Антисмысловые олигонуклеотиды в качестве ингибиторов сигнального пути tgf-r

Авторы патента:

АРТ, Ханс-Лотар (DE)

КРАМПЕРТ, Моника (DE)

ХОССБАХ, Маркус (DE)

C12N15/113 - Получение мутаций или генная инженерия; ДНК или РНК, связанные с генной инженерией, векторы, например плазмиды или их выделение, получение или очистка; использование их хозяев (мутанты или микроорганизмы, полученные генной инженерией C12N 1/00,C12N 5/00,C12N 7/00; новые виды растений A01H; разведение растений из тканевых культур A01H 4/00; новые виды животных A01K 67/00; использование лекарственных препаратов, содержащих генетический материал, который включен в клетки живого организма, для лечения генетических заболеваний, для генной терапии A61K 48/00 пептиды вообще C07K)

A61K31/7088 - соединения, содержащие три или более нуклеозида или нуклеотида

Владельцы патента RU 2717454:

НЬЮРОВИЖН ФАРМА ГМБХ (DE)

Изобретение относится к биотехнологии. Описаны антисмысловые олигонуклеотиды, состоящие из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид комплементарен участку гена, кодирующего TGF-R_II, или участку мРНК, кодирующей TGF-R_II. Описана фармацевтическая композиция, содержащая такие антисмысловые олигонуклеотиды. Указанные нуклеотиды применяют для профилактики и лечения неврологических, нейродегенеративных, фиброзных и гиперпролиферативных заболеваний. 3 н. и 11 з.п. ф-лы, 32 ил., 85 табл., 640 пр.

Настоящее изобретение относится к антисмысловым олигонуклеотидам, их применению в качестве ингибиторов сигнального пути TGF-R, фармацевтическим композициям, содержащим такие антисмысловые олигонуклеотиды, и применению для профилактики и лечения неврологических, нейродегенеративных и гиперпролиферативных заболеваний, в том числе онкологических заболеваний.

В организме человека TGF-β находится в трех известных подтипах, TGF-β1, TGF-β2 и TGF-β3. Они подвергаются повышающей регуляции при нейродегенеративных заболеваниях, таких как ALS, и также при некоторых злокачественных заболеваниях человека, и также было показано, что повышенная экспрессия этого фактора роста имеет место при таких патологических состояниях, как нейродегенеративные заболевания, острая травма и нейровоспаление, и при старении. Полагают, что изоформы трансформирующего фактора роста бета (TGF-β1) также участвуют в патогенезе преэклампсии.

Активированные TGF-β оказывают свои эффекты на клетки-мишени через три различных класса рецепторов: тип I (TGFRI), также называемый активин-подобными киназами (ALK; 53 кДа), тип II (TGFRII; 70-100 кДа) и тип III (TGFRIII; 200-400 кДа). Рецепторы TGF-β представляют собой однопроходные рецепторы с серин-треонин-киназной активностью. В то время, как рецептор типа II киназы является конститутивно активным, рецептор типа I должен активироваться. Данный процесс инициируется посредством связывания лиганда с TGFRII; это «запускает» образование временного комплекса, который включает лиганд и рецептор типа I и II. Принимая во внимание димерный состав лиганда, рецепторный комплекс, скорее всего, состоит из тетрамерной структуры, образованной двумя парами рецепторов каждого типа.

Трансдукция сигналов TGF-β происходит через его рецепторы и ниже через белки Smad. Smad-зависимая трансдукция клеточных сигналов, инициируемая связыванием изоформы TGF-β с парой специфичных рецепторов TGFRI/II, приводит к фосфорилированию внутриклеточных Smads и затем транслокации активированного комплекса Smad в ядро, чтобы оказать влияние на экспрессию конкретного гена-мишени. Дивергенция сигналов на другие пути и конвергенция с соседних сигнальных путей генерирует очень сложную сеть. В зависимости от окружающей и клеточной среды сигнальный путь TGF-β приводит к различным клеточным реакциям, таким как пролиферация, дифференцировка, подвижность клеток и апоптоз опухолевых клеток. При раке TGF-β может непосредственно влиять на рост опухоли (упоминаемый как внутренний эффект сигнального пути TGF-β) или опосредованно (упоминаемый как внешний эффект) посредством стимуляции роста опухоли, индукцией эпителиально-мезенхимального перехода (EMT), блокированием противоопухолевых иммунных ответов, повышением опухолеассоциированного фиброза, модулированием внеклеточного матрикса (ECN) и миграцией клеток, и, наконец, усилением ангиогенеза. Факторы (например, концентрация, время, локальное воздействие), определяющие, имеет сигнальный путь TGF-β промоторную или супрессорную функцию для опухоли, являются предметом интенсивных исследований и дискуссий. В настоящее время считается, что супрессорная функция сигнального пути TGF-β для опухолей отсутствует на ранних стадиях рака аналогично рецессивным мутациям с потерей функции у других опухолевых супрессоров. Следовательно, существует несколько фармакологических подходов к лечению различных видов рака блокированием сигнальных путей TGF-β, таких как исследование галуницертиба и TEW-7197, которые оба являются низкомолекулярными ингибиторами TGFRI и находятся на стадии клинических испытаний, и LY3022859, антитело против TGFRII.

Сигналы, обеспечиваемые белками семейства трансформирующего фактора роста (TGF-β), представляют собой систему посредством которой нейрональные стволовые клетки регулируются в физиологических условиях, но по аналогии с другими типами клеток освобождаются от этого контроля после трансформации в раковые стволовые клетки. TGF-β представляет собой многофункциональный цитокин, участвующий в различных физиологических и патофизиологических процессах в головном мозге. Он индуцируется в мозге взрослого человека после травмы или гипоксии и во время нейродегенерации, когда он модулирует и гасит воспалительные реакции. После травмы, несмотря на то, что TGF-β в общем, является нейропротективным, он ограничивает самовосстановление головного мозга ингибированием пролиферации нервных стволовых клеток и индукцией фиброза/глиоза для образования рубца. Подобно своему действию на нейрональные стволовые клетки, TGF-β оказывает антипролиферативный контроль в отношении большинства типов клеток; однако, как это ни парадоксально, многие опухоли избегают контроля TGF-β. Более того, в таких опухолях развиваются механизмы, которые изменяют антипролиферативное влияние TGF-β и превращают его в онкогенные сигналы, в основном, организуя многочисленные TGF-β-опосредованные эффекты на матрикс, миграцию и инвазию, ангиогенез, и, самое главное, механизмы избежания иммунного надзора. Таким образом, TGF-β участвует в прогрессировании опухолей (смотри фиг. 3).

Следовательно, рецептор II TGF (рецептор II трансформирующего фактора роста бета; аналогично используемые символы: рецептор типа II TGF-бета, TGFBR2; AAT3; FAA3; LDS1B; LDS2; LDS2B; MFS2; RIIC; TAAD2; TGFR-2; TGFbeta-RII, TGF-RII, TGF-R_II), и, в частности, его ингибирование, был признан в качестве мишени для лечения нейродегенеративных заболеваний, таких как ALS, и гиперпролиферативных заболеваний, таких как рак и фиброзные болезни.

Таким образом, целью настоящей заявки является обеспечение фармацевтически активных соединений, способных ингибировать экспрессию рецептора II TGF (TGF-R_II), и, следовательно, уменьшать количество рецептора II TGF (TGF-R_II) и снижать активность сигнального пути ниже по отношению TGF-β.

Цель настоящего изобретения достигается с помощью принципов независимых пунктов формулы изобретения. Другие преимущественные признаки, аспекты и детали изобретения станут очевидными из зависимых пунктов формулы изобретения, описания изобретения, фигур и примеров настоящей заявки.

С удивлением было установлено, что тысячи соединений-кандидатов, таких как белоково-нуклеотидные комплексы, миРНК, микроРНК (миРНК), рибозимы, аптамеры, CpG-олигонуклеотиды, ДНК-зимы, рибопереключатели, липиды, пептиды, небольшие молекулы, модификаторы raft или кавеолина, модификаторы аппарата Гольджи, антитела и их производные, в частности, химеры, Fab-фрагменты и Fc-фрагменты, антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие LNA (LNA^®: «замкнутые» нуклеиновые кислоты), являются наиболее перспективными кандидатами для применений, раскрытых здесь.

Таким образом, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или ACTACCAAAT последовательность (SEQ. ID NO: 6), или последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную к гибридизации с указанной последовательностью TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательностью CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательностью ACTACCAAAT (SEQ. ID NO:6), или последовательностью GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательностью GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательностью TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком открытой рамки считывания гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок открытой рамки считывания гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5) или ACTACCAAAT последовательность (SEQ. ID NO: 6), или последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную к гибридизации с указанной последовательностью TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательностью CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательностью ACTACCAAAT (SEQ. ID NO:6), или последовательностью GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательностью GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательностью TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Альтернативно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или ACTACCAAAT последовательность (SEQ. ID NO: 6), или последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательности CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательности ACTACCAAAT (SEQ. ID NO:6), или последовательности GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательности GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательности TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком открытой рамки считывания гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок открытой рамки считывания гена, кодирующего TGF-R_II или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID No. 4) или последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5) или последовательность ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), или последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательности CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5) или последовательности ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6) или последовательности GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7) или последовательности GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8) или последовательности TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9), и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют собой звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и, более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и/или на 5'терминальном конце.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, которые содержат 3-10 звеньев LNA и которые, в частности, содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида, и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК.

Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, а также их обычные производные. Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению также могут содержать модифицированные межнуклеотидные мостики, такие как фосфоротиоат или фосфородитиоат вместо фосфатных мостиков. Такие модификации могут присутствовать только в сегментах LNA или только в сегменте, который не является LNA, антисмыслового олигонуклеотида.

Таким образом, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297), CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300), TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 303), CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306), TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309), GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297), CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300), TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO:303), CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306), TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309), GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313 соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Альтернативно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297), CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300), TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO:303), CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306), TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309), GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297), CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300), TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO:303), CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306), TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309), GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313 соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297) или CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297) или CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297) или CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 296), TGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 297) или CTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 298) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300) и TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300) и TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300) или TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности TCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 299), CCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 300) или TCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 301) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO:303) или CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 303) или CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 303) или CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 302), ACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 303) или CACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 304) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306) или TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306) или TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306) или TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности TGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 305), GGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 306) или TGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 307) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309) или GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309) или GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309) или GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности GGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 308), GTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 309) или GGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 310) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности TTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 311), TTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 312) или TTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 313 соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению предпочтительно содержат 3-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют собой звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и, более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и/или на 5'терминальном конце.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, которые содержат 3-10 звеньев LNA и которые, в частности, содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида, и, между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК.

Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, а также их обычные производные. Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут также содержать модифицированные межнуклеотидные мостики, такие как фосфоротиоат или фосфородитиоат вместо фосфатных мостиков. Такие модификации могут присутствовать только в сегментах LNA или только в сегменте, который не является LNA, антисмыслового олигонуклеотида.

Таким образом, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322), CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327), ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332), GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337), CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322), CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327), ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332), GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337), CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Альтернативно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322), CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327), ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332), GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337), CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322), CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327), ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332), GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337), CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317), ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317) или ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности ACTGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 314), TGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 315), CTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 316), ACTGGTCCATTCA (SEQ. ID NO: 317) или ACTGGTCCATTCAT (SEQ. ID NO: 318) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322) или CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322) или CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322) или CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CTCCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 319), CCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 320), TCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 321), CTCCCTAAACACT (SEQ. ID NO: 322) или CTCCCTAAACACTA (SEQ. ID NO: 323) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327) или ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327) или ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327) или ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности ACACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 324), ACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 325), CACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 326), ACACTACCAAATA (SEQ. ID NO: 327) или ACACTACCAAATAG (SEQ. ID NO: 328) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332) или GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332) или GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332) или GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности GTGGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 329), GGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 330), TGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 331), GTGGACGCGTATC (SEQ. ID NO: 332) или GTGGACGCGTATCG (SEQ. ID NO: 333) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337) или CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337) или CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CGGTCTATGACG (SEQ. ID NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337) или CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CGGTCTATGACG (SEQ NO: 334), GTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 335), GGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 336), CGGTCTATGACGA (SEQ. ID NO: 337) или CGGTCTATGACGAG (SEQ. ID NO: 338) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, способную гибридизоваться с указанной последовательностью CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Другими словами, настоящее изобретение также относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов, и, по меньшей мере, четыре из 14-20, более предпочтительно 14-18 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343), и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную последовательности CTTTATTAATGC (SEQ. ID NO: 339), TTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 340), TTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 341), CTTTATTAATGCC (SEQ. ID NO: 342) или CTTTATTAATGCCT (SEQ. ID NO: 343) соответственно, и солям и оптическим изомерам указанного антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению предпочтительно содержат 4-11 звеньев LNA, более предпочтительно 4-10 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют собой звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и, более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и/или на 5'терминальном конце.

Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, а также их обычные производные. Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут также содержать модифицированные межнуклеотидные мостики, такие как фосфоротиоат или фосфородитиоат вместо фосфатных мостиков. Такие модификации могут присутствовать только в сегментах LNA или только в сегменте, который не является LNA, антисмыслового олигонуклеотида.

N¹ представляет: CATGGCAGACCCCGCTGCTC-, ATGGCAGACCCCGCTGCTC-, TGGCAGACCCCGCTGCTC-, GGCAGACCCCGCTGCTC-, GCAGACCCCGCTGCTC-, CAGACCCCGCTGCTC-, AGACCCCGCTGCTC-, GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-;

N² представляет: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC, -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCA, -CCGAGCCCCCAG, -CCGAGCCCCCAGC, -CCGAGCCCCCAGCG, -CCGAGCCCCCAGCGC, -CCGAGCCCCCAGCGCA, -CCGAGCCCCCAGCGCAG, -CCGAGCCCCCAGCGCAGC, -CCGAGCCCCCAGCGCAGCG или -CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG;

N³ представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGAT-, GTGGGATCGTGCTGGCGAT-, TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT,- TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGTGCAGCGGC, -ACAGGACGATGTGCAGCGG, -ACAGGACGATGTGCAGCG, -ACAGGACGATGTGCAGC, -ACAGGACGATGTGCAG, -ACAGGACGATGTGCA, -ACAGGACGATGTGC, -ACAGGACGATGTG, -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC, или -A;

N⁵ представляет: GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, AGCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, GCCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CTGCCCCAGAAGAGCTA-, TGCCCCAGAAGAGCTA-, GCCCCAGAAGAGCTA-, CCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, ТА- или A-;

N⁶ представляет: -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGG, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAG, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTC, -TGTTTAGGGAGCCGTCTT, -TGTTTAGGGAGCCGTCT, -TGTTTAGGGAGCCGTC, -TGTTTAGGGAGCCGT, -TGTTTAGGGAGCCG, -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -Т;

N⁷ представляет: TGAATCTTGAATATCTCATG-, GAATCTTGAATATCTCATG-, AATCTTGAATATCTCATG-, ATCTTGAATATCTCATG-, TCTTGAATATCTCATG-, CTTGAATATCTCATG-, TTGAATATCTCATG-, TGAATATCTCATG-, GAATATCTCATG-, AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-;

N⁸ представляет: -AGTATTCTAGAAACTCACCA, -AGTATTCTAGAAACTCACC, -AGTATTCTAGAAACTCAC, -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A;

N⁹ представляет: ATTCATATTTATATACAGGC-, TTCATATTTATATACAGGC-, TCATATTTATATACAGGC-, CATATTTATATACAGGC-, ATATTTATATACAGGC-, TATTTATATACAGGC-, ATTTATATACAGGC-, TTTATATACAGGC-, TTATATACAGGC-, TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или С-;

N¹⁰ представляет: -AGTGCAAATGTTATTGGCTA, -AGTGCAAATGTTATTGGCT, -AGTGCAAATGTTATTGGC, -AGTGCAAATGTTATTGG, -AGTGCAAATGTTATTG, -AGTGCAAATGTTATT, -AGTGCAAATGTTAT, -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A;

N¹¹ представляет: TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTAG-, GCCCCAGAAGAGCTATTTGGTAG-, CCCCAGAAGAGCTATTTGGTAG-, CCCAGAAGAGCTATTTGGTAG-, CCAGAAGAGCTATTTGGTAG-, CAGAAGAGCTATTTGGTAG-, AGAAGAGCTATTTGGTAG-, GAAGAGCTATTTGGTAG-, AAGAGCTATTTGGTAG-, AGAGCTATTTGGTAG-, GAGCTATTTGGTAG-, AGCTATTTGGTAG-, GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-,

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATC, -GAGCCGTCTTCAGGAAT, -GAGCCGTCTTCAGGAA, -GAGCCGTCTTCAGGA, -GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -Ga или -G;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Кроме того, настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью 5'-N¹-GTCATAGA-N²-3' (SEQ. ID NO: 12), где:

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S1 (SEQ ID NO:12) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и, более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и/или на терминальном 5'-конце.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые, в частности, содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида, и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида, и еще более предпочтительно содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин, гуанин, цитозин, тимин и урацил, а также их обычные производные, такие как 5-метилцитозин или 2-аминоаденин. Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут также содержать модифицированные межнуклеотидные мостики, такие как фосфоротиоат или фосфородитиоат вместо фосфатных мостиков. Такие модификации могут присутствовать только в сегментах LNA или только в сегменте, который не является LNA, антисмыслового олигонуклеотида. В качестве звеньев LNA, в частности, остатки b¹-b⁹, раскрытые здесь, являются особенно предпочтительными.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S1):

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

(SEQ. ID NO: 12)

где:

N² выбран из: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC, -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCA, -CCGAGCCCCCAG, -CCGAGCCCCCAGC, -CCGAGCCCCCAGCG, -CCGAGCCCCCAGCGC, -CCGAGCCCCCAGCGCA, -CCGAGCCCCCAGCGCAG, -CCGAGCCCCCAGCGCAGC, -CCGAGCCCCCAGCGCAGCG или -CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1) содержит 12-20 нуклеотидов, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S1):

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

где:

N¹ представляет: TGGCAGACCCCGCTGCTC-, GGCAGACCCCGCTGCTC-, GCAGACCCCGCTGCTC-, CAGACCCCGCTGCTC-, AGACCCCGCTGCTC-, GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; и

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S1):

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

где:

N¹ представляет: GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; и

N² выбран из: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC, -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCA, -CCGAGCCCCCAG или -CCGAGCCCCCAGC.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S1):

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

где:

N¹ представляет: CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; и

N² выбран из: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC или -CCGAGCCC.

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 12-24 нуклеотидов, и, по меньшей мере, три из 12-24 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N^1A-CGTCATAGAC-N^2A-3'

(SEQ. ID NO: 69)

где:

N^1A представляет: CATGGCAGACCCCGCTGCT-, ATGGCAGACCCCGCTGCT-, TGGCAGACCCCGCTGCT-, GGCAGACCCCGCTGCT-, GCAGACCCCGCTGCT-, CAGACCCCGCTGCT-, AGACCCCGCTGCT-, GACCCCGCTGCT-, ACCCCGCTGCT-, CCCCGCTGCT-, CCCGCTGCT-, CCGCTGCT-, CGCTGCT-, GCTGCT-, CTGCT-, TGCT-, GCT-, CT- или T-;

N^2A представляет: -C, -CG, -CGA, -CGAG, -CGAGC, -CGAGCC, -CGAGCCC, -CGAGCCCC, -CGAGCCCCC, -CGAGCCCCCA, -CGAGCCCCCAG, -CGAGCCCCCAGC, -CGAGCCCCCAGCG, -CGAGCCCCCAGCGC, -CGAGCCCCCAGCGCA, -CGAGCCCCCAGCGCAG, -CGAGCCCCCAGCGCAGC, -CGAGCCCCCAGCGCAGCG или -CGAGCCCCCAGCGCAGCGG;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^1A представляет: TGGCAGACCCCGCTGCT-, GGCAGACCCCGCTGCT-, GCAGACCCCGCTGCT-, CAGACCCCGCTGCT-, AGACCCCGCTGCT-, GACCCCGCTGCT-, ACCCCGCTGCT-, CCCCGCTGCT-, CCCGCTGCT-, CCGCTGCT-, CGCTGCT-, GCTGCT-, CTGCT-, TGCT-, GCT-, CT- или T-; и

Более предпочтительно N^1A представляет: GACCCCGCTGCT-, ACCCCGCTGCT-, CCCCGCTGCT-, CCCGCTGCT-, CCGCTGCT-, CGCTGCT-, GCTGCT-, CTGCT-, TGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^2A представляет: -C, -CG, -CGA, -CGAG, -CGAGC, -CGAGCC, -CGAGCCC, -CGAGCCCC, -CGAGCCCCC, -CGAGCCCCCA, -CGAGCCCCCAG или -CGAGCCCCCAGC.

Еще более предпочтительно N^1A представляет: CGCTGCT-, GCTGCT-, CTGCT-, TGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^2A представляет: -C, -CG, -CGA, -CGAG, -CGAGC, -CGAGCC или -CGAGCCC.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1A/SEQ. ID NO: 69) содержит 12-24 нуклеотида и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S1A) содержит 12-20 нуклеотидов, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

N³ представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGAT-, GTGGGATCGTGCTGGCGAT-, TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S2 (SEQ. ID NO: 98) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительные содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S2):

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

(SEQ. ID No: 98)

где:

N³ представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGAT-, GTGGGATCGTGCTGGCGAT-, TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S2):

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

где:

N³ представляет: TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-; и

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGTGCAGCG, -ACAGGACGATGTGCAGC, -ACAGGACGATGTGCAG, -ACAGGACGATGTGCA, -ACAGGACGATGTGC, -ACAGGACGATGTG, -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S2):

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

где:

N³ представляет: TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGTG, -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S2):

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

где:

N³ представляет: CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

N⁴ представляет: -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A

5'-N^3A-TACGCGTCCA-N^4A-3'

(SEQ. ID NO: 70)

где:

N^3A представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGA-, GTGGGATCGTGCTGGCGA-, TGGGATCGTGCTGGCGA-, GGGATCGTGCTGGCGA-, GGATCGTGCTGGCGA-, GATCGTGCTGGCGA-, ATCGTGCTGGCGA-, TCGTGCTGGCGA-, CGTGCTGGCGA-, GTGCTGGCGA-, TGCTGGCGA-, GCTGGCGA-, CTGGCGA-, TGGCGA-, GGCGA-, GCGA-, CGA-, GA- или A-;

N^4A представляет: -CAGGACGATGTGCAGCGGC, -CAGGACGATGTGCAGCGG, -CAGGACGATGTGCAGCG, -CAGGACGATGTGCAGC, -CAGGACGATGTGCAG, -CAGGACGATGTGCA, -CAGGACGATGTGC, -CAGGACGATGTG, -CAGGACGATGT, -CAGGACGATG, -CAGGACGAT, -CAGGACGA, -CAGGACG, -CAGGAC, -CAGGA, -CAGG, -CAG, -CA или -C;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^3A представляет: TGGGATCGTGCTGGCGA-, GGGATCGTGCTGGCGA-, GGATCGTGCTGGCGA-, GATCGTGCTGGCGA-, ATCGTGCTGGCGA-, TCGTGCTGGCGA-, CGTGCTGGCGA-, GTGCTGGCGA-, TGCTGGCGA-, GCTGGCGA-, CTGGCGA-, TGGCGA-, GGCGA-, GCGA-, CGA-, GA- или A-; и

N^4A представляет: -CAGGACGATGTGCAGCG, -CAGGACGATGTGCAGC, -CAGGACGATGTGCAG, -CAGGACGATGTGCA, -CAGGACGATGTGC, -CAGGACGATGTG, -CAGGACGATGT, -CAGGACGATG, -CAGGACGAT, -CAGGACGA, -CAGGACG, -CAGGAC, -CAGGA, -CAGG, -CAG, -CA или -C.

Более предпочтительно N^3A представляет: TCGTGCTGGCGA-, CGTGCTGGCGA-, GTGCTGGCGA-, TGCTGGCGA-, GCTGGCGA-, CTGGCGA-, TGGCGA-, GGCGA-, GCGA-, CGA-, GA- или A-; и

N^4A представляет: -CAGGACGATGTG, -CAGGACGATGT, -CAGGACGATG, -CAGGACGAT, -CAGGACGA, -CAGGACG, -CAGGAC, -CAGGA, -CAGG, -CAG, -CA или -C.

Еще более предпочтительно N^3A представляет: CTGGCGA-, TGGCGA-, GGCGA-, GCGA-, -CAG, -CA или -C; и

N^4A представляет: -CAGGACG, -CAGGAC, -CAGGA, -CAGG, -CAG, -CA или -C.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2A/SEQ. ID NO: 70) содержит 12-24 нуклеотида и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S2A) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S3 (SEQ. ID NO: 10) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительно содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S3):

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

(SEQ. ID No: 10)

где:

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S3):

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

где:

N¹¹ представляет: AGAAGAGCTATTTGGTAG-, GAAGAGCTATTTGGTAG-, AAGAGCTATTTGGTAG-, AGAGCTATTTGGTAG-, GAGCTATTTGGTAG-, AGCTATTTGGTAG-, GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; и

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGAATC, -GAGCCGTCTTCAGGAAT, -GAGCCGTCTTCAGGAA, -GAGCCGTCTTCAGGA, -GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S3):

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

где:

N¹¹ представляет: AGCTATTTGGTAG-, GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; и

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S3):

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

где:

N¹¹ представляет: TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; и

N¹² представляет: -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G.

N^11A представляет: TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTA-, GCCCCAGAAGAGCTATTTGGTA-, CCCCAGAAGAGCTATTTGGTA-, CCCAGAAGAGCTATTTGGTA-, CCAGAAGAGCTATTTGGTA-, CAGAAGAGCTATTTGGTA- AGAAGAGCTATTTGGTA-, GAAGAGCTATTTGGTA-, AAGAGCTATTTGGTA-, AGAGCTATTTGGTA-, GAGCTATTTGGTA-, AGCTATTTGGTA-, GCTATTTGGTA-, CTATTTGGTA-, TATTTGGTA-, ATTTGGTA-, TTTGGTA-, TTGGTA-, TGGTA-, GGTA-, GTA-, TA- или A-;

N^12A представляет: -AGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC, -AGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC, -AGCCGTCTTCAGGAATCTTCT, -AGCCGTCTTCAGGAATCTTC, -AGCCGTCTTCAGGAATCTT, -AGCCGTCTTCAGGAATCT, -AGCCGTCTTCAGGAATC, -AGCCGTCTTCAGGAAT, -AGCCGTCTTCAGGAA, -AGCCGTCTTCAGGA, -AGCCGTCTTCAGG, -AGCCGTCTTCAG, -AGCCGTCTTCA, -AGCCGTCTTC, -AGCCGTCTT, -AGCCGTCT, -AGCCGTC, -AGCCGT, -AGCCG, -AGCC, -AGC, -AG или -A;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^11A представляет: AGAAGAGCTATTTGGTA-, GAAGAGCTATTTGGTA-, AAGAGCTATTTGGTA-, AGAGCTATTTGGTA-, GAGCTATTTGGTA-, AGCTATTTGGTA-, GCTATTTGGTA-, CTATTTGGTA-, TATTTGGTA-, ATTTGGTA-, TTTGGTA-, TTGGTA-, TGGTA-, GGTA-, GTA-, TA- или A-; и

N^12A представляет: -AGCCGTCTTCAGGAATC, -AGCCGTCTTCAGGAAT, -AGCCGTCTTCAGGAA, -AGCCGTCTTCAGGA, -AGCCGTCTTCAGG, -AGCCGTCTTCAG, -AGCCGTCTTCA, -AGCCGTCTTC, -AGCCGTCTT, -AGCCGTCT, -AGCCGTC, -AGCCGT, -AGCCG, -AGCC, -AGC, -AG или -A.

Более предпочтительно N^11A представляет: AGCTATTTGGTA-, GCTATTTGGTA-, CTATTTGGTA-, TATTTGGTA-, ATTTGGTA-, TTTGGTA-, TTGGTA-, TGGTA-, GGTA-, GTA-, TA- или A-; и

N^12A представляет: -AGCCGTCTTCAG, -AGCCGTCTTCA, -AGCCGTCTTC, -AGCCGTCTT, -AGCCGTCT, -AGCCGTC, -AGCCGT, -AGCCG, -AGCC, -AGC, -AG или -A.

Еще более предпочтительно N^11A представляет: TTTGGTA-, TTGGTA-, TGGTA-, GGTA-, GTA-, TA- или A-; и

N^12A представляет: -AGCCGTC, -AGCCGT, -AGCCG, -AGCC, -AGC, -AG или -A.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3A/SEQ. ID NO: 71) содержит 12-24 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S3A) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S4 (SEQ. ID NO: 11) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, два звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительные содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S4):

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

(SEQ. ID No: 11)

где:

N⁶ выбран из: -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGG, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAG, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTCA, -TGTTTAGGGAGCCGTCTTC, -TGTTTAGGGAGCCGTCTT, -TGTTTAGGGAGCCGTCT, -TGTTTAGGGAGCCGTC, -TGTTTAGGGAGCCGT, -TGTTTAGGGAGCCG, -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S4):

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

где:

N⁵ представляет: CCTGCCCCAGAAGAGCTA-, CTGCCCCAGAAGAGCTA-, TGCCCCAGAAGAGCTA-, GCCCCAGAAGAGCTA-, CCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

N⁶ выбран из: -TGTTTAGGGAGCCGTCTT, -TGTTTAGGGAGCCGTCT, -TGTTTAGGGAGCCGTC, -TGTTTAGGGAGCCGT, -TGTTTAGGGAGCCG, -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S4):

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

где:

N⁵ представляет: CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

N⁶ выбран из: -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S4):

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

где:

N⁵ представляет: AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

N⁶ выбран из: -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T.

N^5A представляет: GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCT-, CCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCT-, CCAGCCTGCCCCAGAAGAGCT-, CAGCCTGCCCCAGAAGAGCT-, AGCCTGCCCCAGAAGAGCT-, GCCTGCCCCAGAAGAGCT-, CCTGCCCCAGAAGAGCT-, CTGCCCCAGAAGAGCT-, TGCCCCAGAAGAGCT-, GCCCCAGAAGAGCT-, CCCCAGAAGAGCT-, CCCAGAAGAGCT-, CCAGAAGAGCT-, CAGAAGAGCT-, AGAAGAGCT-, GAAGAGCT-, AAGAGCT-, AGAGCT-, GAGCT-, AGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^6A представляет: -GTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA, -GTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGA, -GTTTAGGGAGCCGTCTTCAGG, -GTTTAGGGAGCCGTCTTCAG, -GTTTAGGGAGCCGTCTTCA, -GTTTAGGGAGCCGTCTTC, -GTTTAGGGAGCCGTCTT, -GTTTAGGGAGCCGTCT, -GTTTAGGGAGCCGTC, -GTTTAGGGAGCCGT, -GTTTAGGGAGCCG, -GTTTAGGGAGCC, -GTTTAGGGAGC, -GTTTAGGGAG, -GTTTAGGGA, -GTTTAGGG, -GTTTAGG, -GTTTAG, -GTTTA, -GTTT, -GTT, -GT или -G;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^5A представляет: CCTGCCCCAGAAGAGCT-, CTGCCCCAGAAGAGCT-, TGCCCCAGAAGAGCT-, GCCCCAGAAGAGCT-, CCCCAGAAGAGCT-, CCCAGAAGAGCT-, CCAGAAGAGCT-, CAGAAGAGCT-, AGAAGAGCT-, GAAGAGCT-, AAGAGCT-, AGAGCT-, GAGCT-, AGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^6A представляет: -GTTTAGGGAGCCGTCTT, -GTTTAGGGAGCCGTCT, -GTTTAGGGAGCCGTC, -GTTTAGGGAGCCGT, -GTTTAGGGAGCCG, -GTTTAGGGAGCC, -GTTTAGGGAGC, -GTTTAGGGAG, -GTTTAGGGA, -GTTTAGGG, -GTTTAGG, -GTTTAG, -GTTTA, -GTTT, -GTT, -GT или -G.

Более предпочтительно N^5A представляет: CCCAGAAGAGCT-, CCAGAAGAGCT-, CAGAAGAGCT-, AGAAGAGCT-, GAAGAGCT-, AAGAGCT-, AGAGCT-, GAGCT-, AGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^6A представляет: -GTTTAGGGAGCC, -GTTTAGGGAGC, -GTTTAGGGAG, -GTTTAGGGA, -GTTTAGGG, -GTTTAGG, -GTTTAG, -GTTTA, -GTTT, -GTT, -GT или -G.

Еще более предпочтительно N^5A представляет: AAGAGCT-, AGAGCT-, GAGCT-, AGCT-, GCT-, CT- или T-; и

N^6A представляет: -GTTTAGG, -GTTTAG, -GTTTA, -GTTT, -GTT, -GT или -G.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4/SEQ. ID NO: 72) содержит 12-24 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S4) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

N⁸ представляет: -AGTATTCTAGAAACTCACCA, -AGTATTCTAGAAACTCACC, -AGTATTCTAGAAACTCAC, -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S6 (SEQ. ID NO: 100) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, две звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительно содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S6):

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

(SEQ. ID No: 100)

где:

N⁸ выбран из: -AGTATTCTAGAAACTCACCA, -AGTATTCTAGAAACTCACC, --AGTATTCTAGAAACTCAC, -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S6):

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

где:

N⁷ представляет: AATCTTGAATATCTCATG-, ATCTTGAATATCTCATG-, TCTTGAATATCTCATG-, CTTGAATATCTCATG-, TTGAATATCTCATG-, TGAATATCTCATG-, GAATATCTCATG-, AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; и

N⁸ выбран из: -AGTATTCTAGAAACTCAC, -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S6):

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

где:

N⁷ представляет: TGAATATCTCATG-, GAATATCTCATG-, AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; и

N⁸ выбран из: -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S6):

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

где:

N⁷ представляет: ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; и

N⁸ выбран из: -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A.

5'-N^7A-GAATGGACCA-N^8A-3'

(SEQ. ID NO: 73)

где:

N^7A представляет: TGAATCTTGAATATCTCAT-, GAATCTTGAATATCTCAT-, AATCTTGAATATCTCAT-, ATCTTGAATATCTCAT-, TCTTGAATATCTCAT-, CTTGAATATCTCAT-, TTGAATATCTCAT-, TGAATATCTCAT-, GAATATCTCAT-, AATATCTCAT-, ATATCTCAT-, TATCTCAT-, ATCTCAT-, TCTCAT-, CTCAT-, TCAT-, CAT-, AT- или T-;

N^8A представляет: -GTATTCTAGAAACTCACCA, -GTATTCTAGAAACTCACC, -GTATTCTAGAAACTCAC, -GTATTCTAGAAACTCA, -GTATTCTAGAAACTC, -GTATTCTAGAAACT, -GTATTCTAGAAAC, -GTATTCTAGAAA, -GTATTCTAGAA, -GTATTCTAGA, -GTATTCTAG, -GTATTCTA, -GTATTCT, -GTATTC, -GTATT, -GTAT, -GTA, -GT или -G;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^7A представляет: AATCTTGAATATCTCAT-, ATCTTGAATATCTCAT-, TCTTGAATATCTCAT-, CTTGAATATCTCAT-, TTGAATATCTCAT-, TGAATATCTCAT-, GAATATCTCAT-, AATATCTCAT-, ATATCTCAT-, TATCTCAT-, ATCTCAT-, TCTCAT-, CTCAT-, TCAT-, CAT-, AT- или T-; и

N^8A представляет: -GTATTCTAGAAACTCAC, -GTATTCTAGAAACTCA, -GTATTCTAGAAACTC, -GTATTCTAGAAACT, -GTATTCTAGAAAC, -GTATTCTAGAAA, -GTATTCTAGAA, -GTATTCTAGA, -GTATTCTAG, -GTATTCTA, -GTATTCT, -GTATTC, -GTATT, -GTAT, -GTA, -GT или -G.

Более предпочтительно N^7A представляет: TGAATATCTCAT-, GAATATCTCAT-, AATATCTCAT-, ATATCTCAT-, TATCTCAT-, ATCTCAT-, TCTCAT-, CTCAT-, TCAT-, CAT-, AT- или T-; и

N^8A представляет: -GTATTCTAGAAA, -GTATTCTAGAA, -GTATTCTAGA, -GTATTCTAG, -GTATTCTA, -GTATTCT, -GTATTC, -GTATT, -GTAT, -GTA, -GT или -G.

Еще более предпочтительно N^7A представляет: ATCTCAT-, TCTCAT-, CTCAT-, TCAT-, CAT-, AT- или T-; и

N^8A представляет: -GTATTCT, -GTATTC, -GTATT, -GTAT, -GTA, -GT или -G.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6А/SEQ. ID NO: 73) содержит 12-24 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S6A) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S7 (SEQ. ID NO: 101) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, две звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительно содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S7):

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

(SEQ. ID No: 101)

где:

N¹⁰ выбран из: -AGTGCAAATGTTATTGGCTA, -AGTGCAAATGTTATTGGCT, -AGTGCAAATGTTATTGGC, -AGTGCAAATGTTATTGG, -AGTGCAAATGTTATTG, -AGTGCAAATGTTATT, -AGTGCAAATGTTAT, -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S7):

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

где:

N ⁹ представляет: TCATATTTATATACAGGC-, CATATTTATATACAGGC-, ATATTTATATACAGGC-, TATTTATATACAGGC-, ATTTATATACAGGC-, TTTATATACAGGC-, TTATATACAGGC-, TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; и

N¹⁰ выбран из: -AGTGCAAATGTTATTGGC, -AGTGCAAATGTTATTGG, -AGTGCAAATGTTATTG, -AGTGCAAATGTTATT, -AGTGCAAATGTTAT, -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S7):

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

где:

N⁹ представляет: TTTATATACAGGC-, TTATATACAGGC-, TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; и

N¹⁰ выбран из: -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S7):

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

где:

N⁹ представляет:: ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; и

N¹⁰ выбран из: -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A.

5'-N^9A-CATTAATAAA-N^10A-3'

(SEQ. ID NO: 74)

где:

N^9A представляет: ATTCATATTTATATACAGG-, TTCATATTTATATACAGG-, TCATATTTATATACAGG-, CATATTTATATACAGG-, ATATTTATATACAGG-, TATTTATATACAGG-, ATTTATATACAGG-, TTTATATACAGG-, TTATATACAGG-, TATATACAGG-, ATATACAGG-, TATACAGG-, ATACAGG-, TACAGG-, ACAGG-, CAGG-, AGG-, GG- или G-;

N^10A представляет: -GTGCAAATGTTATTGGCTA, -GTGCAAATGTTATTGGCT, -GTGCAAATGTTATTGGC, -GTGCAAATGTTATTGG, -GTGCAAATGTTATTG, -GTGCAAATGTTATT, -GTGCAAATGTTAT, -GTGCAAATGTTA, -GTGCAAATGTT, -GTGCAAATGT, -GTGCAAATG, -GTGCAAAT, -GTGCAAA, -GTGCAA, -GTGCA, -GTGC, -GTG, -GT или -G;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Предпочтительно N^9A представляет: TCATATTTATATACAGG-, CATATTTATATACAGG-, ATATTTATATACAGG-, TATTTATATACAGG-, ATTTATATACAGG-, TTTATATACAGG-, TTATATACAGG-, TATATACAGG-, ATATACAGG-, TATACAGG-, ATACAGG-, TACAGG-, ACAGG-, CAGG-, AGG-, GG- или G-; и

Более предпочтительно N^9A представляет: TTTATATACAGG-, TTATATACAGG-, TATATACAGG-, ATATACAGG-, TATACAGG-, ATACAGG-, TACAGG-, ACAGG-, CAGG-, AGG-, GG- или G-; и

N^10A представляет: -GTGCAAATGTTA, -GTGCAAATGTT, -GTGCAAATGT, -GTGCAAATG, -GTGCAAAT, -GTGCAAA, -GTGCAA, -GTGCA, -GTGC, -GTG, -GT или -G.

Еще более предпочтительно N^9A представляет: ATACAGG-, TACAGG-, ACAGG-, CAGG-, AGG-, GG- или G-; и

N^10A представляет: -GTGCAAA, -GTGCAA, -GTGCA, -GTGC, -GTG, -GT или -G.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7A/SEQ. ID NO: 74) содержит 12-24 нуклеотида и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7A) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S7А) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), состоящему из 8-18, предпочтительно 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 8-28, предпочтительно 10-28 нуклеотидов, представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

(SEQ. ID NO: 99)

где:

N¹³ представляет: CCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CAGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, AGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, GCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, TGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, GCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCCAGAAGAGCTATTTG-, CCAGAAGAGCTATTTG-, CAGAAGAGCTATTTG-, AGAAGAGCTATTTG-, GAAGAGCTATTTG-, AAGAGCTATTTG-, AGAGCTATTTG-, GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-;

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTTCT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTTC, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATC, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAAT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAA, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGA, -TAGGGAGCCGTCTTCAGG, -TAGGGAGCCGTCTTCAG, -TAGGGAGCCGTCTTCA, -TAGGGAGCCGTCTTC, -TAGGGAGCCGTCTT, -TAGGGAGCCGTCT, -TAGGGAGCCGTC, -TAGGGAGCCGT, -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T;

m равно 0 или 1;

n равно 0 или 1;

и n+m=1 или 2;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Антисмысловые олигонуклеотиды общей формулы S5 (SEQ. ID NO: 99) предпочтительно содержат 2-10 звеньев LNA, более предпочтительно 3-9 звеньев LNA и еще более предпочтительно 4-8 звеньев LNA и также предпочтительно, по меньшей мере, 6 звеньев, которые не являются LNA, более предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно 8 звеньев, которые не являются LNA. Звенья, которые не являются LNA, предпочтительно представляют звенья ДНК. Звенья LNA предпочтительно расположены на терминальном 3'-конце (также называемом 3'-концом) и терминальном 5'-конце (также называемом 5'-концом). Предпочтительно, по меньшей мере, одно и более предпочтительно, по меньшей мере, две звена LNA находятся на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, обозначенные как гапмеры, которые содержат 2-10 звеньев LNA и которые предпочтительно содержат 1-5 звеньев LNA на терминальном 5'-конце, и 1-5 звеньев LNA на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида и между звеньями LNA, по меньшей мере, 7 и более предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев ДНК. Более предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат 2-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 2-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и еще более предпочтительно содержат 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и содержат предпочтительно, по меньшей мере, 7 звеньев, которые не являются LNA, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: GCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CTGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, TGCCCCAGAAGAGCTATTTG-, GCCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCCAGAAGAGCTATTTG-, CCAGAAGAGCTATTTG-, CAGAAGAGCTATTTG-, AGAAGAGCTATTTG-, GAAGAGCTATTTG-, AAGAGCTATTTG-, AGAGCTATTTG-, GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCGTCTTC, -TAGGGAGCCGTCTT, -TAGGGAGCCGTCT, -TAGGGAGCCGTC, -TAGGGAGCCGT, -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5) содержит 10-28 нуклеотидов и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5) содержит 11-24 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце. Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: CCCCAGAAGAGCTATTTG-, CCCAGAAGAGCTATTTG-, CCAGAAGAGCTATTTG-, CAGAAGAGCTATTTG-, AGAAGAGCTATTTG-, GAAGAGCTATTTG-, AAGAGCTATTTG-, AGAGCTATTTG-, GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: GAAGAGCTATTTG-, AAGAGCTATTTG-, AGAGCTATTTG-, GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: CAGAAGAGCTATTTG-, AGAAGAGCTATTTG-, GAAGAGCTATTTG-, AAGAGCTATTTG-, AGAGCTATTTG-, GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATC, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAAT, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGAA, -TAGGGAGCCGTCTTCAGGA, -TAGGGAGCCGTCTTCAGG, -TAGGGAGCCGTCTTCAG, -TAGGGAGCCGTCTTCA, -TAGGGAGCCGTCTTC, -TAGGGAGCCGTCTT, -TAGGGAGCCGTCT, -TAGGGAGCCGTC, -TAGGGAGCCGT, -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: GAGCTATTTG-, AGCTATTTG-, GCTATTTG-, CTATTTG-, TATTTG-, ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCGTCTTCAGG, -TAGGGAGCCGTCTTCAG, -TAGGGAGCCGTCTTCA, -TAGGGAGCCGTCTTC, -TAGGGAGCCGTCTT, -TAGGGAGCCGTCT, -TAGGGAGCCGTC, -TAGGGAGCCGT, -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Также предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды формулы (S5):

5'-(N¹³)_m-GTAGTGTT-(N¹⁴)_n-3'

где:

N¹³ представляет: ATTTG-, TTTG-, TTG-, TG- или G-; и

N¹⁴ выбран из: -TAGGGAGCCGTCT, -TAGGGAGCCGTC, -TAGGGAGCCGT, -TAGGGAGCCG, -TAGGGAGCC, -TAGGGAGC, -TAGGGAG, -TAGGGA, -TAGGG, -TAGG, -TAG, -TA или -T; и

m равно 0 или 1; n равно 0 или 1; и n+m=1 или 2.

Предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5/SEQ. ID NO: 99) содержит 12-24 нуклеотида и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, один нуклеотид LNA на 5'-конце. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)».

Более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5) содержит 12-22 нуклеотида и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, два нуклеотида LNA на 5'-конце.

Еще более предпочтительно антисмысловой олигонуклеотид общей формулы (S5) содержит 12-20, более предпочтительно 13-19 и еще более предпочтительно 14-18 нуклеотидов и, 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды представляют гапмеры формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. Предпочтительно антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания».

Еще один аспект настоящего изобретения относится к антисмысловому олигонуклеотиду(ам), имеющему длину из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 10-24 нуклеотидов, более предпочтительно 11-22 нуклеотидов, или 12-20 нуклеотидов, еще более предпочтительно 13-19 нуклеотидов и наиболее предпочтительно 14-18 нуклеотидов, где, по меньшей мере, два из нуклеотидов, предпочтительно, по меньшей мере, три из нуклеотидов, и более предпочтительно, по меньшей мере, четыре из нуклеотидов представляют LNA, и последовательность антисмыслового олигонуклеотида из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 10-24 нуклеотидов, более предпочтительно 11-22 нуклеотидов, или 12-20 нуклеотидов, еще более предпочтительно 13-19 нуклеотидов и наиболее предпочтительно 14-18 нуклеотидов выбрана из группы последовательностей из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 10-24 нуклеотидов, более предпочтительно 11-22 нуклеотидов, или 12-20 нуклеотидов, еще более предпочтительно 13-19 нуклеотидов и наиболее предпочтительно 14-18 нуклеотидов, входящих в состав последовательности, выбранной из следующей группы:

GAATCTTGAATATCTCATGAATGGACCAGTATTCTAGAAAC

(SEQ. ID NO. 75: 383-423 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

TTCATATTTATATACAGGCATTAATAAAGTGCAAATGTTAT

(SEQ. ID NO. 77: 2245-2285 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

TGAGGAAGTGCTAACACAGCTTATCCTATGACAATGTCAAAG

(SEQ. ID NO. 78: 2315-2356 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

GCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTAGTGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGG

(SEQ. ID NO. 79: 2528-2576 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CGCAGGTCCTCCCAGCTGATGACATGCCGCGTCAGGTACTCCTGTAGGT

(SEQ. ID NO. 81: 3205-3253 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

ATGTCGTTATTAACCGACTTCTGAACGTGCGGTGGGATCGTGCTGGCGATACGCGTCCACAGGA

CGATGTGCAGCGGC

(SEQ. ID NO. 83: 4141-4218 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

GGCCACAGGCCCCTGAGCAGCCCCCGACCCATGGCAGACCCCGCTGCTCGTCATAGACCGAGC

CCCCAGCGCAG

(SEQ. ID NO. 84: 4216-4289 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

ATGTCGTTATTAACCGACTTCTGAACGTGCGGTGGGATCGTGCTGGCGATACGCGTCCACAGGA

CGATGTGCAGCGGCCACAGGCCCCTGAGCAGCCCCCGACCCATGGCAGACCCCGCTGCTCGTC

ATAGACCGAGCCCCCAGCGCAG

(SEQ. ID NO. 86: 4141-4289 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

TTGAATATCTCATGAATGGACCAGTATTCTA

(SEQ. ID NO. 87: 388-418 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CAAGTGGAATTTCTAGGCGCCTCTATGCTACTG

(SEQ. ID NO. 88: 483-515 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

ATTTATATACAGGCATTAATAAAGTGCAAAT

(SEQ. ID NO. 89: 2250-2280 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

AAGTGCTAACACAGCTTATCCTATGACAATGT

(SEQ. ID NO. 90: 2320-2351 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CCCCAGAAGAGCTATTTGGTAGTGTTTAGGGAGCCGTCT

(SEQ. ID NO. 91: 2533-2571 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CTGGTCGCCCTCGATCTCTCAACACGTTGTCCTTCATGCTTTCGACACAGGGGTGCTCCCGCAC

CTTGGAACCAAATG

(SEQ. ID NO. 92: 2753-2830 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

GTCCTCCCAGCTGATGACATGCCGCGTCAGGTACTCCTG

(SEQ. ID NO. 93: 3210-3248 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CTCAGCTTCTGCTGCCGGTTAACGCGGTAGCAGTAGAAGA

(SEQ. ID NO. 94: 3655-3694 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

GTTATTAACCGACTTCTGAACGTGCGGTGGGATCGTGCTGGCGATACGCGTCCACAGGACGATGTGCA

(SEQ. ID NO. 95: 4146-4213 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CAGGCCCCTGAGCAGCCCCCGACCCATGGCAGACCCCGCTGCTCGTCATAGACCGAGCCCCCAG

(SEQ. ID NO. 96: 4221-4284 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

CACGCGCGGGGGTGTCGTCGCTCCGTGCGCGCGAGTGACTCACTCAACTTCA

(SEQ. ID NO. 97: 4495-4546 в последовательности SEQ. ID NO: 1),

где антисмысловой олигонуклеотид способен избирательно гибридизоваться, по отношению ко всему транскриптому человека, только с геном, кодирующим TGF-R_II, или с мРНК, кодирующей TGF-R_II, и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Указанный антисмысловой олигонуклеотид, имеющий последовательность, входящую в состав последовательностей № 75, 77, 78, 79, 81, 83, 84, 86-97, содержит 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 3'-конце, и 2-5, предпочтительно 3-5 и более предпочтительно 3-4 звена LNA на терминальном 5'-конце, и предпочтительно имеют структуру гапмеров формы LNA-сегмент A-сегмент ДНК-LNA-сегмент B. В качестве нуклеотидов LNA (звеньев LNA) подходящими, в частности, являются таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно в разделе «Предпочтительные LNA», и в качестве межнуклеотидных мостиков подходящими являются, в частности, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Предпочтительно указанные антисмысловые олигонуклеотиды содержат, по меньшей мере, 6, более предпочтительно, по меньшей мере, 7, и наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 8 звеньев, которые не являются LNA, таких как звенья ДНК, между двумя сегментами LNA. Подходящие азотистые основания для звеньев, которые не являются LNA, и звеньев LNA описаны в разделе «Азотистые основания». Подходящие примеры указанных антисмысловых олигонуклеотидов представлены формулами (S1)-(S7), (S1A)-(S4A), (S6A) и (S7A).

SEQ. ID NO: 1 представляет антисмысловую цепь кДНК (кДНК) (5'-3' антисмысловую последовательность) рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (TGF-R_II), вариант транскрипта 2.

SEQ. ID NO: 2 представляет смысловую цепь кДНК (кДНК) (5'-3' смысловую последовательность) рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (70/80 кДа) (TGF-R_II), вариант транскрипта 2. Альтернативно также можно рассматривать последовательность SEQ. ID NO: 2, как представляющую последовательность мРНК рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (TGF-R_II), вариант транскрипта 2 (SEQ. ID NO: 3), но представленной в коде ДНК, т.е. представленной в коде G, C, A, T, а не в коде РНК.

SEQ. ID NO: 3 представляет мРНК (5'-3' смысловую последовательность) рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (TGF-R_II), вариант транскрипта 2. Очевидно, что мРНК, показанная в SEQ. ID NO: 3, представлена в коде РНК, т.е. представлена в коде G, C, A, U.

Очевидно, понятно, что «кодирующая цепь ДНК», как здесь используется, относится к цепи ДНК, которая идентична мРНК (за исключением того, что представлена в коде ДНК), и которая включает кодоны, используемые для трансляции белка. Она не используется в качестве матрицы для транскрипции в мРНК. Таким образом, термины «кодирующая цепь ДНК», «смысловая цепь ДНК» и «нематричная цепь ДНК» могут быть использованы взаимозаменяемо. Кроме того, как здесь используется, термин «некодирующая цепь ДНК» относится к цепи ДНК, комплементарной «кодирующей цепи ДНК», и служит в качестве матрицы для транскрипции мРНК. Таким образом, термины «некодирующая цепь ДНК», «антисмысловая цепь ДНК» и «матричная цепь ДНК» могут быть использованы взаимозаменяемо.

Термин «антисмысловой олигонуклеотид» относится к олигомеру или полимеру рибонуклеиновой кислоты (РНК) или дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) или их миметикам, или вариантам, таким как антисмысловые олигонуклеотиды, имеющие измененную межнуклеотидную связь, такую как фосфортиоатная связь, и/или одно или более модифицированных азотистых оснований, таких как 5-метилцитозин, и/или одну или более модифицированных нуклеотидных звеньев, таких как LNA, например, β-D-окси-LNA. Термин «антисмысловой олигонуклеотид» включает олигонуклеотиды, состоящие из встречающихся в природе азотистых оснований, сахаров и ковалентных межнуклеотидных (остовных) связей, а также олигонуклеотиды, имеющие не встречающиеся в природе фрагменты, которые функционируют аналогично. Такие модифицированные или замещенные олигонуклеотиды часто являются предпочтительными по сравнению с нативными формами за счет наличия желаемых свойств, например, таких как повышенное поглощения клетками, повышенная аффинность для нуклеиновой кислоты-мишени и повышенная стабильность в присутствии нуклеаз. Антисмысловые олигонуклеотиды представляют короткие каталитические РНК или каталитические олигонуклеотиды, которые гибридизуются с нуклеиновой кислотой-мишенью и ингибируют ее экспрессию.

Термин «нуклеозид» хорошо известен специалистам в данной области и относится к пентозной сахарной группе, такой как рибоза, дезоксирибоза или модифицированная или замкнутая рибоза или модифицированная или замкнутая дезоксирибоза, такая как LNA, которые подробно описаны ниже. Азотистое основание связано с гликозидным атомом углерода (положение 1' пентозы), и межнуклеотидная связь образуется между атомом кислорода или серы в положении 3', и предпочтительно атомом кислорода в положении 3' нуклеозида и атомом кислорода или серы в положении 5' и предпочтительно атомом кислорода в положении 5' соседнего нуклеозида, в то время как межнуклеотидная связь отсутствует в нуклеозиде (смотри фиг. 2).

Термин «нуклеотид» хорошо известен специалистам в данной области и относится к пентозной сахарной группе, такой как рибоза, дезоксирибоза или модифицированная или замкнутая рибоза или модифицированная или замкнутая дезоксирибоза, такая как LNA, которые подробно описаны ниже. Азотистое основание связано с гликозидным атомом углерода (положение 1' пентозы), и межнуклеотидная связь образуется между атомом кислорода или серы в положении 3', и предпочтительно атомом кислорода в положении 3' нуклеотида и атомом кислорода или серы в положении 5' и предпочтительно атомом кислорода в положении 5' соседнего нуклеотида, в то время как межнуклеотидная связь является частью нуклеотида (смотри фиг. 2).

Азотистые основания

Термин «азотистое основание», сокращенно здесь как «В», и относится к пяти обычным азотистым основаниям аденину (А), тимину (Т), гуанину (G), цитозину (С) и урацилу (U), а также к их модификациям или аналогам, или аналогам, способным образовывать пары оснований согласно модели Уотсона-Крика с основаниями в комплементарной цепи. Модифицированные азотистые основания включают другие синтетические и природные азотистые основания, такие как 5-метилцитозин (С*), 5-гидроксиметилцитозин, N⁴-метилцитозин, ксантин, гипоксантин, 7-деазаксантин, 2-аминоаденин, 6-метиладенин, 6-метилгуанин, 6-этиладенин, 6-этилгуанин, 2-пропиладенин, 2-пропилгуанин, 6-карбоксиурацил, 5-галогенурацил, 5,6-дигидроурацил, 5-галогенцитозин, 5-пропинилурацил, 5-пропинилцитозин, 6-азаурацил, 6-азацитозин, 6-азатимин, 5-урацил (псевдоурацил), 4-тиоурацил, 8-фтораденин, 8-хлораденин, 8-бромаденин, 8-иодаденин, 8-аминоаденин, 8-тиоладенин, 8-тиоалкиладенин, 8-гидроксиаденин, 8-фторгуанин, 8-хлоргуанин, 8-бромгуанин, 8-иодгуанин, 8-аминогуанин, 8-тиолгуанин, 8-тиолалкилгуанин, 8-гидроксигуанин, 5-фторурацил, 5-бромурацил, 5-хлорурацил, 5-иодурацил, 5-трифторметилурацил, 5-фторцитозин, 5-бромцитозин, 5-хлорцитозин, 5-иодцитозин, 5-трифторметилцитозин, 7-метилгуанин, 7-метиладенин, 8-азагуанин, 8-азааденин, 7-деазагуанин, 7-деазааденин, 7-деаза-8-азааденин, 3-деазагуанин, 3-деазааденин, 2-тиоурацил, 2-тиотимин и 2 тиоцитозин и т.д., где 5-метилцитозин и/или 2-аминоаденин являются предпочтительными, поскольку эти модификации, как было показано, повышают стабильность дуплекса нуклеиновой кислоты.

Предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут содержать аналоги азотистых оснований. Азотистое основание только одного нуклеотидного звена антисмыслового олигонуклеотида может быть замещено аналогом азотистого основания, или два, три, четыре, пять или даже все азотистые основания в антисмысловом олигонуклеотиде могут быть замещены аналогами азотистых оснований, такими как 5-метилцитозин или N⁶-метиладенин, или 2-аминоаденин. Предпочтительно звенья LNA могут быть связаны с аналогами азотистых оснований, такими как 5-метилцитозин.

Следует иметь ввиду, что при обращении к последовательности нуклеотидов или мономеров, то, что называют, представляет собой последовательность оснований, таких как А, Т, G, C или U. Однако за исключением конкретных примеров, приведенных в таблицах 3-8, при представлении антисмысловых олигонуклеотидов буквенным кодом A, T, G, C и U следует понимать, что указанный антисмысловой олигонуклеотид может содержать любые азотистые основания, раскрытые здесь, любую 3'-концевую группу, раскрытую здесь, любую 5'-концевую группу, раскрытую здесь, и любую межнуклеотидную связь (также называемую межнуклеотидным мостиком), описанную здесь. Нуклеотиды А, Т, G, С и U также следует понимать как нуклеотиды LNA или нуклеотиды, которые не являются LNA, предпочтительно такие как нуклеотиды ДНК. Только в отношении конкретных примеров, приведенных в таблицах 4-9, азотистые основания, звенья LNA, звенья, которые не являются LNA, межнуклеотидные связи и концевые группы дополнительно определены, как указано в разделе «Список условных обозначений» перед таблицей 2.

Было доказано, что антисмысловые олигонуклеотиды, а также соли антисмысловых олигонуклеотидов, описанные здесь, являются комплементарными к мишени, которая представляет ген, кодирующий TGF-R_II, или мРНК, кодирующую TGF-R_II, т.е. гибридизуются достаточно эффективно и с достаточной специфичностью, и особенно избирательностью с получением желаемого ингибирующего эффекта.

Термин «соль» относится к физиологически и/или фармацевтически приемлемым солям антисмысловых олигонуклеотидов по настоящему изобретению. Антисмысловые олигонуклеотиды содержат азотистые основания, такие как аденин, гуанин, тимин, цитозин или их производные, которые являются основными соединениями и которые образуют соли, такие как хлорид или мезилат. Межнуклеотидная связь предпочтительно содержит отрицательно заряженный атом кислорода или серы, которые образуют соли, такие как соли натрия, лития или калия. Таким образом, фармацевтически приемлемые основно-аддитивные соли образованы неорганическими основаниями или органическими основаниями. Примеры подходящих органических и неорганических оснований представляют основания, полученные из ионов металлов, например, алюминия, ионов щелочных металлов, таких как натрий или калий, ионов щелочноземельных металлов, таких как кальций или магний, или иона аминной соли, или гидроксидов щелочных или щелочноземельных металлов, карбонатов или бикарбонатов. Примеры включают водный LiOH, NaOH, KOH, NH₄OH, карбонат калия, аммиак и бикарбонат натрия, соли аммония, первичные, вторичные и третичные амины, например, такие как гидроксид тетраалкиламмония, низшие алкиламины, такие как метиламин, трет-бутиламин, прокаин, этаноламин, арилалкиламины, такие как дибензиламин и N,N-дибензилэтилендиамин, низшие алкилпиперидины, такие как N-этилпиперидин, циклоалкиламины, такие как циклогексиламин или дициклогексиламин, морфолин, глюкамин, N-метил- и N,N-диметилглюкамин, 1-адамантиламин, бензатин или соли, полученные из аминокислот, таких как аргинин, лизин, орнитин, или амиды исходно нейтральных или кислых аминокислот, хлорпрокаин, холин, прокаин и тому подобное.

Поскольку антисмысловые олигонуклеотиды являются основными соединениями, то они образуют фармацевтически приемлемые соли с органическими и неорганическими кислотами. Примерами пригодных кислот для образования такой кислотно-аддитивной соли являются соляная кислота, бромистоводородная кислота, серная кислота, фосфорная кислота, уксусная кислота, лимонная кислота, щавелевая кислота, малоновая кислота, салициловая кислота, п-аминосалициловая кислота, яблочная кислота, фумаровая кислота, янтарная кислота, аскорбиновая кислота, малеиновая кислота, сульфоновая кислота, фосфоновая кислота, перхлорная кислота, азотная кислота, муравьиная кислота, пропионовая кислота, глюконовая кислота, молочная кислота, винная кислота, оксималеиновая кислота, пировиноградная кислота, фенилуксусная кислота, бензойная кислота, п-аминобензойная кислота, п-оксибензойная кислота, метансульфоновая кислота, этансульфоновая кислота, азотистая кислота, оксиэтансульфоновая кислота, этиленсульфоновая кислота, п-толуолсульфоновая кислота, нафтилсульфоновая кислота, сульфаниловая кислота, камфорсульфоновая кислота, хиновая кислота, миндальная кислота, о-метилминдальная кислота, гидроксибензолсульфоновая кислота, пикриновая кислота, адипиновая кислота, D-o-толилвинная кислота, тартроновая кислота, α-толуиловая кислота, (о,м,п)-толуиловая кислота, нафтиламинсульфоновая кислота, и другие минеральные или карбоновые кислоты, хорошо известные специалистам в данной области. Соли получают взаимодействием свободного основания с достаточным количеством требуемой кислоты с получением соли обычным способом.

В контексте настоящего изобретения термин «гибридизация» означает гибридизацию нуклеиновых кислот, где одноцепочечная нуклеиновая кислота (ДНК или РНК) взаимодействует с другой одноцепочечной нуклеиновой кислотой, имеющей очень сходную или даже комплементарную последовательность. Таким образом, взаимодействие происходит за счет образования водородных связей между определенными азотистыми основаниями (спаривания оснований).

Как здесь используется, термин «комплементарность» (комплементарность пары оснований ДНК и РНК) относится к способности к точному спариванию между двумя нуклеиновыми кислотами. Нуклеотиды в паре оснований комплементарны друг другу, когда их форма позволяет им связываться друг с другом водородными связями. В результате чего образуется пара аденина и тимидина (или урацила) посредством образования двух водородных связей, и образуется пара цитозин-гуанин посредством образования трех водородных связей. Как здесь используется, термин «комплементарные последовательности» означает последовательности ДНК или РНК, которые, когда они выравниваются антипараллельно друг к другу, то азотистые основания в каждом положении в последовательностях будут комплементарны, как если смотреть в зеркало и видеть оборотную сторону предметов.

Как здесь используется, термин «специфически гибридизуемый» указывает на достаточную степень комплементарности или точного спаривания оснований антисмыслового олигонуклеотида с последовательностью-мишенью таким образом, что происходит стабильное и специфическое связывание между антисмысловым олигонуклеотидом и ДНК- или РНК-мишенью. Последовательность антисмыслового олигонуклеотида по изобретению не должна быть на 100% комплементарной по отношению к его нуклеиновой кислоте-мишени, чтобы быть специфически гибридизуемой, хотя, 100% комплементарность является предпочтительной. При этом «100% комплементарность» означает, что антисмысловой олигонуклеотид гибридизуется с мишенью по ее всей или полной длине без ошибочного спаривания. Другими словами, в настоящем изобретении определено, что антисмысловое соединение является специфически гибридизуемым, когда связывание соединения с молекулой-мишенью ДНК или РНК происходит в физиологических или патологических условиях, а неспецифическое связывание антисмыслового олигонуклеотида с немишеневыми последовательностями весьма маловероятно или даже невозможно.

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловым олигонуклеотидам, где антисмысловые олигонуклеотиды связываются со 100% комплементарностью с мРНК, кодирующей TGF R_II, и не связываются с каким-либо другим участком в полном транскриптоме человека. Кроме того, предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловым олигонуклеотидам, где антисмысловые олигонуклеотиды обладают 100% комплементарностью по их полной длине с мРНК, кодирующей TGF R_II, и не обладают эффектами вне мишени. Альтернативно настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловым олигонуклеотидам, обладающим 100% комплементарностью по отношению к мРНК, кодирующей TGF R_II, но не обладает комплементарностью к другой мРНК транскриптома человека. Таким образом, термин «транскриптом человека» относится к полному набору транскриптов в человеческом организме, что означает транскрипты всех типов клеток и условий окружающей среды (в любой данный момент времени).

Специфичность

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению имеют общее свойство, заключающееся в том, что они специфичны в отношении участка, где они связываются с геном или с мРНК, кодирующей TGF-R_II. По настоящему изобретению предпочтительно, чтобы в человеческом транскриптоме антисмысловые олигонуклеотиды обладали 100% комплементарностью по их полной длине только с мРНК, кодирующей TGF-R_II. Кроме того, целью настоящего изобретения было найти антисмысловые олигонуклеотиды без перекрестной реактивности в пределах транскриптома млекопитающего, иного, чем обезьяны; в частности, антисмысловые олигонуклеотиды обладают только перекрестной реактивностью с транскриптомом человекообразных обезьян. Это позволит избежать проявления побочных эффектов. Таким образом, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению обладают высокой специфичностью в отношении гибридизации с геном или с мРНК, кодирующей TGF-R_II. Антисмысловые олигонуклеотиды по изобретению предпочтительно связываются по их полной длине со 100% комплементарностью, специфичной для гена, кодирующего TGF-R_II, или мРНК, кодирующей TGF-R_II, и не связываются с каким-либо другим участком во всем транскриптоме человека. Это означает, что антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению гибридизуются с мишенью (мРНК TGF-R_II) без ошибочного спаривания.

Как здесь используется, термин «мРНК может включать мРНК, содержащую интроны (также относится к пре-мРНК), и также мРНК, которая не содержит интронов.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению способны связываться или гибридизоваться с пре-мРНК и/или с мРНК. Это означает, что антисмысловые олигонуклеотиды могут связываться или гибридизоваться в области интрона или внутри области интрона пре-мРНК или могут связываться или гибридизоваться в перекрывающейся области интрон-экзон пре-мРНК или могут связываться или гибридизоваться в области экзона или внутри области экзона пре-мРНК и области экзона мРНК (см. фиг. 1). Предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды, которые способны связываться или гибридизоваться с пре-мРНК и мРНК. Связывание или гибридизация антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) с пре-мРНК ингибирует образование 5'-кэппа, ингибирует сплайсинг пре-мРНК для образования мРНК, и активирует РНКазу H, которая расщепляет пре-мРНК. Связывание или гибридизация антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) с мРНК активирует РНКазу H, которая расщепляет РНК и ингибирует связывание рибосомных субъединиц.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению содержат, по меньшей мере, 10 и не более 28, предпочтительно не более чем 24 и более предпочтительно не более чем 20 нуклеотидов и, следовательно, содержат 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 нуклеотидов, предпочтительно 11-20 или 11-19, или 12-19, или 13-19, или 13-18 нуклеотидов и более предпочтительно 14- 18 нуклеотидов, где, по меньшей мере, два, предпочтительно три из этих нуклеотидов представляют замкнутые нуклеиновые кислоты (LNA). Также возможны более короткие антисмысловые олигонуклеотиды, т.е. антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие менее 10 нуклеотидов, но чем короче антисмысловые олигонуклеотиды, тем выше риск, что гибридизация будет не достаточно сильной, и селективность будет снижаться или будет вовсе отсутствовать. Неселективные антисмысловые олигонуклеотиды несут риск связываться с нежелательными участками в человеческом транскриптоме и с нежелательными мРНК, кодирующими другие белки, чем TGF-R_II, тем самым вызывая нежелательные побочные эффекты. Также возможны более длинные антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие более чем 20 нуклеотидов, но дальнейшее увеличение длины делает синтез таких антисмысловых олигонуклеотидов еще более сложным и дорогостоящим, без какой-либо дополнительной пользы в отношении повышения селективности или силы гибридизации, или лучшей стабильности к деградации.

Таким образом, настоящее изобретение относится к антисмысловым олигонуклеотидам, состоящим из 10-20 нуклеотидов, где, по меньшей мере, два нуклеотида, и предпочтительно 3'- и 5'-концевых нуклеотида представляют LNA. Таким образом, предпочтительно, чтобы, по меньшей мере, 3'-концевой нуклеотид представлял LNA, и также, по меньшей мере, 5'-концевой нуклеотид представлял LNA. В том случае, если присутствует более чем 2 LNA, то предпочтительно, чтобы дополнительные LNA были связаны с 3'-или 5'-концевой LNA, как это имеет место в случае гапмеров, описанных здесь.

Один нуклеотидный строительный блок, присутствующий в антисмысловом олигонуклеотиде по настоящему изобретению, может быть представлен следующей общей формулой (B1) и (B2):

где:

В представляет азотистое основание;

IL' представляет -X''-Р(=Х')(X^-);

R представляет -Н, -F, -OH, -NH₂, -ОСН₃, -OCH₂CH₂OCH₃, и R^# представляет -Н;

или R и R^#, взятые вместе, образуют мостик -R^#-R-, который выбран из -CH₂-O-, -CH₂-S-, -CH₂-NH-, -CH₂-N(CH₃)-, -CH₂-N(C₂H₅)-, -CH₂-CH₂-O-, -CH₂-CH₂-S-, -CH₂-CH₂-NH-, -CH₂-CH₂-N(CH₃)- или -CH₂-CH₂-N(C₂H₅)-;

X' представляет =O или =S;

Х представляет -O^-, -OH, -OR^H, -NHR^H, -N(R^H)₂, -OCH₂CH₂OR^H, -OCH₂CH₂SR^H, -BH₃^-, -R^H, -SH, -SR^H или -S^-;

Х'' представляет -O-, -NH-, -NR^H-, -CH₂-, или -S-;

Y представляет -О-, -NH-, -NR^H-, -CH₂- или -S-;

R^H выбран из атома водорода и С_1-4-алкила и предпочтительно -СН₃ или -С₂Н₅ и наиболее предпочтительно -CH₃.

Предпочтительно Х^- представляет -O^-, -OH, -OCH₃, -NH(CH₃), -N (CH₃)₂, -OCH₂CH₂OCH₃, -OCH₂CH₂SCH₃, -BH₃^-, -СН₃, -SH, -SCH₃ или -S^-; и более предпочтительно -O^-, -OH, -OCH₃, -N(CH₃)₂, -OCH₂CH₂OCH₃, -BH₃^-, -SH, -SCH₃ или -S^-.

IL' предпочтительно представляет -O-P(O)(O^-)-, -OP(O)(S^-)-, -O-P(S)(S^-)-, -S-P(O)(O^-)-, -S-P(O)(S^-)-, -S-Р(S)(S^-)-, -O-P(O)O^-)-, -O-P(O)(S^-)-, -S-Р(O)(O^-)-, -O-P(O)(R^H)-, -O-P(O)(OR^H)-, -O-P(O) (NHR^H)-, -O-P(O)[N(R^H)₂]-, -O-P(O) (BH₃^-)-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OR^H)-, -O-P(O)(OCH₂CH₂SR^H)-, -O-Р(O)(O^-)-, -NR^H-P(O)(O^-)-, где R^Hвыбран из атома водорода и С_1-4-алкила.

Группа -O-P(O)(R^H)-O- предпочтительно представляет -O-P(O)(CH₃)-O- или -O-P(O)(C₂H₅)-O-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)(CH₃)-O-.

Группа -O-P(O)(OR^H)-O- предпочтительно представляет -O-P(O)(OCH₃)-O- или -O-P(O)(OC₂H₅)-O-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)(OCH₃)-O-.

Группа -O-Р(O)(NHR^H)-O- предпочтительно представляет -O-P(O)(NHCH₃)-O- или -O-P(O)(NHC₂H₅)-O- и наиболее предпочтительно -O-P(O)(NHCH₃)-О-.

Группа -O-Р(O)[N(R^H)₂]-O- предпочтительно представляет -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O- или -O-P(O)[N(C₂H₅)₂]-О-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-.

Группа -O-Р(O)(OCH₂CH₂OR^H)-O- предпочтительно представляет -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O- или -O-P(O)(OCH₂CH₂OC₂H₅)-O- и наиболее предпочтительно -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-О-.

Группа -O-Р(O)(OCH₂CH₂SR^H)-O-, предпочтительно представляет -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-O- или -O-P(O)(OCH₂CH₂SC₂H₅)-O-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-О-.

Группа -O-Р(O)(O^-)-NR^H- предпочтительно представляет -O-P(O)(O^-)-NH- или -O-P(O)(O^-)-N(CH₃)- и наиболее предпочтительно -O-P(O)(O^-)-NH-.

Группа -NR^H-P(O)(O^-)-O- предпочтительно представляет -NH-P(O)(O^-)-O- или -N(CH₃)-P(O)(O^-)-O- и наиболее предпочтительно -NH-P(O)(O^-)-O-.

Еще более предпочтительно IL' представляет -O-P(O)(O^-)-, -O-P(O)(S^-)-, -O-P(S)(S^-)-, -O-Р(O)(NHR^H)- или -O-P(O)[N(R^H)₂] -, и еще более предпочтительно IL' представляет -O-P(O)(O^-)-, -O-P(O) (S^-)- или -O-P(S)(S^-)-, и наиболее предпочтительно IL' представляет -O-P(O)(S^-)- или -O-P(S)(S^-)-.

Предпочтительно Y представляет -О-.

Предпочтительно В представляет обычное азотистое основание, выбранное из A, T, G, C, U.

Предпочтительно IL представляет -O-P(=O)(S^-) - или -O-P(=S) (S^-)-.

Приведенные выше определения B, Y и IL' применимы также к формулам b¹-b⁹.

Таким образом, следующие общие формулы (B3)-(B6) являются предпочтительными:

где:

В представляет азотистое основание и предпочтительно А, Т, G, C, U;

R представляет -H, -F, -OH, -NH₂, -N(CH₃)₂, -OCH₃, -OCH₂CH₂OCH₃, -OCH₂CH₂CH₂OH, -OCH₂CH₂CH₂NH₂ и предпочтительно -H;

R* представляет группу -R^#-R-, как это определено ниже, и она, например, предпочтительно выбрана из -C(R^aR^b)-O-, -C(R^aR^b)-NR^c-, -C(R^aR^b)-S- и -C(R^aR^b)-C(R^aR^b)-O-, где заместители R^a, R^b и R^c имеют значения, определенные здесь. Более предпочтительно R^*выбран из -CH₂-O-, -CH₂-S-, -CH₂-NH-, -CH₂-N(CH₃)-, -CH₂-CH₂-O- или -CH₂-CH₂-S-, более предпочтительно из -CH₂-O-, -CH₂-S-, -CH₂-CH₂-O- или -CH₂-CH₂-S-, и еще более предпочтительно из -CH₂-O-, -CH₂-S- или -CH₂-CH₂-O-, и еще более предпочтительно из -СН₂-О- или -СН₂-S-, и наиболее предпочтительно представляет -СН₂-О-.

Примерами предпочтительных нуклеотидов, которые не представляют звенья LNA, являются следующие:

Межнуклеотидные связи (IL)

Мономеры антисмысловых олигонуклеотидов, описанных здесь, соединены друг с другом посредством межнуклеотидной связи. Соответственно, каждый мономер связан со смежным 3'-мономером через межнуклеотидную связь. Специалисту с обычной квалификацией в данной области техники понятно, что, в контексте настоящего изобретения 5'-мономер в конце олигомера не содержит 5'-межнуклеотидную связь, хотя, он может содержать концевую 5'-группу или нет. Термин «межнуклеотидная связь» означает группу, способную ковалентно связывать два нуклеотида, два нуклеотидных аналога, таких как две LNA, и нуклеотид и аналог нуклеотида, такой как LNA. Конкретные и предпочтительные примеры включают фосфатные группы и фосфортиоатные группы.

Нуклеотиды антисмысловых олигонуклеотидов по настоящему изобретению или соседние нуклеотидные последовательности соединены друг с другом посредством межнуклеотидных связей. Соответственно каждый нуклеотид связан через 5'-положение с соседним 3'-нуклеотидом через межнуклеотидную связь.

Антисмысловые олигонуклеотиды можно модифицировать различными способами. Возможны модификации в остове, и они относятся к антисмысловым олигонуклеотидам, где фосфатные группы (также называемые фосфодиэфирными группами) в их межнуклеотидном остове частично или полностью заменены другими группами. Предпочтительные модифицированные остовы антисмысловых олигонуклеотидов включают, например, фосфоротиоаты, хиральные фосфоротиоаты, фосфородитиоаты, фосфотриэфир, аминоалкилфосфотриэфиры, метил-, этил- и С₃-С₁₀-алкилфосфонаты, включая 3'-алкиленфосфонаты и хиральные фосфонаты, фосфинаты, фосфороамидаты, включая 3'-аминофосфорамидат и аминоалкилфосфорамидаты, тионофосфорамидаты, тионоалкил фос фонаты, тионоалкилфосфотриэфиры и боранофосфаты, содержащие 3'-5' связи, их 2'-5' связанные аналоги, и таковые, которые имеют инвертированную полярность, где смежные пары нуклеотидных звеньев связаны 3'-5' с 5'-3' или 2'-5' с 5'-2'. Различные соли, смешанные соли и их свободные кислотные формы также включаются и раскрываются более подробно.

Подходящие межнуклеотидные связи включают таковые, которые описаны в международной заявке WO 2007/031091, например межнуклеотидные связи, приведенные в первом абзаце на странице 34 в WO 2007/031091 (включена в данное описание в качестве ссылки). В некоторых вариантах осуществления предпочтительно модифицировать межнуклеотидную связь по сравнению с обычной фосфодиэфирной связью, которая более устойчива к атаке нуклеаз, такую как фосфоротиоат или боранофосфат - эти две, принятые как опосредованное РНКазой Н расщепление, также представляют путь ингибирования антисмысловым олигонуклеотидом, приводящий к снижению экспрессии гена-мишени.

Межнуклеотидная связь состоит из группы IL', которая является группой, связанной с 3'-атомом углерода рибозного фрагмента и группой Y, которая является группой, связанной с 5'-углеродным атомом соседнего рибозного фрагмента, как показано в формуле (IL'Y) ниже:

Межнуклеотидная связь IL представлена -IL'-Y-. IL' представляет -X''-P(=X')(Х^-)- так, что IL представляет -X''-P(=X')(X^-)-Y-, где заместители Х^-, Х', Х'' и Y имеют значения, определенные здесь.

Межнуклеотидная связь IL=-X''-P(=X')(X^-)-Y- предпочтительно выбрана из группы, состоящей из:

-O-P(O)(O^-)-О-, -OP(O)(S^-)-О-, -O-P(S)(S^-)-О-, -S-P(O)(O^-)-О-, -S-P(O)(S^-)-О-, -S-Р(S)(S^-)-О-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O^-)(S)-S-, -S-Р(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(R^H)-О-, -O-P(O)(OR^H)-О-, -O-P(O)(NHR^H)-О-, -O-P(O)[N(R^H)₂]-О-, -O-P(O)(BH₃^-)-О-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OR^H)-О-, -O-P(O)(OCH₂CH₂SR^H)-O-, -O-Р(O)(O^-)-NR^H-, -NR^H-P(O)(O^-)-O-, где R^Hвыбран из атома водорода и С_1-4-алкила.

Группа -O-Р(O)(OCH₂CH₂SR^H)-O- предпочтительно представляет -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-O- или -O-P(O)(OCH₂CH₂SC₂H₅)-O-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-О-.

Группа -O-Р(O)(O^-)-NR^H- предпочтительно представляет -O-P(O)(O^-)-NH- или -O-P(O)(O^-)-N(CH₃)-, и наиболее предпочтительно -O-P(O)(O^-)-NH-.

Еще более предпочтительно IL представляет -O-P(O)(O^-)-О-, -O-P(O)(S^-)-О-, -O-P(S)(S^-)-О-, -O-Р(O)(NHR^H)-О- или -O-P(O)[N(R^H)₂]-О -, и еще более предпочтительно IL представляет -O-P(O)(O^-)-О-, -O-P(O)(S^-)-О- или -O-P(S)(S^-)-О-, и наиболее предпочтительно IL представляет -O-P(O)(S^-)-О- или -O-P(O)(O^-)-O-.

Таким образом, IL предпочтительно представляет фосфатную группу (-O-P(O)(O^-)-O-), фосфоротиоатную группу (-O-P(O)(S^-)-О-) или фосфородитиоатную группу (-O-Р(S)(S^-)-О-).

Нуклеотидные звенья или нуклеозиды антисмысловых олигонуклеотидов соединены друг с другом посредством межнуклеотидных связей, таким образом, что в одном антисмысловом олигонуклеотиде могут присутствовать различные межнуклеотидные связи. Звенья LNA предпочтительно связаны межнуклеотидными связями, которые не являются фосфатными группами. Звенья LNA соединены друг с другом группой IL, которая предпочтительно выбрана из -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -O-P(O)(NHR^H)-O- и -O- (O)[N(R^H)₂]-О- и более предпочтительно -O-P(O)(S^-)-O- и -O-Р(S) (S^-)-О-.

Звенья, которые не являются LNA, связаны друг с другом группой IL, которая предпочтительно выбрана из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-О-, -О-P (S)(S^-)-O-, -O-P(O)(NHR^H)-O- и -O-P(O)[N(R^H)₂]-О- и более предпочтительно -О-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O- и -O-Р(S)(S^-)-О-.

Звенья, которые не являются LNA, связаны со звеном LNA группой IL, которая предпочтительно выбрана из -O-P(O)(S^-)-О-, -О-Р(S)(S^-)-O-, -O-P(O)(NHR^H)-O- и -O-P(O)[N(R^H)₂]-О- и более предпочтительно -O-P (O)(S^-)-O- и -O -P(S)(S^-)-О-.

Как здесь используется, термин «звено LNA» относится к нуклеотиду, который замкнут, т.е. нуклеотиду, который имеет бициклическую структуру, и особенно бициклическую рибозную структуру и особенно бициклическую рибозную структуру, показанную в общей формуле (II). Мост «замыкает» рибозу в 3'-эндо (север) конформации. Рибозный фрагмент нуклеотида LNA модифицируется дополнительным мостиком, соединяющим 2'-кислород и 4'-углерод. Альтернативно используемые термины для LNA представляют бициклические нуклеотиды или связанные мостиком нуклеотиды, таким образом, альтернативный термин для звена LNA представляет бициклическое нуклеотидное звено или связанное мостиком нуклеотидное звено.

Как здесь используется, термин «звено, которое не является LNA» относится к нуклеотиду, который не является замкнутым, т.е. нуклеотиду, который не содержит бициклическую сахарную группу, и особенно не содержит бициклическую рибозную структуру и особенно бициклическую рибозную структуру, показанную в общей формуле (II). Звенья, которые не являются LNA, наиболее предпочтительно представляют звенья ДНК.

Как здесь используется, термин «звено ДНК» относится к нуклеотиду, содержащему 2-дезоксирибозу в качестве сахара. Таким образом, нуклеотид состоит из азотистого основания и 2-дезоксирибозы.

Как здесь используется, термин «звено» относится к части или фрагменту, или группе антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению. Таким образом, «звено» не является полной молекулой, оно является частью или его фрагментом, или группой антисмыслового олигонуклеотида, которое имеет, по меньшей мере, одно положение для ковалентного связывания с другой частью или фрагментом, или группой антисмыслового олигонуклеотида. Например, общие структуры (B1)-(B6) представляют звенья, поскольку они могут быть ковалентно связаны через группу Y и IL' или -O- и -O-P(O)(S^-)- соответственно. Предпочтительно звено представляет фрагмент, состоящий из пентозной структуры, азотистого основания, соединенного с пентозной структурой 5'-радикальной группой, и радикальной группой IL'.

Как здесь используется, термин «строительный блок» или «мономер» относится к молекуле, и, в частности, к нуклеозиду, который используется в синтезе антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению. Примерами являются молекулы LNA общей формулы (I), где Y представляет 5'-концевую группу, и IL' представляет 3'-концевую группу.

Кроме того, предпочтительными являются чистые диастереомерные антисмысловые олигонуклеотиды. Предпочтительными являются Sp- и Rp-диастереомеры, как показано справа:

Соответствующие серусодержащие (S) межнуклеотидные связи, как представлено здесь, являются предпочтительными.

Предпочтительными являются фосфоротиоатные группы в остове, где, по меньшей мере, 50% межнуклеотидных связей представляют фосфортиоатные группы. Также предпочтительным является то, чтобы звена LNA, если они присутствуют, были связаны между собой через фосфоротиоаты в качестве межнуклеотидных связей. Наиболее предпочтительным является полностью фосфоротиоатный остов, т.е. наиболее предпочтительным является, когда все нуклеотидные звенья, а также звенья LNA (если они присутствуют) были связаны друг с другом через фосфортиоатные группы, которые определяются следующим образом: -O-P(O)(S^-)-O-, что является аналогичным -O-P(O, S)-O- или -O-P(O^-)(S)-O-.

В случае, если антисмысловой олигонуклеотид является гапмером, то предпочтительно, чтобы участки LNA имели межнуклеотидные связи, выбранные из -O-P(O)(S^-)-O- и -O-P(S)(S^-)-O- и чтобы участки, которые не являются LNA, в средней части имели межнуклеотидные связи, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O- и -O-P(O)(S^-)-O-, и чтобы участки LNA были связаны с участками, которые не являются LNA, через межнуклеотидные связи, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O- и -O-Р(S)(S^-)-О-.

Еще более предпочтительно, если все межнуклеотидные связи, которые представляют 9 в 10-мерных и 19 в 20-мерных олигонуклеотидах, были выбраны из -О-P(O)(S^-)-O- и -O-P(S)(S^-)-О-.Еще более предпочтительным является то, чтобы все межнуклеотидные связи представляли фосфортиоатные группы (-О-Р(О)(S^-)-О-) или представляли фосфородитиоатные группы (-О-Р(S)(S^-)-О-).

Замкнутые нуклеиновые кислоты (LNA ^® )

Особенно предпочтительно, чтобы некоторые из нуклеотидов общей формулы (В1) или (В2) в антисмысловых олигонуклеотидах были замещены так называемыми LNA (замкнутыми нуклеиновыми кислотами). Сокращенное обозначение LNA является зарегистрированным торговым названием, но здесь термин «LNA» используется исключительно в описательной форме. Предпочтительно, чтобы концевые нуклеотиды замещены LNA и более предпочтительно последние 1-4 нуклеотида на 3'-конце и/или последние 1-4 нуклеотида 5'-конце были замещены LNA. Кроме того, предпочтительно, чтобы, по меньшей мере, концевой нуклеотид на 3'-конце и 5'-конце каждый был замещен LNA.

Как здесь используется, термин «LNA» относится к бициклическому нуклеотидному аналогу, известному как «замкнутая нуклеиновая кислота». Он может относиться к мономеру LNA, или, при использовании в контексте «антисмыслового олигонуклеотида с LNA» или «антисмысловому олигонуклеотиду, содержащему LNA», LNA относится к олигонуклеотиду, содержащему один или более таких бициклических нуклеотидных аналогов. Нуклеотиды LNA характеризуются наличием линкерной группы (такой как мостик) между C2' и C4' рибозного сахарного кольца - например, как показано в виде бирадикала R^#-R, описанного ниже. LNA, используемая в антисмысловых олигонуклеотидах по настоящему изобретению, предпочтительно имеет структуру общей формулы (I):

где для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации;

где Х выбран из -О-, -S-, -N(R^N)-, -C(R⁶R⁷)-, и предпочтительно Х представляет -O-;

В выбран из атома водорода, необязательно замещенного С_1-4-алкокси, необязательно замещенного С_1-4-алкила,, необязательно замещенного С_1-4-ацилокси, азотистых оснований и аналогов азотистых оснований, и предпочтительно В представляет азотистое основание или аналог азотистого основания, и наиболее предпочтительно представляет обычное азотистое основание;

Y представляет часть межнуклеотидной связи с соседним нуклеотидом в случае, если фрагмент общей формулы (I) представляет звено LNA антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению, или 5'-концевую группу в случае, если фрагмент общей формулы (I) представляет мономер или строительный блок для синтеза антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению. 5'-атом углерода необязательно содержит заместитель R⁴ и R⁵;

IL' представляет часть межнуклеотидной связи с соседним нуклеотидом в случае, если фрагмент общей формулы (I) представляет звено LNA антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению, или 5'-концевую группу в случае, если фрагмент общей формулы (I) представляет мономер или строительный блок для синтеза антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению.

R^# и R, взятые вместе, представляют двухвалентную линкерную группу, состоящую из 1-4 групп или атомов, выбранных из -C(R^aR^b)-, -C(R^a)=C(R^b)-, -C(R^a)=N-, -O-, -Si(R^a)₂-, -S-, -SO₂-, -N(R^c)- и > C=Z, где Z выбран из -O-, -S- и -N(R^a)-, и R^a, R^b и R^c независимо друг от друга выбраны из атома водорода, необязательно замещенного C_1-12-алкила, необязательно замещенного C_2-6-алкенила, необязательно замещенного C_2-6-алкинила, гидрокси, необязательно замещенного C_1-12-алкокси, С_1-6-алкокси-С_1-6-алкила, С_2-6-алкенилокси, карбокси, С_1-12-алкоксикарбонила, С_1-12-алкилкарбонила, формила, арила, арилоксикарбонила, арилокси, арилкарбонила, гетероарила, гетероарилоксикарбонила, гетероарилокси, гетероарилкарбонила, амино, моно- и ди(С_1-6- алкил)амино, карбамоила, моно- и ди(C_1-6-алкил)аминокарбонила, амино-C_1-6-алкилениламинокарбонила, моно- и ди(С_1-6-алкил)амино-С _1-6-алкилениламинокарбонила, C_1-6-алкилкарбониламино, карбамидо, С_1-6-алканоилокси, сульфоно, С_1-6-алкилсульфонилокси, нитро, азидо, сульфанила, С_1-6-алкилтио, атома галогена, где арил и гетероарил могут быть необязательно замещены, и где два геминальных заместителя R^a и R^b, взятые вместе, могут представлять необязательно замещенный метилен (=СН₂), где для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации; и

каждый из заместителей R¹, R², R³, R⁴, R⁵, R⁶ и R⁷, которые присутствуют, независимо выбраны из атома водорода, необязательно замещенного C_1-12-алкила, необязательно замещенного C_2-6-алкенила, необязательно замещенного C_2-6-алкинила, гидрокси, C_1-12-алкокси, С_1-6-алкокси-С_1-6-алкила, С_2-6-алкенилокси, карбокси, С_1-12-алкоксикарбонила, С_1-12-алкилкарбонила, формила, арила, арилоксикарбонила, арилокси, арилкарбонила, гетероарила, гетероарилоксикарбонила, гетероарилокси, гетероарилкарбонила, амино, моно- и ди(С_1-6-алкил)амино, карбамоила, моно- и ди(C_1-6-алкил)аминокарбонила, амино-C_1-6-алкиламинокарбонила, моно- и ди(С_1-6-алкил)амино-С_1-6-алкиламинокарбонила, C_1-6-алкилкарбониламино, карбамидо, С_1-6-алканоилокси, сульфоно, С_1-6-алкилсульфонилокси, нитро, азидо, сульфанила, С_1-6-алкилтио, атома галогена, где арил и гетероарил могут быть необязательно замещены, и где два геминальных заместителя, взятые вместе, могут представлять оксо, тиооксо, имино или необязательно замещенный метилен;

где R^N выбран из атома водорода и С_1-4-алкила, и где два соседних (негеминальных) заместителя могут обозначать дополнительную связь, приводя к образованию двойной связи; и R^N, если он присутствует и не входит в состав бирадикала, выбран из атома водорода и С_1-4-алкила; и их основно- и кислотно-аддитивные соли. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал, состоящий из групп, выбранных из группы, состоящей из -C(R^aR^b)-C(R^aR^b)-, -C(R^aR^b)-O-, -C(R^aR^b)-NR^C-, -C(R^aR^b)-S- и -C(R^aR^b)-C(R^aR^b)-O-, где каждый из R^a, R^b и R^c может быть необязательно, независимо выбран.

В некоторых вариантах осуществления R^a и R^b могут быть необязательно, независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода и C_1-6-алкила, такого как метил, и предпочтительно является атомом водорода.

В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного С_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила или замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, C_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации.

В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ представляют атом водорода.

В некоторых вариантах осуществления R¹, R² и R³ независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного С_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила или замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, C_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R² и R³ представляют атом водорода.

В предпочтительных вариантах осуществления R⁴ и R⁵ каждый независимо выбран из группы, состоящей из -H, -CH₃, -CH₂-CH₃, -CH₂-O-CH₃ и -CH=CH₂. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет атом водорода, тогда как другой (R⁴ или R⁵ соответственно) выбран из группы, состоящей из C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного C_1-6-алкила, замещенного С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкинила или замещенного ацила (-C(=O)-); где каждая замещенная группа моно- или полизамещена заместителями, независимо выбранными из атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, -OJ₁, -SJ₁, -NJ₁J₂, -N₃, -COOJ₁, -CN, -О-С(=O)NJ₁J₂, -N(Н)С(=NH)NJ₁J₂ или -N(H)С(=Х)N(H)J₂, где Х представляет О или S; и каждый J₁ и J₂ независимо представляет -Н, C_1-6-алкил, замещенный C_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, замещенный С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, замещенный С_2-6-алкинил, С_1-6-аминоалкил, замещенный С_1-6-аминоалкил или защитную группу. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет замещенный C_1-6-алкил. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет замещенный метилен, где предпочтительные заместители включают одну или более групп, независимо выбранных из -F, -NJ₁J₂, -N₃, -CN, -OJ₁, -SJ₁, -О-С(=O)NJ₁J₂, -N(Н)С(=NH)NJ₁J₂ или -N(H)С(=O)N(H)J₂. В некоторых вариантах осуществления каждый J₁ и J₂ независимо представляет -H или C_1-6-алкил. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет метил, этил или метоксиметил. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет метил. В дополнительном варианте осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет этиленил. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет замещенный ацил. В некоторых вариантах осуществления один из R⁴ или R⁵ представляет -О-С(=O)NJ₁J₂. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации. Такие 5'-модифицированные бициклические нуклеотиды раскрыты в публикации международной заявки WO 2007/134181 А, которая включена здесь в качестве ссылки во всей ее полноте.

В некоторых вариантах осуществления В представляет азотистое основание, в том числе аналоги азотистого основания и встречающиеся в природе азотистые основания, такие как пурин или пиримидин, или замещенный пурин или замещенный пиримидин, такие как азотистое основание в настоящем описании, например, азотистое основание, выбранное из группы, состоящей из аденина, цитозина, тимина, аденина, урацила и/или модифицированного или замещенного азотистого основания, такого как 5-тиазолоурацил, 2-тиоурацил, 5-пропинилурацил, 2'-тиотимин, 5-метилцитозин, 5-тиазолоцитозин, 5-пропинилцитозин и 2,6-диаминопурин.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал, выбранный из -С(R^aR^b)-O-, -C(R^aR^b) -C(R^cR^d)-O-, -C(R^aR^b)-C(R^cR^d)-C(R^eR^f)-O-, -C(R^aR^b)-O-С(R^dR^e)-, -C (R^aR^b)-O-С(R^dR^e)-O-, -C (R^aR^b)-C(R^dR^e)-, -C(R^aR^b)-C(R^cR^d)-C(R^eR^f)-, -C(R^a)=C(R^b)-C(R^dR^e)-, -C(R^aR^b)-N(R^c)-, -C(R^aR^b)-С(R^dR^e)-N(R^c)-, -C (R^aR^b)-N(R^c)-O-, -C(R^aR^b)-S- и -C(R^aR^b)-C(R^dR^e)-S-, где R^a, R^b, R^c, R^d, R^e и R^f каждый независимо выбран из атома водорода, необязательно замещенного C_1-12-алкила, необязательно замещенного C_2-6-алкенила, необязательно замещенного C_2-6-алкинила, гидрокси, необязательно замещенного C_1-12-алкокси, С_1-6-алкокси-С_1-6-алкила, С_2-6-алкенилокси, карбокси, С_1-12-алкоксикарбонила, С_1-12-алкилкарбонила, формила, арила, арилоксикарбонила, арилокси, арилкарбонила, гетероарила, гетероарилоксикарбонила, гетероарилокси, гетероарилкарбонила, амино, моно- и ди(С_1-6- алкил)амино, карбамоила, моно- и ди(C_1-6-алкил)аминокарбонила, амино-C_1-6-алкиламинокарбонила, моно- и ди(С_1-6-алкил)амино-С_1-6-алкиламинокарбонила, C_1-6-алкилкарбониламино, карбамидо, С_1-6-алканоилокси, сульфоно, С_1-6-алкилсульфонилокси, нитро, азидо, сульфанила, С_1-6-алкилтио, атома галогена, где арил и гетероарил могут быть необязательно замещены, и где два геминальных заместителя R^a и R^b, взятые вместе, могут представлять необязательно замещенный метилен (=СН₂). Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации.

В дополнительном варианте осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал (двухвалентную группу), выбранный из -СН₂-O-, -СН₂-S-, -СН₂-NH-, -СН₂-N(CH₃)-, -СН₂-СН₂-О-, -СН₂-СН(СН₃)-, -СН₂-СН₂-S-, -СН₂-СН₂-NH-, -СН₂-СН₂-СН₂-, -СН₂-СН₂-СН₂-О-, -СН₂-СН₂-СН(СН₃)-, -СН=СН-СН₂-, -СН₂-О-СН₂-О-, -СН₂-NH-О-, -СН₂-N(CH₃)-O-, -CH₂-O-CH₂-, -CH(CH₃)-O-, -CH(CH₂-O-CH₃)-O-, -СН₂-СН₂-, и -СН=СН-. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации.

В некоторых вариантах осуществления R# и R, взятые вместе, представляют бирадикал -C(R^aR^b)-N(R^c)-O-, где R^a и R^b независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6- алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила, такой как атом водорода; где R^c выбран из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила, и предпочтительно представляет атом водорода.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал -C(R^aR^b)-O-С(R^dR^e)-O-, где R^a, R^b, R^d и R^e независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила, и предпочтительно представляют атом водорода.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R образуют бирадикал -CH(Z)-O-, где Z выбран из группы, состоящей из C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного C_1-6-алкила, замещенного С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкинила, ацила, замещенного ацила, замещенного амида, тиола или замещенного тио; и где каждая из замещенных групп независимо моно- или полизамещена необязательно защищенными заместителями, независимо выбранными из атома галогена, оксо, гидроксила, -OJ₁, -NJ₁J₂, -SJ₁, -N₃, -OC(=X)J₁, -OC(=X)NJ₁J₂, -NJ₃C(=Х)NJ₁J₂ и -CN, где каждый J₁, J₂ и J₃, независимо представляет -Н или C_1-6-алкил, и Х представляет О, S или NJ₁. В предпочтительных вариантах осуществления Z представляет C_1-6-алкил или замещенный С_1-6-алкил. В других предпочтительных вариантах осуществления Z представляет метил. В предпочтительных вариантах осуществления Z представляет замещенный С_1-6-алкил. В предпочтительных вариантах осуществления указанный заместитель представляет собой С_1-6-алкокси. В некоторых вариантах осуществления Z представляет CH₃OCH₂-. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации. Такие бициклические нуклеотиды раскрыты в патенте США № 7399845, который включен здесь в качестве ссылки во всей его полноте. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ представляют атом водород. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R² и R³ представляют водород, и один или оба из R⁴, R⁵ могут быть другими, чем атом водород, как указано выше, и в международной заявке WO 2007/134181.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал, который содержит замещенную аминогруппу в мостике, такой как бирадикал -СН₂-N(R^c)-, где R^c представляет С_1-12-алкилокси. В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал Cq₃q₄-NOR-, где q₃ и q₄ независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила; где каждая замещенная группа независимо моно- или полизамещена заместителями, независимо выбранными из атома галогена, -OJ₁, -SJ₁, -NJ₁J₂, -COOJ₁, -CN, -OC(=O)NJ₁J₂, -NH-C(=NH)NJ₁J₂ или -NH-С(=Х)NHJ₂, где Х представляет О или S; и каждый из J₁ и J₂ независимо представляет -Н, C_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, С_1-6-аминоалкил или защитную группу. Для всех хиральных центров, асимметричные группы могут находиться в любой R- или S- ориентации. Такие бициклические нуклеотиды раскрыты в международной заявке WO2008/150729, которая включена здесь в качестве ссылки во всей ее полноте. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R4 и R⁵ независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6-алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ представляют атом водорода. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R² и R³ представляют атом водорода, и один или оба из R⁴, R⁵ могут быть иными, чем атом водорода, как указано выше, и в международной заявке WO 2007/134181.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R, взятые вместе, представляют бирадикал (двухвалентную группу) -C(R^aR^b)-O-, где R^a и R^b каждый независимо представляет атом галогена, C_1-12-алкил, замещенный C_1-12-алкил, С_2-6-алкенил, замещенный С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, замещенный С_2-6-алкинил, С_1-12-алкокси, замещенный С_1-12-алкокси, -OJ₁, -SJ₁, -S(O)J₁, -SO₂-J₁, -NJ₁J₂, -N₃, -CN, -C(=O)OJ₁, -C(=O)NJ₁J₂, -C(=O)J₁, -OC(=O)NJ₁J₂, -NH-C(=NH) NJ₁J₂, -NH-С(=O)NJ₁J₂ или -NH-C(=S)NJ₁J₂; или R^a и R^b, взятые вместе, представляют =C(q₃)(q₄); q₃ и q₄ каждый независимо представляет -Н, атом галогена, С_1-12-алкил или замещенный С_1-12-алкил; каждая замещенная группа независимо моно- или полизамещена заместителями, независимо выбранными из атома галогена, С_1-6-алкила, замещенного С_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, -OJ₁, -SJ₁, -NJ₁J₂, -N₃, -CN, -C(=O)OJ₁, -C(=O)NJ₁J₂, -C(=O)J₁, -OC(=O)NJ₁J₂, -NH-C(=O)NJ₁J₂ или -NH-C(=S)NJ₁J₂; и каждый из J₁ и J₂ независимо представляет -H, С_1-6-алкил, замещенный С_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, замещенный С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, замещенный С_2-6-алкинил, С_1-6-аминоалкил, замещенный С_1-6-аминоалкил или защитную группу. Такие соединения описаны в международной заявке WO2009006478A, которая включена здесь в качестве ссылки во всей ее полноте.

В предпочтительных вариантах осуществления R^# и R образуют бирадикал -Q-, где Q представляет -C(q₁)(g₂)C(q₃)(q₄)-, -C(q₁)=С(q₃)-, -C[=C(q₁)(q₂)]-С(q₃)(q₄)- или -C(q₁)(q₂)-C[=С(q₃) (q₄)]-;

q₁, q₂, q₃, q₄ каждый независимо друг от друга представляет -Н, атом галогена, C_1-12-алкил, замещенный C_1-12-алкил, С_2-6-алкенил, замещенный С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, замещенный С_2-6-алкинил, С_1-12-алкокси, замещенный С_1-12-алкокси, -OJ₁, -SJ₁, -S(O)J₁, -SO₂-J₁, -NJ₁J₂, -N₃, -CN, -C(=O)OJ₁, -C(=O)NJ₁J₂, -C(=O)J₁, -OC(=O)NJ₁J₂, -NH-C(=NH) NJ₁J₂, -NH-С(=O)NJ₁J₂ или -NH-C(=S)NJ₁J₂; каждый из J₁ и J₂ независимо друг от друга представляет -H, С_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, С_1-6-аминоалкил или защитную группу; и необязательно, когда Q представляет -C(q₁)(q₂)C(q₃)(q₄), и один из q₃ или q₄ представляет -СН₃, то, по меньшей мере, один из q₃ или q₄ или один из q₁ и q₂ является иным, чем -Н. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R², R³, R4 и R⁵ представляют атом водород. Для всех хиральных центров асимметричные группы могут находиться в любой R- или S-ориентации. Такие бициклические нуклеотиды раскрыты в международной заявке WO2008/154401, которая включена здесь в качестве ссылки во всей ее полноте. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ независимо выбраны из группы, состоящей из атома водорода, атома галогена, C_1-6-алкила, замещенного C_1-6-алкила, С_2-6-алкенила, замещенного С_2-6-алкенила, С_2-6-алкинила, замещенного С_2-6-алкинила, С_1-6- алкоксила, замещенного С_1-6-алкоксила, ацила, замещенного ацила, С_1-6-аминоалкила или замещенного C_1-6-аминоалкила. В предпочтительных вариантах R¹, R², R³, R⁴ и R⁵ представляют атом водорода. В предпочтительных вариантах осуществления R¹, R² и R³ представляют атом водорода, и один или оба из R⁴, R⁵ могут быть иными, чем атом водорода, как указано выше и в международных заявках WO 2007/134181 или WO 2009/067647 (альфа-L-бициклические аналоги нуклеиновых кислот).

Как здесь используется, термин «С_1-6-алкил» относится к -CH₃, -C₂H₅, -C₃H₇, -CH(CH₃)₂, -C₄H₉, -CH₂-CH(CH₃)₂, -CH(СН₃)-C₂H₅, - C(CH₃)₃, -C₅H₁₁, -CH(СН₃)-C₃H₇, -СН₂-СН(СН₃)-С₂Н₅, -СН(СН₃)-СН(СН₃)₂, -C(CH₃)₂-С₂Н₅, -СН₂-C(CH₃)₃, -СН(С₂Н₅)₂, -C₂H₄-CH(CH₃)₂, -C₆H₁₃, -C₃H₆-CH(CH₃)₂, -C₂H₄-CH(CH₃)-C₂H₅, -СН(СН₃)-C₄H₉, -СН₂-СН(СН₃)-C₃H₇, -СН (СН₃)-СН₂-СН(СН₃)₂, -СН(СН₃)-СН(СН₃)-С₂Н₅, -СН₂-СН(СН₃)-СН(СН₃)₂, -СН₂-С(СН₃)₂-С₂Н₅, -С(СН₃)₂-С₃Н₇, -С(СН₃)₂-СН(СН₃)₂, -C₂H₄-C(CH₃)₃, -CH₂-CH(С₂Н₅)₂ и -CH(CH₃)-C(CH₃)₃. Термин «С_1-С₆-алкил» также включает «С_1-С₆-циклоалкил» такой, как цикло-C₃H₅, цикло-C₄H₇, цикло-C₅H₉ и цикло-С₆Н₁₁.

Предпочтительными являются -CH₃, -C₂H₅, -C₃H₇, -CH(CH₃)₂, -C₄H₉, -CH₂-CH(CH₃)₂, -CH(СН₃)-C₂H₅, -C(CH₃)₃ и -C₅H₁₁. Особенно предпочтительными являются -CH₃, -C₂H₅, -C₃H₇ и -CH(CH₃)₂.

Термин «C₁-C₆-алкил» также включает «C₁-C₆-циклоалкил» такой, как цикло-C₃H₅, цикло-C₄H₇, цикло-C₅H₉, и цикло-С₆Н₁₁.

Как здесь используется, термин «C₁-C₁₂-алкил» относится к C₁-C₆-алкилу, -C₇H₁₅, -C₈H₁₇, -C₉H₁₉, -C₁₀H₂₁, -C₁₁H₂₃, -C₁₂H₂₅.

Как здесь используется, термин «С_2-С₆-алкиленил» относится к -CH₂-, -C₂H₄-, -CH(CH₃)-, -C₃H₆-, -CH₂-CH(CH₃)-, -CH(CH₃)-CH₂-, -C(CH₃)₂-, -C₄H₈-, -CH₂-C(CH₃)₂-, -C(CH₃)₂-CH₂-, -C₂H₄-CH(CH₃)-_, -CH(CH₃)-C₂H₄-_, -CH₂-CH(CH₃)-CH₂-, -CH(CH₃)-CH(CH₃)-, -C₅H₁₀-, -CH(CH₃)-C₃H₆-, -CH₂-CH(CH₃)-C₂H₄-, -C₂H₄-CH(CH₃)-CH₂-, -C₃H₆-CH(CH₃)-, -C₂H₄-C(CH₃)₂-_, -C(CH₃)₂-C₂H₄-_, -CH₂-C(CH₃)₂-CH₂-, -CH₂-CH(CH₃)-CH(CH₃)-, -CH(CH₃)-CH₂-CH(CH₃)-, -CH(CH₃)-CH(CH₃)-CH₂-, -CH(CH₃)-CH(CH₃)-CH(CH₃)-, -C(CH₃)₂-C₃H₆-, -CH₂-C(CH₃)₂-C₂H₄-, -C₂H₄-C(CH₃)₂-CH₂-, -C₃H₆-C(CH₃)₂-, -CH(CH₃)-C₄H₈-, -C₆H₁₂-, -CH₂-CH(CH₃)-C₃H₆-, -C₂H₄-CH(CH₃)-C₂H₄-, -C₃H₆-CH(CH₃)-CH₂-, -C₄H₈-CH(CH₃)-, -C₂H₄-CH(CH₃)-CH(CH₃)-, -CH₂-CH(CH₃)-CH(CH₃)-CH₂-, -CH₂-CH(CH₃)-CH₂-CH(CH₃)-, -CH(CH₃)-C₂H₄-CH(CH₃)-, -CH(CH₃)-CH₂-CH(CH₃)-CH₂- и -CH(CH₃)-CH(CH₃)-C₂H₄-.

Как здесь используется, термин «С_2-С₆-алкенил» относится к -CH=CH₂, -CH₂-CH=CH₂, -C(CH₃)=CH₂, -CH=CH-CH₃, -C₂H₄-CH=CH₂, -CH₂-CH=CH-CH₃, -CH=CH-C₂H₅, -CH₂-C(CH₃)=CH₂, -CH(CH₃)-CH=CH, -CH=C(CH₃)₂, -C(CH₃)=CH-CH₃, -CH=CH-CH=CH₂, -C₃H₆-CH=CH₂, -C₂H₄-CH=CH-CH₃, -CH₂-CH=CH-C₂H₅, -CH=CH-C₃H₇, -CH₂-CH=CH-CH=CH₂, -CH=CH-CH=CH-CH₃, -CH=CH-CH₂-CH=CH₂, -C(CH₃)=CH-CH=CH₂, -CH=C(CH₃)-CH=CH₂, -CH=CH-C(CH₃)=CH₂, -C₂H₄-C(CH₃)=CH₂, -CH₂-CH(CH₃)-CH=CH₂, -CH(CH₃)-CH₂-CH=CH₂, -CH₂-CH=C(CH₃)₂, -CH₂-C(CH₃)=CH-CH₃, -CH(CH₃)-CH=CH-CH₃, -CH=CH-CH(CH₃)₂, -CH=C(CH₃)-C₂H₅, -C(CH₃)=CH-C₂H₅, -C(CH₃)=C(CH₃)₂, -C(CH₃)₂-CH=CH₂, -CH(CH₃)-C(CH₃)=CH₂, -C(CH₃)=CH-CH=CH₂, -CH=C(CH₃)-CH=CH₂, -CH=CH-C(CH₃)=CH₂, -C₄H₈-CH=CH₂, -C₃H₆-CH=CH-CH₃, -C₂H₄-CH=CH-C₂H₅, -CH₂-CH=CH-C₃H₇, -CH=CH-C₄H₉, -C₃H₆-C(CH₃)=CH₂, -C₂H₄-CH(CH₃)-CH=CH₂, -CH₂-CH(CH₃)-CH₂-CH=CH₂, -CH(CH₃)-C₂H₄-CH=CH₂, -C₂H₄-CH=C(CH₃)₂, -C₂H₄-C(CH₃)=CH-CH₃, -CH₂-CH(CH₃)-CH=CH-CH₃, -CH(CH₃)-CH₂-CH=CH-CH₃, -CH₂-CH=CH-CH(CH₃)₂, -CH₂-CH=C(CH₃)-C₂H₅, -CH₂-C(CH₃)=CH-C₂H₅, -CH(CH₃)-CH=CH-C₂H₅, -CH=CH-CH₂-CH(CH₃)₂, -CH=CH-CH(CH₃)-C₂H₅, -CH=C(CH₃)-C₃H₇, -C(CH₃)=CH-C₃H₇, -CH₂-CH(CH₃)-C(CH₃)=CH₂, -CH(CH₃)-CH₂-C(CH₃)=CH₂, -CH(CH₃)-CH(CH₃)-CH=CH₂, -CH₂-C(CH₃)₂-CH=CH₂, -C(CH₃)₂-CH₂-CH=CH₂, -CH₂-C(CH₃)=C(CH₃)₂, -CH(CH₃)-CH=C(CH₃)₂, -C(CH₃)₂-CH=CH-CH₃, -CH(CH₃)-C(CH₃)=CH-CH₃, -CH=C(CH₃)-CH(CH₃)₂, -C(CH₃)=CH-CH(CH₃)₂, -C(CH₃)=C(CH₃)-C₂H₅, -CH=CH-C(CH₃)₃, -C(CH₃)₂-C(CH₃)=CH₂, -CH(C₂H₅)-C(CH₃)=CH₂, -C(CH₃)(C₂H₅)-CH=CH₂, -CH(CH₃)-C(C₂H₅)=CH₂, -CH₂-C(C₃H₇)=CH₂, -CH₂-C(C₂H₅)=CH-CH₃, -CH(C₂H₅)-CH=CH-CH₃, -C(C₄H₉)=CH₂, -C(C₃H₇)=CH-CH₃, -C(C₂H₅)=CH-C₂H₅, -C(C₂H₅)=C(CH₃)₂, -C[C(CH₃)₃]=CH₂, -C[CH(CH₃)(C₂H₅)]=CH₂, -C[CH₂-CH(CH₃)₂]=CH₂, -C₂H₄-CH=CH-CH=CH₂, -CH₂-CH=CH-CH₂-CH=CH₂, -CH=CH-C₂H₄-CH=CH₂, -CH₂-CH=CH-CH=CH-CH₃, -CH=CH-CH₂-CH=CH-CH₃, -CH=CH-CH=CH-C₂H₅, -CH₂-CH=CH-C(CH₃)=CH₂, -CH₂-CH=C(CH₃)-CH=CH₂, -CH₂-C(CH₃)=CH-CH=CH₂, -CH(CH₃)-CH=CH-CH=CH₂, -CH=CH-CH₂-C(CH₃)=CH₂, -CH=CH-CH(CH₃)-CH=CH₂, -CH=C(CH₃)-CH₂-CH=CH₂, -C(CH₃)=CH-CH₂-CH=CH₂, -CH=CH-CH=C(CH₃)₂, -CH=CH-C(CH₃)=CH-CH₃, -CH=C(CH₃)-CH=CH-CH₃, -C(CH₃)=CH-CH=CH-CH₃, -CH=C(CH₃)-C(CH₃)=CH₂, -C(CH₃)=CH-C(CH₃)=CH₂, -C(CH₃)=C(CH₃)-CH=CH₂ и -CH=CH-CH=CH-CH=CH₂.

Предпочтительными являются -CH=CH₂, -CH₂-CH=CH₂, -C(CH₃)=CH₂, -CH=CH-CH₃, -C₂H₄-CH=CH₂, -CH₂-CH=CH-CH₃. Особенно предпочтительными являются -CH=CH₂, -CH₂-CH=CH₂ и -CH=CH-CH₃.

Как здесь используется, термин «С_2-С₆-алкинил» относится к -C≡CH, -C≡C-CH₃, -CH₂ C≡CH, -C₂H₄-C≡CH, -CH₂-C≡C-CH₃, -C≡C-C₂H₅, -C₃H₆-C≡CH, -C₂H₄-C≡C-CH₃, -CH₂-C≡C-C₂H₅, -C≡C-C₃H₇, -CH(CH₃)-C≡CH, -CH₂-CH(CH₃)-C≡CH, -CH(CH₃)-CH₂-C≡CH, -CH(CH₃)-C≡C-CH₃, -C₄H₈-C≡CH, -C₃H₆-C≡C-CH₃, -C₂H₄-C≡C-C₂H₅, -CH₂-C≡C-C₃H₇, -C≡C-C₄H₉, -C₂H₄-CH(CH₃)-C≡CH, -CH₂-CH(CH₃)-CH₂-C≡CH, -CH(CH₃)-C₂H₄-C≡CH, -CH₂-CH(CH₃)-C≡C-CH₃, -CH(CH₃)-CH₂-C≡C-CH₃, -CH(CH₃)-C≡C-C₂H₅, -CH₂-C≡C-CH(CH₃)₂, -C≡C-CH(CH₃)-C₂H₅, -C≡C-CH₂-CH(CH₃)₂, -C≡C-C(CH₃)₃, -CH(C₂H₅)-C≡C-CH₃, -C(CH₃)₂-C≡C-CH₃, -CH(C₂H₅)-CH₂-C≡CH, -CH₂-CH(C₂H₅)-C≡CH, -C(CH₃)₂-CH₂-C≡CH, -CH₂-C(CH₃)₂-C≡CH, -CH(CH₃)-CH(CH₃)-C≡CH, -CH(C₃H₇)-C≡CH, -C(CH₃)(C₂H₅)-C≡CH, -C≡C-C≡CH, -CH₂-C≡C-C≡CH, -C≡C-C≡C-CH₃, -CH(C≡CH)₂, -C₂H₄-C≡C-C≡CH, -CH₂-C≡C-CH₂-C≡CH, -C≡C-C₂H₄-C≡CH, -CH₂-C≡C-C≡C-CH₃, -C≡C-CH₂-C≡C-CH₃, -C≡C-C≡C-C₂H₅, -C≡C-CH(CH₃)-C≡CH, -CH(CH₃)-C≡C-C≡CH, -CH(C≡CH)-CH₂-C≡CH, -C(C≡CH)₂-CH₃, -CH₂-CH(C≡CH)₂, -CH(C≡CH)-C≡C-CH. Предпочтительными являются -С≡СН и -С≡С-СН₃.

Термин «С_1-6-алкоксил» относится к группе «C₁-C₆-алкил-O-».

Термин «С_1-12-алкоксил» относится к группе «C₁-C₁₂-алкил-O-».

Термин «С_1-6-аминоалкил» относится к группе «H₂N-C₁-C₆-алкил-».

Термин «С₂-С₆-алкенилокси» относится к группе «С₂-С₆-алкенил-О-».

Термин «С_1-6-алкилкарбонил» относится к группе «C₁-C₆-алкил-СО-». Также упоминается как «ацил».

Термин «С_1-12-алкилкарбонил» относится к «С₁-С₁₂-алкил-СО-». Также упоминается как «ацил».

Термин «С_1-6-алкоксикарбонил» относится к группе «С₁-С₆-алкил-О-СО-».

Термин «С_1-12-алкоксикарбонил» относится к группе «С₁-С₁₂-алкил-СО-О-».

Термин «С₁-С₆-алаканоилокси» относится к группе «С₁-С₆-алкил-СО-О-».

Термин «С_1-6-алкилтио» относится к группе «С₁-С₆-алкил-S-».

Термин «С_1-6-алкилсульфонилокси» относится к группе «С₁-С₆-алкил-SO₂-O-».

Термин «С_1-6-алкилкарбониламино» относится к группе «С₁-С₆-алкил-СО-NH-».

Термин «С_1-6-алкиламино» относится к группе «С₁-С₆-алкил-NH-».

Термин «(C_1-6)₂алкиламино» относится к диалкиламиногруппе, такой как «[С₁-С₆-алкил][С₁-С₆-алкил]N-».

Термин «С_1-6-алкиламинокарбонил» относится к группе «С₁-С₆-алкил-NH-CO-».

Термин «(C_1-6)-алкиламинокарбонил» относится к группе диалкиламинокарбонил, такой как «[C₁-C₆-алкил][C₁-C₆-алкил]-N-CO-».

Термин «амино-C_1-6-алкиламинокарбонил» относится к группе «H₂N-[С₁-С₆-алкиленил]-HN-СО-».

Термин «C_1-6-алкиламино-С_1-6-алкиламинокарбонил» относится к группе «C₁-С₆-алкил-HN-[C₁-C₆-алкиленил]-NH-СО-».

Термин «(C_1-6)₂-алкиламино-С_1-6-алкиламинокарбонил» относится к группе «[C₁-C₆-алкил][C₁-C₆-алкил]-N-[C₁-C₆-алкиленил]-NH-СО-».

Термин «арил» относится к фенилу, толуилу, замещенному фенилу и замещенному толуилу.

Термин «арилокси» относится к группе «арил-О-».

Термин «арилкарбонил» относится к группе «арил-СО-».

Термин «арилоксикарбонил» относится к группе «арил-O-СО-».

Термин «гетероарил» относится к замещенным или незамещенным гетероароматическиам группам, которые содержат 4-9 атомов в кольце, 1-4 из которых выбраны из О, N и/или S. Предпочтительные «гетероарильные» группы содержат 1 или 2 гетероатома в 5- или 6-членном ароматическом кольце. Включаются моно- и бициклические кольцевые системы. Типичными «гетероарильными» группами являются пиридил, фурил, тиенил, пирролил, оксазолил, тиазолил, имидазолил, изоксазолил, оксадиазолил, пиридазинил, пиримидил, пиразинил, 1,3,5-триазинил, 1,2,3-триазолил, 1,3,4-тиадиазолил, индолизинил, индолил, изоиндолил, бензо[b]фурил, бензо[b]тиенил, индазолил, бензимидазолил, бензтиазолил, пуринил, хинолизинил, хинолил, изохинолил, хиназолинил, хиноксалинил, 1,8-нафтиридинил, тетрагидрохинолил, бензооксазолил, хром-2-онил, индазолил и тому подобное.

Термин «гетероарилокси» относится к группе «гетероарил-О-».

Термин «гетероарилкарбонил» относится к группе «гетероарил-СО-».

Термин «гетероарилоксикарбонил» относится к группе «гетероарил-O-СО- ».

Термин «замещенный» относится к группам, в которых один или более атомов водорода замещены одним или более из следующих заместителей: -OH, -OCH₃, -OC₂H₅, -OC₃H₇, -O-цикло-C₃H₅, -OCH(CH₃)₂, -OCH₂Ph, -F, -Cl, -COCH₃, -COC₂H₅, -COC₃H₇, -CO-цикло-C₃H₅, -COCH(CH₃)₂, -COOH, -CONH₂, -NH₂, -NHCH₃, -NHC₂H₅, -NHC₃H₇, -NH-цикло-C₃H₅, -NHCH(CH₃)₂, -N(CH₃)₂, -N(C₂H₅)₂, -N(C₃H₇)₂, -N(цикло-C₃H₅)₂, -N[CH(CH₃)₂]₂, -SO₃H, -OCF₃, -OC₂F₅, цикло-C₃H₅, -CH₃, -C₂H₅, -C₃H₇, -CH(CH₃)₂, -CH=CH₂, -CH₂-CH=CH₂, -C≡CH и/или -C≡C-CH₃.

В случае, когда общая формула (I) представляет мономеры или строительные блоки для синтеза антисмысловых олигонуклеотидов по настоящему изобретению, то концевые группы Y и IL' выбраны независимо друг от друга из атома водорода, азидо, атома галогена, циано, нитро, гидрокси, PG-O-, AG-O-, меркапто, PG-S-, AG-S, С_1-6-алкилтио, амино, PG-N(R^H)-, AG-N(R^H)-, моно- или ди(С_{1 -6}-алкил)амино, необязательно замещенного С_1-6-алкокси, необязательно замещенного С_1-6-алкила, необязательно замещенного С_2-6-алкенила, необязательно замещенного С_2-6-алкенилокси, необязательно замещенного С_1-6-алкенила, необязательно замещенного С_2-6-алкенилокси, необязательно замещенного С_2-6-алкинила, монофосфата, монотиофосфата, дифосфата, дитиофосфата, трифосфата, тритиофосфата, карбокси, сульфоно, гидроксиметила, PG-O-CH₂, AG-O-CH₂-, аминометила, PG-N(R^H)-CH₂, AG-N(R^H)-CH₂, карбоксиметила, сульфонометила, где PG представляет собой защитную группу для -ОН, -SH и NH(R^H) соответственно, AG является активирующей группой для -ОН, -SH и NH(R^H) соответственно, и R^H выбран из атома водорода и С_1-6-алкила.

Защитные группы PG в гидрокси-заместителях включают замещенный тритил, такой как 4,4'-диметокситритил (DMT), 4-монометокситритил (MMT), необязательно замещенный 9-(9-фенил)ксантенил (пиксил), необязательно замещенный метокситетрагидропиранил (mthp), силил, такой как триметилсилил (™S), триизопропилсилил (TIPS), трет-бутилдиметилсилил (TBDMS), триэтилсилил и фенилдиметилсилил, трет-бутиловые эфиры, ацетали (включающие две гидроксильные группы), ацил, такой как ацетил или, замещенный галогеном ацетил, например, хлорацетил или фторацетил, изобутирил, пивалоил, бензоил и замещенные бензоилы, метоксиметил (MOM), бензиловые эфиры или замещенные бензиловые эфиры, такие как 2,6-дихлорбензил (2,6-Cl₂Bzl). Альтернативно, когда Y или IL' представляют гидроксил, то они могут быть защищены присоединением к твердому носителю, необязательно через линкер.

Когда Y или IL' представляет аминогруппу, то иллюстративными примерами защитных групп для аминогруппы являются флуоренилметоксикарбонил (Fmoc), трет-бутилоксикарбонил (ВОС), трифторацетил, аллилоксикарбонил (alloc или АОС), бензилоксикарбонил (Z или Cbz), замещенные бензилоксикарбонилы, такие как 2-хлорбензилоксикарбонил (2-ClZ), монометокситритил (ММТ), диметокситритил (DMT), фталоил и 9-(9-фенил)ксантенил (пиксил).

Act представляет активирующую группу для -ОН, -SH, -NH(R^H) соответственно. Такие активирующие группы, например, выбраны из необязательно замещенного O-фосфорамидита, необязательно замещенного O-фосфотриэфира, необязательно замещенного O-фосфодиэфира, необязательно замещенного H-фосфоната и необязательно замещенного O-фосфоната.

В данном контексте термин «фосфорамидит» означает группу формулы -P(OR^x)N(R^y)₂, где R^x представляет необязательно замещенную алкильную группу, например, метил, 2-цианоэтил или бензил, и каждый из R^y представляет необязательно замещенные алкильные группы, например, этил или изопропил, или группа N(R^y)₂ образует морфолиногруппу (N(CH₂CH₂)₂O). R^x предпочтительно обозначает 2-цианоэтил, и два R^y предпочтительно являются одинаковыми и обозначают изопропил. Таким образом, особенно подходящий фосфорамидит представляет N,N-диизопропил-O-(2-цианоэтил)фосфорамидит.

Мономеры LNA или строительные блоки LNA

Мономеры LNA или строительные блоки LNA, используемые в качестве исходных веществ в синтезе антисмысловых олигонуклеотидов по настоящему изобретению, предпочтительно представляют собой нуклеозиды LNA следующих общих формул:

Строительные блоки LNA, как правило, обеспечиваются в виде фосфорамидитов LNA с четырьмя различными азотистыми основаниями: аденином (А), гуанином (G), 5-метилцитозином (С*) и тимином (Т). Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, содержащие звенья LNA, синтезируют с использованием стандартной фосфорамидатной химии. В строительных блоках LNA азотистые основания защищены. Предпочтительной защитной группой для аминогруппы пуринового основания является бензоильная группа (BZ), обозначенная как A^BZ. Предпочтительной защитной группой для аминогруппы 5-метилпиримидинового основания является бензоильная группа (BZ), обозначенная как C*^Bz. Предпочтительной защитной группой для аминогруппы пуринового основания является диметилформамидин (DMF), диэтилформамидин (DEF), дипропилформамидин (DPF), дибутилформамидин (DBF) или изо-бутирил(-СОСН(СН₃)₂), обозначенные соответственно как G^DMF, G^DEF, G^DPF, G^DBF или G^iBu. Таким образом, группа -NDMF относится к -N=CH-N(CH₃)₂. DMT относится к 4,4'-диметокситритилу.

Таким образом, LNA-Т относится к LNA 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-3'-O(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамитид- тимидину. LNA С*^Bz относится к LNA 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-3'-O-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит-4-N-бензоил-5-метил-2'-цитидину. LNA-A^BZ относится к LNA 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-3'-O-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит-6-N-бензоил-2'-аденозину. LNA-G^DMF относится к LNA 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-3'-O-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит-2-N-диметилформамидин-2'-гуанозину. LNA-G^iBu относится к LNA 5'-O-(4,4'-диметокситритил)-3'-O-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфор амидит-2-N-бутирил-2'-гуанозину.

Концевые группы

В случае, если Y представляет 5'-концевую группу антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению, то остаток Y, также обозначенный как Y⁵', представляет:

-OH, -O-C_1-6-алкил, -S-C_1-6-алкил, -O-C_6-9-фенил, -O-C_7-10-бензил, -NH-C_1-6-алкил, -N(C_1-6-алкил)₂, -O-C_2-6-алкенил, -S-C_2-6-алкенил, -NH-C_2-6-алкенил, -N(C_2-6-алкенил)₂, -O-C_2-6-алкинил, -S-C_2-6-алкинил, -NH-C_2-6-алкинил, -N(C_2-6-алкинил)₂, -O-C_1-6-алкилeнил-O-C_1-6-алкил, -O-[C_1-6-алкилeнил-O]_m-C_1-6-алкил, -O-CO-C_1-6-алкил, -O-CO-C_2-6-алкенил, -O-CO-C_2-6-алкинил, -O-S(O)-C_1-6-алкил, -O-SO₂-C_1-6-алкил, -O-SO₂-O-C_1-6-алкил, -O-P(O)(O^-)₂, -O-P(O)(O^-)(O-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(S^-)₂, -O-P(O)(S-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(S^-)(O-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O^-)(NH-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O-C_1-6-алкил)(NH-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O^-)[N(C_1-6-алкил)₂], -O-P(O)(O-C_1-6-алкил)[N(C_1-6-алкил)₂], -O-P(O)(O^-)(BH₃^-), -O-P(O)(O-C_1-6-алкил)(BH₃^-), -O-P(O)(O^-)(O-C_1-6-алкилeнил-O-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O-C_1-6-алкилeнил-O-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(O^-)(O-C_1-6-алкилeнил-S-C_1-6-алкил), -O-P(O)(O-C_1-6-алкилeнил-S-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(O^-)(OCH₂CH₂O-C_1-6-алкил), -O-P(O)(OCH₂CH₂O-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(O^-)(OCH₂CH₂S-C_1-6-алкил), -O-P(O)(OCH₂CH₂S-C_1-6-алкил)₂, -O-P(O)(O^-)OC₃H₆OH, -O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH, -O-P(S)(S^-)OC₃H₆OH, где С_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, -O-С_6-9-фенил или -O-С_7-10-бензил могут быть дополнительно замещены -F, -ОН, C_1-4-алкилом, С_2-4-алкенилом и/или С_2-4-алкинилом, где m выбран из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10.

Более предпочтительными являются: -OCH₃, -OC₂H₅, -OC₃H₇, -O-цикло-C₃H₅, -OCH(CH₃)₂, -OC(CH₃)₃, -OC₄H₉, -OPh, -OCH₂-Ph, -O-COCH₃, -O-COC₂H₅, -O-COC₃H₇, -O-CO-цикло-C₃H₅, -O-COCH(CH₃)₂, -OCF₃, -O-S(O)CH₃, -O-S(O)C₂H₅, -O-S(O)C₃H₇, -O-S(O)-цикло-C₃H₅, -O-SO₂CH₃, -O-SO₂C₂H₅, -O-SO₂C₃H₇, -O-SO₂-цикло-C₃H₅, -O-SO₂-OCH₃, -O-SO₂-OC₂H₅, -O-SO₂-OC₃H₇, -O-SO₂-O-цикло-C₃H₅, -O(CH₂)_nN[(CH₂)_nOH], -O(CH₂)_nN[(CH₂)_n-H], -O-P(O)(O^-)OC₃H₆OH, -O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH,

еще более предпочтительными являются:

-OCH₃, -OC₂H₅, -OCH₂CH₂OCH₃ (также известный как MOE), -OCH₂CH₂-N(CH₃)₂ (также известный как DMAOE), -O[(CH₂)_nO]_mCH₃, -O(CH₂)_nOCH₃, -O(CH₂)_nNH₂, -O(CH₂)_nN(CH₃)₂, -O-P(O)(O^-)OC₃H₆OH, -O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH,

где n выбран из 1, 2, 3, 4, 5 или 6; и

где m выбран из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10.

В случае, когда IL' представляет 3'-концевую группу антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению, то остаток IL', также обозначенный как IL³', представляет:

где С_1-6-алкил, С_2-6-алкенил, С_2-6-алкинил, -O-С_6-9-фенил или -O-С_7-10-бензил могут быть дополнительно замещены -F, -ОН, C_1-4-алкилом, С_2-4-алкенилом и/или С_2-4-алкинилом, где m выбран из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10.

еще более предпочтительными являются:

где n выбран из 1, 2, 3, 4, 5 или 6; и

где m выбран из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10.

Предпочтительные LNA

В предпочтительных вариантах осуществления звенья LNA, используемые в антисмысловых олигонуклеотидах по настоящему изобретению, предпочтительно, имеют структуру общей формулы (II):

Группа -C(R^aR^b)-X- предпочтительно представляет -C(R^aR^b)-O-, -C(R^aR^b)-NR^c-, -C(R^aR^b)-S- и -C(R^aR^b)-C(R^aR^b)-O-, где заместители R^a, R^b и R^c имеют значения, определенные здесь, и предпочтительно представляют C_1-6-алкил и более предпочтительно С_1-4-алкил. Более предпочтительно -C(R^aR^b)-X- выбран из -CH₂-O-, -CH₂-S-, -CH₂-NH-, -CH₂-N(CH₃)-, -CH₂-CH₂-O- или -CH₂-CH₂-S-, и более предпочтительно из -CH₂-O-, -CH₂-S-, -CH₂-CH₂-O- или -CH₂-CH₂-S-, и еще более предпочтительно из -CH₂-O-, -CH₂-S- или -CH₂-CH₂-O-, и еще более предпочтительно из -CH₂-O- или -CH₂-S-, и наиболее предпочтительно представляет -CH₂-O-.

Все хиральные центры и асимметричные заместители (если таковые имеются) могут находиться в R- или в S-ориентации. Например, два иллюстративных стереохимических изомера представляют бета-D- и альфа-L-изоформы, как показано ниже:

Предпочтительные звенья LNA выбраны из общих формул (b¹)-(b⁹):

Термин «тио-LNA» включает замкнутый нуклеотид, где Х в общей формуле (II) выбран из -S- или -СН₂-S-. Тио-LNA может находиться в бета-D- и альфа-L-конфигурации.

Термин «амино-LNA» включает замкнутый нуклеотид, где Х в общей формуле (II) выбран из -NH-, -N(R)-, -СН₂-NH- и -СН₂-N(R)-, где R выбран из атома водорода и С_1-4-алкила. Амино-LNA может находиться в бета-D- и альфа-L-конфигурации.

Термин «окси-LNA» включает замкнутый нуклеотид, где Х в общей формуле (II) представляет -О-. «Окси-LNA» может находиться в бета-D- и альфа-L-конфигурации.

Термин «ЕNA» включает замкнутый нуклеотид, где Х в общей формуле (II) представляет -CH₂-O- (где атом кислорода -СН₂-O- присоединен к 2'-положению по отношению к основанию B). R^a и R^b независимо представляют атом водорода или метил.

В предпочтительных примерных вариантах осуществления LNA выбран из бета-D-окси-LNA, альфа-L-окси-LNA, бета-D-амино-LNA и бета-D-тио-LNA, в частности, бета-D-окси-LNA.

Еще более предпочтительными являются следующие антисмысловые олигонуклеотиды (таблица 1):


SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
89	17	102a	GCGAGTGACTCACTCAA
90	15	103a	CGAGTGACTCACTCA
90	16	104a	GCGAGTGACTCACTCA
90	17	105a	CGCGAGTGACTCACTCA
91	14	106a	CGAGTGACTCACTC
91	16	107a	CGCGAGTGACTCACTC
91	17	108a	GCGCGAGTGACTCACTC
92	14	109a	GCGAGTGACTCACT
92	16	110a	GCGCGAGTGACTCACT
92	17	111a	CGCGCGAGTGACTCACT
93	12	112a	CGAGTGACTCAC
93	13	113a	GCGAGTGACTCAC
93	14	114a	CGCGAGTGACTCAC
93	16	115a	CGCGCGAGTGACTCAC
93	17	116a	GCGCGCGAGTGACTCAC
94	13	117a	CGCGAGTGACTCA
94	14	118a	GCGCGAGTGACTCA
94	15	119a	CGCGCGAGTGACTCA
94	16	120a	GCGCGCGAGTGACTCA
94	17	121a	TGCGCGCGAGTGACTCA
95	14	122a	CGCGCGAGTGACTC
95	16	123a	TGCGCGCGAGTGACTC
95	17	124a	GTGCGCGCGAGTGACTC
96	13	125a	CGCGCGAGTGACT
97	14	126a	TGCGCGCGAGTGAC
97	16	127a	CGTGCGCGCGAGTGAC
98	13	128a	TGCGCGCGAGTGA
107	16	129a	GTCGTCGCTCCGTGCG
108	15	130a	GTCGTCGCTCCGTGC
108	17	131a	GTGTCGTCGCTCCGTGC
109	13	132a	TCGTCGCTCCGTG
109	15	133a	TGTCGTCGCTCCGTG
110	12	134a	TCGTCGCTCCGT
110	13	135a	GTCGTCGCTCCGT
110	14	136a	TGTCGTCGCTCCGT
110	15	137a	GTGTCGTCGCTCCGT
110	16	138a	GGTGTCGTCGCTCCGT
351	16	139a	CGTCATAGACCGAGCC
351	12	140a	ATAGACCGAGCC
354	16	141a	GCTCGTCATAGACCGA
354	13	142a	CGTCATAGACCGA
355	14	143a	CTCGTCATAGACCG
355	15	144a	GCTCGTCATAGACCG
356	14	145a	GCTCGTCATAGACC
381	17	146a	CAGCCCCCGACCCATGG
382	16	147a	CAGCCCCCGACCCATG
383	14	148a	AGCCCCCGACCCAT
384	14	149a	CAGCCCCCGACCCA
422	17	150a	CGCGTCCACAGGACGAT
425	14	151a	CGCGTCCACAGGAC
429	15	152a	CGATACGCGTCCACA
431	13	153a	CGATACGCGTCCA
431	16	154a	TGGCGATACGCGTCCA
432	12	155a	CGATACGCGTCC
432	13	156a	GCGATACGCGTCC
432	17	157a	GCTGGCGATACGCGTCC
433	15	158a	CTGGCGATACGCGTC
433	12	159a	GCGATACGCGTC
433	16	160a	GCTGGCGATACGCGTC
433	14	161a	TGGCGATACGCGTC
434	13	162a	TGGCGATACGCGT
434	14	163a	CTGGCGATACGCGT
434	12	164a	GGCGATACGCGT
435	13	165a	CTGGCGATACGCG
435	12	166a	TGGCGATACGCG
437	17	167a	ATCGTGCTGGCGATACG
449	16	168a	CGTGCGGTGGGATCGT
449	17	169a	ACGTGCGGTGGGATCGT
450	17	170a	AACGTGCGGTGGGATCG
452	15	171a	AACGTGCGGTGGGAT
452	17	172a	TGAACGTGCGGTGGGAT
459	17	173a	CGACTTCTGAACGTGCG
941	17	174a	TTAACGCGGTAGCAGTA
941	16	175a	TAACGCGGTAGCAGTA
942	17	176a	GTTAACGCGGTAGCAGT
943	15	177a	TTAACGCGGTAGCAG
944	13	178a	TAACGCGGTAGCA
945	12	179a	TAACGCGGTAGC
945	13	180a	TTAACGCGGTAGC
946	12	181a	TTAACGCGGTAG
946	13	182a	GTTAACGCGGTAG
946	15	183a	CGGTTAACGCGGTAG
946	16	184a	CCGGTTAACGCGGTAG
947	14	185a	CGGTTAACGCGGTA
947	13	186a	GGTTAACGCGGTA
947	15	187a	CCGGTTAACGCGGTA
947	16	188a	GCCGGTTAACGCGGTA
947	17	189a	TGCCGGTTAACGCGGTA
948	13	190a	CGGTTAACGCGGT
949	13	191a	CCGGTTAACGCGG
949	14	192a	GCCGGTTAACGCGG
949	15	193a	TGCCGGTTAACGCGG
950	13	194a	GCCGGTTAACGCG
950	15	195a	CTGCCGGTTAACGCG
950	16	196a	GCTGCCGGTTAACGCG
1387	16	197a	ATGCCGCGTCAGGTAC
1392	13	198a	ACATGCCGCGTCA
1393	16	199a	GATGACATGCCGCGTC
1394	12	200a	GACATGCCGCGT
1394	15	201a	GATGACATGCCGCGT
1395	13	202a	ATGACATGCCGCG
1805	17	203a	TCCCGCACCTTGGAACC
1851	16	204a	CGATCTCTCAACACGT
1851	17	205a	TCGATCTCTCAACACGT
1852	15	206a	CGATCTCTCAACACG
1852	16	207a	TCGATCTCTCAACACG
1852	17	208a	CTCGATCTCTCAACACG
2064	16	209a	GTAGTGTTTAGGGAGC
2072	16	210a	GCTATTTGGTAGTGTT
2284	15	211a	AGCTTATCCTATGAC
2285	14	212a	AGCTTATCCTATGA
2355	17	213a	CAGGCATTAATAAAGTG
4120	16	214a	CTAGGCGCCTCTATGC
4121	14	215a	TAGGCGCCTCTATG
4121	15	216a	CTAGGCGCCTCTATG
4122	13	217a	TAGGCGCCTCTAT
4217	16	218a	CATGAATGGACCAGTA

SP - стартовое положение или стартовый нуклеотид в SEQ ID NO:2

L - длина последовательности.

Антисмысловые олигонуклеотиды, раскрытые здесь, такие как антисмысловые олигонуклеотиды, представленные в таблицах 1-3, и в частности, антисмысловые олигонуклеотиды, представленные в таблицах 4-9, состоят из нуклеотидов, предпочтительно нуклеотидов ДНК, представляющих звенья, которые не являются LNA (также называемые здесь как нуклеотиды, которые не являются LNA), а также звеньев LNA (также называемых здесь как нуклеотиды LNA). Несмотря на то, что точно не указано, антисмысловые олигонуклеотиды с последовательностями SEQ ID NO: 102а-218а из таблицы 1 содержат 2-4 нуклеотида LNA (звена LNA) на 3'-конце и 2-4 нуклеотида LNA (звена LNA) на 5'-конце. Несмотря на то, что точно не указано, «С» в таблице 2, которые относятся к звеньям LNA, предпочтительно содержат 5-метилцитозин (С*) в качестве азотистого основания.

Это означает, несмотря на то, что точно не указано, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению или, как здесь раскрыто буквенным кодом А, С, G, Т и U, могут содержать любую межнуклеотидную связь, любую концевую группу и любое азотистое основание, описанные здесь. Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению или раскрытые здесь, представляют гапмеры любой гапмерной структуры, как здесь описано, по меньшей мере, с одним звеном LNA на 3'-конце и, по меньшей мере, с одним звеном LNA на 5'-конце. Кроме того, любое звено LNA, как здесь раскрыто, может быть использовано в антисмысловых олигонуклеотидах по настоящему изобретению или раскрытых здесь. Так, например, антисмысловой олигонуклеотид GCTCGTCATAGACCGA (SEQ ID NO: 13) или CGATACGCGTCCACAG (SEQ ID NO: 14) или GTAGTGTTTAGGGAGC (SEQ ID NO: 15) или GCTATTTGGTAGTGTT (SEQ ID NO: 16) или CATGAATGGACCAGTA (SEQ ID NO: 17) или AGGCATTAATAAAGTG (SEQ ID NO: 18) содержит, по меньшей мере, одно звено LNA на 5'-конце и, по меньшей мере, одно звено LNA на 3'-конце, любое азотистое основание, любую 3'-концевую группу, любую 5'-концевую группу, любую гапмерную структуру и любую межнуклеотидную связь, как здесь описано, и также включает соли и оптические изомеры этого антисмыслового олигонуклеотида.

Использование звеньев LNA является предпочтительным, особенно на терминальном 3'-конце и терминальном 5'-конце. Таким образом, предпочтительно, если последние 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце и также последние 1-5 нуклеотидов на терминальном 5'-конце, в частности, последовательностей, раскрытых здесь, и в частности, последовательностей SEQ ID NO: 102а-218а в таблице 1, представляют звенья LNA (также называемые нуклеотидами LNA), в то время как между 1-5 звеньями LNA на 3'- и 5'-конце, находится 2-14, предпочтительно 3-12, более предпочтительно 4-10, более предпочтительно 5-9, еще более предпочтительно 6-8 звеньев, которые не являются LNA (также называющиеся нуклеотидами, которые не являются LNA). Такой вид антисмысловых олигонуклеотидов называют гапмерами, и они более подробно описаны ниже. Более предпочтительными являются 2-5 нуклеотидов LNA на 3'-конце и 2-5 нуклеотидов LNA на 5'-конце или 1-4 нуклеотида LNA на 3'-конце и 1-4 нуклеотида LNA на 5'-конце и еще более предпочтительно 2-4 нуклеотида LNA на 3'-конце и 2-4 нуклеотида LNA на 5'-конце антисмысловых олигонуклеотидов с числом предпочтительно 4-10, более предпочтительно от 5-9, еще более предпочтительно 6-8 звеньев, которые не являются LNA, между звеньями LNA на 3'- и 5'-конце.

Кроме того, в качестве межнуклеотидных связей между звеньями LNA и между звеньями LNA и звеньями, которые не являются LNA, предпочтительным является использование фосфоротиоатов или фосфородитиоатов и предпочтительно фосфоротиоатов.

Таким образом, предпочтительными являются антисмысловые олигонуклеотиды, где более чем 50%, предпочтительно более чем 60%, более предпочтительно более чем 70%, еще более предпочтительно более чем 80%, и наиболее предпочтительно более чем 90% межнуклеотидных связей представляют фосфоротиоатные или фосфатные, и более предпочтительно фосфоротиоатные связи, и где последние 1-4 или 2-5 нуклеотидов на 3'-конце представляют звенья LNA, и последние 1-4 или 2-5 нуклеотидов на 5'-конце представляют звенья LNA, и между звеньями LNA на концах последовательности находится 6-14 нуклеотидов, предпочтительно 7-12, предпочтительно 8-11, более предпочтительно 8-10 звеньев, которые не являются LNA, предпочтительно звенья ДНК. Кроме того, предпочтительно, чтобы эти антисмысловые олигонуклеотиды в форме гапмеров состояли в общей сложности из 12-20, предпочтительно 12-18 нуклеотидов.

Гапмеры

Антисмысловые олигонуклеотиды по изобретению могут состоять из нуклеотидных последовательностей, которые содержат нуклеотиды ДНК, представляющие звенья, которые не являются LNA, а также нуклеотиды LNA, и они могут располагаться в виде гапмера.

Таким образом, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению, предпочтительно представляют собой гапмеры. Гапмер состоит из средней части нуклеотидных звеньев ДНК, которые не являются замкнутыми, и которые, таким образом, не являются звеньями LNA. Нуклеотиды ДНК данной средней части могут быть связаны друг с другом межнуклеотидными связями (IL), описанными здесь, которые предпочтительно представляют фосфатные группы, фосфортиоатные группы или фосфородитиоатные группы, и которые могут содержать аналоги азотистых оснований, такие как 5-пропинилцитозин, 7-метилгуанин, 7-метиладенин, 2-аминоаденин, 2-тиотимин, 2-тиоцитозин или 5-метилцитозин. Такие звенья ДНК или нуклеотиды ДНК не являются бициклическими пентозными структурами. Средняя часть звеньев, которые не являются LNA, фланкирована на 3'-конце и 5'-конце последовательностями, состоящими из звеньев LNA. Таким образом, гапмеры имеют общую формулу:

LNA-последовательность 1 - последовательность, которая не является LNA - LNA-последовательность 2

или

участок A - участок B - участок C

Средняя часть антисмыслового олигонуклеотида, которая состоит из нуклеотидных звеньев ДНК, которые не являются звеньями LNA, когда образует дуплекс с комплементарной РНК-мишенью, способна к рекрутингу РНКазы. 3'- и 5'-концевые нуклеотидные звенья представляют звенья LNA, которые предпочтительно находятся в альфа-L-конфигурации, в частности, предпочтительными являются бета-D-окси-LNA и альфа-L-окси-LNA.

Таким образом, гапмер представляет собой антисмысловой олигонуклеотид, который содержит непрерывный участок нуклеотидов ДНК, который способен к рекрутингу РНКазы, такой как РНКаза H, такой как участок, по меньшей мере, из 6 или 7 нуклеотидов ДНК, которые не являются LNA, называемые здесь средней частью или участком B, где участок В фланкирован на 3'- и 5'-концах областями нуклеотидных аналогов с повышенной аффинностью, которые представляют звенья LNA, например, 1-6 звеньями LNA 5' и 3', к непрерывному участку нуклеотидов ДНК, способному к рекрутингу РНКазы - эти фланкирующие области относятся к участкам А и С соответственно.

Предпочтительно гапмер содержит (поли)нуклеотидную последовательность формулы (5'к 3') A-B-C или необязательно A-B-C-D или D-A-B-C, где; участок А (5'-область) состоит, по меньшей мере, из одного нуклеотидного аналога, например, по меньшей мере, одного звена LNA, например, 1-6 звеньев LNA, и участок В состоит, по меньшей мере, из пяти последовательных нуклеотидов ДНК, представляющих звенья, которые не являются LNA, и которые способны к рекрутингу РНКазы (при образовании дуплекса с комплементарной молекулой РНК, такой как мРНК-мишень), и участок С (3'-область) состоит, по меньшей мере, из одного нуклеотидного аналога, например, по меньшей мере, одного звена LNA, например, 1-6 звеньев LNA, и область D, если она присутствует, состоит из 1, 2 или 3 нуклеотидных звеньев ДНК, представляющих звенья, которые не являются LNA.

В некоторых вариантах осуществления участок А состоит из 1, 2, 3, 4, 5 или 6 звеньев LNA, например, 2-5 звеньев LNA, например, 3 или 4 звеньев LNA; и/или участок С состоит из 1, 2, 3, 4, 5 или 6 звеньев LNA, например, 2-5 звеньев LNA, например, 3 или 4 звеньев LNA.

В некоторых вариантах осуществления участок В состоит из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 последовательных нуклеотидов ДНК, которые способны к рекрутингу РНКазы, или 6-10, или 7-9, например, 8 последовательных нуклеотидов, которые способны к рекрутингу РНКазы. В некоторых вариантах осуществления участок В состоит, по меньшей мере, из одного нуклеотидного звена ДНК, например, 1-12 нуклеотидных звеньев ДНК, предпочтительно 4-12 нуклеотидных звеньев ДНК, более предпочтительно 6-10 нуклеотидных звеньев ДНК, еще более предпочтительно, например, 7-10 нуклеотидных звеньев ДНК и наиболее предпочтительно, 8, 9 или 10 нуклеотидных звеньев ДНК, представляющих звенья, которые не являются LNA.

В некоторых вариантах осуществления участок А состоит из 3 или 4 LNA, участок В состоит из 7, 8, 9 или 10 нуклеотидных звеньев ДНК, и участок С состоит из 3 или 4 звеньев LNA. Такие конструкции включают (A-B-C): 1-7-2, 2-7-1, 2-7-2, 3-7-1, 3-7-2, 1-7-3, 2-7-3, 3-7-3, 2-7-4, 3-7-4, 4-7-2, 4-7-3, 4-7-4, 1-8-1, 1-8-2, 2-8-1, 2-8-2, 1-8-3, 3-8-1, 3-8-3, 2-8-3, 3-8-2, 4-8-1, 4-8-2, 1-8-4, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 1-9-1, 1-9-2, 2-9-1, 2-9-2, 2-9-3, 3-9-2, 3-9-3, 1-9-3, 3-9-1, 4-9-1, 1-9-4, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 1-10-1, 1-10-2, 2-10-1, 2-10-2, 1-10-3, 3-10-1, 2-10-2, 2-10-3, 3-10-2, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 1-11-1, 1-11-2, 2-11-1, 2-11-2, 1-11-3, 3-11-1, 2-11-2, 2-11-3, 3-11-2, 3-11-3, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3, 4-11-4, и могут дополнительно включать участок D, который может содержать 1 или 2 нуклеотидных звена ДНК, которые не являются звеньями LNA.

Другие гапмерные конструкции раскрыты в международной заявке WO2004/046160A, которая включена здесь в качестве ссылки. Предварительная заявка на патент США 60/977409, включенная здесь в качестве ссылки, относится к короткомерным гапмерным антисмысловым олигонуклеотидам, которые также подходят для настоящего изобретения.

В некоторых вариантах осуществления антисмысловой олигонуклеотид состоит из непрерывной нуклеотидной последовательности в общей сложности из 10, 11, 12, 13 или 14 нуклеотидных звеньев (звеньев LNA и звеньев, которые не являются LNA вместе), где эта непрерывная нуклеотидная последовательность имеет формулу (5'-3'), А-В-С, или необязательно A-B-C-D или D-A-B-C, где участок А состоит из 1, 2 или 3 звеньев LNA, и участок В состоит из 7, 8 или 9 непрерывных нуклеотидных звеньев ДНК, которые не являются звеньями LNA, и которые способны к рекрутингу РНКазы при образовании дуплекса с комплементарной молекулой РНК (например, мРНК-мишенью), и участок С состоит из 1, 2 или 3 звеньев LNA. Когда он присутствует, то участок D состоит из одного нуклеотидного звена ДНК, которое не является LNA.

В некоторых вариантах осуществления участок А состоит из 1 звена LNA. В некоторых вариантах осуществления состоит участок А из 2 звеньев LNA. В некоторых вариантах осуществления участок С состоит из 3 звеньев LNA. В некоторых вариантах осуществления участок С состоит из 2 звеньев LNA. В некоторых вариантах осуществления участок С состоит из 3 звеньев LNA. В некоторых вариантах осуществления участок В состоит из 7 нуклеотидных звеньев ДНК, которые не являются LNA. В некоторых вариантах осуществления участок В состоит из 8 нуклеотидных звеньев ДНК. В некоторых вариантах осуществления участок В состоит из 9 нуклеотидных звеньев ДНК. В некоторых вариантах осуществления участок В состоит из 1-9 нуклеотидных звеньев ДНК, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 нуклеотидных звеньев ДНК. Нуклеотидные звенья ДНК всегда представляют звенья, которые не являются LNA. В некоторых вариантах осуществления участок В содержит 1, 2 или 3 звена LNA, которые предпочтительно находятся в альфа-L-конфигурации и которые более предпочтительно представляют звенья альфа-окси-L-LNA. В некоторых вариантах осуществления число нуклеотидов, присутствующих в A-B-C, выбрано из группы, состоящей из (звенья LNA-участок В-звенья LNA и более предпочтительно звенья альфа-L-окси-LNA (участок А)-участок В-(участок С) звенья альфа-L-окси-LNA): 1-8-1, 1-8-2, 2-8-1, 2-8-2, 1-8-3, 3-8-1, 3-8-3, 2-8-3, 3-8-2, 4-8-1, 4-8-2, 1-8-4, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 1-9-1, 1-9-2, 2-9-1, 2-9-2, 2-9-3, 3-9-2, 3-9-3, 1-9-3, 3-9-1, 4-9-1, 1-9-4, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 1-10-1, 1-10-2, 2-10-1, 2-10-2, 1-10-3, 3-10-1, 2-10-2, 2-10-3, 3-10-2, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 1-11-1, 1-11-2, 2-11-1, 2-11-2, 1-11-3, 3-11-1, 2-11-2, 2-11-3, 3-11-2, 3-11-3, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3, 4-11-4. В других предпочтительных вариантах осуществления число нуклеотидов в A-B-C выбрано из группы, состоящей из: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3, и еще более предпочтительно представляет: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

Фосфоротиоатные, фосфатные или фосфородитиоатные и особенно фосфортиоатные межнуклеотидные связи также являются предпочтительными, в частности, для участка B гапмера. Фосфоротиоатные, фосфатные или фосфородитиоатные связи и особенно фосфоротиоатные межнуклеотидные связи также могут быть использованы для фланкирующих участков (А и С, и для связывания А или С с D, и в участке D, если он присутствует).

Однако участки A, В и С могут содержать межнуклеотидные связи, иные, чем фосфоротиоатные или фосфородитиоатные, такие как фосфодиэфирные связи, в частности, например, когда применение нуклеотидных аналогов защищает межнуклеотидные связи в участках А и С от разрушения под воздействием эндонуклеазы, когда участки А и С состоят из звеньев LNA.

Межнуклеотидные связи в антисмысловом олигонуклеотиде могут быть фосфодиэфирными, фосфоротиоатными, фосфордитиоатными или боранофосфатными таким образом, чтобы обеспечить расщепление РНК-мишени РНКазой Н. Фосфоротиоат или фосфородитиоат являются предпочтительными для повышения устойчивости к воздействию нуклеаз и по другим причинам, таким простота производства. В одном аспекте олигомера по изобретению, звенья LNA и/или звенья, которые не являются LNA, связаны друг с другом фосфоротиоатными группами.

Следует понимать, что включение фосфодиэфирных связей, например, одной или двух связей, иначе в антисмысловой олигонуклеотид с фосфортиоатными связями, в частности, между или рядом с звеньями LNA (как правило, в участке А и/или С) может изменить биодоступность и/или биологическое распределение антисмыслового олигонуклеотида (см. WO2008/053314A, которая включена здесь в качестве ссылки).

В некоторых вариантах осуществления, например, в последовательностях антисмысловых олигонуклеотидов, раскрытых здесь, и где это подходит и не указано конкретно, все остальные группы межнуклеотидных связей представляют фосфодиэфирные группы или фосфортиоатные группы, или их комбинации.

В некоторых вариантах осуществления все группы межнуклеотидных связей представляют фосфоротиоатные группы. При обращении к специфическим гапмерным последовательностям антисмысловых олигонуклеотидов, описанных здесь, следует понимать, что в различных вариантах осуществления, когда связи представляют фосфоротиоатные связи, то можно использовать альтернативные связи, такие как здесь описаны, например, фосфатные связи (также называемые фосфодиэфирными связями), в частности, для связей между нуклеотидными аналогами, такими как звенья LNA. Аналогично, при обращении к специфическим гапмерным последовательностям антисмысловых олигонуклеотидов, описанных здесь, когда остатки C представляют 5'-метил-модифицированный цитозин, в различных вариантах осуществления, то один или более C, присутствующих в олигомере, могут представлять немодифицированные остатки C.

Список условных обозначений

Как здесь используется, аббревиатуры b, d, s, ss имеют следующее значение:

b	звено LNA или нуклеотид LNA (любой выбранный из b1-b7)
b¹	β-D-окси-LNA
b²	β-D-тио-LNA
b³	β-D-амино-LNA
b⁴	α-L-окси-LNA
b⁵	β-D-ENA
b⁶	β-D-(NH)-LNA
b⁷	β-D-(NCH₃)-LNA
d	2-дезокси означает 2-дезоксирибозные звенья (например, формула B3 или B5 с R=-H)
C*	метил-С (5-метилцитозин); [следовательно, dС* представляет 5-метил-2'-дезоксицитидин]
A*	2-аминоаденин [следовательно, dА* представляет 2-амино-2'-дезоксиаденозин]
s	межнуклеотидная связь представляет фосфоротиоатную группу (-O-P(O)(S^-)O)
ss	межнуклеотидная связь представляет фосфородитиоатную группу (-O-P(S)(S^-)O)
/5SpC3/	-O-P(O)(O^-)OC₃H₆OH в 5'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида
/3SpC3/	-O-P(O)(O^-)OC₃H₆OH в 3'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида
/5SpC3s/	-O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH в 5'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида
/3SpC3s/	-O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH в 3'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида

нуклеотиды, выделенные жирным шрифтом, представляют нуклеотиды LNA

нуклеотиды, не выделенные жирным шрифтом, представляют нуклеотиды, которые не являются LNA.

Гапмерные последовательности

Следующие антисмысловые олигонуклеотиды в форме гапмеров, приведенные в таблицах 2-9 и более предпочтительно в таблицах 4-9, являются особенно предпочтительными.

Таблица 2
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
89	17	102b	GbsCbsGbsAbsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsdCsTbsCbsAbsAb
90	15	103b	CbsGbsAbsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsdCsTbsCbsAb
90	16	104b	GbsCbsGbsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsdCsTbsCbsAb
90	17	105b	CbsGbsCbsGbsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsCbsTbsCbsAb
91	14	106b	CbsGbsAbsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsCbsTbsCb
91	16	107b	CbsGbsCbsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsdAsCbsTbsCb
91	17	108b	GbsCbsGbsCbsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsAbsCbsTbsCb
92	14	109b	GbsCbsGbsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsAbsCbsTb
92	16	110b	GbsCbsGbsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsAbsCbsTb
92	17	111b	CbsGbsCbsGbsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsCbsAbsCbsTb
93	12	112b	CbsGbsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsAbsCb
93	13	113b	GbsCbsGbsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsdCsAbsCb
93	14	114b	CbsGbsCbsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsCbsAbsCb
93	16	115b	CbsGbsCbsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsCbsAbsCb
93	17	116b	GbsCbsGbsCbsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsTbsCbsAbsCb
94	13	117b	CbsGbsCbsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsdTsCbsAb
94	14	118b	GbsCbsGbsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsTbsCbsAb
94	15	119b	CbsGbsCbsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsTbsCbsAb
94	16	120b	GbsCbsGbsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsdCsTbsCbsAb
94	17	121b	TbsGbsCbsGbsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsCbsTbsCbsAb
95	14	122b	CbsGbsCbsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsCbsTbsCb
95	16	123b	TbsGbsCbsdGsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsCbsTbsCb
95	17	124b	GbsTbsGbsCbsdGsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsAbsCbsTbsCb
96	13	125b	CbsGbsCbsdGsdCsdGsdAsdGsdTsdGsdAsCbsTb
97	14	126b	TbsGbsCbsdGsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsGbsAbsCb
97	16	127b	CbsGbsTbsdGsdCsdGsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsGbsAbsCb
98	13	128b	TbsGbsCbsdGsdCsdGsdCsdGsdAsdGsdTsGbsAb
107	16	129b	GbsTbsCbsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsdGsdTsGbsCbsGb
108	15	130b	GbsTbsCbsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsdGsTbsGbsCb
108	17	131b	GbsTbsGbsTbsdCsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsGbsTbsGbsCb
109	13	132b	TbsCbsGbsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsdGsTbsGb
109	15	133b	TbsGbsTbsdCsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsGbsTbsGb
110	12	134b	TbsCbsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsGbsTb
110	13	135b	GbsTbsCbsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsdCsGbsTb
110	14	136b	TbsGbsTbsdCsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsCbsGbsTb
110	15	137b	GbsTbsGbsdTsdCsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsCbsGbsTb
110	16	138b	GbsGbsTbsdGsdTsdCsdGsdTsdCsdGsdCsdTsdCsCbsGbsTb
351	16	139b	CbsGbsTbsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsGbsCbsCb
351	12	140b	AbsTbsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsdGsCbsCb
354	16	141b	GbsCbsTbsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCbsGbsAb
354	13	142b	CbsGbsTbsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGbsAb
355	14	143b	CbsTbsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCbsCbsGb
355	14	143c	CbsTbsCbsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCbsGb
355	14	143d	CbsTbsCbsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCbsCbsGb
355	15	144b	GbsCbsTbsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCbsCbsGb
356	14	145b	GbsCbsTbsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAbsCbsCb
381	17	146b	CbsAbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAbsTbsGbsGb
382	16	147b	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAbsTbsGb
382	16	147c	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAsTsG
382	16	147d	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTbsGb
382	16	147e	CbsAbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAbsTbsGb
382	16	147f	CbsAbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTbsGb
383	14	148b	AbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTb
383	14	148c	AbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAbsTb
383	14	148d	AbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTb
384	14	149	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsCbsCbsAb
422	17	150b	CbsGbsCbsGbsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsdGsdAsCbsGbsAbsTb
425	14	151b	CbsGbsCbsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGbsAbsCb
429	15	152b	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAbsCbsAb
429	15	152c	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCbsAbsCbsAb
429	15	152d	CbsGbsAbsTbsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAbsCbsAb
432	12	155b	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsCb
431	13	153b	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCbsAb
431	13	153c	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsCbsAb
431	16	154b	TbsGbsGbsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsCbsAb
432	12	155c	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb
432	12	155d	CbsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsCb
432	13	156b	GbsCbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsCb
432	17	157b	GbsCbsTbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTbsCbsCb
433	15	158b	CbsTbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTbsCb
433	12	159b	GbsCbsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsTbsCb
433	16	160b	GbsCbsTbsdGsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTbsCb
433	14	161b	TbsGbsGbsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTbsCb
434	12	164b	GbsGbsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTb
434	13	162b	TbsGbsGbsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsGbsTb
434	13	162c	TbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsCbsGbsTb
434	14	163b	CbsTbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsCbsGbsTb
435	13	165b	CbsTbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsCbsGb
435	12	166b	TbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsCbsGb
437	17	167b	AbsTbsCbsGbsdTsdGsdCsdTsdGsdGsdCsdGsdAsTbsAbsCbsGb
449	16	168b	CbsGbsTbsdGsdCsdGsdGsdTsdGsdGsdGsdAsdTsCbsGbsTb
449	17	169b	AbsCbsGbsTbsdGsdCsdGsdGsdTsdGsdGsdGsdAsTbsCbsGbsTb
450	17	170b	AbsAbsCbsGbsdTsdGsdCsdGsdGsdTsdGsdGsdGsAbsTbsCbsGb
452	15	171b	AbsAbsCbsdGsdTsdGsdCsdGsdGsdTsdGsdGsGbsAbsTb
452	17	172b	TbsGbsAbsAbsdCsdGsdTsdGsdCsdGsdGsdTsdGsGbsGbsAbsTb
459	17	173b	CbsGbsAbsCbsdTsdTsdCsdTsdGsdAsdAsdCsdGsTbsGbsCbsGb
941	17	174b	TbsTbsAbsAbsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsdGsdCsAbsGbsTbsAb
941	16	175b	TbsAbsAbsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsdGsdCsdAsGbsTbsAb
942	17	176b	GbsTbsTbsAbsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsdGsCbsAbsGbsTb
943	15	177b	TbsTbsAbsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsdGsCbsAbsGb
944	13	178b	TbsAbsAbsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsdGsCbsAb
945	12	179b	TbsAbsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsGbsCb
945	13	180b	TbsTbsAbsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsdAsGbsCb
946	12	181b	TbsTbsdAsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsAbsGb
946	13	182b	GbsTbsTbsdAsdAsdCsdGsdCsdGsdGsdTsAbsGb
946	15	183b	CbsGbsGbsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsdGsTbsAbsGb
946	16	184b	CbsCbsGbsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsdGsTbsAbsGb
947	14	185b	CbsGbsGbsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsGbsTbsAb
947	13	186b	GbsGbsTbsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsdGsTbsAb
947	15	187b	CbsCbsGbsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsGbsTbsAb
947	16	188b	GbsCbsCbsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsGbsTbsAb
947	17	189b	TbsGbsCbsCbsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsGbsGbsTbsAb
948	13	190b	CbsGbsGbsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsdGsGbsTb
949	13	191b	CbsCbsGbsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsdCsGbsGb
949	14	192b	GbsCbsCbsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsCbsGbsGb
949	15	193b	TbsGbsCbsdCsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsCbsGbsGb
950	13	194b	GbsCbsCbsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsdGsCbsGb
950	15	195b	CbsTbsGbsdCsdCsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsGbsCbsGb
950	16	196b	GbsCbsTbsdGsdCsdCsdGsdGsdTsdTsdAsdAsdCsGbsCbsGb
1387	16	197b	AbsTbsGbsdCsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdAsdGsdGsTbsAbsCb
1392	13	198b	AbsCbsAbsdTsdGsdCsdCsdGsdCsdGsdTsCbsAb
1393	16	199b	GbsAbsTbsdGsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsdCsGbsTbsCb
1393	16	199c	GbsAbsTbsdGsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGbsTbsCb
1393	16	199d	GbsAbsTbsGbsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsdCsGbsTbsCb
1393	16	199e	GbsAbsTbsGbsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGbsTbsCb
1394	12	200b	GbsAbsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsdCsGbsTb
1394	15	201b	GbsAbsTbsdGsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGbsTb
1395	13	202b	AbsTbsGbsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGb
1805	17	203b	TbsCbsCbsCbsdGsdCsdAsdCsdCsdTsdTsdGsdGsAbsAbsCbsCb
1851	16	204b	CbsGbsAbsdTsdCsdTsdCsdTsdCsdAsdAsdCsdAsCbsGbsTb
1851	17	205b	TbsCbsGbsAbsdTsdCsdTsdCsdTsdCsdAsdAsdCsAbsCbsGbsTb
1852	15	206b	CbsGbsAbsdTsdCsdTsdCsdTsdCsdAsdAsdCsAbsCbsGb
1852	16	207b	TbsCbsGbsdAsdTsdCsdTsdCsdTsdCsdAsdAsdCsAbsCbsGb
1852	17	208b	CbsTbsCbsGbsdAsdTsdCsdTsdCsdTsdCsdAsdAsCbsAbsCbsGb
2064	16	209b	GbsTbsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsCb
2064	16	209c	GbsTbsAbsGbsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsCb
2064	16	209d	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsCb
2064	16	209e	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGbsCb
2064	16	209f	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAbsGbsCb
2064	16	209g	GbsTbsAbsGbsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAbsGbsCb
2064	16	209h	GbsTbsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsCb
2064	16	209i	GbsTbsAbsGbsTbsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAbsGbsCb
2064	16	209j	GbsTbsAbsGbsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsGbsGbsAbsGbsCb
2064	16	209k	GbsTbsAbsGbsTbsdGsdTsdTsdTsdAsdGsGbsGbsAbsGbsCb
2072	16	210b	GbsCbsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
2072	16	210c	GbsCbsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTbsTb
2072	16	210d	GbsCbsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
2072	16	210e	GbsCbsTbsAbsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
2072	16	210f	GbsCbsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTbsGbsTbsTb
2072	16	210g	GbsCbsTbsAbsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTbsGbsTbsTb
2284	15	211b	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsdTsGbsAbsCb
2284	15	211c	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsTbsGbsAbsCb
2284	15	211d	AbsGbsCbsTbsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsdTsGbsAbsCb
2285	14	212b	AbsGbsdCsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsTbsGbsAb
2285	14	212c	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsdTsGbsAb
2285	14	212d	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsTbsGbsAb
2355	17	213b	CbsAbsGbsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGbsTbsGb
2355	17	213c	CbsAbsGbsGbsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGbsTbsGb
2355	17	213d	CbsAbsGbsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAbsGbsTbsGb
2355	17	213e	CbsAbsGbsGbsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAbsGbsTbsGb
4217	16	218d	CbsAbsTbsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGbsTbsAb
4217	16	218e	CbsAbsTbsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAbsGbsTbsAb
4217	16	218f	CbsAbsTbsGbsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGbsTbsAb
4217	16	218g	CbsAbsTbsGbsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAbsGbsTbsAb
4120	16	214	CbsTbsAbsdGsdGsdCsdGsdCsdCsdTsdCsdTsdAsTbsGbsCb
4121	14	215b	TbsAbsGbsdGsdCsdGsdCsdCsdTsdCsdTsAbsTbsGb
4121	15	216b	CbsTbsAbsdGsdGsdCsdGsdCsdCsdTsdCsdTsAbsTbsGb
4122	13	217b	TbsAbsGbsdGsdCsdGsdCsdCsdTsdCsdTsAbsTb
Таблица 3
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2064	16	209m	GbsTbsAbsGbsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsC*b
2064	16	209n	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsC*b
2064	16	209o	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGbsC*b
2064	16	209p	GbsTbsAbsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAbsGbsC*b
2064	16	209q	GbsTbsAbsGbsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAbsGbsC*b
2064	16	209r	GbsTbsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAbsGbsC*b
429	15	152e	CbsGbsAbsTbsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAbsCbsAb
4217	16	218j	CbsAbsTbsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAbsGbsTbsAb
2355	17	213f	CbsAbsGbsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAbsGbsTbsGb
2355	17	213g	CbsAbsGbsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGbsTbsGb
432	12	155e	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsC*b
4217	16	218h	CbsAbsTbsGbsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAbsGbsTbsAb
2072	16	210h	GbsC*bsTbsAbsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
2072	16	210i	GbsC*bsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
432	12	155f	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsC*b
2072	16	210j	GbsC*bsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTbsTb
432	12	155g	CbsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsC*b
431	13	153d	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsC*bsAb
429	15	152f	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAbsCbsAb
4217	16	218i	CbsAbsTbsGbsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsGbsTbsAb
1393	16	199f	GbsAbsTbsdGsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsdCsGbsTbsC*b
2285	14	212e	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdC*sdTsdAsdTsGbsAb
355	14	143e	CbsTbsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCbsC*bsGb
2072	16	210k	GbsC*bsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGbsTbsTb
1393	16	199g	GbsAbsTbsdGsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGbsTbsC*b
2355	17	213h	CbsAbsGbsGbsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAbsGbsTbsGb
429	15	152g	CbsGbsAbsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCbsAbsCbsAb
2285	14	212f	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdC*sdTsdAsTbsGbsAb
355	14	143f	CbsTbsCbsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCbsC*bsGb
1393	16	199h	GbsAbsTbsGbsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsCbsGbsTbsC*b
1393	16	199i	GbsAbsTbsGbsdAsdCsdAsdTsdGsdCsdCsdGsdCsGbsTbsC*b
4217	16	218k	CbsAbsTbsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsGbsTbsAb
2285	14	212g	AbsGbsdCsdTsdTsdAsdTsdCsdC*sdTsdAsTbsGbsAb
434	13	162d	TbsGbsGbsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdC*sGbsTb
383	14	148e	AbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAbsTb
431	13	153e	CbsGbsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCbsC*bsAb
2284	15	211e	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsdTsGbsAbsCb
355	14	143g	CbsTbsCbsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*bsGb
2284	15	211f	AbsGbsCbsdTsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsTbsGbsAbsCb
383	14	148f	AbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTb
383	14	148g	AbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsCbsAbsTb
382	16	147g	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdC*sAbsTbsGb
2072	16	210m	GbsC*bsTbsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTbsGbsTbsTb
2072	16	210n	GbsC*bsTbsAbsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTbsGbsTbsTb
434	13	162e	TbsGbsdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsC*bsGbsTb
2284	15	211g	AbsGbsCbsTbsdTsdAsdTsdCsdCsdTsdAsdTsGbsAbsCb
382	16	147h	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsC*bsAbsTbsGb
382	16	147i	CbsAbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdC*sAbsTbsGb
382	16	147j	CbsAbsGbsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdC*sAbsTbsGb
2355	17	213i	CbsAbsGbsGbsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGbsTbsGb
382	16	147k	CbsAbsGbsCbsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsC*bsAbsTbsGb

Предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды

Далее раскрываются предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению.

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20, и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и на терминальном 3'-конце последовательности находится, по меньшей мере, 6, предпочтительно, 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью 5'-N¹-GTCATAGA-N²-3' (SEQ. ID NO: 12) или 5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3' (SEQ. ID NO: 98) или 5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3' (SEQ. ID NO: 10) или 5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3' (SEQ. ID NO: 11) или 5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3' (SEQ. ID NO: 100) или 5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3' (SEQ. ID NO: 101), где:

N³ представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGAT-, GTGGGATCGTGCTGGCGAT-, TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC,

-GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATC, -GAGCCGTCTTCAGGAAT, -GAGCCGTCTTCAGGAA, -GAGCCGTCTTCAGGA, -GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G;

или где N¹-N¹² представляют любой из ограниченных списков остатков, раскрытых здесь,

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20, и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и на терминальном 3'-конце последовательности находится, по меньшей мере, 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью 5'-N¹-GTCATAGA-N²-3' (SEQ. ID NO: 12), где:

N¹ представляет: GGCAGACCCCGCTGCTC-, GCAGACCCCGCTGCTC-, CAGACCCCGCTGCTC-, AGACCCCGCTGCTC-, GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-;

и солям и опти ческим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N¹ и/или N² также могут представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, раскрытых здесь.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S1:

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

(SEQ. ID NO: 12)

являются следующие:

CCGCTGCTCGTCATAGAC	(SEQ. ID NO: 19)
CGCTGCTCGTCATAGACC	(SEQ. ID NO: 20)
CTGCTCGTCATAGACCGA	(SEQ. ID NO: 22)
TGCTCGTCATAGACCGAG	(SEQ. ID NO: 23)
GCTCGTCATAGACCGAGC	(SEQ. ID NO: 24)
CTCGTCATAGACCGAGCC	(SEQ. ID NO: 25)
TCGTCATAGACCGAGCCC	(SEQ. ID NO: 26)
CGTCATAGACCGAGCCCC	(SEQ. ID NO: 27)
CGCTGCTCGTCATAGAC	(SEQ. ID NO: 28)
GCTGCTCGTCATAGACC	(SEQ. ID NO: 29)
CTGCTCGTCATAGACCG	(SEQ. ID NO: 30)
TGCTCGTCATAGACCGA	(SEQ. ID NO: 31)
GCTCGTCATAGACCGAG	(SEQ. ID NO: 32)
CTCGTCATAGACCGAGC	(SEQ. ID NO: 33)
TCGTCATAGACCGAGCC	(SEQ. ID NO: 34)
CGTCATAGACCGAGCCC	(SEQ. ID NO: 35)
GCTGCTCGTCATAGAC	(SEQ. ID NO: 36)
CTGCTCGTCATAGACC	(SEQ. ID NO: 37)
TGCTCGTCATAGACCG	(SEQ. ID NO: 38)
GCTCGTCATAGACCGA	(SEQ. ID NO: 39)
CTCGTCATAGACCGAG	(SEQ. ID NO: 40)
TCGTCATAGACCGAGC	(SEQ. ID NO: 41)
CGTCATAGACCGAGCC	(SEQ. ID NO: 42)
CTGCTCGTCATAGAC	(SEQ. ID NO: 43)
TGCTCGTCATAGACC	(SEQ. ID NO: 44)
GCTCGTCATAGACCG	(SEQ. ID NO: 45)
CTCGTCATAGACCGA	(SEQ. ID NO: 46)
TCGTCATAGACCGAG	(SEQ. ID NO: 47)
CGTCATAGACCGAGC	(SEQ. ID NO: 48)
TGCTCGTCATAGAC	(SEQ. ID NO: 49)
GCTCGTCATAGACC	(SEQ. ID NO: 50)
CTCGTCATAGACCG	(SEQ. ID NO: 51)
TCGTCATAGACCGA	(SEQ. ID NO: 52)
CGTCATAGACCGAG	(SEQ. ID NO: 53)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S1 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК -LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S1 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), описанные здесь, в частности, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и предпочтительно раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать стандартные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, описанные в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S1 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, описанную здесь, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S1 необязательно могут также содержать концевые группы в терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S1, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК, и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S1 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3 и еще более предпочтительной: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S1, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на результатах экспериментов, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также с учетом сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

К настоящему времени не было найдено никакой конкретной 3'-концевой группы или 5'-концевой группы, которая заметно изменяла или повышала стабильность или активность в отношении онкологических или неврологических заболеваний, таким образом, 3'- и 5'-концевые группы возможны, но явно не являются предпочтительными.

Возможны различные межнуклеотидные мостики или межнуклеотидные связи. В приведенных здесь формулах межнуклеотидная связь IL представлена -IL'-Y-. Таким образом, IL=-IL'-Y-=-X''-P(=X')(X^-)-Y-, где IL предпочтительно выбрана из группы, состоящей из: -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(CH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₃)-O-, -O-P(O)(NH(CH₃))-O-, -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-, -O-P(O)(BH₃^-)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-O-, -O-P(O)(O^-)-N(CH₃)-, -N(CH₃)-P(O)(O^-)-O-. Предпочтительными являются межнуклеотидные связи IL, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(OCH₃)-O-, -O-P(O)(NH(CH₃))-O-, -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O-, и более предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, и еще более предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, и наиболее предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O- и -O-P(O)(S^-)-O-.

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

(SEQ ID NO: 12)

где:

N¹ представляет: GGCAGACCCCGCTGCTC-, GCAGACCCCGCTGCTC-, CAGACCCCGCTGCTC-, AGACCCCGCTGCTC-, GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-,CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-;

нуклеотиды LNA выбраны из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹); и предпочтительно из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и

межнуклеотидные связи выбраны из: -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(CH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₃)-O-, -O-P(O)(NH(CH₃))-O-, -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-, -O-P(O)(BH₃^-)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-O-, -O-P(O)(O^-)-N(CH₃)-, -N(CH₃)-P(O)(O^-)-O-;

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин и/или 2-аминоаденин.

Более предпочтительно N¹ представляет: CAGACCCCGCTGCTC-, AGACCCCGCTGCTC-, GACCCCGCTGCTC-, ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; и

N² представляет: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC, -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCA, -CCGAGCCCCCAG, -CCGAGCCCCCAGC, -CCGAGCCCCCAGCG или -CCGAGCCCCCAGCGC.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3'

(SEQ ID NO: 12)

где:

N¹ представляет: ACCCCGCTGCTC-, CCCCGCTGCTC-, CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; предпочтительно N¹ представляет: CCCGCTGCTC-, CCGCTGCTC-, CGCTGCTC-, GCTGCTC-, CTGCTC-, TGCTC-, GCTC-, CTC-, TC- или C-; и

N² представляет: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC или -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCA или -CCGAGCCCCCAG; предпочтительно N² представляет: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGC, -CCGAGCC, -CCGAGCCC, -CCGAGCCCC или -CCGAGCCCCC;

и нуклеотиды LNA выбраны из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из: -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-; и предпочтительно выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата;

и солям и опти ческим изомерам антисмыслового олигонуклеотида. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин и/или 2-аминоаденин.

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 19-SEQ ID NO: 53, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 4 (SEQ ID NO: 232a-244b).

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

(SEQ ID NO: 98)

где:

N³ представляет: GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-;

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGTGCAGC, -ACAGGACGATGTGCAG, -ACAGGACGATGTGCA, -ACAGGACGATGTGC, -ACAGGACGATGTG, -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A;

и солям и оптически изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N³ и/или N⁴ могут также представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, раскрытых здесь.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S2:

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3'

(SEQ ID NO: 98)

являются следующие:

GCTGGCGATACGCGTCCA	(SEQ ID NO: 54)
CTGGCGATACGCGTCCAC	(SEQ ID NO: 55)
TGGCGATACGCGTCCACA	(SEQ ID NO: 56)
GGCGATACGCGTCCACAG	(SEQ ID NO: 57)
GCGATACGCGTCCACAGG	(SEQ ID NO: 58)
CGATACGCGTCCACAGGA	(SEQ ID NO: 59)
GATACGCGTCCACAGGAC	(SEQ ID NO: 60)
ATACGCGTCCACAGGACG	(SEQ ID NO: 61)
TACGCGTCCACAGGACGA	(SEQ ID NO: 62)
CTGGCGATACGCGTCCA	(SEQ ID NO: 63)
TGGCGATACGCGTCCAC	(SEQ ID NO: 64)
GGCGATACGCGTCCACA	(SEQ ID NO: 65)
GCGATACGCGTCCACAG	(SEQ ID NO: 66)
CGATACGCGTCCACAGG	(SEQ ID NO: 67)
GATACGCGTCCACAGGA	(SEQ ID NO: 68)
ATACGCGTCCACAGGAC	(SEQ ID NO: 349)
TACGCGTCCACAGGACG	(SEQ ID NO: 350)
TGGCGATACGCGTCCA	(SEQ ID NO: 351)
GGCGATACGCGTCCAC	(SEQ ID NO: 352)
GCGATACGCGTCCACA	(SEQ ID NO: 353)
CGATACGCGTCCACAG	(SEQ ID NO: 354)
GATACGCGTCCACAGG	(SEQ ID NO: 355)
ATACGCGTCCACAGGA	(SEQ ID NO: 356)
TACGCGTCCACAGGAC	(SEQ ID NO: 357)
GGCGATACGCGTCCA	(SEQ ID NO: 358)
GCGATACGCGTCCAC	(SEQ ID NO: 359)
CGATACGCGTCCACA	(SEQ ID NO: 360)
GATACGCGTCCACAG	(SEQ ID NO: 361)
ATACGCGTCCACAGG	(SEQ ID NO: 362)
TACGCGTCCACAGGA	(SEQ ID NO: 363)
GCGATACGCGTCCA	(SEQ ID NO: 364)
CGATACGCGTCCAC	(SEQ ID NO: 365)
GATACGCGTCCACA	(SEQ ID NO: 366)
ATACGCGTCCACAG	(SEQ ID NO: 367)
TACGCGTCCACAGG	(SEQ ID NO: 368)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S2 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК-LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S2 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), описанные здесь, в частности, таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и, предпочтительно таковые, раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, как описано в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S2 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, описанную здесь, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S2 необязательно могут также содержать концевые группы в терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S1, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S2 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3 и еще более предпочтительной: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S2, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на экспериментах, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также в отношении сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

К настоящему времени не было найдено никакой конкретной 3'-концевой группы или 5'-концевой группы, которая заметно изменяла или повышала стабильность или активность в отношении онкологических или неврологических заболеваний, но явно не являются предпочтительными.

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3

(SEQ ID NO: 98)

где:

и нуклеотиды LNA выбраны из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹); и предпочтительно из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

Более предпочтительно N³ представляет: GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-; и

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGTGCA, -ACAGGACGATGTGC, -ACAGGACGATGTG, -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно, по меньшей мере, 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью 5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3' (SEQ ID NO: 98), где

N³ представляет: CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-; предпочтительно N³ представляет: TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или T-; и

N⁴ представляет: -ACAGGACGATGT, -ACAGGACGATG, -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A; предпочтительно N⁴ представляет: -ACAGGACGAT, -ACAGGACGA, -ACAGGACG, -ACAGGAC, -ACAGGA, -ACAGG, -ACAG, -ACA, -AC или -A;

и солям и опти ческим изомерам антисмыслового олигонуклеотида. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин и/или 2-аминоаденин.

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 54-SEQ ID NO: 68 и SEQ ID NO: 349-SEQ ID NO: 368, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами из звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 5 (SEQ ID NO: 245a-257b).

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью 5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3' (SEQ ID NO: 10), где:

N¹¹ представляет: GAAGAGCTATTTGGTAG-, AAGAGCTATTTGGTAG-, AGAGCTATTTGGTAG-, GAGCTATTTGGTAG-, AGCTATTTGGTAG-, GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-;

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGAAT, -GAGCCGTCTTCAGGAA, -GAGCCGTCTTCAGGA, -GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N¹¹ и/или N¹² могут также представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, как здесь раскрыто.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S3:

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

(SEQ ID NO: 10)

являются следующие:

ATTTGGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 369)
TTTGGTAGTGTTTAGGGA	(SEQ ID NO: 370)
TTGGTAGTGTTTAGGGAG	(SEQ ID NO: 371)
TGGTAGTGTTTAGGGAGC	(SEQ ID NO: 372)
GGTAGTGTTTAGGGAGCC	(SEQ ID NO: 373)
GTAGTGTTTAGGGAGCCG	(SEQ ID NO: 374)
TAGTGTTTAGGGAGCCGT	(Seq. ID No. 375)
AGTGTTTAGGGAGCCGTC	(SEQ ID NO: 376)
GTGTTTAGGGAGCCGTCT	(SEQ ID NO: 377)
TTTGGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 378)
TTGGTAGTGTTTAGGGA	(SEQ ID NO: 379)
TGGTAGTGTTTAGGGAG	(SEQ ID NO: 380)
GGTAGTGTTTAGGGAGC	(SEQ ID NO: 381)
GTAGTGTTTAGGGAGCC	(SEQ ID NO: 382)
TAGTGTTTAGGGAGCCG	(SEQ ID NO: 383)
AGTGTTTAGGGAGCCGT	(SEQ ID NO: 384)
GTGTTTAGGGAGCCGTC	(SEQ ID NO: 385)
TTGGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 386)
TGGTAGTGTTTAGGGA	(SEQ ID NO: 387)
GGTAGTGTTTAGGGAG	(SEQ ID NO: 388)
GTAGTGTTTAGGGAGC	(SEQ ID NO: 389)
TAGTGTTTAGGGAGCC	(SEQ ID NO: 390)
AGTGTTTAGGGAGCCG	(SEQ ID NO: 391)
GTGTTTAGGGAGCCGT	(SEQ ID NO: 392)
TGGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 393
GGTAGTGTTTAGGGA	(SEQ ID NO: 394)
GTAGTGTTTAGGGAG	(SEQ ID NO: 395)
TAGTGTTTAGGGAGC	(SEQ ID NO: 396)
AGTGTTTAGGGAGCC	(SEQ ID NO: 397)
GTGTTTAGGGAGCCG	(SEQ ID NO: 398)
GGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 399)
GTAGTGTTTAGGGA	(SEQ ID NO: 400)
TAGTGTTTAGGGAG	(SEQ ID NO: 401)
AGTGTTTAGGGAGC	(SEQ ID NO: 402)
GTGTTTAGGGAGCC	(SEQ ID NO: 403)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S3 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК-LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S3 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), описанные здесь, в частности, таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и, предпочтительно таковые, раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, как описано в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S3 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, описанную здесь, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S3 необязательно могут также содержать концевые группы на терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S3, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S2 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3, и еще более предпочтительная: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S3, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на экспериментах, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также с учетом сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

Возможны различные межнуклеотидные мостики или межнуклеотидные связи. В формулах, раскрытых здесь, межнуклеотидная связь IL представлена -IL'-Y-. Таким образом, IL=-IL'-Y-=-X''-P(=X')(X^-)-Y-, где IL предпочтительно выбрана из группы, состоящей из: -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(CH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₃)-O-, -O-P(O)(NH(CH₃))-O-, -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-, -O-P(O)(BH₃^-)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂SCH₃)-O-, -O-P(O)(O^-)-N(CH₃)-, -N(CH₃)-P(O)(O^-)-O-. Предпочтительными являются межнуклеотидные связи IL, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(OCH₃)-O-, -O-P(O)(NH(CH₃))-O-, -O-P(O)[N(CH₃)₂]-O-, -O-P(O)(OCH₂CH₂OCH₃)-O-, и более предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-, и еще более предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, и наиболее предпочтительные, выбранные из -O-P(O)(O^-)-O- и -O-P(O)(S^-)-O-.

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

(SEQ ID NO: 10)

где:

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

Более предпочтительно N¹¹ представляет: AGAGCTATTTGGTAG-, GAGCTATTTGGTAG-, AGCTATTTGGTAG-, GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; и

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGA, -GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно, по меньшей мере, 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3'

(SEQ ID NO: 10)

где:

N¹¹ представляет: GCTATTTGGTAG-, CTATTTGGTAG-, TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; предпочтительно N¹¹ представляет: TATTTGGTAG-, ATTTGGTAG-, TTTGGTAG-, TTGGTAG-, TGGTAG-, GGTAG-, GTAG-, TAG-, AG- или G-; и

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G; предпочтительно N¹² представляет: -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT, -GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G; и

нуклеотиды LNA выбраны из β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из: -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-; и предпочтительно выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата;

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 369-SEQ ID NO: 403, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 6 (SEQ ID NO: 258a-270b).

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R^II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R^II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

(SEQ ID NO: 11)

где:

N⁵ представляет: CTGCCCCAGAAGAGCTA-, TGCCCCAGAAGAGCTA-, GCCCCAGAAGAGCTA-, CCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-,CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-;

N⁶ представляет: -TGTTTAGGGAGCCGTCT, -TGTTTAGGGAGCCGTC, -TGTTTAGGGAGCCGT, -TGTTTAGGGAGCCG, -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N⁵ и/или N⁶ могут также представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, как здесь раскрыто.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S4:

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

(SEQ ID NO: 11)

являются следующие:

GAAGAGCTATTTGGTAGT	(SEQ ID NO: 404)
AAGAGCTATTTGGTAGTG	(SEQ ID NO: 405)
AGAGCTATTTGGTAGTGT	(SEQ ID NO: 406)
GAGCTATTTGGTAGTGTT	(SEQ ID NO: 407)
AGCTATTTGGTAGTGTTT	(SEQ ID NO: 408)
GCTATTTGGTAGTGTTTA	(SEQ ID NO: 409)
CTATTTGGTAGTGTTTAG	(SEQ ID NO: 410)
TATTTGGTAGTGTTTAGG	(SEQ ID NO: 411)
ATTTGGTAGTGTTTAGGG	(SEQ ID NO: 412)
AAGAGCTATTTGGTAGT	(SEQ ID NO: 413)
AGAGCTATTTGGTAGTG	(SEQ ID NO: 414)
GAGCTATTTGGTAGTGT	(SEQ ID NO: 415)
AGCTATTTGGTAGTGTT	(SEQ ID NO: 416)
GCTATTTGGTAGTGTTT	(SEQ ID NO: 417)
CTATTTGGTAGTGTTTA	(SEQ ID NO: 418)
TATTTGGTAGTGTTTAG	(SEQ ID NO: 419)
ATTTGGTAGTGTTTAGG	(SEQ ID NO: 420)
AGAGCTATTTGGTAGT	(SEQ ID NO: 421)
GAGCTATTTGGTAGTG	(SEQ ID NO: 422)
AGCTATTTGGTAGTGT	(SEQ ID NO: 423)
GCTATTTGGTAGTGTT	(SEQ ID NO: 424)
CTATTTGGTAGTGTTT	(SEQ ID NO: 425)
TATTTGGTAGTGTTTA	(SEQ ID NO: 426)
ATTTGGTAGTGTTTAG	(SEQ ID NO: 427)
GAGCTATTTGGTAGT	(SEQ ID NO: 428)
AGCTATTTGGTAGTG	(SEQ ID NO: 429)
GCTATTTGGTAGTGT	(SEQ ID NO: 430)
CTATTTGGTAGTGTT	(SEQ ID NO: 431)
TATTTGGTAGTGTTT	(SEQ ID NO: 432)
ATTTGGTAGTGTTTA	(SEQ ID NO: 433)
AGCTATTTGGTAGT	(SEQ ID NO: 434)
GCTATTTGGTAGTG	(SEQ ID NO: 435)
CTATTTGGTAGTGT	(SEQ ID NO: 436)
TATTTGGTAGTGTT	(SEQ ID NO: 437)
ATTTGGTAGTGTTT	(SEQ ID NO: 438)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S4 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК-LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S4 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), как здесь описано, в частности, таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и, предпочтительно таковые, раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, как описано в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S4 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, как здесь описано, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S4 необязательно могут также содержать концевые группы на терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S4, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S4 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3 и еще более предпочтительной: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S4, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на экспериментах, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также с учетом сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

(SEQ ID NO: 11)

где:

N⁵ представляет: CTGCCCCAGAAGAGCTA-, TGCCCCAGAAGAGCTA-, GCCCCAGAAGAGCTA-, CCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

Более предпочтительно N⁵ представляет: GCCCCAGAAGAGCTA-, CCCCAGAAGAGCTA-, CCCAGAAGAGCTA-, CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

N⁶ представляет: -TGTTTAGGGAGCCGT, -TGTTTAGGGAGCCG, -TGTTTAGGGAGCC, -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно, по меньшей мере, 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3'

(SEQ ID NO: 11)

где:

N⁵ представляет: CCAGAAGAGCTA-, CAGAAGAGCTA-, AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; предпочтительно N⁵ представляет: AGAAGAGCTA-, GAAGAGCTA-, AAGAGCTA-, AGAGCTA-, GAGCTA-, AGCTA-, GCTA-, CTA-, TA- или A-; и

N⁶ представляет: -TGTTTAGGGAGC, -TGTTTAGGGAG, -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG, or -T; предпочтительно N⁶ представляет: -TGTTTAGGGA, -TGTTTAGGG, -TGTTTAGG, -TGTTTAG, -TGTTTA, -TGTTT, -TGTT, -TGT, -TG или -T; и

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 404-SEQ ID NO: 438, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 7 (SEQ ID NO: 271a-283b).

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

(SEQ ID NO: 100)

где:

N⁷ представляет: ATCTTGAATATCTCATG-, TCTTGAATATCTCATG-, CTTGAATATCTCATG-, TTGAATATCTCATG-, TGAATATCTCATG-, GAATATCTCATG-,AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-;

N⁸ представляет: -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N⁷ и/или N⁸ могут также представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, как здесь раскрыто.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S6:

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

(SEQ ID NO: 100)

являются следующие:

TATCTCATGAATGGACCA	(SEQ ID NO: 439)
ATCTCATGAATGGACCAG	(SEQ ID NO: 440)
TCTCATGAATGGACCAGT	(SEQ ID NO: 441)
CTCATGAATGGACCAGTA	(SEQ ID NO: 442)
TCATGAATGGACCAGTAT	(SEQ ID NO: 443)
CATGAATGGACCAGTATT	(SEQ ID NO: 444)
ATGAATGGACCAGTATTC	(SEQ ID NO: 445)
TGAATGGACCAGTATTCT	(SEQ ID NO: 446)
GAATGGACCAGTATTCTA	(SEQ ID NO: 447)
ATCTCATGAATGGACCA	(SEQ ID NO: 448)
TCTCATGAATGGACCAG	(SEQ ID NO: 449)
CTCATGAATGGACCAGT	(SEQ ID NO: 450)
TCATGAATGGACCAGTA	(SEQ ID NO: 451)
CATGAATGGACCAGTAT	(SEQ ID NO: 452)
ATGAATGGACCAGTATT	(SEQ ID NO: 453)
TGAATGGACCAGTATTC	(SEQ ID NO: 454)
GAATGGACCAGTATTCT	(SEQ ID NO: 455)
TCTCATGAATGGACCA	(SEQ ID NO: 456)
CTCATGAATGGACCAG	(SEQ ID NO: 457)
TCATGAATGGACCAGT	(SEQ ID NO: 458)
CATGAATGGACCAGTA	(SEQ ID NO: 459)
ATGAATGGACCAGTAT	(SEQ ID NO: 460)
TGAATGGACCAGTATT	(SEQ ID NO: 461)
GAATGGACCAGTATTC	(SEQ ID NO: 462)
CTCATGAATGGACCA	(SEQ ID NO: 463)
TCATGAATGGACCAG	(SEQ ID NO: 464)
CATGAATGGACCAGT	(SEQ ID NO: 465)
ATGAATGGACCAGTA	(SEQ ID NO: 466)
TGAATGGACCAGTAT	(SEQ ID NO: 467)
GAATGGACCAGTATT	(SEQ ID NO: 468)
TCATGAATGGACCA	(SEQ ID NO: 469)
CATGAATGGACCAG	(SEQ ID NO: 470)
ATGAATGGACCAGT	(SEQ ID NO: 471)
TGAATGGACCAGTA	(SEQ ID NO: 472)
GAATGGACCAGTAT	(SEQ ID NO: 473)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S6 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК-LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S6 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), как здесь описано, в частности, таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и, предпочтительно таковые, раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, как описано в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S6 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, как здесь описано, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S6 необязательно могут также содержать концевые группы на терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S6, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S6 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3 и еще более предпочтительной: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S6, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на экспериментах, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также в отношении сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

(SEQ ID NO: 100)

где:

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

Более предпочтительно N⁷ представляет: CTTGAATATCTCATG-, TTGAATATCTCATG-, TGAATATCTCATG-, GAATATCTCATG-, AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; и

N⁸ представляет: -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно, по меньшей мере, 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3'

(SEQ ID NO: 100)

где:

N⁷ представляет: GAATATCTCATG-, AATATCTCATG-, ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; предпочтительно N⁷ представляет: ATATCTCATG-, TATCTCATG-, ATCTCATG-, TCTCATG-, CTCATG-, TCATG-, CATG-, ATG-, TG- или G-; и

N⁸ представляет: -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A; предпочтительно N⁸ представляет: -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A; и

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 439-SEQ ID NO: 473, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 8 (SEQ ID NO: 219a-231b).

Кроме того, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

(SEQ ID NO: 101)

где:

N⁹ представляет: CATATTTATATACAGGC-, ATATTTATATACAGGC-, TATTTATATACAGGC-, ATTTATATACAGGC-, TTTATATACAGGC-, TTATATACAGGC-,TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-;

N¹⁰ представляет: -AGTGCAAATGTTATTGG, -AGTGCAAATGTTATTG, -AGTGCAAATGTTATT, -AGTGCAAATGTTAT, -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A;

и солям и оптическим изомерам антисмыслового олигонуклеотида.

N⁹ и/или N¹⁰ могут также представлять любой из дополнительных ограниченных списков 3'- и 5'-остатков, как здесь раскрыто.

Особенно предпочтительными гапмерными антисмысловыми олигонуклеотидами, подпадающими под общую формулу S7:

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

(SEQ ID NO: 101)

являются следующие:

TATACAGGCATTAATAAA	(SEQ ID NO: 474)
ATACAGGCATTAATAAAG	(SEQ ID NO: 475)
TACAGGCATTAATAAAGT	(SEQ ID NO: 476)
ACAGGCATTAATAAAGTG	(SEQ ID NO: 477)
CAGGCATTAATAAAGTGC	(SEQ ID NO: 478)
AGGCATTAATAAAGTGCA	(SEQ ID NO: 479)
GGCATTAATAAAGTGCAA	(SEQ ID NO: 480)
GCATTAATAAAGTGCAAA	(SEQ ID NO: 481)
CATTAATAAAGTGCAAAT	(SEQ ID NO: 482)
ATACAGGCATTAATAAA	(SEQ ID NO: 483)
TACAGGCATTAATAAAG	(SEQ ID NO: 484)
ACAGGCATTAATAAAGT	(SEQ ID NO: 485)
CAGGCATTAATAAAGTG	(SEQ ID NO: 486)
AGGCATTAATAAAGTGC	(SEQ ID NO: 487)
GGCATTAATAAAGTGCA	(SEQ ID NO: 488)
GCATTAATAAAGTGCAA	(SEQ ID NO: 489)
CATTAATAAAGTGCAAA	(SEQ ID NO: 490)
TACAGGCATTAATAAA	(SEQ ID NO: 491)
ACAGGCATTAATAAAG	(SEQ ID NO: 492)
CAGGCATTAATAAAGT	(SEQ ID NO: 493)
AGGCATTAATAAAGTG	(SEQ ID NO: 494)
GGCATTAATAAAGTGC	(SEQ ID NO: 495)
GCATTAATAAAGTGCA	(SEQ ID NO: 496)
CATTAATAAAGTGCAA	(SEQ ID NO: 497)
ACAGGCATTAATAAA	(SEQ ID NO: 498)
CAGGCATTAATAAAG	(SEQ ID NO: 499)
AGGCATTAATAAAGT	(SEQ ID NO: 500)
GGCATTAATAAAGTG	(SEQ ID NO: 501)
GCATTAATAAAGTGC	(SEQ ID NO: 502)
CATTAATAAAGTGCA	(SEQ ID NO: 503)
CAGGCATTAATAAA	(SEQ ID NO: 504)
AGGCATTAATAAAG	(SEQ ID NO: 505)
GGCATTAATAAAGT	(SEQ ID NO: 506)
GCATTAATAAAGTG	(SEQ ID NO: 507)
CATTAATAAAGTGC	(SEQ ID NO: 508)

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S7 в форме гапмеров (LNA-сегмент 1-сегмент ДНК-LNA-сегмент 2) содержат сегмент LNA на терминальном 5'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и содержат сегмент LNA на терминальном 3'-конце, состоящий из 2-5, предпочтительно 2-4 звеньев LNA, и между двумя сегментами LNA один сегмент ДНК, состоящий из 6-14, предпочтительно 7-12 и более предпочтительно 8-11 звеньев ДНК.

Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S7 содержат нуклеотиды LNA (звенья LNA), как здесь описано, в частности, таковые, раскрытые в разделе «Замкнутые нуклеиновые кислоты» (LNA^®) и, предпочтительно таковые, раскрытые в разделе «Предпочтительные LNA». Звенья LNA и звенья ДНК могут содержать обычные азотистые основания, такие как аденин (А), цитозин (С), гуанин (G), тимин (Т) и урацил (U), но могут также содержать модифицированные азотистые основания, как описано в разделе «Азотистые основания». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S7 или сегменты LNA и сегмент ДНК антисмыслового олигонуклеотида могут содержать любую межнуклеотидную связь, как описано здесь, и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Межнуклеотидные связи (IL)». Антисмысловые олигонуклеотиды формулы S7 необязательно могут также содержать концевые группы на терминальном 3'-конце и/или терминальном 5'-конце и в частности, таковые, раскрытые в разделе «Концевые группы».

Результаты экспериментов показали, что модифицированные азотистые основания незначительно увеличивают или изменяют активность антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в отношении тестированных неврологических и онкологических заболеваний. Было показано, что модифицированные азотистые основания 5-метилцитозин или 2-аминоаденин дополнительно повышают активность антисмысловых олигонуклеотидов формулы S7, особенно если 5-метилцитозин используется только в нуклеотидах LNA или в нуклеотидах LNA и в нуклеотидах ДНК и/или, если 2-аминоаденин используется в нуклеотидах ДНК и не в нуклеотидах LNA.

Предпочтительная гапмерная структура антисмысловых олигонуклеотидов формулы S7 является следующей: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3 и еще более предпочтительной: 3-8-3, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 3-11-4 и 4-11-3.

В качестве звеньев LNA для антисмысловых олигонуклеотидов формулы S7, в частности, β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-ENA (b⁵), β-D-(NH)-LNA (b⁶), β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷), β-D-(ONH)-LNA (b⁸) и β-D-(ONCH₃)-LNA (b⁹) являются предпочтительными. Результаты экспериментов показали, что все эти звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶, b⁷, b⁸ и b⁹ можно синтезировать с требуемым усилием и обеспечить антисмысловые олигонуклеотиды с сопоставимой стабильностью и активностью. Однако, основываясь на экспериментах, звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁵, b⁶ и b⁷ являются более предпочтительными. Еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹, b², b⁴, b⁶ и b⁷, и еще более предпочтительными являются звенья LNA b¹ и b⁴, и наиболее предпочтительным также в отношении сложности химического синтеза является β-D-окси-LNA (b¹).

Таким образом, настоящее изобретение предпочтительно относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 10-28 нуклеотидов, предпочтительно 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 и еще более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 1-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 1-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

(SEQ ID NO: 101)

где:

и предпочтительно из -O-P(O)(O^-)-O-, -O-P(O)(S^-)-O-, -O-P(S)(S^-)-O-, -S-P(O)(O^-)-O-, -S-P(O)(S^-)-O-, -O-P(O)(O^-)-S-, -O-P(O)(S^-)-S-, -S-P(O)(O^-)-S-;

Более предпочтительно N⁹ представляет: TATTTATATACAGGC-, ATTTATATACAGGC-, TTTATATACAGGC-, TTATATACAGGC-, TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; и

N¹⁰ представляет: -AGTGCAAATGTTATT, -AGTGCAAATGTTAT, -AGTGCAAATGTTA, -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A.

Еще более предпочтительно настоящее изобретение относится к антисмысловому олигонуклеотиду в форме гапмера, состоящему из 11-24 нуклеотидов, более предпочтительно 12-20 нуклеотидов и более предпочтительно 13-19 или 14-18 нуклеотидов, и 2-5 из этих нуклеотидов на терминальном 5'-конце и 2-5 нуклеотидов на терминальном 3'-конце антисмыслового олигонуклеотида представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и терминальном 3'-конце находится последовательность, по меньшей мере, из 7, предпочтительно, по меньшей мере, 8 нуклеотидов ДНК, и антисмысловой олигонуклеотид способен гибридизоваться с участком гена, кодирующего TGF-R_II, или с участком мРНК, кодирующей TGF-R_II, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3'

(SEQ ID NO: 101)

где:

N⁹ представляет: TTATATACAGGC-, TATATACAGGC-, ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; предпочтительно N⁹ представляет: ATATACAGGC-, TATACAGGC-, ATACAGGC-, TACAGGC-, ACAGGC-, CAGGC-, AGGC-, GGC-, GC- или C-; и

N¹⁰ представляет: -AGTGCAAATGTT, -AGTGCAAATGT, -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A; предпочтительно N¹⁰ представляет: -AGTGCAAATG, -AGTGCAAAT, -AGTGCAAA, -AGTGCAA, -AGTGCA, -AGTGC, -AGTG, -AGT, -AG или -A; и

Особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды последовательностей SEQ ID NO: 474-SEQ ID NO: 508, содержащие сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 3'-конце, и сегмент из 2-5, предпочтительно 2-4 и более предпочтительно 3-4 звеньев LNA на 5'-конце, и сегмент, по меньшей мере, из 6, предпочтительно 7 и более предпочтительно 8 звеньев ДНК между двумя сегментами звеньев LNA, где звенья LNA выбраны из: β-D-окси-LNA (b¹), β-D-тио-LNA (b²), α-L-окси-LNA (b⁴), β-D-(NH)-LNA (b⁶) и β-D-(NCH₃)-LNA (b⁷); и межнуклеотидные связи выбраны из фосфата, фосфоротиоата и фосфородитиоата. Такие предпочтительные антисмысловые олигонуклеотиды могут не содержать какого-либо модифицированного терминального 3'- и 5'-конца или могут не содержать какой-либо 3'- и 5'-концевой группы, и могут в качестве модифицированного азотистого основания содержать 5-метилцитозин в звеньях LNA, предпочтительно всех звеньях LNA и/или 2-аминоаденин в некоторых или всех звеньях ДНК, и/или 5-метилцитозин в некоторых или всех звеньях ДНК.

Также особенно предпочтительными являются гапмерные антисмысловые олигонуклеотиды из таблицы 9 (SEQ ID NO: 284a-236b).

Таблица 4
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
357	10	232a	C^b¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sC^*b¹
357	10	232b	C^b¹Gb¹dTdCdAdTdAdGAb¹C^*b¹
356	12	233a	Tb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹
356	12	233b	Tb¹Cb¹Gb¹dTdCdAdTdAdGAb¹Cb¹Cb¹
356	12	233c	Tb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹
356	12	233d	Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹
356	12	233e	Tb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*b¹
355	13	234a	Tb¹sCb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	13	234b	Tb¹Cb¹Gb¹Tb¹dCdAdUdAdGdACb¹C*b¹Gb¹
355	13	234c	Tb¹sCb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹
355	13	234d	Tb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*b¹sGb¹
355	13	234e	Tb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdC*sdCsGb¹
355	13	234f	Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹sGb¹
354	13	142c	C*b¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹
355	14	143i	Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹sGb¹
355	14	143j	Cb⁴ssTb⁴ssCb⁴ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb⁴ssC*b⁴ssGb⁴
355	14	143h	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143k	C^b²ssTb²ssCb²ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb²ssCb²ssGb²
355	14	143m	Cb¹Tb¹Cb¹Gb¹dUsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹Cb¹Cb¹Gb¹
355	14	143n	Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143o	Cb¹sTb¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsGb¹sAb¹sCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143p	Cb⁶sTb⁶sCb⁶sGb⁶sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁶sCb⁶sGb⁶
355	14	143q	Cb⁷sTb⁷sCb⁷sdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb⁷sC*b⁷sGb⁷
355	14	143r	Cb⁴sTb⁴sCb⁴sGb⁴sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb⁴sGb⁴
355	14	143s	Cb⁴Tb⁴Cb⁴Gb⁴dTdCdAdTdAdGdAdCC*b⁴Gb⁴
355	14	143t	Cb¹ssTb¹ssCb¹ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb¹ssC*b¹ssGb¹
355	14	143u	Cb¹Tb¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb¹Cb¹Gb¹
355	14	143v	Cb¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹Cb¹Gb¹
355	14	143w	Cb⁶sTb⁶sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁶sC*b⁶sGb⁶
355	14	143x	Cb⁷sTb⁷sCb⁷sGb⁷sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁷sC*b⁷sGb⁷
355	14	143y	Cb⁷sTb⁷sdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsAb⁷sCb⁷sCb⁷sGb⁷
355	14	143z	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143aa	Cb¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹C*b¹Gb¹
355	14	143ab	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143ac	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹
355	14	143ad	Cb¹Tb¹dCdGdTdCdAdTdAdGdACb¹Cb¹Gb¹
355	14	143ae	Cb¹sTb¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143af	/5SpC3s/Cb¹sTb¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sC*b¹sGb¹
355	14	143ag	Cb¹sTb¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sC*b¹sGb¹/3SpC3s/
355	14	143ah	/5SpC3s/Cb¹sTb¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sC*b¹sGb¹/3SpC3s/
355	14	143ai	Cb¹sTb¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹
355	14	143aj	Cb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹
356	14	145c	Gb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sC*b¹
354	15	235i	Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sC*b¹sGb¹sAb¹
354	15	235a	C*b¹ssTb¹ssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdCssdCssdGssAb¹
354	15	235b	C*b¹Tb¹dCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGAb¹
354	15	235c	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsdAsdCsC*b¹sGb¹sAb¹
354	15	235d	Cb¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹C*b¹Gb¹Ab¹
354	15	235e	Cb⁴sTb⁴sCb⁴sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴
354	15	235f	Cb⁶sTb⁶sCb⁶sdGdTdCdAdTdAdGdAdCsC*b⁶sGb⁶sAb⁶
354	15	235g	Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdC*sdGsAb¹
354	15	235h	C*b¹ssTb¹ssdCssdGssdUssdCssdAssdUssdAssdGssdAssdCssdCssGb¹ssAb¹
355	15	144c	Gb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹
354	16	141c	Gb¹sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹sAb¹
354	16	141d	Gb¹Cb¹Tb¹Cb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹Gb¹Ab¹
354	16	141e	Gb⁴sCb⁴sTb⁴sCb⁴sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴
354	16	141f	Gb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹
354	16	141g	Gb²sCb²sTb²sdCsdGsdUsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*b²sGb²sAb²
354	16	141h	Gb⁴ssCb⁴ssTb⁴ssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb⁴ssC*b⁴ssGb⁴ssAb⁴
354	16	141i	Gb¹Cb¹dTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCC*b¹Gb¹Ab¹
354	16	141j	Gb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
351	16	139c	Cb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsGb¹sCb¹sC*b¹
354	17	237a	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sC*b¹sGb¹sAb¹
354	17	237b	Tb²sGb²sCb²sdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb²sCb²sCb²sGb²sAb²
354	17	237c	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
354	17	237d	Tb¹sdGsdCsdUsdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹sGb¹sAb¹
354	17	237e	Tb¹sGb¹sCb¹sdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹sGb¹sAb¹
354	17	237f	Tb¹Gb¹dCdTdGdTdCdAdTdAdGdACb¹Cb¹Gb¹Ab¹
354	17	237g	Tb¹sdGsdCsdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
354	17	237h	Tb¹Gb¹Cb¹Tb¹Cb¹dGdTdCdAdTdAdGdAdCdCGb¹Ab¹
354	17	237i	Tb¹ssGb¹ssCb¹ssTb¹ssCb¹ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdCssC*b¹ssGb¹ssAb¹
354	17	237j	Tb⁴sGb⁴sCb⁴sdTdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁴sCb⁴sGb⁴sAb⁴
354	17	237k	Tb⁶sGb⁶sCb⁶sdUsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsdCsC*b⁶sGb⁶sAb⁶
354	17	237m	Tb⁷sGb⁷sCb⁷sTb⁷sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁷sC*b⁷sGb⁷sAb⁷
353	18	238a	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹sAb¹sGb¹
353	18	238b	Tb⁷sGb⁷sCb⁷sTb⁷sCb⁷sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdC*sdGsdAsGb⁷
353	18	238c	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹
353	18	238d	Tb¹sGb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹
353	18	238e	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹
353	18	238f	Tb¹Gb¹dCdUdCdGdTdCdAdTdAdGdACb¹Cb¹Gb¹Ab¹Gb¹
353	18	238g	Tb⁴Gb⁴Cb⁴Tb⁴sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁴C*b⁴Gb⁴Ab⁴Gb⁴
353	18	238h	Tb¹ssGb¹ssCb¹ssdTssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdCssdCssGb¹ssAb¹ssGb¹
353	18	238i	Tb²Gb²Cb²dTdCdGdTdCdAdTdAdGdACb²Cb²Gb²Ab²Gb²
352	19	239a	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹
352	19	239b	Tb⁶Gb⁶Cb⁶Tb⁶Cb⁶dGdTdCdAdTdAdGdAdCCb⁶Gb⁶Ab⁶Gb⁶Cb⁶
352	19	239c	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
352	19	239d	Tb¹sdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sCb¹
352	19	239e	Tb⁴sGb⁴sdCsdUsdCsdGsdUsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴sGb⁴sCb⁴
352	19	239f	Tb²ssGb²ssCb²ssTb²ssCb²ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdCssdCssdGssdAssGb²ssC*b²
352	20	240a	Cb¹sTb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sCb¹
352	20	240b	Cb²sTb²sGb²sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb²sGb²sAb²sGb²sCb²
352	20	240c	Cb¹Tb¹Gb¹dCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCGb¹Ab¹Gb¹Cb¹
352	20	240d	Cb¹sdUsdGsdCsdUsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹
352	20	240e	Cb⁴sTb⁴sGb⁴sCb⁴sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴sGb⁴sC*b⁴
351	22	241a	Gb¹sCb¹sTb¹sGb¹sCb¹sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb¹
351	22	241b	Gb¹Cb¹Tb¹Gb¹Cb¹dTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCGb¹Ab¹Gb¹Cb¹Cb¹
351	22	241c	Gb¹sCb¹sTb¹sGb¹sCb¹sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb¹
350	24	242a	Cb¹sGb¹sCb¹sTb¹sGb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹sCb¹
350	24	242b	Cb¹Gb¹Cb¹Tb¹Gb¹dCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGAb¹Gb¹Cb¹Cb¹C*b¹
349	26	243a	Cb¹sCb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsGb¹sCb¹sCb¹sCb¹sCb¹
349	26	243b	Cb¹Cb¹Gb¹Cb¹Tb¹dGdCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGdAGb¹Cb¹Cb¹Cb¹Cb¹
348	28	244a	Cb¹sCb¹sCb¹sGb¹sCb¹sdTsdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsdGsCb¹sCb¹sCb¹sCb¹sC*b¹
348	28	244b	Cb¹Cb¹Cb¹Gb¹Cb¹dTdGdCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGdAdGCb¹Cb¹Cb¹Cb¹Cb¹
Таблица 5
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
431	10	245a	Tb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsC*b¹sAb¹
431	10	245b	Tb¹Ab¹dCdGdCdGdTdCCb¹Ab¹
430	12	246a	Ab¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sC*b¹
430	12	246b	Ab¹Tb¹Ab¹dCdGdCdGdTdCCb¹Ab¹C*b¹
430	12	246c	Ab¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹
430	12	246d	Ab¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹
430	12	246e	Ab¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹
430	13	247a	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹
430	13	247b	Gb¹Ab¹Tb¹Ab¹dCdGdCdGdUdCCb¹Ab¹Cb¹
430	13	247c	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹
430	13	247d	Gb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹
430	13	247e	Gb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b¹
430	13	247f	Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCb¹sCb¹sAb¹sCb¹
431	13	153f	Cb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹
429	14	248a	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sC*b¹sAb¹
429	14	248b	Gb¹Ab¹Tb¹Ab¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹Cb¹Ab¹
429	14	248c	Gb⁴sAb⁴sTb⁴sAb⁴sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b⁴sAb⁴
429	14	248d	Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdA*sdCsAb¹
429	14	248e	Gb²sAb²sTb²sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb²sCb²sAb²
429	14	248f	Gb⁴ssAb⁴ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssAb⁴ssC*b⁴ssAb⁴
429	14	248g	Gb¹Ab¹dTdAdCdGdCdGdTdCCb¹Ab¹C*b¹Ab¹
429	15	152h	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152i	Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹C*b¹Ab¹
429	15	152j	Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹C*b¹Ab¹
429	15	152k	Cb⁶sGb⁶sAb⁶sTb⁶sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb⁶sCb⁶sAb⁶
429	15	152m	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152n	Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹Cb¹Ab¹
429	15	152o	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152p	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹sAb¹
429	15	152q	Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdTdCdCAb¹Cb¹Ab¹
429	15	152r	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152s	/5SpC3s/Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152t	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹/3SpC3s/
429	15	152u	/5SpC3s/Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹/3SpC3s/
429	15	152v	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹sC*b¹sAb¹
429	15	152w	Cb⁷sGb⁷sAb⁷sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb⁷sAb⁷sCb⁷sAb⁷
429	15	152z	Cb⁷sGb⁷sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsCb⁷sAb⁷sCb⁷sAb⁷
429	15	152aa	Cb¹ssGb¹ssAb¹ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssAb¹ssCb¹ssAb¹
429	15	152ab	Cb⁴ssGb⁴ssAb⁴ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssCb⁴ssAb⁴
429	15	152ac	C*b²ssGb²ssAb²ssTb²ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssAb²
429	15	152ad	Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdUdCCb¹Ab¹C*b¹Ab¹
429	15	152ae	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152af	Cb¹sGb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCb¹sCb¹sAb¹sCb¹sAb¹
429	15	152ag	Cb⁶sGb⁶sAb⁶sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb⁶sAb⁶sC*b⁶sAb⁶
429	15	152ah	Cb⁷sGb⁷sAb⁷sdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb⁷sC*b⁷sAb⁷
429	15	152ai	Cb⁴sGb⁴sAb⁴sTb⁴sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb⁴sAb⁴
429	15	152aj	Cb⁴Gb⁴Ab⁴Tb⁴dAdCdGdCdGdTdCdCdACb⁴Ab⁴
429	15	152ak	Cb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹
428	16	249a	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb¹sC*b¹sAb¹sGb¹
428	16	249b	C*b¹ssGb¹ssdAssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssdAssGb¹
428	16	249c	C*b¹Gb¹dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAGb¹
428	16	249d	Cb¹sGb¹sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹
428	16	249e	Cb¹Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹C*b¹Ab¹Gb¹
428	16	249f	C*b⁴sGb⁴sAb⁴sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb⁴
428	16	249g	Cb⁶Gb⁶Ab⁶dTdAdCdGdCdGdTdCdCdAC*b⁶Ab⁶Gb⁶
428	16	249h	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsGb¹
428	16	249i	C*b¹ssGb¹ssdAssdUssdAssdCssdGssdCssdGssdUssdCssdCssdAssdCssAb¹ssGb¹
428	17	250a	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb¹
428	17	250b	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹
428	17	250c	Gb¹sdCsdGsdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb¹
428	17	250d	Gb¹sCb¹sGb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb¹
428	17	250e	Gb¹Cb¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCAb¹Cb¹Ab¹Gb¹
428	17	250f	Gb¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b¹sAb¹sGb¹
428	17	250g	Gb²sCb²sGb²sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb²sAb²sC*b²sAb²sGb²
428	17	250h	Gb¹Cb¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹
428	17	250i	Gb¹ssCb¹ssGb¹ssAb¹ssTb¹ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssCb¹ssAb¹ssGb¹
428	17	250j	Gb⁴sCb⁴sGb⁴sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb⁴sCb⁴sAb⁴sGb⁴
428	17	250k	Gb⁶sCb⁶sGb⁶sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsC*b⁶sAb⁶sGb⁶
428	17	250m	Gb⁷sCb⁷sGb⁷sAb⁷sdTdAdCdGdCdGdTdCdCsAb⁷sC*b⁷sAb⁷sGb⁷
427	18	251a	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹sAb¹sGb¹sGb¹
427	18	251b	Gb⁷sCb⁷sGb⁷sAb⁷sTb⁷sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb⁷
427	18	251c	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹
427	18	251d	Gb¹sCb¹sGb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b¹sAb¹sGb¹sGb¹
427	18	251e	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹
427	18	251f	Gb¹Cb¹dGdAdUdAdCdGdCdGdTdCdCAb¹C^*b¹Ab¹Gb¹Gb¹
427	18	251g	Gb⁴Cb⁴Gb⁴Ab⁴sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb⁴Cb⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴
427	18	251h	Gb¹ssCb¹ssGb¹ssdAssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdC*ssAb¹ssGb¹ssGb¹
427	18	251i	Gb²Cb²Gb²dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCAb²Cb²Ab²Gb²Gb²
426	19	252a	Gb¹sCb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
426	19	252b	Gb⁶Cb⁶Gb⁶Ab⁶Tb⁶dAdCdGdCdGdTdCdCdACb⁶Ab⁶Gb⁶Gb⁶Ab⁶
426	19	252c	Gb¹sCb¹sGb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
426	19	252d	Gb¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
426	19	252e	Gb⁴sCb⁴sdGsdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb⁴sGb⁴sAb⁴
426	19	252f	Gb²ssC*b²ssGb²ssAb²ssTb²ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssdAssdGssGb²ssAb²
426	20	253a	Gb¹sGb¹sCb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
426	20	253b	Gb²sGb²sCb²sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b²sAb²sGb²sGb²sAb²
426	20	253c	Gb¹Gb¹Cb¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹Gb¹Ab¹
426	20	253d	Gb¹sdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
426	20	253e	Gb⁴sGb⁴sC*b⁴sGb⁴sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb⁴sGb⁴sAb⁴
425	22	254a	Tb¹sGb¹sGb¹sCGb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹sAb¹sC*b¹
425	22	254b	Tb¹Gb¹Gb¹Cb¹Gb¹dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹Gb¹Ab¹Cb¹
425	22	254c	Tb⁶sGb⁶sGb⁶sCb⁶sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb⁶sAb⁶sCb⁶
424	24	255a	Cb¹sTb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsGb¹sGb¹sAb¹sC*b¹sGb¹
424	24	255b	Cb¹Tb¹Gb¹Gb¹Cb¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAGb¹Gb¹Ab¹Cb¹Gb¹
423	26	256a	Gb¹sCb¹sTb¹sGb¹sGb¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb¹sAb¹sC*b¹sGb¹sAb¹
423	26	256b	Gb¹Cb¹Tb¹Gb¹Gb¹dCdGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAdGGb¹Ab¹Cb¹Gb¹Ab¹
422	28	257a	Tb¹sGb¹sCb¹sTb¹sGb¹sdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb¹sAb¹sCb¹sGb¹sAb¹
422	28	257b	Tb¹Gb¹Cb¹Tb¹Gb¹dGdCdGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAdGGb¹Ab¹Cb¹Gb¹Ab¹
Таблица 6
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2067	10	258a	Gb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsGb¹sGb¹
2067	10	258b	Gb¹sTb¹sdGsdUsdTsdTsdA*sdGsGb¹sGb¹
2066	12	259a	Ab¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsGb¹sGb¹sAb¹
2066	12	259b	Ab¹Gb¹Tb¹dGdUdUdUdA*dGGb¹Gb¹Ab¹
2066	12	259c	Ab¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsGb¹sAb¹
2066	12	259d	Ab¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsdGsAb¹
2066	12	259e	Ab¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsGb¹sAb¹
2066	13	260a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb¹sAb¹
2066	13	260b	Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹dGdUdUdUdAdGGb¹Gb¹Ab¹
2066	13	260c	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsGb¹sGb¹sAb¹
2066	13	260d	Tb¹sAb¹sGb¹sdUsdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsGb¹sAb¹
2066	13	260e	Tb¹sAb¹sdGsdUsdGsdUsdUsdUsdA*sdGsdGsdGsAb¹
2066	13	260f	Tb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsGb¹sGb¹sGb¹sAb¹
2065	14	261a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsGb¹sGb¹sAb¹sGb¹
2065	14	261b	Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGGb¹Ab¹Gb¹
2065	14	261c	Tb⁴sAb⁴sGb⁴sTb⁴sdGsdUsdTsdUsdA*sdGsdGsdGsAb⁴sGb⁴
2065	14	261d	Tb¹sdAsdGsdUsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsdGsdA*sGb¹
2065	14	261e	Tb²sAb²sGb²sdUsdGsdUsdUsdTsdAsdGsdGsGb²sAb²sGb²
2065	14	261f	Tb⁴sAb⁴sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb⁴sAb⁴sGb⁴
2065	14	261g	Tb¹Ab¹dGdTdGdTdTdTdA*dGGb¹Gb¹Ab¹Gb¹
2064	15	262a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGdTdTdTdAdGdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹
2064	15	262b	Tb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssC*b¹
2064	15	262c	Tb¹sAb¹sdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹
2064	15	262d	Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGC*b¹
2064	15	262e	Tb¹Ab¹sdGsdUsdGsdUsdTsdUsdAsdGsdGsGb¹Ab¹Gb¹C*b¹
2064	15	262f	Tb⁴sAb⁴sGb⁴sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdsdGsdAsGb⁴sC*b⁴
2064	15	262g	Tb⁶Ab⁶Gb⁶dUdGdTdTdUdAdGdGdGAb⁶Gb⁶C*b⁶
2064	15	262h	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsC*b¹
2064	15	262i	Tb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdUssdUssdUssdAssdGssdGssdGssdAssGb¹ssC*b¹
2064	16	209s	Gb¹Tb¹dAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹C*b¹
2064	16	209t	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209u	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹C*b¹
2064	16	209v	/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209w	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹/s3SpC3/
2064	16	209x	/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹/3SpC3s/
2064	16	209y	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209aa	Gb¹Tb¹dAsdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹Cb¹
2064	16	209ab	Gb¹Tb¹dAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹Cb¹
2064	16	209ac	Gb⁶sTb⁶sdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶sGb⁶sC*b⁶
2064	16	209ad	Gb¹sTb¹sdAsdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209ae	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹
2064	16	209af	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹
2064	16	209ag	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹C*b¹
2064	16	209ah	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹Cb¹
2064	16	209ai	Gb⁶sTb⁶sdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶sGb⁶sCb⁶
2064	16	209aj	Gb¹sTb¹sdAsdGsdUsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209ak	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁷sGb⁷sCb⁷
2064	16	209am	Gb⁷sTb⁷sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsGb⁷sAb⁷sGb⁷sCb⁷
2064	16	209an	Gb¹ssTb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssAb¹ssGb¹ssCb¹
2064	16	209ao	Gb⁴ssTb⁴ssAb⁴ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssGb⁴ssCb⁴
2064	16	209ap	Gb²ssTb²ssAb²ssGb²ssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssC*b²
2064	16	209aq	Gb¹Tb¹Ab¹Gb¹dUdGdUdUdUdAdGdGGb¹Ab¹Gb¹C*b¹
2064	16	209ar	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹
2064	16	209as	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsdGsGb¹sGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209at	Gb⁶sTb⁶sAb⁶sGb⁶sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁶sGb⁶sC*b⁶
2064	16	209au	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sdGsdUsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁷sGb⁷sCb⁷
2064	16	209av	Gb⁴sTb⁴sAb⁴sGb⁴sdUsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴sC*b⁴
2064	16	209aw	Gb⁴Tb⁴Ab⁴Gb⁴dTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb⁴C*b⁴
2064	16	209ax	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209az	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209ba	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹
2064	16	209bb	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sC*b¹
2063	17	263a	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹
2063	17	263b	Gb²sTb²sAb²sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb²sAb²sGb²sCb²sC*b²
2063	17	263c	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹
2063	17	263d	Gb¹sdUsdAsdGsdUsdGsdUsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb¹
2063	17	263e	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdUsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹
2063	17	263f	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹Cb¹Cb¹
2063	17	263g	Gb¹sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sCb¹sC*b¹
2063	17	263h	Gb¹Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹dGdTdUdTdAdGdGdGdAdGCb¹C*b¹
2063	17	263i	Gb¹ssTb¹ssAb¹ssGb¹ssTb¹ssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssGb¹ssCb¹ssCb¹
2063	17	263j	Gb⁴Tb⁴dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb⁴Cb⁴Cb⁴
2063	17	263k	Gb⁶sTb⁶sAb⁶sdGsdTsdGsdUsdUsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁶sCb⁶sC*b⁶
2063	17	263m	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTdGdTdTdTdAdGdGdGsAb⁷sGb⁷sCb⁷sC*b⁷
2063	18	264a	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹
2063	18	264b	Gb⁷sGb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsCb⁷
2063	18	264c	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsC*b¹
2063	18	264d	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdUsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsC*b¹
2063	18	264e	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹
2063	18	264f	Gb¹sGb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹
2063	18	264g	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sCb¹sCb¹
2063	18	264h	Gb¹Gb¹dUdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGGb¹Ab¹Gb¹Cb¹C*b¹
2063	18	264i	Gb⁴Gb⁴Tb⁴Ab⁴dGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb⁴Ab⁴Gb⁴Cb⁴Cb⁴
2063	18	264j	Gb¹ssGb¹ssTb¹ssdAssdGssdTssdGssdUssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssGb¹ssCb¹ssC*b¹
2063	18	264k	Gb²Gb²Tb²dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGGb²Ab²Gb²Cb²C*b²
2062	19	265a	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹sGb¹
2062	19	265b	Gb⁶Gb⁶Tb⁶Ab⁶Gb⁶dTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶Gb⁶Cb⁶C*b⁶Gb⁶
2062	19	265c	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsCb¹sCb¹sGb¹
2062	19	265d	Gb¹sdGsdTsdAsdGsdUsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹sGb¹
2062	19	265e	Gb⁴sGb⁴sdUsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴sCb⁴sC*b⁴sGb⁴
2062	19	265f	Gb²ssGb²ssTb²ssAb²ssGb²ssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssdCssC*b²ssGb²
2062	20	266a	Tb¹sGb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sC*b¹sGb¹
2062	20	266b	Tb²sGb²sGb²sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb²sGb²sCb²sCb²sGb²
2062	20	266c	Gb¹Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb¹Cb¹C*b¹Gb¹
2062	20	266d	Tb¹sdGsdGsdUsdAsdGsdTsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹sGb¹
2062	20	266e	Tb⁴sGb⁴sGb⁴sTb⁴sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴sCb⁴sCb⁴sGb⁴
2061	22	267a	Tb¹sTb¹sGb¹sGb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sCb¹sC*b¹sGb¹sTb¹
2061	22	267b	Tb¹Tb¹Gb¹Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb¹Cb¹Cb¹Gb¹Tb¹
2061	22	267c	Tb⁶sTb⁶sGb⁶sdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁶sCb⁶sCb⁶sGb⁶sTb⁶
2060	24	268a	Tb¹sTb¹sTb¹sGb¹sGb¹sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGCb¹sCb¹sGb¹sTb¹sCb¹
2060	24	268b	Tb¹Tb¹Tb¹Gb¹Gb¹dTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGCb¹Cb¹Gb¹Tb¹C*b¹
2059	26	269a	Ab¹sTb¹sTb¹sTb¹sGb¹sdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsCb¹sGb¹sTb¹sC*b¹sTb¹
2059	26	269b	Ab¹Tb¹Tb¹Tb¹Gb¹dGdTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGdCCb¹Gb¹Tb¹C*b¹Tb¹
2058	28	270a	Tb¹sAb¹sTb¹sTb¹sTb¹sdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsdCsGb¹sTb¹sCb¹sTb¹sTb¹
2058	28	270b	Tb¹Ab¹Tb¹Tb¹Tb¹dGdGdTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGdCdCGb¹Tb¹C*b¹Tb¹Tb¹
Таблица 7
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2075	10	271a	Ab¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdA*sGb¹sTb¹
2075	10	271b	Ab¹Tb¹dTdTdGdGdTdA*Gb¹Tb¹
2074	12	272a	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdA*sGb¹sTb¹sGb¹
2074	12	272b	Tb¹Ab¹Tb¹dTdTdGdGdTdA*Gb¹Tb¹Gb¹
2074	12	272c	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsTb¹sGb¹
2074	12	272d	Tb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsdUsGb¹
2074	12	272e	Tb¹sdAsdTsdUsdTsdGsdGsdUsdA*sdGsTb¹sGb¹
2073	13	273a	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
2073	13	273b	Tb¹Ab¹Tb¹dUdUdGdGdUdAGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
2073	13	273c	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdA*sGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
2073	13	273d	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsdUsGb¹sTb¹
2073	13	273e	Tb¹sAb¹sdUsdUsdUsdGsdGsdUsdA*sdGsdUsdGsTb¹
2073	13	273f	Tb¹sdAsdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
2073	14	274a	Cb¹Tb¹Ab¹sdUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
2073	14	274b	Cb⁴sTb⁴sAb⁴sTb⁴sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb⁴sTb⁴
2073	14	274c	Cb¹sdUsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹
2073	14	274d	Cb²sTb²sAb²sdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²
2073	14	274e	C*b⁴ssTb⁴ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssTb⁴ssGb⁴ssTb⁴
2073	14	274f	Cb¹Tb¹Ab¹dTdTdTdGdGdTdAGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
2073	14	274g	Cb¹sTb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
2072	15	275a	Cb¹sTb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsTb¹
2072	15	275b	Cb¹sTb¹sdAsdUsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹
2072	15	275c	C*b⁴sTb⁴sAb⁴sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴
2072	15	275d	C*b¹ssTb¹ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssdTssTb¹
2072	15	275e	C*b¹ssTb¹ssdAssdUssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdUssdGssTb¹ssTb¹
2072	15	275f	Cb¹sTb¹sAb¹sTb¹sdTdTdGdGdTdAdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹
2072	15	275g	Cb¹Tb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹Gb¹Tb¹Tb¹
2072	15	275h	Cb⁶Tb⁶Ab⁶dUdTdTdGdGdTdAdGdUGb⁶Tb⁶Tb⁶
2072	15	275i	C*b¹dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTTb¹
2072	16	210o	Gb¹C*b¹Tb¹Ab¹dTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
2072	16	210p	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210q	Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210r	Gb¹Cb¹Tb¹Ab¹dTdTdTdGdGdTdAdGdTGb¹Tb¹Tb¹
2072	16	210s	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdUsdUsdTdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210t	Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210u	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdUsdUsdUsdGsdGsdUsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210v	/5SpC3s/Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210w	Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹/3SpC3s/
2072	16	210x	/5SpC3s/Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹/3SpC3s/
2072	16	210y	Gb¹Cb¹Tb¹Ab¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
2072	16	210z	Gb¹Cb¹Tb¹Ab¹sdUsdTsdTsdGsdGsdUsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
2072	16	210aa	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210ab	Gb⁶sCb⁶sTb⁶sAb⁶sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb⁶sTb⁶sTb⁶
2072	16	210ac	Gb⁶sC*b⁶sTb⁶sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb⁶sGb⁶sTb⁶sTb⁶
2072	16	210ad	Gb⁷sCb⁷sTb⁷sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsTb⁷sGb⁷sTb⁷sTb⁷
2072	16	210ae	Gb⁷sCb⁷sdUsdAsdTsdTsdUsdGsdGsdUsdAsdGsTb⁷sGb⁷sTb⁷sTb⁷
2072	16	210af	Gb¹ssCb¹ssTb¹ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssGb¹ssTb¹ssTb¹
2072	16	210ag	Gb⁴ssCb⁴ssTb⁴ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssTb⁴ssTb⁴
2072	16	210ah	Gb²ssC*b²ssTb²ssAb²ssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssdTssTb²
2072	16	210ai	Gb¹C*b¹Tb¹Ab¹dUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹Gb¹Tb¹Tb¹
2072	16	210aj	Gb⁴C*b⁴Tb⁴Ab⁴dTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTdGTb⁴Tb⁴
2072	16	210ak	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210am	Gb⁴sCb⁴sTb⁴sAb⁴sdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴
2072	16	210an	Gb⁷sCb⁷sTb⁷sdAsdTsdTsdUsdGsdGsdTsdA*sdGsdTsGb⁷sTb⁷sTb⁷
2072	16	210ao	Gb¹sC*b¹sdUsdAsdUsdUsdTsdGsdGsdUsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210ap	Gb¹sC*b¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
2072	16	210aq	Gb¹sC*b¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹
2071	17	276a	Gb¹sCb¹sTb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	17	276b	Gb²sCb²sTb²sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²sTb²sTb²
2071	17	276c	Gb¹sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	17	276d	Gb²sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²sTb²sTb²
2071	17	276e	Gb⁶sCb⁶sTb⁶sdAsdUsdUsdUsdGsdGsdUsdA*sdGsdUsdGsTb⁶sTb⁶sTb⁶
2071	17	276f	Gb¹sdCsdTsdAsdUsdUsdUsdGsdGsdUsdAsdGsdUsdGsTb¹sTb¹sTb¹
2071	17	276g	Gb¹Cb¹dTdAdTdTdTdGdGdTdA*dGdTGb¹Tb¹Tb¹Tb¹
2071	17	276h	Gb⁴Cb⁴Tb⁴Ab⁴dTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb⁴Tb⁴Tb⁴
2071	17	276i	Gb¹Cb¹Tb¹Ab¹Tb¹dUdTdGdGdTdAdGdTdGdUTb¹Tb¹
2071	17	276j	Gb¹ssC*b¹ssTb¹ssAb¹ssTb¹ssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssTb¹ssTb¹ssTb¹
2071	17	276k	Gb⁷sCb⁷sTb⁷sAb⁷sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb⁷sTb⁷sTb⁷sTb⁷
2071	18	277a	Ab¹sGb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277b	Ab⁷sGb⁷sCb⁷sTb⁷sAb⁷sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb⁷
2071	18	277c	Ab¹sGb¹sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277d	Ab¹sGb¹sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277e	Ab¹Gb¹dCdTdAdUdTdTdGdGdTdAdGTb¹Gb¹Tb¹Tb¹Tb¹
2071	18	277f	Ab²Gb²Cb²dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGTb²Gb²Tb²Tb²Tb²
2071	18	277g	Ab¹sGb¹sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277h	Ab¹sGb¹sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277i	Ab¹sGb¹sCb¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
2071	18	277j	Ab⁴Gb⁴C*b⁴Tb⁴sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb⁴Gb⁴Tb⁴Tb⁴Tb⁴
2071	18	277k	Ab¹ssGb¹ssCb¹ssdTssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdA*ssdGssdUssdGssTb¹ssTb¹ssTb¹
2070	19	278a	Ab¹sGb¹sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	19	278b	Ab²ssGb²ssC*b²ssTb²ssAb²ssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssdTssdTssTb²ssAb²
2070	19	278c	Ab¹sdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	19	278d	Ab¹sdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdUsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	19	278e	Ab¹sGb¹sCb¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	19	278f	Ab⁴sGb⁴sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴sTb⁴sAb⁴
2070	19	278g	Ab⁶Gb⁶Cb⁶Tb⁶Ab⁶dTdTdTdGdGdTdAdGdTGb⁶Tb⁶Tb⁶Tb⁶Ab⁶
2070	20	279a	Gb¹sAb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	20	279b	Gb²sAb²sGb²sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb²sTb²sTb²sTb²sAb²
2070	20	279c	Gb¹sdAsdGsdCsdUsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
2070	20	279d	Gb⁴sAb⁴sGb⁴sC*b⁴sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴sTb⁴sAb⁴
2070	20	279e	Gb¹Ab¹Gb¹dC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb¹Tb¹Tb¹Ab¹
2069	22	280a	Ab¹sGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹sGb¹
2069	22	280b	Ab¹Gb¹Ab¹Gb¹C*b¹dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb¹Tb¹Tb¹Ab¹Gb¹
2069	22	280c	Ab¹sGb¹sAb¹sGb¹sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹sGb¹
2069	22	280d	Ab⁶sGb⁶sAb⁶sGb⁶sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb⁶sAb⁶sGb⁶
2068	24	281a	Ab¹sAb¹sGb¹sAb¹sGb¹sdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsTb¹sTb¹sAb¹sGb¹sGb¹
2068	24	281b	Ab¹Ab¹Gb¹Ab¹Gb¹dC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTTb¹Tb¹Ab¹Gb¹Gb¹
2067	26	282a	Gb¹sAb¹sAb¹sGb¹sAb¹sdGsdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb¹sAb¹sGb¹sGb¹sGb¹
2067	26	282b	Gb¹Ab¹Ab¹Gb¹Ab¹dGdC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTdTTb¹Ab¹Gb¹Gb¹Gb¹
2066	28	283a	Ab¹sGb¹sAb¹sAb¹sGb¹sdAsdGsdC*sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsAb¹sGb¹sGb¹sGb¹sAb¹
2066	28	283b	Ab¹Gb¹Ab¹Ab¹Gb¹dAdGdC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTdTdTAb¹Gb¹Gb¹Gb¹Ab¹
Таблица 8
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
4220	10	219a	Gb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsC*b¹sAb¹
4220	10	219b	Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹
4219	12	220a	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsC*b¹sAb¹sGb¹
4219	12	220b	Tb¹Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹Gb¹
4219	12	220c	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹
4219	12	220d	Tb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹
4219	12	220e	Tb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsGb¹
4218	13	221a	Tb¹sGb¹sAb¹sAb¹sdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹
4218	13	221b	Tb¹Gb¹Ab¹Ab¹dUdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹
4218	13	221c	Tb¹sGb¹sAb¹sAb¹sdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹
4218	13	221d	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹
4218	13	221e	Tb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹
4218	13	221f	Tb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb¹sTb¹
4218	14	222a	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsC*b¹sAb¹sGb¹sTb¹
4218	14	222b	Ab¹Tb¹Gb¹Ab¹dAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹
4218	14	222c	Ab¹Tb¹dGdAdAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹Gb¹Tb¹
4218	14	222d	Ab⁴sTb⁴sGb⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAbsGb⁴sTb⁴
4218	14	222e	Ab¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹
4218	14	222f	Ab²sTb²sGb²sdA*sdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb²
4218	14	222g	Ab⁴ssTb⁴ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssAb⁴ssGb⁴ssTb⁴
4217	15	223a	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAdTdGdGdAdCdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	15	223b	Ab¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdTssAb¹
4217	15	223c	Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTAb¹
4217	15	223d	Ab¹sTb¹sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdA*sdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹
4217	15	223e	Ab⁶Tb⁶Gb⁶dAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁶Tb⁶Ab⁶
4217	15	223f	Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	15	223g	Ab⁴sTb⁴sGb⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴
4217	15	223h	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹
4217	15	223i	Ab¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdUssdGssdGssdA*ssdCssdCssdAssdGssTb¹ssAb¹
4217	16	218y	C*b²sAb²sTb²sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb²sAb²
4217	16	218z	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218aa	C*b¹ssAb¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssAb¹ssGb¹ssTb¹ssAb¹
4217	16	218ab	Cb¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	16	218ac	Cb¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	16	218ad	C*b⁶sAb⁶sTb⁶sdGdAdAdTdGdGdAdCdCAb⁶sGb⁶sTb⁶sAb⁶
4217	16	218ae	C*b⁷sAb⁷sTb⁷sGb⁷sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁷sTb⁷sAb⁷
4217	16	218af	C*bs¹Ab¹sdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdUsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218b	C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218m	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218n	Cb¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	16	218o	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218p	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218q	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218c	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218r	C*b¹Ab¹Tb¹dGdAdAdTdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	16	218s	Cb¹sAb¹sTb¹sdGdAdAdTdGdGdAdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218t	/5SpC3s/C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218u	C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹/3SpC3s/
4217	16	218v	/5SpC3s/C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹/3SpC3s/
4217	16	218ag	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218ah	Cb⁴ssAb⁴ssTb⁴ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssTb⁴ssAb⁴
4217	16	218ai	C*b²ssAb²ssTb²ssGb²ssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdTssAb²
4217	16	218aj	C*b¹Ab¹Tb¹Gb¹dAdAdUdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
4217	16	218ak	Cb¹sAb¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdA*sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218am	Cb¹sAb¹sdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
4217	16	218an	C*b⁶sAb⁶sTb⁶sGb⁶sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁶sTb⁶sAb⁶
4217	16	218ao	Cb⁷sAb⁷sTb⁷sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁷sTb⁷sAb⁷
4217	16	218ap	Cb⁴sAb⁴sTb⁴sGb⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsdGsTb⁴sAb⁴
4217	16	218aq	C*b⁴Ab⁴Tb⁴Gb⁴dAdAdTdGdGdAdCdCdAdGTb⁴Ab⁴
4217	16	218ar	C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹
4216	17	224a	C*b¹sAb¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	17	224b	C*b²sAb²sTb²sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb²sAb²sTb²
4216	17	224c	C*b¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb¹
4216	17	224d	Cb¹sdAsdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	17	224e	Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	17	224f	C*b¹Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAGb¹Tb¹Ab¹Tb¹
4216	17	224g	C*b¹sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb¹
4216	17	224h	Cb¹Ab¹Tb¹Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCdC*dAdGdTAb¹Tb¹
4216	17	224i	C*b¹ssAb¹ssTb¹ssGb¹ssAb¹ssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssTb¹ssAb¹ssTb¹
4216	17	224j	Cb⁴Ab⁴Tb⁴dGdAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁴Tb⁴Ab⁴Tb⁴
4216	17	224k	Cb⁶sAb⁶sTb⁶sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁶sAb⁶sTb⁶
4216	17	224m	Cb⁷sAb⁷sTb⁷sGb⁷sdAdAdTdGdGdAdCdC*dAsGb⁷sTb⁷sAb⁷sTb⁷
4216	18	225a	Tb¹sC*b¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	18	225b	Tb⁷sC*b⁷sAb⁷sTb⁷sGb⁷sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb⁷
4216	18	225c	Tb¹sCb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	18	225d	Tb¹sC*b¹sAb¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
4216	18	225e	Tb¹sC*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb¹
4216	18	225f	Tb¹Cb¹dAdTdGdAdAdUdGdGdAdCdC*Ab¹Gb¹Tb¹Ab¹Tb¹
4216	18	225g	Tb⁴C*b⁴Ab⁴Tb⁴sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb⁴Gb⁴Tb⁴Ab⁴Tb⁴
4216	18	225h	Tb¹ssCb¹ssAb¹ssdTssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdA*ssdGssTb¹ssAb¹ssTb¹
4216	18	225i	Tb²Cb²Ab²dTdGdAdAdTdGdGdAdCdC*Ab²Gb²Tb²Ab²Tb²
4215	19	226a	Tb¹sC*b¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb¹
4215	19	226b	Tb⁶C*b⁶Ab⁶Tb⁶Gb⁶dAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁶Tb⁶Ab⁶Tb⁶Tb⁶
4215	19	226c	Tb¹sC*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹sTb¹sTb¹
4215	19	226d	Tb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdA*sdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb¹
4215	19	226e	Tb⁴sCb⁴sdAsdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴sTb⁴sTb⁴
4215	19	226f	Tb²ssC*b²ssAb²ssTb²ssGb²ssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdTssdAssTb²ssTb²
4215	20	227a	Cb¹sTb¹sCb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb¹
4215	20	227b	Cb²sTb²sCb²sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb²sTb²sAb²sTb²sTb²
4215	20	227c	Cb¹Tb¹Cb¹dAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdC*dAdGTb¹Ab¹Tb¹Tb¹
4215	20	227d	C*b¹sdUsdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb¹
4215	20	227e	Cb⁴sTb⁴sCb⁴sAb⁴sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴sTb⁴sTb⁴
4214	22	228a	Tb¹sCb¹sTb¹sCb¹sAb¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb¹sTb¹sC*b¹
4214	22	228b	Tb¹Cb¹Tb¹Cb¹Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGTb¹Ab¹Tb¹Tb¹C*b¹
4214	22	228c	Tb⁶sCb⁶sTb⁶sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb⁶sTb⁶sTb⁶sCb⁶
4213	24	229a	Ab¹sTb¹sCb¹sTb¹sCb¹sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹sTb¹sTb¹sCb¹sTb¹
4213	24	229b	Ab¹Tb¹Cb¹Tb¹Cb¹AdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTAb¹Tb¹Tb¹C*b¹Tb¹
4212	26	230a	Tb¹sAb¹sTb¹sCb¹sTb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb¹sTb¹sCb¹sTb¹sAb¹
4212	26	230a	Tb¹sAb¹sTb¹sCb¹sTb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb¹sTb¹sCb¹sTb¹sAb¹
4212	26	230b	Tb¹Ab¹Tb¹Cb¹Tb¹dCdAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTdATb¹Tb¹Cb¹Tb¹Ab¹
4211	28	231a	Ab¹sTb¹sAb¹sTb¹sCb¹sdTsdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsdTsTb¹sCb¹sTb¹sAb¹sGb¹
4211	28	231b	Ab¹Tb¹Ab¹Tb¹Cb¹dTdCdAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTdAdTTb¹C^b¹Tb¹Ab¹Gb¹
Таблица 9
SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2358	10	284a	Cb¹sAb¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹
2358	10	284b	Cb¹Ab¹dTdTdAdAdTdA*Ab¹Ab¹
2357	12	285a	Gb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdA*sdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹
2357	12	285b	Gb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹
2357	12	285c	Gb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdA*sGb¹
2357	12	285d	Gb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹
2357	12	285e	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹
2357	12	285f	Gb¹Cb¹Ab¹dTdTdAdA*dTdAAb¹Ab¹Gb¹
2356	13	286a	Gb¹sC*b¹sAb¹sTb¹sdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹
2356	13	286b	Gb¹sCb¹sAb¹sTb¹sdTsdAsdA*sdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹
2356	13	286c	Gb¹sCb¹sAb¹sdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹
2356	13	286d	Gb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsdGsTb¹
2356	13	286e	Gb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
2356	13	286f	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
2356	13	286g	Gb¹C*b¹Ab¹Tb¹dUdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹
2356	14	287a	Gb¹sGb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
2356	14	287b	Gb⁴sGb⁴sCb⁴sAb⁴sdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdA*sGb⁴sTb⁴
2356	14	287c	Gb¹sdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdTsdAsdAsdA*sdGsTb¹
2356	14	287d	Gb²sGb²sCb²sdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb²sGb²sTb²
2356	14	287e	Gb¹Gb¹Cb¹Ab¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsdA*sAb¹Gb¹Tb¹
2356	14	287f	Gb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
2356	14	287g	Gb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdA*sAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
2356	14	287h	Gb¹Gb¹dC*dAdTdTdAdAdTdAAb¹Ab¹Gb¹Tb¹
2356	14	287i	Gb⁴ssGb⁴ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssAb⁴ssAb⁴ssGb⁴ssTb⁴
2356	14	287j	Gb⁴ssGb⁴ssdC*ssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssAb⁴ssAb⁴ssGb⁴ssTb⁴
2355	15	288a	Gb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	15	288b	Gb¹sGb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdA*sdTsdAsdAsdAsdGsdTsGb¹
2355	15	288c	Gb⁴sGb⁴sC*b⁴sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴
2355	15	288d	Gb¹sGb¹sC*b¹sAb¹sdTdTdAdAdTdAdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	15	288e	Gb¹Gb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
2355	15	288f	Gb¹ssGb¹ssdCssdAssdUssdUssdAssdAssdUssdAssdAssdAssdGssTb¹ssGb¹
2355	15	288g	Gb¹ssGb¹ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssdTssGb¹
2355	15	288h	Gb⁶Gb⁶Cb⁶dAdTdTdAdAdUdAdAdAGb⁶Tb⁶Gb⁶
2355	15	288i	Gb¹Gb¹C*b¹dAdTdTdAdAdUdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
2355	16	289a	Ab¹sGb¹sGb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289b	Ab¹sGb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289c	Ab¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdA*sAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289d	Ab²sGb²sGb²sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb²sAb²sGb²sTb²sGb²
2355	16	289e	Ab¹sdGsdGsdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289f	Ab¹sdGsdGsdC*sdAsdTsdUsdAsdAsdUsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289g	Ab¹sGb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289h	Ab¹sGb¹sGb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdA*sdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289i	Ab⁶sGb⁶sGb⁶sdCsdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁶sTb⁶sGb⁶
2355	16	289j	Ab¹sGb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289k	Ab¹sdGsdGsdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	16	289m	Ab¹Gb¹Gb¹Cb¹Ab¹dUdTdAdA*dTdAdAdAdGTb¹Gb¹
2355	16	289n	Ab¹Gb¹dGdC*dAdTdTdAdAdTdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
2355	16	289o	Ab⁴Gb⁴Gb⁴dCdAdTdTdAdAdTdAdAAb⁴Gb⁴Tb⁴Gb⁴
2355	16	289p	Ab¹ssGb¹ssGb¹ssC*b¹ssAb¹ssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssGb¹ssTb¹ssGb¹
2355	16	289q	Ab⁷sGb⁷sGb⁷sCb⁷sdAdTdTdAdAdTdAdA*sAb⁷sGb⁷sTb⁷sGb⁷
2355	17	213j	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213k	C*b¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213m	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213n	Cb¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213o	/5SpC3s/Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213p	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹/3SpC3s/
2355	17	213q	/5SpC3s/Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹/3SpC3s/
2355	17	213r	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdA*sGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213s	Cb⁶sAb⁶sGb⁶sdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAsGb⁶sTb⁶sGb⁶
2355	17	213t	Cb¹sAb¹sGb¹sdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAsGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213u	Cb¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213v	Cb¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213w	Cb¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213x	Cb⁷sAb⁷sGb⁷sGb⁷sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁷sTb⁷sGb⁷
2355	17	213y	C*b⁶sAb⁶sGb⁶sGb⁶sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁶sTb⁶sGb⁶
2355	17	213z	Cb⁷sAb⁷sGb⁷sdGsdCsdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb⁷sGb⁷sTb⁷sGb⁷
2355	17	213aa	Cb⁴sAb⁴sGb⁴sGb⁴sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴
2355	17	213ab	Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdA*sGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213ac	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdA*sdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213ad	Cb¹sAb¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2355	17	213ae	Cb¹ssAb¹ssGb¹ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssAb¹ssGb¹ssTb¹ssGb¹
2355	17	213af	Cb⁴ssAb⁴ssGb⁴ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssTb⁴ssGb⁴
2355	17	213ag	C*b²ssAb²ssGb²ssGb²ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssdTssGb²
2355	17	213ah	C*b¹Ab¹Gb¹Gb¹dCdAdTdTdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213ai	C*b⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴dCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb⁴Gb⁴
2355	17	213aj	C*b¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdUdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
2355	17	213ak	C*b¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
2354	18	290a	Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹sCb¹
2354	18	290b	Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹sC*b¹
2354	18	290c	Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹sC*b¹
2354	18	290d	Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹sC*b¹
2354	18	290e	Cb⁷sAb⁷sGb⁷sGb⁷sCb⁷sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdGsCb⁷
2354	18	290f	Cb⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb⁴Gb⁴Tb⁴Gb⁴C*b⁴
2354	18	290g	Cb¹ssAb¹ssGb¹ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssTb¹ssGb¹ssCb¹
2354	18	290h	Cb²Ab²Gb²dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAAb²Gb²Tb²Gb²C*b²
2354	18	290i	Cb¹Ab¹dGdGdCdAdUdUdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹Cb¹
2354	19	291a	Ab¹sCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹sC*b¹
2354	19	291b	Ab¹sCb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹sC*b¹
2354	19	291c	Ab⁴sCb⁴sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb⁴sTb⁴sGb⁴sC*b⁴
2354	19	291d	Ab¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹sCb¹
2354	19	291e	Ab²ssCb²ssAb²ssGb²ssGb²ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssdTssGb²ssCb²
2354	19	291f	Ab⁶Cb⁶Ab⁶Gb⁶Gb⁶dCdAdTdTdAdAdTdAdAAb⁶Gb⁶Tb⁶Gb⁶C*b⁶
2353	20	292a	Ab¹sCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹sC*b¹sAb¹
2353	20	292b	Ab²sCb²sAb²sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb²sTb²sGb²sC*b²sAb²
2353	20	292c	Ab¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹sC*b¹sAb¹
2353	20	292d	Ab⁴sCb⁴sAb⁴sGb⁴sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴sCb⁴sAb⁴
2353	20	292e	Ab¹Cb¹Ab¹dGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb¹Gb¹C*b¹Ab¹
2352	22	293a	Tb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹sC*b¹sAb¹sAb¹
2352	22	293b	Tb¹Ab¹Cb¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb¹Gb¹C*b¹Ab¹Ab¹
2352	22	293c	Tb⁶sAb⁶sCb⁶sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁶sGb⁶sCb⁶sAb⁶sAb⁶
2351	24	294a	Ab¹sTb¹sAb¹sCb¹sAb¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsGb¹sC*b¹sAb¹sAb¹sAb¹
2351	24	294b	Ab¹Tb¹Ab¹Cb¹Ab¹dGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTGb¹C*b¹Ab¹Ab¹Ab¹
2350	26	295a	Tb¹sAb¹sTb¹sAb¹sCb¹sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdGsC*b¹sAb¹sAb¹sAb¹sTb¹
2350	26	295b	Tb¹Ab¹Tb¹Ab¹Cb¹dAdGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTdGC*b¹Ab¹Ab¹Ab¹Tb¹
2349	28	236a	Ab¹sTb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdGsdC*sAb¹sAb¹sAb¹sTb¹sGb¹
2349	28	236b	Ab¹Tb¹Ab¹Tb¹Ab¹dCdAdGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTdGdCAb¹Ab¹Ab¹Tb¹Gb¹

Фармацевтические композиции

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению предпочтительно вводят в форме их фармацевтически активных солей, необязательно используя по существу нетоксичные фармацевтически приемлемые носители, эксципиенты, адъюванты, растворители или разбавители. Лекарственные средства по настоящему изобретению формулируют в обычном твердом или жидком носителе или разбавителе и обычном фармацевтически приготовленном адъюванте на подходящем уровне дозирования известным способом. Предпочтительные препараты и композиции находятся в пригодной для введения форме, которая пригодна для инфузии или инъекции (интратекальной, интрацеребровентрикулярной, внутричерепной, внутривенной, интрапаренхимальной, внутриопухолевой, внутриглазной или экстраглазной, внутрибрюшинной, внутримышечной, подкожной), местного введения в мозг, ингаляции, местного введения в солидную опухоль или перорального применения. Однако возможны также другие формы применения, такие как абсорбция через выстилающие эпителиальные или слизисто-кожные оболочки (слизистую оболочку ротовой полости, ректальную и вагинальную эпителиальные оболочки, слизистую оболочку носоглотки, слизистую оболочку кишечника), ректально, трансдермально, местно, внутрикожно, внутрижелудочно, внутримышечно, внутрикожно, подкожно, подъязычно или любыми другими способами, доступными в области фармации.

Вводимые препараты включают, например, инъекционные жидкие композиции, задерживающие композиции, порошки, в частности, для ингаляции, пилюли, таблетки, таблетки с пленочным покрытием, покрытые оболочкой таблетки, диспергируемые гранулы, драже, гели, сиропы, взвеси, суспензии, эмульсии, капсулы и депо-препараты. Возможны и другие способы введения галеновых препаратов, например непрерывная инъекция через имплантированный насос или катетер в головной мозг.

Как здесь используется, термин «фармацевтически приемлемый» относится к любому носителю, который не оказывает отрицательного влияния на эффективность биологической активности антисмысловых олигонуклеотидов, используемых в качестве активного ингредиента в композиции, и не токсичен для хозяина, которому он вводится. Примеры подходящих фармацевтических носителей хорошо известны в данной области и включают забуференные фосфатом физиологические растворы, воду, эмульсии, такие как эмульсии масло/вода, различные типы смачивающих агентов, стерильные растворы и т.д. Такие носители можно формулировать обычными методами, и активное соединение может вводиться субъекту в эффективной дозе. «Эффективная доза» относится к количеству антисмыслового олигонуклеотида, используемого в качестве активного ингредиента, которое достаточно для воздействия на течение и тяжесть заболевания, приводя к снижению или ремиссии такой патологии. «Эффективная доза», пригодная для лечения и/или профилактики этих заболеваний или расстройств, может быть определена с использованием методов, известных специалистам в данной области. Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению можно смешать и вводить вместе с липосомами, комплексообразующими агентами, молекулами, нацеленными на рецепторы, растворителями, консервантами и/или разбавителями.

Предпочтительными являются фармацевтические препараты в форме инфузионных растворов или твердых матриц для непрерывного высвобождения активного ингредиента, особенно для непрерывной инфузии для интратекального введения, интрацеребровентрикулярного введения или внутричерепного введения, по меньшей мере, одного антисмыслового олигонуклеотида по настоящему изобретению. Также предпочтительными являются фармацевтические препараты в виде растворов или твердых матриц, пригодных для местного введения в головной мозг. Для фиброзных болезней легких особенно предпочтительны композиции для ингаляционного введения.

Готовый к употреблению стерильный раствор содержит, например, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид в концентрации от 1 до 10 мг/мл, предпочтительно от 5 до 10 мг/мл, и изотонический агент, выбранный, например, из сахаров, таких как сахароза, лактоза, маннит или сорбит. Также может быть включен подходящий буферный агент для контроля рН раствора до 6-8 (предпочтительно 7-8). Другим необязательным ингредиентом композиции может быть неионогенное поверхностно-активное вещество, такое как твин 20 или твин 80.

Стерильный лиофилизированный порошок, который восстанавливают для применения, содержит, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид и необязательно объемообразующий агент (например, маннит, трегалозу, сорбит, глицин) и/или криопротектор (например, трегалозу, маннит). Растворителем для восстановления может быть вода для инъекционных препаратов, с буферной солью или без нее для регуляции рН до 6-8.

Аэрозольные препараты, подходящие для ингаляции, могут содержать растворы и твердые вещества в виде порошка, которые могут находиться в комбинации с фармацевтически приемлемым носителем, таким как инертный сжатый газ, например, азот.

Особенно предпочтительной фармацевтической композицией является лиофилизированный (высушенный сублимационной сушкой) препарат (лиофилизат), подходящий для введения ингаляцией или для внутривенного введения. Для получения предпочтительного лиофилизированного препарата, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид по изобретению растворяют в 4-5% (мас./об.) растворе маннита и затем раствор лиофилизуют. Раствор маннита можно также приготовить в подходящем буферном растворе, как описано выше.

Дополнительные примеры подходящих крио/лиопротекторов (иначе относится к объемообразующему агенту или стабилизаторам) включают не содержащий тиоловых групп альбумин, иммуноглобулины, полиалкиленоксиды (например, ПЭГ, полипропиленгликоли), трегалозу, глюкозу, сахарозу, сорбит, декстран, мальтозу, рафинозу, стахиозу и другие сахариды (смотри, например, международную заявку WO 97/29782), в то время как маннит используется предпочтительно. Они могут быть использованы в обычных количествах в обычных способах лиофилизации. Способы лиофилизации хорошо известны в области приготовления фармацевтических композиций.

Для введения ингаляцией диаметр частиц лиофилизированного препарата предпочтительно составляет от 2 до 5 мкм, более предпочтительно от 3 до 4 мкм. Лиофилизованный препарат особенно подходит для введения с использованием ингалятора, например ингалятора OPTINEB^® или VENTA NEB^® (NEBU TEC, Elsenfeld, Германия). Лиофилизованный продукт можно регидратировать в стерильной дистиллированной воде или любой другой жидкости, подходящей для ингаляционного введения. Альтернативно, для внутривенного введения лиофилизированный продукт может быть регидратирован в стерильной дистиллированной воде или любой другой жидкости, подходящей для внутривенного введения.

После регидратации для введения в стерильной дистиллированной воде или другой подходящей жидкости лиофилизированный препарат должен иметь примерно физиологическую осмоляльность ткани-мишени для регидратированного пептидного препарата, то есть крови при внутривеннои введении или легочной ткани при ингаляционном введении. Таким образом, предпочтительно, чтобы регидратированный препарат был, по существу, изотоническим.

Предпочтительная концентрация для внутривенного, перорального или ингаляционного введения составляет от 10 до 2000 мкмоль/мл и более предпочтительно составляет от 200 до 800 мкмоль/мл.

Для перорального введения в форме таблеток или капсул, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид может быть объединен с любым нетоксичным фармацевтически приемлемым инертным носителем, подходящим для перорального введения, таким как лактоза, крахмал, сахароза, целлюлоза, стеарат магния, дикальций фосфат, сульфат кальция, тальк, маннит, этиловый спирт (жидкие формы) и тому подобное. Кроме того, когда это желательно или необходимо, то также в смесь могут быть включены подходящие связующие, смазывающие вещества, разрыхлители и красители. Порошки и таблетки могут содержать примерно от 5 до 95% композиции по изобретению.

Подходящие связующие вещества включают крахмал, желатин, природные сахара, кукурузные подсластители, природные и синтетические камеди, такие как гуммиарабик, альгинат натрия, карбоксиметилцеллюлоза, полиэтиленгликоль и воски. Среди смазывающих веществ, которые могут быть упомянуты для применения в данных лекарственных формах, находятся борная кислота, бензоат натрия, ацетат натрия, хлорид натрия и тому подобное. Разрыхлители включают крахмал, метилцеллюлозу, гуаровую камедь и тому подобное.

Кроме того, композиции по настоящему изобретению могут быть составлены в форме с замедленным высвобождением для обеспечения контролируемой скорости высвобождения, по меньшей мере, одного антисмыслового олигонуклеотида для оптимизации терапевтических эффектов. Подходящие лекарственные формы для замедленного высвобождения включают имплантируемые биодеградируемые матрицы для замедленного высвобождения, содержащие, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид, многослойные таблетки, содержащие слои с различной скоростью распадаемости, или полимерные матрицы с контролируемым высвобождением, пропитанные, по меньшей мере, одним антисмысловым олигонуклеотидом.

Препараты в жидкой форме включают растворы, суспензии и эмульсии. В качестве примера можно упомянуть водные или водные-пропиленгликолевые растворы для парентеральных инъекций или добавки подсластителей и замутнителей для пероральных растворов, суспензий и эмульсий.

Подходящими разбавителями являются вещества, которые обычно составляют основную часть композиции или лекарственной формы. Подходящие разбавители включают сахара, такие как лактоза, сахароза, маннит и сорбит, крахмалы, полученные из пшеницы, кукурузы, риса и картофеля, и целлюлозы, такие как микрокристаллическая целлюлоза. Количество разбавителей в композиции может составлять примерно от 5% до примерно 95% по отношению к общей массе композиции, предпочтительно примерно от 25% до примерно 75% по отношению к общей массе композиции.

Термин разрыхлители относится к веществам, добавленным к композиции для обеспечения ее разрушения (распадаемости) и высвобождения активных веществ. Подходящие разрыхлители включают крахмалы, «растворимые в холодной воде» модифицированные крахмалы, такие как натрия карбоксиметилкрахмал, натуральные и синтетические камеди, такие как камедь рожкового дерева, карая, гуаровая камедь, трагакант и агар, производные целлюлозы, такие как метилцеллюлоза и натрий карбоксиметилцеллюлоза, микрокристаллические целлюлозы и сшитые микрокристаллические целлюлозы, такие как кроскармеллоза натрия, альгинаты, такие как альгиновая кислота и альгинат натрия, глины, такие как бентониты, и шипучие смеси. Количество разрыхлителя в композиции может составлять примерно от 1 до примерно 40% по отношению к массе композиции, предпочтительно примерно от 2 до 30% по отношению к массе композиции, более предпочтительно примерно от 3 до 20% по отношению к массе композиции, и наиболее предпочтительно примерно от 5 до примерно 10% по отношению к массе композиции.

Связующие вещества представляют вещества, которые связывают или «склеивают» порошки вместе и делают их когезионными, образуя гранулы, таким образом, функционируя в качестве «адгезива» в композиции. Связующие вещества дополнительно повышают прочность сцепления, уже обеспеченную разбавителем или объемообразующим агентом. Подходящие связующие вещества включают сахара, такие как сахароза, крахмалы, полученные из пшеницы, кукурузы, риса и картофеля; природные камеди, такие как гуммиарабик, желатин и трагакант; производные бурых морских водорослей, такие как альгиновая кислота, альгинат натрия и альгинат аммония, альгинат кальция; целлюлозные материалы, такие как метилцеллюлоза и натрий карбоксиметилцеллюлоза и гидроксипропилметилцеллюлоза; поливинилпирролидон; и неорганические вещества, такие как алюмосиликат магния. Количество связующего вещества в композиции может составлять примерно от 1 до примерно 30% по отношению к массе композиции, предпочтительно примерно от 2 до 20% по отношению к массе композиции, более предпочтительно примерно от 3 до 10% по отношению к массе композиции, и еще более предпочтительно примерно от 3 до примерно 6% по отношению к массе композиции.

Смазочное вещество относится к веществу, добавленному в лекарственную форму для того, чтобы обеспечить таблетке, гранулам и т.д. после их прессования, извлечение из прессовальной формы или матрицы, или истирание в результате трения или износа. Подходящие смазывающие вещества включают стеараты металлов, такие как стеарат магния, стеарат кальция или стеарат калия, стеариновую кислоту; высокоплавкие воски; и водорастворимые смазывающие вещества, такие как хлорид натрия, бензоат натрия, ацетат натрия, олеат натрия, полиэтиленгликоли и D,L-лейцин.

Смазывающие вещества обычно добавляют на самой последней стадии перед прессованием, так как они должны присутствовать на поверхностях гранул и между ними и частями таблеточного пресса. Количество смазывающего вещества в композиции может составлять примерно от 0,05 до примерно 15% по отношению к массе композиции, предпочтительно примерно от 0,2 до примерно 5% по отношению к массе композиции, более предпочтительно примерно от 0,3 до примерно 3% по отношению к массе композиции, и наиболее предпочтительно примерно от 0,3 до примерно 1,5% по отношению к массе композиции.

Скользящие вещества представляют вещества, которые предотвращают комкование и улучшают текучесть гранулятов, для того, чтобы поток был гладким и однородным. Подходящие скользящие вещества включают диоксид кремния и тальк. Количество скользящего вещества в композиции может варьировать примерно от 0,01 до примерно 10% по отношению к массе композиции, предпочтительно примерно от 0,1 до примерно 7% по отношению к массе композиции, более предпочтительно примерно от 0,2 до примерно 5% по отношению к массе композиции, и наиболее предпочтительно примерно от 0,5 до примерно 2% по отношению к массе композиции.

В фармацевтические композиции, раскрытые здесь, антисмысловые олигонуклеотиды включают предпочтительно в форме их солей и, необязательно вместе с другими компонентами, которые повышают стабильность антисмысловых олигонуклеотидов, увеличивают рекрутинг РНКазы Н, повышают способность нахождения мишени, усиливают поглощение клетками и тому подобное. Для достижения этих целей антисмысловые олигонуклеотиды можно модифицировать химически вместо или в дополнении к использованию дополнительных компонентов, пригодных для достижения этих целей. Таким образом, антисмысловые олигонуклеотиды по изобретению можно химически связать с группами или компонентами, которые усиливают активность, клеточное распределение или поглощение клетками антисмысловых олигонуклеотидов и т.д.. Такие фрагменты включают липидные группы, такие как холестериловая группа, холевую кислоту, тиоэфир, гексил-S-тритилтиол, тиохолестерин, алифатическую цепь, например, остатки додекандиола или ундецила, фосфолипид, такой как дигексадецил-rac-глицерин или 1,2-ди-O-гексадецил-rac-глицеро-3-H-фосфонат триэтиламмония, цепь полиамина или полиэтиленгликоля, или адамантан-уксусную кислоту, пальмитиловую группу или группу октадециламина или гексиламинокарбонилоксихолестерина. Настоящее изобретение также включает антисмысловые олигонуклеотиды, которые являются химерными соединениями. «Химерные» антисмысловые олигонуклеотиды в контексте настоящего изобретения представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды, которые содержат две или более химически различных областей, одна из которых представляет последовательность олигонуклеотида, как здесь раскрыто, которая связана с группой или компонентом, предназначенных для повышения поглощения клетками, повышения устойчивости к деградации под воздействием нуклеаз, повышения аффинности связывания с нуклеиновой кислотой-мишенью, увеличения рекрутинга РНКазы Н и так далее. Например, дополнительная область или группа или компонент антисмыслового олигонуклеотида может служить в качестве субстрата для ферментов, способных расщеплять гибриды РНК:ДНК или молекулы РНК:РНК. В качестве примера: РНКаза Н является клеточной эндорибонуклеазой, которая отщепляет цепь РНК из дуплекса РНК:ДНК. Таким образом, активация РНКазы Н приводит к отщеплению РНК-мишени, которая в данном случае представляет собой мРНК, кодирующую TGF-R_II, тем самым существенно повышая эффективность ингибирования экспрессии гена антисмысловым олигонуклеотидом. Следовательно, сопоставимые результаты часто можно получить с более короткими олигонуклеотидами при использовании химерных олигонуклеотидов.

Показания

Настоящее изобретение относится к применению антисмысловых олигонуклеотидов, раскрытых здесь, для профилактики и лечения нейродегенеративных заболеваний, нейротравмы, нейрососудистых и нейровоспалительных заболеваний, включая постинфекционные и воспалительные заболевания центральной нервной системы (ЦНС).

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению особенно пригодны для стимуляции регенерации и функционального восстановления поврежденных нервных путей и/или для лечения и компенсации вызванного возрастом снижения обновления нейрональных стволовых клеток.

Таким образом, еще один аспект настоящего изобретения относится к применению антисмыслового олигонуклеотида, раскрытого здесь, для стимуляции регенерации нейрональной ткани посредством реактивации нейрогенеза, обеспечения дифференцировки и миграции нейронов и индукции интеграции новых нейронов в анатомические и функциональные нейрональные цепи.

Дополнительный аспект настоящего изобретения относится к применению антисмыслового олигонуклеотида, раскрытого здесь, для стимуляции регенерации и клинического (структурного) восстановления у пациентов с повреждением нервной системы или повреждением других систем органов, вызванных фиброзом, или потерей оборота стволовых клеток.

Кроме того, антисмысловые олигонуклеотиды пригодны для компенсации и лечения снижения обновления нейрональных стволовых клеток, вызванного возрастом, воспалением или дефектом гена.

Антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению ингибируют экспрессию TGF-R_II и, следовательно, используются для лечения заболеваний, ассоциированных с повышающей регуляцией или повышенным уровнем TGF-R_II и/или TGF-R_II.

Таким образом, еще один аспект настоящего изобретения относится к применению антисмысловых олигонуклеотидов в профилактике и лечении нейродегенеративных заболеваний, нейровоспалительных расстройств, травматических или посттравматических расстройств, сосудистых или точнее нейроваскулярных расстройств, гипоксических расстройств, постинфекционных расстройств центральной нервной системы, фиброзных болезней, гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей, пресвиакуза и пресбиопии.

Термин «нейродегенеративное заболевание» или «неврологическое заболевание», или «нейровоспалительное расстройство» относится к любому заболеванию, расстройству или состоянию, поражающему центральную или периферическую нервную систему, включая СПИД, неврологические осложнения СПИДа, отсутствие septum pellucidum, приобретенную эпилептиформную афазию, острый диссеминированный энцефаломиелит, адренолейкодистрофию, агнезию мозолистого тела, агнозию, синдром Айкарди, болезнь Александера, болезнь Альперса, альтернирующую гемиплегию, болезнь Альцгеймера, боковой амиотрофический склероз (БАС), анэнцефалию, аневризму, синдром Ангельмана, ангиоматоз, аноксию, афазию, апраксию, арахноидальные кисты, арахноидит, мальформацию Арнольда-Киари, артериовенозную мальформацию, аспартам, синдром Аспергера, атаксию телеангиэктазию, атаксию, синдром дефицита внимания с гиперактивностью, аутизм, вегетативную дисфункцию, боли в спине, синдром Барта, болезнь Баттена, болезнь Бехчета, паралич Белла, доброкачественный эссенциальный блефароспазм, доброкачественную фокальную амиотрофию, доброкачественную внутричерепную гипертензию, синдром Бернарда-Рота, болезнь Бинсвангера, блефароспазм, синдром Блоха-Сульцбергера, родовые травматические повреждения плечевого сплетения, травмы плечевого сплетения, синдром Брэдбери-Эгглстона, аневризму головного мозга, черепно-мозговую травму, опухоли головного и спинного мозга, синдром Броуна-Секара, бульбоспинальную мышечную атрофию, болезнь Канавана, синдром запястного туннеля, каузалгию, каверномы, кавернозную ангиому, кавернозную мальформацию, пирамидный паралич, синдром центрального паралича, центральный болевой синдром, головные расстройства, мозжечковую дегенерацию, гипоплазию мозжечка, церебральную аневризму, церебральный атеросклероз, церебральную атрофию, церебральную форму бери-бери, церебральный гигантизм, церебральную гипоксию, церебральный паралич, церебро-оукло-фасцио-скелетный синдрома, болезнь Шарко-Мари-Тута, ишемический синдром, хорею, хореоакантоцитоз, хроническую воспалительную демиелинизирующую полинейропатию (CIDP), хроническую ортостатическую непереносимость, хроническую боль, синдром Коккейна типа II, синдром Коффина-Лоури, кому, включая стойкое вегетативное состояние, сложный региональный болевой синдром, врожденную лицевую диплегию, врожденную миастению, врожденную миопатию, врожденные пороки развития кавернозных сосудов, кортикобазальную дегенерацию, краниальный артериит, краниосиностоз, болезнь Крейтцфельдта-Якоба, кумулятивные травматические расстройства, синдром Кушинга, цитомегалическую болезнь телец включения (CIBD), цитомегаловирусную инфекцию, синдром танцующих глаз-танцующих ног, синдром Дэнди-Уокера, болезнь Доусона, синдром Де Морсье, паралич Дежерин-Клюмпке, мультиинфарктную деменцию, подкорковую деменцию, деменция с телами Леви, дерматомиозит, диспраксию развития, синдром Девика, диабетическую невропатию, рассеянный склероз, синдром Драве, вегетативную дистонию, дисграфию, дислексию, дисфагию, диспраксию, дистонию, раннюю младенческую эпилептическую энцефалопатию, синдром пустого турецкого седла, летаргический энцефалит, энцефалит и менингит, энцефалоцеле, энцефалопатию, энцефалотригеминальный ангиоматоз, эпилепсию, болезнь Эрба, параличи Эрба-Дюшенна и Дежерина-Клюмпке, болезнь Фабри, синдром Фара, обмороки, семейную дисаутономию, семейную гемангиому, семейную идиопатическую кальцификацию базальных ганглиев, семейный спастический паралич, фебрильные судороги (например, ГЭФС и ГЭФС плюс), синдром Фишера, синдром «вялого ребенка», атаксию Фридрейха, болезнь Гоше, синдром Герстмана, болезнь Герстмана-Штреуслера-Шейнкера, гигантоклеточный артериит, гигантоклеточную болезнь с включениями, глобоидноклеточную лейкодистрофию, глоссофарингеальную невралгию, синдром Гийена-Барре, связанную с HTLV-1 миелопатию, болезнь Галлервордена-Шпатца, черепно-мозговую травму, головную боль, гемикранию континуа, гемифациальный спазм, глазодвигательную гемиплегию, наследственные невропатии, наследственную спастическую параплегию, наследственную полиневропатическую атаксию, опоясывающий лишай уха, опоясывающий лишай, синдром Хираямы, голопрозэнцефалию, болезнь Гентингтона, гидроанэнцефалию, гидроцефалию нормального давления, гидроцефалию (в частности, TGFβ-индуцированную гидроцефалию), гидромиелию, гиперкортицизм, гиперсомнию, гипертонию, гипотонию, гипоксию, иммунно-опосредованный энцефаломиелит, миозит с тельцами включения, недержание пигмента, детскую гипотонию, инфальтивную форму болезни накопления фитановой кислоты, инфантильную болезнь рефсум, инфантильные спазмы, воспалительные миопатии, кишечную липодистрофию, внутричерепные кисты, внутричерепную гипертензию, синдром Исаакса, синдром Жубера, синдром Кернса-Сейра, болезнь Кеннеди, синдром Кинсбурна, синдром Клейна-Левина, синдром Клиппеля-Фейла, синдром Клиппеля-Треноне (KTS), синдром Клювера-Бюси, амнестический синдром Корсакова, болезнь Краббе, болезнь Кугельберга-Веландера, куру, миастенический синдром Ламберта-Итона, синдром Ландау-Клеффнера, компрессию латерального кожного нерва, латеральный синдром продолговатого мозга, необучаемость, болезнь Ли, синдром Леннокса-Гасто, синдром Леша-Нихана, лейкодистрофию, синдром Левина-Критчли, деменцию с тельцами Леви, лиссенцефалию, синдром «запертого человека», болезнь Лу-Герига, неврологические осложнения волчанки, болезнь Лайма-неврологические осложнения, болезнь Мачадо-Джозефа, макренцефалию, мегаленцефалию, синдром Мелькерссона-Розенталя, менингит, болезнь Менкеса, невралгию латерального кожного нерва бедра, метахроматическую лейкодистрофию, микроцефалию, мигрень, синдром Миллера-Фишера, микроинсульт, митохондриальные миопатии, синдром Мебиуса, мономелическую амиотрофию, болезни двигательного нейрона, болезнь Моямоя, муколипидоз, мукополисахаридозы, мультиинфарктную деменцию, мультифокальную двигательную нейропатию, рассеянный склероз (MS), множественную системную атрофию (MSA-C и MSA-P), множественную системную атрофию с ортостатической гипотензией, мышечную дистрофию, врожденную миастению, миастению гравис, диффузный миелинокластический склероз, миоклоническую энцефалопатию младенцев, миоклонус, врожденную миопатию, тиреотоксическую миопатию, миопатию, врожденную миотонию, миотонию, нарколепсию, нейроакантоцитоз, нейродегенерацию с накоплением железа в головном мозге, нейрофиброматоз, злокачественный нейролептический синдром, неврологические осложнения СПИДа, неврологические проявления болезни Помпе, невромиелит оптического нерва, нейромиотонию, нейрональный цероид-липофусциноз, нейрональные расстройства движения, наследственные невропатии, нейросаркоидоз, нейротоксичность, невус кавернозный, болезнь Нимана-Пика, синдром О'Салливана-Маклеода, затылочную невралгию, скрытую дизрафию спинного мозга, синдром Охтахара, оливомостомозжечковую атрофию, синдром опсоклонуса-миоклонуса, ортостатическую гипотензию, синдром Оверуса, хроническую боль, паранеопластические синдромы, парестезии, болезнь Паркинсона, врожденную пармиопатию, пароксизмальный хореоатетоз, пароксизмальную гемикранию, синдром Парри Ромберга, болезнь Пелицеуса-Мерцбахера, синдром Пена-Шокейра, периневральные кисты, периодические параличи, периферическую нейропатию, перивентрикулярную лейкомаляцию, стойкое вегетативное состояние, первазивные расстройства развития, болезнь накопления фитановой кислоты, болезнь Пика, синдром грушевидной мышцы, опухоли гипофиза, полимиозит, болезнь Помпе, поренцефалию, постполиомиелитический синдром, постгерпетическую невралгию, постинфекционный энцефаломиелит, постуральную гипотензию, синдром постуральной ортостатической тахикардии, синдром постуральной тахикардии, первичный боковой склероз, прионные заболевания, прогрессирующую гемифациальную атрофию, прогрессирующую опорно-двигательную атаксию, прогрессирующую мультифокальную лейкоэнцефалопатию, прогрессирующую склерозирующую полиодистрофию, прогрессирующий надъядерный паралич, ложную опухоль головного мозга, пиридоксин-зависимые и пиридоксин-реагирующие судорожные расстройства, синдром Рамсея-Ханта типа I, синдром Рамсея-Ханта типа II, энцефалит Расмуссена и другие аутоиммунные эпилепсии, синдром рефлекторной симпатической дистрофии, детскую форму болезни Рефсума, болезнь Рефсума, повторяющиеся нарушения движения, повторяющиеся стрессовые травмы, синдром беспокойных ног, ретровирус-ассоциированную миелопатию, синдром Ретта, синдром Рейе, синдром Райли-Дея, головную боль SUNCT, кисты крестцовых нервных корешков, «пляска святого Вита», болезнь слюнной железы, болезнь Сандхоффа, болезнь Шильдера, шизенцефалию, судорожные припадки, септооптическую дисплазию, тяжелую миоклоническую эпилепсию младенцев (SMEI), синдром «встряхнутого ребенка», опоясывающий лишай, синдром Шая-Дрейджера, синдром Шегрена, апноэ во сне, сонную болезнь, синдром Сото, спастичность, расщелину позвоночника, инфаркт спинного мозга, повреждение спинного мозга, опухоли спинного мозга, спинальную мышечную атрофию, спиноцеребеллярную атрофию, синдром Стила-Ричардсона-Ольшевского, синдром ригидного человека, стрионигральную дегенерацию, инсульт, синдром Стерджа-Вебера, подострый склерозирующий панэнцефалит, субкортикальную атеросклеротическую энцефалопатию, расстройства глотания, хорею Сиденгама, обмороки, сифилитический спинальный склероз, сирингогидромиелию, сирингомиелию, системную красную волчанку, табес, позднюю дискинезию, кисты Тарлова, болезнь Тея-Сакса, височный артериит, синдром «привязанного» спинного мозга, болезнь Томсена, синдром грудного выхода, тиреотоксическую миопатию, невралгию тройничного нерва, паралич Тодда, синдром Туретта, транзиторную ишемическую атаку, трансмиссивные губчатые энцефалопатии, поперечный миелит, черепно-мозговую травму, тремор, невралгию тройничного нерва, тропический спастический парапарез, клубневой склероз, сосудистую эректильную опухоль, васкулит, включая височный артериит, болезнь фон Экономо, болезнь Гиппеля-Линдау (VHL), болезнь фон Реклингхаузена, синдром Валленберга, болезнь Верднига-Хоффинана, синдром Вернике-Корсакова, западный синдром, болезнь Уиппла, синдром Уильямса, болезнь Вильсона, X-сцепленную и спинальную бульбарную мышечную атрофию и синдром Зеллвегера.

Предпочтительные примеры нейродегенеративных заболеваний и нейровоспалительных расстройств выбраны из группы, состоящей или включающей: болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, болезнь Крейтцфельдта-Якоба (CJD), новый вариант болезни Крейтцфельдта-Якоба (nvCJD), болезнь Галлервордена-Шпатца, болезнь Гентингтона, мультисистемную атрофию, деменцию, лобно-височную деменцию, расстройства двигательного нейрона с множественным спонтанным или генетическим фоном, боковой амиотрофический склероз (АЛС), спинномозговую мышечную атрофию, спиноцеребеллярные атрофии (SCA), шизофрению, аффективные расстройства, большое депрессивное расстройство, менингоэнцефалит, бактериальный менингоэнцефалит, вирусный менингоэнцефалит, аутоиммунные расстройства ЦНС, рассеянный склероз (MS), острые ишемические/гипоксические поражения, травму спинного мозга, травму головы и позвоночника, черепно-мозговые травмы, артериосклероз, атеросклероз, микроангиопатическую деменцию, болезнь Бинсвангера (лейкоареоз), дегенерацию сетчатки, улитковую дегенерацию, дегенерацию желтого пятна, улитковую глухоту, деменцию, связанную со СПИДом, пигментный ретинит, Х-сцепленный рецессивный синдром тремора/атаксии (FXTAS), прогрессирующий супрануклеарный паралич (PSP), стриатонигральную дегенерацию (SND), оливопонтомозжечковую дегенерацию (OPCD), синдром Шая-Дрейджера, зависящий от возраста дефицит памяти, неврологические расстройства развития, связанные с деменцией, синдром Дауна, синуклеинопатии, мутации супероксиддисмутазы, расстройства повторов тринуклеотида, такие как болезнь Гентингтона, травму, гипоксию, сосудистые заболевания, сосудистые воспаления, старение ЦНС. Также можно упомянуть возрастное снижение обновления стволовых клеток.

Особо предпочтительные упомянутые примеры нейродегенеративных заболеваний и нейровоспалительных расстройств выбраны из группы, состоящей или включающей: болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, болезнь Гентингтона, боковой амиотрофический склероз (БАС), гидроцефалию (в частности, TGF-β-индуцированную гидроцефалию), травму ЦНС и спинного мозга, такую как повреждение спинного мозга, травму головы и позвоночника, травматические повреждения головного мозга, дегенерацию сетчатки, дегенерацию желтого пятна, улитковую глухоту, деменцию, связанную со СПИДом, расстройства повторов тринуклеотида, такие как болезнь Гентингтона, и старение ЦНС.

Антисмысловые олигонуклеотиды также пригодны для профилактики и лечения фиброзных болезней. Фиброз или фиброзная болезнь представляет образование избыточной фиброзной соединительной ткани в органе или ткани при репаративном или реактивном процессе. Это может быть реактивное, доброкачественное или патологическое состояние. В ответ на травму это называется рубцеванием, и если фиброз возникает из одной клеточной линии, то он называется фибромой. Физиологически это действует на отложение внеклеточного матрикса, который может облитерировать архитектонику и функцию основного органа или ткани. Также термин фиброз можно использовать для описания патологического состояния избыточного отложения фиброзной ткани, а также процесса отложения соединительной ткани при заживлении. Фиброз представляет процесс, включающий стимулированные клетки для образования соединительной ткани, включая коллаген и гликозаминогликаны. Затем макрофаги и поврежденная ткань между интерстицием высвобождает TGF-β. TGF-β стимулирует пролиферацию и активацию фибробластов, которые откладывают соединительную ткань. Снижение уровней TGF-β предотвращает и уменьшает образование соединительной ткани и таким образом предотвращает и лечит фиброз.

Примерами фиброзных болезней являются:

Легкие:	фиброз легких
	идиопатический фиброз легких (идиопатический означает, что его причина неизвестна)
	кистозный фиброз
Печень:	цирроз печени множественного происхождения
Сердце:	эндомиокардиальный фиброз
	«старый» инфаркт миокарда
	фиброз предсердий
Другие:	медиастинальный фиброз (мягкая ткань средостения)
	глаукома (глаза, окулярный)
	миелофиброз (костный мозг)
	забрюшинный фиброз (мягкие ткани забрюшинного пространства)
	прогрессирующий массивный фиброз (легкие);
	осложнение пневмокониоза работников угольной промышленности
	нефрогенный системный фиброз (кожа)
	болезнь Крона (кишечник)
	келоид (кожа)
	склеродермия/системный склероз (кожа, легкие)
	артрофиброз (колено, плечо, другие суставы)
	болезнь Пейрони (половой член)
	контрактура Дюпюитрена (руки, пальцы)
	некоторые формы адгезивного капсулита (плечо)
	остаточные явления после красной волчанки

Таким образом, еще один аспект настоящего изобретения относится к применению антисмыслового олигонуклеотида для профилактики и/или лечения или к применению антисмыслового олигонуклеотида для приготовления фармацевтической композиции для профилактики и/или лечения фиброза легких, кистозного фиброза, цирроза печени, эндомиокардиального фиброза, «старого» инфаркта миокарда, фиброза предсердий, фиброза средостения, миелофиброза, забрюшинного фиброза, прогрессирующего массивного фиброза, нефрогенного системного фиброза, глаукомы, такой как первичная открытоугольная глаукома, болезни Крона, келоида, системного склероза, артрофиброза, болезни Пейрони, контрактуры Дюпюитрена и остаточных явлений после красной волчанки.

Еще один аспект настоящего изобретения относится к применению антисмыслового олигонуклеотида для профилактики и/или лечения гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей и их метастазов или к применению антисмыслового олигонуклеотида для приготовления фармацевтической композиции для профилактики и/или лечения гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей и их метастазов.

Примеры гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей выбраны из группы, состоящей из или включающей: аденокарциному, меланому, острый лейкоз, акустическую невриному, ампулярную карциному, карциному анального отверстия, астроцитому, базально-клеточную карциному, рак поджелудочной железы, десмоидную опухоль, рак мочевого пузыря, бронхиальную карциному, немелкоклеточный рак легких (NSCLC), рак молочной железы, лимфому Беркитта, рак тела матки, CUP-синдром (неизвестная первичная опухоль), колоректальный рак, рак тонкого кишечника, опухоли тонкого кишечника, рак яичника, рак эндометрия, эпендимому, рак эпителиальных типов, опухоли Юинга, опухоли желудочно-кишечного тракта, рак желудка, рак желчного пузыря, карциномы желчного пузыря, рак матки, рак шейки матки, шейки матки, глиобластомы, гинекологические опухоли, опухоли уха, носа и горла, гематологические неоплазии, волосатоклеточный лейкоз, рак уретры, рак кожи, рак кожи яичка, опухоли головного мозга (глиомы, например астроцитомы, олигодендроглиомы, медуллобластомы, PNET, смешанные глиомы), метастазы в мозг, рак яичка, опухоль гипофиза, карциноиды, саркому Капоши, рак гортани, зародышевоклеточную опухоль, рак кости, колоректальную карциному, опухоли головы и шеи (опухоли в области уха, носа и горла), карциному ободочной кишки, краниофарингиомы, рак ротовой полости (рак в области рта и на губах), рак центральной нервной системы, рак печени, метастазы в печень, лейкоз, опухоль века, рак легких, рак лимфоузлов (ходжкина/неходжкина), лимфомы, рак желудка, злокачественную меланому, злокачественную неоплазию, злокачественные опухоли желудочно-кишечного тракта, карциному молочной железы, рак прямой кишки, медуллобластомы, меланому, менингиомы, болезнь Ходжкина, грибовидный микоз, рак носа, невриному, нейробластому, рак почки, почечноклеточные карциномы, неходжкинские лимфомы, олигодендроглиому, рак пищевода, остеолитические карциномы и остеопластические карциномы, остеосаркомы, карциному яичников, карциному поджелудочной железы, рак полового члена, плазмоцитому, плоскоклеточный рак головы и шеи (SCCHN), рак предстательной железы, рак глотки, карциному прямой кишки, ретинобластому, рак влагалища, рак щитовидной железы, болезнь Шнеебергера, рак пищевода, спиналиомы, Т-клеточную лимфому (грибовидный микоз), тимому, трубчатую карциному, опухоли глаза/окулярные опухоли, рак уретры, урологические опухоли, уротелиальную карциному, рак вульвы, появление бородавок, опухоли мягких тканей, саркому мягких тканей, опухоль Вильмса, карциному шейки матки и рак языка.

Термин «рак» предпочтительно относится к раку, выбранному из группы, состоящей или включающей рак легких, такой как карцинома легких, рак печени, такой как гепатоцеллюлярная карцинома, меланому или злокачественную меланому, рак поджелудочной железы, такой как эпителиоидная карцинома поджелудочной железы или аденокарцинома поджелудочной железы, рак ободочной кишки, такой как колоректальная аденокарцинома, рак желудка или карциному желудка, карциному молочной железы, злокачественную астроцитому, рак предстательной железы, лейкоз, такой как острый миелоидный лейкоз, хронический миелоидный лейкоз, моноцитарный лейкоз, промиелоцитарный лейкоз, лимфоцитарный лейкоз, острый лимфобластный лейкоз, лимфоцитарный лейкоз и острый лимфобластный лейкоз, и лимфому, такую как гистиоцитарная лимфома.

Для лечения гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей и их метастазов антисмысловые олигонуклеотиды можно вводить с регулярными интервалами (интервалами доз DI) от 3 дней до двух недель, например, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или 13 дней, например, примерно 1 неделя, например, 6, 7 или 8 дней. Целесообразно, чтобы, по меньшей мере, две дозы имели период DI между двумя дозами, например, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 доз, каждая с интервалом доз (DI) между каждой дозой антисмыслового олигонуклеотида. Период DI между каждой дозой может быть одинаковым, например, составлять 3 дня и две недели, например, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 дней, например, примерно 1 неделю, например, 6, 7 или 8 дней.

Предпочтительно каждая доза антисмыслового олигонуклеотида может составлять примерно от 0,25 до примерно 10 мг/кг, например, примерно 0,5 мг/кг, примерно 1 мг/кг, примерно 2 мг/кг, примерно 3 мг/кг, примерно 4 мг/кг, примерно 5 мг/кг, примерно 6 мг/кг, примерно 7 мг/кг, примерно 8 мг/кг, примерно 9 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления каждая доза антисмыслового олигонуклеотида может составлять примерно от 2 до примерно 6 мг/кг или примерно от 4 до примерно 5 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления каждая доза антисмыслового олигонуклеотида составляет, по меньшей мере, 2 мг/кг, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 мг/кг, например, 6 мг/кг. В некоторых вариантах осуществления режим дозирования антисмыслового олигонуклеотида может быть повторен после начального режима дозирования, например, после периода отдыха, когда антисмысловой олигонуклеотид не вводится. Например, период отдыха может длиться более 2 недель, например, примерно 3 недели или примерно 4 недели, или примерно 5 недель или примерно 6 недель. В некоторых вариантах осуществления схема дозирования антисмыслового олигонуклеотида представляет одну дозу в неделю, повторяемую три, четыре или пять раз. Такой режим дозирования затем можно повторить после периода отдыха, например, примерно через 3-5 недели, например, примерно через 4 недели. В некоторых вариантах осуществления антисмысловой олигонуклеотид вводят во время первого режима дозирования с регулярными интервалами дозирования (DI) от 4 до 13 дней между 2-10 введениями.

Введение антисмыслового олигонуклеотида обычно проводят парентеральным введением, таким как подкожное, внутримышечное, внутривенное или внутрибрюшинное введение.

Краткое описание фигур

На фиг. 1 показано ингибирующее действие антисмысловых олигонуклеотидов (ASO). ДНК транскрибируется в пре-мРНК, с которой в ядре клетки антисмысловые олигонуклеотиды (ASO) могут связываться или гибридизоваться с комплементарной последовательностью в экзоне (как представлено первым ASO справа и первым ASO слева) или внутри интрона (как представлено вторым ASO справа) или при расположении, состоящем из области экзона и области смежного интрона (как представлено вторым ASO слева). Посредством посттранскрипционной модификации, т.е. сплайсинга, формируется мРНК, с которой ASO может связываться или гибридизоваться в цитоплазме клетки, чтобы ингибировать трансляцию мРНК в последовательность белка. Таким образом, ASO подвергает нокдауну ген-мишень и экспрессию белка избирательно.

На фиг. 2 показано нуклеозидное звено (без межнуклеотидной связи) или нуклеотидное звено (с межнуклеотидной связью), которые не являются звеньями LNA и которые могут входить в состав антисмысловых олигонуклеотидов по настоящему изобретению, особенно в области B, в том случае, если антисмысловой олигонуклеотид по настоящему изобретению представляет гапмер.

На фиг. 3 показан TGF-бета и его эффекты на нейрональные стволовые клетки, раковые стволовые клетки и опухоли. TGF-бета ингибирует пролиферацию нейрональных стволовых клеток. Он может оказывать влияние на переход клетки в раковую стволовую клетку, которая может выйти из-под контроля роста с участием TGF-бета. Позднее при прогрессировании опухоли TGF-бета функционирует как онкоген; он также способствует росту опухоли за счет стимуляции ангиогенеза и подавления иммунной системы. Кроме того, он способствует миграции клеток, тем самым направляя клетки в метастазы.

На фиг. 4 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 218b в форме гапмера, состоящий из 16 нуклеотидов с 3 звеньями LNA (C*b¹ и Ab¹ и Tb¹) на терминальном 5'-конце и 4 звеньями LNA (Ab¹ и Gb¹ и Tb¹ и Ab¹) на терминальном 3'-конце и 9 нуклеотидов ДНК (dG, dA, dA, dT, dG, dG, dA, dC и dC) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в первом звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
4217	16	218b	C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹

На фиг. 5: обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) приводит к снижению внутриклеточного уровня белка pSmad2. Мечение антителом к pSmad2 (левый столбец, красный) в клетках A549 (фиг. 5A) и ReNcell CX^® (фиг. 5B) после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в течение 72 ч или 96 ч соответственно. Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b.

На фиг. 6: обработка ASO (SEQ ID NO: 218с) приводит к снижению внутриклеточного уровня белка pSmad2. Мечение антителом к pSmad2 (левый столбец, красный) в клетках A549 (фиг. 6A) и ReNcell CX^® (фиг. 6B) после трансфекции гимнозом ASO SEQ ID NO: 218с в течение 72 ч или 96 ч соответственно. Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218с.

На фиг. 7: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) приводит к понижающей регуляции мРНК TGF-R_II. Сильная понижающая регуляция мРНК TGF-R_II после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 7A) и ReNcell CX^® (фиг. 7B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанным контрольным образцам. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, ⁺⁺p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.

На фиг. 8: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218с) приводит к понижающей регуляции мРНК TGF-R_II. Сильная понижающая регуляция мРНК TGF-R_II после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 8A) и ReNcell CX^® (фиг. 8B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанным контрольным образцам. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, ⁺⁺p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.

На фиг. 9 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 209y в форме гапмера, состоящий из 16 нуклеотидов с 2 звеньями LNA (Gb¹ и Tb¹) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (Ab¹ и Gb¹ и C*b¹) на терминальном 3'-конце и 11 нуклеотидов ДНК (dA, dG, dT, dG, dT, dT, dT, dA, dG, dG и dG) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в последнем звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2064	16	209y	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹

На фиг. 10 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 210q в форме гапмера, состоящий из 16 нуклеотидов с 4 звеньями LNA (Gb¹и C*b¹ и Tb¹ и Ab¹) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (Gb¹ и Tb¹ и Tb¹) на терминальном 3'-конце и 9 нуклеотидов ДНК (dT, dT, dT, dG, dG, dT, dA, dG и dTs) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) во втором звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2072	16	210q	Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹

На фиг. 11: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) приводит к понижающей регуляции мРНК CTGF. Сильная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 11A) и ReNcell CX^® (фиг. 11B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, ⁺⁺p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.

На фиг. 12: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) приводит к понижающей регуляции мРНК CTGF. Сильная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 12A) и ReNcell CX^® (фиг. 12B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Клетки метили антителом к CTGF (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 13: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) приводит к снижению внутриклеточного уровня белка pSmad2. Экспрессия белка pSmad2 снижалась после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 13A) и ReNcell CX^® (фиг. 13B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Клетки метили антителом к pSmad2 (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 14: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218с) приводит к понижающей регуляции мРНК CTGF. Сильная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 14A) и ReNcell CX^® (фиг. 14B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.

На фиг. 15: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218с) приводит к снижению внутриклеточного уровня белка CTGF. Экспрессия белка CTGF снижалась после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549. ASO инкубировали в течение 72 ч в присутствии TGF-β1. Клетки метили антителом к CTGF (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1.

На фиг. 16: в присутствии TGF-β1 обработка ASO (SEQ ID NO: 218с) приводит к снижению внутриклеточного уровня белка pSmad2. Экспрессия белка pSmad2 снижалась после трансфекции гимнозом TGF-R_II-специфического ASO в предварительно инкубированных с TGF-β1 клетках (48 ч) A549 (фиг. 16A) и ReNcell CX^® (фиг. 16B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч в присутствии TGF-β1 соответственно. Клетки метили антителом к pSmad2 (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1.

На фиг. 17: предварительная обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) и последующее совместное воздействие TGF-β1 приводит к снижению уровня мембранного белка TGF-R_II. Уровень белка TGF-R_II снижался после трансфекции гимнозисом TGF-R_II-специфического ASO с последующим совместным воздействием с TGF-β1 в клетках (48 ч) A549 (фиг. 17A) и ReNcell CX^® (фиг. 17B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч соответственно перед совместным воздействием с TGF-β1 в течение 48 ч. Клетки метили антителом к TGF-R_II (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 18: предварительная обработка ASO (SEQ ID NO: 218b) и последующее совместное воздействие с TGF-β1 приводит к снижению внутриклеточного уровня белка pSmad3. Экспрессия белка pSmad3снижалась после трансфекции гимнозисом TGF-R_II-специфического ASO с последующим совместным воздействием с TGF-β1 в клетках (48 ч) A549 (фиг. 18A) и ReNcell CX^® (фиг. 18B). ASO инкубировали в течение 72 ч или 96 ч соответственно перед совместным воздействием с TGF-β1 в течение 48 ч. Клетки метили антителом к pSmad3 (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 19: ASO (SEQ ID NO: 218b) усиливает и TGF-β1 снижает нейрогенез в клетках-предшественниках нейронов человека ReNcell CX^®. мРНК маркера нейрогенеза DCX подвергается повышающей регуляции в клетках ReNcell CX^® после повторной трансфекции гимнозисом (2×96 ч) ASO по изобретению. Сильное снижение экспрессии мРНК DCX было обнаружено после 8-суточного воздействия TGF-β1. Уровни мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05 по отношению к 2,5 мкМ С, #p<0,05 по отношению к 10 мкМ С.

На фиг. 20: ASO (SEQ ID NO: 218b) усиливает и TGF-β1 снижает пролиферацию в клетках-предшественниках нейронов человека ReNcell CX^®. Экспрессия белка-маркера пролиферации Ki67 повышается в клетках ReNcell CX^® после повторной трансфекции гимнозисом (2×96 ч) ASO по изобретению. Пониженную экспрессию белка Ki67 обнаруживали после 8-суточного воздействия TGF-β1. Клетки метили антителом к Ki67 (левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 21: независимо от условий пролиферации ASO (SEQ ID NO: 218b) усиливает дифференцировку клеток-предшественников нейронов человека ReNcell CX^®. Отмечено присутствие нейрональных маркеров NeuN (фиг. 23A, левый столбец, красный) и βIII-тубулина (фиг. 23B, левый столбец, красный) в клетках ReNcell CX^®. Обработку ASO проводили в течение первых 4 суток в условиях пролиферации и затем еще в течение 4 суток в условиях пролиферации (+EGF/FGF) или дифференцировки (-EGF/FGF). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, +EGF/FGF=пролиферация, -EGF/FGF=дифференцировка.

На фиг. 22: ASO-опосредованное (SEQ ID NO: 218b) спасение нейрональных стволовых клеток от остановки пролиферации, индуцированной TGF-β. Пролиферацию клеток-предшественников нейронов человека ReNcell CX^® наблюдали с или без воздействия TGF-β1 в течение 7 суток с последующей обработкой ASO в течение 8 суток. Повышающая регуляция мРНК GFAP (фиг. 24А), Ki67 (фиг. 24В) и DCX (фиг. 24С) через 7 суток после предварительной инкубации с TGF-β1 указывает на восстановление пролиферации стволовых клеток. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05 по отношению к А. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.

На фиг. 23: ASO снижает пролиферацию клеток рака легких человека (A549). Экспрессия белка-маркера пролиферации Ki67 снижается в клетках A549 после трансфекции гимнозисом (72 ч) ASO по изобретению. Было обнаружно снижение экспрессии белка Ki67 (левый столбец, зеленый). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 26: обработка ASO опосредует антифибротические эффекты опухоли и ослабляет клеточный стресс. Клетки A549 наблюдали после обработки TGF-β1 или после трансфекции гимозом ASO по изобретению (72 ч). Клетки метили антителом к FN (фиг. 30А, левый столбец, зеленый), фаллоидином (актиновый цитоскелет, фиг. 30В, левый столбец, красный). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 27: обработка ASO опосредует антифибротические эффекты опухоли. Клетки рака легких человека A549 исследовали после предварительной инкубации с TGF-β1 (48 ч) с последующей трансфекцией гимнозисом ASO по изобретению и совместным воздействием с обработкой TGF-β1 (72 ч). Клетки метили антителом к CTGF (фиг. 31А, левый столбец, красный) и FN (фиг. 31В, левый столбец, зеленый). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализированы с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1.

На фиг. 28: обработка ASO опосредует антифибротические эффекты опухоли. Клетки рака легких человека A549 наблюдали после предварительной инкубации с TGF-β1 (48 ч) с последующей трансфекцией гимнозисом ASO по изобретению и совместным воздействием с обработкой TGF-β1 (72 ч). Клетки метили антителом к CTGF (фиг. 32А, левый столбец, красный) и FN (фиг. 32В, левый столбец, зеленый). Ядерную ДНК окрашивали DAPI (средний столбец, синий). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с помощью программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1.

На фиг. 29 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 209x в форме гапмера, состоящий из 16 нуклеотидов с 2 звеньями LNA (Gb¹ и Tb¹) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (Ab¹ и Gb¹ и C*b¹) на терминальном 3'-конце и 11 нуклеотидов ДНК (dA, dG, dT, dG, dT, dT, dT, dA, dG, dG и dG) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в терминальных концевых группах на терминальном 5'-конце и на терминальном 3'-конце.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2064	16	209x	/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹/3SpC3s/

На фиг. 30 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 152h в форме гапмера, состоящий из 15 нуклеотидов с 4 звеньями LNA (С*b¹ и Gb¹ и Ab1 и Tb¹) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (Ab¹ и C*b¹ и Ab¹) на терминальном 3'-конце и 8 нуклеотидов ДНК (dA, dC, dG, dC, dG, dT, dC и dC) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в первом и втором последнем звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
429	15	152h	Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹

На фиг. 31 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 143h в форме гапмера, состоящий из 14 нуклеотидов с 2 звеньями LNA (С*b¹ и Tb¹s) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (C*b¹ и C*b¹ и Gb¹) на терминальном 3'-конце и 9 нуклеотидов ДНК (dC, dG, dT, dC, dA, dT, dA, dG и dA) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в первом, третьем от последнего и втором звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
355	14	143h	Cb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sC*b¹sGb¹

На фиг. 32 показан антисмысловой олигонуклеотид SEQ ID NO: 213k в форме гапмера, состоящий из 17 нуклеотидов с 3 звеньями LNA (С*b¹ и Ab¹ и Gb¹) на терминальном 5'-конце и 3 звеньями LNA (Gb¹ и Tb¹ и Gb¹) на терминальном 3'-конце и 11 нуклеотидов ДНК (dG, dC, dA, dT, dT, dA, dA, dT, dA, dA и dA) между сегментами LNA с фосфоротиоатными межнуклеотидными связями и азотистым основанием 5-метилцитозином (C*) в первом звене LNA от терминального 5'-конца.

SP	L	SEQ ID NO.	Последовательность, 5'-3'
2355	17	213k	C*b¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹

Примеры

Материалы и методы

Большинство антисмысловых олигонуклеотидов, а также контрольных или стандартных олигонуклеотидов, используемых здесь, синтезировали EXIQON в качестве заказных олигонуклеотидов в соответствии с потребностями изобретателей/заявителя. Олигонуклеотиды, имеющие следующие последовательности, использовали в качестве стандартов:

Стандартный олигонуклеотид 0=dCsdAsdGsdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsdAsdTsdG (SEQ ID NO: 147c);

Стандартный олигонуклеотид 1=Ab1sAb1sC*b1sdAsdCsdGsdTsdCsdTsdAsdTsdAsC*b1sGb1sC*b1 (SEQ ID NO: 76);

Стандартный олигонуклеотид 2=C*b1sAb1sGb1sdCsdCsdCsdCsdCsdGsdAsdCsdCsdCsAb1sTb1sGb1 (SEQ ID NO: 147m);

Стандартный олигонуклеотид 3=TTGAATATCTCATGAATGGA; содержащий 2'-MOE-группы (5 звеньев 5'и 3') и фосфоротиоатные связи (SEQ ID NO: 80);

Стандартный олигонуклеотид 4=CAGAAGAGCTATTTGGTAGT; содержащий 2'-MOE-группы (5 звеньев 5'и 3') и фосфоротиоатные связи (SEQ ID NO: 82);

Стандартный олигонуклеотид 5=TGGTAGTGTTTAGGGAGCCG (SEQ ID NO: 85)

Стандартный олигонуклеотид 6=GTGCAGGGGAAAGATGAAAA (SEQ ID NO: 344)

Стандартный олигонуклеотид 7=GAGCTCTTGAGGTCCCTGTG (SEQ ID NO: 345)

Стандартный олигонуклеотид 8=AGCCTCTTTCCTCATGCAAA (SEQ ID NO: 346)

Стандартный олигонуклеотид 9=CCTTCTCTGCTTGGTTCTGG (SEQ ID NO: 347) и

Стандартный олигонуклеотид 10=GCCATGGAGTAGACATCGGT (SEQ ID NO: 348).

Протоколы стандартных процедур:

Культивирование клеток:

Таблица 10: следующие человеческие клеточные линии использовали для опытов с антисмысловыми олигонуклеотидами
Описание	Клеточная линия	Содержание CO₂	Среда
Меланома	HTZ-19	5%	DMEM F12 (Gibco 31331-018)+1% dM-Mix (трансферин (30 мг/мл в воде 835 мкл, незаменимые AS (100×) 10 мл, селенит натрия (0,2 мг/мл в воде) 70 мкл, 10 мл PBS), 1% P/S
Карцинома легких	A549	5%	Kaighn's F12 K+10% FCS+1% P/S
Гепатоцеллюлярная карцинома	HepG2	5%	DMEM (Sigma D6429)+10% FCS+1% P/S
Гепатоцеллюлярная карцинома	Hep3B	5%	DMEM (Sigma D6429)+10% FCS+1% P/S
Эпителиоидная карцинома поджелудочной железы	Panc-1	5%	DMEM (Sigma D6429)+10% FCS+1% P/S
Аденокарцинома поджелудочной железы	HPAFII	5%	DMEM (Sigma D5796)+15% FCS, 1% P/S, 1% антибиотик/антимикотик, 1% MEM раствор витаминов, 1% незаменимые AS (100×)
Аденокарцинома поджелудочной железы	BxPC-3	5%	RPMI (Gibco A10491-01)+10% FCS+1% P/S+1% антибиотик/антимикотик, 1% MEM раствор витаминов
Рак поджелудочной железы с метастазами в печень	L3.6pl	5%	DMEM (Sigma D5796)+15% FCS, 1% P/S, 1% антибиотик/антимитотик, 1% раствор витаминов, 1% незаменимые AS (100×)
Колоректальная аденокарцинома	HT-29	5%	DMEM (Sigma D5796)+15% FCS, 1% P/S, 1% антибиотик/антимикотик, 1% MEM раствор витаминов, 1% незаменимые AS (100×)
Эпителиальная колоректальная аденокарцинома	CaCo2	5%	DMEM (Sigma D5796)+20% FCS+1% P/S
Карцинома желудка	™K-1	5%	DMEM (Sigma D5796)+10% FCS+1% P/S, 1% антибиотик/антимикотик, 1% MEM раствор витаминов
Злокачественная астроцитома	HTZ-243	5%	DMEM (Sigma D6046)+10% FCS+1% P/S+1% незаменимые AS+1% MEM раствор витаминов
Карцинома молочной железы	MCF-7	5%	DMEM (Sigma D6046)+10% FCS+1% P/S
Аденокарцинома предстательной железы	PC-3M	5%	RPMI (Gibco #61870-010), 10% FCS, 1% пируват натрия, 1% бикарбонат натрия, 1% P/S
Острый миелоидный лейкоз	KG-1	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+1% P/S
Хронический миелоидный лейкоз	K562	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+1% P/S
Моноцитарный лейкоз	THP-1	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+0,5% P/S
Промиелоцитарный лейкоз	HL60	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+0,5% P/S
Лимфоцитарный лейкоз	CEM-C7H2	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+0,5% P/S
Острый лимфобластный лейкоз	Pre-B697	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+0,5% P/S
Гистиоцитарная лимфома	U937	5%	RPMI (Gibco #61870-010)+10% FCS+0,5% P/S
Клетки-предшественники нейронов кортикальной области головного мозга	ReNcell CX	5%	Среда для поддержания нейрональных стволовых клеток ReNcell (Millipore #SCM005)+основный человеческий FGF+человеческий EGF+добавка N2

Материал:

FCS (ATCC #30-2020)

Пируват натрия (Sigma #S8636)

Бикарбонат натрия (Sigma #S8761-100ML)

Трансферрин (Sigma #T8158-100MG)

Селенит натрия (Sigma #S5261-10G)

Пенициллин/стрептомицин (P/S) (Sigma-Aldrich #P4458)

Незаменимые аминокислоты (AS) 100× (Sigma #M7145)

Антибиотик/антимикотик (Sigma #A5955)

MEM раствор витаминов (Sigma #M6895)

PBS (Sigma #D8537)

Основный фактор роста фибробластов человека (Millipore #GF003)

Эпидермальный фактор роста человека (Millipore #GF144)

Добавка N-2 (Life Technologies #17502048)

Среда для поддержания нейрональных стволовых клеток ReNcell (Millipore #SCM005)

Культивирование и диссеминирование клеток:

После удаления среды клетки промывали PBS и инкубировали с аккутазой (Sigma-Aldrich #P4458) (5 мин, комнатная температура). После инкубации клетки подвергали разделению и добавляли полную среду (3 мл, компания-производитель: смотри таблицу 10 для соответствующих клеточных линий). Затем клетки переносили в пробирку Эппендорфа емкостью 5 мл и центрифугировали (5 мин, 1000 об/мин, комнатная температура). Осадок из флакона 1 T75 (Sarstedt #833.910.302) ресуспендировали в 2,5 мл свежей среды. Количество клеток в клеточной суспензии определяли с помощью автоматического счетчика клеток Luna-FL™ (Biozym #872040) окрашиванием с использованием набора для анализа жизнеспособности клеток окрашиванием красителем акридиновый оранжевый/пропидиум иодид (Biozym #872045). Для адгезии клеток ReNcell CX^® необходимо покрытие планшетов ламинином (Millipore #CC095) перед посевом клеток для экспериментов из расчета 2 мкг/см². Раствор ламинина-PBS вносили в соответствующем количестве непосредственно в лунки и колбы и инкубировали в течение 1,5 ч при 37°С. Для экспериментов клетки высевали и собирали, как описано в методическом подразделе соответствующего экспериментального раздела. После инкубирования в течение ночи клеток при 37°С и 5% СО₂ клетки обрабатывали, как описано в соответствующем описании эксперимента. 500 мкл оставшейся клеточной суспензии помещали в новый флакон Т75, заполненный 10 мл свежей полной среды для культивирования клеток.

Анализ РНК

Полную фракцию РНК для синтеза кДНК выделяли с использованием мининабора innuPREP^® (Analytik Jena #845-KS-2040250), следуя инструкциям производителя. Для синтеза кДНК определяли общее содержание РНК с использованием фотометра (Eppendorf, BioPhotometer D30 #6133000907), при разбавлении водой, не содержащей нуклеазы. Затем получали первую цепь кДНК с использованием набора для синтеза кДНК iScript™ (BioRad #170-8891), следуя рекомендациям производителя. Для анализа мРНК проводили ОТ-ПЦР в режиме реального времени с использованием системы детектирования PCR Detection PCR96 Real Time (BioRad #185-5196).

Все пары праймеров, готовые к применению и стандартизованные, смешивали с соответствующим готовым к использованию раствором Mastermix (SsoAdvanced™ Universe SYBR^® Green Supermix (BioRad #172-5271), следуя инструкциям производителя (BioRad Prime PCR Quick Guide). Пары праймеров для экспериментов in vivo были адаптированы соответственно отдельным видам.

Таблица 11: пары праймеров, использованные для анализа мРНК
Пара праймеров	Компания	Номер уникального анализа
Человеческий CDKN1A	BioRad	qHsaCID0014498
Человеческий CDNK1B	BioRad	qHsaCID0012509
Человеческий CFLAR	BioRad	qHsaCID0038905
Человеческий Col4A1	BioRad	qHsaCID0010223
Человеческий CTGF	BioRad	qHsaCED0002044
Человеческий DCX	BioRad	qHsaCID0010869
Человеческий FN1	BioRad	qHsaCID0012349
Человеческий GFAP	BioRad	qHsaCID0022307
Человеческий GNB2L1	BioRad	qHsaCEP0057912
Человеческий ID-2	BioRad	qHsaCED0043637
Человеческий MKi67	BioRad	qHsaCID0011882
Человеческий нестин	BioRad	qHsaCED0044457
Человеческий SERPINE1	BioRad	qHsaCED0043144
Человеческий SOX2	BioRad	qHsaCED0036871
Человеческий TGFβ-RII	BioRad	qHsaCID0016240
Человеческий TP53	BioRad	qHsaCID0013658

В качестве матрицы использовали 1 мкл соответствующей кДНК. РНК, которая не подвергалась обратной транскрипции, служила в качестве отрицательного контроля для ОТ-ПЦР в режиме реального времени. Для относительного количественного анализа использовали ген «домашнего хозяйства» бета-субъединицы-2-подобной 1 гуанин-нуклеотид-связывающего белка (GNB2L1). ОТ-ПЦР в режиме реального времени проводили по следующему протоколу:

Таблица 12: протокол ОТ-ПЦР в режиме реального времени
Период инициации	2 мин	95°C	1x
Денатурация	5 с	95°C	40x
Отжиг, наращение	30 с	60°C	40x
Кривая плавления		65°C-95°C (градиент 0,5°С)	1x

Затем BioRad CFX Manager 3.1 использовали для количественного определения уровня соответствующей мРНК относительно мРНК GNB2L1 и затем нормализовали к необработанному контролю.

Вестерн-блоттинг:

Для анализа белков клетки/ткани лизировали с использованием реагента для экстракции белков млекопитающих M-PER^®/реагента для экстракции белков из тканей T-PER^® (Thermo Scientific, № 78501/#78510), следуя инструкциям производителя. SDS-акриламидные гели (10%) готовили с использованием набора TGX Stain Free™ Fast Cast™ Acrylamide (BioRad #161-0183), следуя инструкциям производителя. Образцы белка (20 мкл) разбавляли 1:5 буфером Лэммли (6,5 мкл, Roti^®-Load1, Roth #K929.1), инкубировали при 60°С в течение 30 мин и весь объем белкового раствора наносили на гель. Разделение белков проводили электрофорезом с использованием Power Power Supply (Biorad #164-5050SP) и камеры для электрофореза Mini-PROTEAN^® Tetra (BioRad #165-8001-SP) (200 В, 45 мин). После электрофореза белки гибридизовали с использованием системы переноса белков с гелей на мембраны Turbo Trans-Blot^® (BioRad #170-4155SP). Все материалы для постановки вестерн-блоттинга входили в набор Trans-Blot^® Turbo RTA PVDF-Midi (BioRad #170-4273).

PVDF-мембрану для блоттинга активировали в метаноле (Merck #1.06009.2511) и уравновешивали в 1× буфере для переноса. После блоттинга (25 В, 1 А, 30 мин) мембраны промывали (3×, 10 мин, комнатная температура) 1× TBS (Roth #10.60.1), содержащим 0,5 мл твина-20 (Roth #9127.1). После этого мембраны блокировали 5% BSA (не содержащий альбумин IgG, Roth #3737.3), разбавляли TBS-T в течение 1 ч при комнатной температуре, добавляли первичные антитела (разведенные в 0,5% BSA в TBS-T, таблица 13) и инкубировали при 4°С в течение 2 суток. Антитела для экспериментов in vivo выбирали соответственно видовой специфичности.

Таблица 13: антитела, использованные для анализа вестерн-блоттингом
Первичное антитело к	Разведение	Компания	Номер заказа
Альфа-тубулин HRP-конъюги рованное (кроличье)	1:2000	Cell Signaling	cs12351s
CollV (кроличье)	1:1000	Abcam	ab6586
CTGF (кроличье)	1:1000	Genetex	GTX-26992
FN (кроличье)	1:250	Proteintech	15613-1-AP
GAPDH XP HRP-конъюгированн ное (кроличье)	1:1000	Cell Signaling	cs8884s
Ki67 (кроличье)	1:500	Abcam	ab15580
pAkt (кроличье)	1:1000	Cell signaling	cs4060s
pErk1/2 (кроличье)	1:1000	Cell signaling	cs4370s
pSmad2 (кроличье)	1:500	Cell Signaling	cs3104
TGF-βRII (кроличье)	1:400	Aviva	ARP44743-T100
Вторичное антитело	Разведение	Компания	Номер заказа
Анти-кроличий IgG, HRP-конъюгированный	1:10000	Cell signaling	cs#12351S

На следующей стадии мембраны промывали TBS-T (3× 10 мин, комнатная температура) и инкубировали со вторичным антителом (1 ч, комнатная температура, таблица 13). После инкубации блоты промывали TBS-T, проявляли с использованием субстрата Luminata™Forte Western HRP (Millipore #WBLUF0500) и полосы детектировали с помощью люминесцентного анализатора изображений (ImageQuant™ LAS 4000, GE Healthcare). Затем блоты промывали TBS-T (3× 10 мин, комнатная температура) и блокировали 5% BSA, разведенным TBS-T (1 ч, комнатная температура). Для сравнения с геном «домашнего хозяйства» мембраны инкубировали с HRP-конъюгированным анти-альфа-тубулин-антителом (1:2000 в 0,5% BSA, 4°С, в течение ночи). На следующий день блоты проявляли с использованием субстрата Luminata™Forte Western HRP (Millipore #WBLUF0500) и полосы детектировали с помощью люминесцентного анализатора изображений. Наконец, блоты промывали TBS-T (3× 5 мин) и окрашивали с использованием 1х раствора Roti^®-Blue (Roth #A152.2) и высушили при комнатной температуре.

Иммуноцитохимия

Клетки обрабатывали и собирали, как описано выше. После фиксации клеток с использованием Roti^®-Histofix 4% (Roth #P087.4) в 8-луночных слайд-планшетах для культивирования клеток (6 мин, комнатная температура) их трижды промывали PBS. После блокирования клеток в течение 1 ч при комнатной температуре с помощью блокирующего раствора (Zytomed #ZUC007-100) клетки инкубировали с соответствующими первичными антителами, приведенными в таблице 14, и инкубировали при 4°С в течение ночи.

Затем клеточные культуральные слайды трижды промывали PBS после инкубации со вторичным антителом (1 ч, комнатная температура). Все разведения антител готовили с помощью разбавителя антител (Zytomed #ZUC025-100).

Таблица 14: антитела, использованные для иммуноцитохимии
Первичное антитело к	Разведение	Компания	Номер заказа
CollV (кроличье)	1:50	Abcam	ab6586
CTGF (кроличье)	1:50	Genetex	GTX26992
βIII-тубулин (кроличье)	1:100	cell signaling	cs5568
FN (кроличье)	1:50	Proteintech	15613-1-AP
Ki67 (кроличье)	1:100	Abcam	ab15580
NeuN (кроличье)	1:250	Abcam	Ab104225
Фаллоидин Alexa Fluor 555	1:20	Cell signaling	cs8953
pSmad2 (кроличье)	1:50	Cell signaling	cs3104s
pSmad3 (кроличье)	1:50	Cell signaling	cs9520s
TGF-R_II (кроличье)	1:50	Millipore	06-227
Вторичное антитело	Разведение	Компания	Номер заказа
Alexa Fluor 488	1:750	Life Technologies	A21441
Cy3 козье-антикро личье	1:1000	Life Technologies	A10520

После инкубации со вторичным антителом клетки трижды промывали PBS, покровные стекла снимали с планшетов для культивирования клеток и монтировали препараты с использованием среды для монтировки VECTASHIELD^® HardSet™ с DAPI (Biozol #VEC-H-1500). Препараты высушивали в течение ночи при 4°С перед флуоресцентной микроскопией (Zeiss, Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с использованием программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7.

Эксперименты in vivo

Тест с мононуклеарными клетками периферической крови

РВМС отделяли от лейкоцитарной пленки, соответствующей трансфузионным единицам 500 мл полной крови. Каждую единицу получали от здоровых добровольцев, и цитрат глюкозы использовали в качестве антикоагулянта. Готовили лейкоцитаную пленку крови, и она была доставлена Банком крови Suhl Института трансфузионной медицины, Германия. Кровь от каждого донора проверяли на антитела к ВИЧ, антитела к HCV, антиген HBs, TPHA, ВИЧ-РНК и SPGT (ALAT). Только образцы крови с отрицательным результатом при тестировании на наличие инфекционных агентов и с нормальным значением SPGT использовали для разделения лейкоцитов и эритроцитов низкоскоростным центрифугированием. Выделение РВМС проводили в течение 40 ч с момента отбора у донора градиентным центрифугированием с использованием Ficoll-Histopague^® 1077 (Heraeus™ Multifuge™ 3 SR). Для анализа IFN-α PBMC высевали из расчета 100000 клеток/лунку 96-луночного планшета в 100 мкл полной среды плюс добавки (RPMI1640+L-Glu,+10% FCS+PHA-P (5 мкг/мл)+IL-3 (10 мкг/мл)) и добавляли тестируемые соединения (5 мкл) для прямой инкубации (24 ч, 37°С, 5% CO₂). Для анализа TNF-α РВМС высевали из расчета 100000 клеток/лунку 96-луночного планшета в 100 мкл полной среды без добавок (RPMI1640+L-Glu+10% FCS) и вносили тестируемые соединения (5 мкл) для прямой инкубации (24 ч, 37°С, 5% СО₂). ELISA (измерения в двух повторностях из объединенных супернатантов, 20 мкл) проводили для анализа huIFNα (eBioscience, #BMS216INSTCE), следуя инструкциям производителя. ELISA (измерения в двух повторностях из объединенных супернатантов, 20 мкл) проводили для анализа huTNFα (eBioscience, #BMS223INSTCE), следуя инструкциям производителя.

Анализ bДНК

Уровни мРНК TGF-R^II определяли в лизате печени, почек и легких анализом bДНК, следуя инструкциям производителя (набор QuantiGene^®, Panomics/Affimetrix).

Иммунофлуоресценция

Из заключенной в парафин ткань спинного мозга и головного мозга готовили срезы толщиной 5 мкм (3-4 среза на предметное стекло). Парафиновые срезы депарафинизировали и демаскировали нагреванием в цитратном буфере (10 мМ, 40 мин) в микроволновой печи. Затем депарафинизированные срезы инкубировали с 0,3% H₂O₂ (30 мин, комнатная температура), промывали PBS (10 мин, комнатная температура) и блокировали блокирующим раствором (Zytomed #ZUC007-100) в течение 30 мин. После блокирования в течение 1 ч при комнатной температуре с помощью блокирующего раствора (Zytomed) срезы инкубировали с 150 мкл соответствующих первичных антител и инкубировали при 4°С в течение ночи. После промывки PBS (три раза, 5 мин, комнатная температура) срезы инкубировали с вторичным антителом в течение 1 ч при комнатной температуре. Все разведения антител готовили с использованием разбавителя для антител (Zytomed #ZUC025-100). Затем срезы снова промывали PBS (три раза, 5 мин, комнатная температура) и монтировали с использованием среды для монтировки VECTASHIELD^® с DAPI (Vector). Антитела для иммунофлюоресценции были сопоставимы с таковыми в экспериментах по культивированию клеток и адаптированы для каждого вида.

Электрохемилюминесценция

Для выявления иммунологических и гематологических изменений использовали метод электрохемилюминесценции (MesoScale Discovery^®, Мэриленд, США). Для каждого анализа использовали 25 мкл образцов белка, крови и спинномозговой жидкости, и процедуру выполняли, следуя инструкциям производителя.

Анализ BrdU

Мечение делящихся клеток проводили внутрибрюшинной инъекцией аналога тимидина BrdU (Sigma, Steinheim, Германия) в дозе 50 мг/кг массы тела с использованием стерильного раствора BrdU с концентрацией 10 мг/мл, растворенного в 0,9% (мас./об.) растворе NaCl. Инъекции BrdU проводили ежедневно на последней неделе эксперимента.

Хирургия

Для длительной центральной инфузии животных подвергали хирургической операции для имплантации icv канюли, присоединенной к осмотическому мининаносу Alzet^® (мыши, крысы, скорость инфузии 0,25 мкл/ч, Alzet^®, модель 2004, Купертино, США) или газовому насосу давления (обезьяны рода Cynomolgus, скорость инфузии 0,25 мл/ч, Tricumed^®, Model IP 2000V, Германия). Канюлю и насос стереотаксически имплантировали под анестезией кетамином/ксилацином (Baxter, GmbH, Германия) в полустерильных условиях. Каждый осмотический мининасос/газовый насос давления имплантировали подкожно со стороны брюшной области посредством разреза кожи длиной 1 см на шее животных и соединяли с icv канюлей силиконовыми трубками. Животных помещали в стереотаксическую рамку, и icv канюлю погружали в правый боковой желудочек. Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^® Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций мышей местно обрабатывали препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 0,1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубку заполняли соответствующим раствором. Для анализа отбирали образцы крови, спинномозговой жидкости и тканей. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм, окрашенных крезил-фиолетовым.

Показатели клинического исхода и функциональный анализ

Начало симптоматического заболевания, начало первого пареза и выживаемость использовались в качестве конечных точек в опытах in vivo. Начало симптоматического течения заболевания определяли по отсутствию вытягивания конечностей в тесте подвешивания за хвост. Временная точка, на которой были обнаружены нарушения походки (например, качающаяся походка или прихрамывание), принимали за начало первого пареза. Эти показатели определяли ежедневно, начиная с 40 суток.

Для наблюдения за прогрессированием заболевания проводили тест «беличье колесо» (LMTB, Берлин, Германия). Животных помещали в клетки по отдельности с доступом к «беличьему колесу», начиная с 33-дневного возраста. Моторная активность непосредственно коррелировала с количеством оборотов в минуту, проделанных каждым животным на «беличьем колесе». Каждый полный оборот колеса производил два электромагнитных сигнала, напрямую подаваемых в компьютер, подключенный максимум к 120 колесам. Данные по тесту «беличье колесо» записывались и анализировались с помощью программного обеспечения «Maus Vital» (Laser- und Medizin-Technologie, Берлин, Германия). Время оценки составляло 12 ч с 18:00 до 6:00.

Пространственное обучение (водный бассейн Морриса)

Тестирование поведенческих реакций проводили с 8:00 до 13:00. Крыс обучали в черном круглом бассейне (диаметром 1,4 м, высотой 50 см, заполненном теплой водой 20°C до высоты 30 см), для поиска видимой белой мишени (10 см в диаметре, поднятой над поверхностью воды примерно на 1 см), которую располагали в течение всего исследования в центре того же воображаемого квадрата (проксимальный сигнал). Каждое животное обучалось ориентироваться на платформе в 3 последовательных раундах с 12 испытаниями/раунд, один раунд в день и с интервалом между испытаниями 10-20 с.

Микробиологический анализ

Образцы антисмысловых олигонуклеотидов подвергали микробиологическому анализу согласно статье Европейской фармакопеи 2.6.12, статье Фармакопеи США 30 <61> в отношении общего количества аэробных микроорганизмов (TAMC) и общего комбинированного количества дрожжей и форм (TYMC).

Анионобменная высокоэффективная жидкостная хроматография (AEX-HPLC)

Целостность и стабильность образцов антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) определяли с помощью AEX-HPLC с использованием системы ÄKTAexplorer™ (GE Healthcare, Фрайбург, Германия). Очищенные образцы ASO обессоливали осаждением этанолом. Идентичность ASO подтверждали методом масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением (ESI-MS) и чистоту определяли AEX-HPLC на колонке Dionex DNAPac™ 200 (4×250 мм).

Пример 1: определение ингибирующей активности антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению на уровень мРНК

1.1. Трансфекция антисмысловых олигонуклеотидов

Ингибирующую активность нескольких антисмысловых олигонуклеотидов, направленных против TGF-R_II, тестировали на человеческих эпителиальных клетках рака легких (A549). мРНК TGF-R_II определяли количественным анализом с использованием метода разветвленной ДНК в общей мРНК, выделенной из клеток, инкубированных с TGF-R_II-специфическими олигонуклеотидами.

Описание метода:

Клетки получали и культивировали, как описано выше. Трансфекцию антисмысловых олигонуклеотидов проводили непосредственно после посева 10000 клеток A549/лунку в 96-луночном планшете и проводили с использованием Lipofectamine^® 2000 (Invitrogen GmbH, Карлсруэ, Германия, номер по каталогу 11668-019), как описано производителем. В двух независимых экспериментах с одной концентрацией, проведенных в четырех повторностях, олигонуклеотиды трансфектировали при концентрации 20 нМ. После трансфекции клетки инкубировали в течение 24 ч при 37°С и 5% CO₂ в увлажненном термостате (Heraeus GmbH, Ханау, Германия). Для измерения мРНК TGF-R_II клетки собирали и лизировали при 53°С, следуя процедурам, рекомендованным производителем набора QuantiGene^® Explore (Panomics, Fremont, CA, USA, номер по каталогу QG0004) для выделения разветвленной ДНК (bДНК). Для количественного определения содержания мРНК гена «домашнего хозяйства» глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH) использовали набор QuantiGene^® Explore, в то время как количественное определение мРНК TGF-R_II проводили с использованием набора QuantiGene^® 2.0 (произведено на заказ для Axolabs GmbH, Kulmbach, Германия). После инкубации и лизиса 10 мкл лизатов инкубировали с наборами зондов, специфичных к человеческому TGF-R_II и человеческой GAPDH. Оба типа реакции проводили, следуя протоколу производителя, для соответствующего набора QuantiGene^®. Хемолюминесценцию измеряли на счетчике Victor²™ multilabel counter (Perkin Elmer, Wiesbaden, Германия) в виде RLU (относительныесветовые единицы), и значения, полученные с наборами зондов к TGF-R_II, нормализовали к соответствующим значениям GAPDH для каждой лунки, и затем нормализовали к соответствующему показанию мРНК из ложнообработанных клеток.

Результаты

Результаты свидетельствуют о выраженной подавляющей регуляции TGF-R_II несколькими ASO после трансфекции клеток A549. Понижающая регуляция после трансфекции стандартных олигонуклеотидов 6-10 не была столь эффективной и приводила к подавлению не более чем на 60%.

Таблица 15: понижающая регуляция мРНК TGF-R_II. Трансфекция TGF-R_II-специфическими антисмысловыми олигонуклеотидами (ASO) клеток эпителиальной карциномы легких человека (A549). Количественное определение уровней экспрессии мРНК проводили по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием набора QuantiGene^®. Затем зонды нормализовали к соответствующему показанию для мРНК из ложнообработанных клеток.


	A549 (c=20 нМ)
	GAPDH	TGF-R_II
среднее	SD	среднее	SD
ASO
SEQ. ID NO: 141j	1,41	0,05	0,02	0,01
SEQ. ID NO: 143aj	0,76	0,03	0,02	0,01
SEQ. ID NO: 139c	0,9	0,03	0,02	0,01
SEQ. ID NO: 145c	0,91	0,05	0,03	0,01
SEQ. ID NO: 209ax	1,52	0,58	0,03	0,01
SEQ. ID NO: 152ak	0,88	0,03	0,04	0
SEQ. ID NO: 218ar	1,08	0,03	0,04	0
SEQ. ID NO: 144c	0,5	0,07	0,05	0,03
SEQ. ID NO: 210ap	0,92	0,05	0,05	0,01
SEQ. ID NO: 142c	1,33	0,05	0,06	0,03
SEQ. ID NO: 213ak	1,2	0,03	0,07	0,01
SEQ. ID NO: 153f	1,09	0,07	0,08	0,03

Заключение

ASO по изобретению были эффективно нацелены на мРНК TGF-R_II. Указанные ASO обеспечивали эффективную понижающую регуляцию мРНК-мишени после трансфекции клеток A549.

1.2. Поглощение гимнозисом антисмысловых олигонуклеотидов

1.2.1a Сравнение нокдаунов мишени для ASO по изобретению и последовательностям предшествующего уровня трансфекцией гимнозисом в клетках A549 и Panc-1

Понижающую регуляторную активность нескольких антисмысловых олигонуклеотидов, нацеленных на TGF-R_II, тестировали в человеческих эпителиальных клетках рака легких (A549) путем прямого поглощения без использования трансфекционных реагентов («поглощение гимнозисом»). мРНК TGF-R_II определяли количественным анализом с использованием метода разветвленной ДНК в общей мРНК, выделенной из клеток, инкубированных с TGF-R_II-специфическими олигонуклеотидами.

Описание метода:

Клетки получали и культивировали, как описано в общих методах. Трансфекцию гимнозисом антисмысловых олигонуклеотидов осуществляли приготовлением 96-луночного планшета с соответствующими антисмысловыми олигонуклеотидами и последующим посевом из расчета 10000 клеток (Panc-1) или 8000 клеток (A549)/ лунку. Эксперименты проводили в четырех повторностях, олигонуклеотиды использовали в конечных концентрациях 5 мкМ (Panc-1) и 7,5 мкМ (A549). Клетки инкубировали в течение 72 ч при 37°С и 5% CO₂ в увлажненном термостате (Heraeus GmbH, Hanau, Германия). Для измерения мРНК TGF-R_II клетки собирали и лизировали при 53°С, следуя процедурам, рекомендованным производителем набора QuantiGene^® Explore (Panomics, Fremont, CA, США, номер по каталогу QG0004) для разветвленной ДНК (bДНК). Для количественного определения мРНК гена «домашнего хозяйства» GAPDH использовали набор QuantiGene^® Explore, в то время как количественное определение мРНК TGF-R_II проводили с использованием набора QuantiGene^® 2.0 (произведен по заказу для Axolabs GmbH, Kulmbach, Германия). После инкубации и лизиса 10 мкл лизатов инкубировали с наборами зондов, специфичными к человеческому TGF-R_II и человеческому GAPDH. Оба типа реакции проводили, следуя протоколу производителя для соответствующего набора QuantiGene^®. Хемолюминесценцию измеряли на счетчике Victor2™ multilabel counter (Perkin Elmer, Wiesbaden, Германия) в виде RLU (относительные световые единицы), и значения, полученные с наборами зондов TGF-R_II нормализовали к соответствующим значениям GAPDH для каждой лунки, и затем нормализовали к соответствующему показанию мРНК из обработанных PBS клеток.

Выбранные результаты представлены в таблице 16a. Дальнейшие модифицированные последовательности SEQ ID NO: 209ay, SEQ ID NO: 209аx и SEQ ID NO: 209y, а именно ASO, представленные в таблице 6 описания, показали сравнимые значения с этими тремя антисмысловыми олигонуклеотидами. Кроме того, модификации SEQ ID NO: 152h, а именно ASO, представленный в таблице 5 описания, показали сравнимые значения с этим антисмысловым олигонуклеотидом. Модификации SEQ ID NO: 218b, а именно ASO, представленный в таблице 8 описания, показали сравнимые значения с антисмысло-олигонуклеотидом SEQ ID NO: 218b. Модификации SEQ ID NO: 213k, а именно ASO, представленные в таблице 9 описания, показали сопоставимые значения с антисмысловыми олигонуклеотидом SEQ ID NO: 213k. Также модификации SEQ ID NO: 210q, а именно ASO, представленный в таблице 7 описания, показали сопоставимые значения с антисмысловым олигонуклеотидом SEQ ID NO: 210q. Наконец, модификации SEQ ID NO: 143h, а именно ASO, представленный в таблице 4 описания, показали сопоставимые значения с антисмысловым олигонуклеотидом SEQ ID NO: 143h. Трансфекция антисмысловых олигонуклеотидов, представленных в таблицах 4-9, приводила к более сильной понижающей регуляции мРНК-мишени TGF-R_II по сравнению с трансфекцией тестированных стандартных последовательностей (клетки A549: подавление <0,5, клетки Panc1: подавление <0,4).

Таблица 16а: эффективность понижающей регуляции мРНК-мишени посредством трансфекции гимнозисом. Оставшаяся мРНК TGF-R_II после поглощения гимнозисом выбранных TGF-R_II-специфических ASO в клетках A549 и Panc-1. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH) и сравнивали с клетками, обработанными PBS, которые использовали в качестве контроля (=1) с использованием набора QuantiGene^®.


ASO	Оставшаяся мРНК TGF-R_II (обработанные PBS клетки=1)
ASO	клетки A549	клетки Panc1
среднее	SD	среднее	SD
SEQ. ID NO: 209ay	0,11	0,01	0,07	0,02
SEQ. ID NO: 209ax	0,14	0,02	0,08	0,01
SEQ. ID NO: 209bb	0,19	0,01	0,11	0,01
SEQ. ID NO: 209az	0,19	0,03	0,13	0,02
SEQ. ID NO: 209ba	0,23	0,02	0,18	0,03
SEQ. ID NO: 209y	0,27	0,04	0,17	0,01
SEQ. ID NO: 152h	0,29	0,04	0,12	0,02
SEQ. ID NO: 218b	0,30	0,02	0,07	0,01
SEQ. ID NO: 213k	0,34	0,04	0,17	0,04
SEQ. ID NO: 210q	0,37	0,05	0,18	0,02
SEQ. ID NO: 210aq	0,39	0,03	0,18	0,02
SEQ. ID NO: 143h	0,43	0,04	0,35	0,05
Стандарт 2	0,59	0,05	0,40	0,04
Стандарт 0	0,89	0,06	1,10	0,07
Стандарт 3	0,68	0,03	0,62	0,03
Стандарт 4	0,74	0,04	0,71	0,01

Заключение:

Трансфекция гимнозисом ASOs по изобретению приводит к неизменно более сильной понижающей регуляции мРНК-мишени TGF-R_II, чем трансфекция тестированными контрольными последовательностями. Антисмысловые олигонуклеотиды по изобретению превосходили все тестированные последовательности, известные из предшествующего уровня техники, независимо от выбранной клеточной линии человека. Тем не менее, в целом антисмысловые олигонуклеотиды, имеющие длину 12-20 нуклеотидов, приводят к более эффективной понижающей регуляции мРНК-мишени TGF-R_II, чем более короткие или более длинные антисмысловые олигонуклеотиды. Такой эффект был еще более заметным для антисмысловых олигонуклеотидов, имеющих длину 14-18 нуклеотидов, которые, как правило, проявляли наиболее сильные эффекты.

1.2.1b Анализ трансфекции гимнозисом клеток A549 с использованием метода разветвленной ДНК

Наиболее эффективные антисмысловые олигонуклеотиды против TGF-R_II по данным скрининга трансфекции были дополнительно охарактеризованы поглощением гимнозисом в клетки A549. мРНК TGF-R_II количественно определяли методом разветвленной ДНК в общей мРНК, выделенной из клеток, инкубированных с TGF-R_II-специфическими антисмысловыми олигонуклеотидами.

Описание метода:

Клетки A549 культивировали, как описано ранее в стандартных условиях. Для экспериментов с одной концентрацией и исследования зависимости концентрация-эффект 80000 клеток A549/лунку высевали в 6-луночный культуральный планшет и инкубировали непосредственно с олигонуклеотидами в концентрации 7,5 мкМ. Для измерения мРНК TGF-R_II клетки собирали, лизировали при 53°С и анализировали методом разветвленной ДНК, следуя процедурам, рекомендованным производителем набора QuantiGene^® Explore (Panomics, Fremont, CA, USA, номер по каталогу QG0004), как описано выше (смотри 1.1).

Результаты:

Приведенные ASO в таблице 16b показали снижение уровня мРНК-мишени TGF-R_II по сравнению с геном «домашнего хозяйства» GAPDH в клетках A549. Для десяти наиболее эффективных ASO также определяли 50% ингибирующую концентрацию (IC₅₀). Все SEQ ID NO: 209t, SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218с и SEQ ID NO: 209y приводили к наиболее специфическому нокдауну TGF-R_II в низких концентрациях.

Таблица 16b: понижающая регуляция мРНК TGF-R_II после поглощения гимнозисом TGF-R_II-специфических ASO в клетках A549. Уровни мРНК определяли относительно гена «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием набора QuantiGene^®. IC₅₀=ингибирующая концентрация, вызывающая 50% понижающую регуляцию, Pos. Ctrl: LNA, нацеленные на aha-1=активатор белка теплового шока 90 кДа гомолога ATPазы 1 (Aha1), который использовали в качестве положительного контроля, стандартный образец 1=скремблированный контроль.


ASO	TGF-RII n=4	SD	GAPDH n=4	SD	IC50 n=4
SEQ. ID NO: 209t	0,19	0,05	1,13	0,11	1,63
SEQ. ID NO: 218c	0,25	0,04	0,94	0,18	1,17
SEQ. ID NO: 218b	0,26	0,08	1,08	0,28	2,54
SEQ. ID NO: 218q	0,27	0,07	1,11	0,08	2,39
SEQ. ID NO: 209y	0,34	0,06	0,96	0,06	1,57
SEQ. ID NO: 218t	0,36	0,12	0,76	0,04	2,57
SEQ. ID NO: 218m	0,41	0,06	1,16	0,29	1,66
Seq. ID No: 209w	0,44	0,07	1,00	0,11	5,76
SEQ. ID NO: 218p	0,46	0,12	0,88	0,07
SEQ. ID NO: 209v	0,48	0,25	0,96	0,07	3,10
SEQ. ID NO: 209x	0,52	0,02	0,87	0,06	5,60
SEQ. ID NO: 218u	0,53	0,20	0,79	0,05
SEQ. ID NO: 218v	0,54	0,13	0,77	0,04
SEQ. ID NO: 210q	0,60	0,23	1,11	0,11
SEQ. ID NO: 218o	0,61	0,15	0,96	0,06
SEQ. ID NO: 210p	0,65	0,24	1,01	0,23
SEQ. ID NO: 218n	0,89	0,36	1,07	0,22
SEQ. ID NO: 210o	0,95	0,08	0,97	0,14
SEQ. ID NO: 209s	0,96	0,31	1,14	0,24
pos. Ctrl aha-1	0,22	0,04	0,77	0,02
Стандартный олигонуклеотид 1	1,43	0,40	1,27	0,18

Заключение:

Понижающая регуляция мишени наиболее эффективными ASO по изобретению вновь была высокой без использования трансфекционных реагентов. Таким образом, трансфекция гимнозисом может быть осуществимым и предпочтительным методом для дальнейшей разработки лекарственного средства.

1.2.2. Анализ поглощения гимнозисом клетками A549 и ReNcell CX ^®

Ингибирующую активность антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) в отношении мРНК-мишени определяли в клетках-предшественниках нейронов из кортикальной области мозга человека (клетки ReNcell CX^®, Millipore #SCM007). Вопросы относительно взрослого нейрогенеза в качестве терапевтической мишени оценивали в опытах по трансфекции гимнозисом с наиболее эффективными ASO. В качестве контрольной клеточной линии использовали клетки A549.

Описание метода:

Клетки A549 и ReNcell CX^® культивировали, как описано выше. Для проведения исследований клетки высевали в 24-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для обработки клеток A549 и ReNcell CX^® среду удаляли и заменяли свежей полной средой (0,5 мл для 24-луночного планшета). Затем стандартный олигонуклеотид 1, ASO с SEQ ID NO: 218b и ASO с SEQ ID NO: 218c добавляли в среду в концентрациях 2,5 и 10 мкМ для анализа понижающей регуляции мишени на различные временные точки (клетки A549: 18 ч, 72 ч, 6 суток, клетки ReNcell CX^®: 18 ч, 96 ч, 8 суток) при 37°С и 5% СО₂. Для сбора клетки дважды промывали PBS и замораживали при -20°C. Для анализа мРНК с использованием ОТ-ПЦР в режиме реального времени клетки обрабатывали, как описано выше. Использовали готовые к применению и стандартизованные пары праймеров для ОТ-ПЦР в режиме реального времени (смотри таблицу 11) и смешивали с соответствующим готовым к применению раствором Mastermix (SsoAdvanced™ Universe SYBR^® Green Supermix (BioRad #172-5271), следуя инструкциям производителя (BioRad Prime PCR Quick Guide). Зонды анализировали в трех повторностях и данные количественно оценивали по отношению к мРНК GNB2L1, используя BioRad CFX Manager™ 3.1, и затем нормализовали к необработанному контролю. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.

Результаты:

Результаты показали, что трансфекция гимнозисом SEQ ID NO: 218b и 218c приводит к специфической понижающей регуляции мРНК TGF-R_II в клетках A549 и ReNcell CX^® в зависимости от концентрации и времени (таблица 17). Уровень мРНК-мишени в клетках A549 был достоверно снижен через 18 ч, и через 72 ч и 6 суток был еще более эффективно снижен. Через 18 ч в клетках ReNcell CX^® наблюдали только незначительное снижение мРНК TGF-R_II после поглощения гимнозисом 10 мкМ, но понижающая регуляция мишени была достоверной через 72 ч для обеих тестируемых концентраций и была стабильной до 8 суток.

Таблица 17: зависимая от концентрации и времени понижающая регуляция мРНК TGF-R_II после трансфекции гимнозисом TGF-R_II-специфического ASO в клетках A549 и ReNcell CX ^®. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, D=SEQ ID NO: 218c, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, +p<0,05, ++p<0,01 по отношению к B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549
Мишень Временная точка	TGF-R_II 18 ч, n=3	TGF-R_II 72 ч, n=3	TGF-R_II 6 суток, n=3
A	1,00±0,03	1,00±0,20	1,00±0,38
B 2,5 мкM	1,17±0,06	0,87±0,21	0,88±0,14
B 10 мкM	0,98±0,10	0,77±0,06	1,03±0,10
C 2,5 мкM	0,60*++±0,09	0,41*±0,07	0,13±0,03
C 10 мкM	0,49**++±0,02	0,15**±0,02	0,02*+±0,00
D 2,5 мкM		0,46**±0,09
D 10 мкM		0,21*±0,04
Клеточная линия	ReNcell CX^®
Мишень Временная точка	TGF-R_II 18 ч, n=3	TGF-R_II 96 ч, n=3	TGF-R_II 8 суток, n=3
A	1,00±0,41	1,00±0,04	1,00±0,18
B 2,5 мкM	1,38±0,58	0,89±0,09	0,80±0,33
B 10 мкM	1,70±0,68	0,81±0,10	1,16±0,43
C 2,5 мкM	1,04±0,36	0,32**±0,06	0,42±0,16
C 10 мкM	0,64±0,24	0,16**±0,02	0,21±0,09
D 2,5 мкM		0,53±0,07
D 10 мкM		0,23**±0,03

Заключение:

Эффективная и стабильная понижающая регуляция мРНК-мишени посредством поглощения гимнозисом ASO достигается даже при длительном применении. Следовательно, клетки ReNcell CX^® можно использовать, например, для экспериментов, направленных на восстановление взрослого нейрогенеза в качестве терапевтического варианта для пациентов. То же самое относится к другим показаниям, как показано результатами экспериментов с клетками А549.

В совокупности, эффективная понижающая регуляция TGF-R_II подходит независимо от способа трансфекции и типа клеток. Поглощение гимнозисом ASO является предпочтительным методом трансфекции, поскольку в клинических применениях отсутствие дополнительных трансфекционных агентов обеспечивает высокую безопасность для пациентов.

Пример 2: определение ингибирующей активности антисмысловых олигонуклеотидов, нацеленных на TGF-R_II, на уровень белка-мишени

Анализ вестерн-блоттингом и иммуноцитохимией проводили для определения того, приводит ли снижение уровня мРНК TGF-R_II, опосредованное антисмысловыми олигонуклеотидами (ASO) по изобретению, в клетках рака легких человека (A549) и клетках-предшественниках нейронов человека (ReNcell CX^®) к снижению уровня белка-мишени.

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано выше. Для обработки клетки высевали в 6-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.3920.300, 80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #946140802, 10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для трансфекции гимнозисом клеток A549 и ReNcell CX^® клеточную среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл на 6-луночного и 0,5 мл на 8-луночного планшетов). Затем стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль), соответствующий ASO по изобретению добавляли в среду в концентрациях 2,5 и 10 мкМ для анализа понижающей регуляции белка-мишени через 72 ч в клетках A549 и 96 ч в клетках ReNcell CX^®. Клетки лизировали и исследовали вестерн-блоттингом, как описано в общем методическом разделе. Первичное антитело к TGF-R_II разводили 0,5% BSA в TBS-T и инкубировали при 4°C в течение 2 суток. После этого мембраны инкубировали со вторичным антителом к кроличьему IgG, конъюгированному с HRP, разведенным 0,5% BSA в TBS-T (1 ч, комнатная температура). После инкубации блоты промывали TBS-T, визуализировали с использованием субстрата Luminata™Forte Western HRP (Millipore #WBLUF0500) и полосы детектировали с помощью люминесцентного анализатора изображений (ImageQuant™ LAS 4000, GE Healthcare). Для сравнения с геном «домашнего хозяйства» мембраны инкубировали с HRP-конъюгированным анти-GAPDH (1:1000 в 0,5% Blotto, 4°С, в течение ночи). Денситометрический количественный анализ проводили относительно GAPDH и затем нормализовали к необработанному контролю с помощью программного обеспечения Image Studio™ Lite.

Процедуру иммуноцитохимии проводили, как описано в стандартном протоколе. Для подтверждения понижающей регуляции мишени анти-TGF-R_II разбавляли и инкубировали в течение ночи при 4°С. В качестве вторичного антитела использовали Cy3-конъюгированное козье антикроличье антитело. Все разведения антител готовили с разбавителем для антител (Zytomed^® #ZUC025-100). Исследование клеток проводили с помощью флуоресцентной микроскопии (Zeiss Axio^® Observer.Z1). Изображения анализировали с использованием программного обеспечения Image J и программного обеспечения CorelDRAW^® X7.

Результаты после трансфекции гимнозисом:

Анализ вестерн-блоттингом и иммуноцитохимией использовали для подтверждения снижения уровня белка TGF-R_II. Через 72 ч после трансфекции гимнозисом уровень белка TGF-R_II был достоверно снижен при использовании высокой концентрации различных ASO по изобретению по сравнению с необработанным контролем в клетках A549 (таблица 18). Сниженные уровни TGF-R_II также наблюдали в клетках ReNcell CX^® (таблица 18). Для обеих клеточных линий снижение уровня белка TGF-R_II было продемонстрировано анализом вестерн-блоттингом. Результаты иммуноцитохимии свидетельствовали о выраженом, зависимом от концентрации снижении белка TGF-R_II в обеих клеточных линиях по сравнению с необработанными клетками и обработанными скремблированным контролем клетками.

Таблица 18: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга TGF-R_II. Наблюдали снижение белка TGF-R_II после трансфекции гимнозисом TGF-RII-специфических ASO в клетках A549 и ReNcell CX^® через 72 ч или 96 ч соответственно. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием програмного обеспечения Image Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, D=SEQ ID NO: 218с, F=SEQ ID NO: 210q, G=SEQ ID NO: 213k, H=SEQ ID NO: 143h, I=SEQ ID NO: 152h, J=SEQ ID NO: 209az, К=SEQ ID NO: 209y, ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549	ReNcell CX^®
Мишень Временная точка	TGF-R_II 72 ч, n=3	TGF-R_II 96 ч, n=2
A	1,00±0,00	1,00±0,00
B 2,5 мкМ	0,85±0,13	0,91±0,12
B 10 мкМ	1,06±0,47	1,23±0,16
C 2,5 мкМ	0,34±0,11	0,59±0,05
C 10 мкМ	0,39*±0,11	0,63±0,17
D 2,5 мкМ	0,68±0,14	1,21±0,28
D 10 мкМ	0,39*±0,07	0,77±0,10
F 2,5 мкМ	0,51±0,08	0,71±0,16
F 10 мкМ	0,45±0,09	0,57±0,12
G 2,5 мкМ	0,41±0,13	0,61±0,10
G 10 мкМ	0,40*±0,06	0,58±0,08
H 2,5 мкМ	0,75±0,12	0,83±0,13
H 10 мкМ	0,51±0,07	0,77±0,06
I 2,5 мкМ	0,58±0,14	0,91±0,21
I 10 мкМ	0,38*±0,14	0,67±0,09
J 2,5 мкМ	0,42±0,15	0,75±0,23
J 10 мкМ	0,34*±0,05	0,59±0,08
K 2,5 мкМ	0,45±0,17	0,69±0,16
K 10 мкМ	0,36*±0,09	0,49±0,09

Заключение:

В дополнении к понижающей регуляции мРНК-мишени трансфекция гимнозисом SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218с, SEQ ID NO: 210q, SEQ ID NO: 213k, SEQ ID NO: 143h, SEQ ID NO: 152h, SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y приводит к выраженному снижению уровня белка-мишени в клетках A549 и ReNcell CX^®. Окрашивание на TGF-R_II выявило дозозависимое снижение уровня белка TGF-R_II после обработки данными ASO в обеих клеточных линиях.

Результаты после трансфекции гимнозисом других дополнительных ASO:

Анализ белка показал пониженное количество TGF-R_II в клетках A549 и клетках ReNcell CX^® после трансфекции гимнозисом тестированных ASO (10 мкМ, таблица 19). Это также было подтверждено результатами иммуноцитохимии. Для обеих клеточных линий можно было выявить снижение уровня белка TGF-R_II под действием трансфекции гимнозисом тестированных ASO по сравнению с необработанными клетками и обработанными скремблированным контролем клетками.

Таблица 19: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга TGF-R_II. Наблюдали снижение уровня белка TGF-R_II после трансфекции гимнозисом TGF-RII-специфических ASO в клетках A549 и ReNcell CX^® через 72 ч или 96 ч соответственно. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета. Снижение уровня белка для ASO 1-25 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h. Снижение уровня белка для ASO 26-48 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h. Снижение уровня белка для ASO 49-74 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y; B=более чем на 10%, но менее чем 20% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y; C=более 20%, но менее чем на 30% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y. Снижение уровня белка для ASO 75-100 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q. Снижение уровня белка для ASO 101-124 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с. Снижение уровня белка для ASO 125-152 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k.

Номер ASO в опыте	SEQ ID NO:	Результат
1	233d	B
2	234d	A
3	143j	C
4	143p	A
5	143q	A
6	143r	A
7	143w	A
8	143af	C
9	143ag	C
10	143ah	C
11	235b	B
12	235d	A
13	141d	A
14	141g	A
15	141i	A
16	237b	A
17	237c	A
18	237i	C
19	237m	A
20	238c	A
21	238f	A
22	239e	B
23	240c	B
24	241b	C
25	242a	C
26	246e	C
27	247d	A
28	248b	A
29	248e	B
30	248g	A
31	152k	B
32	152s	B
33	152t	B
34	152u	B
35	152ab	C
36	152ag	B
37	152ah	C
38	152ai	C
39	249c	A
40	249e	A
41	250b	A
42	250g	B
43	251c	A
44	251f	A
45	252e	B
46	253c	A
47	254b	C
48	255a	C
49	259e	C
50	260d	B
51	261b	A
52	261e	B
53	261g	A
54	262d	B
55	262e	A
56	209s	A
57	209v	B
58	209w	B
59	209x	C
60	209ai	B
61	209an	C
62	209at	A
63	209au	B
64	209av	B
65	263b	B
66	263c	A
67	263i	B
68	263m	A
69	264e	A
70	264h	A
71	265e	B
72	266c	A
73	267b	B
74	268a	B
75	272e	B
76	273d	A
77	274a	A
78	274d	B
79	274f	A
80	275g	A
81	275i	B
82	210o	A
83	210v	B
84	210w	B
85	210x	C
86	210ab	B
87	210ac	A
88	210ad	B
89	210af	A
90	210am	B
91	276b	B
92	276c	A
93	276j	B
94	276k	B
95	277d	A
96	277e	A
97	278f	B
98	279c	B
99	280b	C
100	281a	C
101	220d	C
102	221d	B
103	222b	A
104	222c	A
105	222f	B
106	223c	B
107	223f	A
108	218ad	B
109	218n	A
110	218t	B
111	218u	B
112	218v	C
113	218ah	C
114	218an	A
115	218ao	B
116	218ap	B
117	224i	B
118	224m	B
119	225c	A
120	225f	A
121	226e	B
122	227c	A
123	228b	C
124	229a	C
125	285d	C
126	286d	A
127	287d	B
128	287e	A
129	287f	A
130	288e	A
131	288i	A
132	289d	B
134	289h	A
135	289o	B
136	289p	B
137	289q	B
138	213o	B
139	213p	B
140	213q	B
141	213s	B
142	213y	B
143	213z	B
144	213aa	B
145	213af	B
146	290c	A
147	290f	B
148	290i	A
149	291c	B
150	292c	C
151	293b	C
152	294a	C

Заключение:

В совокупности, дозозависимая понижающая регуляция мРНК TGF-R_II в результате трансфекции гимнозисом в клетках A549 и ReNcell CX^® приводила к дозозависимому снижению уровней белка-мишени. ASO по изобретению являются эффективными в понижающей регуляции белка-мишени, как показано в клетках A549 и ReNcell CX^®.

Пример 3: анализ влияния антисмысловых олигонуклеотидов на сигнальный путь ниже к TGF-R_II.

Функциональные анализы проводили на клетках рака легких человека (A549) и клетках-предшественниках нейронов человека (ReNcell CX^®). Сигнальный путь ниже к TGF-β анализировали, основываясь на эффективной понижающей регуляции мРНК TGF-R_II и снижения уровней белка после трансфекции гимнозисом ASO по изобретению. Следовательно, оценивали уровни мРНК и белка фактора роста соединительной ткани (CTGF), известного как медиатор ниже к TGF-β. Кроме того, исследовали фосфорилирование Smad2 (матери против гомолога декапентаплегии 2). Фосфорилирование Smad2 является маркером активного пути TGF-β, с последующей повышающей регуляцией гена-мишени CTGF ниже.

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано ранее. Для обработки клетки высевали в 6-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.3920.300) (80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% CO₂. Для трансфекции гимнозисом культуральную среду клеток A549 и ReNcell CX^® удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл на 6- луночный и 0,5 мл на 8-луночный планшет). Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль), ASO с последовательностью SEQ ID NO: 218b (SEQ ID NO: 218b), SEQ ID NO: 218c (SEQ ID NO: 218c) в концентрации 2,5 и 10 мкМ и через 72 ч в клетках A549 и 96 ч в клетках ReNcell CX^®проводили соответствующий анализ. Для оценки эффектов на уровень мРНК CTGF проводили ОТ-ПЦР в режиме реального времени, как описано ранее. Пара праймеров для анализа CTGF была готова к применению и стандартизирована. Для определения уровней белка CTGF и pSmad2 использовали вестерн-блоттинг и иммуноцитохимию, как описано ранее. Тип и использованные разведения антител для соответствующего метода приведены в таблицах 13 и 14.

3.1. Результаты для SEQ ID NO: 218b

3.1.1. Влияние на уровень мРНК и белка CTGF

Уровень мРНК CTGF достоверно и дозозависимо снижался после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 (72 ч) и ReNcell CX^® (96 ч). Уровень медиатора ниже к TGF-β уменьшался до 52±0,02% в клетках ReNcell CX^® и до 39±0,03% в клетках A549 после трансфекции гимнозисом 10 мкМ SEQ ID NO: 218b (таблица 20). В совокупности с этими пониженными уровнями мРНК CTGF наблюдали сильное снижение экспрессии белка CTGF в клетках A549 (таблица 21).

Таблица 20: дозозависимая и достоверная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549	ReNcell CX^®
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч, n=3	CTGF 96 ч, n=3
A	1,00±0,08	1,00±0,04
B 2,5 мкM	0,87±0,06	0,97±0,06
B 10 мкM	0,80±0,03	0,86±0,17
C 2,5 мкM	0,60**±0,04	0,66**±0,02
C 10 мкM	0,39**±0,03	0,52**±0,02

Таблица 21: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга CTGF. Наблюдали понижающую регуляцию белка CTGF после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 через 72 ч. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b.


Клеточная линия	A549
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч, n=1
A	1,00
B 2,5 мкM	0,91
B 10 мкM	1,31
C 2,5 мкM	0,05
C 10 мкM	0,086

Заключение:

Функциональное ингибирование сигнального пути TGF-β было достигнуто трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b, что было показано наличием понижающей регуляции мРНК-мишени CTGF и снижением уровней белка CTGF в клетках A549 и ReNcell CX^®.

3.1.2. Влияние на уровень белка pSmad2

Уровни белка pSmad2 анализировали, чтобы подтвердить отрицательную регуляцию CTGF, в качестве специфического результата ASO-опосредованного ингибирования сигнального пути TGF-β.

Окрашивание на pSmad2 после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b через 72 ч в клетках A549 и 96 ч в клетках ReNcell CX^® показало дозозависимое ингибирование фосфорилирования Smad2 (фиг. 5). Кроме того, снижение уровней экспрессии pSmad2 под действием ASO SEQ ID NO:218b подтверждали анализом вестерн-блоттингом в клетках А549 (таблица 22).

Таблица 22: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга pSmad2. Наблюдали понижающую регуляцию белка pSmad2 после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 через 72 ч. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b.


Клеточная линия	A549
Мишень Временная точка	pSmad2 72 ч, n=1
A	1,00
B 2,5 мкM	1,81
B 10 мкM	1,79
C 2,5 мкM	0,66
C 10 мкM	0,72

Заключение:

Трансфекция гимнозисом SEQ ID NO: 218b клеток A549 и ReNcell CX^® приводила к дозозависимому ингибированию медиаторов сигнального пути ниже к TGF-β. Уровни CTGF и фосфорилирование Smad2 снижались под действием ASO SEQ ID NO: 218b, оба факта указывают на ингибирование пути TGF-β.

3.2 Результаты для SEQ ID NO: 218c

3.2.1. Влияние на уровень мРНК CTRF и белка pSmad2

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c приводила к понижающей регуляции мРНК CTGF в клетках A549 и ReNcell CX^® (таблица 23). Данные иммуноцитохимии для pSmad2 подтверждали ингибирование сигнального пути TGF-β (фиг. 6). Следовательно, понижающая регуляция мРНК CTGF является прямым эффектом подавления сигнального пути TGF-β.

Таблица 23: установлена достоверная понижающая регуляция мРНК CTGF в клетках A549 и ReNcell CX ^® . Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218с. ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549	ReNcell CX^®
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч, n=4	CTGF 96 ч, n=3
A	1,00±0,08	1,00±0,10
B 2,5 мкM	0,97±0,07	0,88±0,08
B 10 мкM	0,85±0,06	0,89±0,07
D 2,5 мкM	0,49**±0,05	1,10±0,08
D 10 мкM	0,31**±0,03	0,82±0,02

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218c был эффективен в ингибировании сигнального пути TGF-β после понижающей регуляции мРНК-мишени TGF-R_II. Это исследовали по определению понижающей регуляции мРНК CTGF и пониженному уровню белка pSmad2 в качестве маркера сигнального пути TGF-β.

В совокупности, ASO по изобретению эффективны в опосредовании функционального ингибирования сигнального пути TGF-β посредством понижающей регуляции TGF-R_II. Таким образом, ASO будут полезны для медицинских показаний, в которых участвуют повышенные уровни TGF-β, например, неврологических расстройств, фиброза и прогрессирования опухолей.

Пример 4: ингибирующая активность ASO по изобретению на уровни мРНК-мишени в обработанных TGF-β1 клетках

4.1. Поглощение гимнозисом ASO клетками A549 и ReNcell CX ^® после предварительной обработки TGF-β1

Для анализа ингибирующей активности антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) в клетках-предшественниках нейронов человека из кортикальной области мозга (ReNcell CX^®) при патологических состояниях клетки предварительно обрабатывали трансформирующим фактором роста-1 (TGF-β1). По результатам предыдущих исследований известно, что TGF-β1 обнаруживается в высоких концентрациях в цереброспинальной жидкости (CSF) при всех неврологических расстройствах, например, ALS. Таким образом, ингибирующее воздействие ASO на TGF-β-зависимый сигнальный путь было исследовано после предварительной обработки и в присутствии TGF-β1. В качестве стандартной клеточной линии использовали клетки A549.

Описание метода:

A549 и ReNcell CX^® культивировали, как описано выше. Для проведения исследований клетки высевали в 24-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для обработки клеток A549 и ReNcell CX^® среду удаляли и заменяли свежей полной средой (0,5 мл для 24-луночного планшете). После экспозиции TGF-β1 (10 нг/ мл, PromoCell #C-63499) в течение 48 ч среду заменяли, повторную обработку TGF-β1 проводили в комбинации со стандартным олигонуклеотидом 1 (скремблированный контроль, 10 мкМ), ASO SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) или ASO SEQ ID NO: 218c (10 мкМ) в среде. Клетки A549 инкубировали еще 72 ч, тогда как клетки ReNcell CX^® собирали через 96 ч. Соответственно клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты), как описано выше. Использованные пары праймеров для ОТ-ПЦР в режиме реального времени приведены в таблице 11.

4.1.1 Результаты для SEQ ID NO: 218b

На эффективность понижающей регуляции мРНК TGF-R_II под действием ASO SEQ ID NO: 218b предварительная инкубация с TGF-β1 не оказывала вияния в клетках A549 и ReNcell CX^® (таблица 24, фиг. 7). Уровень мРНК-мишени в клетках A549 был достоверно снижен после обработки одним ASO (оставшаяся мРНК: 15±0,05%), а также после обработки в присутствии TGF-β1 вслед за предварительной обработкой (оставшаяся мРНК: 7±0,01%). В клетках ReNcell CX^® ASO SEQ ID NO: 218b показал сходную эффективность ингибирования мРНК TGF-R_II в отсутствии TGF-β1 (25±0,01%) или в присутствии TGF-β1 после предварительной обработки TGF-β1 (17±0,02%).

Таблица 24: в присутствии TGF-β1 ASO SEQ ID NO: 218b приводит к сильной понижающей регуляции мРНК TGF-β1 после трансфекции гимнозисом в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, С=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Мишень Временная точка	TGF-R_II 48 ч TGF-β1 → 72 ч/96 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=4	ReNcell CX^® n=3
A	1,00±0,07	1,00±0,11
B 10 мкM	0,90±0,17	0,89±0,26
C 10 мкM	0,15**±0,05	0,25±0,01
E 10 нг/мл	0,71±0,05	0,79±0,34
E 10 нг/мл+B 10 мкM	0,74±0,05	0,89±0,25
E 10 нг/мл+C 10 мкM	0,07**±0,01	0,27±0,02

Заключение:

мРНК-мишень эффективно подверглась понижающей регуляции примерно до уровня 20% в результате трансфекции гимнозисом ASO по изобретению в присутствии TGF-β1 после предварительной инкубации в обеих тестированных клеточных линиях.

4.1.2 Результаты для SEQ ID NO: 218c

Понижающая регуляция мРНК TGF-R_II под действием ASO SEQ ID NO: 218c была эффективной в присутствии TGF-β1 в клетках A549 и ReNcell CX^® (таблица 25, фиг. 8). Уровень мРНК-мишени в обеих тестированных клеточных линиях был достоверно снижен независимо от обработки одним ASO SEQ ID NO: 218c или в присутствии TGF-β1.

Таблица 25: в присутствии TGF-β1 ASO SEQ ID NO: 218b приводит к сильной понижающей регуляции мРНК TGF-β1 после трансфекции гимнозисом в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218с, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Мишень Временная точка	TGF-R_II 48 ч TGF-β1 → 72 ч/96 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=2	ReNcell CX n=2
A	1,00±0,12	1,00±0,18
B 10 мкM	0,92±0,06	0,51±0,14
D 10 мкM	0,31**±0,04	0,05**±0,01
E 10 нг/мл	0,68±0,05	0,88±0,73
E 10 нг/мл+B 10 мкM	0,86±0,04	0,45±0,09
E 10 нг/мл+D 10 мкM	0,16**±0,05	0,03**±0,01

Заключение:

В совокупности, ASO по изобретению были эффективны в понижающей регуляции мРНК TGF-R_II в присутствии TGF-β1, указывая на то, что ASO функционируют в условиях патологических состояний.

Пример 5: ингибирующая активность ASO по изобретению на уровни белка-мишени в обработанных TGF-β1 клетках

Для анализа ингибирующей активности антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) в клетках-предшественниках нейронов человека из кортикальной области мозга (ReNcell CX^®) при патологических состояниях клетки предварительно обрабатывали трансформирующим фактором роста-1 (TGF-β1). По результатам предыдущих исследований известно, что TGF-β1 обнаруживается в высоких концентрациях в цереброспинальной жидкости (CSF) при всех неврологических расстройствах, например, ALS. Таким образом, ингибирующая эффективность ASO на TGF-β-сигнальный путь была исследована после предварительной обработки и в присутствии TGF-β1. В качестве стандартной клеточной линии использовали клетки A549.

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для обработки клетки высевали в 6-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.3920.300) (80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% CO₂. Для исследования эффектов трансфекции гимнозисом (клетки A549 и ReNcell CX^®) после предварительной инкубации с TGF-β1 (Promocell #C-63499) среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл для 6-луночных планшетов и 8-луночных планшетов). После экспозиции TGF-β1 (10 нг/мл, 48 ч) среду заменяли, к клеткам добавляли TGF-β1 (10 нг/мл), стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 10 мкM) и ASO по изобретению (10 мкM) в комбинации и при самостоятельной обработке. Клетки A549 инкубировали еще 72 ч, тогда как клетки ReNcell CX^® собирали через 96 ч. Соответственно, клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения белка (6-луночные планшеты) с последующим анализом вестерн-блоттингом или иммуноцитохимическим исследованием клеток (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток). Процедуры для использованных методик проводили, как описано ранее. Использованные антитела и разведения для соответствующих методов приведены в таблицах 13 и 14.

Результаты после трансфекции гимнозисом

Вестерн-блоттинг и иммуноцитохимический анализ клеток A549 показали, что ASO, имеющие последовательности SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218с, SEQ ID NO: 210q, SEQ ID NO: 213k, SEQ ID NO: 143h, SEQ ID NO: 152h, SEQ ID NO: 209az, SEQ ID NO: 209y генерируют сильную понижающую регуляцию мишени в присутствии TGF-β1 (таблица 26). Окрашивание на TGF-R_II на фиксированных клетках ReNcell CX^® подтвердило результаты, наблюдаемые в клетках A549. Тестированные ASO проявили сильную понижающую регуляцию мишени после самостоятельной обработки, а также в присутствии TGF-β1.

Таблица 26: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга TGF-R_II. Наблюдали снижение уровня белка TGF-R_II после предварительной инкубации с TGF-R_II с последующей трансфекцией гимнозисом различных ASO в клетках A549. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, D=SEQ ID NO: 218с, F=SEQ ID NO: 210q, G=SEQ ID NO: 213k, H=SEQ ID NO: 143h, I=SEQ ID NO: 152h, J=SEQ ID NO: 209az, К=SEQ ID NO: 209y, E=TGF-β1.


Мишень Временная точка	TGF-R_II 48 ч TGF-β1 → 72 ч TGF-β1 + ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=1
A	1,00
B 10 мкМ	1,20
C 10 мкM	0,31
D 10 мкM	0,42
F 10 мкM	0,45
G 10 мкM	0,35
H 10 мкM	0,47
I 10 мкM	0,33
J 10 мкM	0,27
K 10 мкM	0,30
E 10 нг/мл	2,03
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,50
E 10 нг/мл+C 10 мкM	0,78
E 10 нг/мл+D 10 мкM	1,16
E 10 нг/мл+F 10 мкM	1,21
E 10 нг/мл+G 10 мкM	0,83
E 10 нг/мл+H 10 мкM	1,02
E 10 нг/мл+I 10 мкM	0,76
E 10 нг/мл+J 10 мкM	0,69
E 10 нг/мл+K 10 мкM	0,77

Заключение:

Предварительная инкубация с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218с, SEQ ID NO: 210q, SEQ ID NO: 213k, SEQ ID NO: 143h, SEQ ID NO: 152h, SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y приводила помимо понижающей регуляции мРНК-мишени, к снижению уровня белка-мишени в клетках A549 и ReNcell CX^®.

Результаты после трансфекции гимнозисом других дополнительных ASO:

Анализ вестерн-блоттингом показал пониженное количество белка TGF-R_II в клетках A549 (таблица 27) после трансфекции гимнозисом в течение 72 ч по сравнению с необработанными клетками и клетками, обработанными скремблированным контролем. Предварительная инкубация с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом тестированных ASO вызывала снижение по сравнению с клетками, которые были предварительно обработаны TGF-β1, с последующей трансфекцией гимнозисом скремблированного контроля. Иммуноцитохимическое исследование клеток A549 и ReNcell CX^® после окрашивания на TGF-R_II показало, что тестированные ASO опосредовали выраженное снижение уровня белка-мишени после трансфекции гимнозисом с предварительной обработкой TGF-β1 или без нее.

Таблица 27: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга TGF-R_II. Наблюдали снижение белка TGF-R_II после предварительной инкубации с TGF-R_II с последующей трансфекцией гимнозисом TGF-R_II-специфических ASO в клетках A549. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. Снижение уровня белка для ASO 1-25 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 143h. Снижение уровня белка для ASO 26-48 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 152h. Снижение уровня белка для ASO 49-74 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y; B=более чем на 10%, но менее чем 20% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 209az и SEQ ID NO: 209y. Снижение уровня белка для ASO 75-100 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению с SEQ ID NO: 210q. Снижение уровня белка для ASO 101-124 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже среднего значения, полученного с SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с. Снижение уровня белка для ASO 125-152 указано с помощью следующего ключа: A=менее чем на 10% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k; B=более чем на 10%, но менее чем на 20% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k; C=более чем на 20%, но менее чем на 30% ниже по сравнению SEQ ID NO: 213k.


Номер ASO в опыте	SEQ ID NO:	Результат
1	233d	B
2	234d	A
3	143j	C
4	143p	A
5	143q	A
6	143r	A
7	143w	A
8	143af	B
9	143ag	C
10	143ah	C
11	235b	B
12	235d	A
13	141d	A
14	141g	A
15	141i	B
16	237b	A
17	237c	A
18	237i	C
19	237m	A
20	238c	A
21	238f	A
22	239e	B
23	240c	B
24	241b	C
25	242a	C
26	246e	C
27	247d	A
28	248b	A
29	248e	B
30	248g	A
31	152k	B
32	152s	B
33	152t	B
34	152u	B
35	152ab	C
36	152ag	B
37	152ah	A
38	152ai	A
39	249c	A
40	249e	A
41	250b	A
42	250g	B
43	251c	A
44	251f	A
45	252e	B
46	253c	A
47	254b	C
48	255a	C
49	259e	C
50	260d	B
51	261b	A
52	261e	B
53	261g	A
54	262d	B
55	262e	A
56	209s	A
57	209v	B
58	209w	A
59	209x	C
60	209ai	B
61	209an	C
62	209at	B
63	209au	B
64	209av	B
65	263b	B
66	263c	A
67	263i	B
68	263m	A
69	264e	A
70	264h	A
71	265e	B
72	266c	A
73	267b	B
74	268a	B
75	272e	B
76	273d	B
77	274a	A
78	274d	B
79	274f	A
80	275g	A
81	275i	B
82	210o	A
83	210v	B
84	210w	B
85	210x	C
86	210ab	B
87	210ac	A
88	210ad	B
89	210af	A
90	210am	B
91	276b	B
92	276c	A
93	276j	B
94	276k	B
95	277d	A
96	277e	A
97	278f	B
98	279c	B
99	280b	C
100	281a	C
101	220d	C
102	221d	B
103	222b	A
104	222c	A
105	222f	B
106	223c	B
107	223f	A
108	218ad	B
109	218n	A
110	218t	B
111	218u	B
112	218v	C
113	218ah	C
114	218an	A
115	218ao	B
116	218ap	B
117	224i	B
118	224m	B
119	225c	A
120	225f	A
121	226e	B
122	227c	B
123	228b	C
124	229a	C
125	285d	C
126	286d	A
127	287d	B
128	287e	A
129	287f	A
130	288e	A
131	288i	A
132	289d	B
134	289h	A
135	289o	B
136	289p	A
137	289q	B
138	213o	B
139	213p	B
140	213q	B
141	213s	B
142	213y	B
143	213z	B
144	213aa	B
145	213af	C
146	290c	A
147	290f	B
148	290i	A
149	291c	B
150	292c	C
151	293b	C
152	294a	C
125	285d	C

Заключение:

Даже после предварительной инкубации с TGF-β1 трансфекция гимнозисом ASO по изобретению приводит к снижению уровня белка TGF-R_II в клетках A549 и ReNcell CX^®.

Пример 6: анализ влияния ASO по изобретению на сигнальный путь ниже к TGF-R_II после предварительной инкубации с TGF-β1

Функциональные анализы проводили в клетках рака легких человека (A549) и клетках-предшественниках нейронов человека (ReNcell CX^®). Анализировали сигнальный путь TGF-β ниже по отношеню к нему, основываясь на эффективной понижающей регуляции мРНК TGF-R_II и снижении уровней белка после трансфекцит гимнозисом ASO по изобретению в присутствии TGF-β1. Следовательно, оценивали уровни мРНК и белка фактора роста соединительной ткани (CTGF), известного как медиатор ниже TGF-β. Кроме того, исследовали фосфорилирование Smad2 (матери против гомолога декапентаплегии 2). Фосфорилирование Smad2 является маркером активного пути TGF-β, с последующей повышающей регуляцией даунстрим гена-мишени CTGF.

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано ранее. Для обработки клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку), 6-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.3920.300) (80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% CO₂. Для исследования эффектов трансфекции гимнозисом (клетки A549 и ReNcell CX^®) после предварительной инкубации с TGF-R_II культуральную среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл на 6-луночных и 8-луночных планшетов). После экспозиции TGF-R_II (10 нг/мл, 48 ч) среду заменяли, к клеткам добавляли TGF-β1 (10 нг/мл), стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 10 мкМ), ASO с последовательностью SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) и ASO с последовательностью SEQ ID NO: 218c (10 мкМ) в комбинации и в виде самостоятельной обработки. Клетки А549 инкубировали еще в течение 72 ч, в то время как клетки ReNcell CX^® собирали через 96 ч. Соответственно, клетки дважды промывали PBS и затем использовали для определения РНК (24-луночные планшеты) и выделения белка (6-луночные планшеты) или иммуноцитохимического исследования клеток (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток). Оценку влияния на уровень мРНК CTGF проводили ОТ-ПЦР в режиме реального времени, как описано ранее. Пара праймеров для анализа CTGF была готова к применению и стандартизирована. Для анализа уровней белка CTGF и pSmad2 использовали вестерн-блоттинг и иммуноцитохимию, как описано ранее. Тип и использованные разведения антител для соответствующего метода приведены в таблицах 13 и 14.

6.1. Результаты для SEQ ID NO: 218b

6.1.1. Влияние на уровни мРНК и белка CTGF

мРНК CTGF подверглась понижающей регуляции после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 (72 ч, 0,52±0,05) и ReNcell CX^® (96 ч, 0,70±0,25), в то время как инкубация с TGF-β1 в течение 5 суток (А549: 48 ч+72 ч, 6,92±2,32) или 6 суток (ReNcell CX^®: 48 ч+96 ч, 1,60±015) соответственно, вызывала достоверную повышающую регуляцию мРНК CTGF. ASO SEQ ID NO:218b был достаточно эффективным, чтобы вызвать понижающую регуляцию мРНК CTGF, блокируя эффекты TGF-β1 в присутствии TGF-β1 (таблица 28, фиг. 11). Согласно данным по уровням мРНК иммунохимическое окрашивание на CTGF также подтверждало эти наблюдения для уровней белка (фиг. 12).

Таблица 28: понижающая регуляция мРНК CTGF в присутствии TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, ++p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	CTGF 48 ч TGF-β1 → 72 ч/96 ч TGF-β1 + ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=5	ReNcell CX n=3
A	1,00±0,22	1,00±0,04
B 10 мкM	0,89±0,19	0,85±0,01
C 10 мкM	0,52±0,05	0,70*±0,25
E 10 нг/мл	6,92*±2,32	1,60**±0,15
E 10 нг/мл+B 10 мкM	8,79**±2,72	1,71**±0,03
E 10 нг/мл+C 10 мкM	2,53⁺⁺±0,59	1,19⁺⁺±0,04

Заключение:

В присутствии TGF-β1 последующая обработка ASO SEQ ID NO: 218b приводила, во-первых, к понижающей регуляция мРНК TGF-R_II и, во вторых, к снижению уровней мРНК и белка CTGF в клетках A549 и ReNcell CX^®. Данный факт означает, что ASO SEQ ID NO: 218b является достаточно сильным, чтобы быть активным в условиях патологических состояний с высоким уровнем TGF-β1 и способен спасти клетки от последствий эффектов, опосредуемых TGF-β1.

6.1.2. Влияние на уровень белка pSmad2

Для проверки того, является ли понижающая регуляция CTGF следствием специфического ингибирования TGF-β-сигнального пути, опосредованного ASO SEQ ID NO: 218b в присутствии TGF-β1, определяли уровни белка pSmad2.

Окрашивание на pSmad2 после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b с параллельным воздействием TGF-β1 приводит к ингибированию фосфорилирования Smad2 в обеих тестированных клеточных линиях (фиг. 13). Кроме того, снижение уровня белка pSmad2 подтверждали анализом вестерн-блоттингом в клетках A549 и ReNcell CX^® (таблица 29).

Таблица 29: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга pSmad2. Наблюдали понижающую регуляцию белка pSmad2 после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b. Также была установлена отмена TGF-β1-опосредованных эффектов с помощью ASO по изобретению при сравнении комбинированных обработок. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Мишень Временная точка	CTGF 48 ч TGF-β1 → 72 ч/96 ч TGF-β1 + ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=5	ReNcell CX n=3
A	1,00±0,00	1,00±0,00
B 10 мкM	1,23±0,47	0,89±0,22
C 10 мкM	0,58±0,08	0,66±0,14
E 10 нг/мл	1,40±0,31	1,19±0,61
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,27±0,46	2,19±0,76
E 10 нг/мл+C 10 мкM	0,81±0,31	1,55±0,42

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218b приводит к функциональному ингибированию сигнального пути TGF-β в клетках A549 и ReNcell CX^® в присутствии TGF-β1, что подтверждалось снижением фосфорилирования Smad2.

6.2 Результаты для SEQ ID NO: 218c

6.2.1. Влияние на мРНК и уровень белка CTGF

Полученные данные показывают понижающую регуляцию мРНК CTGF после комбинированной обработки ASO SEQ ID NO: 218c и TGF-β1 (A549: 0,86, ReNcell CX^®: 0,23) по сравнению с комбинированной обработкой с использованием скремблированного контроля и TGF-β1 (A549: 5,89, ReNcell CX^®: 1,25) (таблица 30 и фиг. 14). В дополнение к этим наблюдениям иммунохимическое окрашивание на CTGF подтверждало наличие отмены TGF-β1-опосредованных эффектов на уровень белка под действием ASO SEQ ID NO: 218с (фиг. 15).

Таблица 30: уровни мРНК CTGF после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO:218c и параллельной обработкой TGF-β1 в клетках A549 и ReNcell CX^®. Данные подтвердили эффективное предупреждение эффектов TGF-β1 на уровни мРНК CTGF под воздействием ASO SEQ ID NO: 218с. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218c, E=TGF-β1, ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A, ++p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	CTGF 48 ч TGF-β1 → 72 ч/96 ч TGF-β1 + ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n=3	ReNcell CX^® n=2
A	1,00±0,05	1,00±0,03
B 10 мкM	0,86±0,11	0,85±0,01
D 10 мкM	0,53±0,10	0,17*±0,02
E 10 нг/мл	4,71±1,76	1,39±0,08
E 10 нг/мл+B 10 мкM	5,89*±2,16	1,25±0,44
E 10 нг/мл+D 10 мкM	0,86⁺⁺±0,06	0,23*⁺⁺±0,02

Заключение:

Данные подтвердили эффективное предупреждение индуцированных TGF-β1 эффектов на уровни мРНК и белка CTGF под воздействием ASO SEQ ID NO: 218с.

6.2.2. Влияние на уровень белка pSmad2

Для проверки того, является ли понижающая регуляция CTGF (6.2.1) следствием ингибирования сигнального пути TGF-β1, опосредованного ASO SEQ ID NO: 218c, даже при наличии предварительной инкубации с TGF-β1, анализировали уровни белка pSmad2.

Фосфорилирование Smad2 индуцировали инкубацией с TGF-β1 (1,52±0,19), в то время как трансфекция гимнозисом ASO обеспечивала снижение pSmad2 в клетках A549 (0,89±0,05). Предварительная инкубация с TGF-β1 с последующей комбинированной обработкой приводит к подавлению эффектов TGF-β1 на фосфорилирование Smad2 (анализ вестерн-блоттингом, таблица 31). Результаты иммуноцитохимии подтверждали данные, полученные анализом вестерн-блоттингом (фиг. 16).

Таблица 31: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга pSmad2. Определяли понижающую регуляцию белка pSmad2 после трансфекции гимнозисом с ASO SEQ ID NO: 218c. Показано ингибирование опосредованных TGF-β1 эффектов с помощью ASO по изобретению, когда сравнивались комбинированные обработки. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GAPDH с использованием программного обеспечения Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218c, E=TGF-β1. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	pSmad2 48 h TGF-β1 → 72 h TGF-β1 + ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	A549 n= 2
A	1,00±0,00
B 10 мкM	1,23±0,27
D 10 мкM	0,89±0,05
E 10 нг/мл	1,52±0,19
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,27±0,29
E 10 нг/мл+D 10 мкM	0,93±0,35

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218c эффективно ингибирует сигнальный путь TGF-β после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом ASO. Это было показано определением уровней даунстрим белка pSmad2.

В совокупности, ASO по изобретению высокоактивны в опосредовании функционального ингибирования сигнального пути TGF-β в присутствии патологических, высоких уровней TGF-β1 посредством эффективной понижающей регуляций мРНК TGF-R_II. Таким образом, ASO по изобретению будут полезны при медицинских показаниях, при которых имеют место повышенные уровни TGF-β, например, неврологических расстройствах, фиброзе, прогрессировании опухолей и других.

Пример 7: определение профилактической активности антисмысловых олигонуклеотидов на уровне мРНК (последующая обработка TGF-β1)

Для анализа профилактической активности антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) в клетках-предшественниках нейронов человека из кортикальной области головного мозга (ReNcell CX^®), ASO трансфицировали в клетки посредством поглощения гимнозисом с последующей обработкой трансформирующим фактором роста-1 (TGF-β1).

Описание метода:

Клетки A549 и ReNcell CX^® культивировали, как описано выше. Для оценки профилактической обработки клетки высевали в 24-луночный культуральный планшет (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 10 мкМ) или ASO с SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) на 72 ч (А549) или 96 ч (ReNcell CX^®). Вслед за инкубацией после трансфекции гимнозисом к клеткам добавляли TGF-β1 (10 нг/мл, Promocell #C-63499) без замещения среды на 48 ч. Для сбора клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) с последующим анализом мРНК ОТ-ПЦР в режиме реального времени. Использовали готовые к применению и стандартизированные пары праймеров для ОТ-ПЦР в режиме реального времени и смешивали с соответствующим готовым к применению раствором Mastermix (SsoAdvanced™ Universial SYBR^® Green Supermix (BioRad #172-5271), следуя инструкциям производителя (BioRad Prime PCR Quick Guide). Методы проводили, как описано выше.

7.1 Результаты для SEQ ID NO: 218b

На эффективность понижающей регуляции мРНК TGF-R_II под действием ASO SEQ ID NO: 218b последующая инкубация с TGF-β1 не оказывала влияния в клетках A549 и ReNcell CX^® (таблица 32). Достоверное снижение уровня мРНК-мишени в клетках ReNcell CX^®было показано после обработки одним ASO с SEQ ID NO: 218b (0,33*±0,11). Трансфекция гимнозисом ASO с последующей обработкой TGF-β1 эффективно снижала уровень мРНК-мишени TGF-R_II. В клетках A549 SEQ ID NO: 218b показал аналогичную эффективность в ингибировании мРНК TGF-R_II при самостоятельной (0,25±0,07) или комбинированной обработке с последующей инкубацией TGF-β1 (0,24±0,06).

Таблица 32: понижающая регуляция мРНК TGF-R_II после трансфекции гимнозисом с последующей обработкой TGF-β1 ASO в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, С=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, **p<0,05 по отношению к A, ++p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	TGF-R_II 72 ч/96 ч ASO → 48 ч TGF-β1
Клеточная линия	A549 n=3	ReNcell CX n=3
A	1,00±0,44	1,00±0,19
B 10 мкM	0,95±0,22	1,42±0,14
C 10 мкM	0,25±0,07	0,33*±0,11
E 10 нг/мл	1,96±0,16	1,42±0,08
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,14±0,39	1,25±0,14
E 10 нг/мл+C 10 мкM	0,24⁺⁺±0,06	0,56⁺⁺±0,10

Заключение:

Поглощение гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b с последующей инкубацией с TGF-β1 было эффективным в понижающей регуляции мРНК-мишени TGF-R_II, указывая, что ASO SEQ ID NO:218b можно использовать для профилактического лечения по медицинским показаниям.

Пример 8: определение ингибирующей активности ASO по изобретению на уровень белка с последующей обработкой TGF-β1

Для того, чтобы оценить профилактическую активность ASO по изобретению в клетках-предшественниках нейронов человека из кортикальной области мозга (ReNcell CX^®) ASO трансфицировали в клетки путем трансфекции гимнозисом с последующей обработкой TGF-β1.

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для обработки клетки высевали в 8-луночные слайд- планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 10 мкМ) или ASO с последовательностью SEQ ID NO: 218b (SEQ ID NO: 218b, 10 мкМ) на 72 ч (A549) или 96 ч (ReNcell CX^®). После трансфекции гимнозисом добавляли TGF-β1 (10 нг/мл, Promocell #C-63499) на 48 ч без замещения среды. Для сбора клетки дважды промывали PBS и затем использовали для иммуноцитохимического анализа. Процедуру проводили, как описано выше. Используемые антитела и разведения для соответствующих методов приведены в таблицах 13 и 14.

8.1. Результаты по снижению белка TGF-R_II после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b с последующей обработкой TGF-β1

Иммуноцитохимический анализ на TGF-R_II для клеток A549 и ReNcell CX^® показал, что ASO SEQ ID NO:218b генерирует сильную понижающую регуляцию мРНК-мишени TGF-R_II после последующей обработки TGF-β1 (фиг. 17).

Заключение:

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b с последующей обработкой TGF-β1 приводила к понижающей регуляции мРНК-мишени, а также к выраженному снижению уровня белка TGF-R_II в клетках A549 и ReNcell CX^®.

В совокупности, эффективность понижающей регуляции белка TGF-R_II, опосредуемой ASO SEQ ID NO: 218b, в комбинации с последующей обработкой TGF-β1 по-прежнему проявлялась, что дает основание полагать, что ASO по изобретению эффективны для профилактических применений.

Пример 9: влияние обработки ASO на даунстрим сигнальный путь TGF-R_II с последующей обработкой TGF-β1

Эффективность ASO по изобретению в опосредовании ингибирования сигнального пути TGF-β оценивали для обработки TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом в клетках рака легких человека (A549) и клетках-предшественниках нейронов человека (ReNcell CX^®). Следовательно, анализировали даунстрим молекулы на сигнальном пути TGF-β, Smad3 (матери против гомолога декапентаплегии 2) и фактор роста соединительной ткани (CTGF).

Описание метода:

Клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для обработки клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 10 мкМ) или ASO SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) на 72 ч (А549) или 96 ч (ReNcell CX^®). После трансфекции гимнозисом добавляли TGF-β1 (10 нг/мл, Promocell #C-63499) без замещения среды на последующие 48 ч. Для сбора клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) или иммуноцитохимического исследования клеток (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток). Для оценки влияния на уровень мРНК CTGF проводили ОТ-ПЦР в режиме реального времени, как описано ранее. Пара праймеров для анализа CTGF была готова к использованию и стандартизирована. Для определения уровней белка pSmad3 использовали иммуноцитохимию, как описано ранее. Тип и использованные разведения антител для соответствующего метода приводятся в таблицах 13 и 14.

9.1. Результаты для SEQ ID NO: 218b

9.1.1. Влияние на уровень мРНК CTGF и белка pSmad3

Уровень мРНК CTGF снижался после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 (5 суток: 0,67±0,02) и ReNcell CX^® (6 суток: 0,70±0,02). При добавлении TGF-β1 через 72 ч или 96 ч соответственно, клетки реагировали с повышением мРНК CTGF, но по сравнению с трансфекцией гимнозисом скремблированного контроля после обработки TGF-β1 индукция мРНК CTGF была сильно снижена (таблица 33). Для подтверждения того, является ли понижающая регуляция мРНК CTGF следствием ингибирования сигнального пути TGF-β, опосредованной ASO SEQ ID NO: 218b, также после обработки TGF-β1 определяли уровни белка pSmad3. На фиг. 18 показано, что сигнальный путь TGF-β фактически был блокирован трансфекцией гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 (фиг. 18A) и ReNcell CX^® (фиг. 18B). Данный эффект имел место также после трансфекции гимнозисом тестированного ASO с последующей обработкой TGF-β1.

Таблица 33: понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b с последующей обработкой TGF-β1 в клетках A549 и ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A, +p<0,05, ++p <0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	CTGF 72 ч/96 ч ASO → +/- 48 ч TGF-β1
Клеточная линия	A549 n=3	ReNcell CX^® n=3
A	1,00±0,13	1,00±0,09
B 10 мкM	0,80±0,03	1,07±0,07
C 10 мкM	0,67±0,02	0,70±0,02
E 10 нг/мл	4,54**±0,68	1,56*±0,08
E 10 нг/мл+B 10 мкM	4,07**±0,38	1,62*±0,09
E 10 нг/мл+C 10 мкM	1,90⁺±0,03	0,97⁺⁺±0,10

Заключение:

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b приводила к понижающей регуляции мРНК и белка TGF-R_II, а также к снижению уровней мРНК CTGF и белка pSmad3 в клетках A549 и ReNcell CX^® независимо от обработки TGF-β1.

Это означает, что ASO SEQ ID NO: 218b является достаточно эффективным, чтобы проявлять активность в профилактических условиях для отмены или снижения имеющихся TGF-β1-опосредованных эффектов.

Пример 10: анализ потенциальных провоспалительных и токсических эффектов антисмысловых олигонуклеотидов

10.1. Тест с моноядерными клетками периферической крови (РВМС)

Для оценки антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) на иммуностимулирующие свойства мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) инкубировали с контрольными ASO и тестируемыми соединениями с последующей постановкой ELISA для анализа IFNα и TGFα.

Описание метода:

Тест с мононуклеарными клетками периферической крови (PBMC)

Результаты:

Отсутствовал иммуностимулирующий эффект обработки ASO на РВМС, о чем свидетельствовало отсутствие детектируемой секреции IFNα (таблица 34) и TNFα (таблица 35) при инкубации с ASO. Функциональность анализа подтверждали наличием иммуностимулирующего эффекта иммуностимулирующей, конъюгированной с холестерином siРНК (XD-01024, IFNα) и полиинозиновой:полицитидиловой кислоты (поли I:C; TNFα; InvivoGen #tlrl-pic), которая является синтетическим аналогом двухцепочечной РНК, и связывается с TLR3 и стимулирует иммунную систему.

Таблица 34: ответная реакция IFNα на воздействие ASO по изобретению показывает ответную выработку IFNα РВМС при инкубации с ASO. Количественную оценку уровней экспрессии проводили с положительным контролем (ODN2216 [олигонуклеотид CpG класса A, распознаваемый TLR9 и приводящий к сильным иммуностимулирующим эффектам; InvivoGen tlrl-2216], поли I:C, XD-01024) с использованием анализа ELISA.


Тестированный кандидат	Среднее значение по повторностям [пг/мл]
Донор 1	Донор 2
контроль	-0,084	0,720
SEQ. ID NO: 209y	-0,061	-0,039
SEQ. ID NO: 209t	-0,308	-0,520
SEQ. ID NO: 209v	-0,191	-1,252
SEQ. ID NO: 218b	-0,001	-0,093
SEQ. ID NO: 218m	-0,140	-0,163
SEQ. ID NO: 218q	-0,755	0,005
SEQ. ID NO: 218c	-0,852	-0,805
SEQ. ID NO: 218t	-0,469	0,450
ODN2216	0,300	1,311
поли I:C	-1,378	2,053
XD-01024	13,961	26,821
Все значения за исключением положительного контроля (XD-01024) ниже предела количественного определения

Таблица 35: ответная реакция TNFα на воздействие ASO по изобретению. Проводили количественную оценку уровней экспрессии по отношению к контрольным кандидатам (ODN2216, поли I:C, XD-01024) с использованием анализа ELISA.


Тестированный кандидат	Среднее значение по повторностям [пг/мл]
Донор 1	Донор 2
контроль	0,647	-0,137
SEQ. ID NO: 209y	2,397	-0,117
SEQ. ID NO: 209t	0,734	0,193
SEQ. ID NO: 209v	0,360	0,063
SEQ. ID NO: 218b	0,670	0,183
SEQ. ID NO: 218m	0,594	0,519
SEQ. ID NO: 218q	0,049	0,194
SEQ. ID NO: 218c	-0,212	0,029
SEQ. ID NO: 218t	0,593	0,758
ODN2216	0,085	0,894
поли I:C	115,026	102,042
XD-01024	1,188	1,418
Все значения за исключением положительного контроля (поли I:C) ниже предела количественного анализа

10.2 Токсикология антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению в условиях in vivo

Для анализа токсических свойств антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) мышам C57/Bl6N проводили три внутривенных инъекции ASO, и после эвтаназии определяли активность трансаминаз в сыворотке крови, печени и почках.

Описание метода:

Самок мышей C57/Bl6N в возрасте 6 недель обрабатывали тестируемыми соединениями (SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218c) в течение семи суток. ASO (200 мкл, 15 мг/кг/массы тела) вводили внутривенно на сутки 1, 2 и 3 периода обработки. Наблюдали за динамикой привесов (SEQ ID NO: 218c) через день, и на сутки 4 отбирали пробы крови из vena fascicularis и готовили сыворотку. На сутки 8 животных подвергали эвтаназии (CO₂) и отбирали пробы крови из полой вены и готовили сыворотку, отбирали пробы печени (кусочки ≤ 50 мг), почек и легких для количественного определения мРНК и трансаминаз. Уровни мРНК TGF-R_II определяли в лизате печени, почек и легких методом bDNA (набор QuantiGene^®, Panomics/Affimetrix). Активность аспартаттрансаминазы (ASP) и аланинтрансаминазы (ALT) определяли на Cobas Integra^® 400 в разведенной сыворотке в соотношении 1:10.

Таблица 36: уровни экспрессии сывороточной аланинтрансаминазы и аспартаттрансаминазы у мышей C57/Bl6N после повторных внутривенных инъекций ASO. Количественную оценку уровней экспрессии проводили сравнением с уровнями экспрессии у животных, обработанных физиологическим раствором. ±=SEM.


Тестированное соединение	Сывороточные трансаминазы [Е/л]
Тестированное соединение	3 суток после инъекции	7 суток после инъекции
AЛТ	AСТ	AЛT	AСT
SEQ. ID NO: 209ax	13,87±1,44	47,33±15,88	64,91±21,01	108,99±13,56
SEQ. ID NO: 143h	13,68±3,33	53,50±6,99	12,47±1,64	33,35±8,17
SEQ. ID NO: 152h	16,66±6,29	67,23±29,91	17,49±2,81	45,75±17,14
SEQ. ID NO: 209ay	18,29±6,37	69,96±35,44	287,29±65,39	273,45±101,33
SEQ. ID NO: 210q	11,70±3,80	36,44±5,36	11,11±6,31	40,81±13,32
SEQ. ID NO: 218b	19,60±8,62	67,61±42,75	18,38±4,60	48,91±17,86
SEQ. ID NO: 213k	13,59±3,28	54,47±36,15	96,00±46,74	89,12±21,82
Физиологический раствор	9,52±9,21	67,18±28,60	9,99±2,29	28,29±2,23

Таблица 37: уровни экспрессии TGF-R_II в ткани печени, почек и легких у мышей C57/Bl6N после повторных внутривенных инъекций ASO. Количественную оценку уровней экспрессии проводили сравнением с уровнями экспрессии у животных, обработанных физиологическим раствором. ±= SEM.


Тестированное соединение	Экспрессия мРНК TGF-R_II/мРНК GAPDH
Печень	Почки	Легкие
SEQ. ID NO: 209ax	0,64±0,03	1,31±0,11	13,25±0,67
SEQ. ID NO: 143h	0,26±0,02	0,65±0,22	11,10±0,11
SEQ. ID NO: 152h	0,58±0,10	0,87±0,17	13,42±0,69
SEQ. ID NO: 209ay	0,62±0,06	1,30±0,10	13,93±0,57
SEQ. ID NO:210q	0,39±0,06	0,83±0,15	13,53±1,23
SEQ. ID NO: 218b	0,72±0,08	0,97±0,06	15,63±1,45
SEQ. ID NO: 213k	0,42±0,01	1,20±0,04	14,44±1,03
Физиологический раствор	0,66±0,04	1,10±0,08	15,14±0,65

Таблица 38: уровни экспрессии аланинтрансаминазы и аспартаттрансаминазы в сыворотке мышей C57/Bl6N после повторных внутривенных инъекций ASO. Количественную оценку уровней экспрессии проводили сравнением с уровнями экспрессии у животных, обработанных физиологическим раствором. ±= SEM.


Тестированное соединение	Сывороточные трансаминазы [Е/л]
Тестированное соединение	3 суток после инъекции	7 суток после инъекции
AЛT	AСT	AЛT	AСT
SEQ. ID NO: 218c	24,63±2,10	51,87±5,99	18,10±4,01	39,99±2,09
Физиологический раствор	28,68±3,23	79,95±30,24	14,52±4,89	36,08±3,32

Таблица 39: уровни экспрессии TGF-R_II в ткани печени, почек и легких у мышей C57/Bl6N после повторных внутривенных инъекций ASO. Количественную оценку уровней экспрессии проводили сравнением с уровнями экспрессии у животных, обработанных физиологическим раствором. ±= SEM.


Тестированное соединение	Экспрессия мРНК TGF-R_II/мРНК GAPDH
Печень	Почки
SEQ. ID NO: 218c	0,21±0,03	0,16±0,02
Физиологический раствор	0,35±0,05	0,24±0,03

Таблица 40: динамика прироста массы тела в течение 7-суточной схемы введения ASO. Прирост массы тела определяли количественно по сравнению с массой тела на сутки 0, которую принимали за 100%.


Тестированное соединение	Динамика прироста массы тела [%]
Сутки 0	Сутки 1	Сутки 2	Сутки 3	Сутки 4	Сутки 7
SEQ. ID NO: 218c	100%	99%	99%	99%	102%	104%
Физиологический раствор	100%	99%	100%	100%	101%	103%

Заключение: не наблюдали провоспалительных или токсических эффектов соответствующих ASO по изобретению на РВМС или мышах C57/Bl6N. Таким образом, обработка ASO, нацеленных на TGF-R_II, отражает безопасный метод лечения различных связанных с TGF-β расстройств.

Пример 11: оценка интрацеребровентрикулярной инфузии ASO по изобретению на индуцированное TGF-β ингибирование пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов in vivo

Целью настоящего исследования была оценка потенциальной способности ASO по изобретению против TGF-R_II i) профилактировать и ii) лечить индуцированные TGF-β1 эффекты на пролиферацию нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников in vivo.

Описание метода:

11.1. Профилактика связанного с TGF-β1 ингибирования нейрогенеза

Двухмесячным самкам крыс Fischer-344 (n=32) проводили интрацеребровентрикулярные инфузии через осмотические мининасосы (модель 2002, Alzet), соединенные с канюлями из нержавеющей стали. Хирургическую имплантацию мининасосов выполняли под глубокой анестезией с использованием внутримышечных инъекций. Животным инфузировали ASO по изобретению (концентрация 1,64 мМ в насосе), контрольный ASO (концентрация 1,64 мМ в насосе) или аCSF (искусственная спинномозговая жидкость) в течение 7 суток. На сутки 8 меняли насосы, и животным вводили i) аCSF, ii) TGF-β1 (500 нг/мл в насосе), iii) TGF-β1 (500 нг/мл в насосе) плюс контрольный ASO (концентрация 1,64 мМ в насосе) или iv) TGF-β1 (500 нг/мл в насосе) плюс ASO по изобретению (концентрация 1,64 мМ в насосе) в течение 14 суток. В конце инфузионного периода всем животным транскардиально перфузировали 4% параформальдегид. Головной мозг исследовали на локализацию пути канюли, и животные с неправильным размещением канюли исключались из анализа. В течение последних 24 ч периода инфузии животным проводили внутрибрюшинную инъекцию бромдезоксиуридина (BrdU) в дозе 200 мг/кг.

Ткань обрабатывали для хромогенного иммунодетектирования BrdU-позитивных клеток в сагитальных срезах тощиной 40 мкм. Подсчитывали количество позитивных на BrdU клеток в трех рамках подсчета размером 50 мкм ×50 мкм на срез, расположенных в самой нижней, средней и верхней частях субвентрикулярной зоны. Положительные профили, пересекавшие самую верхнюю фокальную плоскость (плоскость исключения) или боковые границы рамки для подсчета, не учитывались. Для исследования гиппокампа определяли объем гиппокампа и подсчитывали все положительные клетки внутри и рядом с его границами. Общее количество положительных профилей умножали на отношение эталонного объема к объему выборки для получения установленного количества BrdU-положительных клеток для каждой структуры. Все экстраполяции выполняли для одного полушария головного мозга и затем удваивали для представления суммарных значений для всего мозга. Данные представлены как средние значения±стандартные отклонения (SD). Статистический анализ проводили с использованием непарного двустороннего t-теста сравнения - тест Стьюдента с t-критерием для сравнения обработанной TGF-β1 и контрольной группы (программное обеспечение GraphPad Prism 4, США). Уровень значимости определяли при р<0,05.

11.2. Лечение ассоциированного с TGF-β1 ингибирования нейрогенеза

Животные получали аCSF или рекомбинантный человеческий TGF-β1 (500 нг/мл, в насосе) со скоростью введения 0,5 мкл в час в течение 14 суток. Через 14 суток насосы меняли и животным вводили i) аCSF, ii) рекомбинантный TGF-β1 человека (500 нг/мл в насосе) или совместно с инфузией iii) ASO по изобретению (концентрация 1,64 мМ в насосе) плюс рекомбинантный TGF-β1 человека (500 нг/мл в насосе) или iv) контрольный ASO (концентрация 1,64 мМ в насосе) плюс рекомбинантный TGF-β1 человека (500 нг/мл в насосе). В конце инфузионного периода всем животным транскардиально перфузировали 4% параформальдегид. Головной мозг исследовали на локализацию пути канюли, и животные с неправильным размещением канюли исключались из анализа. В течение последних 24 ч периода инфузии животные получали внутрибрюшинную инъекцию бромдезоксиуридина (BrdU) в дозе 200 мг/кг.

Гистологический анализ проводили, как описано выше (11.1).

Результаты:

Обработка ASO SEQ ID NO: 143aj, SEQ ID NO: 143h и SEQ ID NO: 210q специфически и частично ослабляла эффект TGF-β1 на пролиферацию клеток в гиппокампе и в стенке желудочка. Обработка ASO по изобретению специфически и частично отменяла ингибирующий эффект TGF-β1 на нейрогенез.

Заключение: ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие перекрестную реактивность с грызунами, индуцировали нейрогенез в данном эксперименте in vivo. ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие отсутствие перекрестной реактивности, оказывали в целом даже более сильные эффекты в экспериментах in vitro. В результате предполагается, что данные ASO по изобретению будут также более эффективными в испытаниях in vivo у людей и приматов, отличных от человека, и поэтому будут функционировать как высокоэффективное лекарственное средство для профилактики или лечения индуцированного TGF-β1 ингибирования пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов.

Пример 12: анализ влияния антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению на пролиферацию и специфические маркеры клеток-предшественников нейронов человека

Боковой амиотрофический склероз (ALS) является нейродегенеративным летальным заболеванием без наличия эффективного лечения к настоящему времени. Проводимые в настоящее время молекулярно-генетические исследования все в большей степени раскрывают молекулярный патогенез данного фатального заболевания; по результатам предыдущих исследований известно, что TGF-β обнаруживается в высоких концентрациях в цереброспинальной жидкости (CSF) пациентов с ALS. Известно, что эти высокие уровни циркулирующего TGF-β способствуют вхождению стволовых клеток в состояние покоя и, как следствие, вызывают торможение взрослого нейрогенеза в субвентрикулярной зоне (SVZ) головного мозга. Таким образом, регенерация дегенерирующих нейронов, по-видимому, предотвращается при усилении сигнального пути TGF-β. Для выяснения того, насколько селективное ингибирование сигнального пути TGF-β, опосредованное антисмысловыми олигонуклеотидами по изобретению, может реактивировать взрослый нейрогенез, необходимо вначале подтвердить факт опосредованной TGF-β остановки клеточного цикла.

Описание методов:

Исследования по остановке клеточного цикла. Клетки культивировали, как описано выше в стандартном протоколе. Для экспериментов клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для определения опосредованного TGF-β1 влияния на клеточный цикл в условиях пролиферации (+EGF/FGF) (Millipore: EGF #GF144, bFGF #GF003) или дифференцировки (-EGF/FGF) клетки обрабатывали в течение 4 суток TGF-β1 (PromoCell #C-63499, 10 или 50 нг/мл) после удаления и замены соответствующей среды. На сутки 4 среду обновляли и проводили повторную обработку TGF-β1 до суток 7. На сутки 7 клетки собирали промыванием дважды PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты), как описано выше. Для оценки влияния TGF-β1 на клеточный цикл с использованием ОТ-ПЦР в режиме реального времени анализировали мРНК маркера пролиферации Ki67, гена-супрессора опухолей р53, ингибитора циклинзависимой киназы 1 (p21) и маркера нейрогенеза даблкортина (DCX). Соответствующие пары праймеров приведены в таблице 11.

Анализ мРНК на эффекты ASO SEQ ID NO: 218b на клетках-предшественниках нейронов человека: клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для экспериментов клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для настоящих экспериментов клеточную среду заменяли и к клеткам добавляли на 96 ч стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль, 2,5 и 10 мкМ), ASO с SEQ ID NO: 218b (2,5 и 10 мкМ) или TGF-β1 (10 нг/мл, Promocell #C-63499). По истечении времени инкубации среду снова заменяли и проводили дальнейшую обработку еще 96 ч. Через 8 суток обработки клетки собирали. Клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты). Для оценки влияния на клетки-предшественники определяли уровни мРНК нестина (ранний нейрональный маркер), Sox2 (ранний нейрональный маркер), DCX (маркер нейрогенеза) и Ki67 (маркер пролиферации) с использованием ОТ-ПЦР в режиме реального времени, как описано ранее. Соответствующие пары праймеров приведены в таблице 11.

Пролиферативные и дифференцирующие эффекты TGFR_II-специфических ASO трансфекцией гимнозисом клеток ReNcell CX ^® . Следующей целью было исследование того, оказывает ли влияние TGF-R_II-специфический ASO на пролиферацию клеток ReNcell CX^®. Соответственно, клетки культивировали, как описано ранее, и высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку) или 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% СО₂. Для построения кривой пролиферации клетки обрабатывали после замены среды в течение 72 ч стандартным олигонуклеотидом 1 (скремблированный контроль, 2,5 и 10 мкМ) и ASO SEQ ID NO: 218b (2,5 и 10 мкМ). После времени инкубации среду заменяли и обработку повторяли два раза. После сбора супернатанта оставшиеся клетки собирали из 24-луночных планшетов для определения количества клеток. Для этой цели оставшиеся клетки промывали PBS (2×), обрабатывали аккутазой (500 мкл/лунку) и инкубировали в течение 5 мин при 37°C. Затем добавляли 500 мкл среды и определяли количество клеток с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® и устройства для светлопольного освещения (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. Вкратце, 18 мкл клеточной суспензии добавляли к 2 мкл красителя акридиновый оранжевый/пропидиум иодида из набора для оценки жизнеспособности клеток (Biozym #872045). Через 1 мин отстаивания 10 мкл наносили на стекло для подсчета клеток (Biozym #872011), подсчитывали количество клеток и выражали в виде общего числа клеток/мл и процента живых клеток по сравнению с мертвыми клетками. После трансфекции гимнозисом стандартного олигонуклеотида 1 (10 мкМ), SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) и соответствующей обработки TGF-β1 (10 нг/мл) в течение 8 суток, клетки на 8-луночных слайд-планшетах для культивирования клеток фиксировали и окрашивали антителом к Ki67. Для оценки способности клеток ReNcell CX^®к дифференцировке после трансфекции гимнозисом другие 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток обрабатывали стандартным олигонуклеотидом 1 (10 мкМ), SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) и TGF-β1 (10 нг/мл) соответственно в течение 96 ч в условиях пролиферации (+EGF/FGF). Затем одну часть клеток обрабатывали еще в течение 96 ч в условиях пролиферации, тогда как другую часть клеток обрабатывали и выдерживали в условиях дифференцировки (-EGF/FGF). После окрашивания клеток определяли уровни экспрессии нейрофиламента N (NeuN) и βIII-тубулина флуоресцентной микроскопией. Протокол сбора, фиксации и окрашивания клеток описан выше, и соответствующие разведения антител приведены в таблице 14.

Анализ мРНК маркеров пролиферации и нейрогенеза после трансфекции гимнозисом после предварительной инкубации с TGF-β1. Клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для экспериментов клетки высевали в 24-луночные планшеты для культивирования (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для индукции остановки клеточного цикла клетки ReNcell CX^® обрабатывали TGF-β1 в течение 4 суток. Затем среду заменяли и вновь добавляли TGF-β1 (10 нг/мл). На сутки 8 среду заменяли еще раз, и проводили трансфекцию гимнозисом в течение 96 ч добавлением стандартного олигонуклеотида 1 (10 мкМ), SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) в комбинации с TGF-β1 (10 нг/мл). После инкубации клетки собирали двукратным промыванием PBS. Затем выделяли РНК и проводили анализ мРНК ОТ-ПЦР в режиме реального времени, как описано выше.

12.1.1. Опосредование TGF-β1 остановки клеточного цикла в клетках-предшественниках нейронов человека

Определение маркеров состояния покоя стволовых клеток показало, что TGF-β1 опосредует остановку клеточного цикла через 7 суток после обработки им клеток. Экспрессия мРНК маркера пролифераци Ki67 снижалась в зависимости от концентрации TGF-β1. Также экспрессия мРНК гена-супрессора опухолей р53 подверглась понижающей регуляции, коррелируя с концентрацией TGF-β1. В противоположность, уровень ингибитора циклинзависимой киназы 1 (p21) достоверно повышался под действием TGF-β1. В совокупности, данные результаты указывают на то, что стволовые клетки находились в состоянии покоя, индуцированным TGF-β1. Интересно, что уровень DCX, маркера нейрогенеза, был сильно снижен под действием TGF-β1 (таблица 41).

Таблица 41: экспрессия мРНК Ki67, p27, p21 и DCX через 7 суток после обработки TGF-β1 в клетках ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, E=TGF-β1. ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК через 7 суток после обработки TGF-β1
Мишень	Ki67 n=3	p53 n=3	p21 n=3	DCX n=3
A+EGF/FGF	1,00±0,38	1,00±0,38	1,00±0,25	1,00±0,49
E 10 нг/мл+EGF/FGF	0,67±0,20	0,66±0,18	1,90*±0,22	0,37±0,06
E 50 нг/мл+EGF/FGF	0,43±0,09	0,42±0,06	1,45±0,16	0,16±0,01
A - EGF/FGF	1,00±0,15	1,00±0,13	1,00±0,14	1,00±0,31
E 10 нг/мл - EGF/FGF	0,87±0,08	0,97±0,10	1,00±0,04	0,72±0,14
E 50 нг/мл - EGF/FGF	0,93±0,11	0,93±0,09	0,90±0,09	0,71±0,24

Заключение:

Пролиферация клеток ReNcell CX^® блокировалась под действием TGF-β1.

12.1.2. Результаты по оценке влияния антисмысловых олигонуклеотидов на маркеры нейрональных стволовых клеток человека

Для исследования влияния ASO SEQ ID NO: 218b на маркеры стволовых клеток через 8 суток после повторной трансфекции гимнозисом (2×96 ч) в клетках ReNcell CX^® анализировали различные маркеры ранних клеток-предшественников нейронов (таблица 42). ASO SEQ ID NO: 218b не оказывал влияния на уровни экспрессии гена нестина и Sox2. Уровень мРНК GFAP несколько повышался после трансфекции гимнозисом 10 мкМ ASO SEQ ID NO: 218b и, напротив, DCX четко повышался после поглощения гимнозисом ASN SEQ ID NO: 218b. Экспрессия всех тестированных маркеров достоверно снижалась после обработки TGF-β1 (8 сутки) (таблица 42, фиг. 19).

Таблица 42: экспрессия мРНК нестина, Sox2, GFAP и DCX через 8 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM, +p<0,05 по отношению к 2,5 мкМ C, #p<0,05 по отношению к 10 мкМ C. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК через 8 суток после трансфекции гимнозисом или обработки TGF-β1
Мишень	Нестин n=4	Sox2 n=4	GFAP n=4	DCX n=4
A	1,00±0,18	1,00±0,25	1,00±0,22	1,00±0,32
B 2,5 мкM	0,97±0,32	0,88±0,33	0,78±0,13	1,31±0,42
B 10 мкM	0,89±0,16	0,79±0,13	1,02±0,20	1,44±0,48
C 2,5 мкM	1,09±0,21	0,93±0,09	0,99±0,14	1,67±0,46
C 10 мкM	0,90±0,09	0,89±0,11	1,21±0,11	1,95±0,37
E 10 нг/мл	0,48±0,12	0,32±0,06	0,41#±0,13	0,05+#±0,01

Заключение:

Результаты анализа мРНК показывают, что ASO SEQ ID NO: 218b направляет клетки ReNcell CX^® к еще более высокой клеточной «стволовости» (повышающая регуляция GFAP). Кроме того, индукция DCX указывает на повышенный нейрогенез. Обработка TGF-β1 приводит к противоположному эффекту.

12.1.3. Результаты оценки влияния антисмысловых олигонуклеотидов на пролиферацию нейрональных стволовых клеток человека

Проводили дальнейший анализ для исследования того, насколько трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: № 218b действительно влияет на скорость пролиферации подсчетом клеток через 9 суток после повторной трансфекции гимнозисом (3×72 ч) и определением уровней белка Ki67 через 8 суток после трансфекции гимнозисом (2×96 ч).

Результаты:

Количество клеток повышалось после поглощения гимнозисом ASN SEQ ID NO: 218b, согласуясь с повышенной экспрессией белка маркера пролиферации Ki67, выявленной при иммунохимическом окрашивании клеток (таблица 43, фиг. 20). Флуоресцентный анализ иммуноцитохимического окрашивания также свидетельствовал об остановке пролиферации, опосредованной TGF-β1.

Таблица 43: повышение количества клеток через 9 суток после повторной трансфекции гимнозисом (3×72 ч) клеток ReNcell CX^®. Количество клеток определяли с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® и устройства для светлопольного освещения (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM.


Клеточная линия	ReNcell CX^®
Количество клеток	живые клетки ×10⁵,n=2	мертвые клетки ×10⁵, n=2
A	3,34±0,09	0,51±0,05
B 2,5 мкM	4,34±0,56	0,60±0,09
B 10 мкM	4,36±0,96	0,58±0,09
C 2,5 мкM	4,63±1,28	0,47±0,02
C 10 мкM	5,24±0,42	0,37±0,02

Заключение:

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b клеток ReNcell CX^® приводит к увеличению числа клеток параллельно с повышением экспрессии белка Ki67, что указывает на усиление пролиферации предшественников нейронов.

12.1.3. Результаты оценки влияния антисмысловых олигонуклеотидов на способность нейрональных стволовых клеток человека к дифференцировке

Для исключения влияния ASO SEQ ID NO: 218b на способность клеток к дифференцировке ASO SEQ ID NO: 218b трансфицировали в клетки путем поглощения гимнозисом в течение 96 ч в условиях пролиферации (+EGF/FGF). После времени инкубации среду заменяли и к одной части клеток добавляли среду для пролиферации, тогда как к другой части клеток добавляли среду для дифференцировки (-EGF/FGF). Затем проводили еще одну трансфекцию гимнозисом в течение 96 ч. Клетки анализировали определением уровней экспрессии нейрональных маркеров нейрофиламента N (NeuN) и βIII-тубулина.

Результаты:

Иммунохимическое окрашивание на NeuN (фиг. 23A) и βIII-тубулин (фиг. 23B) демонстрирует отсутствие эффектов на способность клеток к дифференцировке после трансфекции гимнозисом ASO в условиях пролиферации, с последующей трансфекцией гимнозисом в условиях дифференцировки. ASO SEQ ID NO: 218b не оказывал влияния на сигнал βIII-тубулина, человеческого нейронспецифического белка, в условиях дифференцировки и был сравним с необработанным контролем. Кроме того, на экспрессию NeuN не оказывала влияния трансфекция гимнозисом в условиях дифференцировки. Таким образом, клетки все еще были способны дифференцироваться в нейроны. Удивительно, что клетки ReNcell CX^® экспрессировали нейрональные маркеры NeuN и βIII-тубулин после трансфекции гимнозисом ASO в условиях пролиферации (2×96 ч) во время обоих периодов, указывая на то, что трансфекция гимнозисом ASO может способствовать специфическому сдвигу к дифференцировке нейронов даже в условиях пролиферации. Кроме того, наблюдали повышенные скорости пролиферации клеток-предшественников нейронов (таблица 43, фиг. 20). Также окрашивание на NeuN показало, что клетки, обработанные ASO SEQ ID NO: 218b, выглядят более жизнеспособными по сравнению с клетками, подвергшихся всем другим видам обработки (фиг. 21A). Очевидно, что пролиферативный потенциал клеток, которые были обработаны TGF-β1, был значительно ниже.

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218b по изобретению не оказывал влияния на способность к дифференцировке. Интересно отметить, что клетки ReNcell CX^® подвергались дифференцировке в нейроны после трансфекции гимнозисом в условиях пролиферации и дифференцировки. Данный факт с учетом наблюдения о повышении скорости пролиферации указывает на то, что ASO SEQ ID NO: 218b способствует нейрогенезу с тенденцией к усилению дифференцировки в нейроны.

12.1.4. Результаты оценки влияния антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению на пролиферацию нейрональных стволовых клеток человека после предварительной инкубации с TGF-β1

Для анализа того, насколько трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b является эффективной для отмены TGF-β1-опосредованных эффектов на клетки ReNcell CX^®, проводили дополнительные исследования с предварительной инкубацией с TGF-β1 в течение 7 суток с последующей трансфекцией гимнозисом в течение 8 суток (2× 96 ч).

Результаты:

Экспрессия гена GFAP (таблица 44, фиг. 22А) в качестве раннего нейронального маркера, Ki67 (таблица 44, фиг. 22B) в качестве маркера пролиферации и DCX (таблица 44, фиг. 22C) в качестве маркера нейрогенеза была повышена после обработки одним ASO, в то время как TGF-β1 приводил к обратному эффекту. Кроме того, через 7 суток после предварительной инкубации с TGF-β1 обработка ASO по изобретению полностью отменял TGF-β1-индуцированные эффекты. Таким образом, анализ показывает, что ASO SEQ ID NO: 218b является эффективным в восстановлении последствий опосредованных TGF-β1 эффектов на стволовые клетки и маркеры пролиферации.

Таблица 44: экспрессия мРНК GFAP, Ki67 и DCX через 7 суток после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей 2×96 ч трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках ReNcell CX^®. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1, ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК через 7 суток после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом 2×96 ч
Мишень	GFAP n=2	Ki67 n=1	DCX n=2
A	1,00±0,20	1,00	1,00±0,16
B 10 мкM	1,62±0,15	0,91	1,52±0,24
C 10 мкM	2,23±0,52	1,52	4,82±1,15
E 10 нг/мл	0,76±0,01	0,48	0,68±0,03
E 10 нг/мл+B 10 мкM	0,58±0,07	0,61	0,83±0,10
E 10 нг/мл+C 10 мкM	2,04±1,04	7,40	1,55±0,24

Заключение:

Результаты показывают, что взрослый нейрогенез может быть реактивирован TGF-R_II-специфическим ASO-опосредованным блокированием сигнального пути TGF-β.

В совокупности, TGF-R_II-специфический ASO SEQ ID NO: 218b «спасал» клетки от опосредованного TGF-β состояния покоя стволовых клеток и стимулировал взрослый нейрогенез, не влияя на дифференцировку. Это делает его идеальным лекарственным препаратом для восстановления головного мозга.

Пример 13: определение терапевтической активности антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению при прогрессирующем ALS у мышей SOD1

Для анализа терапевтической потенциальной активности ASO для лечения бокового амиотрофического склероза (ALS) трансгенных мышей самцов и самок SOD1 G93A обрабатывали ASO по изобретению в различных дозах icv введением в боковой желудочек с помощью осмотических мининасосов ALZET^®. Кроме того, рилузол использовали в качестве стандарта. Рилузол является лекарственным препаратом, применяемым для лечения бокового амиотрофического склероза, и комерчески доступен от Sanofi Pharmaceuticals. Он задерживает начало зависимости от искусственной вентиляции легких или трахеостомии у отдельных пациентов и может увеличить выживаемость примерно на два-три месяца.

Описание метода:

Для длительной центральной инфузии icv канюлю, присоединенную к осмотическому мининаносу Alzet^® (скорость инфузии 0,25 мкл/ч, Alzet^®, модель 2004, Купертино, США), стереотаксически имплантировали под анестезией изофлураном (Baxter, GmbH, Германия) в полустерильных условиях. Каждый осмотический мининасос имплантировали подкожно со стороны брюшной области посредством разреза кожи длиной 1 см на шее мыши и соединяли с icv канюлей силиконовыми трубками. Животных помещали в стереотаксическую рамку и icv канюлю (23G, длина 3 мм) погружали в правый боковой желудочек (0,3 мм сзади, 1 мм латеральнее, на глубину 3 мм относительно брегмы). Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^® Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций мышей местно обрабатывали препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 0,1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубку заполняли соответствующим раствором. Для определения влияния ASO на развитие и прогрессирование ALS, начало проявления симптомов, парез и выживаемость использовали в качестве конечных точек in vivo. В возрасте девяти недель мышей подвергали эвтаназии и извлекали головной мозг для нейропатологического анализа. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм, окрашенных крезил-фиолетовым.

ASO по изобретению оказывали потенциальные эффекты в экспериментах in vitro. Согласуясь с этим, перекрестно реагирующие на грызунах ASO по изобретению с последовательностями SEQ ID NO: 143aj, SEQ ID NO: 143h и SEQ ID NO: 210q, были также эффективны в вышеописанных экспериментах, результаты которых доказывают эффект в лечении животных моделей ALS. ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие отсутствие перекрестной реактивности, оказывали даже более сильные эффекты в экспериментах in vitro. В результате предполагается, что данные ASO по изобретению будут также более эффективными в испытаниях in vivo у приматов, отличных от человека и людей, и поэтому будут функционировать как высокоэффективное лекарственное средство для профилактики или лечения индуцированного TGF-β1 ингибирования пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов, и тем самым лечения ALS и других нейродегенеративных расстройств.

Пример 14: определение терапевтической активности антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению, нацеленных на TGF-R_II, на развитие и прогрессирование болезни Гентингтона у мышей R6/2

Для анализа терапевтической активности ASO для лечения болезни Гентингтона (HD) трансгенным мышам самцам и самкам R6/2 вводили различные дозы TGF-R_II-специфического ASO по изобретению icv введением в боковой желудочек с помощью осмотических мининасосов.

Описание метода:

Для длительной центральной инфузии мышей подвергали хирургической операции для имплантации icv канюли, присоединенной к осмотическому мининаносу Alzet^® (скорость инфузии 0,25 мкл/ч, Alzet^®, модель 2004, Купертино, США) в возрасте 5 недель. Канюлю и насос стереотаксически имплантировали под анестезией кетамином/ксилацином (Baxter, GmbH, Германия) в полустерильных условиях. Каждый осмотический мининасос имплантировали подкожно со стороны брюшной области посредством разреза кожи длиной 1 см на шее мыши и соединяли с icv канюлей силиконовыми трубками. Животных помещали в стереотаксическую рамку и icv канюлю (23G, длина 3 мм) погружали в правый боковой желудочек (0,3 мм сзади, 1 мм латеральнее, на глубину 3 мм относительно брегмы). Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^® Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций мышей местно обрабатывали препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 0,1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубку заполняли соответствующим раствором. Для определения влияния ASO на развитие и прогрессирование HD, начало проявления симптомов, силу схвата, общую моторику и выживаемость использовали в качестве конечных точек in vivo. В возрасте девяти недель мышей подвергали эвтаназии и извлекали головной мозг для нейропатологического анализа. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм, окрашенных крезил-фиолетовым.

ASO по изобретению оказывали потенциальные эффекты в экспериментах in vitro. Согласуясь с этим, перекрестно реагирующие на грызунах ASO по изобретению с последовательностями SEQ ID NO: 143aj, SEQ ID NO: 143h и SEQ ID NO: 210q, были также эффективны в вышеописанных экспериментах, результаты которых доказывают эффект в лечении животных моделей болезни Гентингтона. ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие отсутствие перекрестной реактивности, оказывали даже более сильные эффекты в экспериментах in vitro. В результате предполагается, что данные ASO по изобретению будут также более эффективными в испытаниях in vivo у приматов, отличных от человека и людей, и поэтому будут функционировать как высокоэффективное лекарственное средство для профилактики или лечения индуцированного TGF-β1 ингибирования пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов, и тем самым лечения HD и других нейродегенеративных расстройств.

Пример 15: определение терапевтической активности ASO по изобретению при прогрессировании TGF2-индуцированной гидроцефалии и связанного с ней когнитивного дефицита у крыс Fischer-344

Целью настоящего исследования было лечение животных, страдающих TGF-индуцированными эффектами, конкретно на i) пролиферацию и нейрогенез нейрональных стволовых клеток, ii) формирование гидроцефалии и iii) дефицит пространственного обучения путем внутрижелудочковой инфузии ASO по изобретению в зависимости от дозы.

Описание метода: осмотические мининасосы для интрацеребровентрикулярной инфузии имплантировали самкам крыс Fischer-344 массой тела 180-200 г (n_общее=70, n_{в группе}=10). Инфузировали а) искусственную спинномозговую жидкость (aCSF: 148,0 мМ NaCl, 3,0 мМ KCl, 1,4 мМ CaCl₂, 0,8 мМ MgCl₂, 1,5 мМ Na₂HPO₄, 0,2 мМ NaH₂PO₄, 100 мкг/мл крысиного сывороточного альбумина, 50 мкг/мл гентамицина, рН 7,4) в качестве контроля или b) TGF-β1 1 мкг/мл в aCSF с использованием осмотического насоса Alzet^® модель 2004 со скоростью введения 0,25 мкл/ч в течение 14 суток. Через 14 суток насосы меняли и использовали осмотические насосы Alzet^® модель 2004 (скорость введения 0,25 мкл/ч) для следующих инфузий: aCSF или TGF-β1 (1 мкг/мл) в комбинации с различными концентрациями TGF-R_II-специфических ASO (1,1 ммоль/л, 3,28 ммоль/л, 9,84 ммоль/л) или контрольного ASO (3,28 ммоль/л) (2×4 недели). В течение последних четырех дней инфузионного периода животным ежедневно вводили внутрибрюшинно BrdU (50 мг/кг массы тела) для мечения пролиферирующих клеток. Насосы удаляли и через две недели животных обследовали функционально в тесте пространственного обучения (водный бассейн Морриса) в течение 14 суток. Через день животным перфузировали 0,9% NaCl, извлекали головной мозг, ипсилатеральное полушарие фиксировали в 4% параформальдегиде для количественного гистологического анализа PCNA, BrdU, DCX, BrdU/NeuN и BrdU/GFAP, и также для стереологического анализа объема боковых желудочков в качестве показателя гидроцефалии. Далее контралатеральное полушарие рассекали и различные области (стенки желудочков, гиппокамп, кору) обрабатывали для количественной ОТ-ПЦР в целях определения уровней экспрессии TGF-R_II. МР-снимки были сделаны на 4 животных 1, 3 и 6 групп на сутки 4 до имплантации насоса, через неделю после имплантации насоса, в день смены первого насоса и затем каждые 2 недели до конца инфузионного периода. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм с окрашиванием крезил-фиолетовым.

Таблица 46: схема лечения и оценка групп в опыте с гидроцефалией
Группа	1. aCSF	2. aCSF+ASO	3. TGF-β1	4. TGF-β1+скремблированный ASO	5.-7. TGF-β1+ASO
Обработка	Инфузия aCSF	Инфузия aCSF плюс ASO	Инфузия TGF-β1	Инфузия TGF-β1 плюс ASO	Инфузия TGF-β1 плюс ASO
Схема обработки	недели 1-10	недели 1 и 2: aCSF недели 3-10: ASO: 3,28 ммоль/л	недели 1 и 2: 1 мкг/мл недели 3-10: 1 мкг/мл	недели 1 и 2: TGF-β1: 1 мкг/мл недели 3-10: TGF-β1: 1 мкг/мл скремблированный ASO: 3,28 ммоль/л	недели 1 и 2: TGF-β1: 1 мкг/мл недели 3-10: TGF-β1: 1 мкг/мл ASO: 1,1 ммоль/л 3,28 ммоль/л 9,84 ммоль/л
n	10	10	10	10	10 на дозу
Общее значение n	10	10	10	10	30

ASO по изобретению оказывали потенциальные эффекты в экспериментах in vitro. Согласуясь с этим, перекрестно реагирующие на грызунах ASO по изобретению с последовательностями SEQ ID NO: 143aj, SEQ ID NO: 143h и SEQ ID NO: 210q, были также эффективны в вышеописанных экспериментах, результаты которых доказывают эффект в лечении животных моделей гидроцефалии. ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие отсутствие перекрестной реактивности, оказывали даже более сильные эффекты в экспериментах in vitro. В результате предполагается, что данные ASO по изобретению будут также более эффективными в испытаниях in vivo у приматов, отличных от человека и людей, и поэтому будут функционировать как высокоэффективное лекарственное средство для профилактики или лечения индуцированного TGF-β1 ингибирования пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов, и тем самым лечения гидроцефалии и других нейродегенеративных расстройств.

Пример 16: определение терапевтической активности антисмысловых олигонуклеотидов, нацеленных на TGF-R_II, для восстановления повреждения спинного мозга у крыс Fischer 344

Для анализа терапевтической активности ASO для лечения повреждения спинного мозга (SCI), самцов и самок крыс Fischer-344 обрабатывали ASO по изобретению в различных дозах icv введением в боковой желудочек с помощью осмотических мини-насосов.

Описание метода:

SCI воспроизводили перерезанием шейного дорсального отдела позвоночника на уровне C3 ножом из вольфрамовой нити. На следующей стадии для длительной центральной инфузии крыс (с массой тела 180-200 г) подвергали хирургической операции для имплантации icv канюли, присоединенной к осмотическому мининаносу Alzet^® (скорость инфузии 0,25 мкл/ч, Alzet^® модель 2004, Купертино, США). Канюлю и насос стереотаксически имплантировали под анестезией кетамином/ксилацином (Baxter, GmbH, Германия) в полустерильных условиях. Каждый осмотический мининасос имплантировали подкожно со стороны брюшной области посредством разреза кожи длиной 1 см на шее мыши и соединяли с icv канюлей силиконовыми трубками. Животных помещали в стереотаксическую рамку и icv канюлю (23G, длина 3 мм) погружали в правый боковой желудочек (1,0 мм сзади, 1,0 мм латеральнее, на глубину 1,8 мм относительно брегмы). Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^® Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций мышей местно обрабатывали препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 0,1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубку заполняли соответствующим раствором. Для определения влияния ASO на процесс реабилитации после SCI, через 4 недели после хирургической операции проводили МРТ-визуализацию структуры in vivo (3T MRI, Allegra Siemens, катушка с фазовой решеткой для мелких животных). Через 6 недель животных подвергали эвтаназии, и извлекали спинной мозг для гистологического и иммуногистохимического анализа. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм, окрашенных крезил-фиолетовым.

ASO по изобретению оказывали потенциальные эффекты в экспериментах in vitro. Согласуясь с этим, перекрестно реагирующие на грызунах ASO по изобретению с последовательностями SEQ ID NO: 143aj, SEQ ID NO: 143h и SEQ ID NO: 210q, были также эффективны в вышеописанных экспериментах, результаты которых доказывают эффект в лечении на крысах Fischer-344, животных моделях параплегии спинного мозга. МРТ-снимки и нейропатологический анализ свидетельствовали о высокой эффективности ASO по изобретению. ASO по настоящему изобретению, демонстрирующие отсутствие перекрестной реактивности, оказывали даже более сильные эффекты в экспериментах in vitro. В результате предполагается, что данные ASO по изобретению будут также более эффективными в испытаниях in vivo у приматов, отличных от человека и людей, и поэтому будут функционировать как высокоэффективное лекарственное средство для профилактики или лечения индуцированного TGF-β1 ингибирования пролиферации нейрональных стволовых клеток и клеток-предшественников нейронов, и тем самым лечения повреждения спинного мозга и других нейродегенеративных расстройств.

Пример 17: опосредованные ASO эффекты на пролиферацию клеточной линии рака легких человека A549

Определяли уровень мРНК Ki67, p53, каспазы 8 (Casp8) и ингибитора ДНК-связывающего белка 2 (ID2) в качестве репрезентативных маркеров пролиферации в нескольких типах опухолевых клетках. По результатам предыдущих исследований известно, что экспрессия гена-супрессора опухолей р53 и ID2 часто резко повышается в опухолевых тканях. Ki67 является маркером пролиферации, и Casp8 представляет индикатор апоптоза. Кроме того, после трансфекции гимнозисом определяли количество клеток.

Описание метода:

Клетки A549 культивировали, как описано выше. Для обработки клеток среду удаляли и заменяли свежей полной средой в 24-луночных культуральных планшетах (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку), 6-луночных культуральных планшетах (Sarstedt #83.3920.300) (50000 клеток/лунку) или 8-луночных слайд-планшетах для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (20000 клеток/лунку) (0,5 мл для 24-луночных планшетов и 8-луночных слайд-планшетов для культивирования клеток и 1 мл для 6-луночных планшетов) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% CO₂. Для анализа экспрессии мРНК и влияния на пролиферацию клетки обрабатывали стандартным олигонуклеотидом 1 (скремблированный контроль) и ASO SEQ ID NO: 218b в концентрациях 2,5 мкМ и 10 мкМ и инкубировали в течение 72 ч при 37°С и 5% СО₂. Обработку, включающую замену среды, повторяли 3 раза каждые 72 ч (в целом 12 суток). Для иммуноцитохимического анализа пролиферации (Ki67) трансфекцию гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b ограничивали 72 ч. Затем клетки дважды промывали PBS и использовали для выделения белка (6-луночные планшеты), иммуноцитохимии (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток), построения кривой пролиферации и выделения РНК (24-луночные планшеты). Протоколы для анализа РНК, белка и иммуноцитохимии выполняли, как описано выше. Для построения кривой пролиферации извлекали оставшиеся клетки из 24-луночных планшетов для определения количества клеток. Для этой цели оставшиеся клетки промывали PBS (2×), обрабатывали аккутазой (500 мкл/лунку) и инкубировали в течение 7 мин при 37°C. Затем добавляли 500 мкл среды и определяли количество клеток с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. Вкратце, 18 мкл клеточной суспензии добавляли к 2 мкл красителей акридиновый оранжевый/пропидиум иодид из набора для определения жизнеспособности клеток (Biozym #872045). Через 1 мин осаждения 10 мкл наносили на стекло для подсчета клеток (Biozym #872011). Клетки подсчитывали и по отдельности рассчитывали количество живых и мертвых клеток.

17.1 Результаты для ASO SEQ ID NO: 218b

Анализ мРНК показал снижение уровней экспрессии Ki67, p53 и ID2 через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b. В противоположность, экспресия Casp8 повышалась при низких концентрациях ASO SEQ ID NO: 218b (таблица 46). Эти результаты указывают на то, что снижение роста опухоли связано с небольшим увеличением апоптических клеток. Кроме того, анализ вестерн-блоттингом показал снижение уровня белка Ki67 и pAkt через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO по изобретению (таблица 47). Иммунохимическое исследование клеток A549 после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b показало пониженный уровень сигналов Ki67 по сравнению со скремблированным контролем при обеих использованных концентрациях (фиг. 23). Наконец, количество клеток A549 снижалось примерно на 50% через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b (таблица 48).

Таблица 46: экспрессия мРНК Ki67, p53, Casp8 и ID2 через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549. Данные по регуляции тестированных генов демонстрирует снижение скорости пролиферации после трансфекции гимнозисом ASO по изобретению. Снижение уровня мРНК ID2 оказывает положительное действие в подавлении экспансии опухолевых клеток. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	A549 уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Мишень	Ki67 n=2	p53 n=2	Casp8 n=2	ID2 n=2
A	1,00±0,37	1,00±0,31	1,00±0,05	1,00±0,03
B 2,5 мкM	0,92±0,05	1,06±0,02	1,36±0,37	0,73±0,01
B 10 мкM	0,96±0,03	1,11±0,92	1,52±0,15	0,82±0,15
C 2,5 мкM	0,55±0,33	0,27±0,04	1,59±0,48	0,59±0,01
C 10 мкM	0,57±0,20	0,53±0,07	0,98±0,17	0,35±0,02

Таблица 47: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга Ki67 и pAkt. Установлена понижающая регуляция белка Ki67 и pAkt через 12 суток после трансфекции гимнозисом TGF-R_II-специфического ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1, используя программное обеспечение Image Studio™ Lite, и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM.


Клеточная линия	A549 уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Мишень	Ki67 n=1	pAKT n=1
A	1,00	1,00
B 10 мкM	1,18	0,80
C 10 мкM	0,57	0,39

Таблица 48: количество клеток через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом. Количество клеток определяли через 12 суток после повторных трансфекций гимнозисом (4×72 ч) клеток A549 с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® и устройства для светлопольного освещения (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. A=необработанный контроль, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM.


Клеточная линия	A549 количество клеток через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Количество клеток	живые клетки ×10⁵ n=3	мертвые клетки ×10⁵ n=3
A	4,25±0,50	0,47±0,09
B 10 мкM	3,88±0,95	0,31±0,11
C 10 мкM	2,35±0,07	0,35±0,16

Заключение:

Полученные результаты показывают, что снижение роста опухолей связано с увеличением числа апоптотических клеток. Примечательно, что уровень ID2, который является возможным геном-мишенью для терапии в опухолях, снижается после трансфекции гимнозисом TGF-R_II-специфического ASO SEQ ID NO: 218b.

В совокупности, ASO SEQ ID NO: 218b эффективен в минимизации скоростей пролиферации и снижении экспрессии генов, способствующих росту опухолей.

Пример 18: влияние трансфекции гимнозисом ASO на пролиферацию нескольких опухолевых клеточных линий

Сигнальный путь TGF-β является критическим путем в развитии рака. С одной стороны, TGF-β стимулирует факторы, которые подавляют рост опухолей, но с другой стороны, этот ростовый фактор приводит к стимуляции миграции клеток, инвазии клеток, пролиферации клеток, иммунной регуляции и способствует реорганизации среды, способствуя прогрессированию и метастазированию опухолевых клеток. Таким образом, TGF-β является ключевой мишенью в лечении рака. Уровни мРНК и белка маркера пролиферации (Ki67) и количество клеток определяли после поглощения гимнозисом ASO по изобретению, используя первый в качестве маркера скорости пролиферации в опухолевых клетках. Кроме того, определяли уровни мРНК гена-супрессора опухолей р53 и ингибитора ДНК-связывающего белка 2 (ID2).

Описание методов:

A549 культивировали, как описано выше. Для обработки клеток среду удаляли и заменяли свежей полной средой в 24-луночных культуральных планшетах (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку), 6-луночных культуральных планшетах (Sarstedt #83.3920.300) (50000 клеток/лунку) или 8-луночных слайд-планшетах для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (20000 клеток/лунку) (0,5 мл для 24-луночных и 1 мл для 6-луночных планшетов) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% CO₂. Для анализа экспрессии мРНК и оценки влияния на пролиферацию клетки обрабатывали стандартным олигонуклеотидом 1 (скремблированный контроль) и ASO SEQ ID NO: 218b в концентрациях 2,5 мкМ и 10 мкМ и инкубировали в течение 72 ч при 37°С и 5% СО₂. Обработку, включающую замену среды, повторяли 3 раза каждые 72 ч (в целом 12 суток). Для сбора клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты), выделения белка (6-луночные планшеты) или построения кривой пролиферации. Протоколы для выделения РНК и белка выполняли, как описано выше. Перед подсчетом клеток для построения кривой пролиферации клетки анализирвоали с использованием световой микроскопии (Nicon, TS-100 F LED #MFA33500). Оставшиеся клетки извлекали из 24-луночных планшетов для определения количества клеток. Для этой цели оставшиеся клетки промывали PBS (2×), обрабатывали аккутазой (500 мкл/лунку) и инкубировали в течение 5-7 мин при 37°C. Затем добавляли 500 мкл среды и определяли количество клеток с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® и устройства для светлопольного освещения (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. Вкратце, 18 мкл клеточной суспензии добавляли к 2 мкл красителей акридиновый оранжевый/пропидиум иодида из набора для определения жизнеспособности клеток (Biozym #872045). Через 1 мин осаждения 10 мкл наносили на стекло для подсчета клеток (Biozym #872011). Клетки подсчитывали и по отдельности рассчитывали количество живых и мертвых клеток.

18.1 Результаты для SEQ ID NO: 218b

Уровни мРНК Ki67 эффективно снижались независимо (A549, L3.6pl, Panc-1) или в зависимости от использованных концентраций ASO (HT-29, Panc-1, CaCo2) через 12 суток после трансфекции гимнозисом (таблица 40). Уровень экспрессии гена р53 также изменялся в клетках А549, ХТ-29, К562, KG-1, СаСо2 и ТМК-1 (таблица 50). Была показана пониженная экспрессия белка Ki67 в клетках A549, L3.6pl, ™K-1, HT-29 и K562 (таблица 51). Примечательно, что экспрессия мРНК ID2 подверглась последовательной эффективной и дозозависимой понижающей регуляции в клетках A549, HT-29, K562 и ™K-1, опосредуемой ASO SEQ ID NO: 218b (таблица 51). Кроме того, ASO SEQ ID NO: 218b приводил к снижению скорости пролиферации нескольких линий опухолевых клеток (таблица 53). Дозозависимое уменьшение количества клеток было установлено для клеток HPAFII, MCF-7, KG1, K562, U937 и HTZ-19. Клетки злокачественной опухоли легких (A549) показали примерно 50% снижение количества клеток, вызванное ASO SEQ ID NO: 218b. Снижение количества клеток было дополнительно подтверждено световой микроскопией для линий HPAFII, K562, MCF-7, Panc-1 и HTZ-1 через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b (фиг. 24).

Сопоставимые результаты были получены для антисмысловых олигонуклеотидов с последовательностями SEQ ID NO: 141d, 141g, 141i, 143r, 143w, 143af, 143ag, 143ah, 143j, 143p, 143q, 233d, 234d, 235b, 235d, 237b, 237c, 237i, 237m, 238c, 238f, 239e, 240c, 241b, 242a, 246e, 247d, 248b, 248e, 248g, 152k, 152s, 152t, 152u, 152ab, 152ag, 152ah, 152ai, 249c, 249e, 250b, 250g, 251c, 251f, 252e, 253c, 254b, 255a, 259e, 260d, 261b, 261e, 261g, 262d, 262e, 209s, 209v, 209w, 209x, 209ai, 209an, 209at, 209au, 209av, 210o, 210v, 210w, 210x, 210ab, 210ac, 210ad, 210af, 210am, 263b, 263c, 263i, 263m, 264e, 264h, 265e, 266c, 267b, 268a, 272e, 273d, 274a, 274d, 274f, 275g, 275i, 276b, 276c, 276j, 276k, 277d, 277e, 278f, 279c, 280b, 281a, 218ad, 218n, 218t, 218u, 218v, 218ah, 218an, 218ao, 218ap, 220d, 221d, 222b, 222c,222f, 223c, 223f, 224i, 224m, 225c, 225f, 226e, 227c, 213o, 213p, 213q, 213s, 213y, 213z, 213aa, 213af, 228b, 229a, 285d, 286d, 287d, 287e, 287f, 288e, 288i, 289d, 289h, 289o, 289p, 289q, 290c, 290f, 290i, 291c, 292c, 293b и 294a. Большинство вышеуказанных антисмысловых олигонуклеотидов были не более эффективными, чем последовательности SEQ ID NO: 218b и 218c, но, тем не менее, они являются существенно более преимущественными, чем антисмысловые олигонуклеотиды, известные в данной области. Таким образом, антисмысловые олигонуклеотиды по настоящему изобретению очень пригодны для лечения гиперпролиферативных заболеваний, таких как рак и опухоли.

Таблица 49: экспрессия мРНК маркера пролиферации Ki67. Через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b клеток A549, HT-29, L3.6pl, KG1, Panc-1 и CaCo2, уровень мРНК Ki67 снижался во всех клеточных линиях соответственно. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	Ki67 уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	HT-29 n=2	L3.6pl n=2	KG1 n=1	Panc-1 n=1	CaCo2 n=1
A	1,00±0,37	1,00±0,00	1,00±0,25	1,00	1,00	1,00
B 2,5 мкM	0,92±0,05	0,89±0,46	0,93±0,03	0,72	0,76	1,21
B 10 мкM	0,96±0,03	0,60±0,11	0,96±0,16	0,76	0,79	1,07
C 2,5 мкM	0,55±0,33	0,34±0,11	0,42±0,03	0,16	0,68	0,99
C 10 мкM	0,57±0,20	0,17±0,02	0,64±0,05	0,33	0,37	0,37

Таблица 50: экспрессия мРНК супрессора опухолей р53. Через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b клеток A549, HT-29, K562, KG1, CaCo2 и ™K-1, уровень мРНК р53 снижался во всех клеточных линиях соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	p53 уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	HT-29 n=1	K562 n=1	KG1 n=1	™K-1 n=1	CaCo2 n=1
A	1,00±0,31	1,00	1,00	1,00	1,00±0,04	1,00
B 2,5 мкM	1,06±0,02	0,72	0,90	1,37	0,74±0,11	0,82
B 10 мкM	1,11±0,92	0,68	1,35	0,87	0,71±0,15	1,25
C 2,5 мкM	0,27±0,04	0,51	0,27	0,65	0,14*±0,14	0,99
C 10 мкM	0,53±0,07	0,32	0,46	0,67	0,21*±0,05	0,30

Таблица 51: экспрессия мРНК ID2. Через 12 суток после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b клеток A549, HT-29, K562 и ™K-1, уровень мРНК ID2 снижался в зависимости от концентрации во всех клеточных линиях соответственно. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	ID2 уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	HT-29 n=1	K562 n=1	™K-1 n=1
A	1,00±0,03	1,00	1,00±0,23	1,00±0,23
B 2,5 мкM	0,73±0,01	0,93	0,97±0,15	0,88±0,15
B 10 мкM	0,82±0,15	1,00	0,82±0,05	0,82±0,05
C 2,5 мкM	0,59±0,01	0,31	0,70±0,10	0,70±0,10
C 10 мкM	0,35±0,02	0,25	0,29*±0,09	0,30*±0,09

Таблица 52: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга Ki67. Установлена понижающая регуляция белка Ki67 после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b. Уровень белка определяли количественно по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	Ki67 уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=1	L3.6pl n=2	™K-1 n=2	HT29 n=2	K562 n=1
A	1,00	1,00±0,00	1,00±0,00	1,00±0,00	1,00
B 10 мкM	1,18	0,59±0,00	0,75±0,00	1,19±0,68	1,05
C 10 мкM	0,57	0,19±0,17	0,53±0,26	0,69±0,05	0,35

Таблица 53: количество клеток в нескольких линиях раковых клеток через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч). ASO SEQ ID NO: 218b трансфицировали в несколько линий раковых клеток. Количество клеток определяли с использованием автоматического флуоресцентного счетчика клеток Luna FL^® и устройства светопольного освещения (Biozym, #872040), следуя инструкциям производителя. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, a=живые клетки, d=мертвые клетки. ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.

Клеточная линия

Обработка

B 2,5 мкM

B 10 мкM

C 2,5 мкM

C 10 мкM

количество клеток ×10⁵

A549

4,25±0,50

0,47±0,09

3,88±0,95

0,31±0,11

2,35±0,07

0,35±0,16

HPAFII

2,80±0,33

0,35±0,11

2,88±2,04

0,36±0,06

2,56±0,45

0,39±0,06

0,66±0,47

0,25±0,07

0,20±0,09

0,06±0,02

KG1

17,40±3,00

0,43±0,16

16,5±0,85

0,58±0,24

13,80±0,80

0,26±0,17

10,90±0,20

0,59±0,18

7,63±3,08

0,48*+±0,14

A против C 10 мкM *p<0,01
B 2,5 мкM против C 10 мкM +p<0,01 C 10 мкM против D 10 мкM #p<0,01

K562

10,93±1,58

1,37±0,40

7,44±1,05

2,40±0,62

6,40±0,38

2,36±0,30

5,60±0,08

2,66±0,41

3,33±0,54

0,62*±0,07

A против C 10 мкM *p<0,01

MCF-7

6,73

2,37

6,51

1,57

6,51

3,35

5,21

1,64

2,47

0,73

U937

26,43±2,05

7,04±0,28

14,5±2,73

2,88±0,37

17,67±0,50

2,36±0,30

11,34^*±2,85

3,07±0,97

7,56*±1,49

2,25±0,44

A против C 2,5 мкM *p<0,01
A против C 10 мкM *p<0,01

Panc-1

2,16±0,08

0,11±0,02

1,82±0,36

0,15±0,04

2,98±0,27

0,16±0,02

1,15*±0,51

0,07±0,02

1,20*+±0,23

0,36±0,02

A против C 2,5 мкM *p<0,05
A против C 10 мкM *p<0,05
B 10 мкM против C 10 мкM +p<0,01

HTZ-19

2,06±0,02

3,05±0,36

2,57±0,16

1,78±0,15

2,55±0,22

1,22±0,15

1,78±0,25

0,88±0,09

1,17+±0,14

0,49±0,05

B 10 мкM против C 10 мкM +p<0,05

Заключение:

Модуляция мРНК Ki67, p53 и ID2 под действием ASO SEQ ID NO: 218b указывает на положительный эффект в подавлении роста опухолей в нескольких органах и различного происхождения. Известно, что Ki67, ID2 и p53 активируются и способствуют пролиферации клеток в различных типах злокачественных опухолей. Маркеры пролиферации Ki67, p53 и ID2 подвергались эффективной понижающей регуляции. Подсчет клеток и световая микроскопия некоторых типов опухолевых клеток через 12 суток после трансфекции гимнозисом показали, что ASO SEQ ID NO: 218b является высокоэффективным агентом для снижения пролиферации клеток.

В совокупности, TGF-R_II-специфический ASO SEQ ID NO: 218b эффективно снижал скорость пролиферации параллельно с установленными модуляциями мРНК Ki67, p53 и ID2. Эти данные дают основание предположить, что ASO по изобретению являются многообещающими кандидатами для применения в качестве лекарственных препаратов в целях снижения прогрессирования опухолевых клеток и метастазирования опухолевых клеток.

Пример 19: анализ влияния антисмысловых олигонуклеотидов на ангиогенез в нескольких линиях опухолевых клеток

Модуляция ангиогенеза необходима для роста и восстановления органов. Нарушения роста кровеносных сосудов вносят свой вклад в развитие различных заболеваний, например, таких как рост опухолей, ишемия, воспалительные и иммунные расстройства. Известно, что TGF-β является проангиогенным фактором. Это может быть наиболее важно для воспалительных и неопластических процессов, когда избыточный ангиогенез ответственен за прогрессирование заболевания. Данные эффекты могут иметь место параллельно с индуцированным TGF-β1 фиброзом. Следовательно, ингибирование сигнального пути TGF-β TGFR_II-специфическим ASO может представлять собой адекватный терапевтический подход.

Для проверки этого предположения несколько линий опухолевых клеток трансфицировали данными ASO поглощением гимнозисом. Через 12 суток после многократных трансфекций гимнозисом клеточный супернатант анализировали на уровни белка проангиогенных факторов мультиплексным анализом. Данная технология позволила исследовать несколько проангиогенных белков (VEGF, Tie-2, FLt-1, PIGF и bFGF) с использованием электрохемилюминесценции. Фактор роста эндотелия сосудов (VEGF) является мощным секретируемым опухолями цитокином, который способствует ангиогенезу и тем самым стимулирует, например, пролиферацию опухолей. Tie-2 представляет собой белок, который экспрессируется из активно растущих кровеносных сосудов. Fms-подобная тирозинкиназа 1 (Flt-1), также известная как рецептор 1 фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR1), представляет собой трансмембранную рецепторную тирозинкиназу, которая экспрессируется на высоком уровне в сосудистых эндотелиальных клетках, и плацентарный фактор роста (PIGF) функционирует вместе с VEGF и активируется при патологических состояниях, например, при образовании опухоли. Кроме того, основный фактор роста фибробластов (bFGF) является ростовым фактором, который также индуцирует ангиогенез. PAI-1 является геном-мишенью для TGF-β и опосредует образование рубцов и ангиогенные эффекты TGF-β. Таким образом, PAI-1 является также ключевым фактором для инвазии и метастазирования опухолей. Высокая концентрация PAI-1 у пациентов является плохим прогностическим фактором, например, при раке молочной железы, легких, колоректальном раке и раке желудке. Высокие концентрации PAI-1 также являются фактором риска для заболеваний, при которых тромбоз имеет большое значение (например, инфаркт миокарда, инсульт). Таким образом, также исследовали регуляцию мРНК PAI-1 TGF-β-специфическими антисмысловыми олигонуклеотидами.

Описание методов:

Опухолевые клеточные линии культивировали, как описано выше (таблица 10). Для обработки клеток среду удаляли и заменяли свежей полной средой в 24-луночных культуральных планшетах (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку), инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. На следующий день к обновленной среде добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль) и ASO SEQ ID NO: 218b в концентрациях 2,5 и 10 мкМ и инкубировали в течение 72 ч при 37°С и 5% CO₂. Обработку, включающую замену среды, повторяли 3 раза каждые 72 ч (в целом 12 суток). После этого клеточный супернатант собирали и анализировали методом MesoScale Discovery^® (MSD Discovery), что позволило исследовать несколько проангиогенных белков (VEGF, Tie-2, FLt-1, PIGF и bFGF) с использованием электрохемилюминесценции. Протокол проведения эксперимента и информацию об отдельных ростовых факторах получали из инструкций производителя (MSD MesoScale Discovery^®, #K15198G). Результаты были оценены с помощью программного обеспечения GraphPad Prism^® 6.0.

Затем клетки дважды промывали PBS и использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) для анализа того, может ли трансфекция гимнозисом ASO регулировать уровни мРНК ингибитора-1 активатора плазминогена (PAI-1) с использованием ОТ-ПЦР в режиме реального времени. Использовали протоколы и праймеры, и они перечислены, как описано выше.

19.1 Результаты для SEQ ID NO: 218b

В таблице 54 показано, что мРНК PAI-1 подвергалась понижающей регуляции дозозависимым образом в клетках нескольких тестированных раковых опухолей (A549: рак легких, HPAFII: аденокарцинома поджелудочной железы, HT-29: колоректальная аденокарцинома, HTZ-19: меланома, ™K-1: карцинома желудка, ТНР-1: моноцитарный лейкоз) после повторной трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b. Кроме того, уровни белка VEGF в супернатантах стимулированных клеток также свидетельствовали о дозозависимом снижении в A549, HTZ-19, HPAFII и PC3M (аденокарцинома предстательной железы). Для клеток HPAFII и PC3M понижающая регуляция была статистически достоверной (таблица 55). Влияние ASO SEQ ID NO: 218b на bFGF подтверждалось данными для VEGF, означая, что ASO SEQ ID NO: 218b является эффективным в подавлении ангиогенеза (таблица 56). Результаты для клеток A549 и PC3M также показали достоверное снижение уровня bFGF. Количество белка PIGF в клеточных супернатантах незначительно, но дозозависимо снижалось в клетках A549 и HTZ-19. В клетках PC3M уровень основного эндогенного PIGF был выше, чем во всех других тестированных клетках, и эффект ASO был также очевиден (таблица 57). Наконец, имела место понижающая регуляция белка Flt-1 в клетках HT-29 (таблица 58) и снижение Tie-2 в клетках HTZ-19 (ASO SEQ ID NO: 218b, 2,5 мкМ) и MCF-7 (карцинома молочной железы, 10 мкМ) (таблица 59).

Таблица 54: экспрессия мРНК PAI-1 через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549, HPAFII, HT-29, HTZ-19, ™K-1 и THP-1. ASO SEQ ID NO: 218b в зависимости от концентрации регулирует экспрессию гена PAI-1 таким образом, что прогноз заболевания улучшается. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	PAI-1 уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=3	HPAFII n=1	HT-29 n=2	HTZ-19 n=2	™K-1 n=2	THP-1 n=2
A	1,00±0,10	1,00	1,00±0,11	1,00±0,21	1,00±0,06	1,00±0,11
B 2,5 мкM	1,28±0,03	1,48	0,88±0,27	0,99±0,34	0,89±0,04	1,14±0,79
B 10 мкM	1,03±0,27	1,05	0,81±0,08	1,30±0,00	1,16±0,00	1,21±0,37
C 2,5 мкM	0,91±0,28	0,62	0,60±0,13	1,13±0,10	0,56±0,04	0,83±0,20
C 10 мкM	0,56±0,13	0,32	0,50±0,18	0,77±0,10	0,45±0,23	0,09±0,02

Таблица 55: уровни белка VEGF в клеточном супернатанте через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549, HPAFII, HTZ-19, PC3M с использованием метода MesoScale Discovery ^® (MSD Mesoscale Discovery, #K15198G). Уровни белка определяли анализом электрохемилюминесценции. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, *p<0,05 и **p<0,01 по отношению к A, +p<0,05 и ++p<0,01 по отношению к 2,5 мкМ B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	VEGF уровни белка (пг/мл) через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=1	HPAFII n=2	HTZ-19 n=2	PC3M n=2
A	8186	23266±876	4411±66	2657±103
B 2,5 мкM	8387	22278±5711	3385±57	1993±5,4
B 10 мкM	8623	20776±497	4044±21	813±0,8
C 2,5 мкM	8846	15479**++±512	3444±197	1266*+±20,5
C 10 мкM	6842	11214**±898	2882±90	442**±14,3

Таблица 56: уровни белка bFGF в клеточном супернатанте через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549 и PC3M с использованием метода MesoScale Discovery ^® (MSD Mesoscale Discovery, #K15198G). Уровни белка определяли анализом электрохемилюминесценции. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, *p<0,05 и **p<0,01 по отношению к A, +p<0,05 и ++p<0,01 по отношению к 2,5 мкМ B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	bFGF уровни белка (пг/мл) через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	PC3M n=2
A	50,7±2,9	21,2±0,2
B 2,5 мкM	54,4±3,1	16,8±0,1
B 10 мкM	51,8±2,7	14,7±0,2
C 2,5 мкM	26,7**++±2,1	11,3**+±0,0
C 10 мкM	24,2±3,4	7,6**++±0,0

Таблица 57: уровни белка PIGF в клеточном супернатанте через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549, HTZ-19 и PC3M с использованием метода MesoScale Discovery ^® (MSD Mesoscale Discovery, #K15198G). Уровни белка определяли анализом электрохемилюминесценции. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	PIGF уровни белка (пг/мл) через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	HTZ-19 n=1	PC3M n=2
A	9,9±0,4	11,6	61,7±2,1
B 2,5 мкM	9,6±0,2	8,1	54,1±1,9
B 10 мкM	8,6±0,1	8,4	59,5±3,2
C 2,5 мкM	8,2±0,8	8,2	69,4±2,4
C 10 мкM	6,3**±0,9	6,5	45,0±3,5

Таблица 58: уровни белка Flt-1 в клеточном супернатанте через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках HTZ-19 с использованием метода MesoScale Discovery ^® (MSD Mesoscale Discovery, #K15198G). Уровни белка определяли анализом электрохемилюминесценции. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	Flt-1 уровни белка (пг/мл) через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	HT-29 n=1
A	33,9
B 2,5 мкM	27,7
B 10 мкM	27,7
C 2,5 мкM	18,2
C 10 мкM	18,7

Таблица 59: уровни белка Tie-1 в клеточном супернатанте через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках HTZ-19 и MCF-7 с использованием метода MesoScale Discovery ^® (MSD Mesoscale Discovery, #K15198G). Уровни белка определяли анализом электрохемилюминесценции. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	Tie-2 уровни белка (пг/мл) через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	HTZ-19 n=1	MCF-7 n=1
A	13,5	98,1
B 2,5 мкM	6,2
B 10 мкM		149,2
C 2,5 мкM	3,2
C 10 мкM		76,9

Заключение:

Все анализированные проангиогенные факторы (VEGF, bFGF, PIGF, Flt-1 и Tie-2) могут регулироваться по действием ASO SEQ ID NO: 218b таким образом, что это обеспечивает подавление прогрессирования опухоли и других патологических механизмов, зависящих от усиленного ангиогенеза. Кроме того, уровень мРНК PAI-1 дозозависимо снижался под действием ASO SEQ ID NO: 218b. Данный фактор, являющийся геном-мишенью для TGF-β и, например, представляет признанный прогностический маркер при раке молочной железы, также подвергался дозозависимой понижающей регуляции.

В совокупности, все тестированные ASO по изобретению были эффективны в подавлении ангиогенных процессов, которые способствуют прогрессированию опухолей, метастазированию, воспалению и тромбозу. Таким образом, ASO по изобретению, нацеленные на TGF-R_II, являются эффективным кандидатом для применения в качестве терапевтического средства при различных типах заболеваний, связанных с раком и тромбозом.

Пример 20: Анализ влияния ASO по изобретению на фиброз

TGF-β участвует во многих процессах, таких как пролиферация, миграция клеток, заживление ран, ангиогенез и межклеточные взаимодействия. По результатам нескольких исследований известно, что этот фактор часто повышается во время патогенеза при некоторых заболеваниях, в том числе первичной открытоугольной глаукоме, болезни Альцгеймера, фиброзе легких и диабетической нефропатии. Эти заболевания связаны с патологическими изменениями внеклеточного матрикса (ECM) и актинового цитоскелета. Часто такие наблюдаемые изменения коррелируют с прогрессированием тяжести заболевания и резистентностью к лечению (эпителиально-мезенхимальный переход-EMT-в опухолях). Фактор роста соединительной ткани (CTGF) является медиатором ниже TGF-β и опосредует фибротические эффекты TGF-β. Так, показано, что CTGF опосредует отложение ECM и модулирует реорганизацию актинового цитоскелета. Для исследования того, насколько ASO по изобретению вносят свой вклад в разрешение фибротических процессов посредством ингибирования сигнального пути TGF-β, оценивали уровни CTGF в дополнение к фибронектину (FN) и коллагену IV (ColIV), которые представляют собой два основных компонента ECM в нескольких различных типах раковых клеток. Кроме того, было исследовано влияние ASO на CTGF, FN и актиновый цитоскелет в клетках-предшественниках нейронов (ReNcell CX^®) и клетках рака легких человека (A549).

20.1. Фиброз при нейродегенерации

Описание методов:

Клетки культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе. Для обработки клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку), 6-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.3920.300) (80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для исследования ответной реакции клеток ReNcell CX^® на TGF-β1 их обрабатывали после обновления среды TGF-β1 (2 и 10 нг/мл, PromoCell #C63499) в течение 48 ч с последующим анализом мРНК для CTGF. Для выяснения влияния ASO на CTGF и FN в клетках ReNcell CX^® среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл на 6-луночный планшет и 0,5 мл на 8-луночный планшет). Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремблированный контроль), ASO SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с в концентрациях 2,5 и 10 мкМ и через 96 ч проводили соответствующий анализ (ОТ-ПЦР в режиме реального времени, вестерн-блоттинг и иммуноцитохимию). Для оценки влияния ASO после исследования эффекта предварительной инкубации с TGF-β1 среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл для 6-луночных планшетов и 8-луночных слайд-планшетов для культивирования клеток). После экспозиции TGF-β1 (10 нг/мл, 48 ч) среду заменяли, добавляли TGF-β1 (10 нг/мл), стандартный олигонуклеотид 1 (10 мкM), ASO с SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) и ASO с SEQ ID NO: 218c (10 мкМ) в комбинации и в виде самостоятельной обработки клеток. Затем клетки ReNcell CX^® собирали через 96 ч после трансфекции гимнозисом. Соответственно, клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) и выделения белка (6-луночные планшеты) или иммуноцитохимического анализа клеток (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток). Использовали протоколы, антитела, разведения и праймеры, как описано выше.

20.1.1. Результаты оценки эффектов TGF-β1 на клетки-предшественники нейронов (ReNcell CX^®)

Данные о реакции клеток ReNcell CX^® на TGF-β1 отсутствуют. Следовательно, для выяснения этого вопроса клетки ReNcell CX^® обрабатывали в течение 48 ч TGF-β1 в двух разных концентрациях (таблица 60). Оценка ОТ-ПЦР в режиме реального времени выявила дозозависимую индукцию экспрессии генов CTGF и TGF-β1.

Таблица 60: экспрессия мРНК CTGF и TGF-β1 через 48 ч после стимуляции TGF-β1. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, E=TGF-β1. ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК после 48 ч обработки TGF-β1
Мишень Временная точка	CTGF 48 ч n=3	TGF-β1 48 ч n=3
A	1,00±0,43	1,00±0,10
E 2 нг/мл	1,73±0,92	1,34±0,45
E 10 нг/мл	2,15±1,14	1,85±0,65

Заключение:

Клетки ReNcell CX^® проявляли ответную реакцию на воздействие TGF-β1, представляющую самоиндукцию TGF-β1, и повышение экспрессии гена-мишени CTGF для TGF-β1. В совокупности, клетки ReNcell CX^® идеально подходят для изучения вопросов, касающихся эффектов TGF-β.

20.1.2 Результаты для SEQ ID NO: 218b

20.1.2.1. Эффекты трансфекции гимнозисом

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b приводит к дозозависимому и статистически достоверному снижению CTGF и FN (таблица 61). Данный эффект ASO SEQ ID NO: 218b подтверждали для уровня белка FN. Уровень белка FN снижался примерно на 70% через 96 ч после трансфекции гимнозисом тестированного ASO, в то время как обработка клеток ReNcell CX^® TGF-β1 приводила к 3,4-кратной индукции FN (таблица 62).

Таблица 61: дозозависимая и достоверная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках ReNcell CX ^®. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	CTGF 96 ч, n=3	FN 96 ч, n=3
A	1,00±0,04	1,00±0,00
B 2,5 мкM	0,97±0,06	0,81±0,14
B 10 мкM	0,86±0,17	0,67±0,07
C 2,5 мкM	0,66**±0,02	0,59±0,02
C 10 мкM	0,52**±0,02	0,39*±0,03

Таблица 62: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга фибронектина. Установлена понижающая регуляция белка FN через 96 ч после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках ReNcell CX^®. Уровень белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b.


Клеточная линия	ReNcell CX® уровни белка после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	FN 96 ч, n=1
A	1,00
B 2,5 мкM	1,06
B 10 мкM	0,60
C 2,5 мкM	0,46
C 10 мкM	0,30
E 10 нг/мл	3,43

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218b был эффективным в понижающей регуляции уровней мРНК CTGF и FN в клетках-предшественниках нейронов человека. Обработка ASO SEQ ID NO: 218b приводила к снижению уровня белка FN через 96 ч после трансфекции гимнозисом. Таким образом, TGF-R_II^- специфический ASO опосредует блокирование TGF-β-индуцированных фибротических эффектов в клетках ReNcell CX^®.

20.1.2.2. Эффекты трансфекции гимнозисом после предварительной инкубации с TGF-β

Для анализа того, насколько ASO SEQ ID NO: 218b также способен подавлять фибротические эффекты, опосредуемые TGF-β при патологических состояниях, клетки ReNcell CX^® предварительно инкубировали с TGF-β с последующей трансфекцией гимнозисом в течение 96 ч. Установленные затем уровни мРНК CTGF и FN указывают на выраженное антифибротическое действие ASO SEQ ID NO: 218b также после индукции под действием TGF-β экспрессии гена CTGF и FN (таблица 63). Иммуноцитохимическое окрашивание на CTGF (фиг. 25A) и FN (фиг. 25B) подтвердило данные анализа мРНК. Кроме того, окрашивание фаллоидином для анализа актинового цитоскелета показало индукцию стрессовых волокон после обработки TGF-β, в то время как ASO SEQ ID NO: 218b был эффективен в блокировании индукции стрессовых волокна, опосредуемой TGF-β (фиг. 25С).

Таблица 63: понижающая регуляция мРНК CTGF и FN после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках ReNcell CX^® (по сравнению со скремблированным контролем). Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β,±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК через 48 ч TGF-β1 → 96 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Мишень Временная точка	CTGF 96 ч, n=3	FN 96 ч, n=3
A	1,00±0,04	1,00±0,10
B 10 мкM	0,85±0,01	0,78±0,20
C 10 мкM	0,70*±0,25	0,44±0,04
E 10 нг/мл	1,60**±0,15	2,25±0,31
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,71**±0,03	4,08*++±0,90
E 10 нг/мл+C 10 мкM	1,19++±0,04	1,74++±0,61

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218b демонстрировал выраженные антифибротические эффекты при индуцированных патологических состояниях (предварительной инкубацией с TGF-β1). Помимо понижающей регуляции FN, который является одним из основных компонентов ECM, актиновый цитоскелет также подвергался воздействию ASO по изобретению таким образом, что последний может быть полезен для лучшего исхода при фиброзных болезнях.

20.1.3 Результаты для SEQ ID NO: 218c

20.1.3.1. Эффекты трансфекции гимнозисом

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c приводит к выраженному и достоверному снижению мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом 10 мкМ ASO SEQ ID NO: 218с (таблица 64).

Таблица 64: понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218c в клетках ReNcell CX ^® . Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени, и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218с. ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	ReNcell CX^® уровни мРНК после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	CTGF 96 ч, n=3
A	1,00±0,10
B 2,5 мкM	0,88±0,08
B 10 мкM	0,89±0,07
D 2,5 мкM	0,48±0,08
D 10 мкM	0,17*±0,02

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218c был эффективным в дозозависимом снижении уровня мРНК CTGF.

20.1.3.2. Эффекты трансфекции гимнозисом после предварительной инкубации с TGF-β

Результаты по трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c после предварительной инкубации с TGF-β1 подтверждались эффективным блокированием индуцированных TGF-β1 эффектов на уровень мРНК CTGF (таблица 65). ASO был эффективным в блокировании влияния TGF-β1 на CTGF так, что комбинированная обработка была сравнима с обрабаботкой одним ASO SEQ ID NO: 218c.

Таблица 65: уровень мРНК CTGF после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218c и параллельной обработкой TGF-β1 в клетках ReNcell CX^®. Данные подтвердили эффективное блокирование индуцированных TGF-β1 эффектов на уровень мРНК CTRF под действием ASO SEQ ID NO:218c по сравнению с комбинированными обработками. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218c, E=TGF-β1. ±=SEM, *p<0,05 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Мишень Временная точка	ReNcell CX^® уровни мРНК через 48 ч TGF-β1 → 96 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	CTGF n=3
A	1,00±0,03
B 10 мкM	0,85±0,01
D 10 мкM	0,17*±0,02
E 10 нг/мл	1,39±0,08
E 10 нг/мл+B 10 мкM	1,25±0,44
E 10 нг/мл+D 10 мкM	0,23*±0,02

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218c вызывал выраженную понижающую регуляцию мРНК и белка CTGF даже при искусственных патологических состояниях (предварительной инкубацией с TGF-β1).

В совокупности, помимо сильных антифибротических эффектов, TGF-R_II-специфические ASO вызывали модуляцию актинового цитоскелета. Индукция стрессовых волокон может вызывать повышение ригидности и неподвижности клеток, что может играть роль, например, при болезни Альцгеймера и других нейродегенеративных заболеваниях. Отложение ECM также может опосредовать быстрые патологические изменения, например, при первичной открытоугольной глаукоме. Таким образом, уменьшение отложения ECM и подавление формирования стрессовых волокон может быть полезным для улучшения прогноза при неврологических заболеваниях, связанных с фиброзом. Таким образом, TGF-R_II-специфические ASO являются эффективными терапевтическими агентами для лечения, например, болезни Альцгеймера и первичной открытоугольной глаукомы.

20.2. Фиброз легких

Описание методов:

Для определения влияния ASO на ECM и актиновый цитоскелет в легких, исследовали клетки рака легких человека (A549) и культивировали, как описано ранее. Для обработки клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (50000 клеток/лунку), 6-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.3920.300) (80000 клеток/лунку) и 8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток (Sarstedt #94.6140.802) (10000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°C и 5% CO₂. Для исследования ответной реакции клеток A549 на TGF-β1 после обновления среды их обрабатывали TGF-β1 (2 и 10 нг/мл, PromoCell #C63499) в течение 48 ч с последующим анализом мРНК CTGF. Для оценки влияния ASO на CTGF и FN в клетках A549 среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл для 6-луночных и 0,5 мл для 8-луночных планшетов). Затем в среду добавляли стандартный олигонуклеотид 1 (скремлированный контроль), ASO SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с в концентрациях 2,5 и 10 мкМ и проводили соответствующий анализ (ОТ-ПЦР в режиме реального времени, вестерн-блоттинг и иммуноцитохимию) через 72 ч в клетках ReNcell CX^®. Для того, чтобы показать возможное действие ASO после предварительной инкубации с TGF-β1, среду удаляли и заменяли свежей полной средой (1 мл для 6-луночных планшетов и 8-луночных слайд-планшетов для культивирования клеток). После экспозиции TGF-β1 (10 нг/мл, 48 ч) среду заменяли, добавляли TGF-β1 (10 нг/мл), стандартный олигонуклеотид 1 (10 мкM), ASO SEQ ID NO: 218b (10 мкМ) и ASO SEQ ID NO: 218c (10 мкМ) в комбинации и в виде самостоятельной обработки клеток. Затем клетки A549 собирали через 72 ч после трансфекции гимнозисом. Соответственно, клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) и белка (6-луночные планшеты) или иммуноцитохимического анализа клеток (8-луночные слайд-планшеты для культивирования клеток). Протоколы, использованные антитела, разведения и праймеры были такими, как описано выше.

20.2.1. Результаты оценки эффектов TGF-β1 на клетки рака легких (A549)

Для исследования способности клеток A549 реагировать на экспозицию TGF-β1, их обрабатывали в течение 48 ч TGF-β1 в двух разных концентрациях (таблица 66). Оценка ОТ-ПЦР в режиме реального времени показала, что CTGF и TGF-β1 вызывают дозозависимую индукцию генной экспрессии.

Таблица 66: индуцированная экспрессия мРНК CTGF и TGF-β1 через 48 ч после стимуляции TGF-β1 в клетках A549. Уровни экспрессии мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, E=TGF-β1. ±=SEM, *p <0,05 и **p <0,01 по отношению к A, ++p <0,05 по отношению к 2 нг/мл E. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Клеточная линия	A549 уровни мРНК после 48 ч обработки TGF-β1
Мишень Временная точка	CTGF 48 ч, n=3	TGF-β1 48 ч, n=3
A	1,00±0,23	1,00±0,31
E 2 нг/мл	2,44*±0,18	1,60±0,34
E 10 нг/мл	11,35**++±0,52	2,37±0,36

Заключение

Клетки A549 показали дозозависимую и достоверную повышающую регуляцию мРНК CTGF после экспозиции TGF-β1. Кроме того, наблюдали самоиндукцию TGF-β1. В совокупности, клетки A549 являются хорошей моделью для исследования вопросов, касающихся TGF-эффектов в легких и при раке легких.

20.2.2 Результаты для SEQ ID NO: 218b

20.2.2.1 Результаты оценки эффектов трансфекции гимнозисом

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b вызывает дозозависимое и высокодостоверное снижение экспрессии гена CTGF (таблица 67). Тестированный ASO также оказывал влияние на уровень мРНК FN, но не в зависимости от концентрации. В противоположность, окрашивание на FN выявило дозозависимое снижение уровня FN по сравнению со скремблированным контролем (фиг. 260A). Кроме того, исследовали влияние ASO и TGF-β на актиновый цитоскелет. На фиг. 26B показана индукция актиновых волокон, включая образование стрессовых волокон, после обработки TGF-β1 в клетках A549 в зависимости от концентрации, в то время, как сигнал после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549 был достоверно снижен параллельно с установленной отменой TGF-β1-опосредованных эффектов. В отношение анализа белков, то была показана специфическая понижающая регуляция CTGF параллельно с торможением pErk1/2, посредством которого опосредуются фибротические эффекты CTGF (таблица 68). Кроме того, через 72 ч после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b было отмечено снижение уровней обоих основных компонентов ЕСМ: CollV и FN (таблица 68).

Таблица 67: дозазависимая и достоверная понижающая регуляция мРНК CTGF после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549 уровни мРНК после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч, n=3	FN 72 ч, n=3
A	1,00±0,08	1,00±0,07
B 2,5 мкM	0,87±0,06	1,08±0,02
B 10 мкM	0,80±0,03	0,87±0,08
C 2,5 мкM	0,60**±0,04	0,77±0,17
C 10 мкM	0,39**±0,03	0,74±0,16

Таблица 68: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга CTGF, FN, CollV и pErk11/2. Анализ проводили через 72 ч после трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b в клетках A549. Уровень белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b.


Клеточная линия	A549 уровни белка после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч n=1	FN 72 ч n=1	CollV 72 ч n=1	pErk1/2 72 ч n=2
A	1,00	1,00	1,00	1,00±0,00
B 2,5 мкM	0,91	0,89	1,19	1,00±0,14
B 10 мкM	1,31	0,76	0,87	0,98±0,02
C 2,5 мкM	0,05	0,81	1,16	0,67±0,26
C 10 мкM	0,09	0,46	0,65	0,61±0,13

Заключение:

Трансфекция гимнозисом SEQ ID NO: 218b была эффективной в отношении модулирующих факторов, которые участвуют в отложении ECM и реорганизации актинового цитоскелета в клетках легких человека.

20.2.2.2. Результаты оценки эффектов трансфекции гимнозисом после предварительной инкубации с TGF-β1

Результаты трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218b после предварительной инкубации с TGF-β1 подтверждали эффективное блокирование сильных индуцированных TGF-β1 эффектов на уровни мРНК CTGF и FN (таблица 69). Иммуноцитохимическое окрашивание на CTGF (фиг. 27A) и FN (фиг. 27B) подтвердило обнаружение эффектов на мРНК также на уровне белка.

Таблица 69: уровень мРНК CTGF и FN после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218b и параллельной обработкой с TGF-β1 в клетках A549. Данные подтвердили эффективное блокирование индуцированных TGF-β1 эффектов на уровни мРНК CTGF и FN под действием ASO SEQ ID NO: 218b по сравнению с комбинированными обработками. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, E=TGF-β1. ±=SEM, *p<0,05, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Мишень Временная точка	A549 уровни мРНК через 48 ч TGF-β1 → 72 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	CTGF n=5	FN n=3
A	1,00±0,22	1,00±0,45
B 10 мкM	0,89±0,19	1,02±0,37
C 10 мкM	0,52±0,05	0,35±0,06
E 10 нг/мл	6,92*±2,32	2,92±1,02
E 10 нг/мл+B 10 мкM	8,79**±2,72	2,90±0,56
E 10 нг/мл+C 10 мкM	2,53±0,59	1,18±0,28

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218b был эффективным в опосредовании антифибротических эффектов в клетках A549 при искусственных патологических состояниях, имитированных избыточными концентрациями TGF-β1.

20.2.3 Результаты для SEQ ID NO: 218c

20.2.3.1 Результаты оценки эффектов трансфекции гимнозисом

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c опосредует выраженное дозозависимое и достоверное снижение мРНК CTGF через 72 ч после трансфекции гимнозисом клеток A549 (таблица 70).

Таблица 70: понижающая регуляция мРНК CTGF через 72 ч после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218c клеток A549. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218с. ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Даннета.


Клеточная линия	A549 уровни мРНК после трансфекции гимнозисом
Мишень Временная точка	CTGF 72 ч n=4
A	1,00±0,08
B 2,5 мкM	0,97±0,07
B 10 мкM	0,85±0,06
D 2,5 мкM	0,49**±0,05
D 10 мкM	0,31**±0,03

Заключение:

Трансфекция гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c была эффективной в снижении уровня мРНК медиатора CTGF даунстрим TGF-β.

20.2.2.2. Результаты оценки эффектов трансфекции гимнозисом после предварительной инкубации с TGF-β

Результаты оценки трансфекции гимнозисом ASO SEQ ID NO: 218c после предварительной инкубации с TGF-β1 подтвердили эффективное блокирование сильных индуцированных TGF-β1 эффектов на уровни мРНК CTRF (таблица 71). Иммуноцитохимическое окрашивание на CTGF подтвердило эти данные на уровне белка (фиг. 28).

Таблица 71: уровни мРНК CTGF после предварительной инкубации с TGF-β1 с последующей трансфекцией гимнозисом SEQ ID NO: 218c и параллельной обработкой TGF-β1 в клетках A549. Данные подтвердили эффективное блокирование индуцированных TGF-β1 эффектов на уровни мРНК CTRF под действием ASO SEQ ID NO: 218c по сравнению с комбинированными обработками. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, D=SEQ ID NO: 218c, E=TGF-β1. ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A, ++p<0,01 по отношению к E+B. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень Временная точка	A549 48 ч TGF-β1 → 72 ч TGF-β1+ASO/обработка одним ASO
Клеточная линия	CTGF n=3
A	1,00±0,05
B 10 мкM	0,86±0,11
D 10 мкM	0,53±0,10
E 10 нг/мл	4,71±1,76
E 10 нг/мл+B 10 мкM	5,89*±2,16
E 10 нг/мл+D 10 мкM	0,86++±0,06

Заключение:

ASO SEQ ID NO: 218c был эффективным в опосредовании антифибротических эффектов в клетках A549 при искусственных патологических состояниях, имитированных избыточными концентрациями TGF-β1. В совокупности, ASO SEQ ID NO: 218c является эффективным терапевтическим агентом, поскольку патология фиброза легких может замедляться посредством снижения уровней CTGF, FN и CollV. Кроме того, образование стрессовых волокон может эффективно снижаться под действием TGF-R_II-специфических ASO, что делает ASO по изобретению идеальными терапевтическими агентами.

20.3. Влияние на несколько типов раковых клеток

Описание методов:

Для исследования эффектов ASO, направленных против ECM (CTGF, FN, CollV), клетки использовали и культивировали, как описано ранее в стандартном протоколе (таблица 10). Для обработки клетки высевали в 24-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.1836.300) (30000 клеток/лунку), 6-луночные культуральные планшеты (Sarstedt #83.3920.300) (50000 клеток/лунку) и инкубировали в течение ночи при 37°С и 5% СО₂. Для анализа экспрессии и оценки влияния на уровни мРНК и белка CTGF, FN и CollV клетки обрабатывали стандартным олигонуклеотидом 1 (скремлированный контроль) или ASO SEQ ID NO: 218b в концентрациях 2,5 и 10 мкМ и инкубировали в течение 72 ч при 37°С и 5% СО₂. Обработку, включая замену среды, повторяли 3 раза каждые 72 ч (в целом 12 суток). Для сбора клетки дважды промывали PBS и затем использовали для выделения РНК (24-луночные планшеты) или выделения белка (6-луночные планшеты). Протоколы выделения РНК и белка, а также использованные антитела и разведения аналогичны описанным выше.

20.3.1 Результаты для SEQ ID NO: 218b

Антифибротические эффекты оценивали анализом уровней мРНК и белка CTGF, FN, CollV. Уровень мРНК CTGF (таблица 72) дозозависимо снижался под действием SEQ ID NO: 218b в клетках HT-29, HTZ-19, MCF-7 и THP-1. Для клеток KG-1 была установлена понижающая регуляция медиатора ниже TGF-β под действием ASO SEQ ID NO: 218b в концентрации 2,5 мкМ. Для клеток A549, Panc-1 и CaCo2 было показано снижение FN (таблица 73), согласуясь с дозозависимым снижением мРНК CollV (таблица 74) в клетках THP-1, HTZ-19 и L3.6pl (таблица 65). Анализ вестерн-блоттингом выявил значительное снижение уровня белка CTGF в клетках HT-29, MCF-7, ™K-1 и L3.6pl. Результат для MCF-7 был статистически значимым (таблица 75). Кроме того, фосфорилирование Erk1/2 в клетках A549 и ™K-1 ингибировалось ASO SEQ ID NO: 218b. PErk1/2 обычно активируется под действием CTGF с индукцией фибротических эффектов, опосредованных TGF-β (таблица 76). Уровни белков FN (A549, MCF-7, HT-29, HTZ-19, HPAFII) и CollV (A549, HTZ-19, HPAFII, PC3M) (таблицы 77 и 78), двух основных компонентов ECM, резко снижались примерно на 50%.

Таблица 72: экспрессия мРНК CTGF через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках HT-29, HTZ-19, KG1, MCF-7 и THP-1. Уровень мРНК CTGF был снижен после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b во всех тестируемых клеточных линиях. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	CTGF уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	HT-29 n=2	HTZ-19 n=1	KG-1 n=1	MCF-7 n=1	THP-1 n=2
A	1,00±0,28	1,00	1,00	1,00	1,00±0,28
B 2,5 мкM	0,68±0,11	1,30		0,93	0,99±0,68
B 10 мкM	0,65±0,03	1,20	0,88	0,91	1,15±0,34
C 2,5 мкM	0,40±0,20	0,64		0,24	0,98±0,11
C 10 мкM	0,33±0,19	0,55	0,26	0,22	0,09±0,03

Таблица 73: экспрессия мРНК CTGF через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549, Panc-1 и CaCo2-1. Уровень мРНК FN был снижен после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b во всех тестированных клеточных линиях. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM, **p<0,01 по отношению к A. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	FN уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	Panc-1 n=1	CaCo2 n=2
A	1,00±0,39	1,00	1,00±0,30
B 2,5 мкM	0,83±0,08	1,29	0,55±0,13
B 10 мкM			1,00±0,76
C 2,5 мкM	0,35±0,20	0,15	0,73±0,54
C 10 мкM			0,18±0,17

Таблица 74: экспрессия мРНК CollV через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b в клетках A549, HTZ-19, THP-1, L3.6pl, Panc-1 и CaCo2. Уровень мРНК CollV был снижен после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b во всех тестированных клеточных линиях. Уровни мРНК определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» GNB2L1 с использованием количественной ОТ-ПЦР в режиме реального времени и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b, ±=SEM. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	CollV уровни мРНК через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=2	THP-1 n=2	HTZ-19 n=1	L3.6pl n=2	Panc-1 n=1	CaCo2 n=2
A	1,00±0,00	1,00±0,22	1,00	1,00±0,20	1,00	1,00±0,71
B 2,5 мкM	1,18±0,31	0,71±0,25	0,94	0,83±0,09	0,98	1,37±0,19
B 10 мкM	1,11±0,60	0,61±0,03		0,91±0,29	0,57	2,61±0,01
C 2,5 мкM	0,84±0,02	0,65±0,19	0,51	1,14±0,13	0,59	1,30±0,03
C 10 мкM	0,75±0,02	0,30±0,13		0,69±0,05	0,30	0,57±0,14

Таблица 75: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга в клетках HT-29, MCF-7, L3.6pl и ™K-1 через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b. Установлена понижающая регуляция белка CTGF под действием ASO SEQ ID NO: 218b. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	CTGF уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4× 72 ч)
Клеточная линия	HT-29 n=1	MCF-7 n=2	™K-1 n=1	L3.6pl n=1
A	1,00	1,00±0,0	1,00	1,00
B 10 мкM	1,19	1,12±0,11	0,85	0,93
C 10 мкM	0,50	0,22**++±0,03	0,38	0,22

Таблица 76: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга в клетках A549 и ™K-1 через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b. Установлена понижающая регуляция белка pErk1/2 под действием ASO SEQ ID NO: 218b. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечния Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	pErk1/2 уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=1	™K-1 n=1
A	1,00	1,00
B 10 мкM	1,21	1,14
C 10 мкM	0,58	0,76

Таблица 77: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга в клетках A549, MCF-7, HT-29, HTZ-19 и HPAFII через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b. Установлена понижающая регуляция белка FN под действием ASO SEQ ID NO: 218b. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	FN уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=1	MCF-7 n=2	HT-29 n=1	HTZ-19 n=1	HPAFII n=1
A	1,00	1,00±0,22	1,00	1,00	1,00
B 10 мкM	1,10	1,08±0,25	0,81	1,20	1,12
C 10 мкM	0,56	0,69±0,18	0,40	0,83	0,56

Таблица 78: денситометрический анализ после вестерн-блоттинга в клетках A549, MCF-7, HT-29, HTZ-19 и HPAFII через 12 суток после трансфекции гимнозисом SEQ ID NO: 218b. Установлена понижающая регуляция белка CollV под действием ASO SEQ ID NO: 218b. Уровни белка определяли по отношению к гену «домашнего хозяйства» альфа-тубулина с использованием программного обеспечения Image Studio™ Lite и затем нормализовали к необработанному контролю. A=необработанный контроль, B=стандартный олигонуклеотид 1, C=SEQ ID NO: 218b. Статистический анализ проводили с использованием обычного однофакторного дисперсионного анализа ANOVA с последующими апостериорными сравнениями по методу Тьюки.


Мишень	CollV уровни белка через 12 суток после повторной трансфекции гимнозисом (4×72 ч)
Клеточная линия	A549 n=1	HTZ-19 n=1	HPAFII n=1	PC3M n=1
A	1,00	1,00	1,00	1,00
B 10 мкM	1,31	1,01	1,05	1,07
C 10 мкM	0,61	0,36	0,76	0,43

Заключение:

Повышенное отложение ECM, опосредуемое TGF-β1, через даунстрим медиатор CTGF, может быть эффективно отменено TGF-R_II-специфическими ASO по изобретению в различных линиях опухолевых клеток. Пониженный уровень компонентов ЕСМ может способствовать менее агрессивному течению прогрессирования опухолей. В совокупности, испытуемые ASO могут демонстрировать новую терапевтическую стратегию при различных заболеваниях, связанных с фиброзом.

Пример 21: порог токсичности ASO по изобретению при длительном интрацеребровентрикулярном введении с использованием схемы с возрастающими дозами на обезьянах рода Cynomolgus

Для определения идеального диапазона доз для исследования токсичности по GLP был проведен предварительный опыт с использованием длительного интрацеребровентрикулярного (icv) введения антисмыслового олигонуклеотида(ASO) в возрастающих дозах на обезьянах рода Cynomolgus. Во время схемы введения животным проводили наблюдение за изменениями иммунологических, гематологических и физиологических показателей.

Описание метода:

Для длительной центральной инфузии ASO самцам и самкам обезьян рода Cynomolgus имплантировали подкожно газовый насос давления (0,25 мл/24 ч, Tricumed-IP 2000V^®), присоединенный к силиконовому катетеру, направленному на правый боковой желудочек, под анестезией кетамином/ксилацином в полустерильных условиях. Для каждого вида обработки использовали одного самца и одну самку обезьян (SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218c, концентрации приведены в таблице 79). Каждый насос имплантировали подкожно со стороны брюшной области через разрез кожи длиной 10 см на шее обезьяны и соединяли с icv канюлей с помощью силиконового катетера. Животных помещали в стереотаксическую рамку и icv канюлю погружали в правый боковой желудочек. Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^®-Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций обезьян обрабатывали местно препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубки и соответствующий насос заполняли соответствующим раствором для обработки. Периоды инфузии ASO (1 неделя для каждой дозы) прерывались однонедельным периодом вымывания с введением исключительно 0,9% NaCl. В течение всей схемы введения наблюдали за динамикой прироста массы тела и приемом корма. Кроме того, один раз в неделю отбирали образцы крови и СМЖ для определения гематологических, а также иммунологических изменений, и также концентрации ASO в крови. В последний день опыта животных подвергали эвтаназии и извлекали органы (печень, почки, головной мозг) и анализировали на пролиферацию, апоптоз, нокдаун мРНК и образование опухолей.

Таблица 79: дизайн эксперимента и дозы ASO, вводимые в течение 7-недельной схемы введения
Условия обработки	Неделя 1	Неделя 2	Неделя 3	Неделя 4	Неделя 5	Неделя 6	Неделя 7
SEQ ID NO: 218b	0,048 мМ	0,9% NaCl	0,24 мМ	0,9% NaCl	1,2 мМ	0,9% NaCl	6 мМ
SEQ ID NO: 218c	0,048 мМ	0,9% NaCl	0,24 мМ	0,9% NaCl	1,2 мМ	0,9% NaCl	6 мМ

Заключение:

Все тестированные ASO по изобретению были, по меньшей мере, нетоксичны в течение недель 1-6, и поэтому их использовали для проведения дальнейших исследований и токсикологических опытов. Однако инфузия антисмысловых олигонуклеотидов SEQ ID NO: 214, SEQ ID NO: 138b, SEQ ID NO: 172b, а также стандартного олигонуклеотида 0 и стандартного олигонуклеотида 5 приводила к проявлению токсических эффектов на ранних стадиях вышеуказанной схемы. Следовательно, данные антисмысловые олигонуклеотиды были признаны, как непригодные в качестве терапевтических агентов, и их не использовали для дальнейших исследований.

Пример 22: определение поведенческих и физиологических нарушений после центрального введения антисмыслового олигонуклеотида

Целью данного опыта было исследование эффектов однократного интрацеребровентрикулярного (icv) введения антисмыслового олигонуклеотида на неврологические и поведенческие показатели у крыс.

Описание метода:

Стереотаксические процедуры проводили под анестезией кетамином/ксилацином в полустерильных условиях. После хирургической операции крысам давали два дня для восстановления.

icv имплантация направляющей канюли

Животных помещали в стереотаксическую рамку и направляющую канюлю (12 мм) имплантировали на 2 мм выше левого бокового желудочка (координаты относительно брегмы: 1,0 мм сзади, 1,6 мм латеральнее к средней линии, 1,8 мм ниже поверхности черепа). Направляющую канюлю закрепляли двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного акрилового цемента (Kallocryl, Speiko^® -Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия) и закрывали ложной канюлей. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для пофилактики послеоперационных инфекций крыс обрабатывали местно препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 0,1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия).

icv инфузия

Легко зафиксированным крысам проводили icv инфузию ASO (2 мкМ/5 мкл, 10 мкМ/5 мкл, 50 мкмоль/5 мкл, 250 мкмоль/5 мкл) или растворителя (5 мкл, 0,9% NaCl, pH 7,4, Braun), используя канюлю размером 27 G, которую вытягивали на 2 мм за направляющей канюлей и оставляли на месте в течение 30 с для обеспечения диффузии. За крысами проводили наблюдение через 15, 30, 60 и 120 мин после icv введения для оценки поведенческих реакций, двигательной активности, возбуждения ЦНС, положения, координации движений, мышечного тонуса, рефлексов и температуры тела.

Подтверждение размещения канюли и микродиализного зонда

После эвтаназии извлекали головной мозг, быстро замораживали и хранили при -80°С до анализа. Гистологическое подтверждение мест icv имплантации проводили на срезах мозга толщиной 40 мкм, окрашенных крезил-фиолетовым.

Настоящие результаты показали, что однократное icv введение ASO (обеих последовательностей SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218c) в различных дозах было безопасным и надежным методом для крыс с учетом отсутствия влияния на неврологические показатели.

Пример 23: определение идеального диапазона доз для исследования токсичности на обезьянах рода Cynomolgus по GLP (предварительный опыт по оценке токсичности на крысах)

Для исследования любых общих токсических эффектов при ежедневном внутривенном (в/в) введении антисмыслового олигонуклеотида (ASO) и для определения идеального диапазона доз для предварительного исследования токсичности по GLP на крысах, проводили предварительный эксперимент по оценке токсичности на крысах.

Описание метода:

Для многократных внутривенных инъекций ASO 20 самцов и 20 самок крыс разделяли на четыре группы по видам обработки: группа с растворителем, группы ASO_{низкая доза}, ASO_{средняя доза} и ASO_{высокая доза}. Данную схему введения использовали для SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с. Крысам ежедневно вводили внутривенно болюсную инъекцию ASO в течение 15 последовательных суток. Наблюдали за падежом крыс (дважды в день), клиническими симптомами (один раз в день, приростом массы тела (еженедельно)), приемом корма (еженедельно). На 15 сутки схемы эксперимента животных подвергали эвтаназии, извлекали органы (печень, почки, головной мозг) и собирали кровь из туловища. После чего ткани и кровь анализировали на иммунологические и гематологические изменения.

Результаты настоящего исследования показали, что два ASO SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218c являются безопасными лекарственными препаратами для применения при многих различных расстройствах без проявления токсических эффектов при введении в низких и средних дозах.

Пример 24: определение общетоксических эффектов при многократных внутривенных введениях антисмысловых олигонуклеотидов

Целью данного опыта было исследование того, в какой дозе при ежедневном внутривенном (в/в) введении антисмысловой олигонуклеотид (ASO) оказывает какое-либо общетоксическое действие на крыс.

Описание метода:

Для многократных внутривенных инъекций ASO 80 самцов и 80 самок крыс разделяли на четыре группы по видам обработки: группа с растворителем, группы ASO_{низкая доза}, ASO_{средняя доза} и ASO_{высокая доза}. Крысам ежедневно вводили внутривенно болюсную инъекцию ASO в течение 29 последовательных суток. Наблюдали за падежом крыс (дважды в день), клиническими симптомами (один раз в день, приростом массы тела (еженедельно)), приемом корма (еженедельно). На 29 сутки схемы эксперимента животные подвергались эвтаназии, извлекали органы (печень, почки, головной мозг) и собирали кровь из туловища. Также отбирали костный мозг и готовили мазки. Затем ткани и кровь анализировали на иммунологические и гематологические и гистопатологические изменения.

Пример 25: определение токсических свойств антисмыслового олигонуклеотида при длительном центральном введении на обезьянах рода Cynomolgus

Для определения эффективной и установления токсической дозы самцам и самкам обезьян рода Cynomolgus вводили антисмысловой олигонуклеотид (ASO) по изобретению в различных дозах при длительном интрацеребровентрикулярном введении. Во время схемы введения наблюдали за иммунологическими, гематологическими и физиологическими изменениями у животных.

Описание метода:

Для длительной центральной инфузии ASO самцам и самкам обезьян рода Cynomolgus имплантировали подкожно газовый насос давления (0,25 мл/24 ч, Tricumed-IP 2000V^®), присоединенный к силиконовому катетеру, направленному на правый боковой желудочек, под анестезией кетамином/ксилацином в полустерильных условиях. Для каждого вида обработки использовали трех самцов и трех самок обезьян (растворитель, ASO_{низкая доза} и ASO_{высокая доза}, концентрации приведены в таблице 79). Кроме того, для определения сроков восстановления двух самцов и двух самок обезьян (растворитель и ASO_{высокая доза}) подвергали эвтаназии через четыре недели после прекращения введения ASO. Каждый насос имплантировали подкожно со стороны брюшной области через разрез кожи длиной 10 см на шее обезьяны и соединяли с icv канюлей с помощью силиконового катетера. Животных помещали в стереотаксическую рамку и icv канюлю погружали в правый боковой желудочек. Канюлю фиксировали двумя винтами из нержавеющей стали с использованием зубного цемента (Kallocryl, Speiko^®-Dr. Speier GmbH, Мюнстер, Германия). Кожу на шее закрывали швами. Во время операции температуру тела поддерживали грелкой. Для профилактики послеоперационных инфекций обезьян обрабатывали местно препаратом бетаизодона^® (Mundipharma GmbH, Лимбург, Германия) и вводили 1 мл антибиотиков (п/к, Байтрил^® 2,5% Bayer Vital GmbH, Леверкузен, Германия). Трубки заполняли соответствующим раствором для обработки. В течение всей схемы введения наблюдали за динамикой прироста массы тела и приемом корма. Кроме того, один раз в неделю отбирали образцы крови и СМЖ для определения гематологических, а также иммунологических изменений, и также концентрации ASO в крови. В последний день опыта животных подвергали эвтаназии и извлекали органы (печень, почки, головной мозг) и анализировали на пролиферацию, апоптоз, нокдаун мРНК и образование опухолей. Через 57 недель дополнительных животных, используемых для определения сроков восстановления, также подвергали эвтаназии и определяли аналогичные показатели.

Таблица 80: условия обработки и количество животных в каждой группе в 4-недельном исследовании токсичности по GLP и дополнительном 4-недельном периоде восстановления.


Условия обработки	Основной опыт	4-недельный период восстановления
самцы [n]	самки [n]	самцы [n]	самки [n]
Растворитель	3	3	2	2
ASO_низкая _доза	3	3	/	/
ASO_{высокая доза}	3	3	2	2

Результаты настоящего исследования показали, что при длительном интрацеребровентрикулярном введении ASO является нетоксичным и безопасным лекарственным препаратом, который можно использовать для лечения целого ряда различных заболеваний.

Пример 26: определение стабильности и биологической активности антисмыслового олигонуклеотида в растворах различных носителей

Для исследования того, имеются ли какие-либо эффекты взаимодействия антисмысловых олигонуклеотидов (SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218c) и инфузионного раствора, проводили 29-дневный предварительный опыт. Соответственно, два ASO восстановливали в различных, не содержащих эндотоксины растворах (PBS, вода для инъекций [WFI], 0,9% NaCl) и хранили в разных условиях соответственно. Образцы отбирали один раз в неделю и определяли значение pH, стабильность, содержание и целостность ASO анализом AEX-HPLC. Определяли любые изменения эффективности по эффективности нокдауна мРНК TGF-R_II в анализе с клеточной культурой для каждого образца соответственно.

Описание метода:

Лиофилизованные ASO разбавляли раствором соответствующего носителя (вода для инъекций, 0,9% NaCl, PBS) в стерильных условиях (ламинарный поток, BIOWIZARD Golden GL-170 Ergoscience^®, режим S1). Маркировали пробирки Эппендорфа емкостью 1,5 мл и заполняли 100 мкл (AEX-HPLC) или 250 мкл (нокдаун мишени) соответствующего раствора ASO (все стадии в ламинарном потоке, BIOWIZARD Golden GL-170 Ergoscience^®, режим S1, схему пипетирования/маркировки смотри в таблице 81). На следующей стадии все образцы выдерживали в соответствующих условиях хранения, и раз в неделю отбирали образцы (схему отбора образцов смотри в таблице 82) и хранили при -80°C до анализа.

Таблица 81: схема маркировки в исследовании стабильности в системе ASO-носитель. Схему маркировки выполняли для SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218c (в каждом случае 10 мкМ и 0,24 мМ) и для всех трех носителей WFI, 0,9% NaCl и PBS (=> 12 различных схем).


	Сутки
Маркировка	Растворитель (WFI, 0,9% NaCL или PBS)	Условия	0	6	12	18	24	29
ASO [10 мкM]	X	исходно	ASO [10 мкM] X_исходно
ASO [10 мкM]	X	-20°C		ASO [10 мкM] X_-20°C_сутки 6	ASO [10 мкM] X_-20°C_сутки 12	ASO [10 мкM] X_-20°C_сутки 18	ASO [10 мкM] X_-20°C_сутки 24	ASO [10 мкM] X_-20°C_сутки 29
ASO [10 мкM]	X	+4°C		ASO [10 мкM] X_+4°C_сутки 6	ASO [10 мкM] X_+4°C _сутки 12	ASO [10 мкM] X_+4°C _сутки 18	ASO [10 мкM] X_+4°C _сутки 24	ASO [10 мкM] X_+4°C _сутки 29
ASO [10 мкM]	X	+20°C		ASO [10 мкM] X_+20°C _сутки 6	ASO [10 мкM] X_+20°C _сутки 12	ASO [10 мкM] X_+20°C _сутки 18	ASO [10 мкM] X_+20°C _сутки 24	ASO [10 мкM] X_+20°C _сутки 29
ASO [10 мкM]	X	+37°C		ASO [10 мкM] X_+37°C_сутки 6	ASO [10 мкM] X_+37°C _сутки 12	ASO [10 мкM] X_+37°_сутки 18	ASO [10 мкM] X_+37°_сутки 24	ASO [10 мкM] X_+37°C _сутки 29
ASO [10 мкM]	X	+40°C		ASO [10 мкM] X_40°C_сутки 6	ASO [10 мкM] X_40°C _сутки 12	ASO [10 мкM] X_40°C _сутки 18	ASO [10 мкM] X_40°C _сутки 24	ASO [10 мкM] X_40°C _сутки 29
ASO [10 мкM]	X	значение pH	ASO [10 мкM] X_pH значение_сутки 0					ASO [10 мкM] X_значение pH_ сутки 29
ASO [0,24 мM]	X	исходно	ASO [0,24 мМ] X_исходно
ASO [0,24 мM]	X	-20°C		ASO [0,24 мМ] X_-20°C_сутки 6	ASO [0,24 мМ] X_-20°C_сутки 12	ASO [0,24 мМ] X_-20°C_сутки 18	ASO [0,24 мМ] X_-20°C_сутки 24	ASO [0,24 мМ] X_-20°C_сутки 29
ASO [0,24 мкM]	X	+4°C		ASO [0,24 мМ] X_+4°C_сутки 6	ASO [0,24 мМ] X_+4°C _сутки 12	ASO [0,24 мМ] X_+4°C _сутки 18	ASO [0,24 мМ] X_+4°C _сутки 24	ASO [0,24 мМ] X_+4°C _сутки 29
ASO [0,24 мM]	X	+20°C		ASO [0,24 мМ] X_+20°C _сутки 6	ASO [0,24 мМ] X_+20°C _сутки 12	ASO [0,24 мМ] X_+20°C _сутки 18	ASO [0,24 мМ] X_+20°C _сутки 24	ASO [0,24 мМ] X_+20°C _сутки 29
ASO [0,24 мM]	X	+37°C		ASO [0,24 мМ] X_+37°C_сутки 6	ASO [0,24 мМ] X_+37°C _сутки 12	ASO [0,24 мМ] X_+37°_сутки 18	ASO [0,24 мМ] X_+37°_сутки 24	ASO [0,24 мМ] X_+37°C _сутки 29
ASO [0,24 мM]	X	+40°C		ASO [0,24 мМ] X_40°C_сутки 6	ASO [0,24 мМ] X_40°C _сутки 12	ASO [0,24 мМ] X_40°C _сутки 18	ASO [0,24 мМ] X_40°C _сутки 24	ASO [0,24 мМ] X_40°C _сутки 29
ASO [0,24 мM]	X	значение pH	ASO [0,24 мМ] X_значение pH_сутки 0					ASO [0,24 мМ] X_значение pH_ сутки 29

Таблица 82: схема отбора образцов в исследовании стабильности в системе ASO-носитель. Схему отбора образцов выполняли для SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218c (в каждом случае 10 мкМ и 0,24 мМ) и для всех трех носителей WFI, 0,9% NaCl и PBS (=> 12 различных схем).


Образец	Сутки
Условия	0	6	12	18	24	29
Исходно	X
-20°C		X	X	X	X	X
+4°C		X	X	X	X	X
+20°C		X	X	X	X	X
+37°C		X	X	X	X	X
+40°C		X	X	X	X	X
значение pH	X					X

Поскольку отсутствовали какие-либо отрицательные эффекты для всех растворов носителей в отношении стабильности, содержания и целостности SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с, то 0,9% NaCl использовали для эксперимента по оценке стабильности ASO при применении.

Пример 27: определение стабильности и биологической активности при применении антисмысловых олигонуклеотидов по изобретению (ASO) в растворе наполнителя

Для исследования того, существуют ли какие-либо эффекты взаимодействия антисмысловых олигонуклеотидов (SEQ ID NO: 218b, SEQ ID NO: 218c) и газового насоса давления или катетера, проводили предварительный 29-дневный опыт. Соответственно, два ASO восстанавливали в 0,9% NaCl, и заполняли насос и катетер, следуя описанию производителя. Образцы отбирали один раз в неделю и определяли значение рН, проводили микробиологический анализ и определяли стабильность, содержание и целостность олигонуклеотидов анализом AEX-HPLC. Любые изменения в эффективности определяли по эффективности нокдауна мРНК TGF-R_II в анализе с клеточной культурой с каждым образцом соответственно.

Описание метода:

Лиофилизированные ASO разбавляли 0,9% NaCl в стерильных условиях (ламинарный поток, BIOWIZARD Golden GL-170 Ergoscience^®, режим S1). Маркировали пробирки Эппендорфа емкостью 5 мл согласно схеме маркировки (смотри таблицу 83) в стерильных условиях (ламинарный поток, BIOWIZARD Golden GL-170 Ergoscience^®, режим S1). Два газовых насоса давления (Tricumed Model IP-2000 V^®) и катетер (набор спинальных катетеров 4000) заполняли, следуя описанию производителя, соответствующим раствором ASO (все стадии проводили в ламинарном потоке, BIOWIZARD Golden GL-170 Ergoscience^®, режим S1, схему пипетирования/маркировки смотри в таблице 83). На следующей стадии насос, соединенный с катетером, который был соединен с крышкой пробирки Эппендорфа емкостью 5 мл и оставшиеся пробирки хранили в ящике для хранения, где все отверстия были закрыты Parafilm^®, для избежания загрязнения. Образцы отбирали раз в неделю, хранили при -80°С до анализа, и катетер, соединенный с крышкой пробирки Эппендорфа емкостью 5 мл, переносили в следующую пробирку для продолжения процедуры отбора проб. Кроме того, один образец отбирали непосредственно из насоса через болюсный порт и хранили при -80°C. В последний день опыта был отобран дополнительный образец для микробиологического анализа.

Таблица 83: схема маркировки в исследовании стабильности ASO при применении. Схему маркировки выполняли для SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218c (в каждом случае 0,24 мМ); PS: (образец из насоса:образец непосредственно из катетера), AS: (дополнительный образец: образец отобран непосредственно из резервуара внутри насоса через болюсный порт, МБ: (микробиологический анализ: 500 мкМ PS и AS).


Образец	Сутки
Олигонуклеотид	Пробирка	Условия	0	6	12	18	24	29
SEQ ID NO: 218b [0,24 мМ]	5 мл	PS	SEQ ID NO: 218b [10 μM] исходно	SEQ ID NO: 218b _+37°C PS_сутки 6	SEQ ID NO: 218b _+37°C PS_сутки 12	SEQ ID NO: 218b _+37°C PS_сутки 18	SEQ ID NO: 218b _+37°C PS_сутки 24	SEQ ID NO: 218b _+37°C PS_сутки 29
SEQ ID NO: 218b [0,24 мМ]	5 мл	AS		SEQ ID NO: 218b _+37°C AS_сутки 6	SEQ ID NO: 218b _+37°C AS_сутки 12	SEQ ID NO: 218b _+37°C AS_сутки 18	SEQ ID NO: 218b _+37°C AS_сутки 24	SEQ ID NO: 218b _+37°C AS_сутки 29
SEQ ID NO: 218b [0,24 мМ]	5 мл	МБ						SEQ ID NO: 218b _+37°C MB_сутки 29
SEQ ID NO: 218b [0,24 мМ]	5 мл	значение pH	SEQ ID NO: 218b значение pH сутки 0					SEQ ID NO: 218b значение pH сутки 29
SEQ ID NO: 218c [0,24 мМ]	5 мл	PS	SEQ ID NO: 218c исходно	SEQ ID NO: 218c _+37°C PS_сутки 6	SEQ ID NO: 218c _+37°C PS_сутки 12	SEQ ID NO: 218c _+37°C PS_сутки 18	SEQ ID NO: 218c _+37°C PS_сутки 24	SEQ ID NO: 218c _+37°C PS_сутки 29
SEQ ID NO: 218c [0,24 мМ]	5 мл	AS		SEQ ID NO: 218c _+37°C AS_сутки 6	SEQ ID NO: 218c _+37°C AS_сутки 12	SEQ ID NO: 218c _+37°C AS_сутки 18	SEQ ID NO: 218c _+37°C AS_сутки 24	SEQ ID NO: 218c _+37°C AS_сутки 29
SEQ ID NO: 218c [0,24 мМ]	5 мл	МБ						SEQ ID NO: 218c _+37°C MB_сутки 29
SEQ ID NO: 218c [0,24 мМ]	5 мл	значение pH	SEQ ID NO: 218c значение pH сутки 0					SEQ ID NO: 218c значение pH сутки 29

Таблица 84: схема обора образцов в исследовании стабильности ASO при применении. Схему отбора образцов выполняли для SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218c (в каждом случае 0,24 мМ). PS: (образец из насоса:образец непосредственно из катетера), AS: (дополнительный образец: образец отобран непосредственно из резервуара внутри насоса через болюсный порт, МБ: (микробиологический анализ: 500 мкМ PS и AS).


Образец	Сутки
Пробирка	Условия	0	6	12	18	24	29
5 мл	исходно	X
5 мл	PS		X	X	X	X	X
5 мл	AS		X	X	X	X	X
5 мл	МБ						X
5 мл	значение pH	X					X

Поскольку отсутствовали какие-либо эффекты насоса и катетера в отношении стабильности, содержания и целостности SEQ ID NO: 218b и SEQ ID NO: 218с, и также отсутствовали заметные проблемы при микробиологческом анализе, то данная схема применения представляет оптимальную методику для интратекального и интрацеребровентрикулярного введения обезьянам рода Cynomolgus и людям.

Химический синтез

Сокращения

Pybop: гексафторфосфат (бензотриазол-1-илокси)трипирролидинфосфония

DCM: дихлорметан

ДМФА: диметилформамид

DMAP: 4-диметиламинопиридин

DMT: 4,4'-диметокситритил

LCAA: длинноцепочечный алкиламино

TRIS: Трис(гидроксиметил)аминометан

TRIS-HCl: гидрохлорид трис(гидроксиметил)аминометана

DEPC: диэтилдикарбонат

Синтез и очистка гапмерных антисмысловых олигонуклеотидов

Антисмысловые олигонуклеотиды в форме гапмеров были собраны на синтезаторе ABI 3900 или ABI 394 или на Expedite™ (Applied Biosystems) в соответствии с фосфорамидитной химией олигомеризации. На синтезаторе ABI3900 твердый носитель нагружали полистиролом UnySupport (производства Glen Research, Sterling, Virginia, США) с получением масштаба синтеза 0,2 мкмоль. На синтезаторе ABI 394 твердым носителем служило стекло с контролируемой пористостью 500 A (CPG), нагруженное Unylinker™ производства Chemgenes (Wilmington, MA, США), с получением масштаба синтеза 3 мкмоль.

Вспомогательные реагенты для синтеза, такие как «Deblock», «Oxidizer», «CapA» и «CapB», а также ДНК фосфорамидиты получали от SAFC Proligo (Гамбург, Германия).

В частности, мономеры дезокситимидина (dT) 5'-O-(4,4'диметокситритил)-2'-O,3'-O-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит, 4-N-бензоил-2'-дезоксицитидин (dC^Bz), 6-N-бензоил-2'-дезоксиаденозин (dA^Bz) и 2-N-изобутирил-2'-деоксигуанозин (dG^iBu) использовали в качестве строительных блоков ДНК. 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фос форамидит (LNA-G^DMF)-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N, N-диизопропил)]фосфорамидит (LNA-Tb),5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит (LNA-A^Bz), 5'-O-DMT-2'-O-4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин- -(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидит (LNA-C^*Bz) использовали в качестве строительных блоков LNA. LNA фосфорамидиты получали от Exiqon (Вебек, Дания).

Как показано на примерах LNA в таблице 85, фосфорамидиты растворяли в сухом ацетонитриле с получением 0,07 М раствора олигонуклеотида, за исключением LNA-C^*Bz, который растворяли в смеси ТГФ/ацетонитрил (25/75 (об./об.)).

Таблица 85
	Молекулярная масса г/моль	CAS No.	Растворитель	Для получения 0,07 M раствора 100 мг
LNA-A^Bz	885,9	[206055-79-0]	безводный ацетонитрил	1,6 мл
LNA-C*^Bz	875,9	[206055-82-5]	смесь ТГФ/безводный ацетонитрил 25/75 (v/v)	1,6 мл
LNA-G^DMF	852,9	[709641-79-2]	безводный ацетонитрил	1,7 мл
LNA-T	772,8	[206055-75-6]	безводный ацетонитрил	1,8 мл

β-D-тио-LNA: 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-меркапто-2'-S, 4'-С-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидит, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-меркапто-2'-S,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидиты, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-меркапто-2'-S,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидит, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-меркапто-2'-S,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидит и 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-амино-2'-N,4'-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидиты синтезировали, как описано в J. Org. Chem. 1998, 63, 6078-6079.

Синтез β-D-амино-LNA: 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-амино-2'-N,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидитов, 5'-О-DMT-2'-дезокси-2'-амино-2'-N,4'-С-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидита, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-амино-2'-N,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопро пил)]фос форамидита, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-метиламино-2'-N,4'-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита и 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-метиламино-2'-N,4'-С-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидитов, 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-метиламино-2'-N,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)(N,N-диизопропил)] фосфорамидита и 5'-O-DMT-2'-дезокси-2'-метиламино-2'-N,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидита проводили, следуя процедуре, описанной в литературе (J. Org Chem., 1998, 63, 6078-6079).

Синтез β-L-окси-LNA: α-L-5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶- бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита, α-L-5'-O-DMT-2'-O-,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита, α-L-5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидита и α-L-5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)] фосфорамидита проводили аналогично процедурам, описанным в литературе (J.Am.Chem.Soc., 2002, 124, 2164-2176; Angew Chem., Int., Ed., 200, 39, 1656-1659).

(β-бензоилмеркапто)этил)пирролидинолтиофосфорамидиты для синтеза олигонуклеотида с фосфоротиоатным скелетом получали по аналогии с протоколом, описанным Caruthers (J. Org. Chem., 1996, 61, 4272-4281).

«Фосфорамидиты-С3»: (3-(4,4'-диметокситритилокси)пропил-1- [(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидит и «3'-спейсер C3 CPG» (1-диметокситритилоксипропандиол-3-сукциноил)- длинноцепочечный алкиламино-CPG получали от Glen Research.

Общая процедура

Приготовление конъюгата LNA-твердый носитель:

1) Получение неполного сукцинилового эфира LNA (WO2007/112754)

5'-О-DMT-3'-гидроксинуклеозидный мономер, янтарный ангидрид (1,2 экв) И DMAP (1,2 экв) растворяли в 35 мл дихлорметана (DCM). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. После экстракции NaH₂PO₄ 0,1 М pH 5,5 (2×) и насыщенным раствором соли (1×) органический слой дополнительно высушивали над безводным NaSO₄, фильтровали и выпаривали. Производное неполного эфира получали с выходом 95% и использовали без дополнительной очистки.

2) Получение конъюгата LNA-носитель (WO2007/112754)

Вышеуказанное полученное производное неполного эфира (90 мкмоль) растворяли в минимальном количестве ДМФА, добавляли DIEA и pyBOP (90 мкмоль) и перемешивали вместе в течение 1 мин. Данную предварительно активированную смесь объединяли с LCAA-CPG (500 Å, размер 80-120 меш, 300 мг) в лабораторном синтезаторе и перемешивали. Через 1,5 ч при комнатной температуре носитель отфильтровывали и промывали ДМФА, DCM и МеОН. После высушивания установленная нагрузка составила 57 мкмоль/г (смотри Tom Brown, Dorcas JS Brown. Modern machine-aided methods of oligodeoxyribonucleotide synthesis. In: F.Eckstein, editor. Oligonucleotides and 35 Analogues A Practical Approach. Oxford: IRL Press, 1991: 13-14).

Удлинение олигонуклеотида (реакция сочетания)

5-Этилтио-1H-тетразол (ЭТТ) в качестве активатора (0,5 М раствор в ацетонитриле) использовали для реакции сочетания фосфорамидитов. Вместо ETT в качестве активатора можно использовать другие реагенты, такие как 4,5-дицианоимидазол (DCI), описанный в международной заявке WO2007/112754, 5- бензилтио-1H-тетразол или сахарин-1-метилимидазол. 0,25 М раствор DCI в ацетонитриле использовали для реакции сочетания с LNA.

Кэпирование

Добавляли 10% уксусный ангидрид (Ac₂O) в ТГФ (чистый для ВЭЖХ) и 10% N-метилимидазол (NMI) в смеси ТГФ/пиридин (8:1) (чистый для ВЭЖХ) и давали взаимодействовать.

Окисление

Окисление фосфора (III) до фосфора (V) обычно проводили, например, смесью йод/ТГФ/пиридин/H₂O с использованием 0,02 М йода в смеси ТГФ/пиридин/H₂O, полученного от Glen Research, или 0,5 М (1S)-(+)-(10-камфорсульфонил)оксазиридина (CSO) в безводном ацетонитриле производства Glen Research.

В случае, когда получали фосфортиоатную межнуклеозидную связь, то стадию тиолирования проводили с использованием 0,05 М раствора 3-((диметиламинометилиден)амино)-3H-1,2,4-дитиазол-3-тиона (DDTT, полученного от Chemgenes (Wilmington, MA, США)) в смеси безводный ацетонитрил/пиридин (1:1 об./об.). В случае использования LNA тиолирование проводили с использованием 0,2 М 3,H-1,2-бензотиол-3-она 1,1-диоксида (реагента Бьюкажа) в безводном ацетонитриле.

В общем тиолирование также можно провести с использованием хлорида ксантана (0,01 М раствор в смеси ацетонитрил/пиридин 10%), как описано в международной заявке WO2007/112754. Альтернативно можно использовать другие реагенты для стадии тиолирования, такие как ксантангидрид (5-имино(1,2,4)дитиазолидин-3-тион), фенилацетилдисульфид (PADS).

В случае синтеза фосфородитиоата полученный тиофосфитный триэфир окисляли до фосфоротиотриэфира добавлением 0,05 М DDTT (3-((диметиламинометилиден)амино)-3Н-1,2,4-дитиазол-3-тиона) в смеси пиридин/ацетонитрил (4:1 об./об.).

Отщепление от твердого носителя и снятие защиты

В конце твердофазного синтеза антисмысловой олигонуклеотид можно отщепить вариантами «DMT-on» или «DMT-off». Вариант «DMT off» означает, что конечную группу 5'-O-(4,4'-диметокситритил) удаляют в синтезаторе с использованием реагента «Deblock», и вариант DMT-on означает, что данная группа остается, в то время как олигонуклеотид отщепляют от твердого носителя. Группы DMT удаляли трихлоруксусной кислотой.

Вариант «DMT-off»

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 1-5 мл концентрированного водного раствора аммиака (полученного от Sigma Aldrich) в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Если олигонуклеотиды содержат фосфородитиоатный триэфир, то с тиоловых групп снимали защиту с помощью смеси тиофенол:триэтиламин:диоксан, 1:1:2, об./об./об., в течение 24 ч, затем олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя с использованием водного аммиака в течение 1-2 ч при комнатной температуре и дополнительно снимают защиту в течение 4 ч при 65°C.

Вариант «DMT-on»

Олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя с использованием водного аммиака в течение 1-2 ч при комнатной температуре и затем снимали защиту в течение 4 ч при 65°C. Олигонуклеотиды очищали обращенно-фазовой ВЭЖХ (ОФ-ВЭЖХ) и затем DMT-группу удаляли обработкой трихлоруксусной кислотой.

Если олигонуклеотиды содержат фосфородитиотный триэфир, то отщепление от твердого носителя и снятие защиты с тиоловой группы проводили добавлением 850 мкл аммиака в концентрированном этаноле (смесь аммиак/этанол 3:1 об./об.) при 55°С в течение 15-16 ч.

Концевые группы

Концевые группы на 5'-конце антисмыслового олигонуклеотида

Олигонуклеотид на твердом носителе обрабатывали 3% трихлоруксусной кислотой в дихлорметане (мас./об.) для полного удаления защитной группы 5'-DMT. Затем соединение превращали с подходящей концевой группой с (цианоэтил-N,N-диизопропил) фосфорамидитной группой. После окисления фосфора (III) до фосфора (V), снятие защиты, отделение от твердого носителя и снятие защиты с последовательности проводили, как описано выше.

Очистка

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял: 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в 32 объемах колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом.

Аналитика

Идентичность антисмысловых олигонуклеотидов подтверждали масс-спектрометрией с электрораспылительной ионизацией (ESI-MS) и чистоту определяли аналитическим капиллярным электрофорезом OligoPro (CE).

Очистку дитиоата проводили на приборе Amersham Biosciences P920 FPLC, снабженном колонкой Mono Q 10/100 GL. Буферы готовили с обработанной DEPC водой, и их состав был следующим: буфер А: 25 мМ Трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, рН 8,0; буфер B: 25 мМ Трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, 1 М NaCl, pH 8,0.

Пример 28

Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209y)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоксилцитидин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления 5'-DMT. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила проводили реакцию сочетания с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили в колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце данного цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и смеси 448 мкл N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидитов (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-О,4'-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-О,4'-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и затем снимали защиту с использованием 5 мл концентрированного водного аммиака в течение 16 ч при 55°С. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в пределах 32 объемов колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом. Антисмысловой олигонуклеотид получали с чистотой 93,7%. ESI-МС: найдено: 5387,3 Да; вычислено: 5387,80 Да.

Пример 29

Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹C*b¹ (SEQ ID NO: 209u)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 28. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 95,3%. ESI-МС: найдено: 5146,80 Да; вычислено: 5146,4 Да.

Пример 30

/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209v)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 28. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 28. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 97,4%. HRMS (ESI): найдено: 5540,70 Да; вычислено: 5541,4 Да.

Пример 31

Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹/3SpC3s/ (SEQ ID NO: 209w)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)] фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазола (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT. Последующие реакции проводили, как описано в примере 28. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 92,7%. ESI-sMS: найдено: 5541,70 Да; вычислено: 5541,4 Да.

Пример 32

Gb¹ssTb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdA*ssdGssdGssdGssAb¹ssGb¹ssC*b¹ (SEQ ID NO: 209an)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоксицитидин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления 5'-DMT. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазола(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинол-тиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Дальнейшее удлинение олигонуклеотида проводили аналогично.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 850 мкл аммиака в концентрированном этаноле (аммиак/этанол 3:1 об./об.) при 55°С в течение 15-16 ч для отделения антисмыслового олигонуклеотида от твердого носителя и снятия защиты с тиоловой группы.

Затем неочищенный антисмысловой олигонуклеотид очищали анионообменной хроматографией с использованием колонки Mono Q 10/100 GL. Буферы готовили с обработанной DEPC водой, и их состав был следующим: буфер А: 25 мМ Трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, рН 8,0; буфер B: 25 мМ Трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, 1 М NaCl, pH 8,0.

Пример 33

Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGbsAb¹sGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209az)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 28. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 90,5%. ESI-МС: найдено: 5442,9 Да; вычислено: 5443,3 Да.

Пример 34

Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209ba)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными звеньями ДНК и LNA, как описано в примере 28. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 89,4%. ESI-МС: найдено: 5469,9 Да; вычислено: 5471,3 Да.

Пример 35

Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209bb)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 28. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 88,4%. ESI-МС: найдено: 5386,5 Да; вычислено: 5387,3 Да.

Пример 36

Gb¹Tb¹dAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹C*b¹ (SEQ ID NO: 209s)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, как описано в примере 28 и примере 29 с соответствующими строительными блоками ДНК, ДНК-производных и LNA. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 96,8%. ESI-МС: найдено: 5323,30 Да; вычислено: 5323,0 Да.

Пример 37

Gb¹sTb¹sdA*sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹ (SEQ ID NO: 209t)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примере 28, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 91,4%. ESI-МС: найдено: 5416,30 Да; вычислено: 5417,3 Да.

Пример 38

/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sC*b¹/3SpC3s/ (SEQ ID NO: 209x)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 28, примере 30 и примере 31. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 95,1%. ESI-МС: найдено: 5696,30 Да; вычислено: 5695,5 Да.

Примеры 39-132

Другие олигонуклеотиды из таблицы 6 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего звенья β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Пример 133

Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹ (SEQ ID NO: 210q)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила проводили реакцию сочетания с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил)-(N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили в колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце данного цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фос форамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фос форамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 M). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол (NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной группы 5'-DMT.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 5 мл концентрированного водного раствора аммиака в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в 32 объемах колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом.

Получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 87,1%. ESI-МС: найдено: 5384,30 Да; вычислено: 5384,3 Да.

Пример 134

Gb¹C*b¹Tb¹Ab¹dTdTdTdGdGdTdA*dGdTGb¹Tb¹Tb¹ (SEQ ID NO: 210r)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 133. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 95,3%.

Пример 135

/5SpC3s/Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹ (SEQ ID NO: 210v)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 133. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Сочетание проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 133. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 93,9%.

Пример 136

Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹/3SpC3s/(SEQ ID NO: 210w)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. Последующие реакции проводили, как описано в примере 133. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 89,7%.

Пример 137

Gb¹C*b¹Tb¹Ab¹dTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹ (SEQ ID NO: 210o)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 133 и примере 134. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 83,8%. ESI-МС: найдено: 5288,10 Да; вычислено: 5287,9 Да.

Пример 138

Gb¹sC*b¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTdGsdGsdTsdA*sdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹ (SEQ ID NO: 210p)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 133. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 80,7%. ESI-МС: найдено: 5398,40 Да; вычислено: 5399,3 Да.

Пример 139

Gb¹ssC*b¹ssTb¹ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdA*ssdGssdTssGb¹ssTb¹ssTb¹ (SEQ ID NO: 209af)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(β-бензоилмеркап то)этил]пирроли динол тиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролид инол тиофос форамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Дальнейшее удлинение олигонуклеотида проводили аналогично.

Примеры 140-233

Другие олигонуклеотиды из таблицы 7 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего единицы β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA, проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Пример 234

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹ (SEQ ID NO: 210b)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-O-сукцинат

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин (500 мг, 0,73 ммоль), 95 мг янтарного ангидрида (0,95 ммоль, 1,2 экв.) и 116 мг DMAP (0,95 ммоль, 1,2 экв.) растворяли в 35 мл дихлорметана. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Реакционный раствор промывали 2 раза 10 мл NaH₂PO₄ (0,1 М, рН 5,5) и один раз 10 мл насыщенного раствора соли. Органическую фазу высушивали под безводным NaSO₄, фильтровали и концентрировали досуха в вакууме. Производное неполного эфира получали с выходом 95% и использовали без дальнейшей очистки на следующей стадии.

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-O-сукци ноил-связанный LCAA-CPG

70 мг производного неполного эфира (90 мкмоль) растворяли в 0,3 мл ДМФА, добавляли 11,6 мкл DIEA (90 мкмоль) и pyBOP (90 мкмоль) и перемешивали вместе в течение 1 мин. Эту смесь объединяли с LCAA-CPG (500 Å, размер 80-120 меш, 300 мг) в лабораторном синтезаторе и перемешивали в течение 1,5 ч при комнатной температуре. Носитель отфильтровывали и промывали ДМФА, DCM и МеОН. После высушивания определенная нагрузка равнялась 57 мкмоль/г.

Удлинение

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензилоксиаденозин-3'-O-сукци ноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил](N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фос фо рамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁴-бензоил-2'-дезоксицитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл cмеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 5 мл концентрированного водного раствора аммиака в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в пределах 32 объемов колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом. Получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,8%. ESI-МС: найдено: 5365,80 Да; вычислено: 5365,30 Да.

Пример 235

C*b¹Ab¹Tb¹dGdAdAdTdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹Ab¹ (SEQ ID NO: 218r)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 234. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 97,8%. ESI-МС: найдено: 5125,10 Да; вычислено: 5124,4 Да.

Пример 236

/5SpC3s/C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹ (SEQ ID NO: 218t)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Сочетание проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,2%. ESI-МС: найдено: 5519,60 Да; вычислено: 5519,4 Да.

Пример 237

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹s/3SpC3/(SEQ ID NO: 218u)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. Последующие реакции проводили, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,3%. ESI-MS: найдено: 5519,10 Да; вычислено: 5519,4 Да.

Пример 238

C*b¹ssAb¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssAb¹ssGb¹ssTb¹ssAb¹ (SEQ ID NO: 218aa)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин- 3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Дальнейшее удлинение олигонуклеотида проводили аналогично.

Пример 239

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdC*sdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹ (SEQ ID NO: 218m)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 93,8%. ESI-МС: найдено: 5394,00 Да; вычислено: 5393,3 Да.

Пример 240

C*b¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdC*sdC*sAb¹Gb¹Tb¹Ab¹(SEQ ID NO: 218n)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234 и примере 235. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,7%. ESI-МС: найдено: 5297,30 Да; вычислено: 5297,0 Да.

Пример 241

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdA*sdA*sdTsdGsdGsdA*sdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹(SEQ ID NO: 218o)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 92,8%. ESI-МС: найдено: 5410,40 Да; вычислено: 5410,3 Да.

Пример 242

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdA*sdA*sdTsdGsdGsdA*sdC*sdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹(SEQ ID NO: 218p)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 95,3%. ESI-МС: найдено: 5437,40 Да; вычислено: 5438,4 Да.

Пример 243

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdC*sdCsAbsGb¹sTb¹sAb¹(SEQ ID NO: 218q)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 93,9%. ESI-МС: найдено: 5378,80 Да; вычислено: 5379,3 Да.

Пример 244

C*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹ (SEQ ID NO: 218с)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 92,9%. ESI-МС: найдено: 5379,10 Да; вычислено: 5379,3 Да.

Пример 245

C*b¹sAb¹sTb¹sdGdAdAdTdGdGdAdC*sdC*sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹ (SEQ ID NO: 218s)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,5%. ESI-МС: найдено: 5152,70 Да; вычислено: 5152,4 Да.

Пример 246

/5SpC3/sC*b¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹s/3SpC3/(SEQ ID NO: 218v)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 234, примере 236 и примере 237. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,4%. ESI-МС: найдено: 5673,50 Да; вычислено: 5673,5 Да.

Примеры 247-335

Другие олигонуклеотиды из таблицы 8 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего единицы β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA, проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Пример 336

C*b¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹sAb¹ (SEQ ID NO: 152h)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-O-сукци но ил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁴-бензоил-2'-дезоксицитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁴-бензоил-2'-дезокситимидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁴-бензоил-2'-дезоксицитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁴-бензоил-2'-дезоксицитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-С-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метил имидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 5 мл концентрированного водного раствора аммиака в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в 32 объемах колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом.

Пример 337

C*b¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdC*dGdTdCdC*Ab¹C*b¹Ab¹ (SEQ ID NO: 152q)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 336. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 93,1%.

Пример 338

/5SpC3s/C*b¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdC*sdGsdC*sdGsdTsdCsdCsAb¹sC*b¹sAb¹ (SEQ ID NO: 152s)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 336. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Сочетание проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 336. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 96,5%.

Пример 339

C*b¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdC*sdGsdCsdGsdTsdCsdC*sAb¹sC*b¹sAb¹/3SpC3s/ (SEQ ID NO: 152t)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. Последующие реакции проводили, как описано в примере 336. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 92,1%.

Пример 340

C*b¹ssGb¹ssAb¹ssdTssdAssdC*ssdGssdCssdGssdTssdCssdC*ssAb¹ssC*b¹ssAb¹ (SEQ ID NO: 152aa)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-O-сукци ноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтио фосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтиофос форамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Дальнейшее удлиненеие олигонуклеотида проводили аналогично.

Примеры 341-433

Другие олигонуклеотиды из таблицы 5 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего единицы β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA, проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Пример 434

C*b¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsC*b¹sC*b¹sGb¹ (SEQ ID NO: 143h)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодейст вовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-С-метилентимидин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 5 мл концентрированного водного раствора аммиака в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в 32 объемах колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом.

Пример 435

C*b¹Tb¹dC*dGdTdCdAdTdAdGdAC*b¹C*b¹Gb¹ (SEQ ID NO: 143ad)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 434. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 88,7%.

Пример 436

/5SpC3s/C*b¹sTb¹sdC*dGdTdC*dA*dTdAdGdA*sC*b¹sC*b¹sGb¹ (SEQ ID NO: 143af)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 434 и примере 435. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Связывание проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 434 и примере 435. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 94,4%.

Пример 437

C*b¹sTb¹sdC*dGdTdC*dA*dTdAdGdA*sC*b¹sC*b¹sGb¹/3SpC3s/ (SEQ ID NO: 143ag)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. Последующие реакции проводили, как описано в примере 434 и примере 435. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 91,6%.

Пример 438

C*b¹ssTb¹ssC*b¹ssdGssdTssdC*ssdAssdTssdAssdGssdAssC*b¹ssC*b¹ssGb¹ (SEQ ID NO: 143t)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинол-тиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинол тиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Дальнейшее удлинение олигонуклеотида проводили аналогично.

Примеры 439-534

Другие олигонуклеотиды из таблицы 4 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего единицы β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA, проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Пример 535

C*b¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹ (SEQ ID NO: 213k)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-O-сукциноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин- 3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-дезокситимидин-3'-[(2-цианоэтил)(N,N-диизопропил)]фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N⁶-бензоил-2'-дезоксиаденозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-N²-изобутирил-2'-дезоксигуанозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)]фос фор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N⁶-бензоиладенозин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфорамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-5-метил-N⁴-бензоилцитидин-3'-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил)фосфор амидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

По завершении твердофазного синтеза антисмысловые олигонуклеотиды обрабатывали 20% раствором диэтиламина в ацетонитриле (Biosolve BV, Valkenswaard, Нидерланды) в течение 20 мин для удаления цианоэтильных защитных групп на фосфатном остове. Затем антисмысловые олигонуклеотиды отщепляли от твердого носителя и удаляли защитные группы, используя 5 мл концентрированного водного раствора аммиака в течение 16 ч при 55°C. Твердый носитель отделяли от антисмысловых олигонуклеотидов фильтрованием или центрифугированием.

Затем неочищенные антисмысловые олигонуклеотиды очищали анионообменной высокоэффективной жидкостной хроматографией (ВЭЖХ) в системе AKTA Explorer (GE Healthcare, Фрайбург, Германия) и на колонке, заполненной Source Q15 (GE Helthcare). Буфер А представлял 10 мМ перхлората натрия, 20 мМ Трис, 1 мМ ЭДТА, рН 7,4 и содержал 20% ацетонитрила, и буфер В был таким же, как буфер А, за исключением включения 500 мМ перхлората натрия. Использовали градиент от 15% В до 55% В в 32 объемах колонки (CV). В УФ-свете снимали спектр при 280 нм. Соответствующие фракции объединяли и осаждали 3 М NaOAc, рН=5,2 и 70% этанолом. Наконец, осадок промывали 70% этанолом.

Пример 536

C*b¹Ab¹Gb¹dGdC*dAdTdTdAdAdTdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹ (SEQ ID NO: 213n)

LNA связывали с CPG, следуя общей процедуре. Реакцию сочетания и стадию кэпирования также проводили, как описано в примере 535. После стадии кэпирования систему промывали 800 мкл ацетонитрила и 400 мкл 0,02 М раствора йода в смеси ТГФ/пиридин/Н₂О наносили на колонку на 45 с. Систему промывали после стадии окисления 24 мкл ацетонитрила. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 91,4%.

Пример 537

/5SpC3s/C*b¹sAb¹sGb¹sdGsdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹ (SEQ ID NO: 231o)

Соединение синтезировали, следуя общей процедуре, с соответствующими строительными блоками ДНК и LNA, как описано в примере 535. Но за исключением того, что после того, как последний нуклеотид был присоединен к олигонуклеотиду и были проведены стадии окисления и кэпирования добавляли 80 мкл фосфорамидита-C3 (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Связывание проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила. Последующие стадии выполняли, как описано в примере 535. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 87,1%.

Пример 538

C*b¹sAb¹sGb¹sdGsdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹/3SpC3s/ (SEQ ID NO: 213p)

3'-Спейсер C3 CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 80 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(2-цианоэтил)(N,N-диизо про пил)]фос форамидита (0,07 М) и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 640 мкл реагента Бьюкажа (0,2 М) наносили на колонку на 180 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодейст вовать в течение 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. Последующие реакции проводили, как описано в примере 535. После очистки получали антисмысловой олигонуклеотид с чистотой 95,7%.

Пример 539

C*b¹ssAb¹ssGb¹ssdGssdC*ssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssAb¹ssGb¹ssTb¹ssGb¹ (SEQ ID NO: 213ae)

5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-O-сукци ноил-связанный LCAA-CPG (0,2 мкмоль) обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы. После нескольких промываний общим количеством 800 мкл ацетонитрила реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилентимидин- 3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирролидинолтиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Реакцию сочетания проводили с 38 мкл 5'-O-DMT-2'-O,4'-C-метилен-N²-диметилформамидингуанозин-3'-[(β-бензоилмеркапто)этил]пирроли динолтиофосфорамидита (0,15 М) в 10% дихлорметане (об./об.) в ацетонитриле и 236 мкл DCI в ацетонитриле (0,25 М). Реакцию сочетания проводили в течение 250 с, и избыток реагентов вымывали 800 мкл ацетонитрила и 900 мкл DDTT (0,05 М в смеси пиридин/ацетонитрил 4:1 об./об.) наносили на колонку на 240 с. Систему промывали 320 мкл ацетонитрила. Для стадии кэпирования добавляли 448 мкл уксусного ангидрида в ТГФ (1:9 об./об.) и 448 мкл смеси N-метилимидазол(NMI)/ТГФ/пиридин (1:8:1) и оставляли взаимодействовать на 45 с. В конце этого цикла систему промывали 480 мкл ацетонитрила. Соединение обрабатывали 1400 мкл 3% трихлоруксусной кислоты в дихлорметане в течение 60 с для полного удаления защитной 5'-DMT-группы.

Дальнейшее удлинение олигонуклеотида проводили аналогично.

Примеры 540-640

Другие олигонуклеотиды из таблицы 9 синтезировали, следуя общей процедуре, и как описано в примерах. Получение антисмыслового олигонуклеотида, содержащего единицы β-D-тио-LNA, α-L-окси-LNA, β-D-(NH)-LNA или β-D-(NCH₃)-LNA, проводили таким же образом, что и антисмысловые олигонуклеотиды, содержащие звенья β-D-окси-LNA.

Список последовательностей

SEQ ID NO: 1: рецептор II трансформирующего фактора роста бета (TGFBR2) человека, вариант транскрипта 2 (антисмысловая цепь; код ДНК)

TTTAGCTACT AGGAATGGGA ACAGGAGGCA GGATGCTCAC CTGAGTATTT TGCTTTATTC 60

AATCTAATAA ACATTTTATT TATGTAAAAG ACAAACAATG CATAGAATAA AAATAAGTGC 120

TTGAGACTTT TGATATAAAA AGAGTATATA GCATTCACAT TCCTATTTTA ATACATGAGT 180

ACAGCTGAAG TGTTCCATAA AAGAATAAAA CTTTCCCTTT ATGTATAGTA GTGAAAAAAG 240

TCAGTATTTT TAGGAACTAC AGAATGTTAT TCCTTGGTCT TTTTTCTTGA ATAAGAAAAA 300

AAAACATAAA CAAAACAAGC CACAGTATCC TCTGACACTA CATTCCAGTT TATGCTGATA 360

ACCCAGAAGT GAGAATACTC TTGAATCTTG AATATCTCAT GAATGGACCA GTATTCTAGA 420

AACTCACCAC TAGAGGTCAA TGGGCAACAG CTATTGGGAT GGTATCAGCA TGCCCTACGG 480

TGCAAGTGGA ATTTCTAGGC GCCTCTATGC TACTGCAGCC ACACTGTCTT TAACTCTCAG 540

CCCACCCACA CTGAGGAGGG TGCCTAGAGG TTCTATTTCC AAACCTTTGC ATGTATCTTA 600

AAAATCTCAA TAAAATGAGA CCTTCCACCA TCCAAACAGA GCTGATATTC TCACTACCAG 660

TCCCTCTCTA ATATTCCTAT TTGGCTGAAA ATAAGTAGCT TCAAAAAGTT TTAAAAAAGA 720

GATTACTTGC AGCATTAACA CTTCTTTGTT GATTAACAAG TTTCCTATGG AGTTTTAAAG 780

CTCATACTTT GTTCTTGTCC TTGTGGACAC AAATTTTCTA ACTGCAAATG GGACCTTTGT 840

GTCCCACATT CAAATCCTCT CTAGTAATTT CTGCAAAGGT TGAGAAGGCT GGCATGATGG 900

AGAGAACGGT AACCATGAGG AAAGCTTCTT GGAGTAAAGC ACTCCTCTCT CCAATGCAGA 960

GGGTAAAACT ATTAACATAT AAGCAAAAGA AACTTGGGCT AACTGAGACC CTTAAAGGAG 1020

TTCCCCTTTA GTCCAATAAA AGGCCAACTT CAAATCTTAA CACCAGATAA GGTAGTCAAA 1080

ATCATATTAT ATACCCAGAG AATGACTGCT TGAATGGACA TTTCTTACAA GGGACCTTGG 1140

TTAGGTGCAG ATTTAATTCC TAGACTGGGG TCCAGGTAGG CAGTGGAAAG AGCTAATGTT 1200

TACAGTGAGA AGTGAGGCAG CTTTGTAAGT GTCTCCACAC CTTCACATTT TGTGAACGTG 1260

GACTGGAGAT AACTGAAAAC CATCTGCTAT CCTTACCTGG GGATCCAGAT TTTCCTGCAA 1320

AATCTCCAAA TATTTATAAA GTGGCTTCAC TTTTTGAAAC GCTGTGCTGA CCAAACAAAA 1380

CATATGTTTA GAGTGCCTGA GGTCATAGTC CTGACAATGA TAGTATTGTG TAGTTGAAAT 1440

CCTCTTCATC AGGCCAAACT GTGCTTGAGC AATCAGGAGC CCAGAAAGAT GGAACCCATT 1500

GGTGTTTGTA TAGAAAACTA GAAAATCAAG TCAAGTGTAA TGAAAAAGTA AACACGATAA 1560

AGCCTAGAGT GAGAATTTGC TCCTTTTTAG AAAAGGATGA AGGCTGGGAG CAGAGAATAG 1620

TAACATAAGT GCAGGGGAAA GATGAAAAAA AGAACAATTT TTCATTAGTA GATGGTGGGG 1680

CAATCGCATG GATGGGGACA TCTGTTCTGA TTTTTCTGCA ACCCATGAAG GTAAAAAGTG 1740

GGGTTCAAAA CATTCAAGGT ATTAAAGATG GGGTAGAGTT TCTAAACTAG GTTGAGGGAG 1800

AGTTTCTAAA CTAGCCCCCC AGATTTGGGG CTTGGAGCTT AAATGAAAAG TCCAGGAGAA 1860

ATAAGGGCAC ACAGGAACCC CGGGAACACT GGTCCTCAAA CAGTGCCACT GTACTTAGTT 1920

CCATGGCCAG AAGAGAAGTG CTAGGCAGGG AATGATTATT TTGCAAAAGC AAGTGCAATG 1980

TGGTCATAGC TGGCTGTGAG ACATGGAGCC TCTTTCCTCA TGCAAAGTTC ACTGTTTTAC 2040

AGTCAGAGAA CCACTGCATG TGTGATTGTC AAATGCTAAT GCTGTCATGG GTCCCTTCCT 2100

TCTCTGCTTG GTTCTGGAGT TCTCCAATAA AACCAATTTC CTGGGAATAT TTGATGTTTT 2160

TCCTTGTCTC TTTTCAAGGT ATGGCTATAT ATATAGAGCT ATAGACATAT ATAGATATAT 2220

ATATATATAT ATAAAACATA GCTATTCATA TTTATATACA GGCATTAATA AAGTGCAAAT 2280

GTTATTGGCT ATTGTAAAAA TCAATCTCAT TTCCTGAGGA AGTGCTAACA CAGCTTATCC 2340

TATGACAATG TCAAAGGCAT AGAATGCTCT ATGTCACCCA CTCCCTGCTG CTGTTGTTTC 2400

TGCTTATCCC CACAGCTTAC AGGGAGGGGA GTGACCCCCT TGGTTTTCCA GGAAGCATCA 2460

GTTCAGGGGC AGCTTCCTGC TGCCTCTGTT CTTTGGTGAG AGGGGCAGCC TCTTTGGACA 2520

TGGCCCAGCC TGCCCCAGAA GAGCTATTTG GTAGTGTTTA GGGAGCCGTC TTCAGGAATC 2580

TTCTCCTCCG AGCAGCTCCT CCCCGAGAGC CTGTCCAGAT GCTCCAGCTC ACTGAAGCGT 2640

TCTGCCACAC ACTGGGCTGT GAGACGGGCC TCTGGGTCGT GGTCCCAGCA CTCAGTCAAC 2700

GTCTCACACA CCATCTGGAT GCCCTGGTGG TTGAGCCAGA AGCTGGGAAT TTCTGGTCGC 2760

CCTCGATCTC TCAACACGTT GTCCTTCATG CTTTCGACAC AGGGGTGCTC CCGCACCTTG 2820

GAACCAAATG GAGGCTCATA ATCTTTTACT TCTCCCACTG CATTACAGCG AGATGTCATT 2880

TCCCAGAGCA CCAGAGCCAT GGAGTAGACA TCGGTCTGCT TGAAGGACTC AACATTCTCC 2940

AAATTCATCC TGGATTCTAG GACTTCTGGA GCCATGTATC TTGCAGTTCC CACCTGCCCA 3000

CTGTTAGCCA GGTCATCCAC AGACAGAGTA GGGTCCAGAC GCAGGGAAAG CCCAAAGTCA 3060

CACAGGCAGC AGGTTAGGTC GTTCTTCACG AGGATATTGG AGCTCTTGAG GTCCCTGTGC 3120

ACGATGGGCA TCTTGGGCCT CCCACATGGA GTGTGATCAC TGTGGAGGTG AGCAATCCCC 3180

CGGGCGAGGG AGCTGCCCAG CTTGCGCAGG TCCTCCCAGC TGATGACATG CCGCGTCAGG 3240

TACTCCTGTA GGTTGCCCTT GGCGTGGAAG GCGGTGATCA GCCAGTATTG TTTCCCCAAC 3300

TCCGTCTTCC GCTCCTCAGC CGTCAGGAAC TGGAGTATGT TCTCATGCTT CAGATTGATG 3360

TCTGAGAAGA TGTCCTTCTC TGTCTTCCAA GAGGCATACT CCTCATAGGG AAAGATCTTG 3420

ACTGCCACTG TCTCAAACTG CTCTGAAGTG TTCTGCTTCA GCTTGGCCTT ATAGACCTCA 3480

GCAAAGCGAC CTTTCCCCAC CAGGGTGTCC AGCTCAATGG GCAGCAGCTC TGTGTTGTGG 3540

TTGATGTTGT TGGCACACGT GGAGCTGATG TCAGAGCGGT CATCTTCCAG GATGATGGCA 3600

CAGTGCTCGC TGAACTCCAT GAGCTTCCGC GTCTTGCCGG TTTCCCAGGT TGAACTCAGC 3660

TTCTGCTGCC GGTTAACGCG GTAGCAGTAG AAGATGATGA TGACAGATAT GGCAACTCCC 3720

AGTGGTGGCA GGAGGCTGAT GCCTGTCACT TGAAATATGA CTAGCAACAA GTCAGGATTG 3780

CTGGTGTTAT ATTCTTCTGA GAAGATGATG TTGTCATTGC ACTCATCAGA GCTACAGGAA 3840

CACATGAAGA AAGTCTCACC AGGCTTTTTT TTTTCCTTCA TAATGCACTT TGGAGAAGCA 3900

GCATCTTCCA GAATAAAGTC ATGGTAGGGG AGCTTGGGGT CATGGCAAAC TGTCTCTAGT 3960

GTTATGTTCT CGTCATTCTT TCTCCATACA GCCACACAGA CTTCCTGTGG CTTCTCACAG 4020

ATGGAGGTGA TGCTGCAGTT GCTCATGCAG GATTTCTGGT TGTCACAGGT GGAAAATCTC 4080

ACATCACAAA ATTTACACAG TTGTGGAAAC TTGACTGCAC CGTTGTTGTC AGTGACTATC 4140

ATGTCGTTAT TAACCGACTT CTGAACGTGC GGTGGGATCG TGCTGGCGAT ACGCGTCCAC 4200

AGGACGATGT GCAGCGGCCA CAGGCCCCTG AGCAGCCCCC GACCCATGGC AGACCCCGCT 4260

GCTCGTCATA GACCGAGCCC CCAGCGCAGC GGACGGCGCC TTCCCGGACC CCTGGCTGCG 4320

CCTCCGCGCC GCGCCCTCTC CGGACCCCGC GCCGGGCCGG CAGCGCAGAT GTGCGGGCCA 4380

GATGTGGCGC CCGCTCGCCA GCCAGGAGGG GGCCTGGAGG CCGGCGAGGC GCGGGGAGGC 4440

CCCCGGCGGC CGAGGGAAGC TGCACAGGAG TCCGGCTCCT GTCCCGAGCG GGTGCACGCG 4500

CGGGGGTGTC GTCGCTCCGT GCGCGCGAGT GACTCACTCA ACTTCAACTC AGCGCTGCGG 4560

GGGAAACAGG AAACTCCTCG CCAACAGCTG GGCAGGACCT CTCTCCGCCC GAGAGCCTTC 4620

TCCCTCTCC 4629

SEQ ID NO: 2: рецептор II трансформирующего фактора роста бета (TGFBR2) человека, вариант транскрипта 2, мРНК (смысловая цепь; записано в коде ДНК)

GGAGAGGGAG AAGGCTCTCG GGCGGAGAGA GGTCCTGCCC AGCTGTTGGC GAGGAGTTTC 60

CTGTTTCCCC CGCAGCGCTG AGTTGAAGTT GAGTGAGTCA CTCGCGCGCA CGGAGCGACG 120

ACACCCCCGC GCGTGCACCC GCTCGGGACA GGAGCCGGAC TCCTGTGCAG CTTCCCTCGG 180

CCGCCGGGGG CCTCCCCGCG CCTCGCCGGC CTCCAGGCCC CCTCCTGGCT GGCGAGCGGG 240

CGCCACATCT GGCCCGCACA TCTGCGCTGC CGGCCCGGCG CGGGGTCCGG AGAGGGCGCG 300

GCGCGGAGGC GCAGCCAGGG GTCCGGGAAG GCGCCGTCCG CTGCGCTGGG GGCTCGGTCT 360

ATGACGAGCA GCGGGGTCTG CCATGGGTCG GGGGCTGCTC AGGGGCCTGT GGCCGCTGCA 420

CATCGTCCTG TGGACGCGTA TCGCCAGCAC GATCCCACCG CACGTTCAGA AGTCGGTTAA 480

TAACGACATG ATAGTCACTG ACAACAACGG TGCAGTCAAG TTTCCACAAC TGTGTAAATT 540

TTGTGATGTG AGATTTTCCA CCTGTGACAA CCAGAAATCC TGCATGAGCA ACTGCAGCAT 600

CACCTCCATC TGTGAGAAGC CACAGGAAGT CTGTGTGGCT GTATGGAGAA AGAATGACGA 660

GAACATAACA CTAGAGACAG TTTGCCATGA CCCCAAGCTC CCCTACCATG ACTTTATTCT 720

GGAAGATGCT GCTTCTCCAA AGTGCATTAT GAAGGAAAAA AAAAAGCCTG GTGAGACTTT 780

CTTCATGTGT TCCTGTAGCT CTGATGAGTG CAATGACAAC ATCATCTTCT CAGAAGAATA 840

TAACACCAGC AATCCTGACT TGTTGCTAGT CATATTTCAA GTGACAGGCA TCAGCCTCCT 900

GCCACCACTG GGAGTTGCCA TATCTGTCAT CATCATCTTC TACTGCTACC GCGTTAACCG 960

GCAGCAGAAG CTGAGTTCAA CCTGGGAAAC CGGCAAGACG CGGAAGCTCA TGGAGTTCAG 1020

CGAGCACTGT GCCATCATCC TGGAAGATGA CCGCTCTGAC ATCAGCTCCA CGTGTGCCAA 1080

CAACATCAAC CACAACACAG AGCTGCTGCC CATTGAGCTG GACACCCTGG TGGGGAAAGG 1140

TCGCTTTGCT GAGGTCTATA AGGCCAAGCT GAAGCAGAAC ACTTCAGAGC AGTTTGAGAC 1200

AGTGGCAGTC AAGATCTTTC CCTATGAGGA GTATGCCTCT TGGAAGACAG AGAAGGACAT 1260

CTTCTCAGAC ATCAATCTGA AGCATGAGAA CATACTCCAG TTCCTGACGG CTGAGGAGCG 1320

GAAGACGGAG TTGGGGAAAC AATACTGGCT GATCACCGCC TTCCACGCCA AGGGCAACCT 1380

ACAGGAGTAC CTGACGCGGC ATGTCATCAG CTGGGAGGAC CTGCGCAAGC TGGGCAGCTC 1440

CCTCGCCCGG GGGATTGCTC ACCTCCACAG TGATCACACT CCATGTGGGA GGCCCAAGAT 1500

GCCCATCGTG CACAGGGACC TCAAGAGCTC CAATATCCTC GTGAAGAACG ACCTAACCTG 1560

CTGCCTGTGT GACTTTGGGC TTTCCCTGCG TCTGGACCCT ACTCTGTCTG TGGATGACCT 1620

GGCTAACAGT GGGCAGGTGG GAACTGCAAG ATACATGGCT CCAGAAGTCC TAGAATCCAG 1680

GATGAATTTG GAGAATGTTG AGTCCTTCAA GCAGACCGAT GTCTACTCCA TGGCTCTGGT 1740

GCTCTGGGAA ATGACATCTC GCTGTAATGC AGTGGGAGAA GTAAAAGATT ATGAGCCTCC 1800

ATTTGGTTCC AAGGTGCGGG AGCACCCCTG TGTCGAAAGC ATGAAGGACA ACGTGTTGAG 1860

AGATCGAGGG CGACCAGAAA TTCCCAGCTT CTGGCTCAAC CACCAGGGCA TCCAGATGGT 1920

GTGTGAGACG TTGACTGAGT GCTGGGACCA CGACCCAGAG GCCCGTCTCA CAGCCCAGTG 1980

TGTGGCAGAA CGCTTCAGTG AGCTGGAGCA TCTGGACAGG CTCTCGGGGA GGAGCTGCTC 2040

GGAGGAGAAG ATTCCTGAAG ACGGCTCCCT AAACACTACC AAATAGCTCT TCTGGGGCAG 2100

GCTGGGCCAT GTCCAAAGAG GCTGCCCCTC TCACCAAAGA ACAGAGGCAG CAGGAAGCTG 2160

CCCCTGAACT GATGCTTCCT GGAAAACCAA GGGGGTCACT CCCCTCCCTG TAAGCTGTGG 2220

GGATAAGCAG AAACAACAGC AGCAGGGAGT GGGTGACATA GAGCATTCTA TGCCTTTGAC 2280

ATTGTCATAG GATAAGCTGT GTTAGCACTT CCTCAGGAAA TGAGATTGAT TTTTACAATA 2340

GCCAATAACA TTTGCACTTT ATTAATGCCT GTATATAAAT ATGAATAGCT ATGTTTTATA 2400

TATATATATA TATATCTATA TATGTCTATA GCTCTATATA TATAGCCATA CCTTGAAAAG 2460

AGACAAGGAA AAACATCAAA TATTCCCAGG AAATTGGTTT TATTGGAGAA CTCCAGAACC 2520

AAGCAGAGAA GGAAGGGACC CATGACAGCA TTAGCATTTG ACAATCACAC ATGCAGTGGT 2580

TCTCTGACTG TAAAACAGTG AACTTTGCAT GAGGAAAGAG GCTCCATGTC TCACAGCCAG 2640

CTATGACCAC ATTGCACTTG CTTTTGCAAA ATAATCATTC CCTGCCTAGC ACTTCTCTTC 2700

TGGCCATGGA ACTAAGTACA GTGGCACTGT TTGAGGACCA GTGTTCCCGG GGTTCCTGTG 2760

TGCCCTTATT TCTCCTGGAC TTTTCATTTA AGCTCCAAGC CCCAAATCTG GGGGGCTAGT 2820

TTAGAAACTC TCCCTCAACC TAGTTTAGAA ACTCTACCCC ATCTTTAATA CCTTGAATGT 2880

TTTGAACCCC ACTTTTTACC TTCATGGGTT GCAGAAAAAT CAGAACAGAT GTCCCCATCC 2940

ATGCGATTGC CCCACCATCT ACTAATGAAA AATTGTTCTT TTTTTCATCT TTCCCCTGCA 3000

CTTATGTTAC TATTCTCTGC TCCCAGCCTT CATCCTTTTC TAAAAAGGAG CAAATTCTCA 3060

CTCTAGGCTT TATCGTGTTT ACTTTTTCAT TACACTTGAC TTGATTTTCT AGTTTTCTAT 3120

ACAAACACCA ATGGGTTCCA TCTTTCTGGG CTCCTGATTG CTCAAGCACA GTTTGGCCTG 3180

ATGAAGAGGA TTTCAACTAC ACAATACTAT CATTGTCAGG ACTATGACCT CAGGCACTCT 3240

AAACATATGT TTTGTTTGGT CAGCACAGCG TTTCAAAAAG TGAAGCCACT TTATAAATAT 3300

TTGGAGATTT TGCAGGAAAA TCTGGATCCC CAGGTAAGGA TAGCAGATGG TTTTCAGTTA 3360

TCTCCAGTCC ACGTTCACAA AATGTGAAGG TGTGGAGACA CTTACAAAGC TGCCTCACTT 3420

CTCACTGTAA ACATTAGCTC TTTCCACTGC CTACCTGGAC CCCAGTCTAG GAATTAAATC 3480

TGCACCTAAC CAAGGTCCCT TGTAAGAAAT GTCCATTCAA GCAGTCATTC TCTGGGTATA 3540

TAATATGATT TTGACTACCT TATCTGGTGT TAAGATTTGA AGTTGGCCTT TTATTGGACT 3600

AAAGGGGAAC TCCTTTAAGG GTCTCAGTTA GCCCAAGTTT CTTTTGCTTA TATGTTAATA 3660

GTTTTACCCT CTGCATTGGA GAGAGGAGTG CTTTACTCCA AGAAGCTTTC CTCATGGTTA 3720

CCGTTCTCTC CATCATGCCA GCCTTCTCAA CCTTTGCAGA AATTACTAGA GAGGATTTGA 3780

ATGTGGGACA CAAAGGTCCC ATTTGCAGTT AGAAAATTTG TGTCCACAAG GACAAGAACA 3840

AAGTATGAGC TTTAAAACTC CATAGGAAAC TTGTTAATCA ACAAAGAAGT GTTAATGCTG 3900

CAAGTAATCT CTTTTTTAAA ACTTTTTGAA GCTACTTATT TTCAGCCAAA TAGGAATATT 3960

AGAGAGGGAC TGGTAGTGAG AATATCAGCT CTGTTTGGAT GGTGGAAGGT CTCATTTTAT 4020

TGAGATTTTT AAGATACATG CAAAGGTTTG GAAATAGAAC CTCTAGGCAC CCTCCTCAGT 4080

GTGGGTGGGC TGAGAGTTAA AGACAGTGTG GCTGCAGTAG CATAGAGGCG CCTAGAAATT 4140

CCACTTGCAC CGTAGGGCAT GCTGATACCA TCCCAATAGC TGTTGCCCAT TGACCTCTAG 4200

TGGTGAGTTT CTAGAATACT GGTCCATTCA TGAGATATTC AAGATTCAAG AGTATTCTCA 4260

CTTCTGGGTT ATCAGCATAA ACTGGAATGT AGTGTCAGAG GATACTGTGG CTTGTTTTGT 4320

TTATGTTTTT TTTTCTTATT CAAGAAAAAA GACCAAGGAA TAACATTCTG TAGTTCCTAA 4380

AAATACTGAC TTTTTTCACT ACTATACATA AAGGGAAAGT TTTATTCTTT TATGGAACAC 4440

TTCAGCTGTA CTCATGTATT AAAATAGGAA TGTGAATGCT ATATACTCTT TTTATATCAA 4500

AAGTCTCAAG CACTTATTTT TATTCTATGC ATTGTTTGTC TTTTACATAA ATAAAATGTT 4560

TATTAGATTG AATAAAGCAA AATACTCAGG TGAGCATCCT GCCTCCTGTT CCCATTCCTA 4620

GTAGCTAAA 4629

SEQ ID NO: 3: рецептор II трансформирующего фактора роста бета (TGFBR2) человека, вариант транскрипта 2, мРНК (смысловая цепь; записано в коде РНК)

GGAGAGGGAG AAGGCUCUCG GGCGGAGAGA GGUCCUGCCC AGCUGUUGGC GAGGAGUUUC 60

CUGUUUCCCC CGCAGCGCUG AGUUGAAGUU GAGUGAGUCA CUCGCGCGCA CGGAGCGACG 120

ACACCCCCGC GCGUGCACCC GCUCGGGACA GGAGCCGGAC UCCUGUGCAG CUUCCCUCGG 180

CCGCCGGGGG CCUCCCCGCG CCUCGCCGGC CUCCAGGCCC CCUCCUGGCU GGCGAGCGGG 240

CGCCACAUCU GGCCCGCACA UCUGCGCUGC CGGCCCGGCG CGGGGUCCGG AGAGGGCGCG 300

GCGCGGAGGC GCAGCCAGGG GUCCGGGAAG GCGCCGUCCG CUGCGCUGGG GGCUCGGUCU 360

AUGACGAGCA GCGGGGUCUG CCAUGGGUCG GGGGCUGCUC AGGGGCCUGU GGCCGCUGCA 420

CAUCGUCCUG UGGACGCGUA UCGCCAGCAC GAUCCCACCG CACGUUCAGA AGUCGGUUAA 480

UAACGACAUG AUAGUCACUG ACAACAACGG UGCAGUCAAG UUUCCACAAC UGUGUAAAUU 540

UUGUGAUGUG AGAUUUUCCA CCUGUGACAA CCAGAAAUCC UGCAUGAGCA ACUGCAGCAU 600

CACCUCCAUC UGUGAGAAGC CACAGGAAGU CUGUGUGGCU GUAUGGAGAA AGAAUGACGA 660

GAACAUAACA CUAGAGACAG UUUGCCAUGA CCCCAAGCUC CCCUACCAUG ACUUUAUUCU 720

GGAAGAUGCU GCUUCUCCAA AGUGCAUUAU GAAGGAAAAA AAAAAGCCUG GUGAGACUUU 780

CUUCAUGUGU UCCUGUAGCU CUGAUGAGUG CAAUGACAAC AUCAUCUUCU CAGAAGAAUA 840

UAACACCAGC AAUCCUGACU UGUUGCUAGU CAUAUUUCAA GUGACAGGCA UCAGCCUCCU 900

GCCACCACUG GGAGUUGCCA UAUCUGUCAU CAUCAUCUUC UACUGCUACC GCGUUAACCG 960

GCAGCAGAAG CUGAGUUCAA CCUGGGAAAC CGGCAAGACG CGGAAGCUCA UGGAGUUCAG 1020

CGAGCACUGU GCCAUCAUCC UGGAAGAUGA CCGCUCUGAC AUCAGCUCCA CGUGUGCCAA 1080

CAACAUCAAC CACAACACAG AGCUGCUGCC CAUUGAGCUG GACACCCUGG UGGGGAAAGG 1140

UCGCUUUGCU GAGGUCUAUA AGGCCAAGCU GAAGCAGAAC ACUUCAGAGC AGUUUGAGAC 1200

AGUGGCAGUC AAGAUCUUUC CCUAUGAGGA GUAUGCCUCU UGGAAGACAG AGAAGGACAU 1260

CUUCUCAGAC AUCAAUCUGA AGCAUGAGAA CAUACUCCAG UUCCUGACGG CUGAGGAGCG 1320

GAAGACGGAG UUGGGGAAAC AAUACUGGCU GAUCACCGCC UUCCACGCCA AGGGCAACCU 1380

ACAGGAGUAC CUGACGCGGC AUGUCAUCAG CUGGGAGGAC CUGCGCAAGC UGGGCAGCUC 1440

CCUCGCCCGG GGGAUUGCUC ACCUCCACAG UGAUCACACU CCAUGUGGGA GGCCCAAGAU 1500

GCCCAUCGUG CACAGGGACC UCAAGAGCUC CAAUAUCCUC GUGAAGAACG ACCUAACCUG 1560

CUGCCUGUGU GACUUUGGGC UUUCCCUGCG UCUGGACCCU ACUCUGUCUG UGGAUGACCU 1620

GGCUAACAGU GGGCAGGUGG GAACUGCAAG AUACAUGGCU CCAGAAGUCC UAGAAUCCAG 1680

GAUGAAUUUG GAGAAUGUUG AGUCCUUCAA GCAGACCGAU GUCUACUCCA UGGCUCUGGU 1740

GCUCUGGGAA AUGACAUCUC GCUGUAAUGC AGUGGGAGAA GUAAAAGAUU AUGAGCCUCC 1800

AUUUGGUUCC AAGGUGCGGG AGCACCCCUG UGUCGAAAGC AUGAAGGACA ACGUGUUGAG 1860

AGAUCGAGGG CGACCAGAAA UUCCCAGCUU CUGGCUCAAC CACCAGGGCA UCCAGAUGGU 1920

GUGUGAGACG UUGACUGAGU GCUGGGACCA CGACCCAGAG GCCCGUCUCA CAGCCCAGUG 1980

UGUGGCAGAA CGCUUCAGUG AGCUGGAGCA UCUGGACAGG CUCUCGGGGA GGAGCUGCUC 2040

GGAGGAGAAG AUUCCUGAAG ACGGCUCCCU AAACACUACC AAAUAGCUCU UCUGGGGCAG 2100

GCUGGGCCAU GUCCAAAGAG GCUGCCCCUC UCACCAAAGA ACAGAGGCAG CAGGAAGCUG 2160

CCCCUGAACU GAUGCUUCCU GGAAAACCAA GGGGGUCACU CCCCUCCCUG UAAGCUGUGG 2220

GGAUAAGCAG AAACAACAGC AGCAGGGAGU GGGUGACAUA GAGCAUUCUA UGCCUUUGAC 2280

AUUGUCAUAG GAUAAGCUGU GUUAGCACUU CCUCAGGAAA UGAGAUUGAU UUUUACAAUA 2340

GCCAAUAACA UUUGCACUUU AUUAAUGCCU GUAUAUAAAU AUGAAUAGCU AUGUUUUAUA 2400

UAUAUAUAUA UAUAUCUAUA UAUGUCUAUA GCUCUAUAUA UAUAGCCAUA CCUUGAAAAG 2460

AGACAAGGAA AAACAUCAAA UAUUCCCAGG AAAUUGGUUU UAUUGGAGAA CUCCAGAACC 2520

AAGCAGAGAA GGAAGGGACC CAUGACAGCA UUAGCAUUUG ACAAUCACAC AUGCAGUGGU 2580

UCUCUGACUG UAAAACAGUG AACUUUGCAU GAGGAAAGAG GCUCCAUGUC UCACAGCCAG 2640

CUAUGACCAC AUUGCACUUG CUUUUGCAAA AUAAUCAUUC CCUGCCUAGC ACUUCUCUUC 2700

UGGCCAUGGA ACUAAGUACA GUGGCACUGU UUGAGGACCA GUGUUCCCGG GGUUCCUGUG 2760

UGCCCUUAUU UCUCCUGGAC UUUUCAUUUA AGCUCCAAGC CCCAAAUCUG GGGGGCUAGU 2820

UUAGAAACUC UCCCUCAACC UAGUUUAGAA ACUCUACCCC AUCUUUAAUA CCUUGAAUGU 2880

UUUGAACCCC ACUUUUUACC UUCAUGGGUU GCAGAAAAAU CAGAACAGAU GUCCCCAUCC 2940

AUGCGAUUGC CCCACCAUCU ACUAAUGAAA AAUUGUUCUU UUUUUCAUCU UUCCCCUGCA 3000

CUUAUGUUAC UAUUCUCUGC UCCCAGCCUU CAUCCUUUUC UAAAAAGGAG CAAAUUCUCA 3060

CUCUAGGCUU UAUCGUGUUU ACUUUUUCAU UACACUUGAC UUGAUUUUCU AGUUUUCUAU 3120

ACAAACACCA AUGGGUUCCA UCUUUCUGGG CUCCUGAUUG CUCAAGCACA GUUUGGCCUG 3180

AUGAAGAGGA UUUCAACUAC ACAAUACUAU CAUUGUCAGG ACUAUGACCU CAGGCACUCU 3240

AAACAUAUGU UUUGUUUGGU CAGCACAGCG UUUCAAAAAG UGAAGCCACU UUAUAAAUAU 3300

UUGGAGAUUU UGCAGGAAAA UCUGGAUCCC CAGGUAAGGA UAGCAGAUGG UUUUCAGUUA 3360

UCUCCAGUCC ACGUUCACAA AAUGUGAAGG UGUGGAGACA CUUACAAAGC UGCCUCACUU 3420

CUCACUGUAA ACAUUAGCUC UUUCCACUGC CUACCUGGAC CCCAGUCUAG GAAUUAAAUC 3480

UGCACCUAAC CAAGGUCCCU UGUAAGAAAU GUCCAUUCAA GCAGUCAUUC UCUGGGUAUA 3540

UAAUAUGAUU UUGACUACCU UAUCUGGUGU UAAGAUUUGA AGUUGGCCUU UUAUUGGACU 3600

AAAGGGGAAC UCCUUUAAGG GUCUCAGUUA GCCCAAGUUU CUUUUGCUUA UAUGUUAAUA 3660

GUUUUACCCU CUGCAUUGGA GAGAGGAGUG CUUUACUCCA AGAAGCUUUC CUCAUGGUUA 3720

CCGUUCUCUC CAUCAUGCCA GCCUUCUCAA CCUUUGCAGA AAUUACUAGA GAGGAUUUGA 3780

AUGUGGGACA CAAAGGUCCC AUUUGCAGUU AGAAAAUUUG UGUCCACAAG GACAAGAACA 3840

AAGUAUGAGC UUUAAAACUC CAUAGGAAAC UUGUUAAUCA ACAAAGAAGU GUUAAUGCUG 3900

CAAGUAAUCU CUUUUUUAAA ACUUUUUGAA GCUACUUAUU UUCAGCCAAA UAGGAAUAUU 3960

AGAGAGGGAC UGGUAGUGAG AAUAUCAGCU CUGUUUGGAU GGUGGAAGGU CUCAUUUUAU 4020

UGAGAUUUUU AAGAUACAUG CAAAGGUUUG GAAAUAGAAC CUCUAGGCAC CCUCCUCAGU 4080

GUGGGUGGGC UGAGAGUUAA AGACAGUGUG GCUGCAGUAG CAUAGAGGCG CCUAGAAAUU 4140

CCACUUGCAC CGUAGGGCAU GCUGAUACCA UCCCAAUAGC UGUUGCCCAU UGACCUCUAG 4200

UGGUGAGUUU CUAGAAUACU GGUCCAUUCA UGAGAUAUUC AAGAUUCAAG AGUAUUCUCA 4260

CUUCUGGGUU AUCAGCAUAA ACUGGAAUGU AGUGUCAGAG GAUACUGUGG CUUGUUUUGU 4320

UUAUGUUUUU UUUUCUUAUU CAAGAAAAAA GACCAAGGAA UAACAUUCUG UAGUUCCUAA 4380

AAAUACUGAC UUUUUUCACU ACUAUACAUA AAGGGAAAGU UUUAUUCUUU UAUGGAACAC 4440

UUCAGCUGUA CUCAUGUAUU AAAAUAGGAA UGUGAAUGCU AUAUACUCUU UUUAUAUCAA 4500

AAGUCUCAAG CACUUAUUUU UAUUCUAUGC AUUGUUUGUC UUUUACAUAA AUAAAAUGUU 4560

UAUUAGAUUG AAUAAAGCAA AAUACUCAGG UGAGCAUCCU GCCUCCUGUU CCCAUUCCUA 4620

GUAGCUAAA 4629

--->

СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> Neurovision Pharma GmbH

<120> Антисмысловые олигонуклеотиды в качестве ингибиторов сигнального пути TGF-R

<130> NVP-P03653WO

<150> EP14193368

<151> 2014-11-16

<160> 508

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 4629

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Рецептор II трансформирующего фактора роста бета человека

(70/80кДа) (TGFBR2), вариант транскрипта 2, антисмысловая цепь ДНК

<400> 1

tttagctact aggaatggga acaggaggca ggatgctcac ctgagtattt tgctttattc 60

aatctaataa acattttatt tatgtaaaag acaaacaatg catagaataa aaataagtgc 120

ttgagacttt tgatataaaa agagtatata gcattcacat tcctatttta atacatgagt 180

acagctgaag tgttccataa aagaataaaa ctttcccttt atgtatagta gtgaaaaaag 240

tcagtatttt taggaactac agaatgttat tccttggtct tttttcttga ataagaaaaa 300

aaaacataaa caaaacaagc cacagtatcc tctgacacta cattccagtt tatgctgata 360

acccagaagt gagaatactc ttgaatcttg aatatctcat gaatggacca gtattctaga 420

aactcaccac tagaggtcaa tgggcaacag ctattgggat ggtatcagca tgccctacgg 480

tgcaagtgga atttctaggc gcctctatgc tactgcagcc acactgtctt taactctcag 540

cccacccaca ctgaggaggg tgcctagagg ttctatttcc aaacctttgc atgtatctta 600

aaaatctcaa taaaatgaga ccttccacca tccaaacaga gctgatattc tcactaccag 660

tccctctcta atattcctat ttggctgaaa ataagtagct tcaaaaagtt ttaaaaaaga 720

gattacttgc agcattaaca cttctttgtt gattaacaag tttcctatgg agttttaaag 780

ctcatacttt gttcttgtcc ttgtggacac aaattttcta actgcaaatg ggacctttgt 840

gtcccacatt caaatcctct ctagtaattt ctgcaaaggt tgagaaggct ggcatgatgg 900

agagaacggt aaccatgagg aaagcttctt ggagtaaagc actcctctct ccaatgcaga 960

gggtaaaact attaacatat aagcaaaaga aacttgggct aactgagacc cttaaaggag 1020

ttccccttta gtccaataaa aggccaactt caaatcttaa caccagataa ggtagtcaaa 1080

atcatattat atacccagag aatgactgct tgaatggaca tttcttacaa gggaccttgg 1140

ttaggtgcag atttaattcc tagactgggg tccaggtagg cagtggaaag agctaatgtt 1200

tacagtgaga agtgaggcag ctttgtaagt gtctccacac cttcacattt tgtgaacgtg 1260

gactggagat aactgaaaac catctgctat ccttacctgg ggatccagat tttcctgcaa 1320

aatctccaaa tatttataaa gtggcttcac tttttgaaac gctgtgctga ccaaacaaaa 1380

catatgttta gagtgcctga ggtcatagtc ctgacaatga tagtattgtg tagttgaaat 1440

cctcttcatc aggccaaact gtgcttgagc aatcaggagc ccagaaagat ggaacccatt 1500

ggtgtttgta tagaaaacta gaaaatcaag tcaagtgtaa tgaaaaagta aacacgataa 1560

agcctagagt gagaatttgc tcctttttag aaaaggatga aggctgggag cagagaatag 1620

taacataagt gcaggggaaa gatgaaaaaa agaacaattt ttcattagta gatggtgggg 1680

caatcgcatg gatggggaca tctgttctga tttttctgca acccatgaag gtaaaaagtg 1740

gggttcaaaa cattcaaggt attaaagatg gggtagagtt tctaaactag gttgagggag 1800

agtttctaaa ctagcccccc agatttgggg cttggagctt aaatgaaaag tccaggagaa 1860

ataagggcac acaggaaccc cgggaacact ggtcctcaaa cagtgccact gtacttagtt 1920

ccatggccag aagagaagtg ctaggcaggg aatgattatt ttgcaaaagc aagtgcaatg 1980

tggtcatagc tggctgtgag acatggagcc tctttcctca tgcaaagttc actgttttac 2040

agtcagagaa ccactgcatg tgtgattgtc aaatgctaat gctgtcatgg gtcccttcct 2100

tctctgcttg gttctggagt tctccaataa aaccaatttc ctgggaatat ttgatgtttt 2160

tccttgtctc ttttcaaggt atggctatat atatagagct atagacatat atagatatat 2220

atatatatat ataaaacata gctattcata tttatataca ggcattaata aagtgcaaat 2280

gttattggct attgtaaaaa tcaatctcat ttcctgagga agtgctaaca cagcttatcc 2340

tatgacaatg tcaaaggcat agaatgctct atgtcaccca ctccctgctg ctgttgtttc 2400

tgcttatccc cacagcttac agggagggga gtgaccccct tggttttcca ggaagcatca 2460

gttcaggggc agcttcctgc tgcctctgtt ctttggtgag aggggcagcc tctttggaca 2520

tggcccagcc tgccccagaa gagctatttg gtagtgttta gggagccgtc ttcaggaatc 2580

ttctcctccg agcagctcct ccccgagagc ctgtccagat gctccagctc actgaagcgt 2640

tctgccacac actgggctgt gagacgggcc tctgggtcgt ggtcccagca ctcagtcaac 2700

gtctcacaca ccatctggat gccctggtgg ttgagccaga agctgggaat ttctggtcgc 2760

cctcgatctc tcaacacgtt gtccttcatg ctttcgacac aggggtgctc ccgcaccttg 2820

gaaccaaatg gaggctcata atcttttact tctcccactg cattacagcg agatgtcatt 2880

tcccagagca ccagagccat ggagtagaca tcggtctgct tgaaggactc aacattctcc 2940

aaattcatcc tggattctag gacttctgga gccatgtatc ttgcagttcc cacctgccca 3000

ctgttagcca ggtcatccac agacagagta gggtccagac gcagggaaag cccaaagtca 3060

cacaggcagc aggttaggtc gttcttcacg aggatattgg agctcttgag gtccctgtgc 3120

acgatgggca tcttgggcct cccacatgga gtgtgatcac tgtggaggtg agcaatcccc 3180

cgggcgaggg agctgcccag cttgcgcagg tcctcccagc tgatgacatg ccgcgtcagg 3240

tactcctgta ggttgccctt ggcgtggaag gcggtgatca gccagtattg tttccccaac 3300

tccgtcttcc gctcctcagc cgtcaggaac tggagtatgt tctcatgctt cagattgatg 3360

tctgagaaga tgtccttctc tgtcttccaa gaggcatact cctcataggg aaagatcttg 3420

actgccactg tctcaaactg ctctgaagtg ttctgcttca gcttggcctt atagacctca 3480

gcaaagcgac ctttccccac cagggtgtcc agctcaatgg gcagcagctc tgtgttgtgg 3540

ttgatgttgt tggcacacgt ggagctgatg tcagagcggt catcttccag gatgatggca 3600

cagtgctcgc tgaactccat gagcttccgc gtcttgccgg tttcccaggt tgaactcagc 3660

ttctgctgcc ggttaacgcg gtagcagtag aagatgatga tgacagatat ggcaactccc 3720

agtggtggca ggaggctgat gcctgtcact tgaaatatga ctagcaacaa gtcaggattg 3780

ctggtgttat attcttctga gaagatgatg ttgtcattgc actcatcaga gctacaggaa 3840

cacatgaaga aagtctcacc aggctttttt ttttccttca taatgcactt tggagaagca 3900

gcatcttcca gaataaagtc atggtagggg agcttggggt catggcaaac tgtctctagt 3960

gttatgttct cgtcattctt tctccataca gccacacaga cttcctgtgg cttctcacag 4020

atggaggtga tgctgcagtt gctcatgcag gatttctggt tgtcacaggt ggaaaatctc 4080

acatcacaaa atttacacag ttgtggaaac ttgactgcac cgttgttgtc agtgactatc 4140

atgtcgttat taaccgactt ctgaacgtgc ggtgggatcg tgctggcgat acgcgtccac 4200

aggacgatgt gcagcggcca caggcccctg agcagccccc gacccatggc agaccccgct 4260

gctcgtcata gaccgagccc ccagcgcagc ggacggcgcc ttcccggacc cctggctgcg 4320

cctccgcgcc gcgccctctc cggaccccgc gccgggccgg cagcgcagat gtgcgggcca 4380

gatgtggcgc ccgctcgcca gccaggaggg ggcctggagg ccggcgaggc gcggggaggc 4440

ccccggcggc cgagggaagc tgcacaggag tccggctcct gtcccgagcg ggtgcacgcg 4500

cgggggtgtc gtcgctccgt gcgcgcgagt gactcactca acttcaactc agcgctgcgg 4560

gggaaacagg aaactcctcg ccaacagctg ggcaggacct ctctccgccc gagagccttc 4620

tccctctcc 4629

<210> 2

<211> 4629

<212> ДНК

<213> Homo sapiens

<400> 2

ggagagggag aaggctctcg ggcggagaga ggtcctgccc agctgttggc gaggagtttc 60

ctgtttcccc cgcagcgctg agttgaagtt gagtgagtca ctcgcgcgca cggagcgacg 120

acacccccgc gcgtgcaccc gctcgggaca ggagccggac tcctgtgcag cttccctcgg 180

ccgccggggg cctccccgcg cctcgccggc ctccaggccc cctcctggct ggcgagcggg 240

cgccacatct ggcccgcaca tctgcgctgc cggcccggcg cggggtccgg agagggcgcg 300

gcgcggaggc gcagccaggg gtccgggaag gcgccgtccg ctgcgctggg ggctcggtct 360

atgacgagca gcggggtctg ccatgggtcg ggggctgctc aggggcctgt ggccgctgca 420

catcgtcctg tggacgcgta tcgccagcac gatcccaccg cacgttcaga agtcggttaa 480

taacgacatg atagtcactg acaacaacgg tgcagtcaag tttccacaac tgtgtaaatt 540

ttgtgatgtg agattttcca cctgtgacaa ccagaaatcc tgcatgagca actgcagcat 600

cacctccatc tgtgagaagc cacaggaagt ctgtgtggct gtatggagaa agaatgacga 660

gaacataaca ctagagacag tttgccatga ccccaagctc ccctaccatg actttattct 720

ggaagatgct gcttctccaa agtgcattat gaaggaaaaa aaaaagcctg gtgagacttt 780

cttcatgtgt tcctgtagct ctgatgagtg caatgacaac atcatcttct cagaagaata 840

taacaccagc aatcctgact tgttgctagt catatttcaa gtgacaggca tcagcctcct 900

gccaccactg ggagttgcca tatctgtcat catcatcttc tactgctacc gcgttaaccg 960

gcagcagaag ctgagttcaa cctgggaaac cggcaagacg cggaagctca tggagttcag 1020

cgagcactgt gccatcatcc tggaagatga ccgctctgac atcagctcca cgtgtgccaa 1080

caacatcaac cacaacacag agctgctgcc cattgagctg gacaccctgg tggggaaagg 1140

tcgctttgct gaggtctata aggccaagct gaagcagaac acttcagagc agtttgagac 1200

agtggcagtc aagatctttc cctatgagga gtatgcctct tggaagacag agaaggacat 1260

cttctcagac atcaatctga agcatgagaa catactccag ttcctgacgg ctgaggagcg 1320

gaagacggag ttggggaaac aatactggct gatcaccgcc ttccacgcca agggcaacct 1380

acaggagtac ctgacgcggc atgtcatcag ctgggaggac ctgcgcaagc tgggcagctc 1440

cctcgcccgg gggattgctc acctccacag tgatcacact ccatgtggga ggcccaagat 1500

gcccatcgtg cacagggacc tcaagagctc caatatcctc gtgaagaacg acctaacctg 1560

ctgcctgtgt gactttgggc tttccctgcg tctggaccct actctgtctg tggatgacct 1620

ggctaacagt gggcaggtgg gaactgcaag atacatggct ccagaagtcc tagaatccag 1680

gatgaatttg gagaatgttg agtccttcaa gcagaccgat gtctactcca tggctctggt 1740

gctctgggaa atgacatctc gctgtaatgc agtgggagaa gtaaaagatt atgagcctcc 1800

atttggttcc aaggtgcggg agcacccctg tgtcgaaagc atgaaggaca acgtgttgag 1860

agatcgaggg cgaccagaaa ttcccagctt ctggctcaac caccagggca tccagatggt 1920

gtgtgagacg ttgactgagt gctgggacca cgacccagag gcccgtctca cagcccagtg 1980

tgtggcagaa cgcttcagtg agctggagca tctggacagg ctctcgggga ggagctgctc 2040

ggaggagaag attcctgaag acggctccct aaacactacc aaatagctct tctggggcag 2100

gctgggccat gtccaaagag gctgcccctc tcaccaaaga acagaggcag caggaagctg 2160

cccctgaact gatgcttcct ggaaaaccaa gggggtcact cccctccctg taagctgtgg 2220

ggataagcag aaacaacagc agcagggagt gggtgacata gagcattcta tgcctttgac 2280

attgtcatag gataagctgt gttagcactt cctcaggaaa tgagattgat ttttacaata 2340

gccaataaca tttgcacttt attaatgcct gtatataaat atgaatagct atgttttata 2400

tatatatata tatatctata tatgtctata gctctatata tatagccata ccttgaaaag 2460

agacaaggaa aaacatcaaa tattcccagg aaattggttt tattggagaa ctccagaacc 2520

aagcagagaa ggaagggacc catgacagca ttagcatttg acaatcacac atgcagtggt 2580

tctctgactg taaaacagtg aactttgcat gaggaaagag gctccatgtc tcacagccag 2640

ctatgaccac attgcacttg cttttgcaaa ataatcattc cctgcctagc acttctcttc 2700

tggccatgga actaagtaca gtggcactgt ttgaggacca gtgttcccgg ggttcctgtg 2760

tgcccttatt tctcctggac ttttcattta agctccaagc cccaaatctg gggggctagt 2820

ttagaaactc tccctcaacc tagtttagaa actctacccc atctttaata ccttgaatgt 2880

tttgaacccc actttttacc ttcatgggtt gcagaaaaat cagaacagat gtccccatcc 2940

atgcgattgc cccaccatct actaatgaaa aattgttctt tttttcatct ttcccctgca 3000

cttatgttac tattctctgc tcccagcctt catccttttc taaaaaggag caaattctca 3060

ctctaggctt tatcgtgttt actttttcat tacacttgac ttgattttct agttttctat 3120

acaaacacca atgggttcca tctttctggg ctcctgattg ctcaagcaca gtttggcctg 3180

atgaagagga tttcaactac acaatactat cattgtcagg actatgacct caggcactct 3240

aaacatatgt tttgtttggt cagcacagcg tttcaaaaag tgaagccact ttataaatat 3300

ttggagattt tgcaggaaaa tctggatccc caggtaagga tagcagatgg ttttcagtta 3360

tctccagtcc acgttcacaa aatgtgaagg tgtggagaca cttacaaagc tgcctcactt 3420

ctcactgtaa acattagctc tttccactgc ctacctggac cccagtctag gaattaaatc 3480

tgcacctaac caaggtccct tgtaagaaat gtccattcaa gcagtcattc tctgggtata 3540

taatatgatt ttgactacct tatctggtgt taagatttga agttggcctt ttattggact 3600

aaaggggaac tcctttaagg gtctcagtta gcccaagttt cttttgctta tatgttaata 3660

gttttaccct ctgcattgga gagaggagtg ctttactcca agaagctttc ctcatggtta 3720

ccgttctctc catcatgcca gccttctcaa cctttgcaga aattactaga gaggatttga 3780

atgtgggaca caaaggtccc atttgcagtt agaaaatttg tgtccacaag gacaagaaca 3840

aagtatgagc tttaaaactc cataggaaac ttgttaatca acaaagaagt gttaatgctg 3900

caagtaatct cttttttaaa actttttgaa gctacttatt ttcagccaaa taggaatatt 3960

agagagggac tggtagtgag aatatcagct ctgtttggat ggtggaaggt ctcattttat 4020

tgagattttt aagatacatg caaaggtttg gaaatagaac ctctaggcac cctcctcagt 4080

gtgggtgggc tgagagttaa agacagtgtg gctgcagtag catagaggcg cctagaaatt 4140

ccacttgcac cgtagggcat gctgatacca tcccaatagc tgttgcccat tgacctctag 4200

tggtgagttt ctagaatact ggtccattca tgagatattc aagattcaag agtattctca 4260

cttctgggtt atcagcataa actggaatgt agtgtcagag gatactgtgg cttgttttgt 4320

ttatgttttt ttttcttatt caagaaaaaa gaccaaggaa taacattctg tagttcctaa 4380

aaatactgac ttttttcact actatacata aagggaaagt tttattcttt tatggaacac 4440

ttcagctgta ctcatgtatt aaaataggaa tgtgaatgct atatactctt tttatatcaa 4500

aagtctcaag cacttatttt tattctatgc attgtttgtc ttttacataa ataaaatgtt 4560

tattagattg aataaagcaa aatactcagg tgagcatcct gcctcctgtt cccattccta 4620

gtagctaaa 4629

<210> 3

<211> 4629

<212> РНК

<213> Homo sapiens

<400> 3

ggagagggag aaggcucucg ggcggagaga gguccugccc agcuguuggc gaggaguuuc 60

cuguuucccc cgcagcgcug aguugaaguu gagugaguca cucgcgcgca cggagcgacg 120

acacccccgc gcgugcaccc gcucgggaca ggagccggac uccugugcag cuucccucgg 180

ccgccggggg ccuccccgcg ccucgccggc cuccaggccc ccuccuggcu ggcgagcggg 240

cgccacaucu ggcccgcaca ucugcgcugc cggcccggcg cgggguccgg agagggcgcg 300

gcgcggaggc gcagccaggg guccgggaag gcgccguccg cugcgcuggg ggcucggucu 360

augacgagca gcggggucug ccaugggucg ggggcugcuc aggggccugu ggccgcugca 420

caucguccug uggacgcgua ucgccagcac gaucccaccg cacguucaga agucgguuaa 480

uaacgacaug auagucacug acaacaacgg ugcagucaag uuuccacaac uguguaaauu 540

uugugaugug agauuuucca ccugugacaa ccagaaaucc ugcaugagca acugcagcau 600

caccuccauc ugugagaagc cacaggaagu cuguguggcu guauggagaa agaaugacga 660

gaacauaaca cuagagacag uuugccauga ccccaagcuc cccuaccaug acuuuauucu 720

ggaagaugcu gcuucuccaa agugcauuau gaaggaaaaa aaaaagccug gugagacuuu 780

cuucaugugu uccuguagcu cugaugagug caaugacaac aucaucuucu cagaagaaua 840

uaacaccagc aauccugacu uguugcuagu cauauuucaa gugacaggca ucagccuccu 900

gccaccacug ggaguugcca uaucugucau caucaucuuc uacugcuacc gcguuaaccg 960

gcagcagaag cugaguucaa ccugggaaac cggcaagacg cggaagcuca uggaguucag 1020

cgagcacugu gccaucaucc uggaagauga ccgcucugac aucagcucca cgugugccaa 1080

caacaucaac cacaacacag agcugcugcc cauugagcug gacacccugg uggggaaagg 1140

ucgcuuugcu gaggucuaua aggccaagcu gaagcagaac acuucagagc aguuugagac 1200

aguggcaguc aagaucuuuc ccuaugagga guaugccucu uggaagacag agaaggacau 1260

cuucucagac aucaaucuga agcaugagaa cauacuccag uuccugacgg cugaggagcg 1320

gaagacggag uuggggaaac aauacuggcu gaucaccgcc uuccacgcca agggcaaccu 1380

acaggaguac cugacgcggc augucaucag cugggaggac cugcgcaagc ugggcagcuc 1440

ccucgcccgg gggauugcuc accuccacag ugaucacacu ccauguggga ggcccaagau 1500

gcccaucgug cacagggacc ucaagagcuc caauauccuc gugaagaacg accuaaccug 1560

cugccugugu gacuuugggc uuucccugcg ucuggacccu acucugucug uggaugaccu 1620

ggcuaacagu gggcaggugg gaacugcaag auacauggcu ccagaagucc uagaauccag 1680

gaugaauuug gagaauguug aguccuucaa gcagaccgau gucuacucca uggcucuggu 1740

gcucugggaa augacaucuc gcuguaaugc agugggagaa guaaaagauu augagccucc 1800

auuugguucc aaggugcggg agcaccccug ugucgaaagc augaaggaca acguguugag 1860

agaucgaggg cgaccagaaa uucccagcuu cuggcucaac caccagggca uccagauggu 1920

gugugagacg uugacugagu gcugggacca cgacccagag gcccgucuca cagcccagug 1980

uguggcagaa cgcuucagug agcuggagca ucuggacagg cucucgggga ggagcugcuc 2040

ggaggagaag auuccugaag acggcucccu aaacacuacc aaauagcucu ucuggggcag 2100

gcugggccau guccaaagag gcugccccuc ucaccaaaga acagaggcag caggaagcug 2160

ccccugaacu gaugcuuccu ggaaaaccaa gggggucacu ccccucccug uaagcugugg 2220

ggauaagcag aaacaacagc agcagggagu gggugacaua gagcauucua ugccuuugac 2280

auugucauag gauaagcugu guuagcacuu ccucaggaaa ugagauugau uuuuacaaua 2340

gccaauaaca uuugcacuuu auuaaugccu guauauaaau augaauagcu auguuuuaua 2400

uauauauaua uauaucuaua uaugucuaua gcucuauaua uauagccaua ccuugaaaag 2460

agacaaggaa aaacaucaaa uauucccagg aaauugguuu uauuggagaa cuccagaacc 2520

aagcagagaa ggaagggacc caugacagca uuagcauuug acaaucacac augcaguggu 2580

ucucugacug uaaaacagug aacuuugcau gaggaaagag gcuccauguc ucacagccag 2640

cuaugaccac auugcacuug cuuuugcaaa auaaucauuc ccugccuagc acuucucuuc 2700

uggccaugga acuaaguaca guggcacugu uugaggacca guguucccgg gguuccugug 2760

ugcccuuauu ucuccuggac uuuucauuua agcuccaagc cccaaaucug gggggcuagu 2820

uuagaaacuc ucccucaacc uaguuuagaa acucuacccc aucuuuaaua ccuugaaugu 2880

uuugaacccc acuuuuuacc uucauggguu gcagaaaaau cagaacagau guccccaucc 2940

augcgauugc cccaccaucu acuaaugaaa aauuguucuu uuuuucaucu uuccccugca 3000

cuuauguuac uauucucugc ucccagccuu cauccuuuuc uaaaaaggag caaauucuca 3060

cucuaggcuu uaucguguuu acuuuuucau uacacuugac uugauuuucu aguuuucuau 3120

acaaacacca auggguucca ucuuucuggg cuccugauug cucaagcaca guuuggccug 3180

augaagagga uuucaacuac acaauacuau cauugucagg acuaugaccu caggcacucu 3240

aaacauaugu uuuguuuggu cagcacagcg uuucaaaaag ugaagccacu uuauaaauau 3300

uuggagauuu ugcaggaaaa ucuggauccc cagguaagga uagcagaugg uuuucaguua 3360

ucuccagucc acguucacaa aaugugaagg uguggagaca cuuacaaagc ugccucacuu 3420

cucacuguaa acauuagcuc uuuccacugc cuaccuggac cccagucuag gaauuaaauc 3480

ugcaccuaac caaggucccu uguaagaaau guccauucaa gcagucauuc ucuggguaua 3540

uaauaugauu uugacuaccu uaucuggugu uaagauuuga aguuggccuu uuauuggacu 3600

aaaggggaac uccuuuaagg gucucaguua gcccaaguuu cuuuugcuua uauguuaaua 3660

guuuuacccu cugcauugga gagaggagug cuuuacucca agaagcuuuc cucaugguua 3720

ccguucucuc caucaugcca gccuucucaa ccuuugcaga aauuacuaga gaggauuuga 3780

augugggaca caaagguccc auuugcaguu agaaaauuug uguccacaag gacaagaaca 3840

aaguaugagc uuuaaaacuc cauaggaaac uuguuaauca acaaagaagu guuaaugcug 3900

caaguaaucu cuuuuuuaaa acuuuuugaa gcuacuuauu uucagccaaa uaggaauauu 3960

agagagggac ugguagugag aauaucagcu cuguuuggau gguggaaggu cucauuuuau 4020

ugagauuuuu aagauacaug caaagguuug gaaauagaac cucuaggcac ccuccucagu 4080

gugggugggc ugagaguuaa agacagugug gcugcaguag cauagaggcg ccuagaaauu 4140

ccacuugcac cguagggcau gcugauacca ucccaauagc uguugcccau ugaccucuag 4200

uggugaguuu cuagaauacu gguccauuca ugagauauuc aagauucaag aguauucuca 4260

cuucuggguu aucagcauaa acuggaaugu agugucagag gauacugugg cuuguuuugu 4320

uuauguuuuu uuuucuuauu caagaaaaaa gaccaaggaa uaacauucug uaguuccuaa 4380

aaauacugac uuuuuucacu acuauacaua aagggaaagu uuuauucuuu uauggaacac 4440

uucagcugua cucauguauu aaaauaggaa ugugaaugcu auauacucuu uuuauaucaa 4500

aagucucaag cacuuauuuu uauucuaugc auuguuuguc uuuuacauaa auaaaauguu 4560

uauuagauug aauaaagcaa aauacucagg ugagcauccu gccuccuguu cccauuccua 4620

guagcuaaa 4629

<210> 4

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Последовательность-мишень в рецепторе II трансформирующего фактора роста бета человека (70/80кДа) (TGFBR2), вариант транскрипта 2, смысловая цепь

<400> 4

tggtccattc 10

<210> 5

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223 Последовательность-мишень в рецепторе II трансформирующего фактора роста бета человека (70/80кДа) (TGFBR2), вариант транскрипта 2, смысловая цепь

<400> 5

ccctaaacac 10

<210> 6

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 6

actaccaaat 10

<210> 7

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 7

ggacgcgtat 10

<210> 8

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 8

gtctatgacg 10

<210> 9

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 9

ttattaatgc 10

<210> 10

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S3

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTAG'3 или последовательности, полученные из 5'TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTAG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере,G

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> n может представлять 5'GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC'3 или последовательности, полученные из 5'GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца, и где n представляет, по меньшей мере,G

<400> 10

ntgtttaggn 10

<210> 11

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S4

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA'3 или последовательности, полученные из 5'GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, A

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> n может представлять 5'TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA'3 или последовательности, полученные из 5'TGTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, T

<400> 11

ntttggtagn 10

<210> 12

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S1

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'CATGGCAGACCCCGCTGCTC'3 или последовательности, полученные из 5'CATGGCAGACCCCGCTGCTC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, C

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> n может представлять 5'CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG'3 или последовательности, полученные из 5'CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, C

<400> 12

ngtcatagan 10

<210> 13

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Антисмысловой олигонуклеотид против рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (70/80кДа) (TGFBR2), вариант транскрипта 2

<400> 13

gctcgtcata gaccga 16

<210> 14

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 14

cgatacgcgt ccacag 16

<210> 15

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 15

gtagtgttta gggagc 16

<210> 16

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 16

gctatttggt agtgtt 16

<210> 17

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223 Антисмысловой олигонуклеотид против рецептора II трансформирующего фактора роста бета человека (70/80кДа) (TGFBR2), вариант транскрипта 2

<400> 17

catgaatgga ccagta 16

<210> 18

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 18

aggcattaat aaagtg 16

<210> 19

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 19

ccgctgctcg tcatagac 18

<210> 20

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 20

cgctgctcgt catagacc 18

<210> 21

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 21

gctgctcgtc atagaccg 18

<210> 22

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 22

ctgctcgtca tagaccga 18

<210> 23

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 23

tgctcgtcat agaccgag 18

<210> 24

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 24

gctcgtcata gaccgagc 18

<210> 25

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 25

ctcgtcatag accgagcc 18

<210> 26

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 26

tcgtcataga ccgagccc 18

<210> 27

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 27

cgtcatagac cgagcccc 18

<210> 28

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 28

cgctgctcgt catagac 17

<210> 29

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 29

gctgctcgtc atagacc 17

<210> 30

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 30

ctgctcgtca tagaccg 17

<210> 31

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 31

tgctcgtcat agaccga 17

<210> 32

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 32

gctcgtcata gaccgag 17

<210> 33

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 33

ctcgtcatag accgagc 17

<210> 34

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 34

tcgtcataga ccgagcc 17

<210> 35

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 35

cgtcatagac cgagccc 17

<210> 36

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 36

gctgctcgtc atagac 16

<210> 37

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 37

ctgctcgtca tagacc 16

<210> 38

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 38

tgctcgtcat agaccg 16

<210> 39

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 39

gctcgtcata gaccga 16

<210> 40

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 40

ctcgtcatag accgag 16

<210> 41

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 41

tcgtcataga ccgagc 16

<210> 42

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 42

cgtcatagac cgagcc 16

<210> 43

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 43

ctgctcgtca tagac 15

<210> 44

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 44

tgctcgtcat agacc 15

<210> 45

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 45

gctcgtcata gaccg 15

<210> 46

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 46

ctcgtcatag accga 15

<210> 47

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 47

tcgtcataga ccgag 15

<210> 48

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 48

cgtcatagac cgagc 15

<210> 49

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 49

tgctcgtcat agac 14

<210> 50

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 50

gctcgtcata gacc 14

<210> 51

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 51

ctcgtcatag accg 14

<210> 52

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 52

tcgtcataga ccga 14

<210> 53

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 53

cgtcatagac cgag 14

<210> 54

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 54

gctggcgata cgcgtcca 18

<210> 55

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 55

ctggcgatac gcgtccac 18

<210> 56

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 56

tggcgatacg cgtccaca 18

<210> 57

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 57

ggcgatacgc gtccacag 18

<210> 58

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 58

gcgatacgcg tccacagg 18

<210> 59

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 59

cgatacgcgt ccacagga 18

<210> 60

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 60

gatacgcgtc cacaggac 18

<210> 61

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 61

atacgcgtcc acaggacg 18

<210> 62

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 62

tacgcgtcca caggacga 18

<210> 63

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 63

ctggcgatac gcgtcca 17

<210> 64

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 64

tggcgatacg cgtccac 17

<210> 65

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 65

ggcgatacgc gtccaca 17

<210> 66

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 66

gcgatacgcg tccacag 17

<210> 67

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 67

cgatacgcgt ccacagg 17

<210> 68

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 68

gatacgcgtc cacagga 17

<210> 69

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая последовательность

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'CATGGCAGACCCCGCTGCT'3 или последовательности, полученные из 5'CATGGCAGACCCCGCTGCT'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, T

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> n может представлять 5'CGAGCCCCCAGCGCAGCGG'3 или последовательности, полученные из 5'CGAGCCCCCAGCGCAGCGG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, C

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n представляет a, c, g, or t

<400> 69

ncgtcataga cn 12

<210> 70

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'GGTGGGATCGTGCTGGCGA'3 или последовательности, полученные из 5'GGTGGGATCGTGCTGGCGA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, A

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n может представлять 5'CAGGACGATGTGCAGCGGC'3 или последовательности, полученные из 5'CAGGACGATGTGCAGCGGC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, C

<400> 70

ntacgcgtcc an 12

<210> 71

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая последовательность

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTA'3 или последовательности, полученные из 5'TGCCCCAGAAGAGCTATTTGGTA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, A

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n может представлять 5'AGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC'3 или последовательности, полученные из 5'AGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, A

<400> 71

ngtgtttagg gn 12

<210> 72

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая последовательность

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCT'3 или последовательности, полученные из 5'GCCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCT'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, T

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n может представлять 5'GTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA'3 или последовательности, полученные из 5'GTTTAGGGAGCCGTCTTCAGGAA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, G

<400> 72

natttggtag tn 12

<210> 73

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая последовательность

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'TGAATCTTGAATATCTCAT'3 или последовательности, полученные из 5'TGAATCTTGAATATCTCAT'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, T

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n может представлять 5'GTATTCTAGAAACTCACCA'3 или последовательности, полученные из 5'GTATTCTAGAAACTCACCA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, G

<400> 73

ngaatggacc an 12

<210> 74

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая последовательность

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'ATTCATATTTATATACAGG'3 или последовательности, полученные из 5'ATTCATATTTATATACAGG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, G

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> n может представлять 5'GTGCAAATGTTATTGGCTA'3 или последовательности, полученные из 5'GTGCAAATGTTATTGGCTA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, G

<400> 74

ncattaataa an 12

<210> 75

<211> 41

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 75

gaatcttgaa tatctcatga atggaccagt attctagaaa c 41

<210> 76

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид (скремблированный контроль)

<400> 76

aacacgtcta tacgc 15

<210> 77

<211> 41

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 77

ttcatattta tatacaggca ttaataaagt gcaaatgtta t 41

<210> 78

<211> 42

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 78

tgaggaagtg ctaacacagc ttatcctatg acaatgtcaa ag 42

<210> 79

<211> 49

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 79

gcctgcccca gaagagctat ttggtagtgt ttagggagcc gtcttcagg 49

<210> 80

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 80

ttgaatatct catgaatgga 20

<210> 81

<211> 49

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 81

cgcaggtcct cccagctgat gacatgccgc gtcaggtact cctgtaggt 49

<210> 82

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 82

cagaagagct atttggtagt 20

<210> 83

<211> 78

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 83

atgtcgttat taaccgactt ctgaacgtgc ggtgggatcg tgctggcgat acgcgtccac 60

aggacgatgt gcagcggc 78

<210> 84

<211> 74

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 84

ggccacaggc ccctgagcag cccccgaccc atggcagacc ccgctgctcg tcatagaccg 60

agcccccagc gcag 74

<210> 85

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 85

tggtagtgtt tagggagccg 20

<210> 86

<211> 149

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 86

atgtcgttat taaccgactt ctgaacgtgc ggtgggatcg tgctggcgat acgcgtccac 60

aggacgatgt gcagcggcca caggcccctg agcagccccc gacccatggc agaccccgct 120

gctcgtcata gaccgagccc ccagcgcag 149

<210> 87

<211> 31

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 87

ttgaatatct catgaatgga ccagtattct a 31

<210> 88

<211> 33

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 88

caagtggaat ttctaggcgc ctctatgcta ctg 33

<210> 89

<211> 31

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 89

atttatatac aggcattaat aaagtgcaaa t 31

<210> 90

<211> 32

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 90

aagtgctaac acagcttatc ctatgacaat gt 32

<210> 91

<211> 39

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 91

ccccagaaga gctatttggt agtgtttagg gagccgtct 39

<210> 92

<211> 78

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 92

ctggtcgccc tcgatctctc aacacgttgt ccttcatgct ttcgacacag gggtgctccc 60

gcaccttgga accaaatg 78

<210> 93

<211> 39

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 93

gtcctcccag ctgatgacat gccgcgtcag gtactcctg 39

<210> 94

<211> 40

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 94

ctcagcttct gctgccggtt aacgcggtag cagtagaaga 40

<210> 95

<211> 68

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 95

gttattaacc gacttctgaa cgtgcggtgg gatcgtgctg gcgatacgcg tccacaggac 60

gatgtgca 68

<210> 96

<211> 64

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 96

caggcccctg agcagccccc gacccatggc agaccccgct gctcgtcata gaccgagccc 60

ccag 64

<210> 97

<211> 52

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 97

cacgcgcggg ggtgtcgtcg ctccgtgcgc gcgagtgact cactcaactt ca 52

<210> 98

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S2

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> w может представлять 5'GGTGGGATCGTGCTGGCGAT'3 или последовательности, полученные из 5'GGTGGGATCGTGCTGGCGAT'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где w представляет, по меньшей мере, T

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> r может представлять 5'ACAGGACGATGTGCAGCGGC'3 или последовательности, полученные из 5'ACAGGACGATGTGCAGCGGC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где r представляет, по меньшей мере, A

<400> 98

nacgcgtccn 10

<210> 99

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S5

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> w может представлять 5'CCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG'3 или последовательности, полученные из 5'CCCAGCCTGCCCCAGAAGAGCTATTTG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где w представляет, по меньшей мере, G

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> r может представлять 5'TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC'3 или последовательности, полученные из 5'TAGGGAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где r представляет, по меньшей мере, G

<400> 99

ngtagtgttn 10

<210> 100

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S6

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> w может представлять 5'TGAATCTTGAATATCTCATG'3 или последовательности, полученные из 5'TGAATCTTGAATATCTCATG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где w представляет, по меньшей мере, G

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> n может представлять 5'TGAATCTTGAATATCTCATG'3 или последовательности, полученные из 5'TGAATCTTGAATATCTCATG'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где n представляет, по меньшей мере, G

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> r может представлять 5'AGTATTCTAGAAACTCACCA'3 или последовательности, полученные из 5'AGTATTCTAGAAACTCACCA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где r представляет, по меньшей мере, A

<400> 100

naatggaccn 10

<210> 101

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Общая формула S7

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> w может представлять 5'ATTCATATTTATATACAGGC'3 или последовательности, полученные из 5'ATTCATATTTATATACAGGC'3, где один или более нуклеотидов удалены с 5'-конца и где w представляет, по меньшей мере, C

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> r может представлять 5'AGTGCAAATGTTATTGGCTA'3 или последовательности, полученные из 5'AGTGCAAATGTTATTGGCTA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где r представляет, по меньшей мере, A

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> n может представлять 5'AGTGCAAATGTTATTGGCTA'3 или последовательности, полученные из 5'AGTGCAAATGTTATTGGCTA'3, где один или более нуклеотидов удалены с 3'-конца и где n представляет, по меньшей мере, A

<400> 101

nattaataan 10

<210> 102

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 102

gcgagtgact cactcaa 17

<210> 103

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 103

cgagtgactc actca 15

<210> 104

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 104

gcgagtgact cactca 16

<210> 105

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 105

cgcgagtgac tcactca 17

<210> 106

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 106

cgagtgactc actc 14

<210> 107

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 107

cgcgagtgac tcactc 16

<210> 108

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 108

gcgcgagtga ctcactc 17

<210> 109

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 109

gcgagtgact cact 14

<210> 110

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 110

gcgcgagtga ctcact 16

<210> 111

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 111

cgcgcgagtg actcact 17

<210> 112

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 112

cgagtgactc ac 12

<210> 113

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 113

gcgagtgact cac 13

<210> 114

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 114

cgcgagtgac tcac 14

<210> 115

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 115

cgcgcgagtg actcac 16

<210> 116

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 116

gcgcgcgagt gactcac 17

<210> 117

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 117

cgcgagtgac tca 13

<210> 118

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 118

gcgcgagtga ctca 14

<210> 119

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 119

cgcgcgagtg actca 15

<210> 120

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 120

gcgcgcgagt gactca 16

<210> 121

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 121

tgcgcgcgag tgactca 17

<210> 122

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 122

cgcgcgagtg actc 14

<210> 123

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 123

tgcgcgcgag tgactc 16

<210> 124

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 124

gtgcgcgcga gtgactc 17

<210> 125

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 125

cgcgcgagtg act 13

<210> 126

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 126

tgcgcgcgag tgac 14

<210> 127

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 127

cgtgcgcgcg agtgac 16

<210> 128

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 128

tgcgcgcgag tga 13

<210> 129

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 129

gtcgtcgctc cgtgcg 16

<210> 130

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 130

gtcgtcgctc cgtgc 15

<210> 131

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 131

gtgtcgtcgc tccgtgc 17

<210> 132

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 132

tcgtcgctcc gtg 13

<210> 133

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 133

tgtcgtcgct ccgtg 15

<210> 134

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 134

tcgtcgctcc gt 12

<210> 135

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 135

gtcgtcgctc cgt 13

<210> 136

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 136

tgtcgtcgct ccgt 14

<210> 137

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 137

gtgtcgtcgc tccgt 15

<210> 138

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 138

ggtgtcgtcg ctccgt 16

<210> 139

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 139

cgtcatagac cgagcc 16

<210> 140

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 140

atagaccgag cc 12

<210> 141

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 141

gctcgtcata gaccga 16

<210> 142

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 142

cgtcatagac cga 13

<210> 143

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 143

ctcgtcatag accg 14

<210> 144

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 144

gctcgtcata gaccg 15

<210> 145

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 145

gctcgtcata gacc 14

<210> 146

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 146

cagcccccga cccatgg 17

<210> 147

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 147

cagcccccga cccatg 16

<210> 148

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 148

agcccccgac ccat 14

<210> 149

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 149

cagcccccga cccaagcccc cgacccat 28

<210> 150

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 150

cgcgtccaca ggacgat 17

<210> 151

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 151

cgcgtccaca ggac 14

<210> 152

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 152

cgatacgcgt ccaca 15

<210> 153

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 153

cgatacgcgt cca 13

<210> 154

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 154

tggcgatacg cgtcca 16

<210> 155

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 155

cgatacgcgt cc 12

<210> 156

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 156

gcgatacgcg tcc 13

<210> 157

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 157

gctggcgata cgcgtcc 17

<210> 158

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 158

ctggcgatac gcgtc 15

<210> 159

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 159

gcgatacgcg tc 12

<210> 160

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 160

gctggcgata cgcgtc 16

<210> 161

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 161

tggcgatacg cgtc 14

<210> 162

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 162

tggcgatacg cgt 13

<210> 163

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 163

ctggcgatac gcgt 14

<210> 164

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 164

ggcgatacgc gt 12

<210> 165

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 165

ctggcgatac gcg 13

<210> 166

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 166

tggcgatacg cg 12

<210> 167

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 167

atcgtgctgg cgatacg 17

<210> 168

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 168

cgtgcggtgg gatcgt 16

<210> 169

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 169

acgtgcggtg ggatcgt 17

<210> 170

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 170

aacgtgcggt gggatcg 17

<210> 171

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 171

aacgtgcggt gggat 15

<210> 172

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 172

tgaacgtgcg gtgggat 17

<210> 173

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 173

cgacttctga acgtgcg 17

<210> 174

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 174

ttaacgcggt agcagta 17

<210> 175

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 175

taacgcggta gcagta 16

<210> 176

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 176

gttaacgcgg tagcagt 17

<210> 177

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 177

ttaacgcggt agcag 15

<210> 178

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 178

taacgcggta gca 13

<210> 179

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 179

taacgcggta gc 12

<210> 180

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 180

ttaacgcggt agc 13

<210> 181

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 181

ttaacgcggt ag 12

<210> 182

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 182

gttaacgcgg tag 13

<210> 183

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 183

cggttaacgc ggtag 15

<210> 184

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 184

ccggttaacg cggtag 16

<210> 185

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 185

cggttaacgc ggta 14

<210> 186

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 186

ggttaacgcg gta 13

<210> 187

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 187

ccggttaacg cggta 15

<210> 188

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 188

gccggttaac gcggta 16

<210> 189

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 189

tgccggttaa cgcggta 17

<210> 190

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 190

cggttaacgc ggt 13

<210> 191

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 191

ccggttaacg cgg 13

<210> 192

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 192

gccggttaac gcgg 14

<210> 193

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 193

tgccggttaa cgcgg 15

<210> 194

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 194

gccggttaac gcg 13

<210> 195

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 195

ctgccggtta acgcg 15

<210> 196

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 196

gctgccggtt aacgcg 16

<210> 197

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 197

atgccgcgtc aggtac 16

<210> 198

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 198

acatgccgcg tca 13

<210> 199

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 199

gatgacatgc cgcgtc 16

<210> 200

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 200

gacatgccgc gt 12

<210> 201

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 201

gatgacatgc cgcgt 15

<210> 202

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 202

atgacatgcc gcg 13

<210> 203

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 203

tcccgcacct tggaacc 17

<210> 204

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 204

cgatctctca acacgt 16

<210> 205

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 205

tcgatctctc aacacgt 17

<210> 206

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 206

cgatctctca acacg 15

<210> 207

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 207

tcgatctctc aacacg 16

<210> 208

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 208

ctcgatctct caacacg 17

<210> 209

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 209

gtagtgttta gggagc 16

<210> 210

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 210

gctatttggt agtgtt 16

<210> 211

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 211

agcttatcct atgac 15

<210> 212

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 212

agcttatcct atga 14

<210> 213

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 213

caggcattaa taaagtg 17

<210> 214

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 214

ctaggcgcct ctatgc 16

<210> 215

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 215

taggcgcctc tatg 14

<210> 216

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 216

ctaggcgcct ctatg 15

<210> 217

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 217

taggcgcctc tat 13

<210> 218

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 218

catgaatgga ccagta 16

<210> 219

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 219

gaatggacca 10

<210> 220

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 220

tgaatggacc ag 12

<210> 221

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 221

tgaatggacc agt 13

<210> 222

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 222

atgaatggac cagt 14

<210> 223

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 223

atgaatggac cagta 15

<210> 224

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 224

catgaatgga ccagtat 17

<210> 225

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 225

tcatgaatgg accagtat 18

<210> 226

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 226

tcatgaatgg accagtatt 19

<210> 227

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 227

ctcatgaatg gaccagtatt 20

<210> 228

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 228

tctcatgaat ggaccagtat tc 22

<210> 229

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 229

atctcatgaa tggaccagta ttct 24

<210> 230

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 230

tatctcatga atggaccagt attcta 26

<210> 231

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 231

atatctcatg aatggaccag tattctag 28

<210> 232

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 232

cgtcatagac 10

<210> 233

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 233

tcgtcataga cc 12

<210> 234

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 234

tcgtcataga ccg 13

<210> 235

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 235

ctcgtcatag accga 15

<210> 236

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 236

atatacaggc attaataaag tgcaaatg 28

<210> 237

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 237

tgctcgtcat agaccga 17

<210> 238

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 238

tgctcgtcat agaccgag 18

<210> 239

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 239

tgctcgtcat agaccgagc 19

<210> 240

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 240

ctgctcgtca tagaccgagc 20

<210> 241

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 241

gctgctcgtc atagaccgag cc 22

<210> 242

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 242

cgctgctcgt catagaccga gccc 24

<210> 243

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 243

ccgctgctcg tcatagaccg agcccc 26

<210> 244

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 244

cccgctgctc gtcatagacc gagccccc 28

<210> 245

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 245

tacgcgtcca 10

<210> 246

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 246

atacgcgtcc ac 12

<210> 247

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 247

gatacgcgtc cac 13

<210> 248

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 248

gatacgcgtc caca 14

<210> 249

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 249

cgatacgcgt ccacag 16

<210> 250

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 250

gcgatacgcg tccacag 17

<210> 251

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 251

gcgatacgcg tccacagg 18

<210> 252

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 252

gcgatacgcg tccacagga 19

<210> 253

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 253

ggcgatacgc gtccacagga 20

<210> 254

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 254

tggcgatacg cgtccacagg ac 22

<210> 255

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 255

ctggcgatac gcgtccacag gacg 24

<210> 256

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 256

gctggcgata cgcgtccaca ggacga 26

<210> 257

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 257

tgctggcgat acgcgtccac aggacgat 28

<210> 258

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 258

gtgtttaggg 10

<210> 259

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 259

agtgtttagg ga 12

<210> 260

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 260

tagtgtttag gga 13

<210> 261

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 261

tagtgtttag ggag 14

<210> 262

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 262

tagtgtttag ggagc 15

<210> 263

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 263

gtagtgttta gggagcc 17

<210> 264

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 264

ggtagtgttt agggagcc 18

<210> 265

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 265

ggtagtgttt agggagccg 19

<210> 266

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 266

tggtagtgtt tagggagccg 20

<210> 267

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 267

ttggtagtgt ttagggagcc gt 22

<210> 268

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 268

tttggtagtg tttagggagc cgtc 24

<210> 269

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 269

atttggtagt gtttagggag ccgtct 26

<210> 270

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 270

tatttggtag tgtttaggga gccgtctt 28

<210> 271

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 271

atttggtagt 10

<210> 272

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 272

tatttggtag tg 12

<210> 273

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 273

tatttggtag tgt 13

<210> 274

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 274

ctatttggta gtgt 14

<210> 275

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 275

ctatttggta gtgtt 15

<210> 276

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 276

gctatttggt agtgttt 17

<210> 277

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 277

agctatttgg tagtgttt 18

<210> 278

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 278

agctatttgg tagtgttta 19

<210> 279

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 279

gagctatttg gtagtgttta 20

<210> 280

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 280

agagctattt ggtagtgttt ag 22

<210> 281

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 281

aagagctatt tggtagtgtt tagg 24

<210> 282

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 282

gaagagctat ttggtagtgt ttaggg 26

<210> 283

<211> 28

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 283

agaagagcta tttggtagtg tttaggga 28

<210> 284

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 284

cattaataaa 10

<210> 285

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 285

gcattaataa ag 12

<210> 286

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 286

gcattaataa agt 13

<210> 287

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 287

ggcattaata aagt 14

<210> 288

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 288

ggcattaata aagtg 15

<210> 289

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 289

aggcattaat aaagtg 16

<210> 290

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 290

caggcattaa taaagtgc 18

<210> 291

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 291

acaggcatta ataaagtgc 19

<210> 292

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 292

acaggcatta ataaagtgca 20

<210> 293

<211> 22

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 293

tacaggcatt aataaagtgc aa 22

<210> 294

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 294

atacaggcat taataaagtg caaa 24

<210> 295

<211> 26

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 295

tatacaggca ttaataaagt gcaaat 26

<210> 296

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 296

ctggtccatt c 11

<210> 297

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 297

tggtccattc a 11

<210> 298

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 298

ctggtccatt ca 12

<210> 299

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 299

tccctaaaca c 11

<210> 300

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 300

ccctaaacac t 11

<210> 301

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 301

tccctaaaca ct 12

<210> 302

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 302

cactaccaaa t 11

<210> 303

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 303

actaccaaat a 11

<210> 304

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 304

cactaccaaa ta 12

<210> 305

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 305

tggacgcgta t 11

<210> 306

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 306

ggacgcgtat c 11

<210> 307

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 307

tggacgcgta tc 12

<210> 308

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 308

ggtctatgac g 11

<210> 309

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 309

gtctatgacg a 11

<210> 310

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 310

ggtctatgac ga 12

<210> 311

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 311

tttattaatg c 11

<210> 312

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 312

ttattaatgc c 11

<210> 313

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 313

tttattaatg cc 12

<210> 314

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 314

actggtccat tc 12

<210> 315

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 315

tggtccattc at 12

<210> 316

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 316

ctggtccatt cat 13

<210> 317

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 317

actggtccat tca 13

<210> 318

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 318

actggtccat tcat 14

<210> 319

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 319

ctccctaaac ac 12

<210> 320

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 320

ccctaaacac ta 12

<210> 321

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 321

tccctaaaca cta 13

<210> 322

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 322

ctccctaaac act 13

<210> 323

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 323

ctccctaaac acta 14

<210> 324

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 324

acactaccaa at 12

<210> 325

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 325

actaccaaat ag 12

<210> 326

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 326

cactaccaaa tag 13

<210> 327

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 327

acactaccaa ata 13

<210> 328

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 328

acactaccaa atag 14

<210> 329

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 329

gtggacgcgt at 12

<210> 330

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 330

ggacgcgtat cg 12

<210> 331

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 331

tggacgcgta tcg 13

<210> 332

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 332

gtggacgcgt atc 13

<210> 333

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 333

gtggacgcgt atcg 14

<210> 334

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 334

cggtctatga cg 12

<210> 335

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 335

gtctatgacg ag 12

<210> 336

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 336

ggtctatgac gag 13

<210> 337

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 337

cggtctatga cga 13

<210> 338

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 338

cggtctatga cgag 14

<210> 339

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 339

ctttattaat gc 12

<210> 340

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 340

ttattaatgc ct 12

<210> 341

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 341

tttattaatg cct 13

<210> 342

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 342

ctttattaat gcc 13

<210> 343

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 343

ctttattaat gcct 14

<210> 344

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 344

gtgcagggga aagatgaaaa 20

<210> 345

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 345

gagctcttga ggtccctgtg 20

<210> 346

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 346

agcctctttc ctcatgcaaa 20

<210> 347

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 347

ccttctctgc ttggttctgg 20

<210> 348

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Стандартный олигонуклеотид

<400> 348

gccatggagt agacatcggt 20

<210> 349

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 349

atacgcgtcc acaggac 17

<210> 350

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 350

tacgcgtcca caggacg 17

<210> 351

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 351

tggcgatacg cgtcca 16

<210> 352

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 352

ggcgatacgc gtccac 16

<210> 353

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 353

gcgatacgcg tccaca 16

<210> 354

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 354

cgatacgcgt ccacag 16

<210> 355

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 355

gatacgcgtc cacagg 16

<210> 356

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 356

atacgcgtcc acagga 16

<210> 357

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 357

tacgcgtcca caggac 16

<210> 358

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 358

ggcgatacgc gtcca 15

<210> 359

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 359

gcgatacgcg tccac 15

<210> 360

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 360

cgatacgcgt ccaca 15

<210> 361

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 361

gatacgcgtc cacag 15

<210> 362

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 362

atacgcgtcc acagg 15

<210> 363

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 363

tacgcgtcca cagga 15

<210> 364

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 364

gcgatacgcg tcca 14

<210> 365

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 365

cgatacgcgt ccac 14

<210> 366

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 366

gatacgcgtc caca 14

<210> 367

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 367

atacgcgtcc acag 14

<210> 368

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 368

tacgcgtcca cagg 14

<210> 369

<400> 369

000

<210> 370

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 370

tttggtagtg tttaggga 18

<210> 371

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 371

ttggtagtgt ttagggag 18

<210> 372

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 372

tggtagtgtt tagggagc 18

<210> 373

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 373

ggtagtgttt agggagcc 18

<210> 374

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 374

gtagtgttta gggagccg 18

<210> 375

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 375

tagtgtttag ggagccgt 18

<210> 376

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 376

agtgtttagg gagccgtc 18

<210> 377

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 377

gtgtttaggg agccgtct 18

<210> 378

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 378

tttggtagtg tttaggg 17

<210> 379

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 379

ttggtagtgt ttaggga 17

<210> 380

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 380

tggtagtgtt tagggag 17

<210> 381

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 381

ggtagtgttt agggagc 17

<210> 382

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 382

gtagtgttta gggagcc 17

<210> 383

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 383

tagtgtttag ggagccg 17

<210> 384

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 384

agtgtttagg gagccgt 17

<210> 385

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 385

gtgtttaggg agccgtc 17

<210> 386

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 386

ttggtagtgt ttaggg 16

<210> 387

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 387

tggtagtgtt taggga 16

<210> 388

<400> 388

000

<210> 389

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 389

gtagtgttta gggagc 16

<210> 390

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 390

tagtgtttag ggagcc 16

<210> 391

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 391

agtgtttagg gagccg 16

<210> 392

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 392

gtgtttaggg agccgt 16

<210> 393

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 393

tggtagtgtt taggg 15

<210> 394

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 394

ggtagtgttt aggga 15

<210> 395

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 395

gtagtgttta gggag 15

<210> 396

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 396

tagtgtttag ggagc 15

<210> 397

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 397

agtgtttagg gagcc 15

<210> 398

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 398

gtgtttaggg agccg 15

<210> 399

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 399

ggtagtgttt aggg 14

<210> 400

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 400

gtagtgttta ggga 14

<210> 401

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 401

tagtgtttag ggag 14

<210> 402

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 402

agtgtttagg gagc 14

<210> 403

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 403

gtgtttaggg agcc 14

<210> 404

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 404

gaagagctat ttggtagt 18

<210> 405

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 405

aagagctatt tggtagtg 18

<210> 406

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 406

agagctattt ggtagtgt 18

<210> 407

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 407

gagctatttg gtagtgtt 18

<210> 408

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 408

agctatttgg tagtgttt 18

<210> 409

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 409

gctatttggt agtgttta 18

<210> 410

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 410

ctatttggta gtgtttag 18

<210> 411

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 411

tatttggtag tgtttagg 18

<210> 412

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 412

atttggtagt gtttaggg 18

<210> 413

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 413

aagagctatt tggtagt 17

<210> 414

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 414

agagctattt ggtagtg 17

<210> 415

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 415

gagctatttg gtagtgt 17

<210> 416

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 416

agctatttgg tagtgtt 17

<210> 417

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 417

gctatttggt agtgttt 17

<210> 418

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 418

ctatttggta gtgttta 17

<210> 419

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 419

atttggtagt gtttagg 17

<210> 420

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 420

atttggtagt gtttagg 17

<210> 421

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 421

agagctattt ggtagt 16

<210> 422

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 422

gagctatttg gtagtg 16

<210> 423

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 423

agctatttgg tagtgt 16

<210> 424

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 424

gctatttggt agtgtt 16

<210> 425

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 425

ctatttggta gtgttt 16

<210> 426

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 426

tatttggtag tgttta 16

<210> 427

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 427

atttggtagt gtttag 16

<210> 428

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 428

gagctatttg gtagt 15

<210> 429

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 429

agctatttgg tagtg 15

<210> 430

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 430

gctatttggt agtgt 15

<210> 431

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 431

ctatttggta gtgtt 15

<210> 432

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 432

tatttggtag tgttt 15

<210> 433

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 433

atttggtagt gttta 15

<210> 434

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 434

agctatttgg tagt 14

<210> 435

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 435

gctatttggt agtg 14

<210> 436

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 436

ctatttggta gtgt 14

<210> 437

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 437

tatttggtag tgtt 14

<210> 438

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 438

atttggtagt gttt 14

<210> 439

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 439

tatctcatga atggacca 18

<210> 440

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 440

atctcatgaa tggaccag 18

<210> 441

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 441

tctcatgaat ggaccagt 18

<210> 442

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 442

ctcatgaatg gaccagta 18

<210> 443

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 443

tcatgaatgg accagtat 18

<210> 444

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 444

catgaatgga ccagtatt 18

<210> 445

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 445

atgaatggac cagtattc 18

<210> 446

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 446

tgaatggacc agtattct 18

<210> 447

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 447

gaatggacca gtattcta 18

<210> 448

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 448

atctcatgaa tggacca 17

<210> 449

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 449

tctcatgaat ggaccag 17

<210> 450

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 450

ctcatgaatg gaccagt 17

<210> 451

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 451

tcatgaatgg accagta 17

<210> 452

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 452

catgaatgga ccagtat 17

<210> 453

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 453

atgaatggac cagtatt 17

<210> 454

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 454

tgaatggacc agtattc 17

<210> 455

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 455

gaatggacca gtattct 17

<210> 456

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 456

tctcatgaat ggacca 16

<210> 457

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 457

ctcatgaatg gaccag 16

<210> 458

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 458

tcatgaatgg accagt 16

<210> 459

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 459

catgaatgga ccagta 16

<210> 460

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 460

atgaatggac cagtat 16

<210> 461

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 461

tgaatggacc agtatt 16

<210> 462

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 462

gaatggacca gtattc 16

<210> 463

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 463

ctcatgaatg gacca 15

<210> 464

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 464

tcatgaatgg accag 15

<210> 465

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 465

catgaatgga ccagt 15

<210> 466

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 466

atgaatggac cagta 15

<210> 467

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 467

tgaatggacc agtat 15

<210> 468

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 468

gaatggacca gtatt 15

<210> 469

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 469

tcatgaatgg acca 14

<210> 470

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 470

catgaatgga ccag 14

<210> 471

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 471

atgaatggac cagt 14

<210> 472

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 472

tgaatggacc agta 14

<210> 473

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 473

gaatggacca gtat 14

<210> 474

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 474

tatacaggca ttaataaa 18

<210> 475

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 475

atacaggcat taataaag 18

<210> 476

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 476

tacaggcatt aataaagt 18

<210> 477

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 477

acaggcatta ataaagtg 18

<210> 478

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 478

caggcattaa taaagtgc 18

<210> 479

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 479

aggcattaat aaagtgca 18

<210> 480

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 480

ggcattaata aagtgcaa 18

<210> 481

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 481

gcattaataa agtgcaaa 18

<210> 482

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 482

cattaataaa gtgcaaat 18

<210> 483

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 483

atacaggcat taataaa 17

<210> 484

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 484

tacaggcatt aataaag 17

<210> 485

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 485

acaggcatta ataaagt 17

<210> 486

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 486

caggcattaa taaagtg 17

<210> 487

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 487

aggcattaat aaagtgc 17

<210> 488

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 488

ggcattaata aagtgca 17

<210> 489

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 489

gcattaataa agtgcaa 17

<210> 490

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 490

cattaataaa gtgcaaa 17

<210> 491

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 491

tacaggcatt aataaa 16

<210> 492

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 492

acaggcatta ataaag 16

<210> 493

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 493

caggcattaa taaagt 16

<210> 494

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 494

aggcattaat aaagtg 16

<210> 495

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 495

ggcattaata aagtgc 16

<210> 496

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 496

gcattaataa agtgca 16

<210> 497

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 497

cattaataaa gtgcaa 16

<210> 498

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 498

acaggcatta ataaa 15

<210> 499

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 499

caggcattaa taaag 15

<210> 500

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 500

aggcattaat aaagt 15

<210> 501

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 501

ggcattaata aagtg 15

<210> 502

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 502

gcattaataa agtgc 15

<210> 503

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 503

cattaataaa gtgca 15

<210> 504

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 504

caggcattaa taaa 14

<210> 505

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 505

aggcattaat aaag 14

<210> 506

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 506

ggcattaata aagt 14

<210> 507

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 507

gcattaataa agtg 14

<210> 508

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<400> 508

cattaataaa gtgc 14

<---

1. Антисмысловой олигонуклеотид, состоящий из 10-28 нуклеотидов, и, по меньшей мере, два из 10-28 нуклеотидов представляют LNA, и антисмысловой олигонуклеотид комплементарен участку гена, кодирующего TGF-R_II, или участку мРНК, кодирующей TGF-R_II, где участок гена, кодирующего TGF-R_II, или участок мРНК, кодирующей TGF-R_II, содержит последовательность TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4)или последовательность CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательность ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), или последовательность GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательность GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательность TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9),и антисмысловой олигонуклеотид содержит последовательность, комплементарную указанной последовательности TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательности CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательности ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), или последовательности GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательности GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательности TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) соответственно, и соли и оптические изомеры указанного антисмыслового олигонуклеотида, где антисмысловой олигонуклеотид ингибирует экспрессию TGF-R_II.

2. Антисмысловой олигонуклеотид по п.1, где антисмысловой олигонуклеотид гибридизуется избирательно только с последовательностью TGGTCCATTC (SEQ. ID NO: 4) или последовательностью CCCTAAACAC (SEQ. ID NO: 5), или последовательностью ACTACCAAAT (SEQ. ID NO: 6), или последовательностью GGACGCGTAT (SEQ. ID NO: 7), или последовательностью GTCTATGACG (SEQ. ID NO: 8), или последовательностью TTATTAATGC (SEQ. ID NO: 9) участка гена, кодирующего TGF-R_II, или участка мРНК, кодирующей TGF-R_II.

3. Антисмысловой олигонуклеотид по п.1 или 2, где антисмысловой олигонуклеотид имеет длину 12-20 нуклеотидов, и/или где антисмысловой олигонуклеотид имеет гапмерную структуру с 1-5 звеньями LNA на терминальном 3'-конце и 1-5 звеньями LNA на терминальном 5'-конце, и/или где антисмысловой олигонуклеотид содержит фосфат, фосфоротиоат и/или фосфородитиоат в качестве межнуклеотидных связей.

4. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-3, где антисмысловой олигонуклеотид представлен следующей последовательностью:

5'-N¹-GTCATAGA-N²-3' (SEQ. ID NO: 12) или

5'-N³-ACGCGTCC-N⁴-3' (SEQ. ID NO: 98) или

5'-N⁵-TTTGGTAG-N⁶-3' (SEQ. ID NO: 11) или

5'-N⁷-AATGGACC-N⁸-3' (SEQ. ID NO: 100) или

5'-N⁹-ATTAATAA-N¹⁰-3' (SEQ. ID NO: 101) или

5'-N¹¹-TGTTTAGG-N¹²-3' (SEQ. ID NO: 10) или

где:

N² представляет: -C, -CC, -CCG, -CCGA, -CCGAG, -CCGAGCC, -CCGAGCCCCC, -CCGAGCCCCCC, -CCGAGCCCCCCAG, -CCGAGCCCCCAGC, -CCGAGCCCCCAGCG, -CCGAGCCCCCAGCGC, -CCGAGCCCCCAGCGCA, -CCGAGCCCCCAGCGCAG, -CCGAGCCCCCAGCGCAGC, -CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG или -CCGAGCCCCCAGCGCAGCGG;

N³ представляет: GGTGGGATCGTGCTGGCGAT-, GTGGGATCGTGCTGGCGAT-, TGGGATCGTGCTGGCGAT-, GGGATCGTGCTGGCGAT-, GGATCGTGCTGGCGAT-, GATCGTGCTGGCGAT-, ATCGTGCTGGCGAT-, TCGTGCTGGCGAT-, CGTGCTGGCGAT-, GTGCTGGCGAT-, TGCTGGCGAT-, GCTGGCGAT-, CTGGCGAT-, TGGCGAT-, GGCGAT-, GCGAT-, CGAT-, GAT-, AT- или Т-;

N⁸ выбран из: -AGTATTCTAGAAACTCACCA, -AGTATTCTAGAAACTCACC, -AGTATTCTAGAAACTCAC, -AGTATTCTAGAAACTCA, -AGTATTCTAGAAACTC, -AGTATTCTAGAAACT, -AGTATTCTAGAAAC, -AGTATTCTAGAAA, -AGTATTCTAGAA, -AGTATTCTAGA, -AGTATTCTAG, -AGTATTCTA, -AGTATTCT, -AGTATTC, -AGTATT, -AGTAT, -AGTA, -AGT, -AG или -A;

N¹² представляет: -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTCC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTTC, -GAGCCGTCTTCAGGAATCTT, -GAGCCGTCTTCAGGAATCT, -GAGCCGTCTTCAGGAATC,-GAGCCGTCTTCAGGAAT, -GAGCCGTCTTCAGGAA, -GAGCCGTCTTCAGGA,-GAGCCGTCTTCAGG, -GAGCCGTCTTCAG, -GAGCCGTCTTCA, -GAGCCGTCTTC, -GAGCCGTCTT, -GAGCCGTCT, -GAGCCGTC, -GAGCCGT,-GAGCCG, -GAGCC, -GAGC, -GAG, -GA или -G.

5. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4, где последние 2-4 нуклеотида на терминальном 5'-конце представляют нуклеотиды LNA, и последние 2-4 нуклеотида на терминальном 3'-конце представляют нуклеотиды LNA, и между нуклеотидами LNA на терминальном 5'-конце и нуклеотидами LNA на терминальном 3'-конце находится, по меньшей мере, 6 последовательных нуклеотидов, представляющих нуклеотиды, которые не являются LNA, или которые представляют нуклеотиды ДНК.

6. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4, где нуклеотиды LNA связаны друг с другом через фосфоротиоатную группу или фосфородитиоатную группу, или где все нуклеотиды связаны друг с другом через фосфатную группу или фосфоротиоатную группу, или фосфородитиоатную группу.

7. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4, где нуклеотиды LNA выбраны из следующей группы:

где:

IL' представляет -Xʺ-P(=X')(X^-)-;

X' представляет =O или =S;

X^- представляет -O^-, -OH, -OR^H, -NHR^H, -N(R^H)₂, -OCH₂CH₂OR^H, -OCH₂CH₂SR^H, -BH₃^-, -R^H, -SH, -SR^H или -S^-;

Xʺ представляет -O-, -NH-, -NR^H-, -CH₂- или -S-;

Y представляет -O-, -NH-, -NR^H-, -CH₂- или -S-;

R^C и R^H независимо друг от друг выбраны из атома водорода и C_1-4-алкила;

В представляет азотистое основание, выбранное из следующей группы:

аденин, тимин, гуанин, цитозин, урацил, 5-метилцитозин, 5-гидроксиметилцитозин, N⁴-метилцитозин, ксантин, гипоксантин, 7-деазаксантин, 2-аминоаденин, 6-метиладенин, 6-метилгуанин, 6-этиладенин, 6-этилгуанин, 2-пропиладенин, 2-пропилгуанин, 6-карбоксиурацил, 5,6-дигидроурацил, 5-пропинилурацил, 5-пропинилцитозин, 6-азаурацил, 6-азацитозин, 6-азатимин, 5-урацил, 4-тиоурацил, 8-фтораденин, 8-хлораденин, 8-бромаденин, 8-иодаденин, 8-аминоаденин, 8-тиоладенин, 8-тиоалкиладенин, 8-гидроксиладенин, 8-фторгуанин, 8-хлоргуанин, 8-бромгуанин, 8-иодгуанин, 8-аминогуанин, 8-тиолгуанин, 8-тиоалкилгуанин, 8-гидроксилгуанин, 5-фторурацил, 5-бромурацил, 5-хлорурацил, 5-иодурацил, 5-трифторметилурацил, 5-фторцитозин, 5-бромцитозин, 5-хлорцитозин, 5-иодцитозин, 5-трифторметилцитозин, 7-метилгуанин, 7-метиладенин, 8-азагуанин, 8-азааденин, 7-деазагуанин, 7-деазааденин, 7-деаза-8-азааденин, 3-деазагуанин, 3-деазааденин, 2-тиоурацил, 2-тиотимин и 2-тиоцитозин.

8. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4, имеющий одну из следующих гапмерных структур: 3-8-3, 4-8-2, 2-8-4, 3-8-4, 4-8-3, 4-8-4, 3-9-3, 4-9-2, 2-9-4, 4-9-3, 3-9-4, 4-9-4, 3-10-3, 2-10-4, 4-10-2, 3-10-4, 4-10-3, 4-10-4, 2-11-4, 4-11-2, 3-11-4, 4-11-3.

9. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4, где антисмысловые олигонуклеотиды связываются со 100% комплементарностью с мРНК, кодирующей TGF-R_II, и не связываются с каким-либо другим участком в транскриптоме человека.

10. Антисмысловой олигонуклеотид, выбранный из следующей группы:

Seq ID No.	Последовательность, 5'-3'
219a	Gb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb*¹
219b	Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹
220a	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb*¹
220b	Tb¹Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹Gb¹
220c	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb*¹
220d	Tb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹
220e	Tb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sdAsGb¹
221a	Tb¹sGb¹sAb¹sAb¹sdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹
221b	Tb¹Gb¹Ab¹Ab¹dUdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹
221c	Tb¹sGb¹sAb¹sAb¹sdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb*¹
221d	Tb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹
221e	Tb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹
221f	Tb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb¹sTb¹
222a	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb¹sTb*¹
222b	Ab¹Tb¹Gb¹Ab¹dAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹
222c	Ab¹Tb¹dGdAdAdTdGdGdAdCC*b¹Ab¹Gb¹Tb¹
222d	Ab⁴sTb⁴sGb⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAbsGb⁴sTb⁴
222e	Ab¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹
222f	Ab²sTb²sGb²sdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb*²
222g	Ab⁴ssTb⁴ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssAb⁴ssGb⁴ssTb⁴
223a	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAdTdGdGdAdCdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb*¹
223b	Ab¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdTssAb¹
223c	Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTAb¹
223d	Ab¹sTb¹sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb*¹
223e	Ab⁶Tb⁶Gb⁶dAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁶Tb⁶Ab⁶
223f	Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
223g	Ab⁴sTb⁴sGb⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴
223h	Ab¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹
223i	Ab¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdUssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssTb¹ssAb*¹
218y	*Cb²sAb²sTb²sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb²sAb**²
218z	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb*¹
218aa	*Cb¹ssAb¹ssTb¹ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssAb¹ssGb¹ss Tb¹ssAb**¹
218ab	*Cb*¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
218ac	*Cb*¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
218ad	*Cb⁶sAb⁶sTb⁶sdGdAdAdTdGdGdAdCdCAb⁶sGb⁶sTb⁶sAb**⁶
218ae	*Cb⁷sAb⁷sTb⁷sGb⁷sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁷sTb⁷sAb**⁷
218af	*Cbs¹Ab¹sdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdUsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb**¹
218b	*Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb**¹
218m	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb*¹
218n	*Cb*¹Ab¹Tb¹dGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdC*sAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
218o	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218p	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218q	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218c	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218r	*Cb**¹Ab¹Tb¹dGdAdAdTdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
218s	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGdAdAdTdGdGdAdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb*¹
218t	*/5SpC3s/Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb**¹
218u	*Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹/3SpC3s**/
218v	*/5SpC3s/Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹/3SpC3s**/
218ag	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218ah	*Cb⁴ssAb⁴ssTb*⁴ssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGss Tb⁴ssAb⁴
218ai	*Cb²ssAb²ssTb²ssGb**²ssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdT ssAb²
218aj	*Cb**¹Ab¹Tb¹Gb¹dAdAdUdGdGdAdCdCAb¹Gb¹Tb¹Ab¹
218ak	*Cb¹sAb¹sTb¹sGb¹sAb*¹sdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb*¹
218am	*Cb¹sAb*¹sdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsCb¹sAb¹sGb¹sTb¹sAb¹
218an	*Cb⁶sAb⁶sTb⁶sGb⁶sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁶sTb⁶sAb**⁶
218ao	*Cb⁷sAb⁷sTb*⁷sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb⁷sTb⁷sAb⁷
218ap	*Cb⁴sAb⁴sTb⁴sGb*⁴sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb*⁴
218aq	*Cb**⁴Ab⁴Tb⁴Gb⁴dAdAdTdGdGdAdCdCdAdGTb⁴Ab⁴
218ar	*Cb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb**¹
224a	*Cb¹sAb¹sTb¹sGb¹sAb¹sdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb**¹
224b	*Cb²sAb²sTb²sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb²sGb²sTb²sAb²sTb**²
224c	*Cb¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb**¹
224d	*Cb*¹sdAsdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb*¹
224e	*Cb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb¹
224f	*Cb**¹Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAGb¹Tb¹Ab¹Tb¹
224g	*Cb¹sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb**¹
224h	*Cb*¹Ab¹Tb¹Gb¹Ab¹dAdTdGdGdAdCdC*dAdGdTAb¹Tb¹
224i	*Cb¹ssAb¹ssTb¹ssGb¹ssAb¹ssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGss Tb¹ssAb¹ssTb**¹
224j	*Cb*⁴Ab⁴Tb⁴dGdAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁴Tb⁴Ab⁴Tb⁴
224k	*Cb⁶sAb⁶sTb*⁶sdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁶sAb⁶sTb⁶
224m	*Cb⁷sAb⁷sTb⁷sGb*⁷sdAdAdTdGdGdAdCdCdAsGb⁷sTb⁷sAb⁷sTb*⁷
225a	Tb¹*sCb¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb¹sGb¹sTb¹sAb¹sTb**¹
225b	Tb⁷*sCb⁷sAb⁷sTb⁷sGb**⁷sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb⁷
225c	Tb¹*sCb¹sAb¹sTb*¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb*¹
225d	Tb¹*sCb¹sAb¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb**¹
225e	Tb¹*sCb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb**¹
225f	Tb¹*Cb*¹dAdTdGdAdAdUdGdGdAdCdC*Ab¹Gb¹Tb¹Ab¹Tb¹
225g	Tb⁴*Cb**⁴Ab⁴Tb⁴sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsAb⁴Gb⁴Tb⁴Ab⁴Tb⁴
225h	Tb¹*ssCb¹ssAb*¹ssdTssdGssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAss dGssTb¹ssAb¹ssTb*¹
225i	Tb²*Cb*²Ab²dTdGdAdAdTdGdGdAdCdC*Ab²Gb²Tb²Ab²Tb²
226a	Tb¹*sCb¹sAb¹sTb¹sGb¹sdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb**¹
226b	Tb⁶*Cb**⁶Ab⁶Tb⁶Gb⁶dAdAdTdGdGdAdCdCdAGb⁶Tb⁶Ab⁶Tb⁶Tb⁶
226c	Tb¹*sCb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹sTb¹sTb**¹
226d	Tb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb*¹
226e	Tb⁴*sCb*⁴sdAsdUsdGsdAsdAsdUsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴sTb⁴sTb⁴
226f	Tb²*ssCb²ssAb²ssTb²ssGb²ssdAssdAssdTssdGssdGssdAssdCssdCssdAssdGssdTssdAssTb²ssTb**²
227a	*Cb¹sTb¹sCb¹sAb¹sTb¹sdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb*¹
227b	*Cb²sTb²sCb²sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb²sTb²sAb²sTb²sTb*²
227c	*Cb¹Tb¹Cb¹dAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGTb¹Ab¹Tb¹Tb¹
227d	*Cb¹sdUsdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsGb¹sTb¹sAb¹sTb¹sTb**¹
227e	*Cb⁴sTb⁴sCb⁴sAb⁴sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb⁴sAb⁴sTb⁴sTb*⁴
228a	Tb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sAb¹sdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsTb¹sAb¹sTb¹sTb¹sCb**¹
228b	Tb¹*Cb¹Tb¹Cb¹Ab¹dTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGTb¹Ab¹Tb¹Tb¹Cb**¹
228c	Tb⁶*sCb⁶sTb⁶sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb⁶sTb⁶sTb⁶sCb*⁶
229a	Ab¹sTb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsAb¹sTb¹sTb¹*sCb¹sTb**¹
229b	Ab¹Tb¹*Cb¹Tb¹Cb¹AdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTAb¹Tb¹Tb¹Cb**¹Tb¹
230a	Tb¹sAb¹sTb¹*sCb¹sTb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb¹sTb¹sCb¹sTb¹sAb*¹
230a	Tb¹sAb¹sTb¹*sCb¹sTb¹sdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsTb¹sTb¹sCb¹sTb¹sAb*¹
230b	Tb¹Ab¹Tb¹*Cb¹Tb¹dCdAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTdATb¹Tb¹Cb*¹Tb¹Ab¹
231a	Ab¹sTb¹sAb¹sTb¹*sCb¹sdTsdCsdAsdTsdGsdAsdAsdTsdGsdGsdAsdCsdCsdAsdGsdTsdAsdTsTb¹sCb¹sTb¹sAb¹sGb*¹
231b	Ab¹Tb¹Ab¹Tb¹*Cb¹dTdCdAdTdGdAdAdTdGdGdAdCdCdAdGdTdAdTTb¹Cb*¹Tb¹Ab¹Gb¹
232a	*Cb¹sGb*¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹*sCb**¹
232b	*Cb*¹Gb¹dTdCdAdTdAdGAb¹*Cb**¹
233a	Tb¹*sCb¹sGb*¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹*sCb¹sCb*¹
233b	Tb¹*Cb*¹Gb¹dTdCdAdTdAdGAb¹*Cb¹Cb*¹
233c	Tb¹*sCb¹sGb*¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb**¹
233d	Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb**¹
233e	Tb¹*sCb*¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*b¹
234a	Tb¹*sCb¹sGb¹sTb*¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
234b	Tb¹*Cb*¹Gb¹Tb¹dCdAdUdAdGdACb¹*Cb**¹Gb¹
234c	Tb¹*sCb¹sGb¹sTb*¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb**¹
234d	Tb¹*sCb¹sGb*¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb*¹
234e	Tb¹*sCb*¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdC*sdCsGb¹
234f	Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹*sCb¹sCb¹sGb*¹
142c	*Cb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb**¹
143i	*Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb¹sGb*¹
143j	*Cb⁴ssTb⁴ssCb⁴ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb⁴ssCb⁴ssGb**⁴
143h	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
143k	*Cb²ssTb²ssCb²ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb²*ssCb²ssGb**²
143m	*Cb¹Tb¹Cb¹Gb¹dUsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹Cb¹Cb*¹Gb¹
143n	*Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb**¹
143o	*Cb¹sTb¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsGb¹sAb¹sCb¹sCb¹sGb**¹
143p	*Cb⁶sTb⁶sCb⁶sGb⁶sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁶*sCb⁶sGb**⁶
143q	*Cb⁷sTb⁷sCb⁷sdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb⁷sCb⁷sGb**⁷
143r	*Cb⁴sTb⁴sCb⁴sGb⁴sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb⁴sGb*⁴
143s	*Cb⁴Tb⁴Cb⁴Gb⁴dTdCdAdTdAdGdAdCCb⁴Gb⁴
143t	*Cb¹ssTb¹ssCb¹ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb¹ssCb¹ssGb**¹
143u	*Cb*¹Tb¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb¹Cb**¹Gb¹
143v	*Cb*¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹Cb**¹Gb¹
143w	*Cb⁶sTb*⁶sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁶*sCb⁶sGb**⁶
143x	*Cb⁷sTb⁷sCb⁷sGb⁷sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁷sCb⁷sGb**⁷
143y	*Cb⁷sTb*⁷sdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsAb⁷*sCb⁷sCb⁷sGb*⁷
143z	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
143aa	*Cb*¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*Cb**¹Gb¹
143ab	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
143ac	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb**¹
143ad	*Cb*¹Tb¹dCdGdTdCdAdTdAdGdACb¹Cb**¹Gb¹
143ae	*Cb¹sTb*¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
143af	*/5SpC3s/Cb¹sTb*¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
143ag	*Cb¹sTb*¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹*sCb¹sGb¹/3SpC3s/**
143ah	*/5SpC3s/Cb¹sTb*¹sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb¹*sCb¹sGb¹/3SpC3s/**
143ai	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb**¹
143aj	*Cb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
145c	Gb¹*sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹sCb¹sCb**¹
235i	*Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTdCdAdTdAdGdAsCb¹sCb¹sGb¹sAb**¹
235a	*Cb¹ssTb**¹ssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdCssdCssdGssAb¹
235b	*Cb**¹Tb¹dCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGAb¹
235c	*Cb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb*¹
235d	*Cb*¹Tb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*Cb**¹Gb¹Ab¹
235e	*Cb⁴sTb⁴sCb⁴sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb*⁴
235f	*Cb⁶sTb⁶sCb⁶sdGdTdCdAdTdAdGdAdCsCb⁶sGb⁶sAb⁶
235g	*Cb¹sTb¹sCb¹sGb¹sdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹
235h	*Cb¹ssTb¹ssdCssdGssdUssdCssdAssdUssdAssdGssdAssdCssdCssGb¹ssAb**¹
144c	Gb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹*sCb¹sGb**¹
141c	Gb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹sAb**¹
141d	Gb¹*Cb¹Tb¹Cb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsC*b¹Gb¹Ab¹
141e	Gb⁴*sCb⁴sTb⁴sCb⁴sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb*⁴
141f	Gb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹
141g	Gb²*sCb²sTb*²sdCsdGsdUsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb²sGb²sAb*²
141h	Gb⁴*ssCb⁴ssTb*⁴ssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssCb⁴*ssCb⁴ssGb⁴ssAb**⁴
141i	Gb¹*Cb*¹dTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCC*b¹Gb¹Ab¹
141j	Gb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
139c	*Cb¹sGb¹sTb¹sdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdAsGb¹sCb¹sCb**¹
237a	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹*sCb¹sCb¹sGb¹sAb*¹
237b	Tb²sGb²*sCb*²sdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb²*sCb²sCb²sGb²sAb*²
237c	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
237d	Tb¹sdGsdCsdUsdCsdGsdTsdCsdAsdUsdAsdGsAb¹*sCb¹sCb¹sGb¹sAb*¹
237e	Tb¹sGb¹*sCb*¹sdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsAb¹*sCb¹sCb¹sGb¹sAb*¹
237f	Tb¹Gb¹dCdTdGdTdCdAdTdAdGdACb¹Cb**¹Gb¹Ab¹
237g	Tb¹sdGsdCsdTsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹
237h	Tb¹Gb¹*Cb¹Tb¹Cb¹dGdTdCdAdTdAdGdAdCdC*Gb¹Ab¹
237i	Tb¹ssGb¹*ssCb¹ssTb¹ssCb¹ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdC ssCb¹ssGb¹ssAb¹
237j	Tb⁴sGb⁴*sCb*⁴sdTdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁴sCb⁴sGb⁴sAb**⁴
237k	Tb⁶sGb⁶*sCb*⁶sdUsdGsdUsdCsdAsdUsdAsdGsdAsdCsCb⁶sGb⁶sAb*⁶
237m	Tb⁷sGb⁷*sCb⁷sTb*⁷sdCdGdTdCdAdTdAdGdAsCb⁷*sCb⁷sGb⁷sAb**⁷
238a	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb¹sCb¹sGb¹sAb¹sGb**¹
238b	Tb⁷sGb⁷*sCb⁷sTb⁷sCb⁷sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsdA sGb⁷
238c	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹
238d	Tb¹sGb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹
238e	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹
238f	Tb¹Gb¹dCdUdCdGdTdCdAdTdAdGdA*Cb¹Cb*¹Gb¹Ab¹Gb¹
238g	Tb⁴Gb⁴*Cb*⁴Tb⁴sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsCb⁴*Cb**⁴Gb⁴Ab⁴Gb⁴
238h	Tb¹ssGb¹*ssCb*¹ssdTssdCssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdC* ssdCssGb¹ssAb¹ssGb*¹
238i	Tb²Gb²*Cb*²dTdCdGdTdCdAdTdAdGdACb²Cb**²Gb²Ab²Gb²
239a	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb¹sCb¹sdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sCb**¹
239b	Tb⁶Gb⁶*Cb⁶Tb⁶Cb⁶dGdTdCdAdTdAdGdAdC**Cb⁶Gb⁶Ab⁶Gb⁶Cb*⁶
239c	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
239d	Tb¹sdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹sCb**¹
239e	Tb⁴sGb⁴sdCsdUsdCsdGsdUsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴sGb⁴sCb**⁴
239f	Tb²ssGb²*ssCb²ssTb²ssCb²ssdGssdTssdCssdAssdTssdAssdGssdAssdC ssdCssdGssdAssGb²ssCb**²
240a	*Cb¹sTb¹sGb¹sCb¹sTb¹sdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹*sCb**¹
240b	*Cb²sTb²sGb*²sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb²sGb²sAb²sGb²sCb**²
240c	*Cb*¹Tb¹Gb¹dCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCGb¹Ab¹Gb¹Cb**¹
240d	*Cb*¹sdUsdGsdCsdUsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsCb¹sGb¹sAb¹sGb¹*sCb**¹
240e	*Cb⁴sTb⁴sGb⁴sCb⁴sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb⁴sAb⁴sGb⁴sCb**⁴
241a	Gb¹*sCb¹sTb¹sGb¹sCb¹sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdC* sGb¹sAb¹sGb¹*sCb¹sCb*¹
241b	Gb¹*Cb¹Tb¹Gb¹Cb¹dTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCGb¹Ab¹Gb¹Cb¹Cb*¹
241c	Gb¹*sCb¹sTb¹sGb¹sCb¹sdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
242a	*Cb¹sGb¹sCb¹sTb¹sGb¹sdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAsdCsdCsdGsAb¹sGb¹*sCb¹sCb¹sCb**¹
242b	*Cb¹Gb¹Cb¹Tb¹Gb¹dCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGAb¹Gb¹Cb¹Cb¹Cb**¹
243a	*Cb¹sCb¹sGb¹sCb¹sTb*¹sdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGsdAs dCsdCsdGsdAsGb¹*sCb¹sCb¹sCb¹sCb*¹
243b	*Cb¹Cb¹Gb¹Cb*¹Tb¹dGdCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGdAGb¹*Cb¹Cb¹Cb¹Cb*¹
244a	*Cb¹sCb¹sCb¹sGb¹sCb¹sdTsdGsdCsdTsdCsdGsdTsdCsdAsdTsdAsdGs dAsdCsdCsdGsdAsdGsCb¹*sCb¹sCb¹sCb¹sCb*¹
244b	*Cb¹Cb¹Cb¹Gb¹Cb¹dTdGdCdTdCdGdTdCdAdTdAdGdAdCdCdGdAdG *Cb¹Cb¹Cb¹Cb¹Cb**¹
245a	Tb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb*¹
245b	Tb¹Ab¹dCdGdCdGdTdCCb¹Ab¹
246a	Ab¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹*sCb**¹
246b	Ab¹Tb¹Ab¹dCdGdCdGdTdC**Cb¹Ab¹Cb*¹
246c	Ab¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹*sCb**¹
246d	Ab¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹
246e	Ab¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb**¹
247a	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb**¹
247b	Gb¹Ab¹Tb¹Ab¹dCdGdCdGdUdCCb¹Ab¹Cb**¹
247c	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb**¹
247d	Gb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹*sCb**¹
247e	Gb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsC*b¹
247f	Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCb¹*sCb¹sAb¹sCb*¹
153f	*Cb¹sGb¹sAb*¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹
248a	Gb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹*sCb¹sAb**¹
248b	Gb¹Ab¹Tb¹Ab¹sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹Cb**¹Ab¹
248c	Gb⁴sAb⁴sTb⁴sAb⁴sdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb⁴sAb*⁴
248d	Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdA*sdCsAb¹
248e	Gb²sAb²sTb²sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb²sCb²sAb**²
248f	Gb⁴ssAb⁴ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssAb⁴*ssCb⁴ssAb**⁴
248g	Gb¹Ab¹dTdAdCdGdCdGdTdCCb¹Ab¹*Cb**¹Ab¹
152h	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb*¹
152i	*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹*Cb**¹Ab¹
152j	*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹*Cb**¹Ab¹
152k	*Cb⁶sGb⁶sAb⁶sTb*⁶sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb⁶sCb⁶sAb**⁶
152m	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb**¹
152n	*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹Cb**¹Ab¹
152o	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb**¹
152p	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹*sCb¹sAb**¹
152q	*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdTdCdCAb¹Cb**¹Ab¹
152r	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb¹sCb¹sAb**¹
152s	*/5SpC3s/Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb**¹
152t	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹/3SpC3s/**
152u	*/5SpC3s/Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb¹/3SpC3s/**
152v	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹*sCb¹sAb**¹
152w	*Cb⁷sGb⁷sAb*⁷sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb⁷sAb⁷sCb⁷sAb**⁷
152z	*Cb⁷sGb*⁷sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsCb⁷sAb⁷sCb⁷sAb**⁷
152aa	*Cb¹ssGb¹ssAb*¹ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssAb¹ssCb¹ssAb**¹
152ab	*Cb⁴ssGb⁴ssAb*⁴ssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAss Cb⁴ssAb**⁴
152ac	*Cb²ssGb²ssAb²ssTb**²ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssAb²
152ad	*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdUdCCb¹Ab¹*Cb**¹Ab¹
152ae	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb¹sCb¹sAb*¹
152af	*Cb¹sGb*¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsCb¹*sCb¹sAb¹sCb¹sAb*¹
152ag	*Cb⁶sGb⁶sAb*⁶sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb⁶sAb⁶*sCb⁶sAb**⁶
152ah	*Cb⁷sGb⁷sAb*⁷sdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsAb⁷*sCb⁷sAb**⁷
152ai	*Cb⁴sGb⁴sAb⁴sTb*⁴sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb⁴sAb⁴
152aj	*Cb*⁴Gb⁴Ab⁴Tb⁴dAdCdGdCdGdTdCdCdACb⁴Ab⁴
152ak	*Cb¹sGb¹sAb¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹sCb¹sAb*¹
249a	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAdCdGdCdGdTdCdCsAb¹*sCb¹sAb¹sGb**¹
249b	*Cb¹ssGb**¹ssdAssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssdAssGb¹
249c	*Cb**¹Gb¹dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAGb¹
249d	*Cb¹sGb*¹sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹
249e	*Cb*¹Gb¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹*Cb**¹Ab¹Gb¹
249f	*Cb⁴sGb⁴sAb⁴sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb**⁴
249g	*Cb*⁶Gb⁶Ab⁶dTdAdCdGdCdGdTdCdCdA*Cb**⁶Ab⁶Gb⁶
249h	*Cb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsGb¹
249i	*Cb¹ssGb¹ssdAssdUssdAssdCssdGssdCssdGssdUssdCssdCssdAssdCss Ab¹ssGb**¹
250a	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb**¹
250b	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb*¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹
250c	Gb¹sdCsdGsdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb**¹
250d	Gb¹*sCb¹sGb*¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb¹sAb¹sCb¹sAb¹sGb**¹
250e	Gb¹*Cb*¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCAb¹Cb**¹Ab¹Gb¹
250f	Gb¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb*¹
250g	Gb²*sCb²sGb*²sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsCb²sAb²*sCb²sAb²sGb**²
250h	Gb¹*Cb*¹Gb¹Ab¹Tb¹dAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹
250i	Gb¹*ssCb¹ssGb¹ssAb¹ssTb*¹ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssCb¹ssAb¹ssGb¹
250j	Gb⁴*sCb⁴sGb*⁴sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb⁴sCb⁴sAb⁴sGb**⁴
250k	Gb⁶*sCb⁶sGb*⁶sdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsCb⁶sAb⁶sGb*⁶
250m	Gb⁷*sCb⁷sGb⁷sAb*⁷sdTdAdCdGdCdGdTdCdCsAb⁷*sCb⁷sAb⁷sGb**⁷
251a	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb¹*sCb¹sAb¹sGb¹sGb**¹
251b	Gb⁷*sCb⁷sGb⁷sAb⁷sTb*⁷sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGs Gb⁷
251c	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb*¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹
251d	Gb¹*sCb¹sGb*¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb*¹
251e	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb*¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹
251f	Gb¹*Cb*¹dGdAdUdAdCdGdCdGdTdCdCAb¹C^*b¹Ab¹Gb¹Gb¹
251g	Gb⁴*Cb⁴Gb⁴Ab⁴sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsAb⁴Cb*⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴
251h	Gb¹*ssCb¹ssGb*¹ssdAssdTssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdA ssdCssAb¹ssGb¹ssGb*¹
251i	Gb²*Cb*²Gb²dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCAb²Cb**²Ab²Gb²Gb²
252a	Gb¹*sCb¹sGb¹sAb¹sTb*¹sdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb*¹
252b	Gb⁶*Cb*⁶Gb⁶Ab⁶Tb⁶dAdCdGdCdGdTdCdCdACb⁶Ab⁶Gb⁶Gb⁶Ab⁶
252c	Gb¹*sCb¹sGb*¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
252d	Gb¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
252e	Gb⁴*sCb*⁴sdGsdAsdUsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb⁴sGb⁴sAb⁴
252f	Gb²*ssCb²ssGb²ssAb²ssTb²ssdAssdCssdGssdCssdGssdTssdCssdCssdAssdCssdAssdGssGb²ssAb**²
253a	Gb¹sGb¹*sCb¹sGb¹sAb*¹sdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
253b	Gb²sGb²*sCb*²sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsCb²sAb²sGb²sGb²sAb*²
253c	Gb¹Gb¹*Cb*¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹Gb¹Ab¹
253d	Gb¹sdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdUsdCsdCsdAsCb¹sAb¹sGb¹sGb¹sAb¹
253e	Gb⁴sGb⁴*sCb⁴sGb⁴sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb⁴sGb⁴sGb⁴sAb**⁴
254a	Tb¹sGb¹sGb¹*sCGb*¹sdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsAb¹sGb¹sGb¹sAb¹*sCb**¹
254b	Tb¹Gb¹Gb¹*Cb*¹Gb¹dAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCAb¹Gb¹Gb¹Ab¹Cb**¹
254c	Tb⁶sGb⁶sGb⁶*sCb⁶sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdA sdGsGb⁶sAb⁶sCb*⁶
255a	*Cb¹sTb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdA sdCsdAsGb¹sGb¹sAb¹sCb¹sGb**¹
255b	*Cb¹Tb¹Gb¹Gb¹Cb¹dGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAGb¹Gb¹Ab¹*Cb**¹Gb¹
256a	Gb¹*sCb¹sTb¹sGb¹sGb*¹sdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb¹sAb¹*sCb¹sGb¹sAb**¹
256b	Gb¹*Cb*¹Tb¹Gb¹Gb¹dCdGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAdGGb¹Ab¹Cb**¹Gb¹Ab¹
257a	Tb¹sGb¹*sCb¹sTb¹sGb*¹sdGsdCsdGsdAsdTsdAsdCsdGsdCsdGsdTsdCsdCsdAsdCsdAsdGsGb¹sAb¹sCb¹sGb¹sAb**¹
257b	Tb¹Gb¹*Cb*¹Tb¹Gb¹dGdCdGdAdTdAdCdGdCdGdTdCdCdAdCdAdGGb¹Ab¹Cb**¹Gb¹Ab¹
258a	Gb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb*¹
258b	Gb¹sTb¹sdGsdUsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb*¹
259a	Ab¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb¹sAb*¹
259b	Ab¹Gb¹Tb¹dGdUdUdUdA*dGGb¹Gb¹Ab¹
259c	Ab¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb*¹
259d	Ab¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGsdGsAb¹
259e	Ab¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb*¹
260a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb¹sAb¹
260b	Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹dGdUdUdUdAdGGb¹Gb¹Ab¹
260c	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb¹sAb*¹
260d	Tb¹sAb¹sGb¹sdUsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb*¹
260e	Tb¹sAb¹sdGsdUsdGsdUsdUsdUsdA*sdGsdGsdGsAb¹
260f	Tb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsGb¹sGb¹sGb¹sAb¹
261a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsGb¹sGb¹sAb¹sGb*¹
261b	Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹sdGsdTsdTsdTsdA*sdGsdGGb¹Ab¹Gb¹
261c	Tb⁴sAb⁴sGb⁴sTb⁴sdGsdUsdTsdUsdAsdGsdGsdGsAb⁴sGb*⁴
261d	Tb¹sdAsdGsdUsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsdGsdA*sGb¹
261e	Tb²sAb²sGb²sdUsdGsdUsdUsdTsdAsdGsdGsGb²sAb²sGb²
261f	Tb⁴sAb⁴sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb⁴sAb⁴sGb⁴
261g	Tb¹Ab¹dGdTdGdTdTdTdA*dGGb¹Gb¹Ab¹Gb¹
262a	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGdTdTdTdAdGdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb**¹
262b	Tb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssC*b¹
262c	Tb¹sAb¹sdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb**¹
262d	Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGC*b¹
262e	Tb¹Ab¹sdGsdUsdGsdUsdTsdUsdAsdGsdGsGb¹Ab¹Gb¹*Cb**¹
262f	Tb⁴sAb⁴sGb⁴sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdsdGsdAsGb⁴*sCb**⁴
262g	Tb⁶Ab⁶Gb⁶dUdGdTdTdUdAdGdGdGAb⁶Gb⁶*Cb**⁶
262h	Tb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsC*b¹
262i	Tb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdUssdUssdUssdAssdGssdGssdGssdAssGb¹*ssCb**¹
209s	Gb¹Tb¹dAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹*Cb**¹
209t	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209u	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹*Cb**¹
209v	/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209w	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹/s3SpC3/
209x	/5SpC3s/Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹/3SpC3s/
209y	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209aa	Gb¹Tb¹dAsdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹Cb**¹
209ab	Gb¹Tb¹dAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹Gb¹Cb**¹
209ac	Gb⁶sTb⁶sdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶sGb⁶*sCb**⁶
209ad	Gb¹sTb¹sdAsdGsdUsdGsdUsdUsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209ae	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb**¹
209af	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb**¹
209ag	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹*Cb**¹
209ah	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹Cb**¹
209ai	Gb⁶sTb⁶sdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶sGb⁶sCb**⁶
209aj	Gb¹sTb¹sdAsdGsdUsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209ak	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁷sGb⁷sCb**⁷
209am	Gb⁷sTb⁷sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsdGsdGsGb⁷sAb⁷sGb⁷sCb**⁷
209an	Gb¹ssTb¹ssAb¹ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssAb¹ssGb¹ssCb**¹
209ao	Gb⁴ssTb⁴ssAb⁴ssdGssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAss Gb⁴ssCb**⁴
209ap	Gb²ssTb²ssAb²ssGb²ssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssC*b²
209aq	Gb¹Tb¹Ab¹Gb¹dUdGdUdUdUdAdGdGGb¹Ab¹Gb¹*Cb**¹
209ar	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb**¹
209as	Gb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdUsdAsdGsGb¹sGb¹sAb¹sGb¹*sCb**¹
209at	Gb⁶sTb⁶sAb⁶sGb⁶sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁶sGb⁶*sCb**⁶
209au	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sdGsdUsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb⁷sGb⁷sCb**⁷
209av	Gb⁴sTb⁴sAb⁴sGb⁴sdUsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴*sCb**⁴
209aw	Gb⁴Tb⁴Ab⁴Gb⁴dTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb⁴*Cb**⁴
209ax	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb**¹
209az	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹*sCb**¹
209ba	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹*sCb**¹
209bb	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹*sCb**¹
263a	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sTb¹sdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
263b	Gb²sTb²sAb²sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb²sAb²sGb²sCb²sCb*²
263c	Gb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
263d	Gb¹sdUsdAsdGsdUsdGsdUsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹*sCb¹sCb*¹
263e	Gb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdUsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
263f	Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGAb¹Gb¹*Cb¹Cb*¹
263g	Gb¹sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sCb¹sCb*¹
263h	Gb¹Tb¹Ab¹Gb¹Tb¹dGdTdUdTdAdGdGdGdAdGCb¹*Cb**¹
263i	Gb¹ssTb¹ssAb¹ssGb¹ssTb¹ssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssGb¹*ssCb¹ssCb*¹
263j	Gb⁴Tb⁴dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb⁴*Cb⁴Cb*⁴
263k	Gb⁶sTb⁶sAb⁶sdGsdTsdGsdUsdUsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁶sCb⁶sCb*⁶
263m	Gb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTdGdTdTdTdAdGdGdGsAb⁷sGb⁷sCb⁷sCb*⁷
264a	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb¹sAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
264b	Gb⁷sGb⁷sTb⁷sAb⁷sGb⁷sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCsCb⁷
264c	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCs *Cb**¹
264d	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdUsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsdCs *Cb**¹
264e	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb*¹
264f	Gb¹sGb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb¹sCb*¹
264g	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹*sCb¹sCb*¹
264h	Gb¹Gb¹dUdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGGb¹Ab¹Gb¹Cb¹Cb*¹
264i	Gb⁴Gb⁴Tb⁴Ab⁴dGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsGb⁴Ab⁴Gb⁴*Cb⁴Cb*⁴
264j	Gb¹ssGb¹ssTb¹ssdAssdGssdTssdGssdUssdTssdTssdAssdGssdGssdGss dAssGb¹ssCb¹ssCb*¹
264k	Gb²Gb²Tb²dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGGb²Ab²Gb²Cb²Cb*²
265a	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sGb¹sdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹sGb*¹
265b	Gb⁶Gb⁶Tb⁶Ab⁶Gb⁶dTdGdTdTdTdAdGdGdGAb⁶Gb⁶Cb⁶Cb*⁶Gb⁶
265c	Gb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsdGsCb¹sCb¹sGb**¹
265d	Gb¹sdGsdTsdAsdGsdUsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb¹sCb¹sGb*¹
265e	Gb⁴sGb⁴sdUsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴sCb⁴sCb⁴sGb*⁴
265f	Gb²ssGb²ssTb²ssAb²ssGb²ssdTssdGssdTssdTssdTssdAssdGssdGssdGssdAssdGssdCssCb²ssGb*²
266a	Tb¹sGb¹sGb¹sTb¹sAb¹sdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹sCb¹sCb¹sGb*¹
266b	Tb²sGb²sGb²sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsAb²sGb²*sCb²sCb²sGb*²
266c	Gb¹Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb¹Cb¹Cb*¹Gb¹
266d	Tb¹sdGsdGsdUsdAsdGsdTsdGsdTsdUsdTsdAsdGsdGsdGsAb¹sGb¹*sCb¹sCb¹sGb*¹
266e	Tb⁴sGb⁴sGb⁴sTb⁴sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁴*sCb⁴sCb⁴sGb*⁴
267a	Tb¹sTb¹sGb¹sGb¹sTb¹sdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb¹sCb¹sCb¹sGb¹sTb*¹
267b	Tb¹Tb¹Gb¹Gb¹Tb¹dAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAGb¹*Cb¹Cb*¹Gb¹Tb¹
267c	Tb⁶sTb⁶sGb⁶sdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdAsGb⁶*sCb⁶sCb⁶sGb⁶sTb*⁶
268a	Tb¹sTb¹sTb¹sGb¹sGb¹sdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdGsdA sdGCb¹*sCb¹sGb¹sTb¹sCb*¹
268b	Tb¹Tb¹Tb¹Gb¹Gb¹dTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGCb¹Cb¹Gb¹Tb¹Cb*¹
269a	Ab¹sTb¹sTb¹sTb¹sGb¹sdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdGsdG sdAsdGsdCsCb¹sGb¹sTb¹*sCb¹sTb**¹
269b	Ab¹Tb¹Tb¹Tb¹Gb¹dGdTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGdC**Cb¹Gb¹Tb¹Cb*¹Tb¹
270a	Tb¹sAb¹sTb¹sTb¹sTb¹sdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsdAsdGsdG sdGsdAsdGsdCsdCsGb¹sTb¹sCb¹sTb¹sTb**¹
270b	Tb¹Ab¹Tb¹Tb¹Tb¹dGdGdTdAdGdTdGdTdTdTdAdGdGdGdAdGdCdCGb¹Tb¹*Cb**¹Tb¹Tb¹
271a	Ab¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb*¹
271b	Ab¹Tb¹dTdTdGdGdTdA*Gb¹Tb¹
272a	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb*¹
272b	Tb¹Ab¹Tb¹dTdTdGdGdTdA*Gb¹Tb¹Gb¹
272c	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb*¹
272d	Tb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdA*sdGsdUsGb¹
272e	Tb¹sdAsdTsdUsdTsdGsdGsdUsdAsdGsTb¹sGb*¹
273a	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
273b	Tb¹Ab¹Tb¹dUdUdGdGdUdAGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
273c	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb*¹
273d	Tb¹sAb¹sTb¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb¹sTb*¹
273e	Tb¹sAb¹sdUsdUsdUsdGsdGsdUsdA*sdGsdUsdGsTb¹
273f	Tb¹sdAsdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
274a	*Cb*¹Tb¹Ab¹sdUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
274b	*Cb⁴sTb⁴sAb⁴sTb*⁴sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb⁴sTb⁴
274c	*Cb*¹sdUsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹
274d	*Cb²sTb²sAb*²sdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²
274e	*Cb⁴ssTb⁴ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssTb⁴ssGb⁴ssTb**⁴
274f	*Cb*¹Tb¹Ab¹dTdTdTdGdGdTdAGb¹Tb¹Gb¹Tb¹
274g	*Cb¹sTb¹sAb¹sTb*¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹
275a	*Cb¹sTb¹sAb¹sTb*¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsTb¹
275b	*Cb¹sTb*¹sdAsdUsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹
275c	*Cb⁴sTb⁴sAb⁴sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb**⁴
275d	*Cb¹ssTb**¹ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssdTssTb¹
275e	*Cb¹ssTb¹ssdAssdUssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdUssdGssTb¹ssTb**¹
275f	*Cb¹sTb¹sAb¹sTb*¹sdTdTdGdGdTdAdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹
275g	*Cb*¹Tb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹Gb¹Tb¹Tb¹
275h	*Cb*⁶Tb⁶Ab⁶dUdTdTdGdGdTdAdGdUGb⁶Tb⁶Tb⁶
275i	*Cb**¹dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTTb¹
210o	Gb¹*Cb**¹Tb¹Ab¹dTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
210p	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
210q	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb**¹
210r	Gb¹*Cb*¹Tb¹Ab¹dTdTdTdGdGdTdAdGdTGb¹Tb¹Tb¹
210s	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdUsdUsdTdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
210t	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sdUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb**¹
210u	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdUsdUsdUsdGsdGsdUsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹
210v	/5SpC3s/Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb**¹
210w	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹/3SpC3s/**
210x	/5SpC3s/Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹/3SpC3s/**
210y	Gb¹*Cb*¹Tb¹Ab¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
210z	Gb¹*Cb*¹Tb¹Ab¹sdUsdTsdTsdGsdGsdUsdAsdGsdTsGb¹Tb¹Tb¹
210aa	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb¹sTb¹sTb¹
210ab	Gb⁶*sCb⁶sTb⁶sAb*⁶sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb⁶sTb⁶sTb⁶
210ac	Gb⁶*sCb⁶sTb⁶sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb⁶sGb⁶sTb⁶sTb**⁶
210ad	Gb⁷*sCb⁷sTb*⁷sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb⁷sGb⁷sTb⁷sTb*⁷
210ae	Gb⁷*sCb*⁷sdUsdAsdTsdTsdUsdGsdGsdUsdAsdGsTb⁷sGb⁷sTb⁷sTb⁷
210af	Gb¹*ssCb¹ssTb*¹ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssGb¹ssTb¹ssTb¹
210ag	Gb⁴*ssCb⁴ssTb*⁴ssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGss Tb⁴ssTb⁴
210ah	Gb²*ssCb²ssTb²ssAb**²ssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGss dTssTb²
210ai	Gb¹*Cb**¹Tb¹Ab¹dUsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹Gb¹Tb¹Tb¹
210aj	Gb⁴*Cb**⁴Tb⁴Ab⁴dTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTdGTb⁴Tb⁴
210ak	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sTb*¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹
210am	Gb⁴*sCb⁴sTb⁴sAb*⁴sdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴
210an	Gb⁷*sCb⁷sTb*⁷sdAsdTsdTsdUsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb⁷sTb⁷sTb*⁷
210ao	Gb¹*sCb¹sdUsdAsdUsdUsdTsdGsdGsdUsdAsGb¹sTb¹sGb¹sTb¹sTb**¹
210ap	Gb¹*sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb**¹
210aq	Gb¹*sCb¹sTb¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb**¹
276a	Gb¹*sCb¹sTb¹sAb¹sTb*¹sdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
276b	Gb²*sCb²sTb*²sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²sTb²sTb²
276c	Gb¹*sCb¹sTb*¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
276d	Gb²sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb²sGb²sTb²sTb²sTb*²
276e	Gb⁶*sCb⁶sTb*⁶sdAsdUsdUsdUsdGsdGsdUsdAsdGsdUsdGsTb⁶sTb⁶sTb*⁶
276f	Gb¹sdCsdTsdAsdUsdUsdUsdGsdGsdUsdAsdGsdUsdGsTb¹sTb¹sTb¹
276g	Gb¹*Cb*¹dTdAdTdTdTdGdGdTdA*dGdTGb¹Tb¹Tb¹Tb¹
276h	Gb⁴*Cb*⁴Tb⁴Ab⁴dTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb⁴Tb⁴Tb⁴
276i	Gb¹*Cb*¹Tb¹Ab¹Tb¹dUdTdGdGdTdAdGdTdGdUTb¹Tb¹
276j	Gb¹*ssCb¹ssTb¹ssAb¹ssTb¹ssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssTb¹ssTb¹ssTb**¹
276k	Gb⁷*sCb⁷sTb⁷sAb*⁷sdTdTdTdGdGdTdAdGdTsGb⁷sTb⁷sTb⁷sTb⁷
277a	Ab¹sGb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
277b	Ab⁷sGb⁷*sCb⁷sTb⁷sAb*⁷sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb⁷
277c	Ab¹sGb¹sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb*¹
277d	Ab¹sGb¹sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb¹sGb¹sTb¹sTb¹sTb¹
277e	Ab¹Gb¹dCdTdAdUdTdTdGdGdTdAdGTb¹Gb¹Tb¹Tb¹Tb¹
277f	Ab²Gb²*Cb*²dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGTb²Gb²Tb²Tb²Tb²
277g	Ab¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb*¹
277h	Ab¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹
277i	Ab¹sGb¹*sCb*¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb*¹
277j	Ab⁴Gb⁴*Cb**⁴Tb⁴sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsTb⁴Gb⁴Tb⁴Tb⁴Tb⁴
277k	Ab¹ssGb¹*ssCb*¹ssdTssdAssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdUssdGssTb¹ssTb¹ssTb*¹
278a	Ab¹sGb¹*sCb¹sTb¹sAb*¹sdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
278b	Ab²ssGb²*ssCb²ssTb²ssAb²ssdTssdTssdTssdGssdGssdTssdAssdGssdTssdGssdTssdTssTb²ssAb**²
278c	Ab¹sdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
278d	Ab¹sdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdUsdAsdGsdUsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
278e	Ab¹sGb¹*sCb*¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
278f	Ab⁴sGb⁴sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴sTb⁴sAb*⁴
278g	Ab⁶Gb⁶*Cb*⁶Tb⁶Ab⁶dTdTdTdGdGdTdAdGdTGb⁶Tb⁶Tb⁶Tb⁶Ab⁶
279a	Gb¹sAb¹sGb¹*sCb¹sTb*¹sdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
279b	Gb²sAb²sGb²sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb²sTb²sTb²sTb²sAb*²
279c	Gb¹sdAsdGsdCsdUsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsGb¹sTb¹sTb¹sTb¹sAb¹
279d	Gb⁴sAb⁴sGb⁴*sCb⁴sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb⁴sTb⁴sTb⁴sAb**⁴
279e	Gb¹Ab¹Gb¹dC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb¹Tb¹Tb¹Ab¹
280a	Ab¹sGb¹sAb¹sGb¹*sCb¹sdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹sGb**¹
280b	Ab¹Gb¹Ab¹Gb¹*Cb**¹dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGTb¹Tb¹Tb¹Ab¹Gb¹
280c	Ab¹sGb¹sAb¹sGb¹sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsTb¹sTb¹sTb¹sAb¹sGb*¹
280d	Ab⁶sGb⁶sAb⁶sGb⁶sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb⁶sAb⁶sGb⁶
281a	Ab¹sAb¹sGb¹sAb¹sGb¹sdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsTb¹sTb¹sAb¹sGb¹sGb*¹
281b	Ab¹Ab¹Gb¹Ab¹Gb¹dC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTTb¹Tb¹Ab¹Gb¹Gb¹
282a	Gb¹sAb¹sAb¹sGb¹sAb¹sdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsTb¹sAb¹sGb¹sGb¹sGb*¹
282b	Gb¹Ab¹Ab¹Gb¹Ab¹dGdC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTdTTb¹Ab¹Gb¹Gb¹Gb¹
283a	Ab¹sGb¹sAb¹sAb¹sGb¹sdAsdGsdCsdTsdAsdTsdTsdTsdGsdGsdTsdAsdGsdTsdGsdTsdTsdTsAb¹sGb¹sGb¹sGb¹sAb*¹
283b	Ab¹Gb¹Ab¹Ab¹Gb¹dAdGdC*dTdAdTdTdTdGdGdTdAdGdTdGdTdTdTAb¹Gb¹Gb¹Gb¹Ab¹
284a	*Cb¹sAb*¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹
284b	*Cb*¹Ab¹dTdTdAdAdTdA*Ab¹Ab¹
285a	Gb¹*sCb¹sAb*¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb*¹
285b	Gb¹*sCb¹sAb*¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹
285c	Gb¹*sCb*¹sdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdA*sGb¹
285d	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb*¹
285e	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹
285f	Gb¹*Cb*¹Ab¹dTdTdAdA*dTdAAb¹Ab¹Gb¹
286a	Gb¹*sCb¹sAb¹sTb¹sdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb**¹
286b	Gb¹*sCb¹sAb¹sTb*¹sdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb*¹
286c	Gb¹*sCb¹sAb*¹sdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹
286d	Gb¹*sCb*¹sdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsdGsTb¹
286e	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb*¹
286f	Gb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
286g	Gb¹*Cb**¹Ab¹Tb¹dUdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹
287a	Gb¹sGb¹*sCb¹sAb*¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹
287b	Gb⁴sGb⁴*sCb⁴sAb*⁴sdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb⁴sTb*⁴
287c	Gb¹sdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdTsdAsdAsdA*sdGsTb¹
287d	Gb²sGb²*sCb*²sdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb²sGb²sTb²
287e	Gb¹Gb¹*Cb*¹Ab¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsdA*sAb¹Gb¹Tb¹
287f	Gb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb*¹
287g	Gb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb*¹
287h	Gb¹Gb¹dC*dAdTdTdAdAdTdAAb¹Ab¹Gb¹Tb¹
287i	Gb⁴ssGb⁴ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssAb⁴ssAb⁴ssGb⁴ssTb⁴
287j	Gb⁴ssGb⁴ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssAb⁴ssAb⁴ssGb⁴ssTb*⁴
288a	Gb¹sGb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
288b	Gb¹sGb¹sCb¹sAb¹sdTsdTsdAsdA*sdTsdAsdAsdAsdGsdTsGb¹
288c	Gb⁴sGb⁴*sCb**⁴sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴
288d	Gb¹sGb¹*sCb¹sAb¹sdTdTdAdAdTdAdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb**¹
288e	Gb¹Gb¹sdC*sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
288f	Gb¹ssGb¹ssdCssdAssdUssdUssdAssdAssdUssdAssdAssdAssdGssTb¹ssGb¹
288g	Gb¹ssGb¹ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssdTssGb¹
288h	Gb⁶Gb⁶*Cb*⁶dAdTdTdAdAdUdAdAdAGb⁶Tb⁶Gb⁶
288i	Gb¹Gb¹*Cb**¹dAdTdTdAdAdUdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
289a	Ab¹sGb¹sGb¹*sCb¹sAb*¹sdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
289b	Ab¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
289c	Ab¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
289d	Ab²sGb²sGb²sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb²sAb²sGb²sTb²sGb*²
289e	Ab¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
289f	Ab¹sdGsdGsdCsdAsdTsdUsdAsdAsdUsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
289g	Ab¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
289h	Ab¹sGb¹sGb¹*sCb*¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb*¹
289i	Ab⁶sGb⁶sGb⁶sdCsdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁶sTb⁶sGb⁶
289j	Ab¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb*¹
289k	Ab¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb*¹
289m	Ab¹Gb¹Gb¹*Cb*¹Ab¹dUdTdAdA*dTdAdAdAdGTb¹Gb¹
289n	Ab¹Gb¹dGdC*dAdTdTdAdAdTdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
289o	Ab⁴Gb⁴Gb⁴dCdAdTdTdAdAdTdAdAAb⁴Gb⁴Tb⁴Gb⁴
289p	Ab¹ssGb¹ssGb¹*ssCb¹ssAb¹ssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAss Gb¹ssTb¹ssGb**¹
289q	Ab⁷sGb⁷sGb⁷*sCb*⁷sdAdTdTdAdAdTdAdAsAb⁷sGb⁷sTb⁷sGb*⁷
213j	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
213k	*Cb¹sAb¹sGb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb**¹
213m	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
213n	*Cb*¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
213o	*/5SpC3s/Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
213p	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹/3SpC3s/
213q	*/5SpC3s/Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹/3SpC3s/
213r	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb*¹
213s	*Cb⁶sAb⁶sGb*⁶sdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAsGb⁶sTb⁶sGb⁶
213t	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAsGb¹sTb¹sGb¹
213u	*Cb*¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
213v	*Cb*¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
213w	*Cb*¹Ab¹Gb¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹Tb¹Gb¹
213x	*Cb⁷sAb⁷sGb⁷sGb*⁷sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁷sTb⁷sGb⁷
213y	*Cb⁶sAb⁶sGb⁶sGb⁶sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb⁶sTb⁶sGb**⁶
213z	*Cb⁷sAb⁷sGb*⁷sdGsdCsdAsdUsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb⁷sGb⁷sTb⁷sGb⁷
213aa	*Cb⁴sAb⁴sGb⁴sGb*⁴sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴
213ab	*Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹
213ac	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsAb¹sAb¹sGb¹sTb¹sGb*¹
213ad	*Cb¹sAb*¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹
213ae	*Cb¹ssAb¹ssGb*¹ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssAb¹ssGb¹ssTb¹ssGb¹
213af	*Cb⁴ssAb⁴ssGb*⁴ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAss dGssTb⁴ssGb⁴
213ag	*Cb²ssAb²ssGb²ssGb**²ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAss dGssdTssGb²
213ah	*Cb**¹Ab¹Gb¹Gb¹dCdAdTdTdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹
213ai	*Cb**⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴dCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb⁴Gb⁴
213aj	*Cb**¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdUdAdAdAGb¹Tb¹Gb¹
213ak	*Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb**¹
290a	*Cb¹sAb¹sGb¹sGb¹sCb¹sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹*sCb**¹
290b	*Cb¹sAb¹sGb¹sGb*¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹*sCb**¹
290c	*Cb¹sAb¹sGb¹sGb*¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹*sCb**¹
290d	*Cb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹*sCb**¹
290e	*Cb⁷sAb⁷sGb⁷sGb⁷sCb⁷sdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdG *sCb**⁷
290f	*Cb*⁴Ab⁴Gb⁴Gb⁴sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb⁴Gb⁴Tb⁴Gb⁴*Cb**⁴
290g	*Cb¹ssAb¹ssGb*¹ssdGssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdA* ssdGssTb¹ssGb¹*ssCb**¹
290h	*Cb*²Ab²Gb²dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAAb²Gb²Tb²Gb²*Cb**²
290i	*Cb*¹Ab¹dGdGdCdAdUdUdAdAdUdAdAAb¹Gb¹Tb¹Gb¹Cb**¹
291a	Ab¹*sCb¹sAb¹sGb¹sGb*¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹*sCb**¹
291b	Ab¹*sCb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹*sCb**¹
291c	Ab⁴*sCb*⁴sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb⁴sTb⁴sGb⁴*sCb**⁴
291d	Ab¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsAb¹sGb¹sTb¹sGb¹sCb**¹
291e	Ab²*ssCb²ssAb²ssGb²ssGb²ssdCssdAssdTssdTssdAssdAssdTssdAssdAssdAssdGssdTssGb²ssCb*²
291f	Ab⁶*Cb*⁶Ab⁶Gb⁶Gb⁶dCdAdTdTdAdAdTdAdAAb⁶Gb⁶Tb⁶Gb⁶*Cb**⁶
292a	Ab¹*sCb¹sAb¹sGb¹sGb*¹sdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹*sCb¹sAb**¹
292b	Ab²*sCb²sAb*²sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsGb²sTb²sGb²*sCb²sAb**²
292c	Ab¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdUsdUsdAsdAsdUsdAsdAsdAsGb¹sTb¹sGb¹*sCb¹sAb**¹
292d	Ab⁴*sCb⁴sAb⁴sGb⁴sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁴sGb⁴sCb⁴sAb*⁴
292e	Ab¹*Cb*¹Ab¹dGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb¹Gb¹*Cb**¹Ab¹
293a	Tb¹sAb¹*sCb¹sAb¹sGb*¹sdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb¹sGb¹*sCb¹sAb¹sAb**¹
293b	Tb¹Ab¹*Cb*¹Ab¹Gb¹dGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGTb¹Gb¹*Cb**¹Ab¹Ab¹
293c	Tb⁶sAb⁶*sCb⁶sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsTb⁶sGb⁶sCb⁶sAb⁶sAb*⁶
294a	Ab¹sTb¹sAb¹*sCb¹sAb*¹sdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdG sdTsGb¹*sCb¹sAb¹sAb¹sAb**¹
294b	Ab¹Tb¹Ab¹*Cb*¹Ab¹dGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTGb¹*Cb**¹Ab¹Ab¹Ab¹
295a	Tb¹sAb¹sTb¹sAb¹*sCb*¹sdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdGsCb¹sAb¹sAb¹sAb¹sTb*¹
295b	Tb¹Ab¹Tb¹Ab¹*Cb*¹dAdGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTdGC*b¹Ab¹Ab¹Ab¹Tb¹
236a	Ab¹sTb¹sAb¹sTb¹sAb¹sdCsdAsdGsdGsdCsdAsdTsdTsdAsdAsdTsdAsdAsdAsdGsdTsdGsdCsAb¹sAb¹sAb¹sTb¹sGb*¹
236b	Ab¹Tb¹Ab¹Tb¹Ab¹dCdAdGdGdCdAdTdTdAdAdTdAdAdAdGdTdGdCAb¹Ab¹Ab¹Tb¹Gb¹

где аббревиатуры b, d, C*, A*, s, ss имеют следующие значения:

b¹	β-D-окси-LNA
b²	β-D-тио-LNA
b³	β-D-амино-LNA
b⁴	α-L-окси-LNA
b⁵	β-D-ENA
b⁶	β-D-(NH)-LNA
b⁷	β-D-(NCH₃)-LNA
d	2-дезокси
C*	5-метилцитозин
A*	2-аминоаденин
s	межнуклеотидная связь представляет фосфоротиоатную группу (-O-P(O)(S^-)O)
ss	межнуклеотидная связь представляет фосфородитиоатную группу (-O-P(S)(S^-)O)
/5SpC3s/	-O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH в 5'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида
/3SpC3s/	-O-P(O)(S^-)OC₃H₆OH в 3'-концевой группе антисмыслового олигонуклеотида

нуклеотиды, выделенные жирным шрифтом, представляют нуклеотиды LNA

нуклеотиды, не выделенные жирным шрифтом, представляют нуклеотиды, которые не являются LNA, и

где антисмысловой олигонуклеотид ингибирует экспрессию TGF-R_II.

11. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4 для стимуляции регенерации и функционального восстановления поврежденных нервных путей и/или для лечения и компенсации индуцированного возрастом снижения обновления нейрональных стволовых клеток.

12. Антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4 для применения в профилактике и лечении нейродегенеративных заболеваний, нейровоспалительных расстройств, травматических или посттравматических расстройств, нейрососудистых расстройств, гипоксических расстройств, постинфекционных расстройств центральной нервной системы, фиброзных болезней, гиперпролиферативных заболеваний, рака, опухолей, пресбиакузиса и пресбиопии.

13. Антисмысловой олигонуклеотид для применения по п.12, где нейродегенеративные заболевания и нейровоспалительные расстройства выбраны из группы, состоящей из: болезни Альцгеймера, болезни Паркинсона, болезни Крейтцфельдта-Якоба, нового варианта болезни Крейтцфельдта-Якоба, болезни Галлервордена-Шпатца, болезни Гентингтона, мультисистемной атрофии, деменции, лобно-височной деменции, расстройств двигательного нейрона, бокового амиотрофического склероза, спинномозговой мышечной атрофии, спиноцеребеллярных атрофий, шизофрении, аффективных расстройств, большого депрессивного расстройства, менингоэнцефалита, бактериального менингоэнцефалита, вирусного менингоэнцефалита, аутоиммунных расстройств ЦНС, рассеянного склероза, острых ишемических/гипоксических поражений, травмы центральной нервной системы и спинного мозга, травмы головы и позвоночника, черепно-мозговых травм, артериосклероза, атеросклероза, микроангиопатической деменции, болезни Бинсвангера, дегенерации сетчатки, улитковой дегенерации, дегенерации желтого пятна, улитковой глухоты, деменции, связанной со СПИДом, пигментного ретинита, Х-сцепленного рецессивного синдрома тремора/атаксии, прогрессирующего супрануклеарного паралича, стриатонигральной дегенерации, оливопонтомозжечковой дегенерации, синдрома Шая-Дрейджера, зависящего от возраста дефицита памяти, неврологических расстройств развития, связанных с деменцией, синдрома Дауна, синуклеинопатий, мутаций супероксиддисмутазы, расстройств повторов тринуклеотида, травмы, гипоксии, сосудистых заболеваний, сосудистых воспалений и старения ЦНС, и где фиброзные болезни выбраны из группы, состоящей из: фиброза легких, кистозного фиброза, цирроза печени, эндомиокардиального фиброза, «старого» инфаркта миокарда, фиброза предсердий, фиброза средостения, миелофиброза, забрюшинного фиброза, прогрессирующего массивного фиброза, нефрогенного системного фиброза, болезни Крона, келоида, системного склероза, артрофиброза, болезни Пейрони, контрактуры Дюпюитрена и остаточных явлений после красной волчанки.

14. Фармацевтическая композиция, содержащая, по меньшей мере, один антисмысловой олигонуклеотид по любому из пп.1-4 или 10 вместе, по меньшей мере, с одним фармацевтически приемлемым носителем, эксципиентом, адъювантом, растворителем или разбавителем, где антисмысловой олигонуклеотид ингибирует экспрессию TGF-R_II.

Настоящее изобретение относится к области биотехнологии, а именно к нуклеотидной последовательности, содержащей оптимизированный для экспрессии в E. coli ген консенсусного гликопротеина вируса бешенства с SEQ ID NO: 1.

Молекулярная самособирающаяся конструкция наноразмерного диапазона на основе искусственной y-подобной днк-матрицы и белка dps // 2716575

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к области молекулярного конструирования частиц наноразмерного диапазона, а также к способам получения регулярного распределения таких частиц, и может быть использована в наноэлектронике для создания ячеек памяти высокой плотности.

Композиции и способы лечения бокового амиотрофического склероза (als) // 2716422

Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной биологии. Предложен векторный геном на основе аденоассоциированного вируса (AAV) для ингибирования или подавления экспрессии гена супероксиддисмутазы 1 (SOD1) в клетке млекопитающего, а также соответствующая частица, способ ингибирования экспрессии гена, фармацевтическая композиция, способ лечения бокового амиотрофического склероза и дуплекс siРНК.

Доставка, применение и применения в терапии систем crispr-cas и композиций для целенаправленного воздействия на нарушения и заболевания с использованием вирусных компонентов // 2716421

Настоящее изобретение относится к биотехнологии. Предложена композиция, содержащая один или несколько вирусных векторов, кодирующих систему CRISPR/Cas, для применения в лечении заболевания или расстройства мозга.

Плазмида для выявления эпителиального состояния клетки человека // 2716054

Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии и касается плазмиды для трансфекции в клетки человека для выявления их эпителиального состояния в отношении процесса эпителиально-мезенхимальной трансформации, включающей участок с нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:l промотера гена-маркера эпителиального состояния, в качестве которого используют эпителиальный кадгерин человека и по меньшей мере одну последовательность флуоресцентного белка TurboGFP, при этом участок нуклеотидной последовательности флуоресцентного белка находится под контролем промотера гена-маркера эпителиального состояния.

Плазмида для выявления мезенхимального состояния клетки // 2715643

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой плазмиду для трансфекции в клетки человека для выявления их мезенхимального состояния в отношении процесса эпителиально-мезенхимальной трансформации, включающую участок с нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:1 промотера гена-маркера мезенхимального состояния, в качестве которого используют нейрональный кадгерин человека, и по меньшей мере одну последовательность флуоресцентного белка TurboGFP, при этом участок нуклеотидной последовательности флуоресцентного белка находится под контролем промотера гена-маркера мезенхимального состояния.

Способ оценки выраженности инфекционного процесса при урогенитальной инфекции у беременных // 2715626

Изобретение относится к биотехнологии, а именно к акушерству, гинекологии, инфекционной патологии и иммунологии, и может быть использовано при прогнозировании исхода беременности при урогенитальной инфекции.

Способ оценки состояния мукозального иммунитета при урогенитальной инфекции у беременных // 2715618

Способ диагностики полиморфизма гена nhlrc2, обуславливающего генетический дефект дупликации развития крупного рогатого скота абердин-ангусской породы // 2715330

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к способам определения полиморфизма гена, ассоциированного с нежелательным рецессивным генетическим дефектом дупликации развития, характерного для крупного рогатого скота абердин-ангусской породы, а именно гена NHLRC2, ассоциированного с гаплотипом DDC.

Способ выявления днк torque teno virus рода alphatorquevirus семейства anelloviridae в крови и других биоматериалах методом пцр-рв // 2715315

Изобретение относится к области биотехнологии. Раскрыты синтетические олигонуклеотиды для выявления ДНК вируса Torque teno virus рода Alphatorquevirus семейства Anelloviridae.

Модуляция экспрессии прекалликреина (пкк) // 2712559

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид для снижения мРНК и/или белка ПКК (варианты), конъюгированное антисмысловое соединение, содержащее вышеуказанное соединение для снижения экспрессии мРНК и/или белка ПКК, композицию для предупреждения, лечения или облегчения связанного с ПКК заболевания, расстройства или состояния, применение соединения и применение композиции для предупреждения, лечения или облегчения связанного с ПКК заболевания, расстройства или состояния, применение соединения и применение композиции для лечения воспалительного заболевания или тромбоэмболического заболевания.

Способ получения активной фармацевтической субстанции для синтеза радиофармпрепарата, тропного к клеткам карциномы эрлиха // 2711645

Изобретение относится к химико-фармацевтической промышленности и касается получения активной фармацевтической субстанции на основе ДНК-аптамеров для синтеза радиофармпрепарата, тропного к клеткам карциномы Эрлиха.

Средство для лечения фиброза почек // 2711531

Настоящее изобретение относится к носителю для доставки вещества в продуцирующие внеклеточный матрикс клетки в почке, причем носитель содержит ретиноид в качестве нацеливающего агента.

Лекарственное средство // 2709015

Группа изобретений относится к медицине и касается лекарственного средства для лечения рака, включающего агонист Toll-подобного рецептора и белок LAG-3, его вариант или производное, где агонист Toll-подобного рецептора является агонистом Toll-подобного рецептора 3, и белок LAG-3, его вариант или производное является слитым белком белка LAG-3 и IgG.

Система для активации цитидиндезаминаз apobec/aid человека и/или урацил-днк-гликозилазы ung человека и ее применение для элиминации ккз днк вируса гепатита b из клеток человека, в частности из гепатоцитов // 2703532

Группа изобретений относится к области медицины, а именно к биотехнологии и генной инженерии, и может быть использована для получения системы для АРОВЕС/AID-опосредованной и/или UNG-опосредованной деградации ДНК вируса гепатита В.

Композиции и способы модулирования экспрессии пкп // 2703411

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая соединение для снижения количества РНК прекалликреина (ПКП), содержащее модифицированный олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь, модифицированный сахар или модифицированное основание, и группу конъюгата, соль вышеуказанного соединения, фармацевтическую композицию для лечения, предупреждения или облегчения протекания заболевания, расстройства или состояния, связанного с ПКП, пролекарство для снижения количества РНК прекалликреина (ПКП), применение соединения, соли, фармацевтической композиции или пролекарства для предупреждения, лечения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, связанного с ПКП.

Пептид, полученный из urlc10, и содержащая его вакцина // 2700881

Изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к иммуногенным эпитопам URLC10, и может быть использовано в медицине для лечения пациента, страдающего раком.

Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а) // 2699985

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая соединение, специфически ингибирующее экспрессию нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а), композиция для лечения, предупреждения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), содержащая терапевтически эффективное количество соединения, cпособ предупреждения, лечения, облегчения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), включающий введение животному вышеуказанного соединения или композиции.

Средство для подавления экспрессии генов, связанных с накоплением холестерина макрофагами человека // 2698199

Изобретение относится к области медицины, кардиологии и генной терапии. Предложено средство для лечения атеросклероза, представляющее собой композицию для подавления экспрессии генов IL7R, IL7, TIGIT, CXCL8, F2RL1, EIF2AK3, TSPYL2, ANXA1, DUSP1 и IL15, тесно связанных с накоплением холестерина макрофагами человека.

Сопряженные антисмысловые соединения и их применение // 2697152

Изобретение относится к области биотехнологии и медицине. Предложено соединение, сопряженное с тремя N-ацетилгалактозаминовыми лигандами.