Биспецифические антитела к her2 - заявка 2016144176 на патент на изобретение в РФ

1. Биспецифическое антитело к HER2, содержащее первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина и второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина, где (i) первый и второй антигенсвязывающие домены иммуноглобулина специфически связываются с разными антителосвязывающими участками HER2, (ii) первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина связывается с первым антителосвязывающим участком HER2, который содержит эпитоп в пределах домена II HER2, и (iii) первый антителосвязывающий участок HER2 отличается от антителосвязывающего участка для пертузумаба.
2. Биспецифическое антитело по п. 1, где первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина содержит вариабельную область (VH) тяжелой цепи (HC) и вариабельную область (VL) легкой цепи (LC), содержащие:
[001] (i) CDR-1 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR1), идентичную SEQ ID NO: 1 или идентичную SEQ ID NO: 1 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[002] (ii) CDR-2 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR2), идентичную SEQ ID NO: 2 или идентичную SEQ ID NO: 2 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[003] (iii) CDR-3 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR3), идентичную SEQ ID NO: 3 или идентичную SEQ ID NO: 3 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[004] (iv) CDR-1 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR1), идентичную SEQ ID NO: 4 или идентичную SEQ ID NO: 4 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[005] (v) CDR-2 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR2), идентичную SEQ ID NO: 5 или идентичную SEQ ID NO: 5 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен; и
[006] (vi) CDR-3 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR3), идентичную SEQ ID NO: 6 или идентичную SEQ ID NO: 6 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен.
3. Биспецифическое антитело к HER2, содержащее первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина и второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина, где первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина содержит VH и VL, где
(а) VH содержит аминокислоты SEQ ID NO:15 или 43;
(b) VL содержит аминокислоты SEQ ID NO:16 или 44;
и где первый и второй антигенсвязывающие домены иммуноглобулина специфически связываются с разными эпитопами HER2.
4. Биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-3, где первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина и/или второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина содержит (a) VH, дополнительно содержащую константную область тяжелой цепи или ее фрагмент, и VL, содержащую константную область легкой цепи (LC) или ее фрагмент; (b) одноцепочечный Fv ("scFv"); (c) диатело; (d) миниантитело; (e) F(abʹ)2 или (f) F(ab), или состоит из них.
5. Биспецифическое антитело к HER2 по п. 4, где (a) константная область тяжелой цепи или ее фрагмент представляет собой константную область IgG, и/или (b) константная область LC представляет собой константную область каппа-цепи или константную область лямбда-цепи.
6. Биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-5, где первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина представляет собой моноклональное антитело, гуманизированное антитело, антитело человека, химерное антитело или антитело с оптимизированной аффинностью.
7. Биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-6, где:
[007] (а) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина специфически связывается с тем же эпитопом HER2, что и антитело трастузумаб;
[008] (b) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина конкурентно ингибирует связывание антитела трастузумаба с HER2; или
[009] (c) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре, по меньшей мере пять или по меньшей мере шесть областей, определяющих комплементарность (CDR), содержащих аминокислоты любой из SEQ ID NO: 54-59.
8. Биспецифическое антитело к HER2 по п. 7, где второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина представляет собой scFv, содержащий:
[010] (i) VH-CDR1, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:54;
[011] (ii) VH-CDR2, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:55;
[012] (iii) VH-CDR3, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:56;
[013] (iv) VL-CDR1, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:57;
[014] (v) VL-CDR2, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:58; и
[015] (vi) VL-CDR3, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:59.
9. Биспецифическое антитело к HER2 по п. 7 или 8, где:
(a) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина ковалентно соединен с карбокси-концом HC первого антигенсвязывающего домена иммуноглобулина;
(b) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина ковалентно соединен с амино-концом HC первого антигенсвязывающего домена иммуноглобулина; или
(c) второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина ковалентно встроен в полипептидную цепь HC первого антигенсвязывающего домена иммуноглобулина.
10. Биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-9, где тяжелая цепь содержит константную область, содержащую Fc-домен.
11. Биспецифическое антитело к HER2 по п. 10, где Fc-домен содержит по меньшей мере одну мутацию, способную снижать или повышать ADCC-активность биспецифического антитела.
12. Биспецифическое антитело к HER2, содержащее первую и вторую полипептидные цепи, связанные друг с другом, где первая полипептидная цепь выбрана из:
(1) [TZS]-[L1]-[BVH]-[BCH]-[Fcx],
(2) [BVH]-[BCH]-[Fcx]-[L2]-[TZS],
(3) [BVH]-[BCH]-[L3]-[TZS]-[L4]-[Fcx],
где
TZs представляет собой scFv, который связывается с тем же эпитопом, что и трастузумаб;
L1, L2, L3 и L4 представляют собой пептидные линкеры;
Fcx представляет собой Fc-домен;
BVH и BCH представляют собой соответственно VH- и CH1-области антитела, способного к связыванию с эпитопом HER2, отличающимся от эпитопа, распознаваемого антителом трастузумабом;
и где вторая цепь содержит [BVL]-[CL], где BVL представляет собой VL-область антитела, способного к связыванию с эпитопом HER2, отличающимся от эпитопа, распознаваемого антителом трастузумабом, и CL представляет собой константную область легкой цепи IgG, выбранную из группы, состоящей из константной области каппа-цепи человека и константной области лямбда-цепи человека.
13. Биспецифическое антитело к HER2 по п. 12, где BVL содержит:
[016] (i) CDR-1 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR1), идентичную SEQ ID NO: 4 или идентичную SEQ ID NO: 4 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[017] (ii) CDR-2 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR2), идентичную SEQ ID NO: 5 или идентичную SEQ ID NO: 5 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен; и
[018] (iii) CDR-3 вариабельной области легкой цепи (VL-CDR3), идентичную SEQ ID NO: 6 или идентичную SEQ ID NO: 6 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[019] где [TZS] содержит
[020] (i) VH-CDR1, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:54;
[021] (ii) VH-CDR2, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:55;
[022] (iii) VH-CDR3, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:56;
[023] (iv) VL-CDR1, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:57;
[024] (v) VL-CDR2, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:58; и
[025] (vi) VL-CDR3, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:59;
[026] где [Fcx] содержит
[027] (i) по меньшей мере одну аминокислотную замену, вводящую дериватизируемую группу; и/или
[028] (ii) по меньшей мере одну мутацию, способную повышать ADCC-активность биспецифического антитела;
и где [BVH] содержит
[029] (i) CDR-1 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR1), идентичную SEQ ID NO: 1 или идентичную SEQ ID NO: 1 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен;
[030] (ii) CDR-2 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR2), идентичную SEQ ID NO: 2 или идентичную SEQ ID NO: 2 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен; и
[031] (iii) CDR-3 вариабельной области тяжелой цепи (VH-CDR3), идентичную SEQ ID NO: 3 или идентичную SEQ ID NO: 3 за исключением до 1, 2, 3 или 4 аминокислотных замен.
14. Биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-13, где биспецифическое антитело к HER2:
(a) индуцирует интернализацию при связывании с HER2-мишенью;
(b) стимулирует эффективный лизосомальный транспорт после интернализации;
(c) индуцирует разрушение HER2-мишени;
(d) блокирует индуцируемое лигандом фосфорилирование AKT в раковых клетках с низким уровнем экспрессии HER2;
(e) нарушает индуцируемую лигандом димеризацию HER2:HER3 или
(f) осуществляет комбинации этих действий.
15. Конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), содержащий биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-14 и по меньшей мере один, два, три или четыре терапевтических фрагмента и необязательно содержащий по меньшей мере один спейсер.
16. ADC по п. 15, где каждый терапевтический фрагмент химически конъюгирован с боковой цепью аминокислоты в конкретном положении в Fc-участке биспецифического антитела.
17. ADC по п. 16, где конкретные положения выбраны из группы, состоящей из 239, 248, 254, 258, 273, 279, 282, 284, 286, 287, 289, 297, 298, 312, 324, 326, 330, 335, 337, 339, 350, 355, 356, 359, 360, 361, 375, 383, 384, 389, 398, 400, 413, 415, 418, 422, 435, 440, 441, 442, 443, 446, вставки между положениями 239 и 240 и их комбинаций, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat.
18. ADC по п. 17, где конкретные положения представляют собой 239, 442 или как то, так и другое, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat.
19. ADC, содержащий биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-14, где указанное антитело содержит:
[032] (i) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO: 32A, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином в положении 239, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[033] (ii) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:33А, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотами цистеинами, соответственно находящимися в положениях 239 и 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[034] (iii) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:36А, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином в положении 239, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[035] (iv) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:37А, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотами цистеинами, соответственно находящимися в положениях 239 и 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[036] (v) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:40А, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином в положении 239, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat; или
[037] (vi) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:41А, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотами цистеинами, соответственно находящимися в положениях 239 и 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[038] (vii) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:32А или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[039] (viii) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:33C или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, и аминокислотой цистеином, находящейся в положении 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[040] (ix) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:36С или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[041] (x) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:37C или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, и аминокислотой цистеином, находящейся в положении 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat;
[042] (xi) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:4°C или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит терапевтический фрагмент, ковалентно соединенный с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat; или
[043] (xii) первую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:41C или состоящую из них, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислоты SEQ ID NO:42A или состоящую из них, где первая полипептидная цепь содержит два терапевтических фрагмента, ковалентно соединенных с аминокислотой цистеином, вставленной между положениями 239 и 240, и аминокислотой цистеином, находящейся в положении 442, где нумерация аминокислотных положений приведена согласно EU-индексу, как изложено у Kabat.
20. ADC по любому из пп. 15-19, где терапевтический фрагмент включает в себя цитотоксин, радиоактивный изотоп, иммуномодулятор, цитокин, лимфокин, хемокин, фактор роста, фактор некроза опухоли, гормон, антагонист гормона, фермент, олигонуклеотид, ДНК, РНК, siRNA, средство для RNAi, микроРНК, фотоактивное терапевтическое средство, антиангиогенное средство, проапоптозное средство, пептид, липид, углевод, хелатообразующее средство или их комбинации.
21. ADC по п. 20, где цитотоксин представляет собой тубулизин, ауристатин, майтанзиноид или пирролобензодиазепин (PBD).
22. Фармацевтическая композиция, содержащая биспецифическое антитело к HER2 по любому из пп. 1-14 или ADC по любому из пп. 15-21 и фармацевтически приемлемый носитель.
23. Способ лечения рака, характеризующегося экспрессией HER2, включающий введение биспецифического антитела к HER2 по любому из пп. 1-14, ADC по любому из пп. 15-21 или фармацевтической композиции по п. 22 субъекту, нуждающемуся в этом.
24. Способ по п. 23, где рак представляет собой рак, характеризующийся низким уровнем экспрессии HER2.
25. Способ лечения резистентности к терапевтическому средству, нацеливающемуся на HER2, включающий введение биспецифического антитела к HER2 по любому из пп. 1-14, ADC по любому из пп. 15-21 или фармацевтической композиции по п. 22 субъекту, нуждающемуся в этом.
Наверх