Способ прогнозирования клинического исхода местнораспространенных форм рака шейки матки - заявка 2018104661 на патент на изобретение в РФ

Способ прогнозирования клинического исхода местнораспространенного рака шейки матки, включающий забор эпителиальных клеток из цервикального канала и наружной поверхности шейки матки, исследование полученных образцов на наличие ДНК ВПЧ высокого канцерогенного риска и определение его генотипа методом полимеразной цепной реакции, отличающийся тем, что отбирают биологические образцы с ВПЧ-отрицательным, ВПЧ 16- и ВПЧ18-позитивным РШМ II-III стадии, в ВПЧ 16/18-позитивных образцах определяют количество вирусных генов Е7 и Е2 и параллельно оценивают количество ДНК b-глобина человека: анализ проводят методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, в каждом опыте одновременно амплифицируют в нескольких повторах клинические образцы и стандартные образцы с известной концентрацией ДНК ВПЧ и ДНК β-глобина человека, определяют количество ДНК вирусных генов Е7, Е2 и клеточного гена β-глобина по калибровочным кривым, оценивают наличие интеграции ДНК вируса в геном клетки-хозяина по величине среднего значения соотношения количества гена Е7 к количеству гена Е2 (Е7/Е2) для нескольких повторов с учетом коэффициента вариации (CV) и стандартного отклонения (SD), далее методом ROC-анализа устанавливают дискриминационный уровень, разделяющий опухоли на две группы:
I - объединяет РШМ, у которых выявлено наличие интеграции ДНК ВПЧ 16 или 18 типа и ВПЧ-отрицательные РШМ,
II - ВПЧ16- и ВПЧ18-позитивые РШМ, у которых наличие интеграции ДНК вируса не выявлено, после чего классифицируют пациенток в зависимости от наличия или отсутствия вируса, наличия или отсутствия интеграции ДНК в ВПЧ 16- или ВПЧ 18-позитивных образцах, и если:
- ВПЧ ВКР не обнаружен, то прогнозируют неблагоприятный клинический исход заболевания;
- соотношение вирусных генов Е7/Е2≥1,3 при CV%≤10% или (Е7/Е2 - 2,5 SD)≥1 при CV%>10% у ВПЧ 16/18-позитивных пациенток, что соответствует наличию интеграции ДНК вируса в клеточный геном, то прогнозируют неблагоприятный клинический исход заболевания;
- соотношение вирусных генов Е7/Е2<1,3 при CV%≤10% - у ВПЧ16/18-позитивных пациенток, что соответствует отсутствию интеграции ДНК вируса в клеточный геном, то прогнозируют благоприятный клинический исход заболевания.
Наверх