer1, Nodal, FGF8, Brachyury, Mix-like homeobox protein, FGF4, CD48, эомезодермин (EOMES), DKK4, FGF17, GATA-6, CXCR4, C-Kit, CD99 или OTX2. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, относятся клетки-предшественники первичной полоски, клетки первичной полоски, клетки мезэндодермы и клетки сформированной эндодермы.

Термины “c-Kit” и “CD117” означают тирозинкиназу рецепторов клеточной поверхности с последовательностью, описанной под каталожным номером Genbank X06182, или вариант этой последовательности, имеющий природное происхождение (например, аллельный вариант).

Термин “CD99” в настоящем документе означает белок, кодируемый геном с каталожным номером NM_002414.

Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: PDX-1, HNF-1 beta, PTF-1 alpha, HNF-6 или HB9. К клеткам, экспрессирующим маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, относятся клетки панкреатической эндодермы.

Термин “клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток” в настоящем документе означает клетки, экспрессирующие по меньшей мере один из следующих маркеров: NGN-3, NeuroD, Islet-1, PDX-1, NKX6.1, Pax-4, Ngn-3 или PTF-1 alpha. Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии дифференцировки в панкреатические эндокринные клетки, включают панкреатические эндокринные клетки, панкреатические клетки, экспрессирующие гормоны, и панкреатические клетки, секретирующие гормоны, а также клетки β-клеточной линии дифференцировки.

Термин “Cer1” или “Cerebrus” в настоящем документе означает белок, являющийся членом суперсемейства белков с цистеиновым узлом.

Термином “CXCR4” в настоящем документе обозначается рецептор к полученному из стромальных клеток фактору 1 (SDF-1), также имеющий названия “LESTR” или “фузин”. В эмбрионе мыши в стадии гаструляции CXCR4 экспрессируется в сформированной эндодерме и мезодерме, но не во внеэмбриональной эндодерме.

Используемый в настоящем документе термин “сформированная эндодерма” относится к клеткам, обладающим характерными особенностями клеток, возникающих из эпибласта в ходе гаструляции, и формирующим желудочно-кишечный тракт и его производные. Клетки сформированной эндодермы экспрессируют следующие маркеры: HNF-3 beta, GATA-4, SOX-17, Cerberus, OTX2, goosecoid, C-Kit, CD99 и Mixl1.

“Внеэмбриональной эндодермой” в настоящем документе называется популяция клеток, экспрессирующих по меньшей мере один из следующих маркеров: SOX-7, AFP и SPARC.

Терминами “FGF-2”, “FGF-4” “FGF-8” “FGF-10” и “FGF-17” в настоящем документе называются члены семейства факторов роста фибробластов.

“GATA-4” и “GATA-6” являются членами семейства транскрипционных факторов GATA. Данное семейство транскрипционных факторов индуцируется через сигнальный путь TGF-β и участвует в сохранении маркеров ранней эндодермы.

Термин “GLUT-2” в настоящем документе означает молекулу-переносчик глюкозы, экспрессирующуюся во многих эмбриональных и полностью развитых тканях, включая поджелудочную железу, печень, кишечник, мозг и почки.

Термин “Goosecoid” или “GSC” в настоящем документе означает гомеодоменный транскрипционный фактор, экспрессирующийся в дорзальной губе бластопора.

Термин “HB9” в настоящем документе означает ген гомеобокса 9.

Термины “HNF-1 alpha”, “HNF-1 beta”, “HNF-3 beta” и “HNF-6” относятся к семейству печеночных ядерных транскрипционных факторов, характеризующихся высококонсервативным ДНК-связывающим доменом и двумя короткими карбоксиконцевыми доменами.

Термины “Islet-1” или “Isl-1” в настоящем документе означают член семейства LIM/гомеодоменных транскрипционных факторов, экспрессирующихся в развивающейся поджелудочной железе.

Термин “MafA” в настоящем документе означает транскрипционный фактор, экспрессирующийся в поджелудочной железе и контролирующий экспрессию генов, участвующих в биосинтезе и секреции инсулина.

Используемый в настоящей заявке термин "маркеры" означает молекулы нуклеиновых кислот или полипептидов с дифференциальной экспрессией в интересующих клетках. В данном контексте под дифференциальной экспрессией подразумевается повышенный уровень положительного маркера и пониженный уровень отрицательного маркера. Определяемый уровень маркерной нуклеиновой кислоты или полипептида в интересующих клетках оказывается значительно выше или ниже по сравнению с другими клетками, что позволяет идентифицировать интересующую клетку и отличить ее от других клеток с помощью любого из множества известных в данной области способов.

“Мезэндодермальной клеткой” в настоящем документе называется клетка, экспрессирующая по меньшей мере один из следующих маркеров: CD48, эомезодермин (EOMES), SOX-17, DKK4, HNF-3 beta, GSC, FGF17, GATA-6.

Термином “Mixl1” в настоящем документе называется ген гомеобокса, являющийся маркером клеток первичной полоски, мезодермы и эндодермы.

Термином “NeuroD” называется основной транскрипционный фактор типа спираль-петля-спираль (bHLH), участвующий в нейрогенезе.

Термином “NGN-3” в настоящем документе называется член нейрогенинового семейства основных транскрипционных факторов типа петля-спираль-петля.

Терминами “Nkx-2.2” и “Nkx-6.1” в настоящем документе обозначаются члены семейства транскипционных факторов Nkx.

Термином “Nodal” в настоящем документе обозначается член суперсемейства белков TGF-beta.

“Oct-4” представляет собой транскрипционный фактор с доменом POU и является общепризнанным маркером плюрипотентных стволовых клеток. На связь Oct-4 с плюрипотентными стволовыми клетками указывает то, что его экспрессия жестко ограничена недифференцированными плюрипотентными стволовыми клетками. После дифференцировки в соматические линии, экспрессия Oct-4 быстро исчезает.

“Панкреатической эндокринной клеткой” или “клеткой, экспрессирующей гормон поджелудочной железы” в настоящем документе называется клетка, экспрессирующая по меньшей мере один из следующих гормонов: инсулин, глюкагон, соматостатин и панкреатический полипептид.

“Клеткой, секретирующей гормон поджелудочной железы” в настоящем документе называется клетка, способная секретировать по меньшей мере один из следующих гормонов: инсулин, глюкагон, соматостатин и панкреатический полипептид.

“Pax-4” и “Pax-6” в настоящем документе обозначают специфичные для панкреатических β-клеток транскрипционные факторы, участвующие в развитии островков.

“PDX-1” в настоящем документе обозначает гомеодоменный транскрипционный фактор, участвующий в развитии поджелудочной железы.

“Клеткой зародышевого диска” в настоящем документе называется клетка, способная экспрессировать по меньшей мере один из следующих маркеров: Nodal или FGF8.

“Клеткой первичной полоски” в настоящем документе называется клетка, способная экспрессировать по меньшей мере один из следующих маркеров: Brachyury, Mix-like homeobox protein или FGF4.

Термин “PTF-1 alpha” в настоящем документе означает основной белок типа спираль-петля-спираль с массой 48 кДа, представляющий собой специфичную к определенной последовательности ДНК-связывающую субъединицу тримерного панкреатического транскрипционного фактора-1 (PTF1).

Терминами “SOX-1”, “SOX-2”, “SOX-7” и “SOX-17” в настоящем документе обозначаются члены семейства транскрипционных факторов SOX, участвующих в эмбриогенезе.

Термин “SPARC”, используемый в настоящем документе, также носит наименование “секретированный белок, кислый и богатый цистеином”.

“SSEA-1” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-1) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности мышиных тератокарциномных стволовых клеток (EC), мышиных и человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и мышиных эмбриональных стволовых клеток (ES).

“SSEA-3” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-3) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).

“SSEA-4” (стадиеспецифический эмбриональный антиген-4) представляет собой гликолипидный поверхностный антиген, присутствующий на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).

“TRA1-60” представляет собой связанный с кератинсульфатом антиген, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).

“TRA1-81” представляет собой связанный с кератинсульфатом антиген, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC), человеческих эмбриональных зародышевых клеток (EG) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).

“TRA2-49” представляет собой изофермент щелочной фосфатазы, экспрессирующийся на поверхности человеческих тератокарциномных стволовых клеток (EC) и человеческих эмбриональных стволовых клеток (ES).

Термин “UTF-1” в настоящем документе означает коактиватор транскрипции, экспрессирующийся в плюрипотентных эмбриональных стволовых клетках и во внеэмбриональных клетках.

Термином “Zic1” в настоящем документе обозначается член семейства транскрипционных факторов Zic. Zic1 регулирует экспрессию нейрональных и специфичных для нервного валика генов, экспрессируемых в клетках дорзальной нервной трубки и домиграционного нервного валика.

Способ получения клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности

Предметом настоящего изобретения является популяция клеток, обладающих характеристиками человеческих эмбриональных стволовых клеток, способных легко расти в культуре при низком содержании сыворотки, не требующих линии питающих клеток или покрытия из сложных белков матрикса, способных пересеваться в виде суспензии одиночных клеток, трансфицироваться с очень высокой эффективностью и культивироваться в условиях гипоксии. Такое сочетание уникальных свойств отличает описанные клетки, составляющие предмет настоящего изобретения, от прототипа.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. получение клеток; и

b. культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.

Клетки могут представлять собой человеческие эмбриональные стволовые клетки или клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы. Человеческие эмбриональные стволовые клетки перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы человеческие эмбриональные стволовые клетки могут культивироваться в условиях гипоксии.

Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, перед культивированием этих клеток на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом, могут культивироваться в среде с нормальным содержанием кислорода. В качестве альтернативы клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут культивироваться в условиях гипоксии.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток,

b. дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, и

c. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся перед культивированием предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ получения популяции, состоящей из клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности, включающий следующие этапы:

а. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток, и

b. извлечение клеток с последующим их культивированием в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом.

Культивирование клеток в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом

В одном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение срока от приблизительно 1 до приблизительно 20 дней. В альтернативном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение срока от приблизительно 5 до приблизительно 20 дней. В альтернативном варианте осуществления клетки культивируются в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не покрытом экстраклеточным матриксом, в течение приблизительно 15 дней.

В одном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание от приблизительно 1% O2 до приблизительно 20% O2. В альтернативном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание от приблизительно 2% O2 до приблизительно 10% O2. В альтернативном варианте осуществления гипоксия представляет собой содержание приблизительно 3% O2.

Клетки могут культивироваться в условиях гипоксии на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным мактриксом, в среде, содержащей сыворотку, активин-А и Wnt-лиганд. В качестве альтернативы среда также может содержать IGF-1.

Среда для культивирования может содержать сыворотку в концентрации от приблизительно 2% до приблизительно 5%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять приблизительно 2%.

Активин-А может использоваться в концентрациях от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.

Wnt-лиганд может быть выбран из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.

Wnt-лиганд может использоваться в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд может использоваться в концентрации от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд используется в концентрации приблизительно 20 нг/мл.

IGF-1 может использоваться в концентрациях от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления IGF-1 может использоваться в концентрации от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В одном варианте осуществления лиганд IGF-1 используется в концентрации приблизительно 50 нг/мл.

Клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, способны расти в культуре в условиях гипоксии, на субстрате тканевой культуры, не подвергавшемся предварительной обработке белком или экстраклеточным матриксом.

Полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, экспрессируют по меньшей мере один маркер плюрипотентности, выбираемый из группы, состоящей из: ABCG2, cripto, FoxD3, Connexin43, Connexin45, Oct4, SOX-2, Nanog, hTERT, UTF-1, ZFP42, SSEA-3, SSEA-4, Tra1-60 и Tra1-81.

В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток зародышевого диска.

В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток первичной полоски.

В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток мезодермы.

В одном варианте осуществления полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, способны экспрессировать маркеры, характерные для клеток сформированной эндодермы.

Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентости, полученных способами, составляющими предмет настоящего изобретения

Полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, любым известным специалистам способом.

Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 23, 1534-1541 (2005).

Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации Shinozaki et al, Development 131, 1651-1662 (2004).

Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации McLean et al, Stem Cells 25, 29-38 (2007).

Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).

Например, клетки, экспрессирующие маркеры плюрипотентности, полученные способами, составляющими предмет настоящего изобретения, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, путем культивирования плюрипотентных стволовых клеток в среде, содержащей активин-A в отсутствие сыворотки, затем культивирования клеток с активином-A и сывороткой и затем культивирования клеток с активином A и сывороткой в другой концентрации. Пример данного способа описан в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology, 23, 1534-1541, 2005.

Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.

Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, любым известным специалистам способом.

Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).

Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, дифференцируются в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, путем обработки клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, фактором роста фибробластов и ингибитором сигнального пути и KAAD-циклопамином, затем удаления среды, содержащей фактор роста фибробластов и KAAD-циклопамин с последующим культивированием клеток в среде, содержащей ретиноевую кислоту, фактор роста фибробластов и KAAD-циклопамин. Пример данного способа описан в публикации D' Amour et al, Nature Biotechnology, 24: 1392-1401, (2006).

Дальнейшая дифференцировка клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы

Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток, любым известным специалистам способом.

Например, клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатической эндодермы, могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии панкреатических эндокринных клеток, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 24, 1392-1401 (2006).

В следующих разделах содержатся неограничительные примеры способов получения клеток, подходящих для использования в качестве исходного материала для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.

Выделение, выращивание и культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток

Описание человеческих эмбриональных стволовых клеток: человеческие эмбриональные стволовые клетки могут экспрессировать один или несколько стадиеспецифичных эмбриональных антигенов (SSEA) 3 и 4, а также маркеры, определяемые антителами, обозначенными как Tra-1-60 и Tra-1-81 (Thomson et al., Science 282:1145, 1998). Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток in vitro приводит к утрате экспрессии SSEA-4, Tra-1-60 и Tra-1-81 (если имеются) и к увеличению экспрессии SSEA-1. В недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках, как правило, активна щелочная фосфатаза, которая может быть обнаружена путем фиксации клеток с помощью 4% параформальдегида, с последующим обнаружением с помощью Vector Red, применяемого в качестве субстрата, в соответствии с инструкциями производителя (Vector Laboratories, Burlingame Calif.). Недифференцированные плюрипотентные стволовые клетки так же, как правило, экспрессируют Oct-4 и TERT, обнаруживаемые способом ОТ-ПЦР (RT-PCR).

Другим желательным фенотипическим свойством выращенных человеческих эмбриональных клеток является потенциал дифференцировки в клетки всех трех зародышевых листков: в эндодермальные, мезодермальные и эктодермальные ткани. Плюрипотентность человеческих эмбриональных стволовых клеток может быть подтверждена, например, путем инъекции клеток мышам с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (SCID), фиксирования образующихся тератом с помощью 4% параформальдегида и их гистологического исследования на предмет наличия клеточных типов, происходящих от трех зародышевых листков. В качестве альтернативы плюрипотентность можно определить путем создания эмбриоидных телец и анализа их на предмет присутствия маркеров, ассоциирующихся с тремя зародышевыми листками.

Выращенные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток могут быть кариотипированы с применением стандартного способа окрашивания красителем Гимза (G-banding) и сравнения с опубликованными кариотипами соответствующих видов приматов. Желательно получать клетки, имеющие “нормальный кариотип”, т.е. эуплоидные клетки, в которых присутствуют все человеческие хромосомы, не имеющие видимых изменений.

Источники получения человеческих эмбриональных стволовых клеток: к типам человеческих эмбриональных стволовых клеток, которые можно использовать, относятся стабильные линии человеческих эмбриональных клеток, получаемых из ткани, образующейся после беременности, в том числе, из преэмбриональной ткани (такой, как бластоциста), эмбриональной ткани или ткани плода, взятой в любой момент в ходе беременности, как правило, но не обязательно, до срока приблизительно 10-12 недель беременности. Примерами, не ограничивающими настоящее изобретение, являются стабильные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток или человеческих эмбриональных зародышевых клеток, например, клеточные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H1, H7 и H9 (WiCell). Также возможно использование описываемых в настоящей заявке составов в ходе первоначального установления или стабилизации таких клеток; в этом случае исходными клетками являются первичные плюрипотентные клетки, взятые непосредственно из тканей-источников. Также подходящими являются клетки, взятые из популяции плюрипотентных стволовых клеток, уже культивируемых в отсутствие питающих клеток. Также подходящими являются мутантные линии человеческих эмбриональных стволовых клеток, например, BG01v (BresaGen, Athens, GA).

В одном из вариантов осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки подготавливаются как описано в публикации Thomson et al. (США Патент США № 5843780; Science 282:1145, 1998; Curr. Top. Dev. Biol. 38:133 ff., 1998; Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92:7844, 1995).

Культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток: в одном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются в системе культивации, по существу, не содержащей питающих клеток, но, тем не менее, поддерживающей пролиферацию человеческих эмбриональных стволовых клеток и не допускающей существенной дифференцировки. Выращивание человеческих эмбриональных стволовых клеток в культуре, не содержащей питающих клеток, без дифференцировки, осуществляется при помощи среды, кондиционированной путем предварительного культивирования в ней клеток другого типа. В качестве альтернативы выращивание человеческих эмбриональных стволовых клеток в культуре, не содержащей питающих клеток, без дифференцировки, осуществляется при помощи среды с определенным химическим составом.

В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки исходно культивируются на слое питающих клеток, которые оказывают разностороннюю поддержку человеческим эмбриональным стволовым клеткам. Человеческие эмбриональные стволовые клетки далее переносятся в систему культивации, по существу, не содержащую питающих клеток, но, тем не менее, поддерживающую пролиферацию человеческих эмбриональных стволовых клеток и не допускающую их существенной дифференцировки.

Примеры кондиционированной среды, подходящей для использования в настоящем изобретении, описаны в публикациях US20020072117, US6642048, WO2005014799 и Xu et al (Stem Cells 22: 972-980, 2004).

Пример среды с определенным химическим составом, подходящей для использования в настоящем изобретении, можно найти в публикации US20070010011.

Подходящая культуральная среда может состоять из следующих компонентов, например, модифицированная способом Дульбекко среда Игла (DMEM), Gibco # 11965-092; модифицированная способом Дульбекко среда Игла Knockout (KO DMEM), Gibco #10829-018; базальная среда Хэма F12/50% DMEM; 200 мМ L-глутамина, Gibco # 15039-027; раствор заменимых аминокислот, Gibco 11140-050; β-меркаптоэтанол, Sigma # M7522; человеческий рекомбинантный основной фактор роста фибробластов (bFGF), Gibco # 13256-029.

В одном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки наносятся на подходящий культуральный субстрат, предварительно подвергнутый обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения. В одном осуществлении упомянутая обработка представляет собой компонент внеклеточного матрикса, например, компонент, полученный из базальной мембраны, или компонент, который может участвовать во взаимодействии лиганда с рецептором молекулы адгезии. В одном из вариантов осуществления подходящим культуральным субстратом является MATRIGEL (Becton Dickenson). MATRIGEL® представляет собой растворимый препарат из клеток опухоли Энгельбрета-Холма-Суорма, который при комнатной температуре превращается в гель и образует восстановленную базальную мембрану.

В качестве альтернативы можно использовать другие компоненты экстраклеточного матрикса и смеси компонентов. Это может быть ламинин, фибронектин, протеогликан, энтактин, гепарансульфат и т.п., отдельно или в различных сочетаниях.

Человеческие эмбриональные стволовые клетки могут наноситься на субстрат в подходящем распределении и в присутствии среды, способствующей выживанию, размножению клеток и сохранению ими желательных особенностей. На все эти характеристики оказывает влияние аккуратность распределения клеток при посеве, которая легко может быть определена специалистом в данной области.

Далее человеческие эмбриональные стволовые клетки извлекаются из обработанного субстрата тканевой культуры и наносятся на не подвергавшийся обработке субстрат тканевой культуры, и после этого обрабатываются в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения, для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.

Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы

Человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, с помощью любого способа, известного специалистам в данной области. Клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, можно подвергать обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения.

Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации D'Amour et al, Nature Biotechnology 23, 1534-1541 (2005).

Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации Shinozaki et al, Development 131, 1651-1662 (2004).

Например, человеческие эмбриональные стволовые клетки могут быть дифференцированы в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, в соответствии со способами, описанными в публикации McLean et al, Stem Cells 25, 29-38 (2007).

Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы

В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предлагается способ дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, включающий следующие этапы:

а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом; и

b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом.

Далее клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, подвергаются обработке в соответствии со способами, составляющими предмет настоящего изобретения, для формирования клеток, экспрессирующих маркеры плюрипотентности и маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы.

Культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом может осуществляться в одной культуральной среде. В качестве альтернативы культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом может осуществляться в нескольких культуральных средах. В одном варианте осуществления культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом осуществляется в двух культуральных средах.

Экстраклеточный матрикс: в одном аспекте настоящего изобретения, человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются и дифференцируются на субстрате тканевой культуры, покрытом экстраклеточным матриксом. Экстраклеточный матрикс может представлять собой солюбилизированный препарат базальной мембраны, полученный экстракцией из клеток саркомы мыши (продается компанией BD Biosciences под торговым наименованием MATRIGEL). В качестве альтернативы экстраклеточный матрикс может представлять собой MATRIGEL с пониженным содержанием ростовых факторов. В качестве альтернативы экстраклеточный матрикс может представлять собой фибронектин. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются и дифференцируются на субстрате тканевой культуры, покрытом человеческой сывороткой.

Экстраклеточный матрикс может быть растворен перед покрытием им субстрата тканевой культуры. Примеры подходящих способов растворения экстраклеточного матрикса и покрытия им субстрата тканевой культуры можно найти в публикациях Kleinman, H.K., et al., Biochemistry 25:312 (1986), и Hadley, M.A., et al., J.Cell.Biol. 101:1511 (1985).

В одном варианте осуществления экстраклеточный матрикс представляет собой MATRIGEL. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:10. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:15. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:30. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL в разведении 1:60.

В одном варианте осуществления экстраклеточный матрикс может представлять собой MATRIGEL с пониженным содержанием ростовых факторов. В одном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:10. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:15. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:30. В альтернативном варианте осуществления субстрат тканевой культуры покрывается раствором MATRIGEL с пониженным содержанием фактора роста в разведении 1:60.

Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, на экстраклеточном матриксе с использованием одной культуральной среды: в одном варианте осуществления настоящего изобретения предлагается способ дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток, экспрессирующих маркеры характерные для линии сформированной эндодермы, включающий следующие этапы:

а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом; и

b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом.

Для обеспечения дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму культуральная среда должна содержать достаточно низкие концентрации определенных факторов, например, инсулина и IGF (как описано в публикации WO2006020919). Этого можно добиться путем понижения концентрации сыворотки или, в качестве альтернативы, при помощи среды с заданным химическим составом, в котором отсутствуют инсулин и IGF. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wiles et al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1): 241-8.).

Среда для культивирования может содержать сыворотку в концентрации от приблизительно 0% до приблизительно 10%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять от приблизительно 0% до приблизительно 5%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять от приблизительно 0% до приблизительно 2%. В альтернативном варианте осуществления концентрация сыворотки может составлять приблизительно 2%.

Время культивации с активином-A и Wnt-лигандом может составлять от приблизительно 1 дня до приблизительно 7 дней. В альтернативном варианте осуществления время культивации может составлять от приблизительно 1 дня до приблизительно 3 дней. В альтернативном варианте осуществления время культивации может составлять приблизительно 3 дня.

Активин-A может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.

Для увеличения эффективности процесса дифференцировки можно подобрать оптимальный Wnt-лиганд. Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.

Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.

Данная одна культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном варианте осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.

При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.

Данная одна культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.

По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-АА, и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, -11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-А, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин 1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.

По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).

Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, на экстраклеточном матриксе с использованием двух культуральных сред: дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток в клетки, экспрессирующие маркеры характерные для линии сформированной эндодермы, может осуществляться путем культивирования человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом с применением двух культуральных сред. Следовательно, дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток может осуществляться следующим образом:

а. нанесение человеческих эмбриональных стволовых клеток на субстрат тканевой культуры, покрытый экстраклеточным матриксом;

b. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом в первой культуральной среде; и

c. культивирование человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А во второй культуральной среде.

Первая культуральная среда может содержать сыворотку в низкой концентрации, вторая культуральная среда может содержать сыворотку в более высокой концентрации, чем первая культуральная среда.

Вторая культуральная среда может содержать Wnt-лиганд.

Первая культуральная среда: для обеспечения дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму первая культуральная среда должна содержать достаточно низкие концентрации определенных факторов, например, инсулина и IGF (как описано в публикации WO2006020919). Этого можно добиться путем понижения концентрации сыворотки или, в качестве альтернативы, при помощи среды с заданным химическим составом, в котором отсутствуют инсулин и IGF. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wileset al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1):241-8.).

Первая культуральная среда может содержать более низкую концентрацию сыворотки, чем вторая культуральная среда. Повышение концентрации сыворотки во второй культуральной среде повышает выживание клеток или, с другой стороны, может усиливать пролиферацию клеток. Концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 10%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 2%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0% до приблизительно 1%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки в первой среде может составлять приблизительно 0,5%.

При культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток с активином-А и Wnt-лигандом с применением по меньшей мере двух культуральных сред, время культивации в первой культуральной среде может варьировать от приблизительно 1 дня до приблизительно 3 дней.

Активин-А может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.

Для увеличения эффективности процесса дифференцировки можно подобрать оптимальный Wnt-лиганд. Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.

Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.

Данная первая культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может быть добавлен в первую культуральную среду, во вторую культуральную среду или как в первую, так и во вторую культуральную среду.

Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном варианте осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.

При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.

Данная первая культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.

По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-AA и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, 11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-A, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин-1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.

По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).

Вторая культуральная среда: вторая культуральная среда должна содержать определенные факторы, такие как, например, инсулин и IGF (как описывается в публикации WO2006020919), в концентрации, достаточной, чтобы способствовать выживанию культивируемых клеток. Для этого можно повысить концентрацию сыворотки или, в качестве альтернативы, использовать среду с заданным химическим составом, где концентрации инсулина и IGF выше, чем в первой культуральной среде. Примеры среды с заданным химическим составом приводятся в публикации Wiles et al (Exp Cell Res. 1999 Feb 25; 247(1): 241-8.).

Во второй культуральной среде, где используются более высокие концентрации сыворотки, концентрация сыворотки может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 10%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 5%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может лежать в диапазоне от приблизительно 0,5% до приблизительно 2%. В качестве альтернативы концентрация сыворотки во второй культуральной среде может составлять приблизительно 2%. При культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток во второй культуральной среде, время культивации может варьироваться от приблизительно 1 дня до приблизительно 4 дней.

Аналогично первой культуральной среде, активин-A может использоваться в концентрации, подходящей для индукции дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток. Данная концентрация может лежать в диапазоне от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 мкг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 1 мкг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 1 пг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 50 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл. В другом альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять приблизительно 100 нг/мл.

Wnt-лиганд может присутствовать в концентрации от приблизительно 1 нг/мл до приблизительно 1000 нг/мл. В альтернативном варианте осуществления концентрация может составлять от приблизительно 10 нг/мл до приблизительно 100 нг/мл.

Wnt-лиганд может выбираться из группы, состоящей из Wnt-1, Wnt-3a, Wnt-5a и Wnt-7a. В одном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-1. В альтернативном варианте осуществления Wnt-лиганд представляет собой Wnt-3a.

Вторая культуральная среда может также содержать ингибитор GSK-3B. Ингибитор GSK-3B может быть добавлен в первую культуральную среду, во вторую культуральную среду или как в первую, так и во вторую культуральную среду.

Ингибитор GSK-3B может выбираться из группы, состоящей из GSK-3B-ингибитора IX и GSK-3B-ингибитора XI. В одном из вариантов осуществления ингибитор GSK-3B представляет собой GSK-3B-ингибитор IX.

При культивировании человеческих эмбриональных стволовых клеток с ингибитором GSK-3B концентрация ингибитора GSK-3B может составлять от приблизительно 1 нМ до приблизительно 1000 нМ. В альтернативном варианте осуществления человеческие эмбриональные стволовые клетки культивируются с ингибитором GSK-3B в концентрации от приблизительно 10 нМ до приблизительно 100 нМ.

Аналогично первой культуральной среде, вторая культуральная среда может также содержать по меньшей мере один дополнительный фактор, способный усилить формирование клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток. В качестве альтернативы по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить пролиферацию клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученные с помощью способов, составляющих предмет настоящего изобретения. Кроме того, по меньшей мере еще один дополнительный фактор может улучшить способность клеток, экспрессирующих маркеры, характерные для линии сформированной эндодермы, полученных с помощью способов, которые составляют предмет настоящего изобретения, образовывать другие типы клеток или повышать эффективность дополнительных этапов дифференцировки.

По меньшей мере еще одним дополнительным фактором могут быть, например, никотинамид, члены семейства TGF-β, включая TGF-β1, 2 и 3, сывороточный альбумин, члены семейства факторов роста фибробластов, тромбоцитарные факторы роста-AA, и -BB, плазма, богатая тромбоцитами, инсулиноподобный фактор роста (IGF-I, II), фактор роста и дифференцировки (GDF-5, -6, -8, -10, 11), глюкагон-подобный пептид-I и II (GLP-I и II), миметические антитела GLP-1 и GLP-2, экзендин-4, ретиноевая кислота, паратиреоидный гормон, инсулин, прогестерон, апротинин, гидрокортизон, этаноламин, бета-меркаптоэтанол, эпидермальный фактор роста (EGF), гастрин I и II, хелатирующие агенты на основе меди, например, триэтиленпентамин, форсколин, бутират натрия, активин, бетацеллюлин, ITS, noggin, фактор роста нейритов, nodal, вальпроевая кислота, трихостатин-A, натрия бутират, фактор роста гепатоцитов (HGF), сфингозин-1, VEGF, MG132 (EMD, CA), добавки N2 и B27 (Gibco, CA), стероидный алкалоид, например, циклопамин (EMD, CA), фактор роста кератиноцитов (KGF), белки семейства Dickkopf, экстракт бычьего гипофиза, белок, ассоциированный с неогенезом островков (INGAP), Indian Hedgehog, Sonic Hedgehog, ингибиторы протеасомальной активности, ингибиторы сигнального пути Notch, ингибиторы Sonic Hedgehog и их сочетания.

По меньшей мере один дополнительный фактор может поступать из кондиционированной среды, полученной от линий панкреатических клеток, таких как PANC-1 (ATCC No: CRL-1469), CAPAN-1 (ATCC No: HTB-79), BxPC-3 (ATCC No: CRL-1687), HPAF-II (ATCC No: CRL-1997), линий клеток печени, таких как, HepG2 (ATCC No: HTB-8065), линий клеток кишечника, таких как, FHs 74 (ATCC No: CCL-241).

Настоящее изобретение иллюстрируют, но не ограничивают, следующие примеры.

Пример 1

Культура человеческих эмбриональных стволовых клеток

Стволовые клетки представляют собой недифференцированные клетки, определяющиеся по их способности на уровне единичной клетки самообновляться и дифференцироваться с образованием клеток-потомков, таких как самообновляющиеся предшественники, необновляющиеся предшественники и окончательно дифференцированные клетки. Стволовые клетки также характеризуются способностью дифференцироваться in vitro в функциональные клетки различных линий, происходящих из нескольких зародышевых листков (эндодермы, мезодермы и эктодермы), а также после трансплантации давать начало тканям, происходящим от нескольких зародышевых листков, и вносить существенный вклад в формирование большинства, если не всех, тканей после инъекции в бластоциты.

Линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H1, H7 и H9 были получены в WiCell Research Institute, Inc., (Madison, WI) и культивировались в соответствии с инструкциями, предоставленными указанным выше институтом. Вкратце, клетки культивировались на питающих клетках, представляющих собой мышиные эмбриональные фибробласты (МЭФ) в среде для эмбриональных стволовых клеток, содержащей DMEM/F12 (Invitrogen/GIBCO), с добавкой 20% заменителя сыворотки Knockout, 100 нМ раствора заменимых аминокислот MEM, 0,5 мМ бета-меркаптоэтанола, 2 мМ L-глутамина с 4 нг/мл человеческого основного фактора роста фибробластов (bFGF) (все производства Invitrogen/GIBCO). МЭФ-клетки из мышиных эмбрионов E13 -13.5, были приобретены в Charles River. МЭФ-клетки выращивались в среде DMEM с добавлением 10% эмбриональной телячьей сыворотки (ЭТС) (Hyclone), 2 мМ глутамина и 100 мМ заменимых аминокислот MEM. Субконфлюэнтные культуры МЭФ-клеток были обработаны раствором 10 мкг/мл митомицина C (Sigma, St. Louis, MO) в течение 3 ч для остановки деления клеток, затем обработаны трипсином и рассеяны по 2×104/см2 на чашки Петри, покрытые 0,1% бычьим желатином. В качестве слоя питающих клеток использовались МЭФ-клетки пассажей со второго по четвертый. Человеческие эмбриональные стволовые клетки, нанесенные на слой питающих МЭФ-клеток, культивировались при 37°C в атмосфере, содержащей 5% CO2 в инкубаторе с увлажнением для тканевых культур. По достижении конфлюэнтного роста (приблизительно через 5-7 дней после нанесения), человеческие эмбриональные стволовые клетки обрабатывались раствором коллагенозы типа IV с концентрацией 1 мг/мл (Invitrogen/GIBCO) в течение 5-10 мин, а затем мягко счищались с поверхности при помощи пипетки на 5 мл. Клетки центрифугировались при 900 об/мин в течение 5 мин, осадок ресуспендировался и снова высевался с соотношением клеток от 1:3 до 1:4 в свежую культуральную среду.

Параллельно, человеческие эмбриональные стволовые клетки H1, H7 и H9 рассевались на планшеты, покрытые раствором MATRIGEL (BD Biosciences) со сниженным содержанием ростовых факторов в разведении 1:30, и культивировались в кондиционированной МЭФ-клетками среде с добавлением 8 нг/мл bFGF. Клетки, культивируемые на матриксе MATRIGEL, регулярно пересевались с использованием ферментов коллагеназы IV (Invitrogen/GIBCO), диспазы (BD Biosciences) или либеразы (LIBERASE). Некоторые культуры человеческих эмбриональных стволовых клеток инкубировались в условиях гипоксии (приблизительно, при 3% O2).

Пример 2

Сортировка клеток с активацией флуоресценции (FACS)

Прикрепленные человеческие эмбриональные стволовые клетки снимались с культуральных планшет при помощи пятиминутной инкубации с раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA). Освобожденные клетки ресуспендировались в среде для культивации человеческих эмбриональных стволовых клеток и извлекались путем центрифугирования с последующей отмывкой и ресуспендированием в окрашивающем буфере, состоящем из 2% бычьего сывороточного альбумина BSA, 0,05% азида натрия в фосфатно-солевом буфере (PBS) (Sigma, MO). В зависимости от ситуации, на клетках в течение 15 минут блокировался Fc-рецептор путем инкубации с 0,1% раствором γ−глобулина (Sigma). Аликвоты (приблизительно по 1×105 клеток) инкубировались с моноклональными антителами, конъюгированными либо с фикоэритрином (PE), либо с аллофикоцианином (APC) (5 мкл антител на 1×106 клеток), как показано в Таблице IA, или с неконъюгированными первичными антителами. Контроль составляли антитела соответствующего изотипа, неокрашенные клетки и клетки, окрашенные только вторичными конъюгированными антителами. Инкубация с любыми антителами проводилась в течение 30 мин при 4°C, после чего клетки отмывались окрашивающим буфером. Образцы, которые были окрашены неконъюгированными первичными антителами, инкубировались в течение еще 30 мин при 4°C с вторичными конъюгированными антителами, меченными PE или APC. В Таблице IB приводится список используемых вторичных антител. Отмытые клетки были осаждены центрифугированием и ресуспендированы в окрашивающем буфере, после чего проведена идентификация молекул клеточной поверхности с помощью прибора для анализа FACS (BD Biosciences), при регистрации не менее 10000 событий.

Пример 3

Иммуноцитохимия

Прикрепленные клетки были зафиксированы 4% параформальдегидом в течение 20 мин при комнатной температуре. Зафиксированные клетки блокировались в течение 1 часа при комнатной температуре с помощью раствора PBS/0,1%BSA/10% нормальная сыворотка цыпленка/0,5% Triton X-100, а затем инкубировались в течение ночи с первичными антителами в растворе PBS/0,1%BSA/10% нормальная сыворотка цыпленка при 4°C. Список первичных антител и рабочие разведения приведены в Таблице IA. После трехкратной отмывки раствором PBS/0,1% BSA, клетки инкубировались с раствором флуоресцентных вторичных антител (Таблица IB) в разведении 1:100 в PBS в течение одного часа при комнатной температуре для осуществления связывания. Контрольные образцы включали реакции, где не использовались первичные антитела, или где первичные антитела заменялись соответствующими иммуноглобулинами отрицательного контроля в той же концентрации, что и первичные антитела. Окрашенные образцы промывались; к каждому образцу добавлялась капля реагента PROLONG® (Invitrogen, CA), содержащего диамидино-2-фенилиндола дигидрохлорид (DAPI), для контрастного окрашивания ядра, а также в качестве реагента, препятствующего обесцвечиванию. Изображения были получены с помощью инвертного микроскопа Nikon Confocal Eclipse C-1 (Nikon, Япония) с объективом 10-60X.

Пример 4

ПЦР-анализ клеток, полученных из эмбриональных стволовых клеток

Очистка и экстрагирование РНК и синтез кДНК: Образцы РНК очищали путем связывания с силикагелевой мембраной (Rneasy Mini Kit, Qiagen, CA) в присутствии этанолсодержащего высокосолевого буферного раствора, а затем промывали для удаления примесей. Дальнейшую очистку РНК проводили с помощью комплекта TURBO DNA-free kit (Ambion, INC), после чего высококачественная РНК разводилась водой. Выход и чистоту оценивали по показаниям A260 и A280 на спектрофотометре. Копии кДНК получали с очищенной РНК с помощью высокопроизводительного комплекта для создания архивов кДНК от ABI (ABI, CA).

Амплификация и количественный анализ с помощью ПЦР в реальном времени: если не указано иное, все реагенты приобретены в компании Applied Biosystems. Реакции ПЦР в режиме реального времени проводили с использованием системы для определения последовательности ABI PRISM® 7900 Sequence Detection System. Использовался мастер-микс TAQMAN® UNIVERSAL PCR MASTER MIX® (ABI, CA) с 20 нг обратно транскрибированной РНК в общем объеме реакционной смеси 20 мкл. Все исследования образцов кДНК дублировали для внесения поправки на погрешности дозирования пипеткой. Праймеры и зонды TAQMAN®, помеченные красителем FAM, использовали в концентрациях 200 нМ. Уровень экспрессии для каждого целевого гена нормализовали по эндогенному контролю человеческой глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (ГАФДГ), ранее разработанному компанией Applied Biosystems. Наборы праймеров и зондов перечислены в Таблице II. Праймеры SOX-17 были разработаны с помощью программы PRIMERS (ABI, CA) и имели следующие последовательности: SOX-17: TGGCGCAGCAGATACCA, AGCGCCTTCCACGACTTG и CCAGCATCTTGCTCAACTCGGCG. После первоначальной инкубации при 50°C в течение 2 мин с последующей инкубацией при 95°C в течение 10 мин, образцы 40 раз были подвергнуты двустадийному циклу - этап денатурации при 95°C в течение 15 сек с последующим этапом отжига/элонгации при 60°C в течение 1 мин. Анализ данных проводился с помощью программного обеспечения GENEAMP®7000 Sequence Detection System. Для каждого комплекта праймеров и зондов значение порогового цикла (Ct) определялось как номер цикла, при котором интенсивность флуоресценции достигала определенного значения в середине экспоненциальной области амплификации. Уровни относительной экспрессии генов вычисляли способом сравнения Ct. Вкратце, для каждого образца кДНК значение Ct эндогенного контроля вычитали из значения Ct целевого гена и получали величину дельта Ct (ΔCt). Нормализованное количество целевого гена рассчитывали как 2-ΔCt, предполагая, что амплификация имеет 100% эффективность. Окончательные данные были выражены относительно калибровочного образца.

Пример 5

Дифференцировка человеческих эмбриональных стволовых клеток, культивированных на субстрате тканевой культуры, покрытом реактивом MATRIGEL , в сформированную эндодерму (СЭ)

Клетки линии человеческих эмбриональных стволовых клеток H9, пассаж 54, культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) и наносились на чашки, покрытые реактивом MATRIGEL (раствор 1:30) и подвергались воздействию среды DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 20 нг/мл WNT-3a (№ по каталогу 1324-WN-002, R&D Systems, MN) и 100 нг/мл активина-A (R&D Systems, MN), в течение двух дней, с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение еще трех-четырех дней. На Фиг. 1 показана экспрессия CXCR4 по результатам FACS в день 4. На Фиг. 2 показаны данные ПЦР в реальном времени для культур человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, обработанных средой с низким содержанием сыворотки + AA + WNT3A в дни 4 и 6. Данный протокол приводил к значительному повышению экспрессии маркеров сформированной эндодермы. Далее данная процедура будет именоваться протоколом сформированной эндодермы (DE-протокол).

Пример 6

Выделение и выращивание клеток, полученных из человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы

Клетки из линий человеческих эмбриональных стволовых клеток H1 и H9, различные пассажи (пассажи 30-54) культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL в соответствии с Примером 1. К клеткам применялся DE-протокол, описанный в Примере 5. В дни 3-6 культуры обрабатывались раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки высевали с плотностью 1000-10000 клеток/см2 в обработанные полистиролом для культивирования тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Среду ежедневно меняли. В случае некоторых культур к среде также добавляли 10-50 нг/мл IGF-I (инсулин-подобный фактор роста-I, производитель R&D Systems, MN) или 1X ITS (инсулин, трансферрин и селен, производитель Invitrogen, Ca). В случае некоторых культур к базовой среде (DM-F12+2% ЭТС) также добавляли 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствор заменимых аминокислот (1X, NEAA, Invitrogen, CA). Клетки первого пассажа обозначались Р1. Помимо этого, аналогичные культуры выращивали в условиях с нормальным содержанием кислорода (приблизительно 21% O2). Схема процедуры выделения показана на Фиг. 3.

Через 5-15 дней культивации, четко оформленные колонии клеток оказывались окружены большим количеством укрупненных клеток, имеющими облик старых (Фиг. 4a-b). При конфлюэнтности 50-60% производился пересев культур с добавлением раствора TrypLE™ Express в течение 5 мин при комнатной температуре. Освобожденные клетки ресуспендировались в среде DMEM-F12+2% ЭТС, извлекались центрифугированием и сеялись с плотностью 10000 клеток/см2 на флаконы, обработанные полистиролом для культивирования тканей (TCPS) в среде DMEM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-А+20 нг/мл WNT-3A +/- 50 нг/мл IGF-I. Данная среда далее будет именоваться “средой для выращивания”. На Фиг. 4 c показана морфология клеток пассажа 3, посеянных с плотностью 10000 клеток/см2. В пассаже 3 (панель c) после исходного выделения морфология клеток была однородной, напоминающей эпителий, с большим отношением ядро/цитоплазма.

В случае некоторых культур в среду для выращивания добавлялся раствор 1X NEAA, плюс 0,1 мМ меркаптоэтанола. После трех-четырех пассажей прикрепленные клетки имели однородную морфологию с большим отношением ядро/цитоплазма. В параллельных культурах, ведущихся в условиях нормального содержания кислорода, не удалось добиться формирования прикрепленными клетками здоровых колоний. После 2-3 пассажей от культур, ведущихся в условиях нормального содержания кислорода, отказались из-за низкой скорости их роста.

Пример 7

Влияние активина-А, WNT-3A и IGF-I на рост и сохранение маркеров сформированной эндодермы после нескольких пассажей

Культуры, полученные из родительских человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9 в соответствии со способами, описанными в Примере 6, пересевались каждые 4-7 дней. На Фиг. 5 показаны данные ПЦР в реальном времени для выращенных клеток, культивировавшихся в среде 2% ЭТС + DMEM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A в течение трех пассажей. Эти данные соответствуют линии, выделенной на 6 день применения DE-протокола, описанного в Примере 5. После каждого пассажа наблюдается отчетливое уменьшение экспрессии маркеров сформированной эндодермы, таких как SOX-17 и HNF-3 beta. Как показано на Фиг. 6, добавление WNT-3A в питательную среду, содержащую активин-А, приводило к значительному росту экспрессии маркеров сформированной эндодермы. Однако добавление 50 нг/мл IGF-I и отмена активина-А и WNT-3A (Фиг. 7 a-c) вызывали резкое падение экспрессии маркеров сформированной эндодермы и OCT-4, а также к увеличению экспрессии маркеров висцеральной эндодермы, таких как SOX-7 и AFP. На Фиг. 8 a-c показана морфология выращенных клеток, полученных из клеток H9p54, для пассажа 5 культивации в средах a) 2% ЭТС + DMF12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A, b) 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-A, c) 2% ЭТС + DM-F12 + 50 нг/мл IGF-I. Морфологии клеток, культивированных в присутствии активина-А или активина-А + WNT-3A, были очень сходными и резко отличались от морфологии клеток, культивированных в 2% ЭТС + IGF-I.

Пример 8

Потенциал роста клеток, полученных из человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы

Культуры, полученные из родительских человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9 в соответствии со способами, описанными в Примере 6, пересевались каждые 4-5 дней, если питательная среда содержала 50 нг/мл IGF-I или ITS. Однако культуры, выращиваемые в среде, где отсутствовали добавки IGF или ITS, имели более низкую скорость роста и пересевались каждые 5-7 дней. Время удвоения популяций клеток, культивируемых на питательной среде + 50 нг/мл IGF-I, составляло приблизительно 55 часов, тогда как время удвоения популяций клеток, культивируемых на питательной среде без добавок, составляло приблизительно 75 часов. Популяция клеток, выращенная в соответствии с Примером 6, далее будет именоваться клетками EXPRES (EXpandable PRE-primitive Streak cells - размножающиеся клетки пред-первичной полоски). В Таблице III перечислены различные клетки EXPRES, полученные в соответствии со способами, описанными в Примере 6. Потенциал роста двух клеточных линий (EXPRES 01 и 02) показан на Фиг. 9.

Пример 9

Получение клеток EXPRES из суспензий одиночных человеческих эмбриональных стволовых клеток

Клетки из линий человеческих эмбриональных стволовых клеток H1 P33 и H9 P45 культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL, в соответствии с Примером 1. При достижении приблизительно 60% конфлюентности, на культуры воздействовали раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DMEM-F12+2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки сеялись с плотностью от 1000 до 10000 клеток/см2 на обработанные полистиролом для культивации тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствора заменимых аминокислот (1X, NEAA, производитель Invitrogen, CA) в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Смена среды проводилась ежедневно. Клетки первого пассажа обозначаются P1. Помимо этого, аналогичные культуры выращивали в условиях с нормальным содержанием кислорода (приблизительно 21% O2). Культуры, полученные в атмосферной среде, не формировали колонии и демонстрировали плохую пролиферацию. Напротив, культуры, полученные в условиях гипоксии, формировали множество колоний (Фиг. 10), напоминающих колонии эмбриональных стволовых клеток, культивируемых на MATRIGEL или питающих МЭФ-клетках. Характеристики этих культур были очень похожи на характеристики клеток EXPRES, выделенных в ходе дифференцировки эмбриональных стволовых клеток в сформированную эндодерму.

Пример 10

Экспрессия белков клеточной поверхности в клетках EXPRES

Клеточные линии EXPRES 01 и EXPRES 02 оценивались на предмет экспрессии различных маркеров клеточной поверхности, включая маркеры, связанные с плюрипотентностью. Клетки линии EXPRES 01 анализировались в пассажах 9-24. Клетки линии EXPRES 02 анализировались в пассажах 7-20. Обе линии продемонстрировали сильную экспрессию маркеров плюрипотентности, обычно характерную для недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток. Однако линия EXPRES 02 показала более высокую процентную долю экспрессии маркеров дифференцировки, таких как CXCR4, LIF-рецептор и NCAM, чем линия EXPRES 01. Характерные диаграммы FACS представлены для линии EXPRES 01 P24 на Фиг. 11, а для линии EXPRES 02 P21 - на Фиг. 12. В Таблице IV приведены усредненные по трем разным экспериментам уровни экспрессии анализируемых маркеров клеточной поверхности с диапазонами (в квадратных скобках).

Пример 11

Экспрессия маркеров, ассоциирующихся с плюрипотентностью, измеренная путем иммунофлюоресцентного (ИФ) окрашивания клеток EXPRES

Клетки EXPRES 01 и 02, культивированные в питательной среде, окрашивались для выявления маркеров плюрипотентности с использованием способов, описанных в Примере 3. На Фиг. 13 показаны ИФ-изображения, окрашенные на OCT-4, Nanog, SOX-2 и HNF-3 beta, для клеток EXPRES 01 P10, культивированных в среде 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I. На Фиг. 14 показаны ИФ-изображения, окрашенные на OCT-4, Nanog, SOX-2 и HNF-3 beta, для клеток EXPRES 02, пассаж 9, культивированных в среде 2% ЭТС + DM-F12 + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A. EXPRES 01 демонстрировали сильную положительную окрашиваемость на OCT-4, Nanog и SOX-2, и слабую - на HNF-3 beta. Напротив, клетки EXPRES 02 демонстрировали более сильную положительную окрашиваемость на HNF-3 beta и более слабую - на OCT-4, NANOG и SOX-2.

Пример 12

Экспрессия маркеров сформированной эндодермы и маркеров недифференцированных эмбриональных стволовых клеток по данным ПЦР в реальном времени

На Фиг. 15 a-h показан анализ способом ПЦР в реальном времени экспрессии эмбриональных маркеров (POU5F1, SOX-2, UTF1, ZFP42, Connexin43, Connexin45, FOXD3), внеэмбриональных маркеров (AFP, KRT15), эктодермальных маркеров (SOX-1, TUBB3, NESTIN), эндодермальных маркеров (FOXA2, IPF1, KRT15, GATA-4) и мезодермальных маркеров (GATA-4, GATA-2, MYOD, MSX1, CFC1, ABCG2) в клетках линий EXPRES 01, пассаж 11, и EXPRES 02, пассаж 7, культивируемых в соответствующих питательных средах. Все данные нормализованы к кратности изменения относительно недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, культивированных в среде MEF-CM на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL. В качестве контроля из клеток H9 были сформированы эмбриоидные тельца с применением стандартных способов с обработкой коллагеназой и рассеванием на необработанные поверхности в среду DMEM-F12+20% ЭТС приблизительно на 10 дней. В эмбриоидных тельцах увеличивается экспрессия генов различных зародышевых листков в сравнении с недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками. Другая эталонная РНК была получена из недифференцированной линии SA002 (Cellartis, Швеция), культивированной на матриксе MATRIGEL в среде MEF-CM. Как и прогнозировалось, в эмбриоидных тельцах сильно увеличивалась экспрессия генов различных зародышевых листков в сравнении с клеточными линиями EXPRES 01, EXPRES 02, SA002, и H9. Как в линии EXPRES 01, так и в линии EXPRES 02 наблюдалась экспрессия FOXA2, в отличие от линий SA002 и H9. Ни в одной из линий EXPRES не наблюдалось сильной экспрессии внеэмбриональных, мезодермальных или эктодермальных маркеров. Более того, экспрессия эмбриональных маркеров в клетках EXPRES была сходной с эталонными клеточными линиями SA002 и H9.

Пример 13

Различные культивационные среды, подходящие для выращивания клеток EXPRES

Клетки EXPRES успешно культивировались в средах указанных ниже составов в течение по меньшей мере 2-30 пассажей:

1. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A

2. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I

3. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I

4. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I

5. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 10 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I

6. DM-F12 + 2% ЭТС + 50 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I

7. DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 10 нг/мл WNT-3A + 10 нг/мл IGF-I

8. Среда заданного состава HEScGRO (Chemicon, CA)

Основной компонент упомянутой выше среды может быть заменен сходной средой, например, RPMI, DMEM, CRML, Knockout ™DMEM и F12.

Пример 14

Дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки сформированной эндодермы

Клетки EXPRES 01, пассаж 5, и клетки EXPRES 02, пассаж 4, культивируемые на TCPS в соответствующей среде, подвергались воздействию среды DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 20 нг/мл WNT-3a и 100 нг/мл активина-А (R&D Systems, MN) в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) еще в течение 3-5 дней. На Фиг. 16 показана экспрессия CXCR4 по данным FACS, на день 4, в клетках EXPRES 01 (Фиг. 16a приблизительно17% CXCR4-положительных) и EXPRES 02 (Фиг. 16b приблизительно 40% CXCR4-положительных). На Фиг. 17 показаны результаты анализа способом ПЦР в реальном времени для культур клеток EXPRES 01 (Фиг. 17a) и EXPRES 02 (Фиг. 17b) в среде с низким содержанием сыворотки + AA + WNT-3A в дни 2-5. На Фиг. 18 и 19 показаны иммунофлуоресцентные изображения клеток EXPRES 01 и 02, соответственно, подвергавшихся указанной выше обработке в течение 4 дней. В целом, в клетках EXPRES 02 наблюдалась более сильная экспрессия маркеров сформированной эндодермы, чем в клетках EXPRES 01. Как показывают данные, полученные способами FACS, иммунного окрашивания и ПЦР, снижение концентрации сыворотки и удаление IGF увеличивает экспрессию маркеров сформированной эндодермы. Тем не менее, общий уровень экспрессии маркеров сформированной эндодермы, таких как CXCR4 и HNF-3 beta, был ниже, чем обычно наблюдались в культурах недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клеток, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы.

С целью увеличения экспрессии маркеров сформированной эндодермы, в протокол дифференцировки DE были внесены следующие изменения: на клетки EXPRES 01, пассаж 19, и EXPRES 02, пассаж 14, культивированных на TCPS в соответствующих средах, воздействовали средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 20 нг/мл WNT-3a, 100 нг/мл активина-А и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 4-5 дней. На Фиг. 20 показана экспрессия CXCR4 по данным FACS, на день 4, в клетках EXPRES 01 (Фиг. 20a, приблизительно 57% CXCR4-положительных) и EXPRES 02 (Фиг. 20b, приблизительно 86% CXCR4-положительных). На Фиг. 21 показаны соответствующие иммунофлуоресцентные изображения на день 5 для клеток EXPRES 01 (панели a-f) и EXPRES 02 (панели g-l), дифференцированных в стадию сформированной эндодермы. На Фиг. 22 показаны данные ПЦР в реальном времени для клеток EXPRES 01 (Фиг. 22a) и EXPRES 02 (Фиг. 22b).

Пример 15

Влияние плотности посева на дифференцировку клеток EXPRES 01 в сформированную эндодерму

Клетки EXPRES 01 P31 сеялись с плотностью 5000, 10000, 20000 или 40000 клеток/см2 на планшеты TCPS в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 0,1 мМ меркаптоэтанола + 1X, NEAA + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A в условиях гипоксии (приблизительно 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Через два дня после посева среду меняли на DMEM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл активина-А + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX в течение четырех дней в условиях гипоксии (приблизительно 3% O2) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. На Фиг. 23 показаны результаты анализа маркеров сформированной эндодермы способом ПЦР в реальном времени на 4 день дифференцировки. Выяснилось, что для правильного формирования сформированной эндодермы требуется плотность посева по меньшей мере 10000-20000 клеток/см2.

Пример 16

Длина теломеров в клетках EXPRES

Длина теломеров в двух линиях EXPRES, выделенных, как описано в Примере 5, а также в недифференцированных человеческих эмбриональных стволовых клетках линии H1 анализировалась с помощью теста Telo TAGGG Telomere Length Assay (Roche, IN) в соответствии с инструкциями изготовителя. На Фиг. 24 показана длина теломера в клетках EXPRES 01, пассаж P24, в клетках EXPRES 02, пассаж 17, в клетках H1, пассаж 40, контроли с большой и малой длиной теломеров и масштабный маркер входили в состав комплекта. Выявлено, что обе линии имели более короткий теломер, чем недифференцированные эмбриональные стволовые клетки.

Пример 17

Дальнейшая дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки панкреатической эндодермы

Клетки EXPRES 01, пассаж 21, на 5 день дифференцировки подвергались обработке средой 0,5% ЭТС, DMEM:F12 с добавлением 100 нг/мл активина-А, 10 нг/мл Wnt-3a и 100 нМ GSK3 beta-ингибитора IX. Клетки были проанализированы способом FACS, и было показано, что 80% клеток были CXCR4-положительными. Затем клетки проходили описанные далее этапы обработки, каждый этап занимал 3 дня: 2% ЭТС DMEM:F12 с добавлением 50 нг/мл FGF-10 и 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine (Calbiochem, CA); затем 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы, с добавлением 50 нг/мл FGF-10, 0,25М KAAD-Cyclopamine и 1 мкМ ретиноевой кислоты (Sigma, MO); затем 1% B27 DMEM с низким содержанием глюкозы, с добавлением 1 мкМ DAPT (Calbiochem, CA) плюс 50 нг/мл Exendin4 (Sigma, MO); и, наконец, 1% B27 DMEM CMRL с добавлением по 50 нг/мл IGF, HGF и Exendin4. Образцы отбирались в конце каждого этапа, и из клеток экстрагировалась РНК. Для указанных маркеров проводился анализ способом количественной ПЦР в реальном времени. Как показано на Фиг. 25, уровни экспрессии инсулина были в 100 раз больше, чем в необработанных клетках, а уровни PDX-1 также были выше в 1000 раз.

Пример 18

Дальнейшая дифференцировка клеток EXPRES, культивируемых на субстрате тканевой культуры, в клетки эндодермы передней кишки

Клетки EXPRES 01, пассаж 35, на 5 день дифференцировки подвергались обработке средой 0,5% ЭТС, DMEM:F12 с добавлением 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл Wnt-3a и 100 нМ GSK3 beta-ингибитора IX. Клетки были проанализированы способом FACS, и было показано, что приблизительно 70% клеток были CXCR4-положительными. Затем клетки проходили описанные далее этапы обработки: 2% ЭТС DMEM:F12 с добавлением 50 нг/мл FGF-10 и 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine (Calbiochem, CA) в течение 3 дней; Этап 3, 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы с добавлением 50 нг/мл FGF-10, 0,25 мкМ KAAD-Cyclopamine и 1 мкМ ретиноевой кислоты (Sigma, MO) в течение 4 дней; и Этап 4, 1% B27 DMEM, с низким содержанием глюкозы с добавлением 1 мкМ DAPT (Calbiochem, CA), плюс 50 нг/мл Exendin4 (Sigma, MO) в течение 4 дней. Данный протокол основывается на ранее вышедшей публикации D'Amour et al (Nature Biotech, 24, 1392, 2006). В конце этапа 4 клетки фиксировались и окрашивались на PDX-1, HNF-3 beta, SOX-17, альбумин, анти-трипсин и CDX-2. Как показано на Фиг. 26, клетки EXPRES легко могут быть дифференцированы в эндодерму передней кишки, что оценивается по экспрессии PDX-1 (приблизительно 20% положительных клеток в культуре), HNF-3 beta (приблизительно 90% положительных), альбумина (приблизительно 5% положительных), анти-1-трипсина (приблизительно 70% положительных), SOX-17 (приблизительно 70%) и CDX-2 (приблизительно 5% положительных).

Пример 19

Сравнение клеток EXPRES с недифференцированными человеческими эмбриональными стволовыми клетками с помощью генных чипов

Общая РНК была выделена из культуры человеческих эмбриональных стволовых клеток линии H9, пассаж 44, из клеток EXPRES 01 P11 и из клеток EXPRES 02 P7 с помощью набора RNeasy mini kit (Qiagen): каждая группа имела три биологических повтора и для каждого биологического повтора были выполнены повторы на двух отдельных генных чипах. Приготовление образцов, гибридизация и анализ изображений проводили в соответствии с инструкциями к набору Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array. После нормализации и логарифмического преобразования анализ данных проводили с использованием программного обеспечения OmniViz® (MA) и GENESIFTER (VizXLabs, WA). Достоверное отклонение в экспрессии генов между образцами оценивали с помощью дисперсионного анализа и F-критерия с выровненным значением P (поправка Бенджамини и Хохберга), менее или равном 0,05. Анализу подвергались только те гены, для которых отклик имел состояние “Присутствует” (Present). В Таблице V приводятся средние нормализованные, преобразованные в логарифмическую форму значения интенсивности сигналов генов, для которых наблюдалось по меньшей мере 5-кратное различие между группами (недифференцированные эмбриональные стволовые клетки, EXPRES 01 и EXPRES 02), а также скорректированное значение P для каждого гена. Гены, соответствующие первичной полоске или сформированной эндодерме, выделены жирным шрифтом. В Таблице V показаны только 200 генов с наиболее сильно повышенной или пониженной экспрессией.

Пример 20

Сравнение с помощью генных чипов клеток EXPRES, дифференцированных в стадию сформированной эндодермы, с человеческими эмбриональными стволовыми клетками, дифференцированными в стадию сформированной эндодермы

Общая РНК выделялась из описанных ниже культур с помощью комплекта RNeasy mini kit (Qiagen): A) клетки H9 P33, культивированные на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL (разведение 1:30) и обработанных средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 100 нг/мл активина-А и 20 нг/мл wnt-3A в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение еще трех дней; B) клетки EXPRES 01 P24, культивированные на TCPS и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл WNT-3A и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 5 дней C) клетки EXPRES02 P17, культивированные на TCPS и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл WNT-3A и 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (№ по каталогу 361550, Calbiochem, CA) в течение 5 дней, D) клетки H9P39, культивированные на планшетах, покрытых реактивом MATRIGEL (разведение 1:30), и обработанные средой DMEM/F12 с добавлением 0,5% ЭТС и 100 нг/мл активина-А и 20 нг/мл wnt-3A в течение двух дней с последующей обработкой средой DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС и 100 нг/мл активина-А (AA) в течение двух дополнительных дней. Образцы РНК отбирались из группы D на сроках 2 ч, 6 ч, 24 ч, 30 ч, 48 ч, 72 ч и 96 ч. Также в качестве контролей брались клетки EXPRES 01 и 02, культивированные в соответствующей питательной среде. Для каждой группы использовались три биологические повторности, и каждая биологическая повторность была повторена на двух отдельных генных чипах.

Приготовление образцов, гибридизация и анализ изображений проводили в соответствии с инструкциями к набору Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array. После нормализации и логарифмического преобразования анализ данных проводили с использованием программного обеспечения OmniViz® (MA) и GENESIFTER (VizXLabs, WA). Достоверное отклонение в экспрессии генов между образцами оценивали с помощью дисперсионного анализа и F-критерия с выровненным значением P (поправка Бенджамини и Хохберга), меньше или равном 0,05. Анализу подвергались только те гены, для которых отклик имел состояние “Присутствует” (Present). В Таблице VI приводятся средняя нормализованная, преобразованная в логарифмическую форму интенсивность сигналов генов, для которых наблюдалось по меньшей мере 5-кратное различие между группами A, B, C и D в разные сроки, а также скорректированное значение P для каждого гена. В Таблице VI показаны только 200 генов с наиболее сильно повышенной или пониженной экспрессией. Гены, соответствующие первичной полоске или сформированной эндодерме, выделены жирным шрифтом. В Таблице VII указаны коэффициенты корреляции для всех сравниваемых групп. Диаграммы рассеяния, соответствующие коэффициентам корреляции, показаны на Фиг. 27. Выявлено, что глобальный профиль экспрессии в клетках EXPRES 01 сходен с профилем экспрессии образцов, находящихся на 30-м и менее часе стадии сформированной эндодермы, а глобальный профиль экспрессии в клетках EXPRES 02 сходен с профилем экспрессии образцов, находящихся на 48-м и более часе стадии сформированной эндодермы.

Пример 21

Формирование эмбриоидных телец и дифференцировка в различные линии

Культуры клеток EXPRES 01, пассаж 27, были извлечены в форме одиночных клеток с применением раствора TrypLE™ Express, отцентрифугированы при 200 г в течение 4 мин и ресуспендированы в среде DMEM-F12 + 20% ЭТС. Клеточная суспензия была посеяна на чашки Петри с низкой адгезионной способностью. Через 3-4 дня после посева сформировались структуры, напоминающие эмбриоидные тельца (Фиг. 28). Обработка культур средой DMEM-F12 + 2% ЭТС + 1 мкМ ретиноевой кислоты вызвала экспрессию маркеров эктодермы, таких как NeuroD.

Пример 22

Образование тератом в почечных капсулах мышей NOD-SCID

Недифференцированные человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9, пассаж 42, клетки EXSPRES 01, пассаж 30, и клетки EXPRES 02, пассаж 22, были извлечены из культуры с помощью раствора TRYPLE, промыты базовой средой и суспендированы в базовой среде DMEM-F12. Приблизительно 1×106 недифференцированных клеток H9 P42, 1,5 миллиона клеток EXPRES 01 или EXPRES 02 были введены способом инъекции в почечную капсулу шестинедельных мышей NOD-SCID. Через пять недель после трансплантации животные были забиты, почки были извлечены и зафиксированы в формалине или помещены в лизирующий буфер с целью сбора РНК для последующего ПЦР-анализа. На Фиг. 29 показана экспрессия маркеров, характерных для мезодермы, эктодермы, эндодермы, внеэмбриональной висцеральной эндодермы и маркеров плюрипотентности в собранных образцах. Как и в линии H9, в клетках линий EXPRES наблюдалась сильная экспрессия всех зародышевых листков, а также внеэмбриональной эндодермы.

Пример 23

Анализ пролиферации и клеточного цикла в клетках EXPRES 03

Человеческие эмбриональные стволовые клетки имеют уникальное состояние клеточного цикла, легко отличимое от прочих соматических клеток, и характеризующееся высокой долей клеток, находящихся в S-фазе и более короткими или урезанными Gap-фазами (G1 и G2). Механизмы контроля клеточного цикла в чЭС клетках могут быть функционально связаны со способностью этих клеток к самообновлению и с их плюрипотентностью, и могут отличаться от механизмов контроля цикла в дифференцированных/коммитированных клетках. Данные эксперименты были разработаны для определения природы клеточного цикла в клетках EXPRES, которые, как было показано, экспрессируют многие маркеры, характерные для плюрипотентных чЭС клеток.

Способы: Клетки сеялись с плотностью 5000-10000 клеток/см2 во флаконы для культивирования тканей Cell Bind (Corning) и культивировались в течение 2-4 дней. Клетки EXPRES 03 культивировались в питательной среде, содержащей 2% ЭТС в DMEM/F12 с добавлением активина-A (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Для проведения сравнительного анализа пролиферации, IGF иногда не вводился в смесь ростовых факторов. Пролиферацию клеток анализировали с помощью набора APC BRDU Flow в соответствии с рекомендациями изготовителя (BD Biosciences, San Diego, CA). Вкратце, на клетки кратковременно воздействовали бромдезоксиуридином (BRDU) в течение 1-2 часов в конце периода культивации, после чего клетки извлекались с использованием раствора Tryple E Express и подсчитывались. Клетки фиксировали буфером BD Cytofix/Cytosperm, инкубировали в течение 30 мин, после чего инкубировали в буфере BD Cytoperm в течение 10 минут на льду. Далее клетки обрабатывали ДНКазой в течение 1 часа при 37°C, чтобы открыть включенный в них BRDU, после чего окрашивали антителами к BRDU, конъюгированными с APC. Для анализа клеточного цикла клетки окрашивались с помощью 7AAD и анализировались способом FACS.

Результаты: подобно чЭС-клеткам, клетки EXPRES 03 сохраняли высокую скорость пролиферации, что показывает высокая процентная доля клеток, находящихся в S-фазе, измеренная по способности включать BRDU в культуре. Встречаемость клеток, находящихся в S-фазе, как правило, превышала 45% (диапазон 40-60%), что сходно с чЭС-клетками (Фиг. 30a-c). Хотя количество клеток EXPRES 03, выращенных в присутствии IGF, через 3-4 дня в 2-3 раза превышало количество клеток, выращенных без добавления IGF, различия во встречаемости клеток, находящихся в S-фазе при воздействии на них BRDU в течение 1 часа или более были незначительными (Фиг. 30f). Данная высокая встречаемость клеток, находящихся в S-фазе, а также структура клеточного цикла отличаются от характеристик соматических клеток, которые здесь показаны на примере человеческих клеток амниотической жидкости (AFDX002) (Фиг. 30d). Более того, обработанные митомицином мышиные эмбриональные фибробласты (МЭФ, Фиг. 30e) не переходят в S-фазу, но наблюдается их очевидное накопление в фазе G2/M (64%), что может быть связано с неспособностью клеток, обработанных митомицином, разделить нити ДНК при митозе.

Пример 24

Сравнение эффективности трансфекции в эмбриональных стволовых клетках и в клетках EXPRES

Крупным препятствием в генетических манипуляциях с чЭС-клетками является их относительная устойчивость к традиционным способам трансфекции и вирусной трансдукции. Клетки EXPRES, наряду с высокой скоростью пролиферации, легко трансфицируются in vitro. Для сравнения эффективности трансфекции, в клетки EXPRES и чЭС в культуре трансфицировали белок EGFP (усиленный зеленый флуоресцентный белок), после чего проводился анализ способами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии.

Способы: Клетки EXPRES 01 высевались на покрытые человеческим фибронектином (10 мкг/мл) 6-луночные культуральные планшеты в питательную среду, содержащую 2% ЭТС в DMEM/F12, активин-А (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). Если использовались клеточные кластеры, чЭС-клетки сеялись обычными способами, с использованием коллагеназы, на покрытые реактивом MATRIGEL 6-луночные культуральные планшеты и культивировались в кондиционированной с помощью МЭФ среде для чЭС-клеток. В случае одиночных клеток, при пересевании обрабатывали чЭС-клетки раствором TRYPLE в течение 3 минут при 37°C, с последующим нанесением на покрытые реактивом MATRIGEL 6-луночные культуральные планшеты. Когда клетки достигали требуемой конфлюентности (70-80%), их трансфицировали реактивом Lipofectamine 2000 в соответствии с рекомендациями изготовителя (Invitrogen, Carlsbad, CA). Вкратце, 4 мкг ДНК разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I с пониженным содержанием сыворотки. Пять микролитров реактива Lipofectamine 200 смешивали с общим объемом 250 мкл среды Opti-MEM I в течение 5 минут, и осторожно перемешивали с разведенной ДНК. Давали возможность сформироваться комплексам ДНК/Lipofectamine, выдерживая смесь при комнатной температуре в течение 20 минут, после чего добавляли ее в соответствующие лунки при осторожных круговых движениях планшеты для перемешивания. Клетки инкубировали с комплексами в течение еще 24 часов с последующей полной сменой среды. Анализ клеток способами флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии проводился через 48 часов после смешивания.

Результаты: Сравнивали захват и экспрессию eGFP при трансфекции клеток EXPRES 01 и чЭС-клеток, нанесенных в виде одиночных клеток или клеточных кластеров. Анализ проводился через 48 часов. В клетках EXPRES 01 наблюдался наиболее высокий уровень экспрессии белка eGFP. По данным проточной цитометрии, 75% клеток экспрессировали eGFP (Фиг. 31). С другой стороны, чЭС-клетки были более устойчивы к трансфекции, и при использовании кластеров, по данным FACS, только 3% клеток экспрессировали белок eGFP. При приготовлении суспензии одиночных чЭС-клеток, уровень захвата ДНК и экспрессии eGFP возрастал до около 20%, но и эта величина примерно втрое меньше экспрессии, наблюдавшейся в клетках EXPRES 01.

Пример 25

Клетки EXPRES как гибкий инструмент скрининга

Клетки EXPRES выращивались в среде DMEM:F12 с добавлением 2% ЭТС, 100 нг/мл рекомбинантного человеческого активина-А (R&D Systems) и 20 нг/мл рекомбинантного мышиного Wnt-3a (R&D Systems). Питательная среда для выращивания клеток EXPRES 01 также содержала 50 нг/мл рекомбинантного человеческого IGF-1 (R&D Systems). Обе клеточные линии, стандартно, выращивались при 37°C в атмосфере с пониженным содержанием кислорода (3%) и 5% CO2. Клетки EXPRES 01 и EXPRES 02 извлекались из культуры в виде суспензии одиночных клеток с помощью ферментного расщепления реактивом TrypLE (Invitrogen, CA), после чего отмывались и подсчитывались для определения точного количества клеток и их жизнеспособности (>95%). Аликвоты, содержащие от 1250 до 80000 клеток вводились в покрытые человеческим фибронектином лунки 96-луночного планшета (Corning-Costar) с итоговым объемом культуральной среды 100 мкл. Контрольные лунки были также покрыты фибронектином и содержали эквивалентный объем культуральной среды без клеток. Планшетам давали возможность достигнуть равновесия, инкубируя их в течение ночи в камере с увлажнением в стандартной атмосфере с пониженным содержанием кислорода и 5% CO2 при 37°C. За это время клетки прикреплялись и образовывали монослойные культуры с различными уровнями конфлюентности, зависящими от исходной плотности посева. После культивации в течение ночи, в каждую лунку добавляли 20 мкл реагента MTS (CellTiter 96 Aqueous Assay; Promega). Реактив MTS восстанавливался до формазана и мог использоваться в качестве меры активности фермента дегидрогеназы, прямо пропорциональной количеству живых клеток. Один планшет снова культивировали при пониженном содержании кислорода, а идентичный планшет параллельно инкубировали в атмосфере с нормальным содержанием кислорода (20%). Через 4 часа измерялось поглощение при длине волны 490 нм на спектрофотометрическом сканере для планшет (Molecular Devices). Производились вычисления статистических параметров, таких как средняя оптическая плотность (OD), стандартное отклонение и процентный коэффициент вариаций (CV), для повторяющихся наборов образцов в пределах каждой планшеты, после чего сравнивались соответствующие лунки между планшетами.

Значения стандартного отклонения и процентного коэффициента вариаций показывают, что клетки EXPRES распределены между лунками равномерно, обеспечивая высокую эффективность посева и хорошую воспроизводимость результатов в разных лунках (Таблица VIII a-f). Как видно по средним значениям OD490 для эквивалентных количеств клеток, линия EXPRES 01 имеет более высокую метаболическую активность, чем линия EXPRES 02. Значения процентного коэффициента вариаций между двумя планшетами для каждой из линий EXPRES свидетельствуют о том, что в данном краткосрочном анализе нет различий по метаболической активности при параллельной инкубации с разными уровнями кислорода в атмосфере. Путем графического определения среднего значения OD в пределах линейного диапазона данного анализа было выявлено оптимальное количество клеток в лунке (Фиг. 32): менее 20000 клеток в лунке для EXPRES 01 и менее 40000 клеток в лунке для EXPRES 02. И снова, различия в содержании кислорода в атмосфере не повлияли, в данном краткосрочном анализе, на результаты определения оптимального количества клеток. Эти результаты предполагают, что клетки EXPRES пригодны для использования в скрининговых протоколах, предназначенных для определения токсикологических эффектов различных реагентов на пролиферацию клеток и/или на скорость метаболизма.

Пример 26

Рост клеток, подобных сформированной эндодерме, полученных из клеток EXPRES

В предыдущих примерах было установлено, что клетки EXPRES могут быть получены из эмбриональных стволовых клеток и могут легко выращиваться на TCPS в различных культуральных средах. В состав многих этих сред входит IGF или инсулин/IGF и 2% ЭТС. Как было показано, эти факторы оказывают ингибирующее действие на гены, связанные со сформированной эндодермой, через сигнальный путь PI-3-киназы (Stem cells, 25:29-38, 2007). Была создана альтернативная среда на основе DM-F12 + 0,5% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A + 100 нМ GSK-3B-ингибитора IX (далее именуемая “питательной средой для клеток сформированной эндодермы”). Клетки EXPRES 01, пассаж 27, культивируемые в описанной выше среде, были способны размножаться с той же скоростью, что и клетки, культивируемые в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT3A + 50 нг/мл IGF-I. Более того, клетки, культивированные в питательной среде для клеток сформированной эндодермы, имели сильную экспрессию маркеров сформированной эндодермы по данным ПЦР в реальном времени (Фиг. 33) на протяжении трех пассажей. Приблизительно 72% клеток экспрессировали CXCR4 (Фиг. 34).

Пример 27

Нокдаун целевых генов в клетках EXPRES с помощью миРНК

Эффективность нокдауна целевых генов в человеческих эмбриональных стволовых клетках с помощью миРНК сильно ограничена возможностями обеспечения высокого уровня трансфекции в человеческих эмбриональных стволовых клетках, выращиваемых в виде кластерных колоний. Клетки EXPRES легко трансфицируются миРНК с использованием традиционных способов и, следовательно, являются полезной системой для скрининга олигонуклеотидных последовательностей миРНК, а также для анализа роли целевых генов.

Способы: Клетки EXPRES 03 высевались на покрытые человеческим фибронектином (10г/мл) 6-луночные культуральные планшеты в питательную среду, содержащую 2% ЭТС в DMEM/F12, активин-А (100 нг/мл), wnt-3a (10-20 нг/мл) и IGF (50 нг/мл). В случае 6-луночных планшет, 200000 клеток высевались за 24 часа до трансфекции олигонуклеотидными последовательностями миРНК.

Для анализа нокдауна целевых генов, клетки, достигшие конфлюентности 70-80%, трансфицировались с помощью реактива Lipofectamine 2000 в соответствии с инструкциями изготовителя (Ambion (Applied Biosystems), Foster City, CA). Вкратце, соответствующее количество миРНК разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I с пониженным содержанием сыворотки для получения итоговой концентрации 100 нмоль. Пять микролитров реактива Lipofectamine 2000 разводили в 250 мкл среды Opti-MEM I и инкубировали в течение 5 минут. Комплексы инкубировались в течение 15-20 минут при комнатной температуре, а затем добавлялись к клеткам при осторожных круговых движениях планшета с целью аккуратного перемешивания. Клетки инкубировали с миРНК в течение еще 24 часов с последующей полной сменой среды. Клетки визуализировали при помощи флуоресцентной микроскопии через 24-48 часов после трансфекции, и собирали РНК для анализа нокдауна целевых генов способами количественной ПЦР в реальном времени. Были протестированы следующие предварительно проверенные олигонуклеотидные последовательности миРНК, производитель Ambion: бета-катенин (Ид. № 42816) и GSK3b (Ид. № 42839).

Результаты: Флуоресцентная микроскопия выявила очень высокий уровень захвата миРНК клетками EXPRES (>80%) при использовании флуоресцентно-окрашенной миРНК (Фиг. 35). РНК, собранная из клеток, анализировалась способом ПЦР на предмет нокдауна целевых генов и сравнивалась с клетками, трансфицированными контрольными олигонуклеотидными миРНК. Олигонуклеотидные миРНК бета-катенина и GSK3b приводили к очень высокому уровню нокдауна генов в клетках EXPRES, который составил более 93%. Другие, непроверенные олигонуклеотидные последовательности, соответствующие другим целевым генам, например, Hes-1, Oct-4, приводили к более низкому и изменчивому уровню нокдауна целевого гена. Специфичность олигонуклеотидных последовательностей подтверждалась путем анализа транскриптов других генов, в которых значимый нокдаун не был выявлен.

Пример 28

Анализ профиля цитокинов с помощью микромножеств антител в линиях EXPRES 01 и 02

Линии EXPRES 01 и 02, пассажи 22 и 23, соответственно, выращивались до достижения, приблизительно 70% конфлюентности в соответствующих средах, а затем были получены лизаты клеток с помощью набора для лизирования клеток млекопитающих (Sigma-Aldrich, MO). Анализ цитокинов производился с помощью панелей с микромножествами антител, производитель RayBiotech, GA (http://www.raybiotech.com/). В Таблице IX a-c приводится экспрессия цитокинов, а также рецепторов цитокинов и ростовых факторов после нормализации данных и вычитания фона. Для каждой панели также приводятся положительные и отрицательные контроли. Тест с панелями был проведен для двух разных образцов из каждого типа клеток.

Пример 29

Анализ кариотипа

Кариотип клеток EXPRES 01, пассаж 20, и клеток EXPRES 02, пассаж 15, определялся путем анализа Гимза-дисков. Цитогенетический анализ производился на двадцати одной клетке EXPRES 01 с Гимза-дисками и на двадцати клетках EXPRES 02 с Гимза-дисками. Половина клеток EXPRES 01 с Гимза-дисками имели нормальный кариотип 46XX, а оставшиеся имели аномальный кариотип, например, трисомию по 17 хромосоме. В клетках EXPRES 02 также наблюдалась реорганизация хромосом с почти повсеместным дублированием коротких плечей хромосомы 1.

Пример 30

Получение клеток EXPRES из суспензии одиночных человеческих эмбриональных створовых клеток в присутствии ингибитора Rho-киназы (ROCK)

Человеческие эмбриональные стволовые клетки линии H9, пассаж 35, культивировались в условиях гипоксии (приблизительно, 3% O2) в течение по меньшей мере трех пассажей. Клетки культивировались в среде MEF-CM с добавлением 8 нг/мл bFGF и наносились на планшеты, покрытые реактивом MATRIGEL, в соответствии с Примером 1. При достижении приблизительно 60% конфлюентности, на культуры воздействовали раствором TrypLE™ Express (Invitrogen, CA) в течение 5 мин. Освобожденные клетки ресуспендировали в среде DM-F12 + 2% ЭТС, извлекли центрифугированием и подсчитали с помощью гемоцитометра. Освобожденные клетки высевались с плотностью от 1000 до 10000 клеток/см2 на обработанные полистиролом для культивации тканей (TCPS) флаконы и культивировались в среде DM-F12 + 2% ЭТС + 100 нг/мл активина-A + 20 нг/мл WNT-3A + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола (Invitrogen, CA) и раствора заменимых аминокислот (1X, NEAA, производитель Invitrogen, CA) +/- 10 мкм ингибитора ROCK (Y-27632, Calbiochem, CA) в условиях гипоксии (приблизительно, 3% 02) при 37°C в стандартном инкубаторе для тканевых культур. Флаконы TCPS не покрывали реактивом MATRIGEL или другими белками экстраклеточного матрикса. Смена среды проводилась ежедневно. Клетки первого пассажа обозначаются P1. Как показано на Фиг. 37, через 24 часа после посева добавление ингибитора ROCK привело к значительному увеличению количества прикрепленных клеток в сравнении с культурами, полученными без добавления ингибитора ROCK. Клетки EXPRES, полученные при использовании ингибитора ROCK, Y27632, были обозначены как EXPRES 15.

Пример 31

Анализ кариотипа

Кариотип клеток EXPRES 15, пассажи 5 и 12, определялся анализом Гимза-дисков. Цитогенетический анализ проводился на двадцати одной клетке EXPRES 15 с Гимза-дисками. Во всех клетках наблюдался нормальный кариотип 46XX (Фиг. 38). FISH-анализ хромосом 12 и 17 также показал, что все клетки имели нормальный сигнал гена ETV6 BAP (TEL), расположенного на хромосоме 12, и все клетки имели нормальный сигнал гена Her2/neu, расположенного на хромосоме 17.

Пример 32

Клетки EXPRES могут поддерживаться в среде, имеющей определенный диапазон концентраций IGF, WNT-3A, активина-А и ингибиторов GSK-3B

Клетки EXPRES 11 выращивались в среде DMEM/F12 (Invitrogen) с добавлением 2% ЭТС, 100 нг/мл активина-А, 20 нг/мл Wnt-3a и 50 нг/мл IGF. По достижении 80% конфлюентности клетки пересевались с применением раствора TrypLE Express (Invitrogen) в 96-луночные планшеты с плотностью 4000 клеток в лунке в среде DMEM/F12 с добавлением 2% ЭТС. Клеткам давали 1 час на прикрепление к субстрату в инкубаторе с увлажнением при 37°C с 5% CO2, после чего добавляли активин-A в диапазоне концентраций от 50 до 100 нг/мл, Wnt-3a, в диапазоне концентраций от 10 до 20 нг/мл, IGF в диапазоне концентраций от 10 до 50 нг/мл, и GSK-3B-ингибитор (IX) в диапазоне концентраций от 50 до 100 нМ. В сроки 24, 48 и 96 часов определяли жизнеспособность клеток с помощью теста CellTiter® 96 AQueous One Solution Cell Proliferation Assay (Promega). Вкратце, реагент MTS добавляли в 96-луночные планшеты и инкубировали его с клетками в течение 1-4 часов, после чего измеряли поглощение при длине волны 490 нм на сканере для планшет. Величина поглощения была прямо пропорциональна количеству живых клеток. На Фиг. 39a-c показаны величины поглощения в сроки a) 24 часа, b) 48 часов и c) 96 часов после посева.

Публикации, цитируемые в данном документе, полностью включаются в настоящий документ в форме ссылок. Хотя различные аспекты изобретения иллюстрируются выше ссылками на примеры и предпочтительные варианты осуществления, подразумевается, что область изобретения ограничивается не упомянутым выше описанием, а следующими пунктами формулы изобретения, составленными в соответствии с принципами патентного законодательства.

Таблица IA
Список первичных антител, использованных при анализе способом FACS и иммунном окрашивании
Антитело Поставщик Изотип № по каталогу
SSEA-1 Chemicon (CA) Мышиный IgM MAB4301
SSEA-3 Chemicon (CA) Мышиный IgG3 MAB4303
SSEA-4 Chemicon (CA) Крысиный IgM MAB1435
TRA 1-60 Chemicon (CA) Мышиный IgM MAB4360
TRA 1-81 Chemicon (CA) Мышиный IgM MAB4381
TRA 1-85 Chemicon (CA) Мышиный IgG1 MAB4385
AP R&D Systems (MN) Мышиный IgG1 FAB1448A
HNF3β R&D systems Козий IgG AF2400
PDX1 Santa Cruz Biotechnology, INC (CA) Козий IgG sc-14664
GATA4 R&D systems Козий IgG AF2606
Sox 17 R&D systems Козий IgG AF1924
CD 9 BD Bioscience (CA) Мышиный IgG1 341647
CXCR4 R&D systems Мышиный IgG2A FAB170A
SOX2 R&D systems Козий IgG AF2018
Nanog R&D systems Козий IgG AF1997
OCT4 R&D systems Козий IgG AF1759
Gata6 R&D systems Козий IgG AF1700
Ecad R&D systems Мышиный IgG MAB1838
Ncam R&D systems Мышиный IgG MAB777
HNF1b R&D systems Козий IgG AF3330
b-катенин R&D systems Мышиный IgG MAB13291
HNF1a BD Bioscience Мышиный IgG 610902
CD99 Invitrogen (CA) Мышиный IgG 18-0235
Cerebus Santa Cruz Biotechnology, INC Козий IgG SC15131
Hex Santa Cruz Biotechnology, INC Козий IgG SC15129
AFP R&D systems Мышиный IgG MAB1269
Антитрипсин DAKO (CA) Кролики A0012
islet 1 R&D systems Козий IgG AF1837
Таблица IB
Список вторичных конъюгированных антител, используемых при анализе способом FACS и иммунном окрашивании
Вторичное конъюгированное антитело Поставщик Разведение
Козий антимышиный IgG, конъюгированный с APC Jackson ImmunoResearch (PA) 1:200
Козий антимышиный IgG, конъюгированный с PE Jackson ImmunoResearch (PA) 1:200
Ослиный антикроличий, конъюгированный с PE или APC Jackson ImmunoResearch (PA) 1:200
Ослиный антикозий, конъюгированный с PE или APC Jackson ImmunoResearch (PA) 1:200
Козий антимышиный IgM, PE SouthernBiotech (AL) 1:200
Козий антикрысиный IgM, PE SouthernBiotech (AL) 1:200
Козий антимышиный IgG3, PE SouthernBiotech (AL) 1:200
Таблица II
Список праймеров, используемых при анализе способом GWH в реальном времени с применением TAQMAN®зондов
Праймер/Зонд Номер по каталогу
18s 4310893E
ABCG2 Hs00184979_m1
AchE Hs00241307_m1
AFP Hs00173490_m1
ALB Hs00609411_m1
альфа-антитрипсин Hs02384981_m1
Амилаза Hs00420710_g1
AP Hs00240993_m1
Atoh1 Hs00944192_s1
B2MG 4310886E
B3Tubulin Hs00964962_g1
B-катенин Hs99999168_m1
Barx1 Hs00222053_m1
Brachyury (T) Hs00610080_m1
CCK Hs00174937_m1
Cdx1 Hs00156451_m1
Cdx2 Hs00230919_m1
CEBPa Hs00269972_s1
CEBPb Hs00942496_s1
Cerberus Hs00193796_m1
CFC1 (Cripto) Hs00414425_m1
CGA Hs00174938_m1
CK19 (KRT19) Hs00761767_s1
CLDN4 (claudin4) Hs00533616_s1
C-Myc-связывающий белок Hs00429315_g1
Connexin32 (GJB-1) Hs00939759_s1
Connexin45 Hs00271416_s1
CTNNβ1 Hs00170025_m1
CXCR4 Hs00237052_m1
Циклин-D1 Hs00277039_m1
Dapper1 (DACT-1) Hs00420410_m1
DKK1 Hs00183740_m1
DKK4 Hs00205290_m1
Эндоглин Hs00164438_m1
Exo1 Hs00243513_m1
F3 Hs00175225_m1
FAH Hs00164611_m1
FGF4 Hs00173564_m1
FGF10 Hs00610298_m1
FGFR1 Hs00241111_m1
FGFR3 Hs00179839_m1
FGFR4 Hs00242558_m1
Flk1 Hs00911705_g1
FOXA1 Hs00270129_m1
FOXA3 Hs00270130_m1
FOXD3 Hs00255287_s1
FOXF1 Hs00230962_m1
GAPDH (человеческий) 4310884E
Гастрин Hs00174945_m1
GATA1 Hs00231112_m1
GATA4 Hs00171403_m1
GATA5 Hs00388359_m1
GATA6 Hs00232018_m1
GCK Hs00175951_m1
GFAP Hs00157674_m1
GIP Hs00175030_m1
Gli Hs01110766_m1
Глюкагон Hs00174967_m1
Glut-2 Hs00165775_m1
Goosecoid Hs00418279_m1
GS Hs00374213_m1
Handy1 Hs00231848_m1
HB9 Hs00232128_m1
Hes1 Hs00172878_m1
Hex1 Hs00172696_m1
HEYL Hs00232718_m1
HHIP (белок, взаимодействующий с белком hedgehog) Hs01011009_m1
hHIF1α Hs00153153_m1
HNF1 Hs00167041_m1
HNF1α Hs00167041_m1
HNF1β Hs00172123_m1
HNF3β Hs00232764_m1
HNF4α Hs00230853_m1
HNF6 (onecut) Hs00413554_m1
HoxB1 Hs00157973_m1
IBSP Hs00173720_m1
Инсулин II Hs00355773_m1
Islet-1 Hs00158126_m1
Jagged-1 (JAG1) Hs00164982_m1
KDR Hs00176676_m1
KRT15 Hs00267035_m1
MafA Hs00999118_m1
MAML1 Hs00207373_m1
Map2 Hs00159041_m1
MapK14 Hs00176247_m1
MapK8 Hs00177083_m1
MBP (основной белок миелина) Hs00921945_m1
MIXL1 Hs00430824_g1
MMP1 (матриксная металлопротеаза 1) Hs00233958_m1
MOX1 Hs00793059_m1
MSX1 Hs00427183_m1
Mucin1 Hs00904328_m1
Mucin2 Hs00159374_m1
Myf5 Hs00271574_m1
MyoD1 Hs00159528_m1
N-кадгерин (CDH2) Hs00169953_m1
N-Cam1 Hs00169851_m1
NEFH Hs00606024_m1
NEFL Hs00196245_m1
Нестин Hs00707120_s1
NeuroD1 Hs00159598_m1
Ngn3 Hs00360700_q1
Nkx2.1 Hs00163037_m1
Nkx2.2 Hs00159616_m1
Nkx6.1 Hs00232355_m1
Notch1 Hs01062014_m1
NTS Hs00175048_m1
O2 Hs00377820_m1
Oct3/4 Hs00742896_s1
OTX2 Hs00222238_m1
Pax3 Hs00240950_m1
Pax4 Hs00173014_m1
Pax6 Hs00240871_m1
Pax8 Hs00247586_m1
Pax9 Hs00196354_m1
PDX-1 (IPF1) Hs00236830_m1
Ptch (Patched) Hs00970985_m1
PTF1a Hs00603586_q1
PYY Hs01062281_m1
RA-рецептор-альфа Hs00230907_m1
RALDH Hs01125173_m1
RBPSUH Hs00794653_m1
Rex1 (ZFP42) Hs00399279_m1
SCGB1 Hs00171092_m1
Секретин Hs00360814_q1
sFRP Hs00610060_m1
sFRP5 Hs00169366_m1
SHH Hs00179843_m1
SLC5A8 Hs01068911_m1
Snai1 Hs00195591_m1
Snai2 Hs00161904_m1
Соматостатин Hs00174949_m1
Sox1 Hs00534426_s1
Sox10 Hs00366918_m1
SOX17 см. вкладку "Sox17"
SOX2 Hs00602736_s1
Sox3 Hs00271627_s1
SOX7 Hs00846731_s1
Sox9 Hs00165814_m1
Sparc Hs00234160_m1
SP-C Hs00161628_m1
TBX6 Hs00365539_m1
TERT Hs00162669_m1
THBD Hs00264920_s1
Twist1 Hs00361186_m1
UtF1 Hs00747497_q1
Vim Hs00185584_m1
Wnt-3a (человеческий) Hs01055707_m1
Wnt-3a (мышиный) Mm00437337_m1
WT1 Hs01103754_m1
ZIC1 Hs00604749_m1
Zic2 Hs00600845_m1
Таблица III
Список линий EXPRES, полученных из родительских линий H1 и H9
Идентифика-
ционный номер
Линия родительских эмбриональных стволовых клеток, номер пассажа День получения в ходе дифференцировки в сформированную эндодерму Среда, используемая для выращивания клеток
EXPRES 01 H9P54 День 4 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 02 H9P54 День 6 DM-F12-+ 2% ЭТС +100 нг/мл AA + 20 нг/мл WNT-3A (питательная среда)
EXPRES 03 H9P39 День 3 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 04 H9P39 День 4 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 05 H9P39 День 5 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I
EXPRES 06 H9P49 День 5 Питательная среда
EXPRES 07 H1P50 День 5 Питательная среда
EXPRES 08 H1P39 День 4 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 09 H1P39 День 6 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 10 H1P49 День 4 Питательная среда
EXPRES 11 H9P30 День 4 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
EXPRES 12 H9P30 День 6 Питательная среда + 50 нг/мл IGF-I + 0,1 мМ меркаптоэтанола
Таблица IV
Экспрессия маркеров клеточной поверхности линиями EXPRES 01 и 02
Маркер EXPRES 01- % экспрессии EXPRES 02- % экспрессии
TRA 1-60 100 100
TRA1-81 100 100
SSEA-3 100 86 (85-88)
SSEA-4 100 87 (83-88)
CD56 (NCAM) <1 38 (35-40)
CXCR4 <1 20 (10-25)
SSEA-1 <1 26 (9-32)
E-Кадгерин 90 (85-95) 75 (72-79)
CD9 99 66 (62-68)
CD30 97 (96-98) 43 (40-46)
LIF-рецептор <1 20 (15-21)
CD117 92 (90-95) 73 (67-75)
Таблица V
РАЗЛИЧИЕ в экспрессии генов между недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками, культивированными на матриксе MATRIGELTM и клетками EXPRES 01 (a) и 02 (b), культивированными на TCPS
A) Эмбриональные стволовые клетки и EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2.
Эмбриональные стволовые клетки EXPRES 01 Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-5,03662 3,037629 269,52 Повышение 8.34E-05 BG099432 Гены EST
-2,82645 3,094183 60,57 Повышение 3.88E-03 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
-4,71714 0,961816 51,23 Повышение 6.59E-05 AI796169 GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
-1,57973 4,092731 51 Повышение 6.13E-03 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-2,24566 3,409815 50,4 Повышение 1.19E-03 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
-0,66473 4,897427 47,25 Повышение 1.97E-04 R06655 Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
-2,96204 2,589425 46,9 Повышение 1.79E-03 NM_001311 Homo sapiens, богатый цистеином белок 1 (кишечный) (CRIP1), мРНК. /PROD=cysteine-rich protein 1 (intestinal) /FL=gb:U58630.1 gb:BC002738.1 gb:NM_001311.1 gb:U09770.1
-0,08298 5,388254 44,36 Повышение 2.48E-04 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-4,21525 1,240929 43,9 Повышение 4.36E-04 NM_006119 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 8 (индуцированный андрогеном) (FGF8), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 8 (androgen-induced) /FL=gb:U36223.1 gb:U46212.1 gb:NM_006119.1
-3,11273 2,306225 42,78 Повышение 5.07E-03 AW444761 Гены EST
-4,05111 1,075159 34,93 Повышение 1.19E-03 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
-1,81534 3,025351 28,65 Повышение 7.00E-04 AW590925 Гены EST
-2,36335 2,448218 28,08 Повышение 1.62E-02 AI189359 мевалонат (дифосфо) декарбоксилаза /FL=gb:NM_002461.1 gb:BC000011.1 gb:U49260.1
-3,00328 1,794842 27,82 Повышение 7.77E-03 AI571798 Ингибитор диссоциации Rho GDP (GDI) альфа
-4,17258 0,510307 25,69 Повышение 2.29E-04 AI040887 Гены EST
-0,11332 4,420733 23,17 Повышение 8.78E-05 NM_003670 Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
-1,94 2,590871 23,12 Повышение 3.90E-03 NM_016569 Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
-2,18113 2,33099 22,82 Повышение 1.12E-02 NM_004041 Homo sapiens, аррестин, бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
-2,85963 1,609384 22,15 Повышение 6.37E-03 BC005961 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
0,044298 4,505436 22,03 Повышение 4.17E-05 W57613 Гены EST
-3,65051 0,757197 21,23 Повышение 7.11E-04 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
-1,25226 2,990178 18,93 Повышение 2.70E-04 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
-0,63516 3,41866 16,61 Повышение 1.05E-03 AA149250 Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
-0,14916 3,880272 16,33 Повышение 8.45E-04 NM_002521 Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
-2,88485 1,143234 16,31 Повышение 2.83E-03 BF437711 Гены EST
-2,7136 1,194285 15,01 Повышение 2.14E-02 NM_001898 Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-0,07353 3,816817 14,83 Повышение 1.62E-02 AF116616 Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
-1,44577 2,422113 14,6 Повышение 1.34E-02 AL544576 Гены EST
2,301255 6,091008 13,83 Повышение 6.50E-05 BC020935 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
3,006559 6,79047 13,77 Повышение 8.80E-05 AI263909 семейство генов-гомологов ras, член B /FL=gb:NM_004040.1
-0,512 3,268087 13,74 Повышение 2.96E-03 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,484047 7,24746 13,58 Повышение 4.12E-04 NM_003564 Homo sapiens, трансгелин 2 (TAGLN2), мРНК. /PROD=transgelin 2 /FL=gb:D21261.1 gb:NM_003564.1
2,623145 6,382732 13,54 Повышение 7.32E-05 AI050866 nodal, мышиный, гомолог
2,91184 6,66195 13,46 Повышение 1.44E-04 BC002616 Homo sapiens, трансгелин 2, клон MGC:2989, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=transgelin 2 /FL=gb:BC002616.1
-1,18027 2,546953 13,24 Повышение 1.42E-02 AI123555 Гены EST
-0,92213 2,770179 12,93 Повышение 1.08E-04 AK000345 Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
-1,85154 1,840613 12,93 Повышение 6.40E-03 AI949760 Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
0,899321 4,507212 12,19 Повышение 1.08E-04 AW196940 Гены EST
1,651788 5,252439 12,13 Повышение 5.58E-05 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
-1,20347 2,387268 12,05 Повышение 2.76E-02 BF063186 Гены EST
3,669215 7,251816 11,98 Повышение 2.01E-05 NM_000700 Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
-3,52039 0,041471 11,81 Повышение 1.58E-02 AW162210 Homo sapiens, кДНК FLJ11490 fis, клон HEMBA1001918
3,006317 6,564471 11,78 Повышение 2.04E-04 NM_006183 Homo sapiens, нейротензин (NTS), мРНК. /PROD=neurotensin precursor /FL=gb:NM_006183.2 gb:U91618.1
3,227575 6,777916 11,72 Повышение 2.01E-05 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,869893 5,411751 11,65 Повышение 2.01E-05 NM_001854 Homo sapiens, коллаген, тип XI, альфа 1 (COL11A1), мРНК. /PROD=collagen, type XI, alpha 1 /FL=gb:J04177.1 gb:NM_001854.1
2,851479 6,371229 11,47 Повышение 3.61E-05 AI950472 Гены EST
-0,1081 3,393761 11,33 Повышение 1.39E-03 BG028597 Гены EST
0,41954 3,911282 11,25 Повышение 1.42E-04 AI670948 Гены EST
-1,71451 1,771584 11,21 Повышение 7.77E-03 BI254089 Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК, клон ZD50E03
-1,66293 1,80547 11,07 Повышение 2.68E-02 NM_000817 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
0,451086 3,904705 10,96 Повышение 5.45E-04 NM_007038 Homo sapiens, дезинтегрин-подобный белок и металлопротеаза (репролизинового типа) с мотивом типа тромбоспондин-1, 5 (аггреканаза-2) (ADAMTS5), мРНК. /PROD=a disintegrin and metalloprotease with thrombospondin motifs-5 preproprotein /FL=gb:NM_007038.1 gb:AF14209
-1,44798 1,988376 10,83 Повышение 1.07E-02 AW376860 Гены EST
1,19822 4,633038 10,81 Повышение 1.22E-04 NM_016931 Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
1,552808 4,981033 10,76 Повышение 3.24E-04 NM_000602 Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
-0,62725 2,792215 10,7 Повышение 3.24E-04 BC017942 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
-1,22834 2,18828 10,68 Повышение 2.50E-02 BG402859 Гены EST
-0,85366 2,55067 10,59 Повышение 3.53E-04 N36408 гипотетический белок FLJ23306 /FL=gb:NM_024530.1
1,55625 4,952105 10,53 Повышение 1.52E-03 BG164365 белок, связанный с микротрубочками 1B /FL=gb:NM_005909.1
0,93094 4,285883 10,23 Повышение 4.17E-05 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
-3,33551 0,008356 10,15 Повышение 9.88E-03 BF221850 Гены EST
-1,97569 1,35098 10,03 Повышение 2.12E-02 NM_002149 Homo sapiens, гиппокальцин-подобный белок 1 (HPCAL1), мРНК. /PROD=hippocalcin-like 1 /FL=gb:NM_002149.1 gb:D16227.1
0,624024 3,934756 9,92 Повышение 2.01E-05 AF154054 Homo sapiens, DRM (DRM), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=DRM /FL=gb:NM_013372.1 gb:AF110137.2 gb:AF045800.1 gb:AF154054.1
-2,37515 0,931587 9,9 Повышение 2.83E-02 NM_025136 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22187 (FLJ22187), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22187 /FL=gb:BC005059.1 gb:NM_025136.1
0,906004 4,154799 9,51 Повышение 1.45E-04 NM_013372 Homo sapiens, суперсемейство белков 1 с цистеиновым узлом, BMP-антагонист 1 (CKTSF1B1), мРНК. /PROD=cysteine knot superfamily 1, BMP antagonist 1 /FL=gb:NM_013372.1 gb:AF110137.2 gb:AF045800.1 gb:AF154054.1
1,423659 4,64236 9,31 Повышение 2.01E-05 AB019695 Homo sapiens, мРНК тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность. /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
0,620478 3,822765 9,2 Повышение 6.53E-05 AL567376 Связанный с G-белком рецептор 39
2,317589 5,509474 9,14 Повышение 1.02E-05 J04177 В кластер входят J04177:человеческий коллаген альфа-1 типа XI (COL11A1), мРНК, полная кодовая последовательность /cds=(161,5581) /gb=J04177 /gi=179729 /ug=Hs.82772 /len=6158
-0,01596 3,175621 9,14 Повышение 9.88E-03 L37033 Кластер включает L37033:гомолог человеческого белка, связывающего FK-506 (FKBP38) мРНК, полная кодовая последовательность /cds=(140,1207) /gb=L37033 /gi=965469 /ug=Hs.173464 /len=1613
3,119777 6,302535 9,08 Повышение 5.07E-03 AI954041 F-box только белок 9 /FL=gb:NM_012347.1
0,891337 4,058968 8,99 Повышение 1.66E-04 NM_000325 Homo sapiens, paired-подобный гомеодоменный транскрипционный фактор 2 (PITX2), мРНК. /PROD=paired-like homeodomain transcription factor 2 /FL=gb:NM_000325.1 gb:U69961.1 gb:AF048720.1
2,106895 5,247359 8,82 Повышение 2.13E-04 NM_001458 Homo sapiens, филамин C, гамма (актин-связывающий белок-280) (FLNC), мРНК. /PROD=gamma filamin /FL=gb:AF089841.1 gb:NM_001458.1
-1,42687 1,693258 8,69 Повышение 2.43E-02 AF243424 Homo sapiens, SG2NA, бета изоформа, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=SG2NA beta isoform
0,657996 3,771559 8,66 Повышение 2.06E-02 AU158380 Homo sapiens, кДНК FLJ13698 fis, клон PLACE2000176
0,23287 3,334996 8,59 Повышение 2.01E-05 R40917 фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
-0,06159 3,027095 8,51 Повышение 3.60E-04 U16797 Человеческий белок LERK-5 (EPLG5), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=LERK-5 /FL=gb:U16797.1 gb:NM_004093.1 gb:L38734.1 gb:U81262.1
4,07051 7,149479 8,45 Повышение 4.86E-05 M10943 Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
-0,35204 2,705807 8,33 Повышение 1.09E-03 BC004490 Homo sapiens, гомолог вирусного онкогена мышиной остеосаркомы v-fos FBJ, клон MGC:11074, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogenehomolog /FL=gb:NM_005252.2 gb:BC004490.1
-2,0132 1,043139 8,32 Повышение 3.61E-02 BE328496 гипотетический белок PRO2032 /FL=gb:AF116683.1 gb:NM_018615.1
-0,68954 2,36447 8,31 Повышение 8.94E-04 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
-0,00953 3,031935 8,23 Повышение 9.88E-03 AA831438 Гомолог Mad4
3,079271 6,1137 8,19 Повышение 4.17E-05 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
0,788995 3,806044 8,1 Повышение 6.41E-05 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
0,9926 4,004698 8,07 Повышение 8.48E-05 AI202327 Гены EST
0,051719 3,059444 8,04 Повышение 6.98E-04 NM_007350 Homo sapiens, домен, подобный домену плекстриновой гомологии, семейство A, член 1 (PHLDA1), мРНК. /PROD=pleckstrin homology-like domain, family A,member 1 /FL=gb:NM_007350.1
-1,69103 1,312148 8,02 Повышение 1.82E-03 U32500 Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
-0,93931 2,060071 8 Повышение 6.51E-03 AA004300 гипотетический белок DKFZp566I133
1,164666 4,161028 7,98 Повышение 2.51E-03 BC005807 Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,462987 5,441963 7,88 Повышение 1.45E-04 NM_016651 Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
0,581498 3,560033 7,88 Повышение 1.07E-04 U38945 Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
0,470814 3,417829 7,71 Повышение 8.26E-03 AF176039 Homo sapiens, белок R из группы белков высокой подвижности, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=high mobility group protein-R /FL=gb:AF176039.1
-1,50663 1,438639 7,7 Повышение 7.38E-04 BF223214 Гены EST
-2,43082 0,495104 7,6 Повышение 1.71E-02 BF508288 Гены EST
1,084464 4,009912 7,6 Повышение 1.16E-03 BC004865 Homo sapiens, ассоциированный с "заячьей губой" и "волчьей пастью" трансмембранный белок 1, клон MGC:10593, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cleft lip and palate associated transmembraneprotein 1 /FL=gb:BC004865.1
4,232374 7,152167 7,57 Повышение 1.54E-03 BF971587 тубулин, бета-полипептид /FL=gb:BC001352.1
0,129315 3,042634 7,53 Повышение 2.17E-04 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-0,20075 2,710846 7,52 Повышение 2.58E-02 NM_003377 Homo sapiens, сосудистый эндотелиальный фактор роста B (VEGFB), мРНК. /PROD=vascular endothelial growth factor B /FL=gb:NM_003377.1 gb:U43368.1 gb:U52819.1
-0,45681 2,439084 7,44 Повышение 7.82E-03 AI417362 Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J, SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,155309 3,037724 7,37 Повышение 8.78E-04 NM_007061 Homo sapiens, конститутивный белок сыворотки (MSE55), мРНК. /PROD=serum constituent protein /FL=gb:M88338.1 gb:NM_007061.1
1,506057 4,362244 7,24 Повышение 7.30E-05 NM_001425 Homo sapiens, белок 3 эпителиальной мембраны (EMP3), мРНК. /PROD=epithelial membrane protein 3 /FL=gb:U52101.1 gb:NM_001425.1 gb:U87947.1
-1,75194 1,091177 7,18 Повышение 3.15E-02 NM_021570 Homo sapiens, BarH-подобный гомеобокс 1 (BARX1), мРНК. /PROD=BarH-like homeobox 1 /FL=gb:NM_021570.2 gb:AF213356.1
2,455614 5,294065 7,15 Повышение 9.88E-03 AF279899 Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
1,422626 4,257559 7,14 Повышение 2.01E-05 NM_006365 Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
-2,40588 0,424388 7,11 Повышение 1.64E-02 NM_002433 Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
-1,86904 0,959227 7,1 Повышение 4.35E-02 AB033831 Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
1,811736 4,639749 7,1 Повышение 1.09E-03 M27830 Человеческий ген РНК рибосомы 28S, полная кодовая последовательность.
-0,54131 2,28595 7,1 Повышение 3.63E-03 BE504838 Гены EST
4,065536 6,887587 7,07 Повышение 4.08E-04 NM_005796 Homo sapiens, фактор ядерного транспорта 2 (плацентарный белок 15) (PP15), мРНК. /PROD=nuclear transport factor 2 (placental protein15) /FL=gb:BC002348.1 gb:NM_005796.1 gb:U43939.1
-0,4348 2,379408 7,03 Повышение 4.24E-03 BF686824 гибель-ассоциированная протеинкиназа 3 /FL=gb:AB007144.1 gb:AB022341.1 gb:NM_001348.1
1,448288 4,255531 7 Повышение 2.01E-05 AF096296 Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
3,504052 6,307554 6,98 Повышение 4.05E-05 NM_006622 Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
2,124541 4,927935 6,98 Повышение 8.80E-05 J05008 Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
1,872394 4,674078 6,97 Повышение 1.02E-05 AK022852 Homo sapiens, кДНК FLJ12790 fis, клон NT2RP2001985, со слабой степенью подобия с белком Homo sapiens, нацеленным на онкопротеины вирусов папилломы человека E6 высокого риска, E6TP1альфа, мРНК.
1,764338 4,563535 6,96 Повышение 1.43E-04 AA909044 триптаза, альфа
1,401293 4,178686 6,86 Повышение 1.66E-04 NM_003256 Homo sapiens, тканевой ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 4precursor /FL=gb:NM_003256.1 gb:U76456.1
0,767075 3,54446 6,86 Повышение 1.88E-03 AY029208 Homo sapiens, предшественник цепи альфа 2 коллагена типа VI (COL6A2), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=type VI collagen alpha 2 chain precursor /FL=gb:AY029208.1
-1,94468 0,831091 6,85 Повышение 1.92E-02 NM_153036 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
0,586923 3,359675 6,83 Повышение 4.17E-05 NM_000047 Homo sapiens, арилсульфатаза E (chondrodysplasia punctata 1) (ARSE), мРНК. /PROD=arylsulfatase E precursor /FL=gb:X83573.1 gb:NM_000047.1
1,064878 3,834572 6,82 Повышение 2.41E-04 NM_002610 Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
-0,11882 2,64743 6,8 Повышение 6.88E-04 AI702438 Гены EST
-0,34208 2,418198 6,78 Повышение 2.31E-04 AI860150 Гены EST с низкой степенью подобия A49134, регион V-I цепи Ig-каппа (H.sapiens)
4,156522 6,9125 6,76 Повышение 6.48E-05 NM_003240 Homo sapiens, фактор, ассоциированный с внутриматочным кровотечением (фактор А, определяющий лево-правостороннюю ассиметрию; суперсемейство трансформирующего фактора роста бета) (EBAF), мРНК. /PROD=transforming growth factor, beta 4 /FL=gb:U81523.1 gb:NM_003240.1 gb:AF081513.1
-1,8911 0,860193 6,73 Повышение 2.83E-03 NM_001191 Homo sapiens, BCL2-подобный белок 1 (BCL2L1), мРНК. /PROD=BCL2-like 1 /FL=gb:NM_001191.1
-0,53771 2,208449 6,71 Повышение 1.41E-02 AI806338 T-box 3 (локтевой синдром млекопитающих) /FL=gb:AF170708.2 gb:NM_005996.1
3,824397 6,568635 6,7 Повышение 1.66E-04 AL031602 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
0,001822 2,741586 6,68 Повышение 4.44E-05 NM_004904 Homo sapiens, белок, связывающий элемент цАМФ-ответа, CRE-BPa (H_GS165L15.1), мРНК. /PROD=cAMP response element-binding protein CRE-BPa /FL=gb:NM_004904.1 gb:L05911.1
0,301216 3,030236 6,63 Повышение 4.76E-04 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,63387 7,360687 6,62 Повышение 4.17E-05 BF217861 металлотионеин 1E (функциональный)
0,413191 3,124723 6,55 Повышение 5.00E-02 AL136925 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586H1320 (из клона DKFZp586H1320); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136925.1
-0,28056 2,427947 6,54 Повышение 1.39E-03 AW090187 дигидропиримидиназа-подобный белок 4 /FL=gb:NM_006426.1 gb:AB006713.1
1,095892 3,804014 6,53 Повышение 2.43E-04 NM_001146 Homo sapiens, ангиопоэтин 1 (ANGPT1), мРНК. /PROD=angiopoietin 1 /FL=gb:NM_001146.1 gb:D13628.1 gb:U83508.1
-0,0845 2,62025 6,52 Повышение 2.59E-04 AA625683 Гены EST
2,13274 4,835771 6,51 Повышение 2.01E-04 AL574210 ингибитор серин- (или цистеин-) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор активатора плазминогена типа 1), член 1 /FL=gb:NM_000602.1 gb:M16006.1
-0,64252 2,055951 6,49 Повышение 2.10E-04 NM_001035 Homo sapiens, рианодиновый рецептор 2 (сердечный) (RYR2), мРНК. /PROD=ryanodine receptor 2 (cardiac) /FL=gb:NM_001035.1
4,450364 7,144308 6,47 Повышение 3.61E-05 BF246115 белок, связанный с РНК-геликазой
0,405368 3,094055 6,45 Повышение 6.25E-05 AW188198 индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
-0,34351 2,332751 6,39 Повышение 5.54E-05 NM_000077 Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
-0,88122 1,790331 6,37 Повышение 1.37E-03 AA775681 гипотетический белок FLJ23091
3,508565 6,179917 6,37 Повышение 8.80E-05 NM_000158 Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
-1,84589 0,82486 6,37 Повышение 3.13E-03 AV705309 Гены EST
-0,18263 2,487276 6,36 Повышение 1.49E-02 AC006942 Homo sapiens, хромосома 19, космида R31181
3,759854 6,426778 6,35 Повышение 2.01E-05 AF313413 Homo sapiens, предполагаемый малый мембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
2,4094 5,066795 6,31 Повышение 3.61E-05 AI809870 белок HSKM-B
-2,08089 0,570296 6,28 Повышение 7.70E-03 BC016043 Homo sapiens, гипотетический белок MGC2865, клон MGC:20246 IMAGE:4635389, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC016043.1
1,37641 4,004952 6,18 Повышение 1.20E-04 AU148611 Человеческий pTR7, мРНК для повторяющейся последовательности
1,384716 4,012773 6,18 Повышение 4.52E-04 NM_006275 Homo sapiens, фактор сплайсинга, богатый аргининсерином, 6 (SFRS6), мРНК. /PROD=splicing factor, arginineserine-rich 6 /FL=gb:U30883.1 gb:NM_006275.1
2,979212 5,604053 6,17 Повышение 1.52E-04 M27830 Человеческий ген 28S рибосомной РНК, полная кодовая последовательность.
0,310893 2,921559 6,11 Повышение 3.42E-04 NM_007279 Homo sapiens, U2 малый ядерный рибонуклеопротеиновый вспомогательный фактор (65 кДа) (U2AF65), мРНК. /PROD=U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliaryfactor (65kD) /FL=gb:NM_007279.1
0,65284 3,256353 6,08 Повышение 2.49E-04 AI819043 Гены EST
1,609773 4,213168 6,08 Повышение 1.35E-04 M29277 Человеческий изолят гликопротеина JuSo MUC18, мРНК (3 вариант), полная кодовая последовательность. /PROD=MUC18 glycoprotein /FL=gb:M29277.1
-0,62167 1,968272 6,02 Повышение 4.11E-04 AI963304 Гены EST
4,459837 7,047717 6,01 Повышение 1.02E-04 NM_004052 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
3,178404 5,762898 6 Повышение 1.27E-04 AB037810 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1389, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1389 protein
-1,08931 1,494664 6 Повышение 2.35E-03 AB020683 Homo sapiens, мРНК белка KIAA0876, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0876 protein
1,9194 4,501184 5,99 Повышение 3.61E-05 AK000162 Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI ACETYL-COENZYNYME А-SYNTHETAZE.
0,671205 3,243641 5,95 Повышение 2.48E-04 AA463626 Гены EST
0,091029 2,660133 5,93 Повышение 9.55E-04 AF277174 Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
1,479222 4,042679 5,91 Повышение 6.34E-05 NM_005454 Homo sapiens, гомолог белка cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновыми узлами) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
-0,29455 2,259676 5,87 Повышение 2.79E-03 AF312393 Homo sapiens, белок “лейциновая застежка" FKSG13 (FKSG13) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=leucine-zipper protein FKSG13 /FL=gb:AF312393.1
-0,81321 1,740607 5,87 Повышение 3.72E-02 NM_002160 Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
0,167058 2,720179 5,87 Повышение 1.02E-04 NM_021223 Homo sapiens, легкая цепь 2a миозина (LOC58498), мРНК. /PROD=myosin light chain 2a /FL=gb:NM_021223.1
0,901323 3,451092 5,86 Повышение 3.05E-05 NM_005767 Homo sapiens, пуринэргический рецептор (семейство A группа 5) (P2Y5), мРНК. /PROD=purinergic receptor (family A group 5) /FL=gb:AF000546.1 gb:NM_005767.1
1,007578 3,543738 5,8 Повышение 2.13E-04 NM_001955 Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
1,327779 3,862686 5,8 Повышение 1.51E-04 NM_007115 Homo sapiens, индуцированный фактором некроза опухолей-альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
-0,2077 2,32716 5,8 Повышение 1.52E-04 AA211909 Гены EST
1,304257 3,835269 5,78 Повышение 3.02E-04 NM_005451 Homo sapiens, белок enigma (белок с доменом LIM) (ENIGMA), мРНК. /PROD=enigma protein /FL=gb:BC001093.1 gb:NM_005451.2 gb:AF265209.1
-0,30113 2,227329 5,77 Повышение 4.58E-03 BE968750 Homo sapiens, рианодиновый рецептор 2 (сердечный) (RYR2), мРНК
1,678635 4,204607 5,76 Повышение 9.75E-05 AA086229 enigma (белок с доменом LIM)
1,411335 3,932627 5,74 Повышение 1.58E-02 NM_003370 Homo sapiens, стимулируемый вазодилататорами фосфопротеин (VASP), мРНК. /PROD=vasodilator-stimulated phosphoprotein/FL=gb:NM_003370.1
-1,32153 1,183922 5,68 Повышение 2.72E-02 AF217536 Homo sapiens, урезанная мевалонат-киназа, мРНК, частичная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=truncated mevalonate kinase
1,058988 3,560886 5,66 Повышение 3.56E-03 H05812 рецептор к инсулин-подобному фактору роста 1 /FL=gb:NM_000875.2
4,435207 6,93459 5,65 Повышение 3.61E-05 AF078844 Homo sapiens, белок hqp0376, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hqp0376 protein /FL=gb:AF078844.1
2,418835 4,908301 5,62 Повышение 3.47E-03 NM_012268 Homo sapiens, белок, сходный с белком вируса вакцинальной болезни HindIII K4L ORF (HU-K4), мРНК. /PROD=similar to vaccinia virus HindIII K4L ORF /FL=gb:U60644.1 gb:BC000553.1 gb:NM_012268.1
-0,56112 1,927121 5,61 Повышение 6.37E-03 AL041124 гипотетический белок PP1665
-1,63462 0,844727 5,58 Повышение 4.98E-03 AI831874 Гены EST
-0,34446 2,130828 5,56 Повышение 3.75E-05 NM_006379 Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен секретируемый белок (семафорин), 3C (SEMA3C), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3C /FL=gb:NM_006379.1 gb:AB000220.1
4,143258 6,618477 5,56 Повышение 1.18E-05 AU146532 киназа пируватдегидрогеназы, изофермент 1
-0,52233 1,950739 5,55 Повышение 1.54E-03 AI091047 переносчик растворенных веществ, семейство 2 (облегченный переносчик глюкозы), член 1 /FL=gb:K03195.1 gb:NM_006516.1
0,690529 3,155168 5,52 Повышение 9.91E-04 BC033088 Homo sapiens, белок, сходный с ламинином AC, клон MGC:45654 IMAGE:3623265, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to lamin AC /FL=gb:BC033088.1
-0,00098 2,454314 5,48 Повышение 2.48E-04 NM_013281 Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-0,87622 1,577138 5,48 Повышение 1.84E-02 M15329 Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
5,117294 7,564809 5,45 Повышение 6.25E-05 M83248 Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin/FL=gb:M83248.1
2,352834 4,796495 5,44 Повышение 4.17E-05 AI653107 Гены EST
3,27933 5,719116 5,43 Повышение 3.24E-04 NM_016639 Homo sapiens, трансмембранный белок типа I Fn14 (FN14), мРНК. /PROD=type I transmembrane protein Fn14 /FL=gb:NM_016639.1 gb:BC002718.1 gb:AB035480.1 gb:AF191148.1
-2,06232 0,368788 5,39 Повышение 6.40E-03 AA148534 связанный с беременностью белок плазмы A /FL=gb:NM_002581.1 gb:U28727.1
3,982825 6,413408 5,39 Повышение 7.48E-05 AA678241 стеароил-КоА десатураза (дельта-9-десатураза)/FL=gb:AB032261.1 gb:AF097514.1 gb:NM_005063.1
0,399566 2,809822 5,32 Повышение 7.81E-04 AF144103 Homo sapiens, белок NJAC (NJAC), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NJAC protein /FL=gb:AF144103.1 gb:AF106911.1 gb:AF073957.1 gb:BC003513.1 gb:NM_004887.1
4,15299 6,560926 5,31 Повышение 6.59E-05 NM_000935 Homo sapiens, проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизин-гидроксилаза) 2 (PLOD2), мРНК. /PROD=procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase(lysine hydroxylase) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
0,319769 2,724257 5,29 Повышение 8.94E-04 AL552534 Человеческая мРНК для антигена CD44, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,347359 5,750515 5,29 Повышение 5.27E-03 AF047002 Homo sapiens, коактиватор транскрипции ALY, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=transcriptional coactivator ALY
4,571448 6,973787 5,29 Повышение 3.53E-04 AI631159 переносчик растворенных веществ, семейство 2 (облегченный переносчик глюкозы), член 3 /FL=gb:NM_006931.1 gb:M20681.1
1,93843 4,333496 5,26 Повышение 1.21E-04 NM_019886 Homo sapiens, карбогидрат (N-ацетилглюкозамин 6-O) сульфотрансфераза 7 (CHST7), мРНК. /PROD=carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O)sulfotransferase 7 /FL=gb:NM_019886.1 gb:AB037187.1 gb:AB040711.1
-0,3185 2,064012 5,21 Повышение 1.55E-03 U83508 Человеческий ангиопоэтин-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=angiopoietin-1 /FL=gb:NM_001146.1 gb:D13628.1 gb:U83508.1
1,484424 3,866551 5,21 Повышение 3.49E-04 BC000076 Homo sapiens, циклин D1 (PRAD1: белок 1 аденоматоза щитовидной железы), клон MGC:2316, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin D1 (PRAD1: parathyroid adenomatosis 1) /FL=gb:M73554.1 gb:BC000076.1
4,465458 6,844763 5,2 Повышение 1.52E-04 AF003114 Homo sapiens, CYR61, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:AF003114.1
-1,33756 1,041706 5,2 Повышение 8.51E-03 BF196010 Гены EST
3,747557 6,125638 5,2 Повышение 4.52E-04 AA554833 нейроэндокринный секреторный белок 55
-0,24196 2,129273 5,17 Повышение 2.80E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,657439 5,023981 5,16 Повышение 1.66E-04 NM_006472 Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
1,275689 3,642133 5,16 Повышение 1.65E-04 BF982289 Гены EST, низкая степень подобия с эластин-подобным белком (D.melanogaster)
2,11271 4,458591 5,08 Повышение 1.97E-04 H15920 Гены EST, низкая степень подобия с RTA, ПРЕДПОЛАГАЕМЫМ КРЫСИНЫМ РЕЦЕПТОРОМ, СОПРЯЖЕННЫМ С G-БЕЛКОМ (R.norvegicus)
2,624088 4,968498 5,08 Повышение 1.45E-04 M28882 Человеческий гликопротеин MUC18, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=MUC18 glycoprotein /FL=gb:M28882.1
4,046173 6,388326 5,07 Повышение 6.34E-05 NM_015641 Homo sapiens, тестин (DKFZP586B2022), мРНК. /PROD=testin /FL=gb:BC001451.1 gb:AF245357.1 gb:AF245356.1 gb:NM_015641.1
0,946455 3,284436 5,06 Повышение 5.46E-04 BM976939 Homo sapiens кДНК FLJ31611 fis, клон NT2RI2002923.
1,389207 3,725552 5,05 Повышение 1.08E-04 AL136805 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434J1521 (из клона DKFZp434J1521); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136805.1
0,710433 3,041407 5,03 Повышение 1.08E-03 NM_004472 белок с вилкообразным регионом (forkhead box) D1 (FOXD1), мРНК. /PROD=forkhead box D1 /FL=gb:U59832.1 gb:NM_004472.1
2,800881 5,127991 5,02 Повышение 6.53E-05 NM_017817 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20429 (FLJ20429), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20429 /FL=gb:NM_017817.1
0,432778 2,759117 5,02 Повышение 2.50E-03 AI692523 Гены EST
-0,94056 1,385676 5,01 Повышение 4.17E-03 AI927458 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434A196 (из клона DKFZp434A196); полная кодовая последовательность
0,224112 2,550074 5,01 Повышение 4.11E-04 BF060767 Гены EST
-0,47823 1,845598 5,01 Повышение 2.75E-03 AA489100 Гены EST
4,590104 -3,36994 249,01 Снижение 2.26E-04 AA167449 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
6,024741 -1,32044 162,6 Снижение 1.79E-03 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
1,940449 -5,04898 127,07 Снижение 3.05E-05 BE644917 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
2,68759 -3,61621 79 Снижение 1.25E-03 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
5,005827 -1,03397 65,79 Снижение 1.30E-04 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
0,357833 -5,67924 65,67 Снижение 2.26E-03 BG389789 Человеческая мРНК, стимулируемая при индуцированном камптотецином апоптозе клеток U937.
6,500961 0,756526 53,61 Снижение 4.17E-05 NM_003012 Homo sapiens, секретируемый frizzled-белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
2,077151 -3,59883 51,13 Снижение 3.75E-03 BF223193 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
3,29779 -2,3376 49,71 Снижение 3.05E-05 U17496 Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
4,803291 -0,78667 48,17 Снижение 3.75E-05 AA628440 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
4,124115 -1,42293 46,75 Снижение 7.16E-04 AW262311 Гены EST
2,437935 -3,10907 46,75 Снижение 2.41E-04 BE672557 Гены EST
4,276201 -1,19736 44,43 Снижение 9.47E-04 AV699347 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,710253 -3,7619 44,39 Снижение 8.66E-05 NM_016179 Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
2,313549 -3,12747 43,44 Снижение 5.45E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
2,835599 -2,26295 34,26 Снижение 2.50E-03 AI735586 Гены EST
0,588183 -4,50758 34,2 Снижение 2.89E-04 AU118882 эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
0,349102 -4,73558 33,93 Снижение 2.50E-02 BM682352 Homo sapiens, кДНК FLJ37204 fis, клон BRALZ2006976.
-0,10303 -5,00884 29,98 Снижение 1.97E-04 NM_022168 Homo sapiens, связанный с дифференцировкой меланомы белок-5 (MDA5), мРНК. /PROD=melanoma differentiation associated protein-5 /FL=gb:AY017378.1 gb:NM_022168.1 gb:AF095844.1
2,325274 -2,506 28,47 Снижение 1.35E-04 AW193693 белок DKFZP566K1924
0,252976 -4,55112 27,94 Снижение 2.54E-02 NM_018043 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
2,719388 -2,08299 27,9 Снижение 1.72E-02 NM_002048 Homo sapiens, специфичный для задержки роста белок 1 (GAS1), мРНК. /PROD=growth arrest-specific 1 /FL=gb:NM_002048.1 gb:L13698.1
3,257726 -1,54343 27,88 Снижение 6.25E-05 NM_004335 Homo sapiens, антиген 2 клеток стромы костного мозга /FL=gb:NM_004335.2 gb:D28137.1
4,353788 -0,41404 27,24 Снижение 4.72E-04 AI332407 секретированный frizzled-белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
4,387855 -0,27888 25,4 Снижение 6.82E-05 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
0,027478 -4,62508 25,15 Снижение 9.89E-03 NM_152647 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32800 (FLJ32800), мРНК. /FL=gb:NM_152647.1
1,767203 -2,80617 23,81 Снижение 4.44E-04 AI742043 Гены EST
1,665643 -2,69521 20,55 Снижение 1.08E-04 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
0,414323 -3,84422 19,14 Снижение 3.42E-04 AF283777 Homo sapiens, клон TCBAP0702, последовательность мРНК.
3,779853 -0,4664 18,98 Снижение 4.72E-04 AV646597 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,995324 -2,233 18,74 Снижение 1.01E-03 NM_014862 Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
1,946332 -2,24096 18,22 Снижение 2.40E-03 BG166705 малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 5 (нейтрофил-активирующий пептид 78 эпителиального происхождения)
1,179963 -2,9904 18,01 Снижение 2.13E-04 U96136 Homo sapiens, дельта-катенин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=delta-catenin /FL=gb:NM_001332.1 gb:U72665.1 gb:AB013805.1 gb:U96136.1 gb:AF035302.1
2,060687 -2,07873 17,62 Снижение 1.01E-03 AI269290 переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
2,480221 -1,64839 17,49 Снижение 1.22E-03 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,971941 -3,12304 17,09 Снижение 1.07E-02 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
2,263194 -1,81469 16,89 Снижение 2.69E-03 AF052108 Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
2,115848 -1,84267 15,55 Снижение 3.89E-02 AF213678 Homo sapiens, связанный с HAI-2 малый белок (HAI-2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HAI-2 related small protein /FL=gb:AB038317.1 gb:AF213678.1
2,348373 -1,56046 15,02 Снижение 7.77E-03 NM_016354 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
1,910263 -1,99418 14,97 Снижение 3.77E-04 NM_006994 Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
2,699795 -1,16113 14,53 Снижение 5.07E-03 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
2,172559 -1,66608 14,31 Снижение 7.83E-03 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,265765 -3,53873 13,97 Снижение 2.21E-03 AI675836 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3 конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (60S рибосомный белок 23A), гены EST, гены STS
5,440506 1,644236 13,89 Снижение 6.34E-05 M34455 Человеческая индуцируемая интерфероном-гамма индоламин-2,3-диоксигеназа (IDO), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002164.1 gb:M34455.1
0,330556 -3,45471 13,79 Снижение 5.46E-04 BE972639 Гены EST
0,437404 -3,31877 13,51 Снижение 4.52E-04 H05254 Гены EST
1,32524 -2,42314 13,44 Снижение 1.57E-02 H29627 Гены EST
1,673028 -2,06656 13,36 Снижение 5.30E-03 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
1,319614 -2,39234 13,1 Снижение 1.43E-02 NM_004389 Homo sapiens, катенин (белок, связанный с кадгеринами), альфа 2 (CTNNA2), мРНК. /PROD=catenin (cadherin-associated protein), alpha 2 /FL=gb:NM_004389.1 gb:M94151.2
1,708627 -1,98647 12,95 Снижение 1.75E-02 NM_017596 Homo sapiens, белок KIAA0449 (KIAA0449), мРНК. /PROD=hypothetical protein DKFZp434J212 /FL=gb:NM_017596.1
2,777148 -0,8902 12,71 Снижение 4.36E-04 NM_022034 Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстерогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
1,982765 -1,67669 12,64 Снижение 6.88E-04 BE672659 Гены EST
0,457009 -3,18081 12,45 Снижение 3.30E-04 AW449813 белок KIAA0918
0,510314 -3,12055 12,39 Снижение 1.71E-02 AW780006 Гены EST
0,536704 -3,05382 12,05 Снижение 1.92E-02 AL049250 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D113 (из клона DKFZp564D113).
2,294336 -1,27392 11,86 Снижение 1.66E-02 U11058 Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
2,177763 -1,38062 11,78 Снижение 8.80E-05 NM_002590 Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
-0,48821 -4,01809 11,55 Снижение 2.29E-02 AB040812 Homo sapiens, мРНК протеинкиназы PAK5, полная кодовая последовательность. /PROD=protein kinase PAK5 /FL=gb:AB040812.1
1,785431 -1,74236 11,53 Снижение 2.18E-03 R15072 Гены EST
1,459269 -2,00069 11 Снижение 3.74E-04 NM_000277 Homo sapiens, фенилаланин-гидроксилаза (PAH), мРНК. /PROD=phenylalanine hydroxylase /FL=gb:U49897.1 gb:NM_000277.1
1,995493 -1,44407 10,85 Снижение 7.11E-03 U91903 Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
0,679665 -2,7484 10,76 Снижение 5.57E-03 BC000568 Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
1,841888 -1,57619 10,69 Снижение 1.16E-03 AW072790 контактин 1
-0,42571 -3,8118 10,45 Снижение 1.58E-02 AK023699 Homo sapiens, кДНК FLJ13637 fis, клон PLACE1011165.
1,923237 -1,4606 10,44 Снижение 4.11E-04 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
0,931661 -2,45074 10,43 Снижение 1.07E-02 AW149405 нейриксин 1 /FL=gb:AB035356.1
0,781816 -2,56699 10,19 Снижение 2.50E-02 NM_000698 Homo sapiens, арахидонат 5-липоксигеназа (ALOX5), мРНК. /PROD=arachidonate 5-lipoxygenase /FL=gb:NM_000698.1 gb:J03600.1 gb:J03571.1
1,939598 -1,40726 10,17 Снижение 2.29E-03 AB014737 Homo sapiens, мРНК белка SMAP-2b, полная кодовая последовательность. /PROD=SMAP-2b /FL=gb:AB014737.1
0,874376 -2,46854 10,15 Снижение 1.59E-02 U82671 Homo sapiens, из хромосомы Xq28 семейство меланомных антигенов A2a (MAGEA2A), семейство меланомных антигенов A12 (MAGEA12), семейство меланомных антигенов A2b (MAGEA2B), семейство меланомных антигенов A3 (MAGEA3), кальтрактин (CALT), NAD(P)H дегидрогеназа-подобный белок (NSDHL), ...
3,315768 0,011663 9,88 Снижение 7.33E-04 AK098525 Homo sapiens, кДНК FLJ25659 fis, клон TST00427, высокая степень подобия с белком домовой мыши, взаимодействующим с белком hedgehog (Hip), мРНК.
0,121165 -3,1782 9,84 Снижение 4.65E-03 AI985987 Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,686587 -2,59339 9,71 Снижение 2.72E-02 NM_000439 Homo sapiens, пропротеинконвертаза субтилизинкексинового типа 1 (PCSK1), мРНК. /PROD=proprotein convertase subtilisinkexin type 1 /FL=gb:NM_000439.2 gb:M90753.1
3,113317 -0,0881 9,2 Снижение 7.30E-05 AL565745 Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
2,890305 -0,29832 9,12 Снижение 3.24E-04 NM_015474 Homo sapiens, белок DKFZP564A032 (DKFZP564A032), мРНК. /PROD=DKFZP564A032 protein /FL=gb:AF228421.1 gb:AL050267.1 gb:AB013847.1 gb:NM_015474.1
0,447048 -2,73882 9,1 Снижение 4.19E-02 BE645435 Гены EST
3,142124 -0,03564 9,05 Снижение 3.76E-03 AL832535 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp547J1816 (из клона DKFZp547J1816).
0,767101 -2,38787 8,91 Снижение 1.92E-02 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
4,315048 1,168713 8,85 Снижение 7.92E-04 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-0,47937 -3,61302 8,78 Снижение 2.49E-02 BE968773 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564O1262 (из клона DKFZp564O1262)
3,26376 0,151239 8,65 Снижение 1.74E-04 BE644809 Гены EST
0,384182 -2,72567 8,63 Снижение 3.02E-02 NM_005825 Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 2 (calcium andDAG-regulated) /FL=gb:AF043723.1 gb:NM_005825.1
2,363587 -0,72928 8,53 Снижение 7.38E-04 NM_024645 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13842 (FLJ13842), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13842 /FL=gb:NM_024645.1
4,756657 1,668488 8,5 Снижение 1.30E-04 AV715309 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,995551 -2,07915 8,43 Снижение 3.01E-02 NM_005386 Homo sapiens, нейронатин (NNAT), мРНК. /PROD=neuronatin /FL=gb:NM_005386.1 gb:BC001768.1 gb:AB002392.1 gb:U25033.1
2,380226 -0,68921 8,39 Снижение 8.34E-05 NM_016546 Homo sapiens, предшественник комплемент-C1r-подобной протеиназы (LOC51279), мРНК. /PROD=complement C1r-like proteinase precursor, /FL=gb:AF178985.1 gb:NM_016546.1
2,598916 -0,46577 8,37 Снижение 6.59E-05 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
1,045717 -2,01579 8,35 Снижение 1.44E-02 AI937060 белок KIAA1151
3,009579 -0,04543 8,31 Снижение 7.08E-04 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
1,440541 -1,60998 8,29 Снижение 1.58E-02 BE503640 Гены EST
0,4785 -2,56291 8,23 Снижение 2.46E-02 BG532690 интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
5,84374 2,812887 8,17 Снижение 6.34E-05 BC000069 Homo sapiens, белок-респондер рецептора ретиноевой кислоты (индуцируемый тазаротеном) 2, клон MGC:1544, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=retinoic acid receptor responder (tazaroteneinduced) 2 /FL=gb:BC000069.1 gb:NM_002889.2 gb:AB015632.1 gb:U77594.1
1,110683 -1,89628 8,04 Снижение 8.48E-04 AA557324 Гены EST с низкой степенью подобия с жирнокислотной омега-гидроксилазой (H.sapiens)
1,386384 -1,61585 8,01 Снижение 3.53E-04 AF196571 Homo sapiens, дельта-подобный-1 белок (DLL1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Delta-like-1 protein /FL=gb:NM_005618.2 gb:AF196571.1
5,363884 2,372618 7,95 Снижение 7.30E-05 NM_007015 Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
1,364581 -1,62447 7,94 Снижение 2.16E-02 NM_145280 Homo sapiens, белок, сходный с антигеном HCA557b, связанным с гепатоклеточной карциномой (LOC151194), мРНК. /FL=gb:BC009462.1 gb:NM_145280.1
2,628136 -0,35867 7,93 Снижение 1.22E-04 NM_001957 Homo sapiens, рецептор эндотелина, тип A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
1,712212 -1,25121 7,8 Снижение 8.48E-04 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец/ clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
1,443731 -1,51616 7,78 Снижение 4.37E-03 AJ272267 Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
3,106596 0,148375 7,77 Снижение 1.23E-02 NM_002305 Homo sapiens, лектин, галактозид-связывающий, растворимый, 1 (галектин 1) (LGALS1), мРНК. /PROD=beta-galactosidase binding lectin precursor /FL=gb:NM_002305.2 gb:BC001693.1 gb:J04456.1
1,961633 -0,98665 7,72 Снижение 8.93E-03 NM_001463 Homo sapiens, frizzled-белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,38092 -0,54428 7,6 Снижение 6.34E-04 AF053712 Homo sapiens, лиганд остеопротегерина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
0,685413 -2,22507 7,52 Снижение 2.98E-02 NM_018383 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11294 (FLJ11294), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11294 /FL=gb:NM_018383.1
-0,24717 -3,14972 7,48 Снижение 3.67E-04 AF429305 Homo sapiens, белок C23up NCRMS, мРНК, частичная последовательность; продукт альтернативного сплайсинга.
3,893148 0,997757 7,44 Снижение 1.29E-04 AU144892 Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
0,82553 -2,06523 7,42 Снижение 4.10E-02 BC041933 Homo sapiens, клон IMAGE:5300703, мРНК.
0,728978 -2,13318 7,27 Снижение 1.25E-03 AL573058 компонент комплемента 1, подкомпонент r
1,033324 -1,8148 7,2 Снижение 5.93E-03 N80918 Новый человеческий ген, соответствующий хромосоме 13
2,858719 0,013383 7,19 Снижение 4.37E-03 L10374 Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
2,260317 -0,57539 7,14 Снижение 1.02E-03 AI138603 Гены EST
2,003902 -0,82254 7,09 Снижение 8.00E-03 BF109660 Гены EST
3,85985 1,037668 7,07 Снижение 2.70E-04 R40892 Гены EST
3,921983 1,12675 6,94 Снижение 3.53E-04 AA206141 Гены EST
-0,17018 -2,96268 6,93 Снижение 2.08E-02 AV741130 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,610685 -1,16078 6,83 Снижение 9.82E-04 AA886335 Homo sapiens, серологически определяемый антиген NY-BR-20 рака молочной железы, мРНК, частичная кодовая последовательность
2,859538 0,089114 6,82 Снижение 2.22E-03 AW014734 Гены EST
3,212409 0,467551 6,7 Снижение 2.69E-04 BG434174 Homo sapiens кДНК FLJ13555 fis, клон PLACE1007677
2,116702 -0,60252 6,59 Снижение 3.35E-03 AF107846 Homo sapiens, ген нейроэндокрин-специфичного белка Гольджи p55 (XLalphas), экзон XL2 и полная кодовая последовательность
3,179908 0,462842 6,58 Снижение 3.24E-04 U82811 Человеческий гомеодомен-содержащий белок (HANF) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HANF /FL=gb:U82811.1 gb:NM_003865.1
2,509452 -0,20066 6,54 Снижение 1.04E-03 NM_001609 Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
2,596054 -0,10733 6,51 Снижение 1.39E-03 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
0,559211 -2,13754 6,48 Снижение 2.20E-02 BF000203 Гены EST
4,534853 1,872557 6,33 Снижение 9.75E-05 R38389 ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
2,068166 -0,59258 6,32 Снижение 1.69E-03 BF698797 Гены EST
2,168796 -0,49174 6,32 Снижение 2.44E-04 NM_002522 Homo sapiens, нейрональный пентраксин I (NPTX1), мРНК. /PROD=neuronal pentraxin I precursor /FL=gb:NM_002522.1 gb:U61849.1
-0,10024 -2,75761 6,31 Снижение 3.60E-02 BC033812 Homo sapiens, белок, сходный с LOC155399, клон MGC:45477 IMAGE:5181460, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to LOC155399 /FL=gb:BC033812.1
0,994947 -1,65385 6,27 Снижение 7.39E-03 NM_024034 Homo sapiens, гипотетический белок MGC3129, сходный с белком, связанным с ганглиозид-индуцированной дифференцировкой (MGC3129), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC3129 similar toganglioside-induced differentiation-associated protein /FL=gb:NM_024034.1 gb:BC0
3,758058 1,109291 6,27 Снижение 4.39E-04 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая белковая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
1,553207 -1,09181 6,26 Снижение 2.54E-02 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - HYDROXYPHENYLPYRUVATE DIOXYGENASE (H.sapiens)
3,702164 1,060081 6,24 Снижение 4.08E-04 U26662 Человеческий нейрональный пентраксин II (NPTX2) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=neuronal pentraxin II
4,260791 1,638346 6,16 Снижение 6.25E-05 AA603344 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,172331 -0,44991 6,16 Снижение 2.44E-04 NM_003839 Homo sapiens, суперсемейство рецепторов фактора некроза опухолей, член 11a, активатор NFKB (TNFRSF11A), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor receptor superfamily,member 11a, activator of NFKB /FL=gb:NM_003839.1 gb:AF018253.1
4,981307 2,359848 6,15 Снижение 4.17E-05 NM_005103 Homo sapiens, белок фасцикуляции и удлинения зета 1 (зигин I) (FEZ1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=zygin 1, isoform 1 /FL=gb:U60060.1 gb:U69139.1 gb:NM_005103.2
3,826815 1,207679 6,14 Снижение 6.48E-05 BG401568 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434H1235 (из клона DKFZp434H1235); частичная кодовая последовательность
1,027188 -1,59055 6,14 Снижение 8.40E-03 BG169832 аденилаткиназа 5 /FL=gb:NM_012093.1 gb:AF062595.1
2,054962 -0,54704 6,07 Снижение 2.86E-03 NM_002800 Homo sapiens, субъединица протеасомы (просома, макропаин), тип бета, 9 (большая многофункциональная протеаза 2) (PSMB9), мРНК. /PROD=proteasome (prosome, macropain) subunit, betatype, 9 (large multifunctional protease 2) /FL=gb:U01025.1 gb:NM_002800.1
5,372736 2,7744 6,06 Снижение 8.80E-05 AA669799 Кластер включает AA669799:ag36c04.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-1118886 /clone_end=3 /gb=AA669799 /gi=2631298 /ug=Hs.6315 /len=679
0,24636 -2,3444 6,02 Снижение 1.31E-03 AW057589 Гены EST
1,145878 -1,44369 6,02 Снижение 9.46E-03 AI056877 Человеческая ДНК-последовательность от клонирования RP4-530I15 на хромосоме 20. Содержит 3 конец гена PTPN1, протеинтирозинфосфатазы, нерецепторного типа 1 (EC 3.1.3.48), гена нового белка, сходного с плацентарным белком DIFF40, RPL36 (60S рибос
0,976009 -1,61054 6,01 Снижение 5.39E-03 AW264204 Гены EST
0,497515 -2,08762 6 Снижение 2.83E-02 AF052117 Homo sapiens, клон 23809, последовательность мРНК.
0,381933 -2,20139 5,99 Снижение 8.66E-04 AI913749 Гены EST
0,528494 -2,05438 5,99 Снижение 4.17E-02 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
3,795925 1,232161 5,91 Снижение 2.20E-04 NM_004688 Homo sapiens, белок, взаимодействующий с N-myc (и STAT) (NMI), мРНК. /PROD=N-myc and STAT interactor /FL=gb:BC001268.1 gb:NM_004688.1 gb:U32849.1
1,934415 -0,62283 5,89 Снижение 4.93E-04 NM_001351 Homo sapiens, белок, подобный белку, удаленному из азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
1,805448 -0,75007 5,88 Снижение 1.88E-03 AI681917 Гены EST с высокой степенью подобия с МЫШИНЫМ IRX3, ГОМЕОДОМЕННЫМ БЕЛКОМ IRX-3 КЛАССА IROQUOIS (M.musculus)
2,788534 0,237692 5,86 Снижение 7.40E-03 AW450929 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A1
2,99034 0,457208 5,79 Снижение 5.23E-04 NM_002993 Homo sapiens, малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 6 (гранулоцитарный хемотактический белок 2) (SCYB6), мРНК. /PROD=small inducible cytokine subfamily B(Cys-X-Cys), member 6 (granulocyte chemotactic protein 2) /FL=gb:U81234.1 gb:NM_00299
0,362564 -2,17012 5,79 Снижение 1.28E-02 AB018580 Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
1,673874 -0,85315 5,76 Снижение 8.93E-03 NM_005965 Homo sapiens, киназа легкого полипептида миозина (MYLK), мРНК. /PROD=myosin, light polypeptide kinase /FL=gb:AB037663.1 gb:AF069601.2 gb:NM_005965.1
1,858219 -0,66565 5,75 Снижение 2.13E-04 NM_005084 Homo sapiens, фосфолипаза A2, группа VII (ацетилгидролаза фактора активации тромбоцитов, плазматическая) (PLA2G7), мРНК. /PROD=phospholipase A2, group VII (platelet-activatingfactor acetylhydrolase, plasma) /FL=gb:U20157.1 gb:U24577.1 gb:NM_005084.1
3,016209 0,501482 5,71 Снижение 6.48E-05 AW026379 Гены EST
3,692792 1,179422 5,71 Снижение 1.52E-04 N21096 Гены EST
1,28245 -1,23083 5,71 Снижение 3.20E-04 AF063824 Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant delta /FL=gb:AF063824.1
3,772564 1,260638 5,7 Снижение 3.53E-04 AA404269 Гены EST
2,016986 -0,49385 5,7 Снижение 6.37E-03 AI741439 Гены EST
2,453774 -0,04433 5,65 Снижение 1.01E-03 NM_007191 Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
5,545158 3,061783 5,59 Снижение 1.71E-04 BF057809 Гены EST
5,219258 2,740374 5,57 Снижение 1.08E-04 AA974416 протеинфосфатаза 2 (ранее 2A), регуляторная субъединица B (PR 52), бета-изоформа
2,913327 0,434686 5,57 Снижение 2.99E-04 NM_012419 Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 17 (RGS17), мРНК. /PROD=regulator of G-protein signalling 17 /FL=gb:AF202257.2 gb:NM_012419.2
1,651332 -0,81962 5,54 Снижение 8.34E-02 NM_007181 Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 1 (MAP4K1), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinasekinase 1 /FL=gb:U66464.1 gb:NM_007181.1
1,293775 -1,16956 5,51 Снижение 1.15E-02 BF593660 Гены EST
1,417933 -1,04305 5,51 Снижение 4.93E-04 NM_002738 Homo sapiens, протеинкиназа C, бета 1 (PRKCB1), мРНК. /PROD=protein kinase C, beta 1 /FL=gb:NM_002738.1
3,66812 1,207732 5,5 Снижение 1.97E-04 NM_133329 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство G, член 3 (KCNG3), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, subfamily G,member 3 isoform 1 /FL=gb:AF454548.1 gb:AF348982.1 gb:AB070604.1 gb:NM_133329.4
3,002731 0,549124 5,48 Снижение 4.89E-04 R54042 Гены EST
5,276628 2,824048 5,47 Снижение 6.48E-05 BC005127 Homo sapiens, белок, связанный с дифференцировкой жировой ткани, клон MGC:10598, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=adipose differentiation-related protein /FL=gb:BC005127.1 gb:NM_001122.1
3,380946 0,937118 5,44 Снижение 1.22E-04 AU151342 Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
2,01577 -0,42783 5,44 Снижение 1.92E-03 BE220341 казеинкиназа 2, полипептид альфа 1
1,307387 -1,12824 5,41 Снижение 1.08E-04 AK021452 Homo sapiens, кДНК FLJ11390 fis, клон HEMBA1000561, с низкой степенью подобия с ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 91.
0,36507 -2,02151 5,23 Снижение 4.98E-03 BF062244 Гены EST
0,756663 -1,62346 5,21 Снижение 1.69E-03 BG533580 Гены EST
3,876819 1,518834 5,13 Снижение 4.76E-04 AI651212 Гены EST
0,619594 -1,73795 5,12 Снижение 1.18E-03 BE467611 Гены EST
0,482843 -1,87385 5,12 Снижение 1.04E-03 BG284890 Гены EST
1,048359 -1,30538 5,11 Снижение 8.93E-03 AA464273 Гены EST
3,527039 1,198446 5,02 Снижение 2.69E-03 BG283790 Гены EST
2,522705 0,194248 5,02 Снижение 3.09E-03 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
2,356401 0,028606 5,02 Снижение 6.23E-04 NM_024893 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ14220 (FLJ14220), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ14220 /FL=gb:NM_024893.1
4,587367 2,264046 5 Снижение 2.70E-04 AL049589 Последовательность человеческой ДНК из клона 570L12 на хромосоме Xq13.1-21.1. Содержит ген PGK1 для фосфоглицераткиназы 1, ген нового белка, подобного TAF2G (фактором, связанным с белком, связывающим TATA-участок (TBP), РНК-полимераза II, G, 32 кДа) (TAF...
B) Эмбриональные стволовые клетки и EXPRES 02- Значения интенсивности даны в формате Log2.
Эмбриональные стволовые клетки EXPRES 02 Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-2,7136 7,077563 886 Повышение 9.62E-04 NM_001898 Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-2,3713 6,959692 644,03 Повышение 6.55E-05 R72286 связанный с микрофибриллами белок 4
-3,78394 5,172093 496,63 Повышение 1.06E-04 AW157548 связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-4,79257 3,432794 299,28 Повышение 1.81E-03 AA352113 Гены EST
-5,16453 3,053666 297,8 Повышение 5.30E-03 NM_002345 Homo sapiens, люмикан (LUM), мРНК. /PROD=lumican /FL=gb:NM_002345.1 gb:U18728.1 gb:U21128.1
-2,55753 5,625595 290,65 Повышение 1.79E-04 D87811 Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-5,03662 3,030028 268,1 Повышение 7.79E-05 BG099432 Гены EST
-2,97296 4,901727 234,7 Повышение 5.95E-05 AI821586 Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-3,06613 4,772945 228,98 Повышение 2.57E-03 AI422986 Гены EST
-4,37538 3,399327 218,99 Повышение 7.01E-05 AA552969 Гены EST
-3,47045 4,200612 203,81 Повышение 4.26E-03 NM_025140 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22471 (FLJ22471), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22471 /FL=gb:NM_025140.1
-4,82833 2,813842 199,77 Повышение 1.40E-04 BF064262 Гены EST
-5,1127 2,479359 192,95 Повышение 1.06E-04 NM_002653 Homo sapiens, paired-подобный гомеодоменный транскрипционный фактор 1 (PITX1), мРНК. /PROD=paired-like homeodomain transcription factor 1 /FL=gb:NM_002653.1
-3,4841 4,092799 190,93 Повышение 4.34E-04 BM128432 Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК клон YA81B05
-4,64254 2,721466 164,74 Повышение 2.38E-05 AY177407 Homo sapiens, белок гомеобокса goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-3,40132 3,923976 160,37 Повышение 1.34E-02 BF589787 Гены EST
-1,20324 6,071574 154,86 Повышение 2.23E-04 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,4292 3,808106 150,89 Повышение 4.62E-04 AB028021 Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,71714 2,374201 136,37 Повышение 6.98E-05 AI796169 GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
-2,26798 4,781861 132,5 Повышение 9.04E-05 NM_001322 Homo sapiens, цистатин SA (CST2), мРНК. /PROD=cystatin SA /FL=gb:NM_001322.1
-0,81321 6,174771 126,94 Повышение 1.57E-03 NM_002160 Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-2,38522 4,594021 126,17 Повышение 6.89E-05 AA502609 Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
-3,75387 3,204091 124,32 Повышение 2.13E-04 AI991459 Гены EST
-4,21525 2,671776 118,36 Повышение 1.99E-04 NM_006119 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 8 (индуцированный андрогеном) (FGF8), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 8 (androgen-induced) /FL=gb:U36223.1 gb:U46212.1 gb:NM_006119.1
-2,02474 4,768631 110,92 Повышение 7.31E-03 NM_021827 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23514 (FLJ23514), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23514 /FL=gb:NM_021827.1
-2,38432 4,381798 108,84 Повышение 1.01E-03 AL534095 гипотетический белок FLJ23091
-2,25187 4,311095 94,55 Повышение 7.26E-03 AL136944 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-1,92189 4,619888 93,17 Повышение 9.02E-04 AV700724 GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-3,42725 2,997778 85,93 Повышение 2.95E-03 NM_022469 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ21195, сходный с белком, связанным с DAC и cerberus (FLJ21195), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ21195 similar to proteinrelated to DAC and cerberus /FL=gb:NM_022469.1
-3,14404 3,270152 85,28 Повышение 6.55E-05 AB028021 Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-0,88122 5,526622 84,91 Повышение 1.25E-04 AA775681 гипотетический белок FLJ23091
-2,96204 3,439168 84,52 Повышение 1.08E-03 NM_001311 Homo sapiens, богатый цистеином белок 1 (кишечный) (CRIP1), мРНК. /PROD=cysteine-rich protein 1 (intestinal) /FL=gb:U58630.1 gb:BC002738.1 gb:NM_001311.1 gb:U09770.1
-3,42819 2,876705 79,06 Повышение 2.31E-04 AL121722 Человеческая ДНК-последовательность из клона RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF-3B (гепатоцитарный ядерный фактор 3, бета). Новый ген, основанный на генах EST, EST, STS, GSS и островках CpG
-1,01231 5,27686 78,2 Повышение 1.85E-04 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-2,13331 4,095704 75,01 Повышение 2.99E-04 NM_003867 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-0,14916 6,052967 73,63 Повышение 2.30E-04 NM_002521 Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
-2,9139 3,274181 72,91 Повышение 9.48E-04 NM_005143 Homo sapiens, гаптоглобин (HP), мРНК. /PROD=haptoglobin /FL=gb:K00422.1 gb:L29394.1 gb:NM_005143.1
-2,33028 3,85605 72,82 Повышение 2.04E-04 X02162 Человеческая мРНК аполипопротеина AI (apo AI)=. /PROD=preproapolipoprotein AI
-4,75249 1,427636 72,51 Повышение 8.97E-04 AJ276395 Homo sapiens, мРНК белка MSF-FN70 (ген FN). /PROD=migration stimulation factor FN70
-1,50663 4,672617 72,47 Повышение 9.82E-05 BF223214 Гены EST
-4,40099 1,778003 72,45 Повышение 8.87E-05 AI733179 Гены EST
-2,56553 3,594638 71,51 Повышение 4.24E-04 D31771 Homo sapiens, мРНК белка MSX-2, полная кодовая последовательность. /PROD=MSX-2 /FL=gb:NM_002449.2 gb:D31771.1
-3,67415 2,447201 69,62 Повышение 1.97E-02 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-1,33141 4,770833 68,7 Повышение 2.36E-04 AI640307 протокадгерин 10
-2,41293 3,673615 67,96 Повышение 8.00E-04 NM_000846 Homo sapiens, глутатион S-трансфераза A2 (GSTA2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase A2 /FL=gb:BC002895.1 gb:M25627.1 gb:M16594.1 gb:M14777.1 gb:M15872.1 gb:M21758.1 gb:NM_000846.1
-2,95346 3,079949 65,5 Повышение 7.93E-05 NM_000420 Homo sapiens, белок группы крови Келла (KEL), мРНК. /PROD=Kell blood group antigen /FL=gb:BC003135.1 gb:NM_000420.1
-3,41755 2,612638 65,35 Вверх 1,03E-02 AI808090 Гены EST
-4,08201 1,927438 64,42 Повышение 5.56E-04 AK000680 Homo sapiens кДНК FLJ20673 fis, клон KAIA4464. /FL=gb:AF240634.1 gb:NM_018440.1
-0,1416 5,830942 62,79 Повышение 6.89E-05 NM_022454 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс геном 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-1,79329 4,15609 61,79 Повышение 7.58E-04 AL575177 noggin /FL=gb:NM_005450.1
-0,88683 5,039046 60,79 Повышение 8.36E-05 AI821669 Гены EST
-3,76697 2,141612 60,07 Повышение 2.25E-04 NM_001147 Homo sapiens, ангиопоэтин 2 (ANGPT2), мРНК. /PROD=angiopoietin 2 /FL=gb:AB009865.1 gb:AF004327.1 gb:NM_001147.1
0,720535 6,617979 59,61 Повышение 5.95E-05 AW007532 Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
-1,03589 4,784337 56,5 Повышение 2.23E-04 AI242583 Homo sapiens, кДНК FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-2,28856 3,531402 56,49 Повышение 4.54E-04 AF211891 Homo sapiens, mix-like homeobox protein 1 (MILD1) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,04403 3,759502 55,85 Повышение 2.17E-03 NM_000039 Homo sapiens, аполипопротеин A-I (APOA1), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-I precursor /FL=gb:M27875.1 gb:M11791.1 gb:NM_000039.1 gb:BC005380.1
0,129315 5,920102 55,36 Повышение 6.89E-05 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-1,57973 4,207564 55,23 Повышение 5.25E-03 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-4,11172 1,670966 55,05 Повышение 4.57E-04 BG256677 индуцируемый гамма-интерфероном белок 16 /FL=gb:AF208043.1
-0,28789 5,482347 54,58 Повышение 6.89E-05 AW772192 Homo sapiens, клон 23736, последовательность мРНК
-1,44577 4,307421 53,94 Повышение 3.59E-03 AL544576 Гены EST
-3,9513 1,76416 52,54 Повышение 7.33E-05 NM_016341 Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
0,05538 5,762108 52,23 Повышение 7.33E-05 AI817041 связанный с G-белком рецептор
-3,52376 2,14189 50,76 Повышение 8.23E-05 AW300217 Гены EST, со средней степенью подобия с C212_HUMAN 28.3 КДА C21ORF2 (H.sapiens)
-3,18877 2,469472 50,5 Повышение 7.47E-03 AF260333 Homo sapiens, белок AD036, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=AD036 /FL=gb:AF260333.1
-1,973 3,674867 50,14 Повышение 1.91E-04 AA772920 Гены EST
-2,30094 3,341814 49,96 Повышение 7.23E-03 AI806174 транскрипционный фактор 8 (подавляет экспрессию интерлейкина 2)
-2,25531 3,356433 48,9 Повышение 6.63E-03 AI380207 Гены EST
-2,71676 2,892681 48,82 Повышение 5.25E-04 AU144167 Homo sapiens, кДНК FLJ11428 fis, клон HEMBA1001071, высокая степень сходства с ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ ЦЕПИ ПРОКОЛЛАГЕНА АЛЬФА 1(III)
-0,16429 5,442379 48,73 Повышение 6.83E-04 L01639 Человеческий (клон HSY3RR) рецептор к нейропептиду Y (NPYR) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=neuropeptide Y receptor /FL=gb:L06797.1 gb:NM_003467.1 gb:AF025375.1 gb:AF147204.1 gb:M99293.1 gb:L01639.1
-4,03477 1,563749 48,45 Повышение 1.19E-02 U12170 Человеческий гомеодоменный цинк-пальцевый белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=zinc finger homeodomain protein /FL=gb:U12170.1
-0,08298 5,493663 47,72 Повышение 2.19E-04 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
-2,99405 2,552238 46,73 Повышение 4.78E-04 AI767388 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1024N4 на хромосоме 1p32.1-33. Содержит ген нового члена семейства сопряженных переносчиков Натрий:переносимое вещество, подобного SLC5A1 (SGLT1), псевдоген, подобный части членов семейства бутирофилинов, новый ген, гены EST, STS, GS
-4,61432 0,925434 46,52 Повышение 2.53E-04 NM_005221 Homo sapiens, относящийся к типу distal-less гомеобокс 5 (DLX5), мРНК. /PROD=distal-less homeo box 5 /FL=gb:NM_005221.3
-3,22309 2,302183 46,05 Повышение 4.60E-03 AW207243 Гены EST
-2,82645 2,655384 44,69 Повышение 4.60E-03 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
0,533443 5,958927 42,98 Повышение 6.55E-05 NM_001899 Homo sapiens, цистатин S (CST4), мРНК. /PROD=cystatin S /FL=gb:NM_001899.1
0,116207 5,518477 42,29 Повышение 1.27E-04 NM_000599 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-2,1675 3,230235 42,16 Повышение 1.53E-04 NM_021804 Homo sapiens, ангиотензин I -преобразующий фермент (пептидил-дипептидаза A) 2 (ACE2), мРНК. /PROD=angiotensin I converting enzyme(peptidyl-dipeptidase A) 2 /FL=gb:NM_021804.1 gb:AF241254.1 gb:AB046569.1 gb:AF291820.1
-0,61985 4,752547 41,42 Повышение 3.54E-04 NM_001963 Homo sapiens, эпидермальный фактор роста (бета-урогастрон) (EGF), мРНК. /PROD=epidermal growth factor (beta-urogastrone) /FL=gb:NM_001963.2
-1,73746 3,627971 41,22 Повышение 3.35E-04 NM_014391 Homo sapiens, сердечный белок с анкириновыми повторами (CARP), мРНК. /PROD=cardiac ankyrin repeat protein /FL=gb:NM_014391.1
-3,68848 1,657514 40,67 Повышение 2.86E-03 NM_018557 Homo sapiens, связанный с липопротеинами низкой плотности белок 1B (отсутствующий в опухолях) (LRP1B), мРНК. /PROD=low density lipoprotein-related protein 1B(deleted in tumors) /FL=gb:AF176832.1 gb:NM_018557.1
-3,11273 2,220281 40,31 Повышение 5.02E-03 AW444761 Гены EST
-2,78886 2,517881 39,58 Повышение 7.89E-03 NM_001115 Homo sapiens, аденилат-циклаза 8 (мозговая) (ADCY8), мРНК. /PROD=adenylate cyclase 8 /FL=gb:NM_001115.1
-1,93668 3,348112 38,98 Повышение 7.23E-03 BE670361 сопряженный с G-белком рецептор 72 /FL=gb:NM_016540.1 gb:AF236081.1
-3,65051 1,595241 37,94 Повышение 3.80E-04 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,767075 5,998268 37,56 Повышение 2.55E-04 AY029208 Homo sapiens, предшественник цепи альфа 2 коллагена типа VI (COL6A2), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=type VI collagen alpha 2 chain precursor /FL=gb:AY029208.1
-2,34732 2,874499 37,32 Повышение 6.51E-03 AI240545 гликофорин B (содержит белок группы крови Ss)
-2,41622 2,773394 36,49 Повышение 6.29E-04 NM_001977 Homo sapiens, глутамил-аминопептидаза (аминопептидаза A) (ENPEP), мРНК. /PROD=glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-1,58875 3,588854 36,19 Повышение 2.45E-03 NM_152506 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
-0,93849 4,238505 36,18 Повышение 1.38E-02 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
1,479222 6,611842 35,08 Повышение 5.95E-05 NM_005454 Homo sapiens, гомолог белка cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновыми узлами) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
-0,46494 4,666106 35,04 Повышение 2.90E-04 AI141603 коллаген, тип VI, альфа 1
-2,23021 2,897749 34,97 Повышение 4.92E-04 NM_001785 Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,12836 1,991299 34,77 Повышение 8.63E-04 NM_002770 Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-0,98659 4,115782 34,35 Повышение 1.19E-04 M65062 Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP-5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
-2.,50194 2,569744 33,63 Повышение 4.84E-03 AJ277914 Homo sapiens, часть гена LHX9 для LIM-гомеобокса 9, 3UTR.
-1,27526 3,792158 33,53 Повышение 1.12E-03 AI688418 плексин A2
-3,34034 1,708137 33,09 Повышение 2.46E-03 AA781795 Гены EST
1,339655 6,36612 32,59 Повышение 7.93E-05 AJ224869 Homo sapiens, CXCR4 ген, кодирующий рецептор CXCR4
-0,6944 4,326307 32,46 Повышение 7.33E-05 R73554 Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
-0,67187 4,337831 32,22 Повышение 7.54E-05 AI692659 белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-0,46298 4,533319 31,92 Повышение 3.96E-04 S69738 MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нуклеотид). /PROD=MCP-1
-2,56712 2,414446 31,59 Повышение 1.67E-03 AI813758 коллаген, тип III, альфа 1 (синдром Элерса-Данлоса, тип IV, аутосомальная доминанта) /FL=gb:NM_000090.1
-0,31684 4,651259 31,3 Повышение 7.83E-04 BF130943 Гены EST
-2,78124 2,184054 31,24 Повышение 8.36E-05 NM_020995 Homo sapiens, связанный с гаптоглобином белок (HPR), мРНК. /PROD=haptoglobin-related protein /FL=gb:NM_020995.1
-1,24179 3,719223 31,15 Повышение 4.92E-04 AL534095 гипотетический белок FLJ23091
-0,35003 4,606618 31,05 Повышение 6.88E-03 NM_001778 Homo sapiens, антиген CD48 (белок мембраны B-клеток) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-1,81534 3,141104 31,05 Повышение 5.86E-04 AW590925 Гены EST
-1,93655 3,000448 30,63 Повышение 5.42E-03 NM_013369 Homo sapiens, ДНК (цитозин-5-)-метилтрансфераза 3-подобный белок (DNMT3L), мРНК. /PROD=DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like /FL=gb:BC002560.1 gb:NM_013369.1 gb:AF194032.1
1,122063 6,03378 30,1 Повышение 7.33E-05 X58851 Человеческий ген MLC1emb легкой щелочной цепи эмбрионального миозина, промотер и экзон 1
-0,4721 4,436335 30,03 Повышение 7.93E-05 D89377 Homo sapiens, мРНК белка MSX-2, полная кодовая последовательность /PROD=MSX-2 /FL=gb:D89377.1
0,044298 4,952379 30,02 Повышение 6.89E-05 W57613 Гены EST
-0,59928 4,305866 29,96 Повышение 1.03E-03 AF020769 Homo sapiens, сердечный вентрикулярный тропонин C, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cardiac ventricular troponin C /FL=gb:NM_003280.1 gb:AF020769.1
-1,04571 3,857701 29,93 Повышение 4.57E-03 NM_001362 Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-3,24802 1,648226 29,78 Повышение 1.47E-03 AI694325 Гены EST
-2,50665 2,356234 29,1 Повышение 8.64E-03 BE222668 Гены EST
-2,27119 2,568908 28,64 Повышение 2.53E-03 NM_002608 Homo sapiens, бета-полипептид тромбоцитарного фактора роста (гомолог онкогена вируса обезьяней саркомы (v-sis)) (PDGFB), мРНК. /PROD=platelet-derived growth factor beta polypeptide(simian sarcoma viral (v-sis) oncogene homolog) /FL=gb:M12783.1 gb:NM_002
-4,34018 0,485509 28,36 Повышение 7.34E-05 AU144247 Homo sapiens, кДНК FLJ13443 fis, клон PLACE1002853
-1,02297 3,794799 28,2 Повышение 3.36E-03 AF208043 Homo sapiens, белок IFI16b (IFI16b) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=IFI16b /FL=gb:AF208043.1
-2,79469 2,013598 28,02 Повышение 9.94E-05 AI700341 Гены EST
-2,73255 2,070789 27,92 Повышение 1.35E-03 X89271 H.sapiens, мРНК "сиротского" рецептора HG11. /PROD=HG11 orphan receptor /FL=gb:NM_005161.1
-3,05797 1,724772 27,53 Повышение 3.48E-04 AI801626 Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,83953 1,922194 27,13 Повышение 5.16E-04 BG290193 гипотетический белок FLJ14299 /FL=gb:NM_025069.1
-4,60716 0,149736 27,04 Повышение 1.22E-02 NM_004696 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 4 (SLC16A4), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 4 /FL=gb:U59185.1 gb:NM_004696.1
-1,57919 3,174205 26,97 Повышение 5.94E-04 AL524520 связанный с G-белком рецептор 49
-1,36626 3,37132 26,68 Повышение 2.16E-03 AI824037 Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
0,167058 4,895371 26,51 Повышение 6.90E-05 NM_021223 Homo sapiens, легкая цепь 2a миозина (LOC58498), мРНК. /PROD=myosin light chain 2a /FL=gb:NM_021223.1
-1,4009 3,316905 26,31 Повышение 6.35E-04 BC029835 Homo sapiens, клон IMAGE:5169759, мРНК.
-2,16518 2,549789 26,26 Повышение 1.77E-03 AI521166 Гены EST, со средней степенью подобия с MTR5_HUMAN, СВЯЗАННЫМ С МИОТУБУЛАРИНОМ БЕЛКОМ 5 (H.sapiens)
-3,32235 1,375121 25,95 Повышение 2.00E-04 BC039433 Homo sapiens, клон IMAGE:5303550, мРНК.
-5,7338 -1,05152 25,67 Повышение 8.80E-03 NM_020130 Homo sapiens, хромосома 8, открытая рамка считывания 4 (C8ORF4), мРНК. /PROD=chromosome 8 open reading frame 4 /FL=gb:NM_020130.1 gb:AF268037.1
1,214325 5,878585 25,36 Повышение 7.93E-05 M36172 Человеческая щелочная легкая цепь эмбрионального миозина (MLC1), мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:M36172.1 gb:M24121.1 gb:NM_002476.1
-2,20104 2,461597 25,33 Повышение 4.67E-03 NM_000939 Homo sapiens, проопиомеланокортин (адренокортикотропин бета-липотропин альфа-меланоцит-стимулирующий гормон бета-меланоцит-стимулирующий гормон бета-эндорфин) (POMC), мРНК. /PROD=proopiomelanocortin (adrenocorticotropinbeta-lipotropin alpha-melanocyt
-0,2674 4,336009 24,31 Повышение 9.18E-05 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
1,367677 5,968973 24,27 Повышение 1.00E-04 AF116676 Homo sapiens, PRO1957, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=PRO1957 /FL=gb:AF116676.1
-0,62697 3,974228 24,27 Повышение 4.69E-04 NM_005531 Homo sapiens, индуцируемый интерфероном-гамма белок 16 (IFI16), мРНК. /PROD=interferon, gamma-inducible protein 16 /FL=gb:M63838.1 gb:NM_005531.1
-3,90861 0,686447 24,17 Повышение 3.72E-03 BC022531 Homo sapiens, олфактомедин 3, клон MGC:26675 IMAGE:4812035, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=olfactomedin 3 /FL=gb:AF397394.1 gb:BC022531.1
-2,75089 1,840723 24,11 Повышение 2.60E-04 AL365343 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 32539.
-0,6097 3,975428 24 Повышение 1.05E-04 L12468 Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-3,18285 1,397334 23,92 Повышение 3.32E-04 BC041441 Homo sapiens, клон IMAGE:5167131, мРНК.
-1,92796 2,645248 23,81 Повышение 1.20E-02 BE551416 Гены EST с низкой степенью подобия с белком KIAA1330 (H.sapiens)
-4,05111 0,51291 23,65 Повышение 1,05E-03 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
-2,79378 1,767388 23,61 Повышение 3.68E-02 AW291402 Гены EST
-2,80173 1,752943 23,5 Повышение 7.26E-03 AW088232 Гены EST
0,422022 4,975085 23,48 Повышение 1.38E-04 D49958 Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-1,20314 3,343061 23,36 Повышение 3.63E-04 M60721 Человеческий гомеобоксовый ген, полная кодовая последовательность /FL=gb:M60721.1 gb:NM_021958.1
1,932439 6,477785 23,35 Повышение 7.33E-05 H92988 белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-3,00328 1,524799 23,07 Повышение 8.50E-03 AI571798 Ингибитор диссоциации Rho GDP (GDI) альфа
0,526605 5,052252 23,03 Повышение 7.01E-05 N71923 Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-1,26047 3,239318 22,62 Повышение 5.12E-03 NM_007250 Homo sapiens, Kruppel-подобный фактор 8 (KLF8), мРНК. /PROD=Kruppel-like factor 8 /FL=gb:U28282.1 gb:NM_007250.1
-1,93118 2,556654 22,44 Повышение 2.34E-04 L33477 Человеческий (клон 8B1) Br-кадгерин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Br-cadherin /FL=gb:L34057.1 gb:L33477.1 gb:NM_004061.1
0,005876 4,456564 21,87 Повышение 6.89E-05 AK023621 Homo sapiens, кДНК FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-1,94 2,509492 21,85 Повышение 4.29E-03 NM_016569 Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
-3,44347 1,001698 21,78 Повышение 1.61E-02 AF187858 Homo sapiens, ангиопоэтин-2 изоформа-1 мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=angiopoietin-2 isoform-1 /FL=gb:AF187858.1
0,586923 5,027737 21,72 Повышение 6.55E-05 NM_000047 Homo sapiens, арилсульфатаза E (chondrodysplasia punctata 1) (ARSE), мРНК. /PROD=arylsulfatase E precursor /FL=gb:X83573.1 gb:NM_000047.1
1,422626 5,860875 21,68 Повышение 5.95E-05 NM_006365 Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
-4,18575 0,241573 21,52 Повышение 7.54E-03 NM_001736 Homo sapiens, компонента комплемента 5 рецептор 1 (лиганд C5a) (C5R1), мРНК. /PROD=complement component 5 receptor 1 (C5a ligand) /FL=gb:M62505.1 gb:NM_001736.1
2,301255 6,712959 21,28 Повышение 7.68E-05 BC020935 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
-3,61192 0,788317 21,12 Повышение 1.71E-03 R37101 Гены EST
-0,62474 3,768383 21,01 Повышение 6.55E-05 NM_000313 Homo sapiens, белок S (альфа) (PROS1), мРНК. /PROD=protein S (alpha) /FL=gb:M15036.1 gb:NM_000313.1
-0,62725 3,760374 20,93 Повышение 1.52E-04 BC017942 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
-1,52261 2,858274 20,83 Повышение 2.98E-03 NM_002614 Homo sapiens, содержащий PDZ-домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-1,11347 3,25087 20,6 Повышение 4.26E-03 N69091 Гены EST
-0,11332 4,231933 20,33 Повышение 1.05E-04 NM_003670 Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
-1,69238 2,643704 20,2 Повышение 3.73E-03 W05495 Гены EST
-2,18113 2,138504 19,97 Повышение 1.23E-02 NM_004041 Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
1,306329 5,625069 19,96 Повышение 6.90E-05 NM_001200 Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
-1,23777 3,066156 19,75 Повышение 6.27E-04 AI917371 Гены EST
-0,00098 4,266076 19,25 Повышение 9.82E-05 NM_013281 Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
-2,0132 2,250432 19,21 Повышение 1.37E-02 BE328496 гипотетический белок PRO2032 /FL=gb:AF116683.1 gb:NM_018615.1
1,758844 6,008618 19,02 Повышение 6.55E-05 N21138 белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
0,095309 4,341668 18,98 Повышение 8.55E-04 AA524250 отсутствующий при раке печени белок 1
-0,96212 3,265791 18,74 Повышение 2,04E-04 AY113699 Homo sapiens, стабилизирующий пресенилин фактор b (PSF) мРНК, полная кодовая последовательность; продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=presenilin stabilization factor b /FL=gb:AY113699.1
0,502339 4,722511 18,64 Повышение 1.04E-04 AI676059 Гены EST
-1,74369 2,474001 18,61 Повышение 7.33E-05 NM_001882 Homo sapiens, белок, связывающий кортиколиберин (CRHBP), мРНК. /PROD=corticotropin releasing hormone-binding protein /FL=gb:NM_001882.2
0,70975 4,924051 18,56 Повышение 1.64E-04 BF939489 гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-2,40752 1,7892 18,34 Повышение 4.46E-03 AI738662 гомеобокс HB9 /FL=gb:NM_005515.1
-1,34609 2,844235 18,26 Повышение 7.33E-05 NM_018388 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
-0,74044 3,448679 18,24 Повышение 7.33E-05 N63706 Гены EST
-1,55229 2,611591 17,92 Повышение 4.34E-04 AU158444 Homo sapiens, кДНК FLJ14216 fis, клон NT2RP3003672, слабая степень подобия с ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ ГЛИКОПРОТЕИНА Е2 ПОВЕРХНОСТИ Т-КЛЕТОК
0,082922 4,230149 17,72 Повышение 1.63E-04 AI632223 гипотетический белок DKFZp434F2322
-1,66293 2,482886 17,7 Повышение 1.56E-02 NM_000817 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
-1,82505 2,319685 17,69 Повышение 7.89E-03 T16257 сопряженный с G-белком рецептор 37 (белок, подобный эндотелиновому рецептору типа B) /FL=gb:NM_005302.1 gb:AF017262.1
-3,11387 1,027176 17,64 Повышение 9.68E-03 U70370 Человеческий, экспрессируемый в задних конечностях гомеобоксовый белок backfoot (Bft), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=hindlimb expressed homeobox protein backfoot /FL=gb:U70370.1 gb:BC003685.1
-0,98938 3,143558 17,54 Повышение 6.04E-03 AF190725 Homo sapiens, фермент, расщепляющий APP по бета-участку (BACE), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-site APP cleaving enzyme /FL=gb:AF200343.1 gb:AF204943.1 gb:AF190725.1 gb:AF201468.1 gb:NM_012104.1
-0,74839 3,363245 17,29 Повышение 5.33E-03 M17955 Человеческий белок MHC класса II HLA-DQ-бета, мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
2,851479 6,958929 17,24 Повышение 5.95E-05 AI950472 Гены EST
-2,85963 1,242896 17,18 Повышение 7.55E-03 BC005961 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
-1,18027 2,905057 16,97 Повышение 1.03E-02 AI123555 Гены EST
-1,53522 2,547506 16,94 Повышение 2.58E-03 NM_006456 Homo sapiens, сиалилтрансфераза (STHM), мРНК. /PROD=sialyltransferase /FL=gb:U14550.1 gb:NM_006456.1
1,620279 5,700292 16,91 Повышение 1,08E-04 AI583173 главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
1,446234 5,516116 16,79 Повышение 6.55E-05 AF348491 Homo sapiens, хемокиновый рецептор CXCR4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chemokine receptor CXCR4 /FL=gb:AF348491.1
0,880085 4,948285 16,77 Повышение 6.90E-05 NM_006096 Homo sapiens, белок с нисходящей регуляцией белком N-myc (NDRG1), мРНК. /PROD=N-myc downstream regulated /FL=gb:AF004162.1 gb:BC003175.1 gb:D87953.1 gb:NM_006096.1
-1,11823 2,945099 16,72 Повышение 1.28E-02 NM_002100 Homo sapiens, гликофорин B (включает белок группы крови Ss) (GYPB), мРНК. /PROD=glycophorin B precursor /FL=gb:J02982.1 gb:NM_002100.2
-1,68075 2,377232 16,66 Повышение 4.35E-03 NM_012431 Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен секретируемый белок (семафорин) 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
0,70158 4,759011 16,65 Повышение 1,07E-04 U46768 Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
2,429693 6,487025 16,65 Повышение 6.89E-05 AA284532 белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
1,964573 6,018949 16,61 Повышение 1.18E-04 NM_030781 Homo sapiens, скавенджер-рецептор с лектином типа C (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
0,399566 4,451136 16,58 Повышение 1.57E-04 AF144103 Homo sapiens, белок NJAC (NJAC), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NJAC protein /FL=gb:AF144103.1 gb:AF106911.1 gb:AF073957.1 gb:BC003513.1 gb:NM_004887.1
4,590104 -3,21322 223,38 Снижение 7.77E-05 AA167449 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,940449 -5,370717 158,81 Снижение 8.36E-05 BE644917 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
3,29779 -3,911445 147,98 Снижение 2.38E-05 U17496 Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
4,124115 -2,85548 126,2 Снижение 2.99E-03 AW262311 Гены EST
3,702164 -2,970402 102,01 Снижение 2.53E-03 U26662 Человеческий нейрональный пентраксин II (NPTX2) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=neuronal pentraxin II
1,785431 -4,509786 78,53 Снижение 1.45E-03 R15072 Гены EST
5,545158 -0,710745 76,42 Снижение 7.01E-05 BF057809 Гены EST
1,946332 -3,865792 56,19 Снижение 7.43E-04 BG166705 малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 5 (нейтрофил-активирующий пептид 78 эпителиального происхождения)
1,717184 -3,902593 49,17 Снижение 1.30E-04 AF237813 Homo sapiens, NPD009, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NPD009 /FL=gb:NM_020686.1 gb:AF237813.1
3,179908 -2,381796 47,23 Снижение 9.96E-04 U82811 Человеческий гомеодомен-содержащий белок (HANF), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HANF /FL=gb:U82811.1 gb:NM_003865.1
2,359289 -3,177031 46,41 Снижение 1.72E-04 NM_006334 Homo sapiens, белок нейробластомы (нервная ткань) (AMY), мРНК. /PROD=neuroblastoma (nerve tissue) protein /FL=gb:NM_006334.1 gb:D82343.1
4,276201 -1,247561 46,01 Снижение 7.33E-05 AV699347 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
2,435058 -2,963261 42,18 Снижение 1.36E-04 BF056204 Homo sapiens, клон IMAGE:3603836, мРНК, частичная кодовая последовательность
2,348373 -2,98029 40,19 Снижение 7.34E-05 NM_016354 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
4,315048 -0,819678 35,13 Снижение 3.33E-03 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
2,348717 -2,72835 33,76 Снижение 9.42E-04 NM_001877 Homo sapiens, рецептор 2 компонента комплемента (3d вируса Эпштейна-Барр) (CR2), мРНК. /PROD=complement component (3dEpstein Barr virus)receptor 2 /FL=gb:NM_001877.1 gb:M26004.1
3,342331 -1,710595 33,2 Снижение 6.55E-05 AA876372 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp667D095 (из клона DKFZp667D095)
1,995324 -3,045119 32,91 Снижение 4.60E-03 NM_014862 Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
2,890305 -2,133881 32,54 Снижение 1.71E-03 NM_015474 Homo sapiens, белок DKFZP564A032 (DKFZP564A032), мРНК. /PROD=DKFZP564A032 protein /FL=gb:AF228421.1 gb:AL050267.1 gb:AB013847.1 gb:NM_015474.1
2,443445 -2,518495 31,17 Снижение 7.43E-03 NM_152332 Homo sapiens, хромосома 14, открытая рамка считывания 47 (C14orf47), мРНК. /FL=gb:NM_152332.1
3,692792 -1,250743 30,77 Снижение 8.80E-04 N21096 Гены EST
2,266312 -2,653405 30,27 Снижение 7.22E-03 NM_003026 Homo sapiens, GRB2-подобный белок 2 с SH3-доменом (SH3GL2), мРНК. /PROD=SH3-domain GRB2-like 2 /FL=gb:AF036268.1 gb:NM_003026.1
2,453774 -2,402069 28,96 Снижение 7.93E-05 NM_007191 Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
2,325274 -2,512615 28,6 Снижение 3.19E-05 AW193693 белок DKFZP566K1924
1,982765 -2,836916 28,24 Снижение 1.21E-04 BE672659 Гены EST
0,997895 -3,793735 27,7 Снижение 3.97E-03 AW025928 Гены EST, с низкой степенью подобия с I38588, гомологом обратной транскриптазы (H.sapiens)
4,756657 0,005012 26,94 Снижение 6.55E-05 AV715309 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
4,803291 0,085342 26,32 Снижение 7.34E-05 AA628440 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
1,124153 -3,582082 26,1 Снижение 5.42E-03 W52934 Гены EST, с низкой степенью подобия с серин-треонинкиназой (C.elegans)
0,874376 -3,810554 25,72 Снижение 2.24E-02 U82671 Homo sapiens, из хромосомы Xq28 семейство меланомных антигенов A2a (MAGEA2A), семейство меланомных антигенов A12 (MAGEA12), семейство меланомных антигенов A2b (MAGEA2B), семейство меланомных антигенов A3 (MAGEA3), кальтрактин (CALT), NAD(P)H дегидрогеназа-подобный белок (NSDHL), ...
0,621075 -4,029928 25,12 Снижение 5.18E-03 BC028721 Homo sapiens, белок, сходный с переносчиком растворенных веществ, семейство 1 (высокоаффинный аспартатно-глутаматный переносчик), член 6, клон MGC:33092 IMAGE:5269300, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to solute carrier family 1 (highaffinity aspartateglutamate transporter), memb
1,49883 -3,130556 24,75 Снижение 7.87E-04 BF057784 Гены EST
2,074855 -2,552806 24,72 Снижение 1.87E-03 AI420156 Гены EST
3,2597 -1,357805 24,55 Снижение 1,05E-03 NM_017671 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20116 (FLJ20116), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20116 /FL=gb:NM_017671.1
-0,10303 -4,717227 24,49 Снижение 7.33E-05 NM_022168 Homo sapiens, связанный с дифференцировкой меланомы белок-5 (MDA5), мРНК. /PROD=melanoma differentiation associated protein-5 /FL=gb:AY017378.1 gb:NM_022168.1 gb:AF095844.1
2,688175 -1,908993 24,2 Снижение 2.73E-04 NM_014178 Homo sapiens, белок HSPC156 (HSPC156), мРНК. /PROD=HSPC156 protein /FL=gb:NM_014178.1 gb:AF161505.1
1,24677 -3,309288 23,52 Снижение 2.54E-02 BC028359 Homo sapiens, клон IMAGE:4828836, мРНК.
0,686587 -3,862863 23,42 Снижение 1.28E-03 NM_000439 Homo sapiens, пропротеинконвертаза субтилизинкексинового типа 1 (PCSK1), мРНК. /PROD=proprotein convertase subtilisinkexin type 1 /FL=gb:NM_000439.2 gb:M90753.1
5,363884 0,82261 23,28 Снижение 7.68E-05 NM_007015 Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
3,962328 -0,577927 23,27 Снижение 6.90E-05 AL533416 аксонный транспорт синаптическизх везикул
2,086969 -2,410461 22,59 Снижение 9.65E-03 AL359055 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 2344436.
0,536704 -3,939442 22,26 Снижение 4.78E-03 AL049250 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D113 (из клона DKFZp564D113).
4,260791 -0,214844 22,25 Снижение 6.89E-05 AA603344 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,121165 -4,34837 22,15 Снижение 1.36E-04 AI985987 Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN SUBFAMILY ALU J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,437404 -4,019211 21,96 Снижение 2.48E-02 H05254 Гены EST
2,263194 -2,16575 21,54 Снижение 7.34E-04 AF052108 Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
4,055226 -0,3701 21,49 Снижение 1.16E-04 NM_001307 Homo sapiens, клаудин 7 (CLDN7), мРНК. /PROD=claudin 7 /FL=gb:BC001055.1 gb:NM_001307.1
5,440506 1,023282 21,37 Снижение 1.02E-04 M34455 Человеческая индуцируемая интерфероном-гамма индоламин-2,3-диоксигеназа (IDO), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002164.1 gb:M34455.1
2,169025 -2,207268 20,77 Снижение 3.41E-03 NM_022467 Homo sapiens, N-ацетилгалактозамин-4-O-сульфотрансфераза (GALNAC-4-ST1), мРНК. /PROD=N-acetylgalactosamine-4-O-sulfotransferase /FL=gb:NM_022467.1 gb:AF300612.1
0,252976 -4,116368 20,67 Снижение 3.36E-03 NM_018043 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
1,353776 -3,010836 20,6 Снижение 2.85E-02 AF147427 Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК клон YP80A10.
2,437935 -1,918781 20,49 Снижение 1.70E-03 BE672557 Гены EST
2,46341 -1,870689 20,17 Снижение 4.16E-04 NM_003182 Homo sapiens, тахикинин, предшественник 1 (субстанция K, субстанция P, нейрокинин 1, нейрокинин 2, нейромедин L, нейрокинин альфа, нейропептид K, нейропептид гамма) (TAC1), вариант транскрипта бета, мРНК. /PROD=tachykinin 2 precursor, isoform beta /FL=gb:U3
2,294336 -2,028037 20,01 Снижение 7.10E-03 U11058 Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
4,534853 0,221559 19,88 Снижение 7.68E-05 R38389 ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
3,142124 -1,136699 19,41 Снижение 1.73E-02 AL832535 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp547J1816 (из клона DKFZp547J1816).
3,85985 -0,410223 19,29 Снижение 7.34E-05 R40892 Гены EST
4,557488 0,304559 19,07 Снижение 1,43E-04 AK026546 Homo sapiens кДНК: FLJ22893 fis, клон KAT04792.
5,966394 1,719122 18,99 Снижение 1.99E-04 AL117612 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564B1264 (из клона DKFZp564B1264).
1,212373 -3,013161 18,71 Снижение 5.22E-04 AI564075 Гены EST
2,27629 -1,932316 18,49 Снижение 1.09E-04 BC044830 Homo sapiens, белок, сходный с RIKEN кДНК ген 1700011F14, клон MGC:35062 IMAGE:5166167, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to RIKEN cDNA 1700011F14 gene /FL=gb:BC044830.1
3,18092 -1,007603 18,23 Снижение 1.29E-03 AJ011712 Homo sapiens, ген TNNT1, экзоны 1-11 (и граничащая с ним кодовая последовательность)
2,598916 -1,553059 17,78 Снижение 2.46E-03 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,003902 -2,139208 17,67 Снижение 4.71E-03 BF109660 Гены EST
1,905278 -2,229324 17,56 Снижение 5.05E-04 NM_018964 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 37 (переносчик глицерин-3-фосфата), член 1 (SLC37A1), мРНК. /PROD=solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphatetransporter), member 1 /FL=gb:NM_018964.1
0,330556 -3,792993 17,43 Снижение 3.26E-04 BE972639 Гены EST
1,044277 -3,067425 17,29 Снижение 1.23E-02 AL529104 Гены EST
0,733534 -3,349221 16,94 Снижение 4.39E-03 BF061389 Гены EST с низкой степенью подобия с JC1405 6-пирувоилтетрагидроптерин синтазой (H.sapiens)
2,684281 -1,394654 16,9 Снижение 2.91E-04 BF449063 коллаген, тип XIV, альфа 1 (ундулин)
4,572354 0,512428 16,68 Снижение 5.89E-04 BF437747 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,313549 -1,734907 16,55 Снижение 6.84E-03 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
0,679665 -3,355919 16,4 Снижение 1.43E-03 BC000568 Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
4,099873 0,092088 16,09 Снижение 6.90E-05 AI057619 Гены EST с высокой степенью подобия с T42654, гипотетическим белком DKFZp434G1115.1 (H.sapiens)
1,459269 -2,519 15,76 Снижение 6.26E-03 NM_000277 Homo sapiens, фенилаланин-гидроксилаза (PAH), мРНК. /PROD=phenylalanine hydroxylase /FL=gb:U49897.1 gb:NM_000277.1
2,220936 -1,733714 15,5 Снижение 1.34E-04 AF237813 Homo sapiens, NPD009, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NPD009 /FL=gb:NM_020686.1 gb:AF237813.1
2,81177 -1,140906 15,48 Снижение 6.89E-05 NM_002593 Homo sapiens, белок-энхансер проколлаген C-эндопептидазы (PCOLCE), мРНК. /PROD=procollagen C-endopeptidase enhancer /FL=gb:BC000574.1 gb:NM_002593.2 gb:AB008549.1 gb:L33799.1
1,529971 -2,399749 15,24 Снижение 2.29E-02 NM_024789 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22529 (FLJ22529), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22529 /FL=gb:NM_024789.1
0,255558 -3,655262 15,04 Снижение 4.26E-03 BC039509 Homo sapiens, клон IMAGE:5578073, мРНК.
0,970967 -2,921559 14,85 Снижение 4.46E-03 AI144156 Гены EST
2,38092 -1,504443 14,78 Снижение 4,36E-04 AF053712 Homo sapiens, лиганд остеопротегерина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
3,779853 -0,095194 14,67 Снижение 3.22E-04 AV646597 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,651332 -2,189895 14,33 Снижение 3.45E-03 NM_007181 Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 1 (MAP4K1), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinasekinase 1 /FL=gb:U66464.1 gb:NM_007181.1
3,786136 -0,030985 14,1 Снижение 1.49E-04 BF057731 Гены EST
3,257726 -0,553697 14,04 Снижение 4.48E-04 NM_004335 Homo sapiens, антиген 2 клеток стромы костного мозга /FL=gb:NM_004335.2 gb:D28137.1
-0,33527 -4,146199 14,03 Снижение 4.21E-03 BE968806 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,349102 -3,450633 13,93 Снижение 1.30E-02 BM682352 Homo sapiens, кДНК FLJ37204 fis, клон BRALZ2006976.
2,172559 -1,624126 13,9 Снижение 2.32E-03 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,381933 -3,390833 13,67 Снижение 1.84E-02 AI913749 Гены EST
1,120467 -2,648498 13,63 Снижение 1.85E-03 BE672607 Гены EST
1,924097 -1,801676 13,23 Снижение 8.92E-03 AW242920 Гены EST
1,491527 -2,224633 13,14 Снижение 7.01E-05 BG258131 Гены EST
2,060687 -1,652733 13,12 Снижение 5.63E-03 AI269290 переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
2,886142 -0,811762 12,98 Снижение 4.93E-04 U83115 Человеческий белок, подобный не связанному с хрусталиком бета-гамма-кристаллину (AIM1) мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=non-lens beta gamma-crystallin like protein
0,626797 -3,063928 12,91 Снижение 4.51E-02 AF393369 Homo sapiens, сигма1C-адаптин (AP1S3), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=sigma 1C adaptin /FL=gb:AF393369.1
1,575227 -2,112834 12,89 Снижение 1.85E-03 BE856544 гипотетический белок FLJ22573
0,4785 -3,197824 12,78 Снижение 1.72E-04 BG532690 интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
1,707178 -1,969084 12,78 Снижение 1.84E-02 AF043179 Homo sapiens, бета-цепь Т-клеточного рецептора (TCRBV13S1-TCRBJ2S1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=T cell receptor beta chain /FL=gb:AF043179.1
0,47298 -3,177323 12,56 Снижение 8.00E-03 AF311324 Homo sapiens, убиквитин-подобный химерный белок, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=ubiquitin-like fusion protein /FL=gb:AF311324.1
2,641731 -0,985721 12,36 Снижение 1.49E-04 AL133653 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434M2415 (из клона DKFZp434M2415).
2,913327 -0,707745 12,3 Снижение 3.70E-03 NM_012419 Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 17 (RGS17), мРНК. /PROD=regulator of G-protein signalling 17 /FL=gb:AF202257.2 gb:NM_012419.2
2,127724 -1,49095 12,28 Снижение 1.49E-03 NM_001275 Homo sapiens, хромогранин A (секреторный белок 1 паращитовидной железы) (CHGA), мРНК. /PROD=chromogranin A /FL=gb:BC001059.1 gb:NM_001275.2 gb:J03915.1 gb:J03483.1
0,80034 -2,81487 12,25 Снижение 4.62E-03 AW003107 Гены EST
2,11511 -1,494168 12,2 Снижение 1.27E-03 NM_000593 Homo sapiens, ATP-связывающая кассета, подсемейство B (MDRTAP), член 2 (ABCB2), мРНК. /PROD=ATP-binding cassette, sub-family B, member 2 /FL=gb:NM_000593.2 gb:L21205.1 gb:L21206.1 gb:L21207.1 gb:L21204.1 gb:L21208.1
3,690675 0,086414 12,16 Снижение 1.85E-03 AW274018 Гены EST
1,283746 -2,317044 12,13 Снижение 4.10E-03 NM_014031 Homo sapiens, VLCS-H1, белок-гомолог 1 очень длинной цепи ацил-КоА, мРНК. /PROD=very long-chain acyl-CoA synthetase homolog 1 /FL=gb:AF064254.1 gb:NM_014031.1
0,467003 -3,132847 12,12 Снижение 4.39E-02 AL117530 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434B172 (из клона DKFZp434B172); частичная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein
2,6402 -0,955567 12,09 Снижение 3.80E-02 NM_013267 Homo sapiens, глутаминаза клеток молочной железы (GA), мРНК. /PROD=breast cell glutaminase /FL=gb:AF110331.1 gb:AF110330.1 gb:AF223944.1 gb:NM_013267.1
1,858597 -1,724557 11,98 Снижение 5.91E-04 AA757457 Гены EST
0,945333 -2,635993 11,97 Снижение 2.41E-03 BC040959 Homo sapiens, клон IMAGE:5242616, мРНК.
3,795925 0,223304 11,9 Снижение 1.71E-03 NM_004688 Homo sapiens, белок, взаимодействующий с N-myc (и STAT) (NMI), мРНК. /PROD=N-myc and STAT interactor /FL=gb:BC001268.1 gb:NM_004688.1 gb:U32849.1
2,074972 -1,490898 11,84 Снижение 2.94E-03 NM_017933 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20701 (FLJ20701), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20701 /FL=gb:NM_017933.1
-0,42571 -3,975429 11,71 Снижение 1,54E-03 AK023699 Homo sapiens, кДНК FLJ13637 fis, клон PLACE1011165.
3,742964 0,195658 11,69 Снижение 1.19E-04 T62571 связанный с микротрубочками белок 7 /FL=gb:NM_003980.1
1,621518 -1,924672 11,68 Снижение 2.63E-02 NM_003725 Homo sapiens, окислительная 3 альфа гидроксистероид дегидрогеназа; ретинолдегидрогеназа; 3-гидроксистероидэпимераза (RODH), мРНК. /PROD=oxidative 3 alpha hydroxysteroid dehydrogenase;retinol dehydrogenase; 3-hydroxysteroid epimerase /FL=gb:AF016509.1 gb:A
6,076777 2,566425 11,4 Снижение 6.90E-05 AF229180 Homo sapiens, альфа-аминоадипат полуальдегидсинтаза, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=alpha-aminoadipate semialdehyde synthase /FL=gb:AF229180.1
3,758058 0,25238 11,36 Снижение 1.89E-04 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая белковая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
3,797019 0,297284 11,31 Снижение 2.69E-04 AI871745 Гены EST
2,469508 -1,020673 11,24 Снижение 9.14E-04 W63754 Homo sapiens, мРНК гикозилтрансферазы (ORF1)
1,048359 -2,438018 11,21 Снижение 1.39E-02 AA464273 Гены EST
3,146674 -0,339455 11,21 Снижение 1.26E-04 BF435773 белок, связывающий SH3-домен кортактина
1,627801 -1,848139 11,13 Снижение 3.70E-03 L39833 Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
1,594689 -1,879508 11,11 Снижение 4.03E-02 AJ236915 Homo sapiens, мРНК белка pak5. /PROD=pak5 protein /FL=gb:NM_020168.1 gb:AF276893.1
2,806504 -0,6571 11,03 Снижение 1.21E-04 NM_003645 Homo sapiens, лигаза жирных кислот-коэнзима А, очень длинная цепь 1 (FACVL1), мРНК. /PROD=very long-chain fatty-acid-Coenzyme A ligase 1 /FL=gb:AF096290.1 gb:D88308.1 gb:NM_003645.1
3,826815 0,364324 11,02 Снижение 6.55E-05 BG401568 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434H1235 (из клона DKFZp434H1235); частичная кодовая последовательность
2,99034 -0,471936 11,02 Снижение 7.16E-04 NM_002993 Homo sapiens, малый индуцибельный цитокин, подсемейство B (Cys-X-Cys), член 6 (гранулоцитарный хемотактический белок 2) (SCYB6), мРНК. /PROD=small inducible cytokine subfamily B(Cys-X-Cys), member 6 (granulocyte chemotactic protein 2) /FL=gb:U81234.1 gb:NM_00299
3,788599 0,329467 11 Снижение 8.58E-05 NM_002252 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, выпрямитель с задержкой, подсемейство S, член 3 (KCNS3), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel,delayed-rectifier, subfamily S, member 3 /FL=gb:AF043472.1 gb:NM_002252.1 gb:BC004987.1 gb:BC004148.1
4,397278 0,939176 10,99 Снижение 1,22E-04 NM_021614 Homo sapiens, активируемый кальцием калиевый канал с промежуточной и малой проводимостью, подсемейство N, член 2 (KCNN2), мРНК. /PROD=potassium intermediatesmall conductancecalcium-activated channel, subfamily N, member 2 /FL=gb:NM_021614.1 gb:AF239613.1
1,027188 -2,423197 10,93 Снижение 1.22E-03 BG169832 аденилаткиназа 5 /FL=gb:NM_012093.1 gb:AF062595.1
1,022495 -2,421211 10,88 Снижение 2.47E-02 BC002832 Homo sapiens, белок, сходный с бутирофилином, подсемейство 3, член A2, клон MGC:3790, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to butyrophilin, subfamily 3, member A2 /FL=gb:U90144.1 gb:NM_007047.1 gb:U90546.1 gb:BC002832.1
0,311203 -3,122447 10,81 Снижение 1.70E-03 AI964053 Гены EST
1,673874 -1,728682 10,57 Снижение 2.25E-03 NM_005965 Homo sapiens, киназа легкого полипептида миозина (MYLK), мРНК. /PROD=myosin, light polypeptide kinase /FL=gb:AB037663.1 gb:AF069601.2 gb:NM_005965.1
1,443731 -1,955774 10,55 Снижение 1.43E-03 AJ272267 Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
0,383563 -3,004508 10,47 Снижение 2.48E-02 AI377688 Гены EST
0,995551 -2,39165 10,46 Снижение 5.14E-03 NM_005386 Homo sapiens, нейронатин (NNAT), мРНК. /PROD=neuronatin /FL=gb:NM_005386.1 gb:BC001768.1 gb:AB002392.1 gb:U25033.1
3,45531 0,070626 10,44 Снижение 1.94E-04 AV733308 интегрин, альфа 6
3,527039 0,143408 10,44 Снижение 5.95E-05 BG283790 Гены EST
2,950823 -0,418278 10,33 Снижение 1.38E-03 NM_003645 Homo sapiens, лигаза жирных кислот-коэнзима А, очень длинная цепь 1 (FACVL1), мРНК. /PROD=very long-chain fatty-acid-Coenzyme A ligase 1 /FL=gb:AF096290.1 gb:D88308.1 gb:NM_003645.1
1,55078 -1,80799 10,26 Снижение 3.70E-03 H28597 тимопоэтин
5,005827 1,649812 10,24 Снижение 1.90E-04 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
0,760646 -2,590248 10,2 Снижение 2.29E-02 AW589793 Гены EST
2,209313 -1,126222 10,09 Снижение 5.95E-05 AA747379 полипептид, связанный с кальцитонином, бета /FL=gb:NM_000728.1
-0,10418 -3,43217 10,04 Снижение 4.66E-03 NM_017655 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20075 (FLJ20075), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20075 /FL=gb:NM_017655.1
2,598488 -0,722855 10 Снижение 2.03E-03 L08599 Человеческий увоморулин (E-кадгерин) (UVO), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=uvomorulin /FL=gb:NM_004360.1 gb:L08599.1
1,858219 -1,457169 9,95 Снижение 1.81E-03 NM_005084 Homo sapiens, фосфолипаза A2, группа VII (ацетилгидролаза фактора активации тромбоцитов, плазматическая) (PLA2G7), мРНК. /PROD=phospholipase A2, group VII (platelet-activatingfactor acetylhydrolase, plasma) /FL=gb:U20157.1 gb:U24577.1 gb:NM_005084.1
1,910263 -1,3945 9,88 Снижение 1.27E-03 NM_006994 Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
2,001097 -1,297629 9,84 Снижение 1,19E-03 BC028721 Homo sapiens, белок, сходный с переносчиком растворенных веществ, семейство 1 (высокоаффинный аспартатно-глутаматный переносчик), член 6, клон MGC:33092 IMAGE:5269300, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to solute carrier family 1 (highaffinity aspartateglutamate transporter), memb
5,020283 1,723791 9,83 Снижение 1.63E-04 AK025084 Homo sapiens кДНК: FLJ21431 fis, клон COL04214, высокая степень подобия с HSU80736, Homo sapiens CAGF9, мРНК.
2,474373 -0,811562 9,75 Снижение 5.94E-03 NM_013272 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 11 (SLC21A11), мРНК. /PROD=solute carrier family 21 (organic aniontransporter), member 11 /FL=gb:NM_013272.2 gb:AF205074.1 gb:AB031050.2 gb:AF187816.1
2,116702 -1,16308 9,71 Снижение 4.40E-02 AF107846 Homo sapiens, ген нейроэндокрин-специфичного белка Гольджи p55 (XLalphas), экзон XL2 и полная кодовая последовательность
2,472358 -0,803312 9,68 Снижение 2.33E-03 NM_000363 Homo sapiens, тропонин I, сердечный (TNNI3), мРНК. /PROD=troponin I, cardiac /FL=gb:M64247.1 gb:NM_000363.1
0,384182 -2,880367 9,61 Снижение 4.26E-03 NM_005825 Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 2 (calcium andDAG-regulated) /FL=gb:AF043723.1 gb:NM_005825.1
2,394742 -0,866876 9,59 Снижение 1.57E-04 AI733027 Гены EST, слабая степень подобия с RET2_HUMAN, РЕТИНОЛ-СВЯЗЫВАЮЩИМ БЕЛКОМ II, КЛЕТОЧНЫМ (H.sapiens)
1,319792 -1,930717 9,52 Снижение 5.95E-05 M18767 Человеческий подкомпонент комплемента C1s, альфа- и бета-цепи, полная кодовая последовательность /FL=gb:J04080.1 gb:M18767.1 gb:NM_001734.1
3,859451 0,610002 9,51 Снижение 5.73E-04 AJ242502 Homo sapiens, мРНК эпителиального белка, связанного с микротрубочками, E-MAP-115105 (ген MAP). /PROD=epithelial microtubule-associated protein
3,009579 -0,239729 9,51 Снижение 5.22E-04 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
2,600702 -0,646217 9,49 Снижение 1.43E-02 AA740186 биливердин-редуктаза A /FL=gb:NM_000712.1 gb:U34877.1
0,971941 -2,274152 9,49 Снижение 7.72E-04 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
0,414323 -2,829854 9,48 Снижение 6.30E-03 AF283777 Homo sapiens, клон TCBAP0702, последовательность мРНК.
6,139688 2,900659 9,44 Снижение 4.48E-04 BC036488 Homo sapiens, клон MGC:43145 IMAGE:5261574, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:43145) /FL=gb:BC036488.1
1,569503 -1,668679 9,44 Снижение 1.24E-03 BF195118 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,665643 -1,567308 9,4 Снижение 8.63E-04 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
4,319584 1,104655 9,29 Снижение 5.53E-04 AA618420 Homo sapiens кДНК: FLJ23597 fis, клон LNG15281
4,436354 1,227541 9,25 Снижение 2.94E-04 AI912275 белок B-клеточной CLL / лимфомы 11A (цинк-пальцевый белок) /FL=gb:NM_022893.1 gb:NM_018014.1
1,923237 -1,283751 9,23 Снижение 3.70E-03 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
2,59299 -0,613677 9,23 Снижение 1.94E-04 NM_003887 Homo sapiens, усиливающий развитие и дифференцировку фактор 2 (DDEF2), мРНК. /PROD=ADP-ribosylation factor(arf)-directed GTPaseactivating protein /FL=gb:AB007860.1 gb:NM_003887.1
3,20248 0,002668 9,19 Снижение 5.80E-04 AF220153 Homo sapiens, содержащий четыре с половиной LIM-домена белок 1, изоформа C (FHL1), мРНК, полная кодовая последовательность, продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=four and a half LIM domains 1 protein isoform C /FL=gb:AF220153.1
1,689335 -1,505873 9,16 Снижение 2.46E-03 NM_031272 Homo sapiens, экспрессируемая в семенниках последовательность 14 (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
3,026209 -0,167981 9,15 Снижение 6.90E-05 BC032302 Homo sapiens, белок, сходный с УДФ-глюкозо-церамид-глюкозилтрансфераза-подобным белком 2, клон MGC:40268 IMAGE:5169731, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=similar to UDP-glucose ceramideglucosyltransferase-like 2 /FL=gb:BC032302.1
3,116245 -0,070826 9,11 Снижение 7.93E-05 NM_017947 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20733 (FLJ20733), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20733 /FL=gb:NM_017947.1
2,91664 -0,26326 9,06 Снижение 1.68E-03 AW003367 Homo sapiens, клон 25237, последовательность мРНК
4,453662 1,27718 9,04 Снижение 7.33E-05 AV681807 гомолог 3 онкогена вируса птичьей эритробластической лейкемии v-erb-b2
3,454075 0,278604 9,03 Снижение 1.86E-04 AV691491 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp564D1462 (из клона DKFZp564D1462)
1,883578 -1,291525 9,03 Снижение 2.67E-02 BF970287 Человеческая ДНК-последовательность от клонирования RP1-310O13 на хромосоме 20q11.2. Содержит (части) четырех новых генов, EST, STS, GSS и четыре предполагаемых CpG-островка
2,326737 -0,838174 8,97 Снижение 2.61E-03 NM_015982 Homo sapiens, специфичный для зародышевых клеток Y-бокс-связывающий белок (LOC51087), мРНК. /PROD=germ cell specific Y-box binding protein /FL=gb:NM_015982.1 gb:AF096834.1
0,392456 -2,771428 8,96 Снижение 2.73E-02 NM_003007 Homo sapiens, семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
3,116953 -0,041715 8,93 Снижение 3.90E-04 AA469071 Кластер включает AA469071:ne17f11.s1 Homo sapiens кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-881517 /clone_end=3 /gb=AA469071 /gi=2195605 /ug=Hs.180479 /len=758
3,113317 -0,040507 8,9 Снижение 2.36E-03 AL565745 Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
5,010828 1,86984 8,82 Снижение 3.28E-04 AK027006 Homo sapiens кДНК: FLJ23353 fis, клон HEP14321, высокая степень подобия с HSU80736, Homo sapiens CAGF9, мРНК.
3,249727 0,113464 8,79 Снижение 2.14E-04 BC001745 Homo sapiens, клон MGC:3328, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:3328) /FL=gb:BC001745.1 gb:NM_014392.1
1,532208 -1,601117 8,77 Снижение 3.19E-03 AI796813 адвиллин
5,063502 1,934512 8,75 Снижение 1.01E-04 AB018289 Homo sapiens мРНК белка KIAA0746, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0746 protein
1,934415 -1,192238 8,73 Снижение 3.13E-03 NM_001351 Homo sapiens, белок, подобный белку, отсутствующему при азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
2,522705 -0,592752 8,67 Снижение 9.13E-03 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
3,995648 0,881994 8,66 Снижение 6.55E-05 AI961231 продукт гена KIAA0808 /FL=gb:AB018351.1 gb:NM_014729.1
2,077151 -1,020617 8,56 Снижение 7.33E-05 BF223193 ядерный рецептор, подсемейство 1, группа I, член 3
6,650173 3,554864 8,55 Снижение 8.55E-04 NM_004360 Homo sapiens, кадгерин 1, тип 1, E-кадгерин (эпителиальный) (CDH1), мРНК. /PROD=cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) /FL=gb:NM_004360.1 gb:L08599.1
1,440541 -1,650241 8,52 Снижение 1.11E-03 BE503640 Гены EST
1,344522 -1,721548 8,37 Снижение 1.97E-02 AW071705 дипептидилпептидаза VI
4,319671 1,253603 8,37 Снижение 1.05E-04 AF063002 Homo sapiens, LIM-белок SLIMMER, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=LIM protein SLIMMER /FL=gb:AF063002.1 gb:AF098518.1
2,575606 -0,489298 8,37 Снижение 1.24E-03 BC016785 Homo sapiens, белок, сходный с гипотетическим белком PRO1722, клон IMAGE:4096414, мРНК.
1,070412 -1,992167 8,35 Снижение 7.29E-04 AF070642 Homo sapiens, клон 24488, последовательность мРНК.
3,083054 0,021788 8,35 Снижение 2.33E-03 BC026969 Homo sapiens, клон IMAGE:5116073, мРНК, частичная кодовая последовательность.
6,075972 3,015223 8,34 Снижение 1.35E-04 NM_001449 Homo sapiens, содержащий четыре с половиной LIM-домена белок 1 (FHL1), мРНК. /PROD=four and a half LIM domains 1 /FL=gb:U60115.1 gb:NM_001449.1 gb:U29538.1
0,779095 -2,27952 8,33 Снижение 1,58E-02 AF497717 Homo sapiens, неизвестный белок, тип ткани - легкие, мРНК.
4,227241 1,173625 8,3 Снижение 3.47E-04 AI193252 Гены EST, с низкой степенью подобия с AF133270 1 SLIT2 (H.sapiens)
1,139113 -1,908335 8,27 Снижение 1.40E-02 AI741469 Гены EST
3,120689 0,079671 8,23 Снижение 6.27E-04 U01874 Человеческий белок me20m, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=me20m /FL=gb:NM_006928.1 gb:BC001414.1 gb:U01874.1
3,499377 0,460367 8,22 Снижение 2.16E-03 NM_024572 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12691 (FLJ12691), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12691 /FL=gb:NM_024572.1
2,568736 -0,463022 8,18 Снижение 4.78E-03 AA531287 Гены EST
Таблица VI
РАЗЛИЧИЕ в экспрессии генов между недифференцированными эмбриональными стволовыми клетками, культивированными на матриксе MATRIGELTM и клетками EXPRES 01 (a) и 02 (b), культивированными на TCPS
A) Сравнение клеток H9 P39 на 2 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01 2 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-3,61621 3,301718 120,92 Повышение 0,001179 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044 4,320344 49,89 Повышение 0,005081 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747 2,331072 43,97 Повышение 0,000718 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,3376 2,787516 34,9 Повышение 0,000229 U17496 Человеческая протеасомная субъединица LMP7 (аллель LMP7B), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=proteasome subunit LMP7 /FL=gb:U17497.1 gb:U17496.1
-0,27888 4,715023 31,86 Повышение 0,000339 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-1,56608 3,343812 30,06 Повышение 0.009753 NM_000767 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
0,756526 5,558453 27,89 Повышение 0,000271 NM_003012 Homo sapiens, секретированный frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,03397 3,688335 26,4 Повышение 0,000308 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-1,64839 2,654165 19,73 Повышение 0,000963 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-0,41404 3,88291 19,66 Повышение 0,00068 AI332407 секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-4,55112 -0,49607 16,62 Повышение 0,040292 NM_018043 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10261 (FLJ10261), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10261 /FL=gb:NM_018043.1
-2,38787 1,639634 16,31 Повышение 0,010236 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-2,506 1,482042 15,87 Повышение 0,000737 AW193693 белок DKFZP566K1924
-1,89835 2,076299 15,72 Повышение 0,000308 AL122010 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-997D16 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит часть гена белка DAP-1, гены STS, GSS и островок CpG
-2,80061 1,027087 14,2 Повышение 0.005931 NM_014624 Homo sapiens, S100 кальций-связывающий белок A6 (кальциклин) (S100A6), мРНК. /PROD=S100 calcium-binding protein A6 /FL=gb:NM_014624.2 gb:BC001431.1
-1,56046 2,251934 14,05 Повышение 0,009772 NM_016354 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 21 (переносчик органических анионов), член 12 (SLC21A12), мРНК. /PROD=organic anion transporter OATP-E /FL=gb:AB031051.1 gb:NM_016354.1 gb:AF205072.1 gb:AF187817.1
1,109291 4,853054 13,4 Повышение 0,000308 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,69521 1,04038 13,32 Повышение 0,000271 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
1,168713 4,897416 13,26 Повышение 0,001059 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-3,05488 0,645316 13 Повышение 0,001719 AI569804 Гены EST
-0,10733 3,574485 12,83 Повышение 0,001042 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-3,12055 0,460578 11,97 Повышение 0,018849 AW780006 Гены EST
-0,8902 2,675714 11,84 Повышение 0,001172 NM_022034 Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстерогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
-2,233 1,292642 11,52 Повышение 0,002196 NM_014862 Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-1,16113 2,362911 11,5 Повышение 0,007894 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
-2,7484 0,710709 11 Повышение 0,006544 BC000568 Homo sapiens, клон MGC:3040, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:3040) /FL=gb:BC000568.1
-2,89467 0,509405 10,59 Повышение 0,010729 AW971205 Гены EST
-1,66608 1,669381 10,09 Повышение 0,01208 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-1,38062 1,947029 10,04 Повышение 0,000277 NM_002590 Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
1,12675 4,40089 9,67 Повышение 0,000277 AA206141 Гены EST
-0,04543 3,208344 9,54 Повышение 0,000875 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-3,12304 0,081126 9,22 Повышение 0,025215 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
-2,26295 0,940715 9,21 Повышение 0,013376 AI735586 Гены EST
3,061783 6,265115 9,21 Повышение 0,000149 BF057809 Гены EST
-1,57619 1,598447 9,03 Повышение 0,001707 AW072790 контактин 1
1,260638 4,356898 8,55 Повышение 0,000408 AA404269 Гены EST
-1,79406 1,19242 7,93 Повышение 0,023768 NM_004731 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 7 (SLC16A7), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 7 /FL=gb:AF058056.1 gb:NM_004731.1
-1,25121 1,703716 7,75 Повышение 0,000875 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-2,01579 0,901094 7,55 Повышение 0,014339 AI937060 белок KIAA1151
0,194248 3,083487 7,41 Повышение 0,002413 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,17012 0,714641 7,39 Повышение 0,011075 AB018580 Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
1,872557 4,741366 7,3 Повышение 0,000311 R38389 ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
-1,81469 1,042382 7,25 Повышение 0,007408 AF052108 Homo sapiens, клон 23687, последовательность мРНК.
-1,51616 1,329372 7,19 Повышение 0,007084 AJ272267 Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-0,54428 2,289592 7,13 Повышение 0,000308 AF053712 Homo sapiens, лиганд остеопротегирина, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=osteoprotegerin ligand /FL=gb:AF053712.1 gb:AF019047.1
-3,17826 -0,38807 6,92 Повышение 0,040995 AI798098 Гены EST
-1,88254 0,903098 6,9 Повышение 0,007894 BF694956 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-1,27392 1,501511 6,85 Повышение 0,036787 U11058 Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
-1,89628 0,858329 6,75 Повышение 0,001372 AA557324 Гены EST с низкой степенью подобия с жирнокислотной омега-гидроксилазой (H.sapiens)
-2,62694 0,10781 6,66 Повышение 0,017924 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-0,69028 2,041376 6,64 Повышение 0,001589 M16276 Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
1,037668 3,763873 6,62 Повышение 0,00068 R40892 Гены EST
-1,4606 1,25243 6,56 Повышение 0,001042 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-2,07873 0,629421 6,53 Повышение 0,006819 AI269290 переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
-1,17422 1,532018 6,53 Повышение 0,009466 AI962169 Гены EST
-1,85153 0,844198 6,48 Повышение 0,022892 AL359062 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 1913076.
-0,32746 2,355449 6,42 Повышение 0,000657 L39833 Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
-0,62283 2,054006 6,39 Повышение 0,000522 NM_001351 Homo sapiens, белок, подобный белку, отсутствующему при азооспермии (DAZL), мРНК. /PROD=deleted in azoospermia-like /FL=gb:U66726.2 gb:NM_001351.1 gb:U65918.1 gb:U66078.1
-0,04433 2,61928 6,34 Повышение 0,001042 NM_007191 Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
0,462867 3,108247 6,26 Повышение 0,006847 AI807026 Гены EST
1,37261 4,006097 6,21 Повышение 0,000311 BC040605 Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
0,997757 3,610644 6,12 Повышение 0,000246 AU144892 Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
2,214091 4,82397 6,1 Повышение 0,000277 N98595 Гены EST
-0,58317 2,018483 6,07 Повышение 0,000412 AL563460 GATA-связывающий белок 2 /FL=gb:M68891.1
-3,21441 -0,62151 6,03 Повышение 0,033157 NM_021981 Homo sapiens, белок, связанный с предшественниками TNK-клеток (1D12A), мРНК. /PROD=pre-TNK cell associated protein /FL=gb:L17325.1 gb:NM_021981.1
-1,61054 0,964359 5,96 Повышение 0,005872 AW264204 Гены EST
-0,46577 2,083834 5,85 Повышение 0,00021 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-1,09181 1,45367 5,84 Повышение 0,027071 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-1,64801 0,893628 5,82 Повышение 0,000875 AW779917 Гены EST
-0,49174 2,041917 5,79 Повышение 0,005081 NM_002522 Homo sapiens, нейрональный пентраксин I (NPTX1), мРНК. /PROD=neuronal pentraxin I precursor /FL=gb:NM_002522.1 gb:U61849.1
-0,7841 1,740263 5,75 Повышение 0,00111 BF672975 липопротеин-липаза /FL=gb:M15856.1 gb:NM_000237.1
-0,75335 1,769582 5,75 Повышение 0,01551 AK023900 Homo sapiens кДНК FLJ13838 fis, клон THYRO1000756, с низкой степенью подобия с АЛЬФА-N-АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМИНИД АЛЬФА-2,6-СИАЛИЛТРАНСФЕРАЗОЙ (EC 2.4.99.-). /FL=gb:NM_013443.1 gb:AB035173.1
1,174608 3,695562 5,74 Повышение 0,001082 AI659533 Взаимодействующий с ArgAbl белок ArgBP2
-2,3444 0,162277 5,68 Повышение 0,00079 AW057589 Гены EST
-1,70607 0,798713 5,68 Повышение 0,006868 BC040321 Homo sapiens, белок, сходный с LIM-содержащим гомеобоксовым белком 8, клон IMAGE:4839343, мРНК.
-1,11642 1,371492 5,61 Повышение 0,016088 BC000185 Homo sapiens, белок, сходный с карнитин-пальмитоилтрансферазой I, печеночной, клон MGC:1772, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to carnitine palmitoyltransferase I,liver /FL=gb:BC000185.1
2,631289 5,118301 5,61 Повышение 0,002033 AK026546 Homo sapiens кДНК: FLJ22893 fis, клон KAT04792.
-1,99418 0,464132 5,5 Повышение 0,002048 NM_006994 Homo sapiens, бутирофилин, подсемейство 3, член A3 (BTN3A3), мРНК. /PROD=butyrophilin, subfamily 3, member A3 /FL=gb:U90548.1 gb:NM_006994.2
-2,05438 0,400672 5,48 Повышение 0,047179 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,0881 2,345496 5,4 Повышение 0,001106 AL565745 Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
-1,67442 0,753821 5,38 Повышение 0,004073 AW117456 нейротримин
-0,2823 2,124629 5,3 Повышение 0,006868 NM_016582 Homo sapiens, переносчик пептидов 3 (LOC51296), мРНК. /PROD=peptide transporter 3 /FL=gb:NM_016582.1 gb:AB020598.1
-0,08433 2,303971 5,24 Повышение 0.003841 NM_000767 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
-0,49385 1,890277 5,22 Повышение 0,005872 AI741439 Гены EST
2,372618 4,749882 5,2 Повышение 0,000339 NM_007015 Homo sapiens, предшественник хондромодулина I (CHM-I), мРНК. /PROD=chondromodulin I precursor /FL=gb:NM_007015.1 gb:AB006000.1
0,650035 3,011594 5,14 Повышение 0,011507 NM_004744 Homo sapiens, лецитин-ретинол-ацилтрансфераза (фосфатидилхолин--ретинол O-ацилтрансфераза) (LRAT), мРНК. /PROD=lecithin retinol acyltransferase(phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) /FL=gb:NM_004744.1 gb:AF071510.1
-1,60594 0,753467 5,13 Повышение 0,027018 AL050090 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586F1018 (из клона DKFZp586F1018). /PROD=hypothetical protein
4,239108 6,593362 5,11 Повышение 0,001589 BG542521 пируват-дегидрогеназы фосфатаза /FL=gb:NM_018444.1 gb:AF155661.1
0,040412 2,375678 5,05 Повышение 0,00034 AA960844 Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
1,986226 4,31181 5,01 Повышение 0,000576 NM_018444 Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы фосфатаза (PDP), мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase phosphatase /FL=gb:NM_018444.1 gb:AF155661.1
3,409815 -3,01948 86,18 Снижение 0,000948 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
5,388254 -0,10197 44,95 Снижение 0,000308 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094183 -2,07205 35,91 Снижение 0,000277 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
4,092731 -0,56561 25,25 Снижение 0,000149 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,990178 -1,65945 25,1 Снижение 0,012588 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
6,777916 2,398415 20,81 Снижение 0,000465 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
2,469646 -1,82868 19,68 Снижение 0,035416 N76327 Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
2,306111 -1,98162 19,53 Снижение 0,000324 AI632223 гипотетический белок DKFZp434F2322
3,834572 -0,18549 16,22 Снижение 0,001082 NM_002610 Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
1,790331 -2,19355 15,82 Снижение 0,001383 AA775681 гипотетический белок FLJ23091
2,770179 -1,16728 15,32 Снижение 0,000149 AK000345 Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,025351 -0,90644 15,26 Снижение 0,000718 AW590925 Гены EST
4,505436 0,7876 13,16 Снижение 0,000277 W57613 Гены EST
4,749034 1,283923 11,04 Снижение 0,001992 NM_002130 Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
2,792215 -0,63797 10,78 Снижение 0,000308 BC017942 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
1,80547 -1,58337 10,47 Снижение 0,003516 NM_000817 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD67, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD67 /FL=gb:NM_000817.1 gb:M81883.1 gb:L16888.1
5,095598 1,712881 10,43 Снижение 0,003841 NM_005542 Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
3,268087 -0,094 10,28 Снижение 0,000308 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
4,161028 0,812032 10,19 Снижение 0,01551 BC005807 Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,62025 -0,70119 10 Снижение 0,002196 AA625683 Гены EST
1,840613 -1,45068 9,79 Снижение 0,004024 AI949760 Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
1,389794 -1,83973 9,38 Снижение 0,001383 BG498699 Гены EST
1,075159 -2,15236 9,37 Снижение 0,002413 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
0,757197 -2,44574 9,21 Снижение 0,036787 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,831091 -2,3635 9,16 Снижение 0,026606 NM_153036 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
4,507212 1,314761 9,14 Снижение 0,000772 AW196940 Гены EST
1,194285 -1,99568 9,13 Снижение 0,018647 NM_001898 Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
3,030236 -0,13469 8,97 Снижение 0,001421 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,422113 -0,73175 8,9 Снижение 0,012832 AL544576 Гены EST
6,091008 2,976341 8,66 Снижение 0,000149 BC020935 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
5,023981 1,92526 8,57 Снижение 0,000702 NM_006472 Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,285883 1,193881 8,53 Снижение 0,000308 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
6,371229 3,380355 7,95 Снижение 0,000277 AI950472 Гены EST
3,953402 0,998399 7,75 Снижение 0,000728 BC005369 Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
2,759117 -0,13047 7,41 Снижение 0,000277 AI692523 Гены EST
1,143234 -1,73889 7,37 Снижение 0,018647 BF437711 Гены EST
2,36447 -0,49577 7,26 Снижение 0,000358 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
2,514693 -0,33184 7,19 Снижение 0,000412 NM_145032 Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
1,956681 -0,85067 7 Снижение 0,045693 NM_005242 Homo sapiens, подобный рецептору фактора коагуляции II (тромбина) белок 1 (F2RL1), мРНК. /PROD=coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1precursor /FL=gb:U34038.1 gb:NM_005242.2
4,103964 1,313863 6,92 Снижение 0,000149 AA579773 Гены EST
4,501184 1,716877 6,89 Снижение 0,000149 AK000162 Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,660133 -0,12206 6,88 Вниз 0.000412 AF277174 Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
4,560288 1,812725 6,72 Снижение 0,049122 BF979497 скваленэпоксидаза
0,300578 -2,4423 6,69 Снижение 0,047414 AI110886 протимозин альфа (генная последовательность 28)
3,816817 1,093203 6,61 Снижение 0,008646 AF116616 Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
7,047717 4,332472 6,57 Снижение 6.33E-05 NM_004052 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
4,897427 2,262649 6,21 Снижение 0,000149 R06655 Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
4,424942 1,790634 6,21 Снижение 0,010942 AF493929 Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 5 (RGS5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=regulator of G protein signalling 5 /FL=gb:AF493929.1
2,28595 -0,34058 6,18 Снижение 0,001421 BE504838 Гены EST
2,276913 -0,33923 6,13 Снижение 0,045179 AK025909 Homo sapiens кДНК: FLJ22256 fis, клон HRC02860.
2,33099 -0,27829 6,1 Снижение 0,020405 NM_004041 Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
5,319714 2,718977 6,07 Снижение 0,00034 AL117352 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
6,618477 4,029022 6,02 Снижение 0,000267 AU146532 киназа пируватдегидрогеназы, изофермент 1
2,658828 0,094296 5,92 Снижение 0,000277 NM_024603 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11588 (FLJ11588), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11588 /FL=gb:NM_024603.1
3,806044 1,246883 5,89 Снижение 0,001383 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
4,782763 2,225157 5,89 Снижение 0,000229 NM_004199 Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
2,350127 -0,15742 5,69 Снижение 0,001603 AK026106 Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
5,979532 3,475949 5,67 Снижение 0,038914 U18197 Человеческая АТФ:цитрат-лиаза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ATP:citrate lyase /FL=gb:U18197.1
2,322104 -0,13595 5,49 Снижение 0,001082 AW291369 Гены EST
2,951696 0,4944 5,49 Снижение 0,004024 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
2,265595 -0,17155 5,42 Снижение 0,00303 NM_022144 Homo sapiens, белок миодулин (LOC64102), мРНК. /PROD=myodulin protein /FL=gb:AB055421.1 gb:AF191770.1 gb:NM_022144.1 gb:AF234259.1
5,606506 3,176643 5,39 Снижение 0,000149 NM_013409 Homo sapiens, фоллистатин (FST), вариант транскрипта FST344, мРНК. /PROD=follistatin isoform FST344 precursor /FL=gb:NM_013409.1 gb:BC004107.1
4,03305 1,617698 5,33 Снижение 0,000512 BE300521 индуцируемый инсулином ген 1 /FL=gb:NM_005542.1
5,294065 2,87892 5,33 Снижение 0,01743 AF279899 Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
5,807319 3,40016 5,3 Снижение 0,000277 NM_018004 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
2,64743 0,242871 5,29 Снижение 0,00111 AI702438 Гены EST
4,257559 1,873346 5,22 Снижение 0,00021 NM_006365 Homo sapiens, активатор транскрипции промотера c-fos (CROC4), мРНК. /PROD=transcriptional activator of the c-fos promoter /FL=gb:NM_006365.1 gb:U49857.1
B) Сравнение клеток H9 P39 на 6 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01 6 Ч СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-3,61621 3,039489 100,82 Повышение 0,001521 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044 4,397292 52,63 Повышение 0,005415 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747 2,554429 51,34 Повышение 0,000785 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-1,56608 3,285259 28,87 Повышение 0,010886 NM_000767 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
0,756526 5,442022 25,73 Повышение 0,000181 NM_003012 Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,03397 3,570137 24,32 Повышение 0,000451 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-0,27888 4,229001 22,75 Повышение 0,000262 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-0,41404 4,064841 22,3 Повышение 0,000713 AI332407 секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,64839 2,511027 17,87 Повышение 0,001081 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-0,10733 3,921888 16,33 Повышение 0,001963 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,89835 2,08573 15,82 Повышение 0,000268 AL122010 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-997D16 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит часть гена белка DAP-1, гены STS, GSS и островок CpG
-2,38787 1,510394 14,91 Повышение 0,012419 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
1,168713 4,97383 13,98 Повышение 0,000908 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
1,109291 4,713388 12,16 Повышение 0,000639 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-0,69028 2,890465 11,96 Повышение 0,001335 M16276 Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-2,89467 0,604102 11,3 Повышение 0,009629 AW971205 Гены EST
-1,66608 1,816524 11,18 Повышение 0,011253 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
3,061783 6,476101 10,66 Повышение 0,000192 BF057809 Гены EST
1,495888 4,907617 10,64 Повышение 0,000719 NM_002133 Homo sapiens, гем-оксигеназа (дециклирующая) 1 (HMOX1), мРНК. /PROD=heme oxygenase (decyclizing) 1 /FL=gb:NM_002133.1
-3,05488 0,24579 9,85 Повышение 0,002819 AI569804 Гены EST
-2,233 1,058708 9,79 Повышение 0,002994 NM_014862 Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-3,588 -0,31418 9,67 Повышение 0,048375 AI743261 Гены EST
-2,01579 1,241268 9,56 Повышение 0,012905 AI937060 белок KIAA1151
-2,16864 1,08358 9,53 Повышение 0,053176 NM_001480 Homo sapiens, галаниновый рецептор 1 (GALR1), мРНК. /PROD=galanin receptor 1 /FL=gb:NM_001480.2 gb:U23854.1 gb:L34339.1 gb:U53511.1
-1,39784 1,792634 9,13 Повышение 0,006895 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-1,79406 1,292814 8,5 Повышение 0,025849 NM_004731 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 7 (SLC16A7), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 7 /FL=gb:AF058056.1 gb:NM_004731.1
-0,04543 3,025604 8,4 Повышение 0,001481 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-2,62694 0,426879 8,3 Повышение 0,015097 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-3,17826 -0,15901 8,11 Повышение 0,032029 AI798098 Гены EST
1,875596 4,86264 7,93 Повышение 0,052512 M10098 Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-2,87679 0,053356 7,62 Повышение 0,045164 AI378647 Гены EST
-2,39234 0,513238 7,49 Повышение 0,032932 NM_004389 Homo sapiens, катенин (белок, связанный с кадгеринами), альфа 2 (CTNNA2), мРНК. /PROD=catenin (cadherin-associated protein), alpha 2 /FL=gb:NM_004389.1 gb:M94151.2
-1,16113 1,724952 7,39 Повышение 0,016804 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
0,194248 3,078427 7,38 Повышение 0,002349 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,57619 1,300336 7,34 Повышение 0,003836 AW072790 контактин 1
2,284174 5,158015 7,33 Повышение 0,031092 M10098 Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-1,51992 1,341829 7,27 Повышение 0,008657 AA460960 H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
0,462867 3,324494 7,27 Повышение 0,005747 AI807026 Гены EST
-2,05438 0,78321 7,15 Повышение 0,031227 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,997757 3,818432 7,06 Повышение 0,000204 AU144892 Homo sapiens, кДНК FLJ11569 fis, клон HEMBA1003304
2,013831 4,834052 7,06 Повышение 0,044501 M10098 Человеческий ген рРНК 18S, полный.
-2,26295 0,550594 7,03 Повышение 0,018367 AI735586 Гены EST
-1,51616 1,294636 7,02 Повышение 0,005536 AJ272267 Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-2,13754 0,667215 6,99 Повышение 0,022696 BF000203 Гены EST
0,466394 3,270039 6,98 Повышение 0,000736 NM_003121 Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-2,17012 0,632675 6,98 Повышение 0,0112 AB018580 Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
-2,45074 0,326451 6,86 Повышение 0,021849 AW149405 нейрексин 1 /FL=gb:AB035356.1
-0,8902 1,856598 6,71 Повышение 0,001423 NM_022034 Homo sapiens, ген 1, регулируемый эстрогеном (ERG-1), мРНК. /PROD=estrogen regulated gene 1 /FL=gb:AF305835.1 gb:NM_022034.1
-1,25121 1,488908 6,68 Повышение 0,001035 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-1,42062 1,315517 6,66 Повышение 0,053176 AI830490 глицеринкиназа
-1,85153 0,876867 6,63 Повышение 0,021533 AL359062 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 1913076.
-3,12055 -0,40125 6,59 Повышение 0,044501 AW780006 Гены EST
1,037668 3,7519 6,56 Повышение 0,000736 R40892 Гены EST
-2,07873 0,630876 6,54 Повышение 0,00724 AI269290 переносчик растворенных веществ, семейство 18 (везикулярный моноамин), член 2 /FL=gb:L14269.1 gb:L23205.1 gb:L09118.1 gb:NM_003054.1
-1,88254 0,821519 6,52 Повышение 0,006908 BF694956 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-0,5392 2,15739 6,48 Повышение 0,00126 AA769438 Гены EST со средней степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,872557 4,557858 6,43 Повышение 0,000315 R38389 ольфактомедин-связанный белок, локализованный в ЭР
-2,06656 0,610015 6,39 Повышение 0,01711 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,4606 1,189801 6,28 Повышение 0,001394 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-1,17422 1,42382 6,05 Повышение 0,007542 AI962169 Гены EST
-1,27392 1,293844 5,93 Повышение 0,042956 U11058 Homo sapiens, альфа-субъединица высокопроводящего кальциевого и потенциалзависимого калиевого канала (MaxiK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=large conductance calcium- and voltage-dependentpotassium channel alpha subunit /FL=gb:U23767.1 gb:NM_002247.1 gb:AF025999
-0,04433 2,486339 5,78 Повышение 0,001511 NM_007191 Homo sapiens, ингибирующий Wnt фактор-1 (WIF-1), мРНК. /PROD=Wnt inhibitory factor-1 /FL=gb:AF122922.1 gb:NM_007191.1
-1,38062 1,126483 5,68 Повышение 0,003297 NM_002590 Homo sapiens, протокадгерин 8 (PCDH8), мРНК. /PROD=protocadherin 8 /FL=gb:NM_002590.2 gb:AF061573.2
1,37261 3,87602 5,67 Повышение 0,000713 BC040605 Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
-2,3444 0,156063 5,66 Повышение 0,002001 AW057589 Гены EST
-1,60594 0,882381 5,61 Повышение 0,016783 AL050090 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp586F1018 (из клона DKFZp586F1018). /PROD=hypothetical protein
-1,09181 1,384319 5,56 Повышение 0,030796 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-0,32746 2,147256 5,56 Повышение 0,001039 L39833 Homo sapiens (клон hKvBeta3), субъединица K+ канала-бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=K+ channel beta-subunit /FL=gb:U16953.1 gb:L39833.1
-0,46577 2,00387 5,54 Повышение 0,000262 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-2,19527 0,241495 5,41 Повышение 0,017156 NM_013333 Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
1,684042 4,109252 5,37 Повышение 0,000924 BE504979 белок, подобный белку синдрома Вискотта-Олдрича /FL=gb:D88460.1 gb:NM_003941.1
2,7744 5,196982 5,36 Повышение 0,001859 AA669799 Кластер включает AA669799:ag36c04.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-1118886 /clone_end=3 /gb=AA669799 /gi=2631298 /ug=Hs.6315 /len=679
0,623369 3,023579 5,28 Повышение 0,000791 Homo sapiens, белок нейробластомы (нервная ткань) (AMY), мРНК. /PROD=neuroblastoma (nerve tissue) protein /FL=gb:NM_006334.1 gb:D82343.1
-0,0881 2,307249 5,26 Повышение 0,000742 AL565745 Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
0,225505 2,619908 5,26 Повышение 0,000552 AI968440 Гены EST
-1,67442 0,713629 5,23 Повышение 0008409 AW117456 нейротримин
0,040412 2,394979 5,11 Повышение 0,000552 AA960844 Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
1,638346 3,992456 5,11 Повышение 0,000281 AA603344 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,923146 4,275361 5,11 Повышение 0,000799 BF057731 Гены EST
1,398961 3,745146 5,08 Повышение 0,000972 NM_024036 Homo sapiens, гипотетический белок MGC3103 (MGC3103), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC3103 /FL=gb:NM_024036.1 gb:BC000207.1
-0,2823 2,040956 5 Повышение 0,007542 NM_016582 Homo sapiens, переносчик пептидов 3 (LOC51296), мРНК. /PROD=peptide transporter 3 /FL=gb:NM_016582.1 gb:AB020598.1
3,409815 -2,62843 65,72 Снижение 0,0112 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
5,388254 0,009545 41,61 Снижение 0,000281 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094183 -1,98643 33,84 Снижение 0,012905 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
3,025351 -1,81749 28,7 Снижение 0,004056 AW590925 Гены EST
4,092731 -0,55563 25,08 Снижение 0,000627 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
6,777916 2,149128 24,74 Снижение 0,000281 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
0,959227 -3,66704 24,7 Снижение 0,001627 AB033831 Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
1,470435 -3,07409 23,34 Снижение 0,029826 L49506 Homo sapiens, циклин G2, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin G2 /FL=gb:L49506.1
4,161028 -0,3587 22,94 Снижение 0,006316 BC005807 Homo sapiens, клон MGC:10264, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:10264) /FL=gb:BC005807.1
2,446762 -1,7919 18,88 Снижение 0,029145 NM_005983 Homo sapiens, связанный с киназой S-фазы белок 2 (p45) (SKP2), мРНК. /PROD=S-phase kinase-associated protein 2 (p45) /FL=gb:U33761.1 gb:NM_005983.1
1,790331 -2,43995 18,77 Снижение 0,001074 AA775681 гипотетический белок FLJ23091
4,505436 0,27614 18,76 Снижение 0,000281 W57613 Гены EST
2,792215 -1,38592 18,1 Снижение 0,013563 BC017942 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4285317, мРНК.
4,507212 0,470029 16,42 Снижение 0,000262 AW196940 Гены EST
2,469646 -1,56158 16,35 Снижение 0,000649 N76327 Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
2,770179 -1,16077 15,25 Снижение 0,000181 AK000345 Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,834572 -0,07465 15,02 Снижение 0,000272 NM_002610 Homo sapiens, пируват-дегидрогеназы киназа, изофермент 1 (PDK1), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=pyruvate dehydrogenase kinase, isoenzyme 1 /FL=gb:NM_002610.2 gb:L42450.1
2,306111 -1,49375 13,93 Снижение 0,004398 AI632223 гипотетический белок DKFZp434F2322
3,030236 -0,72689 13,52 Снижение 0,006371 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
3,268087 -0,40455 12,75 Снижение 0,000114 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
5,294065 1,68926 12,17 Снижение 0,001199 AF279899 Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
0,173113 -3,3673 11,64 Снижение 0,006169 NM_152490 Homo sapiens, гипотетический белок MGC39558 (MGC39558), мРНК. /FL=gb:BC029564.1 gb:NM_152490.1
0,432613 -3,10597 11,62 Снижение 0,013508 BC004884 Homo sapiens, клон MGC:11141, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:11141) /FL=gb:BC004884.1
6,371229 2,841928 11,55 Снижение 0,000432 AI950472 Гены EST
5,023981 1,496597 11,53 Снижение 0,000207 NM_006472 Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,036188 -1,4564 11,26 Снижение 0,023936 U55936 Человеческий SNAP-23, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=SNAP-23 /FL=gb:U55936.1 gb:BC000148.2 gb:BC003686.1 gb:Y09567.1
1,075159 -2,41498 11,24 Снижение 0,004979 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
6,091008 2,605414 11,2 Снижение 0,000741 BC020935 Homo sapiens, белок, подобный отоконину 90, клон IMAGE:4277593, мРНК.
0,783065 -2,6827 11,05 Снижение 0,030265 AB014486 Homo sapiens, мРНК белка RA70, полная кодовая последовательность /PROD=RA70 /FL=gb:AF051323.1 gb:BC002893.1 gb:AB014486.1 gb:AF072166.1 gb:NM_003930.1
2,505869 -0,95096 10,98 Снижение 0,001627 AV721177 фосфатидилинозитол-связывающий белок клатринового агрегата
4,749034 1,297636 10,94 Снижение 0,000464 NM_002130 Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
1,840613 -1,60133 10,87 Снижение 0,015976 AI949760 Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,060071 -1,36259 10,72 Снижение 0,003053 AA004300 гипотетический белок DKFZp566I133
2,990178 -0,3979 10,47 Снижение 0,000924 NM_013445 Homo sapiens, глутамат декарбоксилаза 1 (мозговая, 67 кДа) (GAD1), вариант транскрипта GAD25, мРНК. /PROD=glutamate decarboxylase 1, isoform GAD25 /FL=gb:NM_013445.1 gb:AF178853.1 gb:BC002815.1
1,143234 -2,23959 10,43 Снижение 0,00724 BF437711 Гены EST
0,680039 -2,65005 10,06 Снижение 0,005452 AW268357 Гены EST с высокой степенью подобия с антигеном AF155116 1 NY-REN-60 (H.sapiens)
0,757197 -2,55666 9,94 Снижение 0,012419 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,953402 0,655224 9,84 Снижение 0,000312 BC005369 Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
2,660133 -0,625 9,75 Снижение 0,000281 AF277174 Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
2,370141 -0,82549 9,16 Снижение 0,011076 BC020691 Homo sapiens, белок, сходный с фактором, стимулирующим колонии предшественников В-клеток, клон MGC:22427 IMAGE:4717726, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Similar to pre-B-cell colony-enhancing factor /FL=gb:BC020691.1
1,250277 -1,93752 9,11 Снижение 0,02358 BC035744 Homo sapiens, гипотетический белок HSPC129, клон MGC:46091 IMAGE:5744745, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC035744.1
2,62025 -0,48479 8,6 Снижение 0,002377 AA625683 Гены EST
4,560288 1,479495 8,46 Снижение 0,000799 BF979497 скваленэпоксидаза
1,609384 -1,40302 8,07 Снижение 0,03374 BC005961 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
2,422113 -0,58962 8,07 Снижение 0,035909 AL544576 Гены EST
4,285883 1,280326 8,03 Снижение 0,000262 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
1,194285 -1,77245 7,82 Снижение 0,029849 NM_001898 Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
0,885541 -2,07053 7,76 Снижение 0,025326 AV721958 Гены EST
4,501184 1,559254 7,68 Снижение 0,000103 AK000162 Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,264785 -0,65782 7,58 Снижение 0,000552 AF005037 Homo sapiens, мембранный белок - секреторный переносчик (SCAMP1) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=secretory carrier membrane protein /FL=gb:AF038966.1 gb:AF005037.1 gb:NM_004866.1
5,095598 2,21166 7,38 Снижение 0,001394 NM_005542 Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
5,979532 3,098176 7,37 Снижение 0,003586 U18197 Человеческая АТФ:цитрат-лиаза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ATP:citrate lyase /FL=gb:U18197.1
4,782763 1,929757 7,23 Снижение 0,000451 NM_004199 Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
5,356771 2,540614 7,04 Снижение 0,000587 W92036 Гены EST
1,41468 -1,38083 6,94 Снижение 0,017389 NM_018470 Homo sapiens, неохарактеризованный белок гипоталамуса HT009 (HT009), мРНК. /PROD=uncharacterized hypothalamus protein HT009 /FL=gb:AF220183.1 gb:NM_018470.1
7,047717 4,25951 6,91 Снижение 0,000431 NM_004052 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,815339 -0,96912 6,89 Снижение 0,011253 BE206621 Homo sapiens мРНК; кДНК DKFZp434P228 (из клона DKFZp434P228)
5,319714 2,54291 6,85 Снижение 0,000213 AL117352 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
4,010007 1,2423 6,81 Снижение 0,00398 NM_006577 Homo sapiens, бета-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза (BETA3GNT), мРНК. /PROD=beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase /FL=gb:NM_006577.2 gb:AF288208.1 gb:AF092051.2
1,390174 -1,34692 6,67 Снижение 0,014402 BC001224 Homo sapiens, клон MGC:982 IMAGE:3354306, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:982) /FL=gb:BC001224.1
0,831091 -1,89825 6,63 Снижение 0,025217 NM_153036 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
2,33099 -0,39642 6,62 Снижение 0,000103 NM_004041 Homo sapiens, аррестин бета 1 (ARRB1), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=arrestin beta 1, isoform A /FL=gb:BC003636.1 gb:AF084040.1 gb:NM_004041.2
1,389794 -1,32346 6,56 Снижение 0,006908 BG498699 Гены EST
4,424942 1,717072 6,53 Снижение 0,000627 AF493929 Homo sapiens, регулятор G-белковой сигнализации 5 (RGS5) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=regulator of G protein signalling 5 /FL=gb:AF493929.1
1,987876 -0,71603 6,52 Снижение 0,032029 D84105 Человеческий CD46, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=CD46 /FL=gb:D84105.1
2,224696 -0,43842 6,33 Снижение 0,003781 NM_015601 Homo sapiens, белок DKFZP564G092 (DKFZP564G092), мРНК. /PROD=DKFZP564G092 protein /FL=gb:NM_015601.1
0,366041 -2,27572 6,24 Снижение 0,017238 AI242583 Homo sapiens, кДНК FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
0,899011 -1,74189 6,24 Снижение 0,031092 NM_002820 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон (PTHLH), мРНК. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:J03802.1 gb:NM_002820.1
-0,00139 -2,64223 6,24 Снижение 0,045323 NM_002837 Homo sapiens, протеинтирозинфосфатаза, рецепторного типа, B (PTPRB), мРНК. /PROD=protein tyrosine phosphatase, receptor type, B /FL=gb:NM_002837.1
0,81216 -1,82788 6,23 Снижение 0,021836 NM_017763 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20315 (FLJ20315), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20315 /FL=gb:NM_017763.1
5,600865 2,995377 6,09 Снижение 0,000713 AI183997 регулятор G-белковой сигнализации 5 /FL=gb:AB008109.1 gb:NM_003617.1 gb:AF159570.1
2,350127 -0,2504 6,07 Снижение 0,030265 AK026106 Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
3,732985 1,134619 6,06 Снижение 0,001697 AI459194 белок раннего ростового ответа 1
2,36447 -0,20141 5,92 Снижение 0,000552 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,621319 1,058823 5,91 Снижение 0,001394 AY072911 Homo sapiens, рецептор аденовируса коксаки, изоформа CAR37 (CXADR), мРНК, полная кодовая последовательность; продукт альтернативного сплайсинга. /PROD=coxsackie-adenovirus-receptor isoform CAR37 /FL=gb:AY072911.1
3,816817 1,261309 5,88 Снижение 0,000279 AF116616 Homo sapiens, PRO0998, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PRO0998 /FL=gb:AF116616.1
2,003811 -0,52279 5,76 Снижение 0,012377 AK001291 Homo sapiens кДНК FLJ10429 fis, клон NT2RP1000413, высокая степень подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0587.
2,951696 0,463484 5,61 Снижение 0,000268 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
4,654166 2,17714 5,57 Снижение 0,006161 H09085 Homo sapiens, клон FLC0675 PRO2870 мРНК, полная кодовая последовательность
2,590871 0,126582 5,52 Снижение 0,00106 NM_016569 Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,432066 -0,0298 5,51 Снижение 0,005455 NM_007034 Homo sapiens, DnaJ-подобный белок теплового шока 40 (HLJ1), мРНК. /PROD=DnaJ-like heat shock protein 40 /FL=gb:NM_007034.2 gb:U40992.2
5,807319 3,352042 5,48 Снижение 0,000612 NM_018004 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
2,006604 -0,43301 5,42 Снижение 0,000713 NM_004087 Homo sapiens, гомолог 1 белка discs large (Drosophila) (DLG1), мРНК. /PROD=discs, large (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:NM_004087.1 gb:U13896.1
0,72592 -1,71056 5,41 Снижение 0,014643 AB050856 Homo sapiens, beta3GalNAcT-1, мРНК глобозид синтазы, полная кодовая последовательность, клон:тип 2. /PROD=globoside synthase /FL=gb:AB050856.1
3,805066 1,369345 5,41 Снижение 0,001099 BG330076 Человеческий альфа-катенин, мРНК, частичная кодовая последовательность.
3,70002 1,279892 5,35 Снижение 0,014262 NM_006544 Homo sapiens, SEC10 (S. cerevisiae)-подобный белок 1 (SEC10L1), мРНК. /PROD=SEC10 (S. cerevisiae)-like 1 /FL=gb:U85946.1 gb:NM_006544.1
0,873551 -1,53444 5,31 Снижение 0,031228 AW293376 Гены EST
5,850582 3,443167 5,31 Снижение 0,008657 AF394735 Homo sapiens, сходный с дефицитным при угнетении митоза белком MAD2 вариант белка 1 (MAD2L1) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=MAD2 mitotic arrest deficient-like 1 variant /FL=gb:AF394735.1
5,252439 2,850969 5,28 Снижение 0,000192 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
1,275104 -1,11616 5,25 Снижение 0,031092 AU146738 Homo sapiens кДНК FLJ11985 fis, клон HEMBB1001356
4,255531 1,866771 5,24 Снижение 0,001003 AF096296 Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,075321 1,687619 5,23 Снижение 0,000791 AI652662 аминотрансфераза 1 с разветвленной цепью, цитозольная
3,806044 1,418363 5,23 Снижение 0,010886 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,276913 -0,10568 5,21 Снижение 0,042222 AK025909 Homo sapiens кДНК: FLJ22256 fis, клон HRC02860.
3,264799 0,883433 5,21 Снижение 0,001003 NM_016076 Homo sapiens, белок CGI-146 (LOC51029), мРНК. /PROD=CGI-146 protein /FL=gb:NM_016076.1 gb:AF151904.1
-0,70217 -3,08122 5,2 Снижение 0,046444 AV735100 Гены EST, с низкой степенью подобия с ALU1_HUMAN ALU SUBFAMILY J SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
2,28595 -0,08329 5,17 Снижение 0,001394 BE504838 Гены EST
0,424388 -1,93597 5,13 Снижение 0,039624 NM_002433 Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
5,450694 3,100148 5,1 Снижение 0,000281 AF095771 Homo sapiens, реагирующий на PTH белок остеосаркомы B1 (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,176455 -0,15806 5,04 Снижение 0,000603 AB033281 Homo sapiens, BTRCP2, мРНК белка с F-боксом и WD-повторами, изоформа C, полная кодовая последовательность /PROD=F-box and WD-repeats protein beta-TRCP2 isoformC /FL=gb:AF176022.1 gb:AB033281.1
4,103964 1,770836 5,04 Снижение 0,000114 AA579773 Гены EST
4,970228 2,637225 5,04 Снижение 0,005013 AF450454 Homo sapiens, предполагаемый цинк-пальцевый белок 42 (ZFP42), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative zinc finger protein 42 /FL=gb:AF450454.1
1,951234 -0,37257 5,01 Снижение 0,032802 NM_016277 Homo sapiens, RAB23, член семейства RAS-онкогенов (RAB23), мРНК. /PROD=RAB23 protein /FL=gb:NM_016277.1 gb:AB034244.1
C) Сравнение клеток H9 P39 на 24 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01 24 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-3,61621 3,252949 116,9 Повышение 1.09E-03 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,12747 2,81955 61,69 Повышение 5.09E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-0,27888 4,796134 33,71 Повышение 2.25E-04 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-3,26893 1,684842 30,99 Повышение 1.95E-04 NM_001785 Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,88742 0,690893 23,89 Повышение 2.83E-03 AA180985 Гены EST
-1,32044 3,115913 21,65 Повышение 9.44E-03 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
1,168713 5,393939 18,7 Повышение 4.05E-04 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-2,69521 1,432079 17,48 Повышение 7.06E-05 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,506 1,523432 16,33 Повышение 2.66E-04 AW193693 белок DKFZP566K1924
-0,10733 3,827249 15,29 Повышение 5.09E-04 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-3,62742 0,232422 14,52 Повышение 1.32E-02 AA772920 Гены EST
-0,69028 3,077263 13,62 Повышение 8.84E-04 M16276 Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-2,38787 1,308962 12,97 Повышение 1.24E-02 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-1,03397 2,650732 12,86 Повышение 4.41E-04 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-2,05438 1,576656 12,39 Повышение 1.46E-02 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,756526 4,2504 11,27 Повышение 1.84E-04 NM_003012 Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,39784 2,037775 10,82 Повышение 4.58E-03 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-3,12304 0,280186 10,58 Повышение 1.86E-02 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
-2,01579 1,387151 10,58 Повышение 7.46E-03 AI937060 белок KIAA1151
-2,19527 1,171426 10,32 Повышение 2.14E-03 NM_013333 Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
-1,16113 2,202477 10,29 Повышение 8.90E-03 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
1,109291 4,425076 9,96 Повышение 3.72E-04 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,66608 1,62119 9,76 Повышение 1.29E-02 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-2,233 1,032915 9,62 Повышение 4.41E-03 NM_014862 Homo sapiens, продукт гена KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-3,17826 0,063512 9,46 Повышение 2.56E-02 AI798098 Гены EST
3,042634 6,275162 9,4 Повышение 1.84E-04 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-2,62694 0,564089 9,13 Повышение 1.08E-02 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-3,588 -0,42279 8,97 Повышение 5.08E-02 AI743261 Гены EST
-1,75731 1,403919 8,95 Повышение 3.72E-02 BC008992 Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-1,56608 1,492453 8,33 Повышение 3.48E-02 NM_000767 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство IIB (индуцируемый фенобарбиталом), полипептид 6 (CYP2B6), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily IIB(phenobarbital-inducible), polypeptide 6 /FL=gb:NM_000767.2 gb:AF182277.1 gb:M29874.1
-1,64839 1,373964 8,12 Повышение 2.63E-03 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
-2,85395 0,154004 8,04 Повышение 3.89E-02 AY063451 Homo sapiens, D21S2088E, последовательность мРНК.
-1,61054 1,380575 7,95 Повышение 3.70E-03 AW264204 Гены EST
-3,12055 -0,14826 7,85 Повышение 3.16E-02 AW780006 Гены EST
-0,48291 2,475412 7,77 Повышение 6.01E-04 NM_000273 Homo sapiens, белок глазного альбинизма 1 (синдрома Неттлшопа-Фоллза) (OA1), мРНК. /PROD=ocular albinism 1 (Nettleship-Falls) protein /FL=gb:NM_000273.1
-0,01122 2,91624 7,61 Повышение 5.09E-04 AI356398 Реагирующий на бутират фактор 2 (реагирующий на EGF фактор 2) /FL=gb:BC005010.1 gb:NM_006887.1
-0,41404 2,492138 7,5 Повышение 1.22E-03 AI332407 секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,04543 2,826104 7,32 Повышение 8.38E-04 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
3,061783 5,932074 7,31 Повышение 2.39E-04 BF057809 Гены EST
1,750623 4,603127 7,22 Повышение 3.35E-04 AA176289 Гены EST
1,37261 4,224545 7,22 Повышение 2.56E-04 BC040605 Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
0,194248 2,977224 6,88 Повышение 1.76E-03 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-2,17012 0,571059 6,69 Повышение 1.11E-02 AB018580 Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
0,270429 2,998558 6,63 Повышение 2.01E-02 AF493872 Homo sapiens, связывающий гуаниновый нуклеотид белок гамма 4 (GNG4), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=guanine nucleotide binding protein gamma 4 /FL=gb:AF493872.1
0,462867 3,188675 6,62 Повышение 5.56E-03 AI807026 Гены EST
-2,3444 0,379948 6,61 Повышение 5.18E-04 AW057589 Гены EST
-2,06656 0,644395 6,55 Повышение 1.48E-02 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,88254 0,823917 6,53 Повышение 5.94E-03 BF694956 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
-2,14678 0,54813 6,48 Повышение 2.59E-02 AA143060 Гены EST с высокой степенью подобия с I38945, повсеместно распространенным при меланоме мутантным белком (H.sapiens)
-1,09181 1,594917 6,44 Повышение 2.17E-02 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
-1,57619 1,107388 6,42 Повышение 2.44E-03 AW072790 контактин 1
-1,42062 1,262234 6,42 Повышение 5.27E-02 AI830490 глицеринкиназа
-1,51992 1,159662 6,41 Повышение 4.58E-03 AA460960 H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
0,828954 3,501807 6,38 Повышение 9.79E-04 AK026659 Homo sapiens кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
0,040412 2,69519 6,3 Повышение 3.16E-04 AA960844 Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
-0,0881 2,555378 6,25 Повышение 1.84E-04 AL565745 Гены EST с низкой степенью подобия с 2108402A, карнитин-пальмитоилтрансферазой I (H.sapiens)
-0,66924 1,971531 6,24 Повышение 1.10E-02 AI986120 связывающий латентный трансформирующий фактор роста бета белок 1 /FL=gb:M34057.1 gb:NM_000627.1
-1,25121 1,36043 6,11 Повышение 8.84E-04 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
1,285793 3,892769 6,09 Повышение 1.84E-04 AI949827 Гены EST
-1,4606 1,131857 6,03 Повышение 1.46E-03 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
1,037668 3,589262 5,86 Повышение 3.89E-04 R40892 Гены EST
-2,13754 0,412333 5,86 Повышение 2.35E-02 BF000203 Гены EST
1,470195 4,017332 5,84 Повышение 1.93E-04 AI676059 Гены EST
0,780689 3,30524 5,75 Повышение 2.66E-04 AI016316 Гены EST
-1,41031 1,100005 5,7 Повышение 2.17E-02 AI832477 серологически определяемый антиген 43 колоректального рака
-0,68225 1,819364 5,66 Повышение 3.04E-03 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
0,937118 3,415706 5,57 Повышение 2.66E-04 AU151342 Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
-0,41626 2,0614 5,57 Повышение 1.39E-03 BF110534 Гены EST
2,167442 4,632856 5,52 Повышение 2.19E-04 NM_001552 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 4 (IGFBP4), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor-binding protein 4 /FL=gb:M62403.1 gb:NM_001552.1
-0,46577 1,990737 5,49 Повышение 1.62E-04 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
-1,98038 0,474231 5,48 Повышение 1.22E-02 NM_002442 Homo sapiens, гомолог 1 белка Musashi (Drosophila) (MSI1), мРНК. /PROD=Musashi (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:AB012851.1 gb:NM_002442.1
0,466394 2,917466 5,47 Повышение 6.01E-04 NM_003121 Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-2,73733 -0,30853 5,38 Повышение 1.36E-03 L41944 Homo sapiens, рецептор интерферона ifnar2-1 (вариант сплайсинга IFNAR2-1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=interferon receptor /FL=gb:NM_000874.1 gb:L41944.1
0,923781 3,31197 5,23 Повышение 2.23E-04 BE897866 Гены EST
1,198446 3,56619 5,16 Повышение 3.79E-03 BG283790 Гены EST
0,013383 2,37551 5,14 Повышение 7.45E-03 L10374 Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
-1,39667 0,965049 5,14 Повышение 2.75E-03 AI018174 Гены EST
-3,38515 -1,06056 5,01 Повышение 3.31E-02 NM_172368 Homo sapiens, предполагаемый белок LG30 (G30), мРНК. /PROD=putative protein LG30 /FL=gb:AY138548.1 gb:NM_172368.1
3,409815 -1,99672 42,42 Снижение 8.38E-04 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
4,092731 -0,75499 28,79 Снижение 3.57E-04 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
5,388254 0,591477 27,8 Снижение 4.11E-05 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ семейства 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,306225 -2,24414 23,43 Снижение 1.14E-03 AW444761 Гены EST
2,306111 -1,93483 18,91 Снижение 7.20E-04 AI632223 гипотетический белок DKFZp434F2322
3,025351 -1,21304 18,87 Снижение 6.42E-03 AW590925 Гены EST
0,757197 -3,40795 17,94 Снижение 7.19E-03 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
0,959227 -3,03425 15,93 Снижение 1.27E-02 AB033831 Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
4,505436 0,524918 15,79 Снижение 1.36E-04 W57613 Гены EST
0,942774 -2,97701 15,13 Снижение 8.44E-04 AW957786 Гены EST, с низкой степенью подобия с S51797, фосфопротеином, стимулируемым вазодилятаторами (H.sapiens)
1,1136 -2,73154 14,37 Снижение 1.61E-02 Z70519 H.sapiens, FASApo 1, мРНК для растворимого белка FAS (клон FAS Exo4Del). /PROD=FAS soluble protein
1,389794 -2,42829 14,1 Снижение 1.11E-02 BG498699 Гены EST
1,312148 -2,42325 13,32 Снижение 5.09E-04 U32500 Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
2,62025 -1,04008 12,64 Снижение 1.04E-03 AA625683 Гены EST
3,268087 -0,32148 12,04 Снижение 1.86E-04 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
4,152765 0,57732 11,92 Снижение 3.06E-04 AW003173 станниокальцин 1
6,777916 3,231028 11,69 Снижение 3.37E-05 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
1,143234 -2,39818 11,64 Снижение 6.01E-04 BF437711 Гены EST
2,36447 -1,1716 11,6 Снижение 3.57E-04 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
4,285883 0,804811 11,17 Снижение 3.89E-04 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
5,023981 1,567701 10,98 Снижение 2.66E-04 NM_006472 Homo sapiens, белок, стимулируемый 1,25-дигидроксивитамином D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,590871 -0,83277 10,73 Снижение 2.00E-03 NM_016569 Homo sapiens, изо-белок TBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,332751 -1,07983 10,65 Снижение 2.06E-02 NM_000077 Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
1,577138 -1,83389 10,64 Снижение 3.70E-03 M15329 Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
0,831091 -2,57623 10,61 Снижение 1.77E-02 NM_153036 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
2,350127 -1,04844 10,55 Снижение 2.83E-03 AK026106 Homo sapiens кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, высокая степень подобия с AF059516, Homo sapiens толлоид-подобный белок 2 (TLL2), мРНК.
4,927935 1,558948 10,33 Снижение 6.84E-04 J05008 Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
2,951696 -0,34119 9,8 Снижение 5.52E-04 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
-0,42962 -3,66853 9,44 Снижение 3.14E-02 D28364 Человеческая мРНК для аннексина II, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,030236 -0,19682 9,36 Снижение 3.06E-04 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,528627 1,33908 9,12 Снижение 1.86E-04 NM_003155 Homo sapiens, станниокальцин 1 (STC1), мРНК. /PROD=stanniocalcin 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
2,660133 -0,51613 9,04 Снижение 3.37E-05 AF277174 Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
2,422113 -0,74259 8,97 Снижение 6.51E-03 AL544576 Гены EST
3,806044 0,684261 8,7 Снижение 3.17E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
3,953402 0,872354 8,46 Снижение 1.12E-03 BC005369 Homo sapiens, хромосома 1 открытая рамка считывания 12, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
3,437271 0,406885 8,17 Снижение 1.28E-04 AB029025 Homo sapiens мРНК белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,469646 -0,53314 8,02 Снижение 1.95E-03 N76327 Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
4,255531 1,305501 7,73 Снижение 2.22E-03 AF096296 Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
1,609384 -1,3385 7,72 Снижение 3.57E-04 BC005961 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон, клон MGC:14611, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:BC005961.1
5,356771 2,475735 7,37 Снижение 2.39E-04 W92036 Гены EST
4,055862 1,176103 7,36 Снижение 1.54E-04 AK026815 Homo sapiens кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,782763 1,926881 7,24 Снижение 2.56E-04 NM_004199 Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II, мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
4,749034 1,911794 7,15 Снижение 6.01E-04 NM_002130 Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
4,501184 1,674786 7,09 Снижение 3.37E-05 AK000162 Homo sapiens, кДНК FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
4,103964 1,279587 7,08 Снижение 1.86E-04 AA579773 Гены EST
5,294065 2,498324 6,94 Снижение 3.17E-04 AF279899 Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
6,179917 3,394324 6,9 Снижение 2.56E-04 NM_000158 Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
3,880272 1,125517 6,75 Снижение 2.25E-04 NM_002521 Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
1,075159 -1,64214 6,58 Снижение 2.88E-03 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
0,031255 -2,68323 6,56 Снижение 1.26E-02 AU142380 Homo sapiens кДНК FLJ34825 fis, клон NT2NE2008785, слабая степень подобия с ANTER-СПЕЦИФИЧНЫМ, БОГАТЫМ ПРОЛИНОМ БЕЛКОМ APG.
5,252439 2,540223 6,55 Снижение 1.93E-04 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
1,58166 -1,12925 6,55 Снижение 3.72E-02 AF207990 Homo sapiens, fer-1-подобный белок 3 (FER1L3), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=fer-1 like protein 3 /FL=gb:AF207990.1
3,732985 1,022527 6,55 Снижение 8.08E-04 AI459194 белок раннего ростового ответа 1
6,1137 3,411176 6,51 Снижение 2.56E-04 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,507212 1,810296 6,48 Снижение 1.84E-04 AW196940 Гены EST
2,770179 0,094942 6,39 Снижение 7.20E-04 AK000345 Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
4,633038 1,983552 6,27 Снижение 5.56E-04 NM_016931 Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
5,099016 2,450575 6,27 Снижение 4.88E-04 NM_018192 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10718 (FLJ10718), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10718 /FL=gb:NM_018192.1
3,41866 0,772516 6,26 Снижение 1.05E-03 AA149250 Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
4,506475 1,891343 6,13 Снижение 2.83E-04 AI300520 станниокальцин 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
0,060743 -2,53505 6,05 Снижение 3.08E-02 NM_014795 Homo sapiens, гомеобоксовый цинк-пальцевый белок 1B (ZFHX1B), мРНК. /PROD=zinc finger homeobox 1B /FL=gb:NM_014795.1 gb:AB011141.1
1,470435 -1,11845 6,02 Снижение 1.04E-03 L49506 Homo sapiens, циклин G2, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cyclin G2 /FL=gb:L49506.1
7,564809 4,992443 5,95 Снижение 2.36E-04 M83248 Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
3,508683 0,95049 5,89 Снижение 3.89E-04 AK027231 Homo sapiens кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
3,543738 0,987655 5,88 Снижение 4.67E-04 NM_001955 Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
0,279226 -2,24474 5,75 Снижение 3.73E-02 AF278532 Homo sapiens, бета-нетрин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=beta-netrin /FL=gb:AF119916.1 gb:AF297711.1 gb:NM_021229.1 gb:AF278532.1
1,771584 -0,72454 5,64 Снижение 1.63E-03 BI254089 Homo sapiens, полноразмерная вставка кДНК, клон ZD50E03
5,450694 2,958035 5,63 Снижение 1.84E-04 AF095771 Homo sapiens, реагирующий на PTH белок остеосаркомы B1 (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,648874 0,166558 5,59 Снижение 1.84E-04 AW007532 Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
4,420733 1,940312 5,58 Снижение 1.95E-04 NM_003670 Homo sapiens, белок, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2 (BHLHB2), мРНК. /PROD=differentiated embryo chondrocyte expressed gene1 /FL=gb:AB004066.1 gb:NM_003670.1
1,659275 -0,81556 5,56 Снижение 6.51E-03 L16895 Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
3,334996 0,86328 5,55 Снижение 8.21E-04 R40917 фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
2,886643 0,429864 5,49 Снижение 1.63E-03 NM_022036 Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор, семейство C, группа 5, член C (GPRC5C), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor, family C, group 5,member C, isoform a, precursor /FL=gb:AF207989.1 gb:NM_022036.1
5,319714 2,870709 5,46 Снижение 1.84E-04 AL117352 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-876B10 на хромосоме 1q42.12-43. Содержит 3-конец гена GNPAT для глицеронфосфат O-ацилтрансферазы (DHAPAT, DAPAT, дигидроксиацетонфосфат-ацилтрансфераза, EC 2.3.1.42), ген нового белка...
5,398488 2,949509 5,46 Снижение 3.37E-05 NM_001134 Homo sapiens, альфа-фетопротеин (AFP), мРНК. /PROD=alpha-fetoprotein /FL=gb:NM_001134.1 gb:J00077.1
3,904705 1,46154 5,44 Снижение 4.81E-04 NM_007038 Homo sapiens, дезинтегрин-подобный белок и металлопротеаза (репролизинового типа) с мотивом типа тромбоспондин-1, 5 (аггреканаза-2) (ADAMTS5), мРНК. /PROD=a disintegrin and metalloprotease withthrombospondin motifs-5 preproprotein /FL=gb:NM_007038.1 gb:AF14209
2,001263 -0,41849 5,35 Снижение 2.30E-03 U46768 Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
5,095598 2,679984 5,34 Снижение 3.06E-04 NM_005542 Homo sapiens, индуцируемый инсулином ген 1 (INSIG1), мРНК. /PROD=insulin induced gene 1 /FL=gb:NM_005542.1
0,899011 -1,48844 5,23 Снижение 7.45E-03 NM_002820 Homo sapiens, паратгормон-подобный гормон (PTHLH), мРНК. /PROD=parathyroid hormone-like hormone /FL=gb:J03802.1 gb:NM_002820.1
2,933166 0,546859 5,23 Снижение 1.54E-04 NM_005780 Homo sapiens, белок-партнер по слиянию для белка HMGIC в липоме (LHFP), мРНК. /PROD=lipoma HMGIC fusion partner /FL=gb:NM_005780.1 gb:AF098807.1
2,454314 0,080053 5,18 Снижение 3.37E-05 NM_013281 Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 3 (FLRT3), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein3 /FL=gb:AF169677.1 gb:NM_013281.1
4,981033 2,626098 5,12 Снижение 1.14E-03 NM_000602 Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
5,209052 2,857021 5,11 Снижение 2.66E-04 AI754404 проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизингидроксилаза) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
7,251816 4,921229 5,03 Снижение 5.18E-04 NM_000700 Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
D) Сравнение клеток H9 P39 на 30 часу стадии сформированной эндодермы и клеток EXPRES 01- Значения интенсивности приводятся в формате Log2
EXPRES 01 30 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-3,61621 3,085829 104,12 Повышение 1.25E-03 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,12747 2,633618 54,23 Повышение 5.47E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-3,26893 2,480892 53,81 Повышение 3.52E-04 NM_001785 Homo sapiens, цитидин деаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-3,62742 1,93392 47,22 Повышение 3.24E-03 AA772920 Гены EST
-0,27888 4,672575 30,94 Повышение 2.20E-04 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-3,88742 0,719139 24,36 Повышение 2.32E-03 AA180985 Гены EST
1,168713 5,535315 20,63 Повышение 4.09E-04 NM_016139 Homo sapiens, белок 16,7 кДа (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-2,05438 2,234331 19,54 Повышение 9.02E-03 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,69028 3,350018 16,45 Повышение 8.76E-04 M16276 Человеческий белок MHC класса II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-бета, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1
-1,32044 2,675867 15,96 Повышение 1.31E-02 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1
3,042634 6,981126 15,33 Повышение 2.51E-04 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-0,41626 3,4773 14,86 Повышение 5.42E-04 BF110534 Гены EST
-2,69521 1,031628 13,24 Повышение 7.80E-05 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,38787 1,314022 13,01 Повышение 1.37E-02 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-2,45311 1,22951 12,84 Повышение 4.18E-02 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-0,68225 2,956253 12,45 Повышение 2.72E-04 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-0,18256 3,454591 12,44 Повышение 2.72E-04 AI583173 главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
-0,26005 3,330481 12,05 Повышение 1.37E-03 R72286 связанный с микрофибриллами белок 4
-1,75731 1,805232 11,81 Повышение 2.70E-02 BC008992 Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-3,76077 -0,22572 11,59 Повышение 2.57E-02 AI040305 Гены EST
0,756526 4,287575 11,56 Повышение 4.69E-04 NM_003012 Homo sapiens, секретированный frizzled-связаный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,61054 1,918985 11,55 Повышение 2.71E-03 AW264204 Гены EST
-2,30432 1,221219 11,52 Повышение 3.31E-02 BC017958 Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-1,16113 2,306767 11,06 Повышение 6.77E-03 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
-1,03397 2,369328 10,58 Повышение 5.45E-04 NM_003020 Homo sapiens, секреторная гранула, нейроэндокринный белок 1 (белок 7B2) (SGNE1), мРНК. /PROD=secretory granule, neuroendocrine protein 1 (7B2protein) /FL=gb:BC005349.1 gb:NM_003020.1
-0,80043 2,583204 10,44 Повышение 9.08E-04 D87811 Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-1,16952 2,129685 9,84 Повышение 4.80E-02 NM_001343 Homo sapiens, гомолог 2 disabled-белка (дрозофила) (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
-0,10733 3,157091 9,61 Повышение 2.31E-03 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-0,70855 2,511903 9,32 Повышение 2.13E-03 AI917371 Гены EST
1,109291 4,227073 8,68 Повышение 1.36E-03 NM_005356 Homo sapiens, лимфоцит-специфическая тирозинкиназа (LCK), мРНК. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,39784 1,697082 8,54 Повышение 1.04E-02 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-2,23133 0,840905 8,41 Повышение 8.31E-03 AA044140 ингибитор-бета ядерного фактора каппа (kappa light polypeptide gene enhancer) в В-клетках
-1,64839 1,38707 8,2 Повышение 2.49E-03 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B мРНКediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,502333 3,532743 8,17 Повышение 1.88E-03 AF211891 Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
1,470195 4,487924 8,1 Повышение 4.48E-04 AI676059 Гены EST
-1,66608 1,305765 7,85 Повышение 1.61E-02 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
-2,17012 0,717557 7,4 Повышение 8.40E-03 AB018580 Homo sapiens, мРНК белка hluPGFS, полная кодовая последовательность. /PROD=hluPGFS /FL=gb:NM_003739.2 gb:AF149416.2 gb:AB018580.1 gb:D17793.1
-3,17826 -0,30252 7,34 Повышение 3.88E-02 AI798098 Гены EST
-2,62694 0,235765 7,27 Повышение 1.61E-02 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-2,13754 0,709615 7,2 Повышение 1.59E-02 BF000203 Гены EST
1,750623 4,592477 7,17 Повышение 3.86E-04 AA176289 Гены EST
0,923781 3,753533 7,11 Повышение 5.45E-04 BE897866 Гены EST
-1,51616 1,306468 7,07 Повышение 3.70E-03 AJ272267 Homo sapiens, часть мРНК холиндегидрогеназы (ген chdh). /PROD=choline dehydrogenase
-3,12304 -0,30584 7,05 Повышение 3.13E-02 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
0,828954 3,642692 7,03 Повышение 1.53E-03 AK026659 Homo sapiens кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
3,061783 5,870643 7,01 Повышение 1.32E-04 BF057809 Гены EST
-0,20066 2,598953 6,96 Повышение 8.90E-04 NM_001609 Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
-0,5777 2,186912 6,8 Повышение 2.34E-03 BC036592 Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-2,20139 0,556645 6,76 Повышение 1.88E-03 AI913749 Гены EST
-2,19527 0,555455 6,73 Повышение 3.02E-03 NM_013333 Homo sapiens, EH домен-связывающий митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
0,194248 2,884093 6,45 Повышение 3.02E-03 U07236 Человеческая мутантная лимфоцит-специфическая протеин-тирозинкиназа (LCK), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=lymphocyte-specific protein tyrosine kinase /FL=gb:U07236.1 gb:NM_005356.1 gb:M36881.1
-1,4606 1,195222 6,3 Повышение 1.88E-03 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
-0,41404 2,208672 6,16 Повышение 1.88E-03 AI332407 секретированный frizzled-связаный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,98038 0,627155 6,09 Повышение 9.18E-03 NM_002442 Homo sapiens, гомолог 1 белка Musashi (Drosophila) (MSI1), мРНК. /PROD=Musashi (Drosophila) homolog 1 /FL=gb:AB012851.1 gb:NM_002442.1
-3,12055 -0,51875 6,07 Повышение 4.51E-02 AW780006 Гены EST
2,428694 5,011314 5,99 Повышение 8.90E-04 BF510715 фактор роста фибробластов 4 (гепариновый секреторный трансформирующий белок 1, онкоген саркомы Капоши) /FL=gb:M17446.1 gb:NM_002007.1
-2,06656 0,511613 5,97 Повышение 1.81E-02 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
-1,18368 1,389404 5,95 Повышение 1.12E-03 AB011152 Homo sapiens, мРНК белка KIAA0580, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0580 protein
0,884916 3,44953 5,92 Повышение 2.61E-04 NM_000104 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство I (индуцируемый диоксином), полипептид 1 (глаукома 3, первичная младенческая) (CYP1B1), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily I (dioxin-inducible),polypeptide 1 /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
1,380324 3,936779 5,88 Повышение 4.48E-04 NM_006895 Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,937118 3,476237 5,81 Повышение 5.45E-04 AU151342 Homo sapiens, кДНК FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
-2,3444 0,189019 5,79 Повышение 3.32E-03 AW057589 Гены EST
-1,09181 1,43832 5,78 Повышение 2.62E-02 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
0,270429 2,788184 5,73 Повышение 2.50E-02 AF493872 Homo sapiens, связывающий гуаниновый нуклеотид белок гамма 4 (GNG4), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=guanine nucleotide binding protein gamma 4 /FL=gb:AF493872.1
2,453593 4,950008 5,64 Повышение 4.67E-04 NM_005410 Homo sapiens, селенопротеин P, плазматический, 1 (SEPP1), мРНК. /PROD=selenoprotein P precursor /FL=gb:NM_005410.1
-1,88254 0,61166 5,63 Повышение 6.09E-03 BF694956 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, сходного с предсказанными белками S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, сходного с ингибиторами протеинкиназы C, 3-конец
0,462867 2,940232 5,57 Повышение 8.05E-03 AI807026 Гены EST
-0,04543 2,430022 5,56 Повышение 1.88E-03 AB037730 Homo sapiens, мРНК белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-0,01122 2,462282 5,55 Повышение 2.31E-03 AI356398 Реагирующий на бутират фактор 2 (реагирующий на EGF фактор 2) /FL=gb:BC005010.1 gb:NM_006887.1
1,285793 3,745524 5,5 Повышение 2.58E-03 AI949827 Гены EST
1,37261 3,832097 5,5 Повышение 4.48E-04 BC040605 Homo sapiens, клон IMAGE:5271039, мРНК.
-0,67823 1,780805 5,5 Повышение 3.24E-04 AA040057 протокадгерин 20
-1,41031 1,030229 5,43 Повышение 1.98E-02 AI832477 серологически определяемый антиген 43 колоректального рака
1,076427 3,500322 5,37 Повышение 1.17E-03 AI640307 протокадгерин 10
-0,35323 2,051621 5,3 Повышение 2.59E-03 BM666010 Homo sapiens, кДНК FLJ23803 fis, клон HEP22811.
0,040412 2,442774 5,29 Повышение 3.56E-04 AA960844 Homo sapiens, клон IMAGE:4081483, мРНК
-1,51992 0,881919 5,28 Повышение 6.04E-03 AA460960 H.sapiens, мРНК (клон ICRFp507L1876)
-2,32443 0,069216 5,25 Повышение 3.43E-03 BC035759 Homo sapiens, клон IMAGE:5557641, мРНК.
4,072718 6,466193 5,25 Повышение 1.53E-03 AU144598 молекула клеточного распознавания Caspr2 /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
0,143628 2,506522 5,14 Повышение 1.36E-02 AB037763 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1342, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1342 protein /FL=gb:AF299075.1
-0,46577 1,883396 5,1 Повышение 6.92E-04 AW051591 Гены EST со средней степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
0,780689 3,126868 5,08 Повышение 7.58E-04 AI016316 Гены EST
3,409815 -2,82988 75,57 Снижение 1.48E-02 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
0,757197 -4,3571 34,64 Снижение 4.81E-03 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
5,388254 0,288621 34,29 Снижение 4.14E-05 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
4,092731 -0,8862 31,54 Снижение 7.12E-04 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
2,306111 -2,22732 23,16 Снижение 8.51E-04 AI632223 гипотетический белок DKFZp434F2322
3,030236 -1,2974 20,08 Снижение 8.31E-03 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
4,505436 0,504147 16,01 Снижение 1.23E-04 W57613 Гены EST
3,025351 -0,90728 15,27 Снижение 2.53E-04 AW590925 Гены EST
3,268087 -0,54228 14,03 Снижение 2.76E-05 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
2,62025 -1,1154 13,32 Снижение 1.12E-03 AA625683 Гены EST
6,777916 3,123818 12,59 Снижение 6.00E-05 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
2,590871 -1,03729 12,36 Снижение 1.53E-03 NM_016569 Homo sapiens, изо-белокTBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
4,152765 0,533234 12,29 Снижение 2.53E-04 AW003173 станниокальцин 1
4,528627 0,921256 12,19 Снижение 7.80E-05 NM_003155 Homo sapiens, станниокальцин 1 (STC1), мРНК. /PROD=stanniocalcin 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
1,544409 -1,9767 11,48 Снижение 4.92E-02 NM_000599 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 5 /FL=gb:M65062.1 gb:M62782.1 gb:NM_000599.1 gb:AF055033.1
5,023981 1,530419 11,26 Снижение 2.80E-04 NM_006472 Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
2,36447 -1,00627 10,34 Снижение 1.88E-03 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
4,285883 0,94478 10,13 Снижение 7.80E-05 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
4,782763 1,624946 8,92 Снижение 4.14E-05 NM_004199 Homo sapiens, проколлаген-пролин, 2-оксоглутарат 4-диоксигеназа (пролин 4-гидроксилаза), альфа полипептид II (P4HA2), мРНК. /PROD=procollagen-proline, 2-oxoglutarate4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptideII /FL=gb:NM_004199.1 gb:U904
2,660133 -0,48383 8,84 Снижение 3.01E-04 AF277174 Homo sapiens, PNAS-137, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-137 /FL=gb:AF277174.1
1,99849 -1,11713 8,67 Снижение 1.48E-02 NM_002317 Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
4,927935 1,83445 8,54 Снижение 4.77E-04 J05008 Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_001955.1
5,356771 2,317383 8,22 Снижение 1.92E-05 W92036 Гены EST
3,806044 0,77917 8,15 Снижение 1.32E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,350127 -0,67445 8,14 Снижение 1.86E-02 AK026106 Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного 2 (TLL2) белка, Homo sapiens.
5,450694 2,473087 7,88 Снижение 2.35E-04 AF095771 Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
2,208449 -0,76852 7,87 Снижение 5.20E-03 AI806338 T-box 3 (локтевой синдром млекопитающих) /FL=gb:AF170708.2 gb:NM_005996.1
2,951696 -0,00873 7,78 Снижение 4.48E-04 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
3,953402 0,998843 7,75 Снижение 2.51E-04 BC005369 Homo sapiens, открытая рамка считывания 12 хромосомы 1, клон MGC:12484, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chromosome 1 open reading frame 12 /FL=gb:AF277176.1 gb:NM_022051.1 gb:AF229245.1 gb:BC005369.1
4,507212 1,576505 7,62 Снижение 2.04E-04 AW196940 Гены EST
4,055862 1,195121 7,26 Снижение 5.45E-04 AK026815 Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,103964 1,24922 7,23 Снижение 8.28E-05 AA579773 Гены EST
2,001263 -0,84882 7,21 Снижение 3.24E-03 U46768 Человеческий станниокальцин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=stanniocalcin /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
1,1136 -1,73388 7,2 Снижение 3.21E-04 Z70519 Homo sapiens, FASApo 1 мРНК для FAS растворимого белка (клон FAS Exo4Del). /PROD=FAS soluble protein
2,332751 -0,46123 6,94 Снижение 1.69E-04 NM_000077 Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
5,187988 2,402941 6,89 Снижение 3.52E-04 AA074145 гомолог пролиноксидазы
4,255531 1,471522 6,89 Снижение 3.24E-04 AF096296 Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,501184 1,72274 6,86 Снижение 7.80E-05 AK000162 Homo sapiens, кДНК: FLJ20155 fis, клон COL08754, с высокой степенью подобия с ACSA_ECOLI АЦЕТИЛКОЭНЗИМ А-СИНТЕТАЗОЙ.
2,770179 0,000064 6,82 Снижение 2.31E-03 AK000345 Homo sapiens, кДНК: FLJ20338 fis, клон HEP12179.
6,1137 3,356776 6,76 Снижение 2.20E-04 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,506475 1,751272 6,75 Снижение 2.53E-04 AI300520 станниокальцин 1 /FL=gb:U25997.1 gb:NM_003155.1 gb:U46768.1
3,404056 0,670009 6,65 Снижение 4.14E-05 AI623211 лимфоцит-специфический белок 1
2,469646 -0,26027 6,63 Снижение 4.40E-03 N76327 Гены EST с высокой степенью подобия с трансферриновым рецептором 1011297A (H.sapiens)
5,252439 2,542675 6,54 Снижение 3,24E-04 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
5,294065 2,607826 6,44 Снижение 1.45E-03 AF279899 Homo sapiens, PNAS-145, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PNAS-145 /FL=gb:U03105.1 gb:NM_006813.1 gb:AF279899.1
1,312148 -1,30796 6,15 Снижение 2.85E-04 U32500 Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
6,179917 3,561259 6,14 Снижение 3.24E-04 NM_000158 Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
0,959227 -1,64817 6,09 Снижение 2.57E-02 AB033831 Homo sapiens, hSCDGF, мРНК фактора роста из спинного мозга, полная кодовая последовательность. /PROD=spinal cord-derived growth factor /FL=gb:NM_016205.1 gb:AB033831.1 gb:AF091434.1 gb:AF244813.1
0,579765 -1,99563 5,96 Снижение 2.00E-02 AI393930 Гены EST
3,508683 0,978051 5,78 Снижение 4.14E-05 AK027231 Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
1,577138 -0,9435 5,74 Снижение 1.09E-02 M15329 Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
2,982965 0,463474 5,73 Снижение 5.03E-04 AK026829 Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
3,86075 1,347537 5,71 Снижение 7.64E-04 U85995 Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
2,64743 0,138623 5,69 Снижение 2.04E-04 AI702438 Гены EST
3,437271 0,928673 5,69 Снижение 5.45E-04 AB029025 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,886643 0,386181 5,66 Снижение 1.25E-03 NM_022036 Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор, семейство C, группа 5, член C (GPRC5C), вариант транскрипта 1, мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor, family C, group 5,member C, isoform a, precursor /FL=gb:AF207989.1 gb:NM_022036.1
5,099016 2,60798 5,62 Снижение 4.48E-04 NM_018192 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10718 (FLJ10718), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10718 /FL=gb:NM_018192.1
5,807319 3,321529 5,6 Снижение 3.21E-04 NM_018004 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
1,659275 -0,80393 5,51 Снижение 2.08E-03 L16895 Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
2,060071 -0,40069 5,51 Снижение 5.45E-04 AA004300 гипотетический белок DKFZp566I133
3,094055 0,633797 5,5 Снижение 6.17E-04 AW188198 индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
1,865674 -0,57364 5,42 Снижение 1.88E-03 AU156421 Homo sapiens, кДНК: FLJ13457 fis, клон PLACE1003343
5,207569 2,775215 5,4 Снижение 1.32E-04 AA083478 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
2,322104 -0,10923 5,39 Снижение 1.89E-03 AW291369 Гены EST
3,862686 1,433656 5,39 Снижение 1.88E-03 NM_007115 Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
4,881197 2,470702 5,32 Снижение 1.33E-03 NM_001975 Homo sapiens, енолаза 2, (гамма, нейрональная) (ENO2), мРНК. /PROD=enolase 2, (gamma, neuronal) /FL=gb:NM_001975.1 gb:BC002745.1 gb:M22349.1
5,318139 2,908344 5,31 Снижение 4.67E-04 U87408 Кластер включает U87408:Человеческий клон IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
3,41866 1,024231 5,26 Снижение 1.40E-03 AA149250 Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
2,28595 -0,10789 5,26 Снижение 1.74E-03 BE504838 Гены EST
1,143234 -1,2451 5,24 Снижение 2.07E-03 BF437711 Гены EST
2,164901 -0,22261 5,23 Снижение 2.00E-03 AI559300 Гены EST
0,38149 -2,00456 5,23 Снижение 1.36E-02 Z25433 Homo sapiens, ген протеин-серин/треонин киназы, полная кодовая последовательность /PROD=protein-serinethreonine kinase /FL=gb:Z25433.1
2,271332 -0,11134 5,22 Снижение 1.88E-03 NM_015198 Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
2,933166 0,558335 5,19 Снижение 1.04E-03 NM_005780 Homo sapiens, партнер по слиянию липомы HMGIC (LHFP), мРНК. /PROD=lipoma HMGIC fusion partner /FL=gb:NM_005780.1 gb:AF098807.1
3,77776 1,406437 5,17 Снижение 3.24E-04 BU729850 гипотетический белок LOC153469
3,113698 0,751705 5,14 Снижение 7.12E-04 NM_002196 Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
7,564809 5,218561 5,09 Снижение 5.70E-04 M83248 Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
5,209052 2,875305 5,04 Снижение 3.17E-04 AI754404 проколлаген-лизин, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа (лизингидроксилаза) 2 /FL=gb:NM_000935.1 gb:U84573.1
1,639038 -0,68383 5 Снижение 2.00E-03 AW027879 Гены EST с низкой степенью подобия с предшественником декорина NBHUC8 (H.sapiens)
E) Клетки линии H9 39 пассажа через 48 часов стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01 48 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-3,62742 4,403382 261,52 Повышение 9.26E-04 AA772920 Гены EST
-3,26893 4,712617 252,75 Повышение 7.47E-05 NM_001785 Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-4,01441 3,67249 206,06 Повышение 1.83E-04 AB028021 Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,29896 3,38304 205,36 Повышение 6.25E-05 AY177407 Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-0,80043 6,55024 163,22 Повышение 7.98E-05 D87811 Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-2,178 4,977566 142,57 Повышение 5.92E-04 NM_014420 Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог 4 (DKK4), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 4 /FL=gb:AB017788.1 gb:AF177397.1 gb:NM_014420.1
-3,61621 3,360873 125,98 Повышение 8.64E-04 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-3,8752 2,947466 113,19 Повышение 8.92E-05 AB028021 Homo sapiens, HNF-3beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-0,62093 5,956038 95,47 Повышение 7.47E-05 NM_022454 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-1,11159 5,388499 90,52 Повышение 1.05E-04 NM_003867 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-3,7558 2,70012 87,79 Повышение 1.88E-03 AW473656 Гены EST
-0,83997 5,315997 71,31 Повышение 2.36E-04 AI821669 Гены EST
-0,26005 5,721539 63,19 Повышение 1.82E-04 R72286 связанный с микрофибриллами белок 4
-1,32044 4,378147 51,93 Повышение 4.06E-03 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,12747 2,481837 48,82 Повышение 4.18E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-0,69028 4,779809 44,33 Повышение 1.82E-04 M16276 Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
-4,79201 0,661683 43,83 Повышение 3.06E-04 NM_012431 Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-1,55323 3,862277 42,68 Повышение 1.26E-04 AI821586 Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-5,25658 0,098569 40,93 Повышение 1.11E-03 AW005572 предполагаемый белок 47 кДа
-2,45311 2,87165 40,08 Повышение 1.40E-02 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-3,10357 2,19103 39,25 Повышение 6.25E-05 NM_001453 Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,27888 4,97765 38,23 Повышение 7.98E-05 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-0,81978 4,345795 35,89 Повышение 3.86E-04 AI824037 Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-2,4051 2,697137 34,35 Повышение 6.25E-05 NM_021020 Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1), мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
0,756526 5,856918 34,31 Повышение 7.98E-05 NM_003012 Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,41626 4,620452 32,82 Повышение 2.24E-04 BF110534 Гены EST
0,502333 5,516306 32,31 Повышение 1.26E-04 AF211891 Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,39338 2,604622 31,96 Повышение 3.59E-03 M17955 Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
-0,5292 4,348346 29,4 Повышение 1.25E-03 AI127440 Гены EST
-4,15276 0,716875 29,24 Повышение 1.59E-04 AA129444 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-0,18256 4,556137 26,7 Повышение 5.90E-05 AI583173 главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-3,47945 1,255979 26,64 Повышение 2.39E-04 NM_000854 Homo sapiens, глутатион S-трансфераза тэта 2 (GSTT2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase theta 2 /FL=gb:L38503.1 gb:BC002415.1 gb:NM_000854.2
-3,39007 1,340459 26,55 Повышение 9.26E-03 NM_006614 Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-1,61054 3,073011 25,7 Повышение 6.48E-04 AW264204 Гены EST
-0,68225 3,994036 25,57 Повышение 8.92E-05 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-2,69284 1,94677 24,93 Повышение 1.03E-02 R33964 Homo sapiens, кДНК: FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
-3,3099 1,316389 24,7 Повышение 4.00E-03 NM_172037 Homo sapiens, ретинолдегидрогеназа 10 (all-trans) (RDH10), мРНК. /PROD=retinol dehydrogenase 10 /FL=gb:NM_172037.1 gb:AF456765.1
-2,23941 2,381967 24,61 Повышение 2.32E-03 NM_005413 Homo sapiens, гомеобоксного гена sine oculis (Drosophila) гомолог 3 (SIX3), мРНК. /PROD=sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 3 /FL=gb:NM_005413.1
-2,6422 1,964075 24,36 Повышение 8.92E-05 BF589787 Гены EST
-2,05438 2,54631 24,26 Повышение 6.59E-03 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,168713 5,686572 22,91 Повышение 2.60E-04 NM_016139 Homo sapiens, 16,7 кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-0,77864 3,712574 22,49 Повышение 5.77E-04 NM_022055 Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-0,70855 3,762307 22,17 Повышение 7.67E-04 AI917371 Гены EST
-2,06656 2,392721 22 Повышение 2.94E-03 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
3,042634 7,476267 21,61 Повышение 5.90E-05 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
-1,28224 3,131936 21,32 Повышение 2.22E-04 NM_005568 Homo sapiens, LIM гомеобоксный белок 1 (LHX1), мРНК. /PROD=LIM homeobox protein 1 /FL=gb:NM_005568.1 gb:U14755.1
-2,83906 1,564539 21,16 Повышение 4.15E-04 T15545 Гены EST
-0,5777 3,802538 20,82 Повышение 8.57E-04 BC036592 Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-3,88742 0,452273 20,25 Повышение 2.18E-03 AA180985 Гены EST
-1,95127 2,384447 20,19 Повышение 2.26E-03 L12468 Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-4,63418 -0,31383 19,98 Повышение 2.41E-02 BF112218 Гены EST
-2,30432 1,94413 19,01 Повышение 1.88E-02 BC017958 Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-2,9769 1,2531 18,77 Повышение 1.55E-02 AW612111 Гены EST
0,420056 4,641313 18,65 Повышение 7.47E-05 NM_012242 Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-0,41404 3,780442 18,31 Повышение 4.24E-04 AI332407 секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-2,90798 1,272589 18,13 Повышение 1.07E-04 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,84662 0,311955 17,86 Повышение 2.27E-02 BF445031 Гены EST
-0,48487 3,656098 17,64 Повышение 7.98E-05 BG150534 Гены EST
0,442286 4,570914 17,49 Повышение 1.50E-04 NM_001778 Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-2,0457 2,013773 16,67 Повышение 9.72E-04 AI422986 Гены EST
-1,37391 2,670539 16,5 Повышение 1.44E-02 NM_006605 Homo sapiens, подобный белку ret finger белок 2 (RFPL2), мРНК. /PROD=ret finger protein-like 2 /FL=gb:NM_006605.1
-3,51429 0,527621 16,47 Повышение 2.50E-03 AA352113 Гены EST
-0,15629 3,869435 16,29 Повышение 4.57E-04 AI799018 Гены EST
-0,81856 3,176308 15,94 Повышение 8.74E-05 AI129628 Гены EST
-2,38787 1,575045 15,59 Повышение 9.00E-03 BC003517 Homo sapiens, клон IMAGE:3542589, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3542589)
-1,39784 2,47691 14,67 Повышение 2.38E-03 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-2,20139 1,663866 14,57 Повышение 7.98E-05 AI913749 Гены EST
-3,18081 0,676419 14,49 Повышение 2.33E-04 AW449813 белок KIAA0918
-2,14545 1,70837 14,46 Повышение 3.27E-03 NM_015831 Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (YT группа крови) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-2,233 1,502044 13,32 Повышение 1.33E-03 NM_014862 Homo sapiens, генный продукт KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-0,21464 3,518576 13,3 Повышение 5.92E-04 NM_005045 Homo sapiens, рилин (RELN), мРНК. /PROD=reelin /FL=gb:U79716.1 gb:NM_005045.1
-0,96765 2,760723 13,25 Повышение 1.83E-04 NM_024426 Homo sapiens, опухоль Вильмса 1 (WT1), вариант транскрипта D, мРНК. /PROD=Wilms tumor 1 isoform D /FL=gb:NM_024424.1 gb:NM_024426.1
1,076427 4,796662 13,18 Повышение 6.25E-05 AI640307 протокадгерин 10
1,197921 4,916826 13,17 Повышение 6.25E-05 AW150720 гипотетический белок FLJ10262
0,366041 4,082294 13,14 Повышение 1.82E-04 AI242583 Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-0,13396 3,581638 13,14 Повышение 5.99E-04 NM_006206 Homo sapiens, рецептор полученных из тромбоцитов факторов роста, альфа полипептид (PDGFRA), мРНК. /PROD=platelet-derived growth factor receptor, alphapolypeptide /FL=gb:NM_006206.1 gb:M21574.1
-2,08299 1,631534 13,13 Повышение 3.64E-02 NM_002048 Homo sapiens, специфичный для задержки роста белок 1 (GAS1), мРНК. /PROD=growth arrest-specific 1 /FL=gb:NM_002048.1 gb:L13698.1
0,502235 4,214192 13,1 Повышение 2.47E-04 NM_014899 Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
0,500662 4,2088 13,07 Повышение 4.57E-04 AB043703 Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-1,80959 1,846066 12,6 Повышение 2.72E-03 BF447246 белок KIAA0960
0,804491 4,446299 12,48 Повышение 2.36E-04 AA583044 костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
0,937118 4,57509 12,45 Повышение 7.47E-05 AU151342 Homo sapiens, кДНК: FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
2,428694 6,062052 12,41 Повышение 7.98E-05 BF510715 фактор роста фибробластов 4 (гепариновый секреторный трансформирующий белок 1, онкоген саркомы Капоши) /FL=gb:M17446.1 gb:NM_002007.1
-4,25059 -0,61821 12,4 Повышение 2.17E-02 AL834407 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp547H074 (из клона DKFZp547H074).
-2,64131 0,98784 12,37 Повышение 4.22E-02 AU157303 Гены EST
1,370117 4,998653 12,37 Повышение 2.02E-04 M33653 Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
-0,05814 3,523836 11,98 Повышение 5.01E-04 BF308645 белок KIAA1415
0,85401 4,424822 11,88 Повышение 3.70E-04 NM_001742 Homo sapiens, кальцитониновый рецептор (CALCR), мРНК. /PROD=calcitonin receptor /FL=gb:AB022177.1 gb:NM_001742.1 gb:U26553.1 gb:U26554.1
-0,4843 3,086083 11,88 Повышение 1.07E-04 NM_001766 Homo sapiens, CD1D антиген, d полипептид (CD1D), мРНК. /PROD=CD1D antigen, d polypeptide /FL=gb:NM_001766.1 gb:J04142.1
-3,03319 0,529885 11,82 Повышение 3.86E-02 AI378026 Гены EST
-0,45718 3,095926 11,74 Повышение 2.21E-04 BF939489 гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-1,35345 2,18761 11,64 Повышение 3.72E-03 AW157571 Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
1,829497 5,364987 11,6 Повышение 2.65E-04 AA534817 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
0,828954 4,325235 11,28 Повышение 4.08E-04 AK026659 Homo sapiens, кДНК: FLJ23006 fis, клон LNG00414.
-1,68521 1,795916 11,17 Повышение 5.31E-03 NM_002770 Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-1,75731 1,71717 11,12 Повышение 2.72E-02 BC008992 Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
-0,33264 3,138536 11,09 Повышение 2.48E-04 NM_020353 Homo sapiens, фосфолипид-скрамблаза 4 (LOC57088), мРНК. /PROD=phospholipid scramblase 4 /FL=gb:NM_020353.1 gb:AF199023.1
-2,84061 0,614927 10,97 Повышение 1.85E-03 AI123532 Гены EST
-0,11092 3,32528 10,82 Повышение 1.51E-04 BF591483 Гены EST
-2,87916 0,555292 10,81 Повышение 6.20E-03 BF529886 Homo sapiens, кДНК: FLJ39329 fis, клон OCBBF2015751.
0,378586 3,8114 10,8 Повышение 6.60E-05 BF109231 Гены EST
0,53123 3,962218 10,79 Повышение 5.00E-04 BF112171 белок DKFZP564O0423
-1,82351 1,607197 10,78 Повышение 1.13E-03 AA603467 рибосомальный белок S11
-2,56291 0,847807 10,63 Повышение 1.68E-02 BG532690 интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
0,1187 3,529403 10,63 Повышение 1.31E-04 N21184 Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3 конец /clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-3,12055 0,266255 10,46 Повышение 1.87E-02 AW780006 Гены EST
-0,27888 3,087584 10,31 Повышение 1.05E-04 NM_003078 Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
1,223968 4,582504 10,26 Повышение 1.32E-04 AL574912 Гены EST с низкой степенью подобия с серинпротеазой (H.sapiens)
-0,52859 2,828373 10,25 Повышение 6.20E-03 AW590614 Гены EST
-1,20714 2,140319 10,18 Повышение 1.22E-03 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
1,59762 4,944335 10,17 Повышение 1.33E-03 NM_018649 Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-0,75724 2,582097 10,12 Повышение 5.49E-03 AL445192 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
0,884916 4,219652 10,09 Повышение 9.57E-05 NM_000104 Homo sapiens, цитохром P450, подсемейство I (диоксин-индуцируемые), полипептид 1 (глаукома 3, первичный инфантильный) (CYP1B1), мРНК. /PROD=cytochrome P450, subfamily I (dioxin-inducible),polypeptide 1 /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
-2,62694 0,700178 10,04 Повышение 8.15E-03 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
1,388898 4,709109 9,99 Повышение 1.48E-04 BE620739 Гены EST
0,345528 3,626449 9,72 Повышение 6.25E-05 AW276186 главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
1,563993 4,835093 9,65 Повышение 7.47E-05 NM_002413 Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
0,923781 4,188917 9,61 Повышение 7.47E-05 BE897866 Гены EST
-1,64839 1,585806 9,41 Повышение 1.44E-03 NM_004900 Homo sapiens, форболин (сходный с аполипопротеином B мРНК-редактирующий белок) (DJ742C19.2), мРНК. /PROD=phorbolin (similar to apolipoprotein B mRNAediting protein) /FL=gb:NM_004900.1 gb:U61083.1
0,829254 4,053354 9,34 Повышение 1.19E-04 AV697515 гипотетический белок FLJ10262
-0,62897 2,594105 9,34 Повышение 2.12E-02 AI694545 Гены EST
1,040647 4,25749 9,3 Повышение 6.25E-05 AI348094 белок KIAA0882
-2,10316 1,110711 9,28 Повышение 1.17E-02 H49805 Гены EST
-0,67823 2,5328 9,26 Повышение 1.82E-04 AA040057 протокадгерин 20
-0,27302 2,923702 9,17 Повышение 3.58E-04 NM_014271 Homo sapiens, подобный вспомогательному белку рецептора интерлейкина 1 белок 1 (IL1RAPL1), мРНК. /PROD=interleukin 1 receptor accessory protein-like 1 /FL=gb:AF284435.1 gb:NM_014271.1 gb:AF181284.1
0,205308 3,376912 9,01 Повышение 1.73E-04 BF509230 Гены EST
-0,13427 3,027131 8,95 Повышение 1.71E-04 D49958 Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-0,95386 2,202339 8,91 Повышение 5.60E-04 AF312769 Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,39976 1,747599 8,86 Повышение 1.07E-04 NM_005204 Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 8 (MAP3K8), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinase8 /FL=gb:NM_005204.1 gb:D14497.1
-1,12824 2,007285 8,79 Повышение 9.57E-05 AK021452 Homo sapiens, кДНК: FLJ11390 fis, клон HEMBA1000561, с низкой степенью подобия с ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 91.
4,042679 7,170301 8,74 Повышение 2.33E-04 NM_005454 Homo sapiens, гомолог гена cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
2,430238 5,551898 8,7 Повышение 7.47E-05 NM_004929 Homo sapiens, кальбиндин 1, (28 кДа) (CALB1), мРНК. /PROD=calbindin 1 /FL=gb:NM_004929.2
-3,17826 -0,07573 8,59 Повышение 2.88E-02 AI798098 Гены EST
0,424882 3,515001 8,52 Повышение 1.13E-03 AI692659 белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
2,19676 5,285103 8,51 Повышение 6.25E-05 AW264102 Гены EST
-1,16113 1,925599 8,5 Повышение 9.58E-03 NM_012281 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, подсемейство, связанное с Shal, член 2 (KCND2), мРНК. /PROD=potassium voltage-gated channel, Shal-relatedsubfamily, member 2 /FL=gb:NM_012281.1 gb:AB028967.1 gb:AF121104.1
1,071985 4,144927 8,41 Повышение 9.57E-05 NM_004560 Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
1,750623 4,809696 8,33 Повышение 2.20E-04 AA176289 Гены EST
-1,25995 1,783805 8,25 Повышение 1.48E-03 AK026607 Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с мРНК белка AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11).
0,828899 3,847136 8,1 Повышение 6.55E-04 NM_001200 Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
1,690321 4,701963 8,06 Повышение 1.26E-04 NM_014045 Homo sapiens, белок DKFZP564C1940 (DKFZP564C1940), мРНК. /PROD=DKFZP564C1940 protein /FL=gb:BC000424.1 gb:AF131760.1 gb:NM_014045.1
1,979568 4,987789 8,05 Повышение 7.98E-05 M17565 Человеческий MHC, класс II, DQ-beta, связанный с DRw6, белок DQw1, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M17565.1
-0,75007 2,251382 8,01 Повышение 1.88E-03 AI681917 Гены EST с высокой степенью подобия с МЫШИНЫМ IRX3, ГОМЕОДОМЕННЫМ БЕЛКОМ IRX-3 КЛАССА IROQUOIS (M.musculus)
2,109037 5,094219 7,92 Повышение 5.90E-05 AW014927 кальбиндин 1, (28 кДа) /FL=gb:NM_004929.2
1,380324 4,364081 7,91 Повышение 2.74E-04 NM_006895 Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,143628 3,121397 7,88 Повышение 7.94E-03 AB037763 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1342, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1342 protein /FL=gb:AF299075.1
-0,20066 2,775234 7,87 Повышение 4.95E-04 NM_001609 Homo sapiens, ацил-коэнзим А-дегидрогеназа, коротко-ветвистая цепь (ACADSB), ядерный ген, кодирующий митохондриальный белок, мРНК. /PROD=acyl-Coenzyme A dehydrogenase, shortbranchedchain precursor /FL=gb:U12778.1 gb:NM_001609.1
-2,16611 0,806244 7,85 Повышение 2.70E-02 NM_001977 Homo sapiens, глутамиламинопептидаза (аминопептидаза A) (ENPEP), мРНК. /PROD=glutamyl aminopeptidase (aminopeptidase A) /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
0,007601 2,978021 7,84 Повышение 3.96E-04 N63706 Гены EST
1,186033 4,154093 7,82 Повышение 1.02E-04 AI627704 Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
1,207341 4,163803 7,76 Повышение 7.98E-05 M31213 Кодируемый папиллярной карциномой щитовидной железы человека белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M31213.1
0,106425 3,062268 7,76 Повышение 1.05E-04 NM_018371 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11264 (FLJ11264), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11264 /FL=gb:NM_018371.1
1,997597 4,940494 7,69 Повышение 8.49E-05 BC005997 Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
-0,29145 2,648165 7,67 Повышение 8.78E-04 AI197932 Гены EST
-1,20098 1,732939 7,64 Повышение 8.76E-03 NM_001794 Homo sapiens, кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчаточный) (CDH4), мРНК. /PROD=cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal) /FL=gb:L34059.1 gb:NM_001794.1
-0,96106 1,954749 7,55 Повышение 3.03E-04 AU153412 Homo sapiens, кДНК: FLJ13136 fis, клон NT2RP3003139
4,072718 6,987624 7,54 Повышение 3.42E-04 AU144598 молекула клеточного распознавания Caspr2 /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
1,754933 4,669573 7,54 Повышение 1.40E-04 NM_013231 Homo sapiens, фибронектиновый богатый лейцином трансмембранный белок 2 (FLRT2), мРНК. /PROD=fibronectin leucine rich transmembrane protein2 /FL=gb:AB007865.1 gb:AF169676.1 gb:NM_013231.1
-2,81405 0,095993 7,52 Повышение 9.09E-03 AI694325 Гены EST
-1,80965 1,082014 7,42 Повышение 2.00E-02 NM_152506 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
0,360809 3,246455 7,39 Повышение 7.76E-03 N47315 субстрат протеинкиназы C и казеинкиназы в нейронах 1
-0,10733 2,776046 7,38 Повышение 2.10E-03 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,44407 1,430083 7,33 Повышение 1.37E-02 U91903 Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,383898 5,242759 7,25 Повышение 9.57E-05 BF476502 гипотетический белок FLJ11585
-1,74597 1,112559 7,25 Повышение 3.28E-02 AW269818 гипотетический белок FLJ23403 /FL=gb:NM_022068.1
-2,26295 0,569202 7,12 Повышение 1.70E-02 AI735586 Гены EST
-1,6164 1,213758 7,11 Повышение 2.52E-02 X00452 Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-0,13959 2,687835 7,1 Повышение 3.70E-04 BG109855 Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
-0,88175 1,936253 7,05 Повышение 3.50E-03 AI650874 Гены EST
-1,37453 1,440655 7,04 Повышение 1.15E-02 AF126966 Homo sapiens, изоформа а альфа1G субъединицы потенциал-зависимого кальциевого канала (CACNA1G), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=voltage-dependent calcium channel alpha 1Gsubunit a isoform /FL=gb:AF190860.1 gb:AF126966.1
-3,09265 -0,28152 7,02 Повышение 9.07E-03 AI093492 Гены EST
-0,54935 2,252035 6,97 Повышение 1.12E-03 NM_006877 Homo sapiens, гуанозинмонофосфатредуктаза (GMPR), мРНК. /PROD=guanosine monophosphate reductase /FL=gb:M24470.1 gb:NM_006877.1
1,956109 4,750668 6,94 Повышение 2.21E-04 AI332979 калиевый потенциал-зависимый канал, подсемейство G, член 1 /FL=gb:NM_002237.1 gb:AF033383.1
-1,26967 1,520668 6,92 Повышение 7.48E-03 AW166711 белок KIAA0403
-0,23726 2,551912 6,91 Повышение 3.23E-04 AA912476 Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
2,093848 4,875184 6,87 Повышение 5.90E-05 AC004010 BAC клон человека GS1-99H8
-0,96264 1,812987 6,85 Повышение 6.20E-03 AB028998 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1075, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1075 protein
-2,33994 0,434528 6,84 Повышение 3.67E-02 AL134708 Гены EST
-2,08762 0,681751 6,82 Повышение 2.01E-02 AF052117 Homo sapiens, последовательность мРНК клона 23809.
0,323675 3,088394 6,8 Повышение 8.50E-03 M32577 Человеческий MHC, HLA-DQ бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M32577.1
3,287037 6,047807 6,78 Повышение 5.77E-04 AI633559 Гены EST
-2,02151 0,737644 6,77 Повышение 3.93E-03 BF062244 Гены EST
-1,66608 1,08864 6,75 Повышение 1.86E-02 BE673445 Homo sapiens, хромосома 19, космида R28379
0,449168 3,190138 6,69 Повышение 1.96E-04 AI688418 плексин A2
0,798972 3,539942 6,69 Повышение 4.35E-04 AI082827 гипотетический белок FLJ11585
0,83572 3,564527 6,63 Повышение 1.99E-03 N21138 белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
1,231172 3,958844 6,62 Повышение 2.36E-04 AI949419 Гены EST
-2,31389 0,411671 6,61 Повышение 1.05E-02 AF302494 Homo sapiens, потенциал-зависимый калиевый канал, субъединица MIRP2 (KCNE3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=voltage-gated K+ channel subunit MIRP2 /FL=gb:NM_005472.1 gb:AF076531.1 gb:AF302494.1
1,415513 4,132936 6,58 Повышение 3.18E-04 AI692703 калиевый потенциал-зависимый канал, Isk-связанное семейство, член 3
0,631332 3,346113 6,56 Повышение 5.92E-04 AI130705 Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
3,954335 6,666275 6,55 Повышение 7.98E-05 AB020675 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0868, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0868 protein /FL=gb:AF193613.1 gb:NM_014141.1
-1,09181 1,620124 6,55 Повышение 2.00E-02 AI653050 Гены EST с низкой степенью подобия с HPPD_HUMAN 4 - ГИДРОКСИФЕНИЛПИРУВАТ-ДИОКСИГЕНАЗОЙ (H.sapiens)
1,888188 4,581731 6,47 Повышение 3.37E-04 AW340311 Гены EST
-1,83503 0,855966 6,46 Повышение 6.85E-03 AA552969 Гены EST
-2,08627 0,604316 6,46 Повышение 1.75E-03 N50714 Гены EST
-1,2719 1,416234 6,44 Повышение 4.00E-03 NM_020406 Homo sapiens, истинная первичная полицитемия 1; рецептор на поверхности клетки (PRV1), мРНК. /PROD=polycythemia rubra vera 1; cell surfacereceptor /FL=gb:NM_020406.1 gb:AF146747.1
2,444644 5,126622 6,42 Повышение 2.48E-04 AA789332 Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1215 (H.sapiens)
-1,10551 1,574234 6,41 Повышение 1.76E-02 AL136859 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434P1735 (из клона DKFZp434P1735); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AL136859.1
-1,30127 1,354641 6,3 Повышение 4.69E-04 AI003579 переносчик растворенных веществ, семейство 6 (переносчик нейромедиаторов, GABA), член 1 /FL=gb:NM_003042.1
-0,22337 2,432405 6,3 Повышение 5.31E-03 NM_021822 Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-1,25121 1,403996 6,3 Повышение 1.13E-03 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
-1,55104 1,102459 6,29 Повышение 7.99E-04 AU157716 Homo sapiens, кДНК: FLJ13585 fis, клон PLACE1009150
-2,47063 0,175591 6,26 Повышение 1.53E-02 H09657 Гены EST
0,373467 3,018454 6,25 Повышение 1.79E-03 AU151239 Homo sapiens, кДНК: FLJ12927 fis, клон NT2RP2004743
1,861693 4,496649 6,21 Повышение 3.70E-04 AI374739 Гены EST
-1,73396 0,890885 6,17 Повышение 1.62E-02 AU145336 Homo sapiens, кДНК: FLJ11655 fis, клон HEMBA1004554
1,586056 4,195825 6,1 Повышение 4.67E-04 Z83851 Последовательность человеческой ДНК от клонирования 989H11 на хромосоме 22q13.1-13.2. Содержит часть нового гена, гены EST, GSS и четыре предполагаемых CpG-островка
0,569298 3,178582 6,1 Повышение 3.18E-04 NM_000362 Homo sapiens, тканевой ингибитор металлопротеиназы 3 (фундальная дистрофия Сорсби, псевдовоспалительная) (TIMP3), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 3precursor /FL=gb:NM_000362.2 gb:U14394.1 gb:U67195.1 gb:U02571.1
-2,13754 0,46922 6,09 Повышение 2.02E-02 BF000203 Гены EST
0,013383 2,617624 6,08 Повышение 5.42E-03 L10374 Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК.
1,250788 3,85327 6,07 Повышение 1.09E-04 AF077040 Homo sapiens, SIH003 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=SIH003 /FL=gb:AF077040.1
-1,09421 1,502221 6,05 Повышение 2.38E-03 AK023621 Homo sapiens, кДНК: FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
0,466394 3,059875 6,04 Повышение 5.79E-04 NM_003121 Homo sapiens, транскрипционный фактор Spi-B (связанный с Spi-1PU.1) (SPIB), мРНК. /PROD=Spi-B transcription factor (Spi-1PU.1 related) /FL=gb:NM_003121.1
-0,18863 2,401303 6,02 Повышение 3.85E-03 AV700724 GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
2,182526 4,77117 6,02 Повышение 8.49E-05 NM_004010 Homo sapiens, дистрофин (мышечная дистрофия, типы Дюшена и Беккера), включает DXS142, DXS164, DXS206, DXS230, DXS239, DXS268, DXS269, DXS270, DXS272 (DMD), вариант транскрипта Dp427p2, мРНК. /PROD=dystrophin Dp427p2 isoform /FL=gb:NM_004010.1
1,08211 3,666711 6 Повышение 9.72E-04 AF010314 Homo sapiens, Pig10 (PIG10) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Pig10 /FL=gb:AF059611.1 gb:AF010314.1 gb:NM_003633.1 gb:BC000418.1 gb:AF005381.1
-1,4606 1,112751 5,95 Повышение 1.20E-03 AW072102 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434H205 (из клона DKFZp434H205)
2,092702 4,657439 5,92 Повышение 6.25E-05 AA700440 Гены EST
0,513482 3,076608 5,91 Повышение 3.96E-04 AU154504 цитохром P450, подсемейство I (диоксин-индуцируемые), полипептид 1 (глаукома 3, первичный инфантильный) /FL=gb:U03688.1 gb:NM_000104.2
-1,13676 1,422546 5,89 Повышение 6.80E-03 AB023144 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0927, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0927 protein
1,297014 3,854685 5,89 Повышение 1.02E-04 NM_005756 Homo sapiens, связанный с G-белком рецептор 64 (GPR64), мРНК. /PROD=G protein-coupled receptor 64 /FL=gb:NM_005756.1
-0,68272 1,867351 5,86 Повышение 5.59E-03 AF159447 Homo sapiens, подавитель составной мРНК, альтернативная форма сплайсинга 2, полная кодовая последовательность. /PROD=Suppressor of Fused /FL=gb:NM_016169.1 gb:AF159447.1 gb:AF175770.1
-3,12304 -0,58481 5,81 Повышение 4.03E-02 NM_018018 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10191 (FLJ10191), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10191 /FL=gb:NM_018018.1
1,163123 3,692873 5,77 Повышение 1.63E-04 NM_002742 Homo sapiens, протеинкиназа C, мю (PRKCM), мРНК. /PROD=protein kinase C, mu /FL=gb:NM_002742.1
-0,35867 2,162789 5,74 Повышение 1.69E-04 NM_001957 Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
2,405473 4,925144 5,73 Повышение 6.25E-05 AI283093 Гены EST
-1,58235 0,936512 5,73 Повышение 1.59E-03 NM_018419 Homo sapiens, SRY (определяющий пол участок Y-хромосомы)-бокс 18 (SOX18), мРНК. /PROD=SRY (sex determining region Y)-box 18 /FL=gb:AF270652.1 gb:AB033888.1 gb:NM_018419.1
-1,88254 0,627373 5,7 Повышение 6.20E-03 BF694956 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-187J11 на хромосоме 6q11.1-22.33. Содержит ген нового белка, подобного предсказанным белкам S. pombe и S. cerevisiae, ген нового белка, подобного ингибиторам протеинкиназы C, 3-конец
-0,68545 1,817815 5,67 Повышение 5.99E-03 BC035640 Homo sapiens, клон IMAGE:5547405, мРНК.
-1,92555 0,569805 5,64 Повышение 1.75E-03 BE856597 Гены EST
3,313759 5,801354 5,61 Повышение 1.18E-04 AB020657 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA0850, полная кодовая последовательность. /PROD=KIAA0850 protein /FL=gb:AB020657.1 gb:AF161553.1 gb:AF205218.1 gb:NM_016389.1
4,49505 6,977964 5,59 Повышение 6.25E-05 AK093435 Homo sapiens, кДНК: FLJ36116 fis, клон TESTI2022338.
0,618056 3,100379 5,59 Повышение 1.33E-04 BG165333 Гены EST
-1,12392 1,354596 5,57 Повышение 2.50E-03 T82147 Гены EST
-1,17289 1,304294 5,57 Повышение 6.03E-03 AW025980 Гены EST с низкой степенью подобия с A47582, предшественником факторов роста B-клеток (H.sapiens)
-0,66753 1,784294 5,47 Повышение 9.05E-04 AF284435 Homo sapiens, TIGIRR-2 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=TIGIRR-2 /FL=gb:AF284435.1 gb:NM_014271.1 gb:AF181284.1
-0,04543 2,399112 5,44 Повышение 1.46E-03 AB037730 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1309, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1309 protein
-2,47478 -0,03132 5,44 Повышение 8.96E-03 NM_152687 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ33641 (FLJ33641), мРНК. /FL=gb:NM_152687.1
-1,89695 0,545787 5,44 Повышение 3.46E-03 AL136944 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
1,095538 3,529324 5,4 Повышение 1.59E-04 AF319520 Homo sapiens, ARG99 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ARG99 /FL=gb:AF319520.1
2,130365 4,562488 5,4 Повышение 8.49E-05 BC005047 Homo sapiens, клон MGC:12852, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:12852) /FL=gb:NM_001946.1 gb:AB013382.1 gb:BC003562.1 gb:BC003143.1 gb:BC005047.1
3,686635 6,118029 5,39 Повышение 1.82E-04 AF205218 Homo sapiens, подобный связывающему белку NS1 белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NS1-binding protein-like protein /FL=gb:AB020657.1 gb:AF161553.1 gb:AF205218.1 gb:NM_016389.1
1,298769 3,727597 5,38 Повышение 2.76E-04 AI123815 Гены EST
1,182358 3,610132 5,38 Повышение 1.82E-04 AW270138 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1729, частичная кодовая последовательность
-1,39667 1,02491 5,36 Повышение 6.51E-03 AI018174 Гены EST
-0,47241 1,946888 5,35 Повышение 6.80E-03 NM_006604 Homo sapiens, подобный белку ret finger белок 3 (RFPL3), мРНК. /PROD=ret finger protein-like 3 /FL=gb:NM_006604.1
-0,68921 1,725879 5,33 Повышение 1.34E-04 NM_016546 Homo sapiens, предшественник комплемент-C1r-подобной протеиназы, (LOC51279), мРНК. /PROD=complement C1r-like proteinase precursor, /FL=gb:AF178985.1 gb:NM_016546.1
-0,17505 2,238912 5,33 Повышение 1.05E-04 AA995925 Homo sapiens, последовательность мРНК клона 23741
-0,20099 2,21229 5,33 Повышение 1,55E-03 BF984830 индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
2,377335 4,79048 5,33 Повышение 4.69E-04 NM_005328 Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-0,98665 1,425455 5,32 Повышение 1.34E-02 NM_001463 Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
2,264046 4,672118 5,31 Повышение 1.25E-04 AL049589 Последовательность человеческой ДНК из клона 570L12 на хромосоме Xq13.1-21.1. Содержит ген PGK1 для фосфоглицераткиназы 1, ген нового белка, подобного TAF2G (фактором, ассоциированным с белком, связывающим TATA-участок (TBP), РНК-полимераза II, G, 32 кДа) (TAF...
-0,35323 2,046488 5,28 Повышение 2.37E-03 BM666010 Homo sapiens, кДНК: FLJ23803 fis, клон HEP22811.
3,472109 5,867303 5,26 Повышение 7.98E-05 AW069729 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434B2119 (из клона DKFZp434B2119); частичная кодовая последовательность
0,977201 3,368558 5,25 Повышение 7.47E-05 AI656807 Гены EST
2,732975 5,121756 5,24 Повышение 6.52E-04 AC005378 Homo sapiens, PAC клон RP5-1137M13 из хромосомы 7q33-q35
1,592667 3,976725 5,22 Повышение 6.48E-04 AI978754 Гены EST
1,008383 3,391251 5,22 Повышение 8.23E-04 BE397715 транскрипционный фактор 2 лейкимии предшественников В-клеток /FL=gb:NM_002586.1
0,134434 2,516313 5,21 Повышение 3.13E-04 AV758821 Гены EST с низкой степенью подобия с Z132_HUMAN, ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 13 (H.sapiens)
1,496791 3,877324 5,21 Повышение 8.49E-05 BF338045 калуменин
0,329872 2,705019 5,19 Повышение 1.05E-04 AI652899 Гены EST
-0,39856 1,964554 5,14 Повышение 1.29E-03 BC019064 Homo sapiens, подобный гипотетическому белку FLJ14743, клон MGC:29781 IMAGE:4590587, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to hypothetical protein FLJ14743 /FL=gb:BC019064.1
0,462867 2,81993 5,12 Повышение 8.02E-03 AI807026 Гены EST
0,385307 2,742224 5,12 Повышение 4.37E-04 BF435123 содержащий бромодомен и белок PHD-finger 3
-1,10371 1,252512 5,12 Повышение 9.04E-04 NM_005985 Homo sapiens, snail 1 (drosophila, гомолог), цинк-пальцевый белок (SNAI1), мРНК. /PROD=snail 1 (drosophila homolog), zinc fingerprotein /FL=gb:AF125377.1 gb:NM_005985.1
1,094591 3,449692 5,12 Повышение 1.02E-04 NM_024064 Homo sapiens, гипотетический белок MGC5363 (MGC5363), мРНК. /PROD=hypothetical protein MGC5363 /FL=gb:BC001000.2 gb:NM_024064.1
2,167442 4,520183 5,11 Повышение 4.37E-04 NM_001552 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 4 (IGFBP4), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor-binding protein 4 /FL=gb:M62403.1 gb:NM_001552.1
2,49682 4,845096 5,09 Повышение 2.00E-04 NM_014943 Homo sapiens, белок KIAA0854 (KIAA0854), мРНК. /PROD=KIAA0854 protein /FL=gb:NM_014943.1 gb:AB020661.1
0,089114 2,430633 5,07 Повышение 5.31E-03 AW014734 Гены EST
0,208844 2,544219 5,05 Повышение 4.90E-04 H09780 Человеческая (клон CTG-A4) последовательность мРНК
1,38879 3,721503 5,04 Повышение 1.05E-04 D21254 Человеческая мРНК для OB-кадгерин-1, полная кодовая последовательность. /PROD=OB-cadherin-1 /FL=gb:L34056.1 gb:NM_001797.1 gb:D21254.1
-0,07494 2,251273 5,01 Повышение 8.04E-04 NM_001394 Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4 (DUSP4), мРНК. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
2,115363 4,439619 5,01 Повышение 1.50E-04 NM_018700 Homo sapiens, связывающий цинк белок Rbcc728 (Rbcc728), мРНК. /PROD=zinc-binding protein Rbcc728 /FL=gb:NM_018700.1
1,361153 -4,07391 43,26 Снижение 4.28E-04 NM_014352 Homo sapiens, транскрипционный фактор POU (OCT11), мРНК. /PROD=POU transcription factor /FL=gb:NM_014352.1 gb:AF133895.1 gb:AF162278.1
1,312148 -3,67593 31,74 Снижение 2.15E-02 U32500 Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
3,409815 -1,40094 28,07 Снижение 4.88E-03 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
0,757197 -4,01309 27,29 Снижение 5.31E-03 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
5,187988 0,925716 19,19 Снижение 1.82E-04 AA074145 гомолог пролиноксидазы
3,862686 -0,33976 18,41 Снижение 1.79E-03 NM_007115 Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,579765 -3,61266 18,28 Снижение 1.63E-03 AI393930 Гены EST
3,77776 -0,38219 17,88 Снижение 4.99E-04 BU729850 гипотетический белок LOC153469
2,951696 -1,16992 17,41 Снижение 5.31E-03 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
1,143234 -2,96901 17,29 Снижение 1.60E-04 BF437711 Гены EST
3,268087 -0,81338 16,93 Снижение 1.82E-04 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,113698 -0,8325 15,41 Снижение 6.25E-05 NM_002196 Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
4,927935 1,009599 15,12 Снижение 1.75E-04 J05008 Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_001955.1
4,897427 1,053368 14,36 Снижение 6.25E-05 R06655 Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
2,271332 -1,54277 14,07 Снижение 1.21E-02 NM_015198 Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
3,025351 -0,68158 13,06 Снижение 6.25E-05 AW590925 Гены EST
0,961816 -2,64027 12,14 Снижение 1.38E-02 AI796169 GATA-связывающий белок 3 /FL=gb:NM_002051.1 gb:M69106.1 gb:BC003070.1
1,840613 -1,75619 12,1 Снижение 1.31E-02 AI949760 Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
2,350127 -1,16435 11,43 Снижение 1.75E-03 AK026106 Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного 2 (TLL2) белка, Homo sapiens.
2,36447 -1,11975 11,19 Снижение 1.26E-04 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,806044 0,35797 10,91 Снижение 5.32E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
5,023981 1,579769 10,88 Снижение 1.50E-04 NM_006472 Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
7,564809 4,126951 10,84 Снижение 6.52E-04 M83248 Человеческий нефропонтин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
4,055862 0,664604 10,49 Снижение 9.57E-05 AK026815 Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
3,437271 0,12475 9,94 Снижение 3.82E-04 AB029025 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,129273 -1,1448 9,67 Снижение 1.66E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
4,847114 1,573515 9,67 Снижение 1.73E-04 NM_006474 Homo sapiens, ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
1,577138 -1,67271 9,51 Снижение 7.76E-03 M15329 Человеческий интерлейкин 1-альфа (IL1A), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=interleukin 1-alpha /FL=gb:M15329.1
4,505436 1,287267 9,31 Снижение 9.57E-05 W57613 Гены EST
3,508683 0,294832 9,28 Снижение 1.97E-04 AK027231 Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
2,62025 -0,53251 8,89 Снижение 5.60E-04 AA625683 Гены EST
1,659275 -1,48435 8,84 Снижение 9.40E-04 L16895 Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
5,207569 2,064859 8,83 Снижение 2.72E-04 AA083478 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
2,306225 -0,8129 8,69 Снижение 2.76E-04 AW444761 Гены EST
2,000419 -1,10961 8,63 Снижение 5.03E-03 NM_031272 Homo sapiens, экспрессированная последовательность 14 яичек (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
5,450694 2,394209 8,32 Снижение 9.84E-05 AF095771 Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
5,252439 2,196404 8,32 Снижение 1.18E-03 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,507212 1,458704 8,27 Снижение 1.26E-04 AW196940 Гены EST
3,543738 0,544705 7,99 Снижение 4.95E-04 NM_001955 Homo sapiens, эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
3,334996 0,337521 7,99 Снижение 1.34E-05 R40917 фосфодиэстераза 4D, цАМФ-специфичная (гомологичная гену дрозофилы (Drosophila) фосфодиэстераза E3) /FL=gb:L20969.1 gb:NM_006203.1 gb:U02882.1
4,092731 1,098988 7,97 Снижение 7.83E-04 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,19487 0,215496 7,89 Снижение 2.37E-03 NM_173553 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ25801 (FLJ25801), мРНК. /FL=gb:NM_173553.1
5,388254 2,421904 7,82 Снижение 3.23E-04 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,094055 0,128818 7,81 Снижение 3.00E-04 AW188198 индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
2,332751 -0,63023 7,8 Снижение 9.35E-05 NM_000077 Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
1,10782 -1,84525 7,74 Снижение 3.46E-03 BC029425 Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
3,655193 0,705514 7,73 Снижение 3.18E-04 AI659927 Homo sapiens, кДНК: FLJ22547 fis, клон HSI00356
5,356771 2,412135 7,7 Снижение 1.86E-04 W92036 Гены EST
2,28595 -0,65294 7,67 Снижение 2.78E-03 BE504838 Гены EST
6,1137 3,198978 7,54 Снижение 2.22E-04 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
4,738703 1,825888 7,53 Снижение 1.59E-04 NM_014033 Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
4,633038 1,723613 7,51 Снижение 7.34E-05 NM_016931 Homo sapiens, NADPH-оксидаза 4 (NOX4), мРНК. /PROD=NADPH oxidase 4 /FL=gb:AF261943.1 gb:NM_016931.1 gb:AF254621.1 gb:AB041035.1
0,831091 -2,07313 7,49 Снижение 1.64E-02 NM_153036 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32239 (FLJ32239), мРНК. /FL=gb:NM_153036.1
3,030236 0,148098 7,37 Снижение 1.06E-03 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
5,715937 2,845518 7,31 Снижение 6.25E-05 U85658 Человеческий транскрипционный фактор ERF-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ERF-1 /FL=gb:NM_003222.1 gb:U85658.1
2,597946 -0,264 7,27 Снижение 1.96E-04 AW138143 Гены EST
2,798327 -0,06241 7,26 Снижение 1.59E-04 BF062943 протокадгерин 18
2,590871 -0,2675 7,25 Снижение 5.03E-03 NM_016569 Homo sapiens, изо-белокTBX3 (TBX3-iso), мРНК. /PROD=TBX3-iso protein /FL=gb:NM_016569.1 gb:AF216750.1
2,967768 0,161666 6,99 Снижение 2.73E-03 AL121753 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-614O4 на хромосоме 20q11.1-12. Содержит 3-часть MMP24 (ген матриксной металлопротеазы 24 (вставленной в мембрану)), ген ITGB4BP (белка, связывающего интегрин-бета 4), 3-конец нового гена, 3-конец ...
1,041706 -1,73204 6,84 Снижение 3.48E-02 BF196010 Гены EST
0,424388 -2,34418 6,81 Снижение 3.04E-03 NM_002433 Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
6,307554 3,554438 6,74 Снижение 3.96E-04 NM_006622 Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
3,876749 1,137352 6,68 Снижение 1.28E-03 AL574184 гидроксипростагландин-дегидрогеназа 15-(NAD) /FL=gb:NM_000860.1 gb:L76465.1
7,67265 4,935152 6,67 Снижение 3.86E-04 NM_002966 Homo sapiens, связывающего кальций белок S100 A10 (лиганд аннексина II, кальпактин I, легкий полипептид (p11)) (S100A10), мРНК. /PROD=S100 calcium-binding protein A10 /FL=gb:M81457.1 gb:M38591.1 gb:NM_002966.1
3,127666 0,401912 6,62 Снижение 4.36E-04 NM_003577 Homo sapiens, недифференцированной эмбриональной клетки транскрипционный фактор 1 (UTF1), мРНК. /PROD=undifferentiated embryonic cell transcriptionfactor 1 /FL=gb:NM_003577.1 gb:AB011076.1
2,677334 -0,04099 6,58 Снижение 4.48E-04 NM_000094 Homo sapiens, коллаген, тип VII, альфа 1 (epidermolysis bullosa, дистрофичный, доминантный и рецессивный) (COL7A1), мРНК. /PROD=collagen, type VII, alpha 1 (epidermolysisbullosa, dystrophic, dominant and recessive) /FL=gb:L02870.1 gb:NM_000094.1
4,796495 2,100178 6,48 Снижение 2.14E-05 AI653107 Гены EST
1,075159 -1,6205 6,48 Снижение 2.02E-02 J03580 Человеческий паратиреоидподобный белок (связанный со злокачественной гуморальной гиперкальцемией), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J03580.1
3,86075 1,187353 6,38 Снижение 1.59E-04 U85995 Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
0,300578 -2,35535 6,3 Снижение 2.44E-02 AI110886 протимозин альфа (генная последовательность 28)
0,182328 -2,47093 6,29 Снижение 1.88E-02 BC036917 Homo sapiens, клон MGC:46457 IMAGE:5201433, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Unknown (protein for MGC:46457) /FL=gb:BC036917.1
6,568635 3,918368 6,28 Снижение 1.51E-04 AL031602 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
1,639038 -1,00453 6,25 Снижение 5.77E-04 AW027879 Гены EST с низкой степенью подобия с предшественником декорина NBHUC8 (H.sapiens)
4,038177 1,406797 6,2 Снижение 1.02E-04 BF449053 Гены EST
6,008797 3,380703 6,18 Снижение 1.64E-03 W72516 дигидропиримидиназа-подобный белок 3 /FL=gb:NM_001387.1 gb:D78014.1
2,098906 -0,52676 6,17 Снижение 2.78E-03 NM_003914 Homo sapiens, циклин A1 (CCNA1), мРНК. /PROD=cyclin A1 /FL=gb:NM_003914.1 gb:U66838.1
1,99849 -0,59877 6,05 Снижение 5.92E-04 NM_002317 Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
2,982965 0,397911 6 Снижение 1.82E-04 AK026829 Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
3,08363 0,500579 5,99 Снижение 1.74E-04 U73778 Предшественник человеческого коллагена типа XII альфа 1 (COL12A1), мРНК. /PROD=collagen type XII alpha-1 /FL=gb:NM_004370.3
0,857744 -1,71151 5,94 Снижение 4.12E-03 AB085901 Homo sapiens, DBL мРНК для DBL прото-онкогена, вариант сплайсинга 1, полная кодовая последовательность. /PROD=DBL proto-oncogene splicing variant 1 /FL=gb:AB085901.1
7,251816 4,700433 5,86 Снижение 3.86E-04 NM_000700 Homo sapiens, аннексин A1 (ANXA1), мРНК. /PROD=annexin I /FL=gb:BC001275.1 gb:NM_000700.1
5,318139 2,768691 5,85 Снижение 9.51E-05 U87408 Кластер включает U87408:Человеческого клона IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
0,668218 -1,87886 5,84 Снижение 1.56E-02 BE048571 Гены EST
4,103964 1,558115 5,84 Снижение 8.74E-05 AA579773 Гены EST
0,549053 -1,9953 5,83 Снижение 4.41E-02 AI825645 Гены EST с низкой степенью подобия с GBX2_HUMAN, ГОМЕОБОКСОВЫМ БЕЛКОМ GBX-2 (H.sapiens)
2,98904 0,457127 5,78 Снижение 7.98E-05 AW138143 Гены EST
3,280973 0,749482 5,78 Снижение 2.21E-04 AL139377 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
2,750597 0,238017 5,71 Снижение 1.92E-02 NM_006942 Homo sapiens, SRY (определяющий пол участок Y-хромосомы)-бокс 20 (SOX20), мРНК. /PROD=SRY (sex determining region Y)-box 20 /FL=gb:NM_006942.1 gb:BC000985.1 gb:AB006867.1
3,880272 1,369596 5,7 Снижение 1.82E-04 NM_002521 Homo sapiens, натрийуретического пептида предшественник B (NPPB), мРНК. /PROD=natriuretic peptide precursor B /FL=gb:NM_002521.1 gb:M25296.1
2,324824 -0,18374 5,69 Снижение 2.00E-04 AL096771 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-238D15 на хромосоме 6q12-14.3 Содержит часть гена COL12A1 (коллаген, тип XII, альфа 1) и гены STS
6,179917 3,681421 5,65 Снижение 6.25E-05 NM_000158 Homo sapiens, глюкан (1,4-альфа-), ветвящий фермент 1 (гликоген-ветвящий фермент, болезнь Андерсена, гликогеновая болезнь типа IV) (GBE1), мРНК. /PROD=glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1(glycogen branching enzyme) /FL=gb:L07956.1 gb:NM_000158.1
6,777916 4,283022 5,64 Снижение 3.42E-04 U15174 Homo sapiens, взаимодействующий с белком BCL2adenovirus E1B 19 кДа белок 3 (BNIP3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=BCL2adenovirus E1B 19kD-interacting protein 3 /FL=gb:AF002697.1 gb:NM_004052.2 gb:U15174.1
3,560033 1,066273 5,63 Снижение 4.18E-04 U38945 Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
2,64743 0,1565 5,62 Снижение 7.06E-03 AI702438 Гены EST
4,981033 2,492173 5,61 Снижение 7.98E-05 NM_000602 Homo sapiens, ингибитор сериновой (или цистеиновой) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор типа 1 активатора плазминогена), член 1 (SERPINE1), мРНК. /PROD=serine (or cysteine) proteinase inhibitor, cladeE (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), membe
5,13621 2,649783 5,6 Снижение 1.82E-04 BC013944 Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
2,648874 0,170587 5,57 Снижение 2.39E-04 AW007532 Человеческий связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 5 (IGFBP5), мРНК
4,285883 1,811154 5,56 Снижение 1.26E-04 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
3,41866 0,980192 5,42 Снижение 3.42E-04 AA149250 Гены EST с низкой степенью подобия с КРЫСИНЫМ WDNM, КРЫСИНЫМ БЕЛКОМ-ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ WDNM1 (R.norvegicus)
3,932141 1,49687 5,41 Снижение 6.25E-05 NM_004490 Homo sapiens, связанный с рецепторами фактора роста белок 14 (GRB14), мРНК. /PROD=growth factor receptor-bound protein 14 /FL=gb:L76687.1 gb:NM_004490.1
4,64236 2,208805 5,4 Снижение 4.99E-04 AB019695 Homo sapiens, мРНК для тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
2,256481 -0,17666 5,4 Снижение 2.51E-03 NM_018495 Homo sapiens, белок NAG22 (LOC55873), мРНК. /PROD=NAG22 protein /FL=gb:AF247820.3 gb:NM_018495.3
2,93223 0,515985 5,34 Снижение 1.40E-03 J05594 Homo sapiens, NAD+-зависимая 15-гидроксипростагландин-дегидрогеназа (PDGH), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=NAD+-dependent 15-hydroxyprostaglandindehydrogenase /FL=gb:J05594.1
3,557525 1,145962 5,32 Снижение 1.74E-04 BF514079 Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
6,844763 4,45073 5,26 Снижение 5.92E-04 AF003114 Homo sapiens, CYR61 мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:AF003114.1
3,947271 1,57134 5,19 Снижение 3.82E-04 AI928035 Гены EST
4,835771 2,460275 5,19 Снижение 1.74E-04 AL574210 ингибитор серин- (или цистеин-) протеиназы, ветвь E (нексин, ингибитор активатора плазминогена типа 1), член 1 /FL=gb:NM_000602.1 gb:M16006.1
5,332534 2,96686 5,15 Снижение 2.34E-04 AW189885 протокадгерин 18
5,43052 3,069652 5,14 Снижение 2.73E-04 AU154455 ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I
3,041407 0,703421 5,06 Снижение 1.48E-04 NM_004472 Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) D1 (FOXD1), мРНК. /PROD=forkhead box D1 /FL=gb:U59832.1 gb:NM_004472.1
F) Клетки линии H9 Р39 на 78 час стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01 72 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-4,01441 5,083597 547,99 Повышение 9.50E-05 AB028021 Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,79201 3,675687 354,02 Повышение 7.11E-05 NM_012431 Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-5,25658 3,066715 320,3 Повышение 5.36E-05 AW005572 предполагаемый белок 47 кДа
-0,80043 7,317513 277,81 Повышение 3.10E-05 D87811 Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-3,8752 4,204423 270,53 Повышение 1.89E-05 AB028021 Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-3,26893 4,729085 255,65 Повышение 3.66E-05 NM_001785 Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-4,29896 3,360647 202,2 Повышение 1.85E-05 AY177407 Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-0,62093 6,953987 190,67 Повышение 1.85E-05 NM_022454 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-4,50758 2,853368 164,39 Повышение 5.73E-05 AU118882 эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-1,11159 6,244682 163,85 Повышение 1.85E-05 NM_003867 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-0,26005 7,057553 159,52 Повышение 8.58E-05 R72286 связанный с микрофибриллами белок 4
-3,62742 3,595825 149,42 Повышение 1.19E-03 AA772920 Гены EST
-3,61621 3,595293 148,21 Повышение 7.06E-04 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,32044 5,888668 147,96 Повышение 1.62E-03 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,83997 6,288395 139,91 Повышение 1.06E-04 AI821669 Гены EST
-1,89695 5,066236 124,78 Повышение 5.04E-05 AL136944 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-2,90798 4,005677 120,56 Повышение 7.41E-05 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,39007 3,146077 92,81 Повышение 2.92E-03 NM_006614 Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-4,63418 1,846961 89,33 Повышение 5.54E-03 BF112218 Гены EST
-2,0457 4,332524 83,18 Повышение 1.95E-04 AI422986 Гены EST
0,756526 7,130796 82,96 Повышение 2.44E-05 NM_003012 Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-3,17056 3,112711 77,88 Повышение 5.66E-05 AI801626 Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-2,5679 3,691959 76,63 Повышение 1.85E-05 AL121722 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF3B (гепатоцитного ядерного фактора-3 бета), новый ген на основе генов EST, гены EST, STS, GSS и CpG-островки
-3,12184 3,093954 74,33 Повышение 1.27E-04 AI700341 Гены EST
-3,51429 2,6835 73,4 Повышение 7.26E-04 AA352113 Гены EST
0,502235 6,679567 72,37 Повышение 8.17E-06 NM_014899 Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-3,7619 2,400862 71,64 Повышение 6.61E-05 NM_016179 Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-1,66311 4,46486 69,94 Повышение 3.60E-04 S69738 MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нт). /PROD=MCP-1
-2,26295 3,775709 65,74 Повышение 1.21E-03 AI735586 Гены EST
-3,20091 2,823883 65,11 Повышение 8.22E-03 NM_002614 Homo sapiens, содержащий PDZ-домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-0,81978 5,17876 63,94 Повышение 1.52E-04 AI824037 Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-3,10357 2,888163 63,63 Повышение 1.85E-05 NM_001453 Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,41404 5,48675 59,75 Повышение 1.39E-04 AI332407 секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-4,29055 1,60372 59,48 Повышение 5.86E-05 AI337300 Homo sapiens, клон MGC:4604, мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:BC004219.1
-1,70149 4,121658 56,62 Повышение 6.46E-04 AF225426 Homo sapiens, HT016 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HT016 /FL=gb:AF225426.1
-2,07937 3,707398 55,21 Повышение 2.52E-03 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
0,800949 6,56634 54,39 Повышение 2.72E-07 NM_030781 Homo sapiens, захватывающий рецептор с лектином C-типа (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
-2,72686 2,973219 51,99 Повышение 1.82E-04 AI692180 белок 2, связывающий белок, взаимодействующий с PTPRF (липрин бета 2)
-1,55323 4,113731 50,81 Повышение 2.92E-05 AI821586 Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, связанным с трансплантабельностью (H.sapiens)
-3,53873 2,127137 50,77 Повышение 4.17E-04 AI675836 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3-конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (белок 23A рибосомы 60S), гены EST, гены STS
-2,45311 3,17372 49,41 Повышение 1.17E-02 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-2,91295 2,704851 49,1 Повышение 5.98E-03 AW005572 предполагаемый белок 47 кДа
-1,44407 4,173723 49,1 Повышение 1.23E-03 U91903 Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-0,77864 4,836717 49,02 Повышение 2.61E-04 NM_022055 Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-3,90126 1,704039 48,68 Повышение 2.65E-04 AI004009 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU7_HUMAN ALU SUBFAMILY SQ SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
1,388898 6,98175 48,26 Повышение 1.85E-05 BE620739 Гены EST
-3,91992 1,582406 45,33 Повышение 1.28E-04 AL553774 белок KIAA1462
-2,50168 2,984782 44,83 Повышение 6.69E-03 X16468 Человеческая мРНК для коллагена альфа-1 типа II.
-1,71797 3,748284 44,21 Повышение 2.10E-03 AL524520 связанный с G-белком рецептор 49
-0,5292 4,934946 44,14 Повышение 7.15E-04 AI127440 Гены EST
-0,69028 4,756395 43,61 Повышение 1.42E-04 M16276 Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
0,83572 6,263504 43,05 Повышение 8.83E-05 N21138 белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,61405 2,778049 41,99 Повышение 4.08E-05 U71207 Человеческий гомолог гена отсутствия глаз (Eab1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Eab1 /FL=gb:NM_005244.1 gb:U71207.1
-3,54017 1,841563 41,69 Повышение 9.86E-04 NM_002091 Homo sapiens, гастрин-высвобождающий белок (GRP), мРНК. /PROD=gastrin-releasing peptide /FL=gb:NM_002091.1 gb:K02054.1 gb:BC004488.1
-2,39338 2,964195 41 Повышение 2.62E-03 M17955 Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
-1,77041 3,564655 40,37 Повышение 1.48E-03 NM_003966 Homo sapiens, содержащий sema-домен, 7 тромбоспондиновых повторов (типа 1 и сходного с типом 1), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазменный домен белок, (семафорин), 5A (SEMA5A), мРНК. /PROD=sema domain, seven thrombospondin repeats (type1 and type 1-like), transmem
-0,27888 5,053648 40,29 Повышение 4.00E-05 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-2,4051 2,925248 40,23 Повышение 2.25E-05 NM_021020 Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1) , мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
-2,16079 3,152396 39,76 Повышение 4.00E-05 NM_000552 Homo sapiens, фактор фон Виллебранда (VWF), мРНК. /PROD=von Willebrand factor precursor /FL=gb:NM_000552.2
-2,6422 2,666218 39,63 Повышение 1.85E-05 BF589787 Гены EST
-1,09421 4,204596 39,36 Повышение 7.37E-05 AK023621 Homo sapiens, кДНК: FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-3,7558 1,527474 38,94 Повышение 3.02E-03 AW473656 Гены EST
-3,21708 2,015336 37,59 Повышение 1.57E-04 NM_004438 Homo sapiens, EphA4 (EPHA4), мРНК. /PROD=EphA4 /FL=gb:L36645.1 gb:NM_004438.1
-0,18256 5,019816 36,82 Повышение 1.85E-05 AI583173 главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-0,18863 5,007893 36,67 Повышение 3.26E-04 AV700724 GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-2,69284 2,499705 36,57 Повышение 6.77E-03 R33964 Homo sapiens, кДНК: FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
0,804491 5,966318 35,8 Повышение 4.00E-05 AA583044 костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
0,828899 5,985645 35,67 Повышение 4.40E-05 NM_001200 Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
0,663834 5,813725 35,5 Повышение 7.23E-05 AI817041 связанный с G-белком рецептор
-2,83906 2,291355 35,03 Повышение 8.28E-05 T15545 Гены EST
-3,25309 1,849989 34,37 Повышение 1.65E-03 AL050154 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586L0120 (из клона DKFZp586L0120).
0,713597 5,813528 34,3 Повышение 2.17E-04 BF508344 Гены EST
-1,61054 3,372801 31,63 Повышение 6.80E-04 AW264204 Гены EST
-3,31261 1,666545 31,54 Повышение 5.69E-04 BG397856 главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ альфа 1
-1,35345 3,621423 31,45 Повышение 7.05E-04 AW157571 Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
-0,81856 4,154852 31,42 Повышение 2.94E-05 AI129628 Гены EST
-0,45718 4,48679 30,78 Повышение 6.26E-05 BF939489 гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
0,424882 5,366945 30,74 Повышение 1.58E-04 AI692659 белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-0,95386 3,986146 30,7 Повышение 7.87E-05 AF312769 Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,39784 3,506506 29,95 Повышение 9.97E-04 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-0,47614 4,408298 29,54 Повышение 3.38E-05 BF508639 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434E082 (из клона DKFZp434E082)
-3,12747 1,716365 28,72 Повышение 9.08E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,81405 2,019329 28,51 Повышение 9.96E-04 AI694325 Гены EST
1,829497 6,661623 28,48 Повышение 3.98E-05 AA534817 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-1,42034 3,409373 28,44 Повышение 4.12E-04 BE737251 Homo sapiens, кДНК: FLJ22482 fis, клон HRC10859, с высокой степенью подобия cIRO180147, Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 180147
1,563993 6,383462 28,24 Повышение 1.85E-05 NM_002413 Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
1,314051 6,126464 28,1 Повышение 1.89E-05 BC000740 Homo sapiens, рецептор холецистокинина B, клон MGC:2199, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cholecystokinin B receptor /FL=gb:L07746.1 gb:L08112.1 gb:S70057.1 gb:BC000740.1 gb:L04473.1 gb:NM_000731.1
0,420056 5,197721 27,43 Повышение 1.85E-05 NM_012242 Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог 1 (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-1,54464 3,22856 27,34 Повышение 5.11E-05 AI743534 Homo sapiens, МРНК; кДНК DKFZp564B1162 (из клона DKFZp564B1162); полная кодовая последовательность /FL=gb:AL136646.1
-4,15276 0,598294 26,93 Повышение 1.83E-04 AA129444 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-1,83503 2,912585 26,86 Повышение 8.60E-04 AA552969 Гены EST
0,442286 5,16846 26,47 Повышение 1.85E-05 NM_001778 Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-2,05438 2,666454 26,37 Повышение 5.65E-03 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-3,25961 1,457558 26,3 Повышение 1.49E-02 NM_016341 Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
-0,68225 4,022195 26,07 Повышение 4.08E-05 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
-0,37709 4,293707 25,47 Повышение 5.32E-05 AU152102 Homo sapiens, кДНК: FLJ12993 fis, клон NT2RP3000197
-0,13959 4,521681 25,3 Повышение 5.89E-05 BG109855 Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
-1,80965 2,799751 24,41 Повышение 4.74E-03 NM_152506 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
1,275191 5,879425 24,32 Повышение 3.33E-05 AI587307 гипотетический белок FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-3,79684 0,804733 24,28 Повышение 2.78E-04 AK026720 Homo sapiens, кДНК: FLJ23067 fis, клон LNG04993.
-0,13427 4,467037 24,27 Повышение 2.87E-05 D49958 Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
1,997597 6,595913 24,22 Повышение 2.84E-05 BC005997 Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
-2,9769 1,607498 23,99 Повышение 1.19E-02 AW612111 Гены EST
-3,10679 1,463399 23,76 Повышение 3.41E-04 N59476 Гены EST
-2,06656 2,502146 23,73 Повышение 2.55E-03 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
0,007601 4,558709 23,44 Повышение 1.02E-04 N63706 Гены EST
-0,15629 4,385668 23,3 Повышение 2.61E-04 AI799018 Гены EST
-3,10838 1,4221 23,11 Повышение 3.43E-04 N50412 Гены EST
-2,50006 1,997519 22,59 Повышение 1.83E-03 U66061 Бета-цепь человеческого Т-клеточного рецептора зародышевой линии TCRBV17S1A1T, TCRBV2S1, TCRBV10S1P, TCRBV29S1P, TCRBV19S1P, TCRBV15S1, TCRBV11S1A1T, HVB реликт, TCRBV28S1P, TCRBV34S1, TCRBV14S1, TCRBV3S1, TCRBV4S1A1T, TRY4, TRY5, TRY6, TRY7, TRY8, TCRBD1, TCRBJ1S1, TCRB...
-0,98665 3,469502 21,95 Повышение 1.93E-03 NM_001463 Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-0,62897 3,790333 21,4 Повышение 7.95E-03 AI694545 Гены EST
0,500662 4,91845 21,37 Повышение 1.92E-04 AB043703 Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-0,10733 4,302037 21,25 Повышение 2.88E-04 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-0,70855 3,6919 21,12 Повышение 4,93E-04 AI917371 Гены EST
-3,53207 0,857843 20,97 Повышение 1.12E-03 NM_002769 Homo sapiens, протеаза, серин, 1 (трипсин 1) (PRSS1), мРНК. /PROD=protease, serine, 1 (trypsin 1) /FL=gb:M22612.1 gb:NM_002769.1
1,168713 5,556831 20,94 Повышение 2.43E-04 NM_016139 Homo sapiens, 16,7 кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
-1,68521 2,69622 20,84 Повышение 2.06E-03 NM_002770 Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
-2,14813 2,233148 20,84 Повышение 2.55E-04 NM_006034 Homo sapiens, p53-индуцированный белок (PIG11), мРНК. /PROD=p53-induced protein /FL=gb:AF010315.1 gb:BC000443.1 gb:BC003010.1 gb:NM_006034.1
-0,5982 3,780076 20,8 Повышение 1.63E-02 AI806510 предполагаемый белок 47 кДа
0,449168 4,82657 20,78 Повышение 2.33E-05 AI688418 плексин A2
1,223968 5,565279 20,27 Повышение 1.85E-05 AL574912 Гены EST с низкой степенью подобия с серинпротеазой (H.sapiens)
2,368939 6,691717 20,01 Повышение 3.09E-05 AJ224869 Homo sapiens, CXCR4, ген, кодирующий рецептор CXCR4
-1,83333 2,487663 19,99 Повышение 2.10E-03 NM_006501 Homo sapiens, связанный с миелином основной белок олигодендроцитов (MOBP), мРНК. /PROD=myelin-associated oligodendrocyte basic protein /FL=gb:D28113.1 gb:NM_006501.1
-2,16064 2,095432 19,11 Повышение 1.23E-02 NM_000475 Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 0, группа B, член 1 (NR0B1), мРНК. /PROD=adrenal hypoplasia protein /FL=gb:NM_000475.2
1,861693 6,103583 18,92 Повышение 2.59E-05 AI374739 Гены EST
-3,47945 0,755598 18,83 Повышение 5.51E-04 NM_000854 Homo sapiens, глутатион S-трансфераза тэта 2 (GSTT2), мРНК. /PROD=glutathione S-transferase theta 2 /FL=gb:L38503.1 gb:BC002415.1 gb:NM_000854.2
-1,25995 2,973193 18,81 Повышение 2.98E-04 AK026607 Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с мРНК белка AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11).
-0,27888 3,946435 18,7 Повышение 2.46E-05 NM_003078 Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
1,740607 5,961556 18,65 Повышение 2.25E-05 NM_002160 Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-2,84061 1,378474 18,62 Повышение 7.18E-04 AI123532 Гены EST
3,042634 7,250084 18,47 Повышение 2.33E-05 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
1,192657 5,39941 18,47 Повышение 1.18E-04 NM_024641 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12838 (FLJ12838), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-2,81453 1,375898 18,26 Повышение 3.27E-02 BC014585 Homo sapiens, клон IMAGE:4047715, мРНК.
0,476688 4,64635 18 Повышение 1.14E-04 NM_024581 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13942 (FLJ13942), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13942 /FL=gb:NM_024581.1
-2,14545 2,018966 17,93 Повышение 2.47E-03 NM_015831 Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (YT группа крови) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-2,24406 1,891442 17,58 Повышение 4.96E-05 NM_003275 Homo sapiens, тропомодулин (TMOD), мРНК. /PROD=tropomodulin /FL=gb:NM_003275.1 gb:M77016.1 gb:BC002660.1
-0,5777 3,557171 17,57 Повышение 5.59E-04 BC036592 Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-0,05814 4,076316 17,56 Повышение 1.83E-04 BF308645 белок KIAA1415
-1,27748 2,846094 17,43 Повышение 1.96E-04 D78260 Homo sapiens, мРНК для транскрипционного фактора GATA-4, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-4 transcription factor /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-2,64131 1,466395 17,24 Повышение 2.99E-02 AU157303 Гены EST
-1,82351 2,283948 17,24 Повышение 3,95E-04 AA603467 рибосомальный белок S11
1,59762 5,701737 17,2 Повышение 5.72E-04 NM_018649 Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-0,20099 3,88744 17,01 Повышение 1.99E-04 BF984830 индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
-0,41626 3,652079 16,78 Повышение 2.69E-04 BF110534 Гены EST
2,377335 6,437231 16,68 Повышение 1.89E-05 NM_005328 Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-0,29145 3,768186 16,68 Повышение 2.40E-04 AI197932 Гены EST
-3,88742 0,162889 16,57 Повышение 2.95E-03 AA180985 Гены EST
-0,75724 3,289214 16,52 Повышение 2.66E-03 AL445192 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
-2,30432 1,732166 16,41 Повышение 2.23E-02 BC017958 Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
-3,30412 0,716129 16,23 Повышение 3.22E-02 AU157224 Homo sapiens, кДНК: FLJ11570 fis, клон HEMBA1003309
-3,4744 0,544234 16,21 Повышение 8.79E-03 L32867 Homo sapiens, альфа 2,8-сиалилтрансфераза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha 2,8-sialyltransferase /FL=gb:L43494.1 gb:D26360.1 gb:L32867.1 gb:NM_003034.1
-3,09265 0,925475 16,2 Повышение 2.03E-03 AI093492 Гены EST
-1,39277 2,622602 16,17 Повышение 2.73E-04 AI629041 Гены EST
0,366041 4,354631 15,87 Повышение 8.71E-05 AI242583 Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
-0,35867 3,62672 15,84 Повышение 3.71E-05 NM_001957 Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-0,66587 3,318505 15,83 Повышение 9.18E-05 NM_001362 Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-1,80959 2,172774 15,81 Повышение 1.70E-03 BF447246 белок KIAA0960
-3,95752 0,007632 15,62 Повышение 1.52E-02 NM_001432 Homo sapiens, эпирегулин (EREG), мРНК. /PROD=epiregulin precursor /FL=gb:D30783.1 gb:NM_001432.1
-0,22337 3,730539 15,5 Повышение 9.97E-04 NM_021822 Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-2,56291 1,390726 15,49 Повышение 1.14E-02 BG532690 интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
-2,89467 1,029195 15,18 Повышение 4.69E-03 AW971205 Гены EST
-1,16952 2,748825 15,12 Повышение 2.94E-02 NM_001343 Homo sapiens, гена disabled (Drosophila) гомолог 2 (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
0,798972 4,674672 14,68 Повышение 5.97E-05 AI082827 гипотетический белок FLJ11585
-0,33264 3,541617 14,66 Повышение 3.49E-05 NM_020353 Homo sapiens, фосфолипид-скрамблаза 4 (LOC57088), мРНК. /PROD=phospholipid scramblase 4 /FL=gb:NM_020353.1 gb:AF199023.1
-0,88175 2,988123 14,62 Повышение 1.30E-03 AI650874 Гены EST
-0.11092 3.758565 14.62 Повышение 4.96E-05 BF591483 Гены EST
1,370117 5,237165 14,59 Повышение 7.39E-05 M33653 Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
0,041468 3,902142 14,53 Повышение 9.62E-04 BF130943 Гены EST
-0,41994 3,432925 14,45 Повышение 1.98E-03 AI686957 белок KIAA1494
-3,44709 0,392958 14,32 Повышение 3.27E-02 H39185 Гены EST
1,071985 4,903249 14,23 Повышение 1.89E-05 NM_004560 Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
-0,60671 3,220921 14,2 Повышение 2.49E-03 NM_000458 Homo sapiens, транскрипционный фактор 2, гепатический; LF-B3; вариант гепатический ядерный фактор (TCF2), вариант транскрипта a, мРНК. /PROD=transcription factor 2, isoform a /FL=gb:NM_000458.1
1,186033 5,004503 14,11 Повышение 5.86E-05 AI627704 Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
-2,69521 1,121263 14,09 Повышение 5.32E-05 AF282250 Homo sapiens, кальньюрон 1 (CALN1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=calneuron 1 /FL=gb:AF282250.1
-2,70961 1,095539 13,98 Повышение 2.03E-02 AK055534 Homo sapiens, кДНК: FLJ30972 fis, клон HEART2000492.
-0,65009 3,149996 13,93 Повышение 2.55E-04 NM_017931 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20699 (FLJ20699), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20699 /FL=gb:NM_017931.1
-1,6164 2,173017 13,83 Повышение 9.97E-03 X00452 Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-3,47125 0,312463 13,77 Повышение 3.91E-02 BF114815 Гены EST
-2,17973 1,59463 13,68 Повышение 1.03E-03 BE379542 связывающий ДНК хромодоменгеликазы белок 3 /FL=gb:U91543.1
-1,95127 1,804379 13,51 Повышение 3.31E-03 L12468 Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
0,449933 4,203433 13,49 Повышение 6.43E-04 Z21533 H.sapiens, ген HEX, кодирующий связанный с гомеобоксом белок. /PROD=homeobox related protein
0,502333 4,255116 13,48 Повышение 3.46E-04 AF211891 Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
0,151239 3,88836 13,33 Повышение 5.61E-05 BE644809 Гены EST
0,631332 4,364524 13,3 Повышение 8.23E-05 AI130705 Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
-1,83999 1,892454 13,29 Повышение 2.17E-04 AK074453 Homo sapiens, кДНК: FLJ23873 fis, клон LNG12941.
-0,28951 3,441091 13,27 Повышение 2.34E-04 NM_018388 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
0,120924 3,842731 13,19 Повышение 4.04E-05 NM_001529 Homo sapiens, экпрессируемый в кроветворных клетках гомеобокс (HHEX), мРНК. /PROD=hematopoietically expressed homeobox /FL=gb:NM_001529.1 gb:L16499.1 gb:NM_002729.1
-0,4843 3,220215 13,04 Повышение 2.66E-05 NM_001766 Homo sapiens, CD1D антиген, d полипептид (CD1D), мРНК. /PROD=CD1D antigen, d polypeptide /FL=gb:NM_001766.1 gb:J04142.1
-3,18081 0,521542 13,02 Повышение 3.11E-04 AW449813 белок KIAA0918
-1,17885 2,522906 13,01 Повышение 7.75E-04 AB002155 Homo sapiens, мРНК для человеческого уроплакина Ib, полная кодовая последовательность. /PROD=human uroplakin Ib /FL=gb:NM_006952.1 gb:AB015234.1 gb:AF042331.1 gb:AB002155.1
2,383898 6,070755 12,88 Повышение 2.59E-05 BF476502 гипотетический белок FLJ11585
3,2061 6,89075 12,86 Повышение 2.73E-05 NM_006681 Homo sapiens, нейромедин U (NMU), мРНК. /PROD=neuromedin U /FL=gb:NM_006681.1
0,454394 4,138042 12,85 Повышение 2.43E-04 AL036088 белок KIAA1479
-2,233 1,436726 12,73 Повышение 1.41E-03 NM_014862 Homo sapiens, генный продукт KIAA0307 (KIAA0307), мРНК. /PROD=KIAA0307 gene product /FL=gb:AB002305.1 gb:NM_014862.1
-2,50335 1,160623 12,68 Повышение 4.71E-04 AA781795 Гены EST
0,414809 4,075067 12,64 Повышение 3.71E-05 NM_016179 Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-0,40798 3,250175 12,62 Повышение 3.66E-05 AI143879 фосфодиэстераза 10A /FL=gb:AB020593.1 gb:AF127479.1 gb:NM_006661.1
-1,20714 2,448878 12,61 Повышение 9.04E-04 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
0,999053 4,64687 12,53 Повышение 3.66E-05 AW129593 белок с повторяющимися tudor-доменами, ассоциирующийся с PCTAIRE 2
-1,0335 2,604062 12,45 Повышение 4.91E-04 AL553774 белок KIAA1462
-1,78964 1,842967 12,4 Повышение 1.49E-02 NM_004861 Homo sapiens, цереброзид (3-фосфоаденилсульфат:галактозилкерамид 3) сульфотрансфераза (CST), мРНК. /PROD=galactosylceramide sulfotransferase /FL=gb:NM_004861.1 gb:D88667.1
0,81871 4,448452 12,38 Повышение 9.04E-05 X06268 Человеческая мРНК для 3-конца C-терм. тройного геликоидного и C-терминальнального негеликоидного домена про-альфа 1 (II) коллагена. /PROD=pro-alpha 1 (II) collagen (313 AA; AA 975-271c) /FL=gb:NM_001844.2
1,040647 4,667276 12,35 Повышение 2.25E-05 AI348094 белок KIAA0882
-2,2316 1,390239 12,31 Повышение 1.38E-02 AA757630 Гены EST
1,076427 4,696942 12,3 Повышение 3.12E-05 AI640307 протокадгерин 10
-1,28224 2,327697 12,21 Повышение 3.34E-04 NM_005568 Homo sapiens, LIM гомеобоксный белок 1 (LHX1), мРНК. /PROD=LIM homeobox protein 1 /FL=gb:NM_005568.1 gb:U14755.1
-1,99136 1,617733 12,2 Повышение 4.20E-03 AL109653 Последовательность человеческой ДНК от клонирования GS1-115M3 на хромосоме Xq27.1-28. Содержит ген нового белка CXorf1 (хромосома X, открытая рамка считывания 1), гены EST, STS, GSS и островок CpG
-3,12055 0,469175 12,04 Повышение 1.54E-02 AW780006 Гены EST
0,1187 3,707767 12,03 Повышение 5.97E-05 N21184 Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец/clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-1,40826 2,177544 12,01 Повышение 7.18E-04 AB046770 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1550, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1550 protein
1,316429 4,899037 11,98 Повышение 7.87E-05 AI769688 Homo sapiens, клон 23664 и 23905, последовательность мРНК
-1,08244 2,498502 11,97 Повышение 1.67E-03 X75208 X75208 /FEATURE=cds /DEFINITION=HSPTKR H.sapiens, HEK2, мРНК белка рецептора тирозинкиназы
-2,68947 0,886703 11,93 Повышение 4.38E-02 AW291402 Гены EST
1,438639 5,011903 11,9 Повышение 2.06E-04 BF223214 Гены EST
-0,10881 3,452952 11,81 Повышение 2.39E-04 AA701657 гипотетический белок FLJ12666
-2,33994 1,211956 11,73 Повышение 1.74E-02 AL134708 Гены EST
-0,52859 3,016773 11,68 Повышение 4.43E-03 AW590614 Гены EST
-1,77455 1,768056 11,65 Повышение 1.17E-02 AF140507 Homo sapiens, Ca2+кальмодулин-зависимой протеинкиназы киназа бета (CAMKKB), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=Ca2+calmodulin-dependent protein kinase kinasebeta /FL=gb:AF140507.1
-2,84187 0,695267 11,61 Повышение 1.89E-03 NM_002244 Homo sapiens, калиевый выпрямляющийся внутрь канал, подсемейство J, ингибитор 1 (KCNJN1), мРНК. /PROD=potassium inwardly-rectifying channel, subfamilyJ, inhibitor 1 /FL=gb:NM_002244.1
4,042679 7,571956 11,55 Повышение 2.86E-05 NM_005454 Homo sapiens, гена cerberus 1 (Xenopus laevis) гомолог (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
0,581614 4,103441 11,49 Повышение 1.82E-04 AF005775 Homo sapiens, каспаза-подобный регулирующий апоптоз белок 2 (clarp), мРНК, продукт альтернативного сплайсинга, полная кодовая последовательность. /PROD=caspase-like apoptosis regulatory protein 2 /FL=gb:AF005775.1
3,287037 6,806239 11,47 Повышение 3.78E-05 AI633559 Гены EST
0,661121 4,174547 11,42 Повышение 4.53E-05 AA502609 Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
1,888188 5,396458 11,38 Повышение 4.53E-05 AW340311 Гены EST
-1,24923 2,257525 11,37 Повышение 1.03E-03 R42166 Гены EST с низкой степенью подобия с AXO1_HUMAN, ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ АКСОНИНА-1 (H.sapiens)
-0,21464 3,287026 11,33 Повышение 1.37E-03 NM_005045 Homo sapiens, рилин (RELN), мРНК. /PROD=reelin /FL=gb:U79716.1 gb:NM_005045.1
2,377686 5,872207 11,27 Повышение 2.86E-05 NM_000222 Homo sapiens, гомолог гена v-kit Харди-Цукермана 4 вирусного онкогена кошачьей саркомы (KIT), мРНК. /PROD=v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viraloncogene homolog precursor /FL=gb:NM_000222.1
4,897427 -1,39089 78,16 Снижение 7.30E-04 R06655 Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
3,409815 -2,69915 69,02 Снижение 1.89E-05 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
2,62025 -2,80479 42,96 Снижение 6.27E-03 AA625683 Гены EST
0,757197 -4,55188 39,65 Снижение 2.02E-04 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,113698 -2,03811 35,55 Снижение 2.91E-04 NM_002196 Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
2,36447 -2,49724 29,08 Снижение 2.24E-03 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,77776 -1,04395 28,28 Снижение 5.05E-05 BU729850 гипотетический белок LOC153469
3,862686 -0,6228 22,4 Снижение 5.05E-05 NM_007115 Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,579765 -3,59498 18,06 Снижение 5.51E-04 AI393930 Гены EST
0,300578 -3,86457 17,94 Снижение 5.00E-04 AI110886 протимозин альфа (генная последовательность 28)
2,28595 -1,84349 17,5 Снижение 2.27E-02 BE504838 Гены EST
4,507212 0,466223 16,46 Снижение 1.27E-04 AW196940 Гены EST
3,025351 -0,89578 15,15 Снижение 8.71E-05 AW590925 Гены EST
6,568635 2,65029 15,12 Снижение 6.26E-05 AL031602 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
2,000419 -1,85226 14,45 Снижение 1.06E-02 NM_031272 Homo sapiens, экспрессируемая в яичках последовательность 14 (TEX14), мРНК. /PROD=testis expressed sequence 14 /FL=gb:NM_031272.1
1,361153 -2,47081 14,24 Снижение 6.49E-03 NM_014352 Homo sapiens, транскрипционный фактор POU (OCT11), мРНК. /PROD=POU transcription factor /FL=gb:NM_014352.1 gb:AF133895.1 gb:AF162278.1
2,350127 -1,47399 14,16 Снижение 7.74E-03 AK026106 Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679 с высокой степенью подобия с AF059516, мРНК толлоид-подобного белка 2 (TLL2), Homo Sapiens.
7,360687 3,631772 13,26 Снижение 4.64E-05 BF217861 металлотионеин 1E (функциональный)
0,372329 -3,25088 12,32 Снижение 3.04E-02 AV64805 полимераза (РНК) III (направленная на ДНК) (32 кДа)
0,82229 -2,77919 12,14 Снижение 1.29E-02 АВ017269 Homo sapiens, TMEFF2 мРНК, полная кодовая последовательность /FL=gb:AB017269.1 gb:NM_016192.2 gb:AF179274.2 gb:AF242222.1
3,806044 0,220062 12,01 Снижение 7.25E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,967768 -0,60775 11,92 Снижение 1.42E-02 AL121753 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-614O4 на хромосоме 20q11.1-12. Содержит 3-часть MMP24 (ген матриксной металлопротеазы 24 (вставленной в мембрану)), ген ITGB4BP (белка, связывающего интегрин-бета 4), 3-конец нового гена, 3-конец ...
2,129273 -1,43763 11,85 Снижение 1.15E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,951696 -0,61466 11,85 Снижение 8.28E-05 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
0,860464 -2,69824 11,78 Снижение 2.25E-02 NM_003007 Homo sapiens семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
3,557525 0,063117 11,27 Снижение 1.07E-03 BF514079 Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
3,094055 -0,35326 10,91 Снижение 4.64E-05 AW188198 индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
4,847114 1,490225 10,25 Снижение 6.76E-05 NM_006474 Homo sapiens, ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I (T1A-2), вариант транскрипта 2, мРНК. /PROD=lung type-I cell membrane-associatedglycoprotein, isoform 2 precursor /FL=gb:NM_006474.1 gb:AF030428.1
6,426778 3,157882 9,64 Снижение 1.85E-05 AF313413 Homo sapiens, предполагаемый малый трансмембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
4,927935 1,661339 9,62 Снижение 8.71E-05 J05008 Homo sapiens, ген эндотелина-1 (EDN1), полная кодовая последовательность /FL=gb:NM_001955.1
3,268087 0,027916 9,45 Снижение 1.05E-03 AF345910 Homo sapiens, NYD-SP14, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=NYD-SP14 /FL=gb:AF345910.1
3,655193 0,425727 9,38 Снижение 2.88E-04 AI659927 Homo sapiens, кДНК: FLJ22547 fis, клон HSI00356
7,149479 3,957802 9,14 Снижение 3.56E-05 M10943 Человеческий If-ген металлотионеина (hMT-If)
1,143234 -2,04451 9,11 Снижение 1.25E-02 BF437711 Гены EST
1,588735 -1,59544 9,09 Снижение 4.64E-02 AF279774 Homo sapiens, клон N4 NTera2D1 тератокарциномы, мРНК.
7,144308 3,960669 9,09 Снижение 2.18E-05 BF246115 белок, связанный с РНК-геликазой
3,437271 0,276071 8,95 Снижение 4.74E-05 AB029025 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
7,224807 4,073278 8,89 Снижение 2.46E-05 NM_005951 Homo sapiens, металлотионеин 1H (MT1H), мРНК. /PROD=metallothionein 1H /FL=gb:NM_005951.1
2,367534 -0,77672 8,84 Снижение 3.10E-03 AF098641 Homo sapiens, CD44 изоформа RC (CD44) мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=CD44 isoform RC /FL=gb:AF098641.1
4,253624 1,120681 8,77 Снижение 4.72E-05 NM_003385 Homo sapiens, визинин-подобный белок 1 (VSNL1), мРНК. /PROD=visinin-like 1 /FL=gb:AF039555.1 gb:U14747.1 gb:AB001104.1 gb:NM_003385.1
5,398488 2,316218 8,47 Снижение 6.93E-05 NM_001134 Homo sapiens, альфа-фетопротеин (AFP), мРНК. /PROD=alpha-fetoprotein /FL=gb:NM_001134.1 gb:J00077.1
3,947271 0,8794 8,39 Снижение 2.51E-04 AI928035 Гены EST
7,768254 4,72435 8,25 Снижение 2.44E-05 NM_005953 Homo sapiens, металлотионеин 2A (MT2A), мРНК. /PROD=metallothionein 2A /FL=gb:NM_005953.1
6,813053 3,774649 8,22 Снижение 2.87E-05 NM_005950 Homo sapiens, металлотионеин 1G (MT1G), мРНК. /PROD=metallothionein 1G /FL=gb:NM_005950.1
7,426418 4,406989 8,11 Снижение 1.89E-05 NM_005952 Homo sapiens, металлотионеин 1X (MT1X), мРНК. /PROD=metallothionein 1X /FL=gb:NM_005952.1
2,332751 -0,66491 7,99 Снижение 5.08E-03 NM_000077 Homo sapiens, циклин-зависимой киназы ингибитор 2A (меланома, p16, ингибирует CDK4) (CDKN2A), мРНК. /PROD=cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (melanoma,p16, inhibits CDK4) /FL=gb:NM_000077.1 gb:L27211.1
4,738703 1,752163 7,93 Снижение 4.08E-05 NM_014033 Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
5,601289 2,627505 7,86 Снижение 1.20E-04 AF039555 Homo sapiens, визинин-подобный белок 1 (VSNL1), мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=visinin-like protein 1 /FL=gb:AF039555.1 gb:U14747.1 gb:AB001104.1 gb:NM_003385.1
7,564809 4,595208 7,83 Снижение 2.94E-05 M83248 Человеческий нефропонтин мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=nephropontin /FL=gb:M83248.1
3,602406 0,633934 7,83 Снижение 5.32E-05 AI493245 антиген CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian)
3,08363 0,127792 7,76 Снижение 9.96E-04 U73778 Предшественник человеческого коллагена типа XII альфа 1 (COL12A1), мРНК. /PROD=collagen type XII alpha-1 /FL=gb:NM_004370.3
3,030236 0,074899 7,76 Снижение 9.24E-03 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
7,493544 4,550383 7,69 Снижение 2.85E-05 NM_002450 Homo sapiens, металлотионеин 1L (MT1L), мРНК. /PROD=metallothionein 1L /FL=gb:NM_002450.1
3,19487 0,252626 7,69 Снижение 1.19E-04 NM_173553 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ25801 (FLJ25801), мРНК. /FL=gb:NM_173553.1
3,127666 0,186544 7,68 Снижение 5.32E-05 NM_003577 Homo sapiens, недифференцированной эмбриональной клетки транскрипционный фактор 1 (UTF1), мРНК. /PROD=undifferentiated embryonic cell transcriptionfactor 1 /FL=gb:NM_003577.1 gb:AB011076.1
2,514693 -0,40391 7,56 Снижение 4.74E-05 NM_145032 Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
5,207569 2,290724 7,55 Снижение 5.33E-05 AA083478 Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 746039
0,041471 -2,87232 7,54 Снижение 4.34E-02 AW162210 Homo sapiens, кДНК FLJ11490 fis, клон HEMBA1001918
5,13621 2,236529 7,46 Снижение 5.86E-05 BC013944 Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
4,255531 1,357834 7,45 Снижение 6.54E-05 AF096296 Homo sapiens, предшественник хемокина-1 стромы тимуса, мРНК, полная кодовая последовательность /PROD=thymic stroma chemokine-1 precursor /FL=gb:AF142434.1 gb:AF096296.1 gb:AF124601.1 gb:AB010447.1 gb:NM_006072.1
4,055862 1,169817 7,39 Снижение 1.10E-04 AK026815 Homo sapiens, кДНК: FLJ23162 fis, клон LNG09734.
4,715355 1,834956 7,36 Снижение 6.18E-04 AA788946 Гены EST со средней степенью подобия с CA1C, АЛЬФА 1-ЦЕПЬЮ КРЫСИНОГО КОЛЛАГЕНА (XII) (R.norvegicus)
2,597946 -0,27094 7,31 Снижение 6.26E-05 AW138143 Гены EST
4,796495 1,938561 7,25 Снижение 1.82E-04 AI653107 Гены EST
3,508683 0,663662 7,19 Снижение 1.82E-04 AK027231 Homo sapiens, кДНК: FLJ23578 fis, клон LNG12709.
5,441963 2,62358 7,05 Снижение 3.09E-05 NM_016651 Homo sapiens, белок нового гена-3 гепатоклеточной карциномы (LOC51339), мРНК. /PROD=heptacellular carcinoma novel gene-3 protein /FL=gb:NM_016651.2 gb:AF251079.2
1,389794 -1,42311 7,03 Снижение 4.34E-03 BG498699 Гены EST
2,194683 -0,60003 6,94 Снижение 3.56E-02 U63296 Человеческая 15-гидроксипростагландин-дегидрогеназа, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase /FL=gb:U63296.1
5,450694 2,658196 6,93 Снижение 1.85E-05 AF095771 Homo sapiens, белок B1 реагирующей на PTH остеосаркомы (B1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=PTH-responsive osteosarcoma B1 protein /FL=gb:AF095771.1
0,907338 -1,88392 6,92 Снижение 3.84E-02 NM_025243 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ (SLC19A3), мРНК. /PROD=solute carrier /FL=gb:NM_025243.1 gb:AF271633.1
6,93459 4,14838 6,9 Снижение 9.04E-05 AF078844 Homo sapiens, белок hqp0376, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hqp0376 protein /FL=gb:AF078844.1
2,724257 -0,05687 6,87 Снижение 7.43E-04 AL552534 Человеческая мРНК для антигена CD44, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
3,86075 1,090793 6,82 Снижение 1.89E-05 U85995 Кластер включает U85995:Человеческий клон IMAGE-22181, неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1291) /gb=U85995 /gi=1835749 /ug=Hs.79340 /len=1696
2,982965 0,222537 6,78 Снижение 1.19E-03 AK026829 Homo sapiens, кДНК: FLJ23176 fis, клон LNG10452.
0,873551 -1,88238 6,75 Снижение 5.65E-03 AW293376 Гены EST
5,023981 2,272773 6,73 Снижение 8.41Е-05 NM_006472 Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3, (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
3,932141 1,1878 6,7 Снижение 3.66E-05 NM_004490 Homo sapiens, связанный с рецепторами фактора роста белок 14 (GRB14), мРНК. /PROD=growth factor receptor-bound protein 14 /FL=gb:L76687.1 gb:NM_004490.1
5,356771 2,61556 6,69 Снижение 4.40E-05 W92036 Гены EST
2,770179 0,05935 6,55 Снижение 1.17E-04 AK000345 Homo sapiens, кДНК FLJ20338 fis, клон HEP12179.
3,462851 0,769123 6,47 Снижение 2.19E-04 BE673800 Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1238 (H.sapiens)
7,424722 4,734219 6,46 Снижение 7.86E-05 AF333388 Homo sapiens, металлотионеин 1H-подобный белок, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=metallothionein 1H-like protein /FL=gb:AF333388.1
3,610367 0,921088 6,45 Снижение 4.21E-05 ВС004372 Homo sapiens, подобный антигену CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian), клон MGC:10468, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to CD44 antigen (homing function andIndian blood group system) /FL=gb:BC004372.1
2,798327 0,114281 6,43 Снижение 4.31E-04 BF062943 протокадгерин 18
2,387268 -0,26492 6,29 Снижение 2.59E-04 BF063186 Гены EST
4,622217 1,982686 6,23 Снижение 4.40E-05 AL537457 нейрофиламент, легкий полипептид (68 кДа) /FL=gb:NM_006158.1
5,295204 2,664042 6,2 Снижение 5.37E-04 D32039 мРНК человеческого pgH3 для протеогликана PG-M(V3), полная кодовая последовательность. /PROD=proteoglycan PG-M(V3) /FL=gb:D32039.1
-0,55251 -3,18076 6,18 Снижение 2.91E-02 AI277662 Гены EST с низкой степенью подобия с TRP7_HUMAN, ВРЕМЕННЫМ РЕЦЕПТОРНЫМ ПОТЕНЦИАЛЬНЫМ КАНАЛОМ 7 (H.sapiens)
2,060071 -0,56473 6,17 Снижение 8.28E-05 AA004300 гипотетический белок DKFZp566I133
1,892794 -0,71503 6,1 Снижение 5.25E-04 AL138349 белок KIAA0367
3,822765 1,223367 6,06 Снижение 2.86E-04 AL567376 связанный с G-белком рецептор 39
0,803559 -1,78647 6,02 Снижение 8.07E-04 BF673779 Гены EST
4,038177 1,461889 5,96 Снижение 1.52E-04 BF449053 Гены EST
3,280973 0,707817 5,95 Снижение 1.37E-03 AL139377 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-251J8 на хромосоме 13. Содержит гены EST, STS, GSS и островок CpG. Содержит два новых гена с двумя изоформами каждый, и ген KIAA0610 с двумя изоформами
3,059444 0,490104 5,94 Снижение 3.30E-02 NM_007350 Homo sapiens, домен, подобный домену плекстриновой гомологии, семейство A, член 1 (PHLDA1), мРНК. /FL=gb:NM_007350.1
3,876749 1,313133 5,91 Снижение 1.25E-03 AL574184 гидроксипростагландин-дегидрогеназа 15-(NAD) /FL=gb:NM_000860.1 gb:L76465.1
5,318139 2,762676 5,88 Снижение 2.55E-04 U87408 Кластер включает U87408:Человеческого клона IMAGE-74593 неизвестный белок, мРНК, частичная кодовая последовательность /cds=(0,1362) /gb=U87408 /gi=1842104 /ug=Hs.79340 /len=1982
1,99849 -0,55448 5,87 Снижение 1.01E-03 NM_002317 Homo sapiens, лизилоксидаза (LOX), мРНК. /PROD=lysyl oxidase /FL=gb:AF039291.1 gb:NM_002317.1 gb:M94054.1
1,312148 -1,23479 5,84 Снижение 1.36E-04 U32500 Человеческий рецептор типа 2 к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=type 2 neuropeptide Y receptor /FL=gb:U42766.1 gb:U36269.1 gb:U32500.1
2,64743 0,101711 5,84 Снижение 6.52E-04 AI702438 Гены EST
2,918001 0,408444 5,69 Снижение 5.51E-04 BF674052 катгепсин D (лизосомальная аспартилпротеаза)
4,64236 2,137119 5,68 Снижение 3.09E-05 AB019695 Homo sapiens, мРНК для тиоредоксин-редуктазы II бета, полная кодовая последовательность. /PROD=thioredoxin reductase II beta /FL=gb:AB019695.1
4,505436 2,001428 5,67 Снижение 9.04E-05 W57613 Гены EST
2,98904 0,488717 5,66 Снижение 2.78E-04 AW138143 Гены EST
0,424388 -2,06318 5,61 Снижение 2.92E-02 NM_002433 Homo sapiens, гликопротеин миелина олигодендроцитов (MOG), мРНК. /PROD=myelin oligodendrocyte glycoprotein /FL=gb:U18798.1 gb:U64564.1 gb:NM_002433.1
3,560033 1,077194 5,59 Снижение 1.52E-04 U38945 Человеческий гипотетический белок 18,1 кДа, (CDKN2A) мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:U38945.1 gb:U26727.1
1,840613 -0,62498 5,52 Снижение 9.50E-05 AI949760 Гены EST с низкой степенью подобия с безымянным белковым продуктом (H.sapiens)
4,178686 1,713153 5,52 Снижение 1.61E-04 NM_003256 Homo sapiens, тканевый ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4), мРНК. /PROD=tissue inhibitor of metalloproteinase 4precursor /FL=gb:NM_003256.1 gb:U76456.1
2,324824 -0,13601 5,51 Снижение 2.39E-04 AL096771 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP1-238D15 на хромосоме 6q12-14.3. Содержит часть гена COL12A1 (коллаген, тип XII, альфа 1) и гены STS
5,041032 2,59268 5,46 Снижение 2.25E-05 AK022686 Homo sapiens, кДНК FLJ12624 fis, клон NT2RM4001754.
1,294482 -1,14923 5,44 Снижение 2.97E-02 АА723810 кДНК для дифференциально экспрессируемого гена CO16 /FL=gb:BC001291.1
3,732985 1,29318 5,43 Снижение 4.32E-03 AI459194 белок раннего ростового ответа 1
1,117304 -1,32124 5,42 Снижение 1.63E-02 AL046992 сопряженный с G-белком рецептор 1 /FL=gb:NM_005279.1
6,120177 3,682667 5,42 Снижение 1.93E-04 NM_001753 Homo sapiens, кавеолин 1, белок кавеолы, 22 кДа (CAV1), мРНК. /PROD=caveolin 1 /FL=gb:NM_001753.2
3,365852 0,931215 5,41 Снижение 8.41E-05 NM_003392 Homo sapiens, белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A (WNT5A), мРНК. /PROD=wingless-type MMTV integration site family,member 5A /FL=gb:NM_003392.1 gb:L20861.1
5,752704 3,318587 5,4 Снижение 5.75E-04 R94644 Homo sapiens, изоформа Vint верзикана, мРНК, частичная кодовая последовательность.
2,256481 -0,17157 5,38 Снижение 1.10E-04 NM_018495 Homo sapiens, белок NAG22 (LOC55873), мРНК. /PROD=NAG22 protein /FL=gb:AF247820.3 gb:NM_018495.3
5,522456 3,095555 5,38 Снижение 9.25E-05 BG054844 семейство генов-гомологов ras, член E /FL=gb:NM_005168.1
3,660753 1,237109 5,37 Снижение 1.10E-04 ВЕ903880 цинк-пальцевый белок 6 (CMPX1)
2,418198 0,007534 5,32 Снижение 9.96E-04 AI860150 Гены EST с низкой степенью подобия с A49134, регион V-I цепи Ig-каппа (H.sapiens)
1,659275 -0,74924 5,31 Снижение 2.40E-03 L16895 Человеческий ген лизилоксидазы (LOX), экзон 7
5,715937 3,314142 5,28 Снижение 1.74E-04 U85658 Человеческий транскрипционный фактор ERF-1, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ERF-1 /FL=gb:NM_003222.1 gb:U85658.1
2,572851 0,172113 5,28 Снижение 2.43E-04 AW592563 продукт гена KIAA0455
5,807319 3,410152 5,27 Снижение 6.54E-05 NM_018004 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10134 (FLJ10134), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10134 /FL=gb:NM_018004.1
4,138808 1,745346 5,25 Снижение 1.40E-03 AW590196 ассоциированный с клеточной мембраной гликопротеин легочного типа-I
6,003141 3,615412 5,23 Снижение 7.14E-04 М25915 Человеческий ингибитор цитолиза комплемента (CLI), мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:J02908.1 gb:NM_001831.1 gb:M64722.1 gb:M25915.1
1,05854 -1,32898 5,23 Снижение 1.59E-03 AI703321 белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
4,285883 1,901821 5,22 Снижение 6.26E-05 AL038787 6-фосфофрукто-2-киназафруктоза-2,6-бифосфатаза 4
6,959783 4,576665 5,22 Снижение 1.85E-05 NM_014367 Homo sapiens, гипотетический белок, индуцируемый эстрадиолом (E2IG5), мРНК. /PROD=hypothetical protein, estradiol-induced /FL=gb:NM_014367.1 gb:AF191020.1
1,10782 -1,27174 5,2 Снижение 1.99E-04 BC029425 Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
5,252439 2,877592 5,19 Снижение 5.32E-05 NM_001553 Homo sapiens, связывающий инсулин-подобный фактор роста белок 7 (IGFBP7), мРНК. /PROD=insulin-like growth factor binding protein 7 /FL=gb:NM_001553.1 gb:L19182.1
6,881969 4,510778 5,17 Снижение 1.85E-05 AF2011944 Homo sapiens HGTD-P (HGTD-P) мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HGTD-P /FL=gb:AF201944.1 gb:AF250321.1
3,543738 1,178007 5,15 Снижение 2.51E-05 NM_001955 Homo sapiens эндотелин 1 (EDN1), мРНК. /PROD=endothelin 1 /FL=gb:NM_001955.1
4,229884 1,871489 5,13 Снижение 1.55E-04 BC032716 Homo sapiens, клон MGC:45425 IMAGE:5518697, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:45425) /FL=gb:BC032716.1
3,035594 0,680769 5,12 Снижение 1.37E-03 AI963605 Гены EST
6,307554 3,95342 5,11 Снижение 7.03E-05 NM_006622 Homo sapiens, индуцируемая сывороткой киназа (SNK), мРНК. /PROD=serum-inducible kinase /FL=gb:AF059617.1 gb:NM_006622.1 gb:AF223574.1
2,271332 -0,08272 5,11 Снижение 1.59E-03 NM_015198 Homo sapiens, белок KIAA0633 (COBL), мРНК. /PROD=KIAA0633 protein /FL=gb:NM_015198.1
3,584234 1,244979 5,06 Снижение 7.30E-04 AF232772 Homo sapiens, гиалуронансинтаза 3 (HAS3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=hyaluronan synthase 3 /FL=gb:NM_005329.1 gb:AF232772.1
6,883803 4,552208 5,03 Снижение 3.09E-05 AF107495 Homo sapiens, FWP001 и предполагаемый FWP002, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=FWP001 /FL=gb:AF107495.1
3,931505 1,606097 5,01 Снижение 5.32E-05 NM_000610 Homo sapiens, антиген CD44 (функция хоуминга и система группы крови Indian) (CD44), мРНК. /PROD=CD44 antigen (homing function and Indian bloodgroup system) /FL=gb:U40373.1 gb:NM_000610.1 gb:M59040.1 gb:M24915.1
G) Клетки линии H9 пассажа 39 на 96 час стадии дифференцировки в сформированную эндодерму и клетки EXPRES 01- Значения интенсивности даны в формате Log2
EXPRES 01 96 ЧАС СТАДИИ СЭ Отношение Направление скорректир. значение p Идентификатор гена Название гена
-4,01441 4,896261 481,26 Повышение 1.67E-04 AB028021 Кластер включает AB028021:Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК для гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность /cds=(196,1569) /gb=AB028021 /gi=4958949 /ug=Hs.155651 /len=1944
-4,79201 3,803312 386,77 Повышение 1.32E-04 NM_012431 Homo sapiens, содержащий sema-домен, иммуноглобулиновый домен (Ig), короткий основной домен, секретируемый белок (семафорин), 3E (SEMA3E), мРНК. /PROD=sema domain, immunoglobulin domain (Ig), shortbasic domain, secreted, (semaphorin) 3E /FL=gb:NM_012431.1 gb:AB002329.1
-5,25658 3,205654 352,69 Повышение 1.07E-04 AW005572 предполагаемый белок 47 кДа
-0,80043 7,232518 261,91 Повышение 5.61E-05 D87811 Homo sapiens, мРНК для GATA-6, полная кодовая последовательность. /PROD=GATA-6 /FL=gb:U66075.1 gb:NM_005257.1 gb:D87811.1
-4,50758 3,451939 248,92 Повышение 8.69E-05 AU118882 эндотелиновый рецептор типа A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-3,8752 4,026704 239,17 Повышение 2.39E-05 AB028021 Homo sapiens, HNF-3 beta, мРНК гепатоцитного ядерного фактора-3 бета, полная кодовая последовательность. /PROD=hepatocyte nuclear factor-3 beta /FL=gb:AB028021.1 gb:NM_021784.1
-2,90798 4,967321 234,8 Повышение 2.99E-05 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-4,29896 3,162606 176,26 Повышение 3.54E-05 AY177407 Homo sapiens, гомеобоксовый белок goosecoid, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=homeobox protein goosecoid /FL=gb:AY177407.1 gb:NM_173849.1
-3,61621 3,736424 163,44 Повышение 7.81E-04 AL569326 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность
-1,11159 6,139499 152,33 Повышение 2.99E-05 NM_003867 Homo sapiens, фактор роста фибробластов 17 (FGF17), мРНК. /PROD=fibroblast growth factor 17 /FL=gb:NM_003867.1 gb:AB009249.1
-3,26893 3,979011 152 Повышение 7.78E-05 NM_001785 Homo sapiens, цитидиндеаминаза (CDA), мРНК. /PROD=cytidine deaminase /FL=gb:L27943.1 gb:NM_001785.1
-2,0457 5,103681 141,96 Повышение 2.15E-04 AI422986 Гены EST
-0,62093 6,499027 139,1 Повышение 2.99E-05 NM_022454 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ22252, сходный с содержащим SRY-бокс белком 17 (FLJ22252), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ22252 similar to SRY-boxcontaining gene 17 /FL=gb:NM_022454.1
-0,26005 6,792541 132,75 Повышение 1.17E-04 R72286 связанный с микрофибриллами белок 4
-3,62742 3,409798 131,34 Повышение 1.36E-03 AA772920 Гены EST
-1,89695 5,127766 130,21 Повышение 8.40E-05 AL136944 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586J0624 (из клона DKFZp586J0624); полная кодовая последовательность. /PROD=hypothetical protein /FL=gb:AF215636.1 gb:NM_014585.1 gb:AF231121.1 gb:AF226614.1 gb:AL136944.1
-1,32044 5,59755 120,93 Повышение 2.06E-03 AF017987 Homo sapiens, связанный с апоптозом секретированный белок 2 (SARP2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=secreted apoptosis related protein 2 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,83997 5,897601 106,71 Повышение 1.78E-04 AI821669 Гены EST
-3,51429 3,198717 104,91 Повышение 1.10E-03 AA352113 Гены EST
-2,5679 4,132538 104 Повышение 7.31E-05 AL121722 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP4-788L20 на хромосоме 20. Содержит ген HNF3B (гепатоцитного ядерного фактора-3 бета), новый ген на основе генов EST, гены EST, STS, GSS и CpG-островки
-3,53873 2,87541 85,28 Повышение 7.65E-04 AI675836 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-446H13 на хромосоме 10. Содержит 3-конец гена нового белка, подобного KIAA1059 (ортолог мышиного рецепторного белка SORCS, содержащего домен VPS10), псевдоген RPL23A (белок 23A рибосомы 60S), гены EST, гены STS
-3,39007 3,012851 84,62 Повышение 3.25E-03 NM_006614 Homo sapiens, молекула клеточной адгезии с гомологией с L1CAM (близкий гомолог L1) (CHL1), мРНК. /PROD=cell adhesion molecule with homology to L1CAM(close homologue of L1) /FL=gb:AF002246.1 gb:NM_006614.1
-1,66311 4,666455 80,42 Повышение 4.61E-04 S69738 MCP-1=моноцитарный хемотактический белок (человеческий, клетки эндотелия аорты, мРНК, 661 нт). /PROD=MCP-1
0,502235 6,820772 79,81 Повышение 1.83E-05 NM_014899 Homo sapiens, белок KIAA0878 (KIAA0878), мРНК. /PROD=KIAA0878 protein /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-2,07937 4,232685 79,45 Повышение 1.97E-03 NM_001643 Homo sapiens, аполипопротеин A-II (APOA2), мРНК. /PROD=apolipoprotein A-II precursor /FL=gb:M29882.1 gb:NM_001643.1 gb:BC005282.1
-3,17056 3,136032 79,15 Повышение 8.69E-05 AI801626 Гены EST со средней степенью подобия с ALU4_HUMAN ALU SUBFAMILY SB2 SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-3,54017 2,747179 78,11 Повышение 6.80E-04 NM_002091 Homo sapiens, гастрин-высвобождающий белок (GRP), мРНК. /PROD=gastrin-releasing peptide /FL=gb:NM_002091.1 gb:K02054.1 gb:BC004488.1
0,756526 7,035708 77,66 Повышение 3.90E-05 NM_003012 Homo sapiens, секретируемый frizzled-связанный белок 1 (SFRP1), мРНК. /PROD=secreted frizzled-related protein 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-1,44407 4,79513 75,54 Повышение 9.78E-04 U91903 Человеческий белок Fritz, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Fritz /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-2,72686 3,495506 74,67 Повышение 2.07E-04 AI692180 белок 2, связывающий белок, взаимодействующий с PTPRF (липрин бета 2)
-3,20091 3,013879 74,27 Повышение 7.33E-03 NM_002614 Homo sapiens, содержащий PDZ домен белок 1 (PDZK1), мРНК. /PROD=PDZ domain containing 1 /FL=gb:NM_002614.1 gb:AF012281.1
-3,7619 2,33669 68,53 Повышение 7.27E-05 NM_016179 Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-3,12184 2,909781 65,42 Повышение 1.61E-04 AI700341 Гены EST
0,800949 6,787852 63,42 Повышение 2.39E-05 NM_030781 Homo sapiens, фагоцитарный рецептор лектина С-типа (SRCL), мРНК. /PROD=scavenger receptor with C-type lectin /FL=gb:NM_030781.1
-4,29055 1,624099 60,32 Повышение 2.39E-04 AI337300 Homo sapiens, клон MGC:4604, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:BC004219.1
-2,91295 2,987854 59,75 Повышение 5.35E-03 AW005572 предполагаемый белок 47 кДа
-1,70149 4,156198 57,99 Повышение 7.75E-04 AF225426 Homo sapiens, HT016 мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HT016 /FL=gb:AF225426.1
-1,71797 4,089548 56,01 Повышение 2.11E-03 AL524520 связанный с G-белком рецептор 49
-2,50168 3,192473 51,77 Повышение 6.18E-03 X16468 Человеческая мРНК для коллагена альфа-1 типа II.
-1,55323 4,102505 50,41 Повышение 6.30E-05 AI821586 Гены EST со средней степенью подобия с полученным из клеток JE0284 Mm-1 белком 1b, ассоциированным с трансплантабельностью (H.sapiens)
1,388898 7,006012 49,08 Повышение 2.00E-05 BE620739 Гены EST
0,663834 6,273873 48,84 Повышение 1.42E-04 AI817041 связанный с G-белком рецептор
-0,41404 5,168897 47,93 Повышение 2.80E-04 AI332407 секретированный frizzled-связанный белок 1 /FL=gb:AF056087.1 gb:NM_003012.2 gb:AF017987.1 gb:AF001900.1
-0,77864 4,801921 47,85 Повышение 3.26E-04 NM_022055 Homo sapiens, зарезервированный (KCNK12), мРНК. /PROD=tandem pore domain potassium channel THIK-2 /FL=gb:NM_022055.1 gb:AF287302.1
-3,10357 2,474935 47,79 Повышение 1.14E-04 NM_001453 Homo sapiens, белок с вилкообразным регионом (forkhead box) C1 (FOXC1), мРНК. /PROD=forkhead box C1 /FL=gb:NM_001453.1
-0,81978 4,721279 46,56 Повышение 2.62E-04 AI824037 Гены EST с низкой степенью подобия с FCE2, МЫШИНЫМ НИЗКОАФФИННЫМ РЕЦЕПТОРОМ ДЛЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА ЭПСИЛОН (M.musculus)
-2,26295 3,255855 45,85 Повышение 1.71E-03 AI735586 Гены EST
-2,45311 3,005889 43,99 Повышение 1.26E-02 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
-0,18863 5,2349 42,92 Повышение 3.48E-04 AV700724 GATA-связывающий белок 4 /FL=gb:NM_002052.1 gb:L34357.1 gb:D78260.1
-0,27888 5,117281 42,11 Повышение 1.28E-04 AF225513 Homo sapiens, цАМФ-зависимой протеинкиназы ингибитор бета, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta /FL=gb:AF225513.1
-1,83503 3,514396 40,77 Повышение 1.00E-03 AA552969 Гены EST
0,83572 6,138202 39,46 Повышение 1.51E-04 N21138 белок KIAA0878 /FL=gb:NM_014899.1 gb:AB020685.1
-3,79684 1,484084 38,88 Повышение 7.14E-05 AK026720 Homo sapiens, кДНК: FLJ23067 fis, клон LNG04993.
-1,77041 3,498637 38,56 Повышение 1.69E-03 NM_003966 Homo sapiens, содержащий sema-домен, 7 тромбоспондиновых повторов (типа 1 и сходного с типом 1), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазменный домен белок, (семафорин), 5A (SEMA5A), мРНК. /PROD=sema domain, seven thrombospondin repeats (type1 and type 1-like), transmem
-3,31261 1,945323 38,26 Повышение 5.68E-04 BG397856 главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ альфа 1
0,804491 6,016482 37,07 Повышение 6.98E-05 AA583044 костный морфогенетический белок 2 /FL=gb:NM_001200.1
-3,10838 2,083703 36,56 Повышение 3.89E-04 N50412 Гены EST
-2,61405 2,571666 36,4 Повышение 7.27E-05 U71207 Человеческий гомолог гена отсутствия глаз (Eab1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Eab1 /FL=gb:NM_005244.1 gb:U71207.1
-3,12747 2,048588 36,15 Повышение 6.25E-04 AV726956 Гены EST с низкой степенью подобия с C35826, гипотетическим 13K белком A (H.sapiens)
-2,81405 2,361598 36,14 Повышение 1.28E-03 AI694325 Гены EST
-0,69028 4,475046 35,89 Повышение 2.18E-04 M16276 Человеческий MHC, класс II, HLA-DR2-Dw12, мРНК, DQw1-beta, полная кодовая последовательность. /FL=gb:NM_002123.1 gb:M16276.1 gb:M60028.1 gb:M17564.1 gb:M81141.1 gb:M81140.1
0,713597 5,840181 34,93 Повышение 2.79E-04 BF508344 Гены EST
0,828899 5,924976 34,2 Повышение 7.27E-05 NM_001200 Homo sapiens, костный морфогенетический белок 2 (BMP2), мРНК. /PROD=bone morphogenetic protein 2 precursor /FL=gb:NM_001200.1
-0,47614 4,618034 34,16 Повышение 6.98E-05 BF508639 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434E082 (из клона DKFZp434E082)
-0,5292 4,497879 32,61 Повышение 9.90E-04 AI127440 Гены EST
f 7,391827 32,51 Повышение 5.61E-05 AJ224869 Homo sapiens, CXCR4 ген, кодирующий рецептор CXCR4
-3,7558 1,259886 32,35 Повышение 4.07E-03 AW473656 Гены EST
-0,98665 4,021785 32,19 Повышение 1.71E-03 NM_001463 Homo sapiens, frizzled-связанный белок (FRZB), мРНК. /PROD=frizzled-related protein /FL=gb:U24163.1 gb:U68057.1 gb:NM_001463.1 gb:U91903.1
-4,30972 0,685002 31,88 Повышение 7.81E-04 AI911379 гипотетический белок FLJ11113
-3,25309 1,716276 31,33 Повышение 2.03E-03 AL050154 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp586L0120 (из клона DKFZp586L0120).
-0,45718 4,508664 31,25 Повышение 1.56E-04 BF939489 гликопротеин M6A /FL=gb:D49958.1
-2,39338 2,572327 31,25 Повышение 3.48E-03 M17955 Человеческий MHC, класс II, HLA-DQ-beta, мРНК, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M33907.1 gb:M17955.1 gb:M16996.1 gb:M17563.1 gb:M20432.1 gb:M26042.1
1,314051 6,278914 31,23 Повышение 2.39E-05 BC000740 Homo sapiens, рецептор холецистокинина B, клон MGC:2199, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cholecystokinin B receptor /FL=gb:L07746.1 gb:L08112.1 gb:S70057.1 gb:BC000740.1 gb:L04473.1 gb:NM_000731.1
-2,16079 2,736566 29,8 Повышение 2.47E-04 NM_000552 Homo sapiens, фактор фон Виллебранда (VWF), мРНК. /PROD=von Willebrand factor precursor /FL=gb:NM_000552.2
-1,39784 3,483531 29,47 Повышение 1.14E-03 BE222344 богатый аргинином и серином фактор сплайсинга 5
-3,25961 1,618799 29,41 Повышение 1.38E-02 NM_016341 Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
-4,15276 0,707307 29,04 Повышение 1.84E-04 AA129444 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1263, частичная кодовая последовательность
-0,13959 4,718875 29,01 Повышение 6.98E-05 BG109855 Homo sapiens, клон TUA8, область, связанная с синдромом кошачьего крика, мРНК
1,829497 6,66646 28,58 Повышение 6.58E-05 AA534817 Гены EST с низкой степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-1,09421 3,740217 28,53 Повышение 8.67E-04 AK023621 Homo sapiens, кДНК FLJ13559 fis, клон PLACE1007852, с высокой степенью подобия с Homo sapiens мРНК для белка KIAA0878.
-0,37709 4,429943 27,99 Повышение 7.27E-05 AU152102 Homo sapiens, кДНК FLJ12993 fis, клон NT2RP3000197
-3,4744 1,320969 27,77 Повышение 5.88E-03 L32867 Homo sapiens, альфа 2,8-сиалилтрансфераза, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha 2,8-sialyltransferase /FL=gb:L43494.1 gb:D26360.1 gb:L32867.1 gb:NM_003034.1
-2,4051 2,382948 27,63 Повышение 7.27E-05 NM_021020 Homo sapiens, связанного с F37/раком пищевода гена кодирующий мотив leucine-zipper motif (FEZ1), мРНК. /PROD=F37Esophageal cancer-related gene-codingleucine-zipper motif /FL=gb:AF123659.1 gb:NM_021020.1
1,563993 6,348869 27,57 Повышение 2.99E-05 NM_002413 Homo sapiens, микросомальная глутатион S-трансфераза 2 (MGST2), мРНК. /PROD=microsomal glutathione S-transferase 2 /FL=gb:NM_002413.1 gb:U77604.1
-4,63418 0,150462 27,56 Повышение 1.41E-02 BF112218 Гены EST
-2,83906 1,924807 27,17 Повышение 1.51E-04 T15545 Гены EST
-0,18256 4,580673 27,16 Повышение 2.39E-05 AI583173 главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ бета 1
-1,80965 2,891679 26,02 Повышение 4.11E-03 NM_152506 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ32835 (FLJ32835), мРНК. /FL=gb:NM_152506.1
-0,10733 4,583423 25,83 Повышение 3.29E-04 BC005107 Homo sapiens, клон IMAGE:3840937, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for IMAGE:3840937)
-1,42034 3,260135 25,64 Повышение 5.35E-04 BE737251 Homo sapiens, кДНК: FLJ22482 fis, клон HRC10859, с высокой степенью подобия cIRO180147, Homo sapiens, мРНК, полноразмерная вставка, кДНК, клон EUROIMAGE 180147
-2,6422 2,00977 25,14 Повышение 2.92E-05 BF589787 Гены EST
-2,50335 2,123365 24,7 Повышение 3.11E-04 AA781795 Гены EST
-2,68947 1,923908 24,48 Повышение 2.10E-02 AW291402 Гены EST
-2,14813 2,455272 24,31 Повышение 7.80E-04 NM_006034 Homo sapiens, p53-индуцированный белок (PIG11), мРНК. /PROD=p53-induced protein /FL=gb:AF010315.1 gb:BC000443.1 gb:BC003010.1 gb:NM_006034.1
-1,35345 3,203459 23,54 Повышение 9.11E-04 AW157571 Гены EST с низкой степенью подобия с T00331, гипотетическим белком KIAA0555 (H.sapiens)
0,424882 4,980575 23,52 Повышение 2.79E-04 AI692659 белок теплового шока 90 кДа 1, альфа
-2,05438 2,485242 23,26 Повышение 6.59E-03 BG290908 Гены EST со средней степенью подобия с ALU8_HUMAN ALU SUBFAMILY SX SEQUENCE CONTAMINATION WARNING ENTRY (H.sapiens)
-0,35867 4,178782 23,22 Повышение 4.79E-05 NM_001957 Homo sapiens, эндотелиновый рецептор типа A (EDNRA), мРНК. /PROD=endothelin receptor type A /FL=gb:NM_001957.1 gb:L06622.1
-0,13427 4,37209 22,73 Повышение 3.30E-04 D49958 Homo sapiens, мРНК для мембранного гликопротеина M6, полная кодовая последовательность. /PROD=membrane glycoprotein M6 /FL=gb:D49958.1
-1,54464 2,95955 22,69 Повышение 1.14E-04 AI743534 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp564B1162 (из клона DKFZp564B1162); полная кодовая последовательность. /FL=gb:AL136646.1
-2,16064 2,33987 22,64 Повышение 1.03E-02 NM_000475 Homo sapiens, ядерный рецептор, подсемейство 0, группа B, член 1 (NR0B1), мРНК. /PROD=adrenal hypoplasia protein /FL=gb:NM_000475.2
1,168713 5,649978 22,34 Повышение 3.27E-04 NM_016139 Homo sapiens, 16,7кДа белок (LOC51142), мРНК. /PROD=16.7Kd protein /FL=gb:NM_016139.1 gb:AF078845.1 gb:BC003079.1
1,740607 6,204585 22,07 Повышение 3.29E-05 NM_002160 Homo sapiens, гексабрахион (тенасцин C, цитотактин) (HXB), мРНК. /PROD=hexabrachion (tenascin C, cytotactin) /FL=gb:M55618.1 gb:NM_002160.1
-3,95062 0,506384 21,96 Повышение 3.04E-03 AU144247 Homo sapiens, кДНК FLJ13443 fis, клон PLACE1002853
-2,49959 1,953408 21,9 Повышение 2.53E-03 NM_000623 Homo sapiens, брадикинина рецептор B2 (BDKRB2), мРНК. /PROD=bradykinin receptor B2 /FL=gb:M88714.1 gb:NM_000623.1
1,997597 6,394209 21,06 Повышение 7.27E-05 BC005997 Homo sapiens, клон MGC:14801, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:14801) /FL=gb:BC005997.1
0,476688 4,86637 20,96 Повышение 1.84E-04 NM_024581 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ13942 (FLJ13942), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ13942 /FL=gb:NM_024581.1
-0,5982 3,789814 20,94 Повышение 1.67E-02 AI806510 предполагаемый белок 47 кДа
1,275191 5,659185 20,88 Повышение 2.29E-04 AI587307 гипотетический белок FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-0,81856 3,56477 20,87 Повышение 6.98E-05 AI129628 Гены EST
-1,25995 3,108032 20,65 Повышение 5.74E-04 AK026607 Homo sapiens, кДНК: FLJ22954 fis, клон KAT09813, с высокой степенью подобия с белком AF010315, Homo sapiens Pig11 (PIG11), мРНК.
-2,69284 1,656461 20,38 Повышение 1.26E-02 R33964 Homo sapiens, кДНК FLJ11022 fis, клон PLACE1003771
0,449168 4,77336 20,03 Повышение 2.99E-05 AI688418 плексин A2
-3,9115 0,399609 19,85 Повышение 2.57E-03 NM_005739 Homo sapiens, RAS гуанил-высвобождающий белок 2 (регулируемый кальцием и диацилглицерином) (RASGRP2), мРНК. /PROD=RAS guanyl releasing protein 1 /FL=gb:AF081195.1 gb:NM_005739.2 gb:AF106071.1
-1,61054 2,680455 19,58 Повышение 1.10E-03 AW264204 Гены EST
-1,40826 2,851659 19,16 Повышение 6.31E-04 AB046770 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1550, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1550 protein
0,007601 4,206081 18,36 Повышение 8.27E-05 N63706 Гены EST
-0,15629 4,036024 18,28 Повышение 5.42E-04 AI799018 Гены EST
-0,95386 3,225705 18,12 Повышение 2.80E-04 AF312769 Homo sapiens, криптическая мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=cryptic /FL=gb:AF312769.1
-1,16952 2,986121 17,82 Повышение 2.56E-02 NM_001343 Homo sapiens, гена disabled (Drosophila) гомолог 2 (реагирующий на митоген фосфопротеин) (DAB2), мРНК. /PROD=disabled (Drosophila) homolog 2 /FL=gb:U39050.1 gb:NM_001343.1 gb:U53446.1 gb:BC003064.1
-0,68225 3,470947 17,79 Повышение 9.21E-05 N48299 Гены EST со средней степенью подобия с NFY-C (H.sapiens)
1,861693 6,008305 17,71 Повышение 2.22E-04 AI374739 Гены EST
0,366041 4,503789 17,6 Повышение 2.15E-04 AI242583 Homo sapiens, кДНК: FLJ11550 fis, клон HEMBA1002970
0,420056 4,533726 17,31 Повышение 7.27E-05 NM_012242 Homo sapiens, гена dickkopf (Xenopus laevis) гомолог (DKK1), мРНК. /PROD=dickkopf (Xenopus laevis) homolog 1 /FL=gb:AF177394.1 gb:NM_012242.1 gb:AF127563.1
-2,64131 1,459191 17,15 Повышение 3.06E-02 AU157303 Гены EST
-1,39277 2,690011 16,94 Повышение 1.61E-04 AI629041 Гены EST
-0,88175 3,200899 16,94 Повышение 1.09E-03 AI650874 Гены EST
-2,14545 1,935001 16,92 Повышение 3.05E-03 NM_015831 Homo sapiens, ацетилхолинэстераза (группа крови YT) (ACHE), вариант транскрипта E4-E5, мРНК. /PROD=acetylcholinesterase PI-linked form precursor /FL=gb:NM_015831.1
-0,5777 3,489676 16,76 Повышение 7.55E-04 BC036592 Homo sapiens, клон IMAGE:4814184, мРНК.
-3,18582 0,860182 16,52 Повышение 1.89E-03 AI991033 гепаран-сульфат протеогликан 2 (perlecan) /FL=gb:M85289.1 gb:NM_005529.2
0,041468 4,081945 16,46 Повышение 6.89E-04 BF130943 Гены EST
-1,6164 2,402639 16,21 Повышение 8.12E-03 X00452 Человеческая мРНК для альфа-цепи антигена гистосовместимости DC, класс II. /PROD=DC classII histocompatibility antigenalpha-chain
-0,70855 3,310445 16,21 Повышение 8.09E-04 AI917371 Гены EST
1,186033 5,204849 16,21 Повышение 2.18E-04 AI627704 Гены EST с низкой степенью подобия с T17346, гипотетическим белком DKFZp586O1624.1 (H.sapiens)
-2,70961 1,305453 16,17 Повышение 1.75E-02 AK055534 Homo sapiens, кДНК: FLJ30972 fis, клон HEART2000492.
1,192657 5,206164 16,15 Повышение 6.23E-04 NM_024641 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ12838 (FLJ12838), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ12838 /FL=gb:NM_024641.1
-0,41626 3,581554 15,98 Повышение 4.74E-04 BF110534 Гены EST
-0,29145 3,703489 15,94 Повышение 3.27E-04 AI197932 Гены EST
-0,20099 3,787591 15,87 Повышение 4.75E-04 BF984830 индуцируемый ретиноевой кислотой белок 1
-0,62897 3,35485 15,82 Повышение 1.12E-02 AI694545 Гены EST
3,042634 7,019598 15,75 Повышение 2.39E-05 NM_005442 Homo sapiens, гомолог эомезодермина (Xenopus laevis) (EOMES), мРНК. /PROD=eomesodermin (Xenopus laevis) homolog /FL=gb:AB031038.1 gb:NM_005442.1
0,500662 4,465346 15,61 Повышение 5.59E-04 AB043703 Homo sapiens, FZD8 мРНК для 7-трансмембранного рецептора Frizzled-8, полная кодовая последовательность. /PROD=seven-transmembrane receptor Frizzled-8 /FL=gb:AB043703.1
-2,81453 1,143479 15,54 Повышение 4.26E-02 BC014585 Homo sapiens, клон IMAGE:4047715, мРНК.
-0,27888 3,6716 15,46 Повышение 7.27E-05 NM_003078 Homo sapiens, связанный с SWISNF, ассоциированный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство d, член 3 (SMARCD3), мРНК. /PROD=SWISNF related, matrix associated, actindependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 /FL=gb:NM_003078.1 gb
2,377335 6,2969 15,13 Повышение 7.27E-05 NM_005328 Homo sapiens, гиалуронансинтаза 2 (HAS2), мРНК. /PROD=hyaluronan synthase 2 /FL=gb:U54804.1 gb:NM_005328.1
-2,84061 1,073185 15,07 Повышение 1.33E-03 AI123532 Гены EST
0,81871 4,722909 14,97 Повышение 2.18E-04 X06268 Человеческая мРНК для 3-конца C-терм. тройного геликоидного и C-терминального негеликоидного домена про-альфа 1 (II) коллагена (313 AA; AA 975-271c) /FL=gb:NM_001844.2
3,2061 7,080736 14,67 Повышение 2.00E-05 NM_006681 Homo sapiens, нейромедин U (NMU), мРНК. /PROD=neuromedin U /FL=gb:NM_006681.1
-0,60671 3,260587 14,59 Повышение 2.39E-03 NM_000458 Homo sapiens, транскрипционный фактор 2, гепатический; LF-B3; вариант гепатический ядерный фактор (TCF2), вариант транскрипта a, мРНК. /PROD=transcription factor 2, isoform a /FL=gb:NM_000458.1
-3,75063 0,097574 14,4 Повышение 2.53E-03 AW243154 Гены EST
-0,66587 3,17829 14,36 Повышение 2.94E-04 NM_001362 Homo sapiens, деиодиназа, иодотиронин, тип III (DIO3), мРНК. /PROD=thyroxine deiodinase type III /FL=gb:NM_001362.1 gb:S79854.1
-2,17973 1,654509 14,26 Повышение 7.81E-04 BE379542 связывающий ДНК хромодоменгеликазы белок 3 /FL=gb:U91543.1
-0,40798 3,424074 14,24 Повышение 3.78E-04 AI143879 фосфодиэстераза 10A /FL=gb:AB020593.1 gb:AF127479.1 gb:NM_006661.1
1,194285 5,026057 14,24 Повышение 4.81E-04 NM_001898 Homo sapiens, цистатин SN (CST1), мРНК. /PROD=cystatin SN /FL=gb:J03870.1 gb:NM_001898.1
-0,22337 3,603991 14,2 Повышение 1.24E-03 NM_021822 Homo sapiens, форболин-подобный белок MDS019 (MDS019), мРНК. /PROD=phorbolin-like protein MDS019 /FL=gb:AF182420.1 gb:NM_021822.1
-3,47125 0,352559 14,16 Повышение 3.65E-02 BF114815 Гены EST
-3,95752 -0,14384 14,06 Повышение 1.63E-02 NM_001432 Homo sapiens, эпирегулин (EREG), мРНК. /PROD=epiregulin precursor /FL=gb:D30783.1 gb:NM_001432.1
-1,83999 1,973187 14,06 Повышение 2.96E-04 AK074453 Homo sapiens, кДНК: FLJ23873 fis, клон LNG12941.
-2,9769 0,834997 14,04 Повышение 2.11E-02 AW612111 Гены EST
-1,92059 1,887684 14,01 Повышение 1.43E-03 AI738662 гомеобокс HB9 /FL=gb:NM_005515.1
1,868094 5,672805 13,97 Повышение 7.78E-05 H92988 белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-1,42171 2,367519 13,83 Повышение 1.18E-04 NM_005010 Homo sapiens, молекула нейрональной клеточной адгезии (NRCAM), мРНК. /PROD=neuronal cell adhesion molecule /FL=gb:AB002341.1 gb:NM_005010.1
-3,18081 0,59108 13,66 Повышение 6.34E-04 AW449813 белок KIAA0918
-0,11092 3,655377 13,61 Повышение 1.43E-04 BF591483 Гены EST
-1,74597 2,018156 13,59 Повышение 1.45E-02 AW269818 гипотетический белок FLJ23403 /FL=gb:NM_022068.1
1,59762 5,358013 13,55 Повышение 9.35E-04 NM_018649 Homo sapiens, коровый гистон macroH2A2.2 (MACROH2A2), мРНК. /PROD=core histone macroH2A2.2 /FL=gb:AF151534.1 gb:NM_018649.1
-2,85208 0,904726 13,52 Повышение 4.53E-03 AI423201 Гены EST
-1,68521 2,068725 13,49 Повышение 3.53E-03 NM_002770 Homo sapiens, протеаза, серин, 2 (трипсин 2) (PRSS2), мРНК. /PROD=protease, serine, 2 (trypsin 2) /FL=gb:M27602.1 gb:NM_002770.1
0,753353 4,506029 13,48 Повышение 1.83E-05 NM_021827 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ23514 (FLJ23514), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ23514 /FL=gb:NM_021827.1
-1,54589 2,19498 13,37 Повышение 7.14E-03 AW088232 Гены EST
-2,06656 1,672721 13,35 Повышение 5.12E-03 AF141339 Homo sapiens, взаимодействующий с LYST белок LIP3, мРНК, частичная кодовая последовательность. /PROD=LYST-interacting protein LIP3
1,696658 5,415977 13,17 Повышение 8.38E-04 L01639 Человеческий (клон HSY3RR) рецептор к нейропептиду Y, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=neuropeptide Y receptor /FL=gb:L06797.1 gb:NM_003467.1 gb:AF025375.1 gb:AF147204.1 gb:M99293.1 gb:L01639.1
1,633768 5,346711 13,11 Повышение 2.39E-05 AI733465 коллаген, тип IX, альфа 2 /FL=gb:NM_001852.1
-0,65009 3,058078 13,07 Повышение 1.17E-04 NM_017931 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ20699 (FLJ20699), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ20699 /FL=gb:NM_017931.1
0,661121 4,360957 12,99 Повышение 1.08E-04 AA502609 Homo sapiens, анкирин-подобный белок с трансмембранными доменами 1 (ANKTM1), мРНК
1,048741 4,74741 12,98 Повышение 4.60E-04 NM_001899 Homo sapiens, цистатин S (CST4), мРНК. /PROD=cystatin S /FL=gb:NM_001899.1
-2,19527 1,501137 12,96 Повышение 1.06E-03 NM_013333 Homo sapiens, связывающий EH-домен митотический фосфопротеин (EPSIN), мРНК. /PROD=EH domain-binding mitotic phosphoprotein /FL=gb:NM_013333.1 gb:AF073727.1
-2,89467 0,794807 12,9 Повышение 7.39E-03 AW971205 Гены EST
-3,30412 0,383694 12,89 Повышение 3.93E-02 AU157224 Homo sapiens, кДНК: FLJ11570 fis, клон HEMBA1003309
1,223968 4,90936 12,87 Повышение 8.70E-05 AL574912 Гены EST с низкой степенью подобия с серин-протеазой (H.sapiens)
-2,30432 1,381011 12,86 Повышение 3.92E-02 BC017958 Homo sapiens, клон IMAGE:4607409, мРНК.
2,593137 6,238337 12,51 Повышение 2.99E-05 NM_001873 Homo sapiens, карбоксипептидаза E (CPE), мРНК. /PROD=carboxypeptidase E precursor /FL=gb:NM_001873.1
-1,43446 2,199521 12,41 Повышение 9.27E-03 AW291482 Гены EST
0,151239 3,777599 12,35 Повышение 1.16E-04 BE644809 Гены EST
-0,07494 3,527775 12,15 Повышение 9.39E-05 NM_001394 Homo sapiens, двойной специфичности фосфатаза 4 (DUSP4), мРНК. /PROD=dual specificity phosphatase 4 /FL=gb:NM_001394.2 gb:BC002671.1 gb:U48807.1 gb:U21108.1
-2,56291 1,033178 12,09 Повышение 1.48E-02 BG532690 интегрин, альфа 4 (антиген CD49D, субъединица альфа 4 рецептора VLA-4)
-3,10679 0,486734 12,07 Повышение 8.34E-04 N59476 Гены EST
-1,71673 1,874627 12,05 Повышение 9.46E-04 NM_000420 Homo sapiens, белок группы крови Келла (KEL), мРНК. /PROD=Kell blood group antigen /FL=gb:BC003135.1 gb:NM_000420.1
1,071985 4,656957 12 Повышение 6.98E-05 NM_004560 Homo sapiens, побочный рецептор, подобный рецептору тирозинкиназы 2 (ROR2), мРНК. /PROD=receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 /FL=gb:M97639.1 gb:NM_004560.1
-0,05814 3,51961 11,94 Повышение 8.07E-04 BF308645 белок KIAA1415
0,581614 4,158253 11,93 Повышение 1.95E-04 AF005775 Homo sapiens, каспаза-подобный регулирующий апоптоз белок 2 (clarp), мРНК, продукт альтернативного сплайсинга, полная кодовая последовательность. /PROD=caspase-like apoptosis regulatory protein 2 /FL=gb:AF005775.1
-3,51603 0,057356 11,9 Повышение 2.99E-02 AV724769 Гены EST
-1,99136 1,57545 11,85 Повышение 8.72E-03 AL109653 Последовательность человеческой ДНК от клонирования GS1-115M3 на хромосоме Xq27.1-28. Содержит ген нового белка CXorf1 (хромосома X, открытая рамка считывания 1), гены EST, STS, GSS и островок CpG
0,454394 4,013479 11,79 Повышение 3.30E-04 AL036088 белок KIAA1479
-0,41994 3,13818 11,78 Повышение 2.73E-03 AI686957 белок KIAA1494
1,355965 4,912341 11,76 Повышение 2.16E-04 AI141603 коллаген, тип VI, альфа 1
-2,33835 1,203342 11,65 Повышение 2.16E-02 L33477 Человеческий (клон 8B1) Br-кадгерин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Br-cadherin /FL=gb:L34057.1 gb:L33477.1 gb:NM_004061.1
2,453593 5,992042 11,62 Повышение 5.24E-05 NM_005410 Homo sapiens, селенопротеин P, плазма, белок 1 (SEPP1), мРНК. /PROD=selenoprotein P precursor /FL=gb:NM_005410.1
0,240245 3,777926 11,61 Повышение 8.44E-04 BF940761 Гены EST
-0,28951 3,242447 11,57 Повышение 3.11E-04 NM_018388 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ11316 (FLJ11316), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ11316 /FL=gb:NM_018388.1
-0,10881 3,416108 11,51 Повышение 3.44E-04 AA701657 гипотетический белок FLJ12666
-1,17666 2,334376 11,4 Повышение 7.27E-04 NM_024633 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ21276 (FLJ21276), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ21276 /FL=gb:NM_024633.1
2,59334 6,102285 11,38 Повышение 6.58E-05 AA045184 рибосомальный белок L14
0,451744 3,95936 11,37 Повышение 2.79E-04 NM_001399 Homo sapiens, эктодермальной дисплазии белок 1, ангидротический (ED1), мРНК. /PROD=ectodermal dysplasia 1, anhidrotic /FL=gb:AF060999.1 gb:NM_001399.1 gb:AF040628.1 gb:AF061189.1
1,040647 4,542431 11,33 Повышение 6.98E-05 AI348094 белок KIAA0882
-1,24923 2,248992 11,3 Повышение 1.02E-03 R42166 Гены EST с низкой степенью подобия с AXO1_HUMAN, ПРЕДШЕСТВЕННИКОМ АКСОНИНА-1 (H.sapiens)
0,414809 3,908697 11,27 Повышение 2.78E-04 NM_016179 Homo sapiens, временный рецепторный потенциальный канал 4 (TRPC4), мРНК. /PROD=transient receptor potential 4 /FL=gb:NM_016179.1 gb:AF175406.1
-2,9904 0,493882 11,19 Повышение 2.79E-04 U96136 Homo sapiens, дельта-катенин, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=delta-catenin /FL=gb:NM_001332.1 gb:U72665.1 gb:AB013805.1 gb:U96136.1 gb:AF035302.1
1,076427 4,559689 11,18 Повышение 1.88E-04 AI640307 протокадгерин 10
-1,08244 2,395089 11,14 Повышение 2.32E-03 X75208 X75208 /FEATURE=cds /DEFINITION=HSPTKR H.sapiens HEK2 мРНК для рецептора протеинтирозинкиназы
-1,25121 2,224638 11,13 Повышение 3.78E-04 R62432 Кластер включает R62432:yg52e11.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-36023 /clone_end=3 /gb=R62432 /gi=834311 /ug=Hs.12321 /len=487
0,631332 4,097155 11,05 Повышение 3.78E-04 AI130705 Гены EST с низкой степенью подобия с A46302, фактором сплайсинга, ассоциированным с PTB, длинная форма (H.sapiens)
1,438639 4,903827 11,04 Повышение 9.39E-05 BF223214 Гены EST
0,120924 3,584799 11,03 Повышение 9.41E-05 NM_001529 Homo sapiens, экспрессируемый в кроветворных клетках гомеобокс (HHEX), мРНК. /PROD=hematopoietically expressed homeobox /FL=gb:NM_001529.1 gb:L16499.1 gb:NM_002729.1
1,316429 4,768005 10,94 Повышение 1.37E-04 AI769688 Homo sapiens, клон 23664 и 23905, последовательность мРНК
0,449933 3,898646 10,92 Повышение 3.56E-03 Z21533 H.sapiens, ген HEX, кодирующий связанный с гомеобоксом белок. /PROD=homeobox related protein
2,383898 5,826754 10,87 Повышение 2.39E-05 BF476502 гипотетический белок FLJ11585
-2,21968 1,214412 10,81 Повышение 2.00E-02 AA946876 Гены EST
0,999053 4,427902 10,77 Повышение 2.39E-04 AW129593 белок с повторяющимися tudor-доменами, ассоциирующийся с PCTAIRE 2
1,750623 5,17881 10,76 Повышение 7.27E-05 AA176289 Гены EST
0,502333 3,925314 10,73 Повышение 2.47E-03 AF211891 Homo sapiens, Mix-like homeobox protein 1 (MILD1), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Mix-like homeobox protein 1 /FL=gb:AF211891.1
-2,15454 1,256699 10,64 Повышение 4.44E-02 NM_012082 Homo sapiens, белок Friend of GATA2 (FOG2), мРНК. /PROD=Friend of GATA2 /FL=gb:NM_012082.2 gb:AF119334.1
-0,23726 3,166937 10,59 Повышение 3.27E-04 AA912476 Homo sapiens, кДНК: FLJ13221 fis, клон NT2RP4002075
-2,38435 1,018436 10,58 Повышение 1.74E-03 AI743137 Гены EST
-1,83333 1,555259 10,47 Повышение 5.26E-03 NM_006501 Homo sapiens, ассоциированный с миелином основной белок олигодендроцитов (MOBP), мРНК. /PROD=myelin-associated oligodendrocyte basic protein /FL=gb:D28113.1 gb:NM_006501.1
2,168853 5,557183 10,47 Повышение 2.75E-04 AA284532 белок активации тирозин 3-монооксигеназы/триптофан 5-монооксигеназы, полипептид-эта
-1,0335 2,347369 10,42 Повышение 9.35E-04 AL553774 белок KIAA1462
-1,78964 1,575618 10,3 Повышение 2.04E-02 NM_004861 Homo sapiens, цереброзид (3-фосфоаденилсульфат:галактозилкерамид 3) сульфотрансфераза (CST), мРНК. /PROD=galactosylceramide sulfotransferase /FL=gb:NM_004861.1 gb:D88667.1
-3,12055 0,243075 10,29 Повышение 2.31E-02 AW780006 Гены EST
2,194421 5,519803 10,02 Повышение 8.38E-04 AF348491 Homo sapiens, рецептор хемокина CXCR4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=chemokine receptor CXCR4 /FL=gb:AF348491.1
-0,75724 2,561949 9,98 Повышение 5.19E-03 AL445192 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP11-269H4 на хромосоме 20. Содержит 3-конец гена KIAA1415, подобный индуцирующему заражение и метастазирование Т-лимфомы белку-1, гены EST, STS и GSS
-0,92287 2,395505 9,98 Повышение 3.26E-04 AA443280 Гены EST с высокой степенью подобия с миозином класса III AF229172, белок 1 (H.sapiens)
-0,38837 2,924326 9,94 Повышение 6.37E-04 BE551088 Гены EST
-1,06796 2,241523 9,91 Повышение 3,97E-02 AW664179 гипотетический белок MGC4342 /FL=gb:NM_024329.1 gb:BC003033.1
-0,65031 2,656212 9,89 Повышение 1.16E-04 AI760630 Гены EST
-0,2425 3,063759 9,89 Повышение 1.10E-04 NM_018286 Homo sapiens, гипотетический белок FLJ10970 (FLJ10970), мРНК. /PROD=hypothetical protein FLJ10970 /FL=gb:NM_018286.1
4,042679 7,345476 9,87 Повышение 3.22E-04 NM_005454 Homo sapiens, гомолог гена cerberus 1 (Xenopus laevis) (суперсемейство белков с цистеиновым узлом) (CER1), мРНК. /PROD=cerberus 1 /FL=gb:NM_005454.1
0,561438 3,86147 9,85 Повышение 3,49E-04 BF968270 Гены EST
-2,62694 0,672523 9,85 Повышение 8.33E-03 NM_000055 Homo sapiens, бутирилхолинэстераза (BCHE), мРНК. /PROD=butyrylcholinesterase precursor /FL=gb:M16541.1 gb:M16474.1 gb:NM_000055.1
-1,75731 1,539959 9,83 Повышение 3.37E-02 BC008992 Homo sapiens, клон MGC:16926 IMAGE:4183000, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:16926) /FL=gb:BC008992.1
3,287037 6,580588 9,81 Повышение 7.27E-05 AI633559 Гены EST
-1,20714 2,08291 9,78 Повышение 3.66E-03 BC042378 Homo sapiens, клон IMAGE:5277693, мРНК.
0,937118 4,225755 9,77 Повышение 7.27E-05 AU151342 Homo sapiens, кДНК: FLJ12935 fis, клон NT2RP2004982
0,447082 3,734688 9,76 Повышение 1.61E-04 NM_014942 Homo sapiens, белок KIAA0957 (KIAA0957), мРНК. /PROD=KIAA0957 protein /FL=gb:AB023174.1 gb:NM_014942.1
-3,09265 0,191299 9,74 Повышение 6.04E-03 AI093492 Гены EST
-2,20597 1,071614 9,7 Повышение 1.05E-02 AI968904 Гены EST
1,370117 4,641246 9,65 Повышение 7.27E-05 M33653 Человеческий (клоны HT-(125,133)) альфа-2 тип IV коллаген (COL4A2), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=alpha-2 type IV collagen /FL=gb:M33653.1
0,205308 3,457432 9,53 Повышение 1.55E-04 BF509230 Гены EST
1,380324 4,628332 9,5 Повышение 3.46E-04 NM_006895 Homo sapiens, гистамин N-метилтрансфераза (HNMT), мРНК. /PROD=histamine N-methyltransferase /FL=gb:NM_006895.1 gb:D16224.1 gb:U08092.1
0,1187 3,354157 9,42 Повышение 2.39E-05 N21184 Кластер включает N21184:yx41a10.s1 Homo sapiens, кДНК, 3-конец /clone=IMAGE-264282 /clone_end=3 /gb=N21184 /gi=1126354 /ug=Hs.93605 /len=619
-0,30596 2,924622 9,39 Повышение 1.42E-03 BC029835 Homo sapiens, клон IMAGE:5169759, мРНК.
1,008383 4,233261 9,35 Повышение 1.84E-04 BE397715 транскрипционный фактор 2 лейкемии предшественников В-клеток /FL=gb:NM_002586.1
-1,28081 1,941655 9,33 Повышение 1.10E-03 NM_001735 Homo sapiens, компонент комплемента 5 (C5), мРНК. /PROD=complement component 5 /FL=gb:M57729.1 gb:NM_001735.1
-1,80959 1,41238 9,33 Повышение 3.47E-03 BF447246 белок KIAA0960
0,378586 3,596764 9,31 Повышение 3.90E-05 BF109231 Гены EST
-1,17885 2,035986 9,28 Повышение 1.34E-03 AB002155 Homo sapiens, мРНК для человеческого уроплакина Ib, полная кодовая последовательность. /PROD=human uroplakin Ib /FL=gb:NM_006952.1 gb:AB015234.1 gb:AF042331.1 gb:AB002155.1
-2,84187 0,3707 9,27 Повышение 2.06E-03 NM_002244 Homo sapiens, калиевый выпрямляющийся внутрь канал, подсемейство J, ингибитор 1 (KCNJN1), мРНК. /PROD=potassium inwardly-rectifying channel, subfamilyJ, inhibitor 1 /FL=gb:NM_002244.1
0,442286 3,651458 9,25 Повышение 6.22E-04 NM_001778 Homo sapiens, CD48 антиген (B-клеточный мембранный белок) (CD48), мРНК. /PROD=CD48 antigen (B-cell membrane protein) /FL=gb:NM_001778.1 gb:M37766.1 gb:M59904.1
-1,58477 1,612357 9,17 Повышение 3.93E-03 NM_016341 Homo sapiens, обильная в поджелудочной железе фосфолипаза C (LOC51196), мРНК. /PROD=pancreas-enriched phospholipase C /FL=gb:AF117948.1 gb:NM_016341.1 gb:AF190642.2
0,798972 3,993241 9,15 Повышение 2.02E-05 AI082827 гипотетический белок FLJ11585
-1,39976 1,793953 9,15 Повышение 8.10E-04 NM_005204 Homo sapiens, митоген-активированной протеинкиназы киназы киназы киназа 8 (MAP3K8), мРНК. /PROD=mitogen-activated protein kinase kinase kinase8 /FL=gb:NM_005204.1 gb:D14497.1
-1,2719 1,918316 9,13 Повышение 2.22E-03 NM_020406 Homo sapiens, истинная первичная полицитемия, белок 1; рецептор на поверхности клетки (PRV1), мРНК. /PROD=polycythemia rubra vera 1; cell surfacereceptor /FL=gb:NM_020406.1 gb:AF146747.1
-1,20098 1,986443 9,11 Повышение 7.28E-03 NM_001794 Homo sapiens, кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчаточный) (CDH4), мРНК. /PROD=cadherin 4, type 1, R-cadherin (retinal) /FL=gb:L34059.1 gb:NM_001794.1
0,270283 3,456007 9,1 Повышение 1.24E-03 AI690433 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp434K0621 (из клона DKFZp434K0621); частичная кодовая последовательность
-3,14727 0,038057 9,1 Повышение 4.46E-02 NM_001147 Homo sapiens, ангиопоэтин 2 (ANGPT2), мРНК. /PROD=angiopoietin 2 /FL=gb:AB009865.1 gb:AF004327.1 gb:NM_001147.1
-2,65285 0,529695 9,08 Повышение 5.20E-04 BE549700 Гены EST
-0,70603 2,476147 9,08 Повышение 2.75E-04 X02162 Человеческая мРНК для аполипопротеина AI (apo AI)=. /PROD=preproapolipoprotein AI
0,134434 3,31354 9,06 Повышение 7.31E-05 AV758821 Гены EST с низкой степенью подобия с Z132_HUMAN, ЦИНК-ПАЛЬЦЕВЫМ БЕЛКОМ 13 (H.sapiens)
1,488455 4,666225 9,05 Повышение 2.39E-05 NM_000177 Homo sapiens, гельсолин (финский амилоидоз) (GSN), мРНК. /PROD=gelsolin (amyloidosis, Finnish type) /FL=gb:NM_000177.1
0,37879 3,553097 9,03 Повышение 2.78E-04 BC039295 Homo sapiens, подобный подавляемому Ctnnb1 белку, a, клон MGC:39518 IMAGE:5267063, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Similar to down-regulated by Ctnnb1, a /FL=gb:BC039295.1
-2,03929 1,12953 8,99 Повышение 1.03E-02 NM_003855 Homo sapiens, интерлейкина 18 рецептор 1 (IL18R1), мРНК. /PROD=interleukin 18 receptor 1 /FL=gb:NM_003855.1 gb:U43672.1
-1,95127 1,210788 8,95 Повышение 6.65E-03 L12468 Homo sapiens, аминопептидаза A, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=aminopeptidase A /FL=gb:L12468.1 gb:NM_001977.1 gb:L14721.1
-3,03451 0,120756 8,91 Повышение 1.30E-03 BF432875 Гены EST
0,219552 3,367037 8,86 Повышение 1.61E-04 BE856336 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp761G151 (из клона DKFZp761G151); частичная кодовая последовательность
1,091867 4,237655 8,85 Повышение 3.97E-03 NM_004765 Homo sapiens, хроническая лимфоцитарная лейкемия B-клеток: семейство белков лимфома 7, член C (BCL7C), мРНК. /PROD=B-cell CLLlymphoma 7C /FL=gb:NM_004765.1
-1,37872 1,766362 8,85 Повышение 2.81E-03 AF063825 Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant gamma /FL=gb:AF063825.1
-0,88126 2,263541 8,84 Повышение 1.10E-03 BC014364 Homo sapiens, клон MGC:24252 IMAGE:3932604, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=Unknown (protein for MGC:24252) /FL=gb:BC014364.1
0,345528 3,488906 8,84 Повышение 1.32E-04 AW276186 главный комплекс гистосовместимости (MHC), класс II, DQ бета 1
-1,23083 1,909333 8,82 Повышение 3.54E-05 AF063824 Homo sapiens, урезанный вариант-дельта связанного с trp белка 4, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=trp-related protein 4 truncated variant delta /FL=gb:AF063824.1
-0,95126 2,187719 8,81 Повышение 8.38E-04 NM_021170 Homo sapiens, bHLH фактор Hes4 (LOC57801), мРНК. /PROD=bHLH factor Hes4 /FL=gb:NM_021170.1 gb:AB048791.1
1,979568 5,115328 8,79 Повышение 1.83E-05 M17565 Человеческий MHC, класс II, DQ-beta, ассоциированный с DRw6, белок DQw1, полная кодовая последовательность. /FL=gb:M17565.1
1,425392 4,555892 8,76 Повышение 1.10E-03 AB018195 Homo sapiens, ca xi мРНК для ассоциированного с карбоангидразой белка XI, полная кодовая последовательность. /PROD=carbonic anhydrase-related protein XI /FL=gb:NM_001217.2 gb:AB018195.1 gb:BC002662.1 gb:AF067662.1
-0,94697 2,181933 8,75 Повышение 8.53E-03 BG208091 Homo sapiens, кДНК: FLJ37414 fis, клон BRAWH1000157.
-2,29059 0,832807 8,71 Повышение 1.45E-03 NM_000110 Homo sapiens, дигидропиримидин-дегидрогеназа (DPYD), мРНК. /PROD=dihydropyrimidine dehydrogenase /FL=gb:AB003063.1 gb:U09178.1 gb:NM_000110.2 gb:U20938.1
1,409091 4,531365 8,71 Повышение 3.78E-04 AF026219 Homo sapiens, белок HP (HP), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=HP protein /FL=gb:AF026219.1 gb:AF035119.1 gb:NM_006094.2
0,038661 3,158562 8,69 Повышение 1.38E-02 AL831967 Homo sapiens, мРНК; кДНК DKFZp451H072 (из клона DKFZp451H072); полная кодовая последовательность. /FL=gb:AL831967.1
-0,75335 2,363345 8,67 Повышение 7.05E-03 AK023900 Homo sapiens, кДНК: FLJ13838 fis, клон THYRO1000756, с низкой степенью подобия с АЛЬФА-N-АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМИНИД АЛЬФА-2,6-СИАЛИЛТРАНСФЕРАЗОЙ (EC 2.4.99.-). /FL=gb:NM_013443.1 gb:AB035173.1
-3,56757 -0,45104 8,67 Повышение 3.25E-03 R43486 Гены EST
2,377686 5,491345 8,66 Повышение 5.61E-05 NM_000222 Homo sapiens, гомолог гена v-kit Харди-Цукермана 4 вирусного онкогена кошачьей саркомы (KIT), мРНК. /PROD=v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viraloncogene homolog precursor /FL=gb:NM_000222.1
3,409815 -4,69755 275,78 Снижение 7.78E-05 NM_016588 Homo sapiens, нейритин (LOC51299), мРНК. /PROD=neuritin /FL=gb:NM_016588.1 gb:BC002683.1 gb:AF136631.1
2,62025 -3,04157 50,63 Снижение 2.62E-04 AA625683 Гены EST
4,897427 -0,73179 49,5 Снижение 3.89E-04 R06655 Гены EST со средней степенью подобия с белком AF078844 1 hqp0376 (H.sapiens)
3,77776 -1,65937 43,32 Снижение 9.82E-04 BU729850 гипотетический белок LOC153469
0,757197 -4,31965 33,75 Снижение 9.91E-03 AF213459 Homo sapiens, эфриновый рецептор EPHA3, полная форма (EPHA3), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=ephrin receptor EPHA3 complete form /FL=gb:NM_005233.1 gb:M83941.1 gb:AF213459.1
3,025351 -1,38311 21,24 Снижение 1.78E-03 AW590925 Гены EST
2,350127 -1,99242 20,29 Снижение 2.82E-04 AK026106 Homo sapiens, кДНК: FLJ22453 fis, клон HRC09679, с высокой степенью подобия cAF059516, мРНК толлоид-подобного белка 2 (TLL2), Homo sapiens.
0,860464 -3,44694 19,8 Снижение 1.25E-02 NM_003007 Homo sapiens, семеногелин I (SEMG1), мРНК. /PROD=semenogelin I /FL=gb:J04440.1 gb:NM_003007.1
0,579765 -3,42804 16,09 Снижение 1.83E-03 AI393930 Гены EST
4,507212 0,732117 13,69 Снижение 6.09E-05 AW196940 Гены EST
3,862686 0,237876 12,34 Снижение 1.03E-03 NM_007115 Homo sapiens, индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 (TNFAIP6), мРНК. /PROD=tumor necrosis factor, alpha-induced protein 6 /FL=gb:NM_007115.1
2,36447 -1,22861 12,07 Снижение 2.57E-04 NM_005181 Homo sapiens, карбоангидраза III, специфичная для мышц (CA3), мРНК. /PROD=carbonic anhydrase III /FL=gb:BC004897.1 gb:NM_005181.2
3,113698 -0,4652 11,95 Снижение 1.17E-04 NM_002196 Homo sapiens, ассоциированный с инсулиномой белок 1 (INSM1), мРНК. /PROD=insulinoma-associated 1 /FL=gb:NM_002196.1 gb:M93119.1
1,05854 -2,46305 11,48 Снижение 2.94E-02 AI703321 белок типа wingless семейства сайта интеграции MMTV, член 5A
3,557525 0,041029 11,44 Снижение 2.62E-04 BF514079 Kruppel-подобный фактор 4 (кишечный)
3,806044 0,419409 10,46 Снижение 7.75E-04 AV734646 Экспрессированная последовательность 9928 для сегмента ДНК на хромосоме X (уникального)
2,64743 -0,69932 10,17 Снижение 2.48E-03 AI702438 Гены EST
3,030236 -0,17175 9,2 Снижение 4.80E-03 AA812232 стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
5,023981 1,931575 8,53 Снижение 1.95E-04 NM_006472 Homo sapiens, стимулируемый при воздействии 1,25-дигидроксивитамина D-3 (VDUP1), мРНК. /PROD=upregulated by 1,25-dihydroxyvitamin D-3 /FL=gb:NM_006472.1 gb:S73591.1
6,426778 3,371755 8,31 Снижение 2,62E-04 AF313413 Homo sapiens, предполагаемый малый трансмембранный белок NID67, мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=putative small membrane protein NID67 /FL=gb:AF313413.1
-0,42962 -3,45743 8,16 Снижение 2.90E-02 D28364 Человеческая мРНК для аннексина II, 5UTR (последовательность от 5cap до стартового кодона).
2,367534 -0,64534 8,07 Снижение 2.77E-02 AF098641 Homo sapiens, CD44 изоформа RC (CD44), мРНК, полная кодовая последовательность. /PROD=CD44 isoform RC /FL=gb:AF098641.1
5,13621 2,189627 7,71 Снижение 2.78E-03 BC013944 Homo sapiens, подобный миозину, тяжелый полипептид 7, сердечная мышца, бета, клон IMAGE:4064393, мРНК.
2,951696 0,005808 7,71 Снижение 1.79E-02 AB019562 Homo sapiens, мРНК, экспрессируемая только в ворсинах плаценты, клон SMAP41.
6,568635 3,642312 7,6 Снижение 2.61E-04 AL031602 Последовательность человеческой ДНК от клонирования RP5-1174N9 на хромосоме 1p34.1-35.3. Содержит ген нового белка с доменом IBR, ген (псевдо?) нового белка, сходного с MT1E (металлотионеин 1E (функциональный)), гены EST, STS, GSS и два предполагаемых Cp...
0,237018 -2,68848 7,6 Снижение 1.69E-02 NM_002852 Homo sapiens, связанный с пентаксином ген, быстро индуцируемый IL-1 бета (PTX3), мРНК. /PROD=pentaxin-related gene, rapidly induced by IL-1beta /FL=gb:M31166.1 gb:NM_002852.1
3,094055 0,187515 7,5 Снижение 7.78E-05 AW188198 индуцируемый фактором некроза опухолей альфа белок 6 /FL=gb:NM_007115.1
0,510307 -2,36971 7,36 Снижение 5.02E-02 AI040887 Гены EST
2,514693 -0,35098 7,29 Снижение 5.77E-05 NM_145032 Homo sapiens, гипотетический белок MGC21636 (MGC21636), мРНК. /FL=gb:BC020572.1 gb:NM_145032.2
5,356771 2,49399 7,27 Снижение 2.39E-04 W92036 Гены EST
4,622217 1,771706 7,21 Снижение 4.89E-05 AL537457 нейрофиламент, легкий полипептид (68 кДа) /FL=gb:NM_006158.1
7,360687 4,513462 7,2 Снижение 5.28E-04 BF217861 металлотионеин 1E (функциональный)
5,388254 2,562722 7,09 Снижение 4.27E-04 NM_004207 Homo sapiens, переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 (SLC16A3), мРНК. /PROD=solute carrier family 16 (monocarboxylic acidtransporters), member 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,462851 0,655394 7 Снижение 5.00E-04 BE673800 Гены EST со средней степенью подобия с белком KIAA1238 (H.sapiens)
4,749034 1,960178 6,91 Снижение 1.18E-02 NM_002130 Homo sapiens, 3-гидрокси-3-метилглутарил-Коэнзим A синтаза 1 (растворимая) (HMGCS1), мРНК. /PROD=3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 1(soluble) /FL=gb:NM_002130.1 gb:L25798.1 gb:BC000297.1
4,738703 1,971781 6,81 Снижение 7.81E-04 NM_014033 Homo sapiens, белок DKFZP586A0522 (DKFZP586A0522), мРНК. /PROD=DKFZP586A0522 protein /FL=gb:NM_014033.1
2,28595 -0,4498 6,66 Снижение 2.03E-03 BE504838 Гены EST
1,10782 -1,62775 6,66 Снижение 9.81E-04 BC029425 Homo sapiens, белок, подобный KIAA1275, клон IMAGE:4616553, мРНК.
4,092731 1,365462 6,62 Снижение 2.70E-04 AL513917 переносчик растворенных веществ, семейство 16 (переносчики монокарбоновых кислот), член 3 /FL=gb:U81800.1 gb:NM_004207.1
3,437271 0,717704 6,59 Снижение 1.77E-04 AB029025 Homo sapiens, мРНК для белка KIAA1102, частичная кодовая последовательность. /PROD=KIAA1102 protein
2,129273 -0,56464 6,47 Снижение 9.35E-04 AV734646 Экспрессированная после