Антитело против igf-1r и его применение в качестве адресующего переносчика для лечения рака - заявка 2016145277 на патент на изобретение в РФ

1. Способ выбора интернализированного антитела или его интернализированного IGF-1R-связывающего фрагмента, который связывается с человеческим рецептором инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF-1R) и интернализируется после связывания с IGF-1R, где указанный способ включает этапы выбора антитела:
i) которое связывается с IGF-1R последовательности SEQ ID NO 52, и
ii) которое не связывается с IGF-1R последовательности SEQ ID NO 52, в которой аминокислота в позиции 494 отличается от гистидина или аминокислота в позиции 491 отличается от аспарагиновой кислоты.
2. Способ выбора интернализированного антитела или его интернализированного IGF-1R-связывающего фрагмента по п. 1, где указанное антитело не связывается с IGF-1R последовательности SEQ ID NO 52 с аминокислотой, отличающейся от гистидина в позиции 494, и с аминокислотой, отличающейся от аспарагиновой кислоты в позиции 491 в SEQ ID NO 52.
3. Способ по п. 1 или 2, дополнительно включающий этап выбора интернализированного антитела или его IGF-1R-связывающего фрагмента, процент интернализации которого после его связывания с IGF-1R составляет по меньшей мере 40%.
4. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент, которое связывается с человеческим рецептором инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF-1R), такое как, полученное способом по любому из пп. 1-3.
5. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент, которое связывается с человеческим рецептором инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF-1R) последовательности SEQ ID NO 52 и интернализируется после связывания с IGF-1R, и которое не связывается с IGF-1R последовательности SEQ ID NO 82 и/или SEQ ID NO 92.
6. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 5, где эпитоп указанного интернализированного антитела содержит аминокислоту гистидин в позиции 494 последовательности SEQ ID NO 52 и/или аминокислоту аспарагиновую кислоту в позиции 491 последовательности SEQ ID NO 52.
7. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 6, в котором указанный эпитоп содержит аминокислотную последовательность, состоящую по меньшей мере из 8 аминокислот.
8. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 4 или 5, процент интернализации которого после его связывания с IGF-1R составляет по меньшей мере 40%.
9. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 4 или 5, в котором указанная аминокислота в позиции 494 последовательности SEQ ID NO 52, отличающаяся от гистидина, представляет собой аргинин, и/или указанная аминокислота в позиции 491 последовательности SEQ ID NO 52, отличающаяся от аспарагиновой кислоты, представляет собой аланин.
10. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 4 или 5, отличающийся тем, что он включает шесть определяющих комплементарность участков (CDR, от англ. complementarity-determining region), где по меньшей мере один из указанных CDR выбран из группы, состоящей из: CDR-H2 последовательности SEQ ID NO 2, CDR-H3 последовательности SEQ ID NO 3 и CDR-L2 последовательности SEQ ID NO 5.
11. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 10, отличающийся тем, что он включает шесть CDR, где три из указанных CDR представляют собой CDR-H2 последовательности SEQ ID NO 2, CDR-H3 последовательности SEQ ID NO 3 и CDR-L2 последовательности SEQ ID NO 5
12. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 4 или 5, отличающийся тем, что он включает три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 1, 2 и 3, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 4, 5 и 6.
13. Интернализированное антитело или его интернализированный IGF-1R-связывающий фрагмент по п. 4 или 5, отличающийся тем, что он состоит из моноклонального антитела, рекомбинантного моноклонального антитела или его IGF-1R-связывающего фрагмента.
14. Интернализированное антитело по п. 4 или 5, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11;
b) антитело, содержащее три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 10, 5 и 11;
c) антитело, содержащее три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 12; и
d) антитело, содержащее три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 8, 2 и 3, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11.
15. Интернализированное антитело по п. 14, отличающееся тем, что оно состоит из химерного антитела.
16. Интернализированное антитело по п. 15, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 13 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 13, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11;
b) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 14 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 14, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 10, 5 и 11;
c) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 15 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 15, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 12;
d) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 16 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 16, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11; и
e) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 17 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 17, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 12.
17. Интернализированное антитело по п. 15, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 18 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 18, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3;
b) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 19 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 19, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3;
c) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 20 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 20, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3;
d) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 21 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 21, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 8, 2 и 3; и
e) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 22 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 22, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3.
18. Интернализированное антитело по п. 15, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее или состоящее из тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 23 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 23, и легкой цепи последовательности SEQ ID NO 28 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 28;
b) антитело, содержащее или состоящее из тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 24 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 24, и легкой цепи последовательности SEQ ID NO 29 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 29;
c) антитело, содержащее или состоящее из тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 25 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 25, и легкой цепи последовательности SEQ ID NO 30 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 30;
d) антитело, содержащее или состоящее из тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 26 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 26, и легкой цепи последовательности SEQ ID NO 31 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 31; и
e) антитело, содержащее или состоящее из тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 27 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 27, и легкой цепи последовательности SEQ ID NO 32 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 32.
19. Интернализированное антитело по п. 14, отличающееся тем, что оно состоит из гуманизированного антитела.
20. Интернализированное антитело по п. 19, отличающееся тем, что оно содержит:
a) тяжелую цепь, имеющую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3, соответственно, и FR1, FR2 и FR3, полученные из IGHV1-46*01 зародышевой линии человека (SEQ ID NO 44), и FR4, полученный из IGHJ4*01 зародышевой линии человека (SEQ ID NO 46); и
b) легкую цепь, имеющую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11, соответственно, и FR1, FR2 и FR3, полученные из IGKV1-39*01 зародышевой линии человека (SEQ ID NO 45), и FR4, полученный из IGKJ4*01 зародышевой линии человека (SEQ ID NO 47).
21. Интернализированное антитело по п. 20, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 33 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 33, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11;
b) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности SEQ ID NO 34 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 34, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11; и
с) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности, выбранной среди SEQ ID NO 56, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 и 80, или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 56, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 и 80, и три CDR участка легкой цепи последовательностей SEQ ID NO 9, 5 и 11.
22. Интернализированное антитело по п. 20, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 35 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 35, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3;
b) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности SEQ ID NO 36 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 36, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3; и
c) антитело, содержащее вариабельный домен легкой цепи последовательности, выбранной среди SEQ ID NO 57 и 60, или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 57 или 60, и три CDR участка тяжелой цепи последовательностей SEQ ID NO 7, 2 и 3.
23. Интернализированное антитело по п. 20, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
a) антитело, содержащее тяжелую цепь последовательности SEQ ID NO 37 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 37, и легкую цепь последовательности SEQ ID NO 39 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 39;
b) антитело, содержащее тяжелую цепь последовательности SEQ ID NO 38 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 38, и легкую цепь последовательности SEQ ID NO 40 или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 40; и
c) антитело, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи последовательности, выбранной среди SEQ ID NO 56, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 и 80, или любой последовательности, которая демонстрирует по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 56, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78 или 80, и вариабельный домен легкой цепи последовательности, выбранной среди SEQ ID NO 57 и 60, или любой последовательности, которая демонстрируют по меньшей мере 80% идентичность с SEQ ID NO 57 или 60.
24. Интернализированное антитело по п. 20, отличающееся тем, что оно включает:
a) вариабельный домен тяжелой цепи (VH) последовательности SEQ ID NO 33, где указанная последовательность SEQ ID NO 33 содержит по меньшей мере 1 обратную мутацию, выбранную среди остатков 20, 34, 35, 38, 48, 50, 59, 61, 62, 70, 72, 74, 76, 77, 79, 82 и 95; а также
b) вариабельный домен легкой цепи (VL) последовательности SEQ ID NO 35, где указанная последовательность SEQ ID NO 35 содержит по меньшей мере 1 обратную мутацию, выбранную среди остатков 22, 53, 55, 65, 71, 72, 77 и 87.
25. Интернализированное антитело по п. 4 или 5, отличающееся тем, что оно выбрано среди следующих:
i) антитело, продуцируемое гибридомой I-4757, I-4773, I-4775, I-4736 или I-4774, депонированной в CNCM, Институт Пастера, Франция, 30 мая 2013 года, 26 июня 2013, 26 июня 2013, 24 апреля 2013 и 26 июня 2013 года, соответственно,
ii) антитело, которое конкурирует за связывание IGF-1R с антителом i); и
iii) антитело, которое связывается с тем же эпитопом IGF-1R, что и антитело i).
26. Мышиная гибридома, выбранная среди гибридом I-4757, I-4773, I-4775, I-4736 или I-4774, депонированных в CNCM, Институт Пастера, Франция, 30 мая 2013 года, 26 июня 2013, 26 июня 2013, 24 апреля 2013 и 26 июня 2013 года, соответственно.
27. Интернализированное антитело или его интернализированный антигенсвязывающий фрагмент по п. 4 или 5 для применения в качестве адресующего переносчика для доставки цитотоксического агента в место-мишень хозяина, при этом указанное место-мишень хозяина состоит из эпитопа, локализованного во внеклеточном домене белка IGF-1R, предпочтительно во внеклеточном домене человеческого белка IGF-1R (SEQ ID NO 51), более предпочтительно на N-конце внеклеточного домена человеческого IGF-1R (SEQ ID NO 52), или в последовательности любого их природного варианта.
28. Конъюгат "антитело - лекарственное средство", содержащий интернализированное антитело или его интернализированный антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 4-25, конъюгированный с цитотоксическим агентом.
29. Конъюгат "антитело - лекарственное средство" по п. 28 для применения в качестве медикамента.
30. Конъюгат "антитело - лекарственное средство" для применения по п. 29 для лечения рака.
31. Конъюгат "антитело - лекарственное средство" для применения по п. 29 для лечения рака, экспрессирующего IGF-1R.
32. Фармацевтическая композиция, содержащая интернализированное антитело по любому из пп. 4-25 или конъюгат "антитело - лекарственное средство" по п. 28 и по меньшей мере эксципиент и/или фармацевтически приемлемый носитель.
33. Фармацевтическая композиция по п. 32 для применения в лечении рака.
34. Фармацевтическая композиция по п. 32 для применения в лечении рака, экспрессирующего IGF-1R.
35. Применение конъюгата "антитело - лекарственное средство" по п. 28 для лечения рака, экспрессирующего IGF-1R.
36. Способ лечения у субъекта рака, экспрессирующего IGF-1R, включающий введение указанному субъекту эффективного количества по меньшей мере конъюгата "антитело - лекарственное средство" по п. 28 или фармацевтической композиции по п. 32.
37. Способ доставки лекарственного средства или медикамента к раковой клетке, экспрессирующей IGF-1R, у субъекта, включающий введение указанному субъекту эффективного количества по меньшей мере конъюгата "антитело - лекарственное средство" по п. 28 или фармацевтической композиции по п. 32.
Наверх