Антитела и иммуноконъюгаты против gpc3 - заявка 2016150370 на патент на изобретение в РФ

1. Выделенное антитело, связывающее GPC3 человека, причем указанное антитело связывается с эпитопом, выбранным из:
a) эпитопа в пределах аминокислот 25-137 GPC3 человека;
b) эпитопа, охватывающего сайт расщепления фурином в области аминокислот R358/S359 GPC3 человека;
c) эпитопа в пределах аминокислот 420-470 GPC3 человека; и
d) эпитопа в пределах аминокислот 470-509 GPC3 человека.
2. Антитело по п. 1, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с эпитопом в области аминокислот 25-137 GPC3 человека.
3. Антитело по п. 2, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с GPC3 по меньшей мере одного вида, выбранного из яванского макака, мыши и крысы.
4. Антитело по п. 3, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с GPC3 яванского макака, мыши и крысы.
5. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, и HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5.
6. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4, HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6.
7. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9.
8. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2;
b) последовательность VL, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 3; или
c) VH согласно (а), и VL согласно (b).
9. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2;
b) последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3;
c) гуманизированную VH, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2;
d) гуманизированную последовательность VL, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 3;
e) VH согласно (а) или (с), и VL согласно (b) или (d).
10. Антитело по п. 1, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с эпитопом, охватывающим сайт расщепления фурином в области аминокислот R358/S359 GPC3 человека.
11. Антитело по п. 10, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с полноразмерным зрелым GPC3 человека, но не связывается с N-концевым фрагментом GPC3 человека, состоящим из аминокислот 25-358 SEQ ID NO: 1, и не связывается с C-концевым фрагментом GPC3 человека, состоящим из аминокислот 359-560 или аминокислот 359-580 SEQ ID NO: 1.
12. Антитело по любому из пп. 1, 10 и 11, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30, HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33, и HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29.
13. Антитело по любому из пп. 1, 10, 11 и 12, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28, HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29, и HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30.
14. Антитело по любому из пп. 1 и 10-13, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, и HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33.
15. Антитело по любому из пп. 1 и 10-14, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 26;
b) последовательность VL, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 27; или
c) VH согласно (а), и VL согласно (b).
16. Антитело по любому из пп. 1 и 10-15, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26;
b) последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;
c) гуманизированную VH, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 26;
d) гуманизированную последовательность VL, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 27; или
e) VH согласно (а) или (с), и VL согласно (b) или (d).
17. Антитело по п. 1, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с эпитопом в области аминокислот 420-470 GPC3 человека.
18. Антитело по п. 1 или 17, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с GPC3 по меньшей мере одного вида, выбранного из яванского макака, макака-резуса, мыши и крысы.
19. Антитело по п. 18, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с GPC3 яванского макака, макака-резуса, мыши и крысы.
20. Антитело по любому из пп. 1 и 17-19, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25, и HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21.
21. Антитело по любому из пп. 1 и 17-20, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, и HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22.
22. Антитело по любому из пп. 1 и 17-21, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25.
23. Антитело по любому из пп. 1 и 17-22, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18;
b) последовательность VL, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19; или
c) VH согласно (а), и VL согласно (b).
24. Антитело по любому из пп. 1 и 17-23, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18;
b) последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19;
c) гуманизированную VH, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 18;
d) гуманизированную последовательность VL, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 19; или
e) VH согласно (а) или (с), и VL согласно (b) или (d).
25. Антитело по п. 1, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с эпитопом в области аминокислот 470-509 GPC3 человека.
26. Антитело по п. 1 или 25, отличающееся тем, что указанное антитело связывается с GPC3 яванского макака.
27. Антитело по любому из пп. 1, 25 и 26, отличающееся тем, что указанное антитело не связывается с GPC3 крысы.
28. Антитело по любому из пп. 1 и 25-27, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, и HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13.
29. Антитело по любому из пп. 1 и 25-28, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14.
30. Антитело по любому из пп. 1 и 25-29, отличающееся тем, что указанное антитело содержит HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, и HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.
31. Антитело по любому из пп. 1 и 25-30, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10;
b) последовательность VL, которая по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 11; или
c) VH согласно (а), и VL согласно (b).
32. Антитело по любому из пп. 1 и 25-31, отличающееся тем, что указанное антитело содержит:
a) последовательность VH, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10;
b) последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11;
c) гуманизированную VH, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10;
d) гуманизированную последовательность VL, основанную на аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 11; или
e) VH согласно (а) или (с), и VL согласно (b) или (d).
33. Выделенное антитело, связывающееся с GPC3, причем указанное антитело содержит (а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5; (c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; и (f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9.
34. Выделенное антитело, связывающееся с GPC3, причем указанное антитело содержит (а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; (c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16; и (f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.
35. Выделенное антитело, связывающееся с GPC3, причем указанное антитело содержит (а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; (d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25.
36. Выделенное антитело, связывающееся с GPC3, причем указанное антитело содержит (а) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28; (b) HVR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29; (c) HVR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30; (d) HVR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31; (e) HVR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; и (f) HVR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33.
37. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело представляет собой моноклональное антитело.
38. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело представляет собой антитело человека, гуманизированное или химерное антитело.
39. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело представляет собой фрагмент антитела, который связывает GPC3.
40. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что GPC3 представляет собой GPC3 человека, содержащий аминокислоты 25-580 SEQ ID NO: 1.
41. Антитело по любому из предшествующих пунктов, отличающееся тем, что указанное антитело представляет собой IgG1, IgG2a или IgG2b антитело.
42. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело по любому из предшествующих пунктов.
43. Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по п. 42.
44. Способ получения антитела, включающий культивирование клетки-хозяина по п. 43, что приводит к продукции указанного антитела.
45. Иммуноконъюгат, содержащий антитело по любому из пп. 1-41 и цитотоксический агент.
46. Иммуноконъюгат по п. 45, имеющий формулу Ат-(L-D)p, где:
(а) Ат представляет собой антитело по любому из пп. 1-41;
(b) L представляет собой линкер;
(c) D представляет собой цитотоксический агент; и
(d) p находится в диапазоне от 1 до 8.
47. Иммуноконъюгат по п. 46, отличающийся тем, что указанный цитотоксический агент выбран из майтансиноида, калихеамицина, пирролбензодиазепина и производного неморубицина.
48. Иммуноконъюгат по п. 46, отличающийся тем, что D представляет собой пирролбензодиазепин Формулы А:
A;
где пунктирные линии указывают на необязательное присутствие двойной связи между C1 и C2 или C2 и C3;
R2 независимо выбрана из H, OH, =O, =CH2, CN, R, OR, =CH-RD, =C(RD)2, O-SO2-R, CO2R и COR, и дополнительно необязательно выбрана из галогена или дигалогена, где RD независимо выбрана из R, CO2R, COR, CHO, CO2H и галогена;
R6 и R9 независимо выбрана из H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRRʹ, NO2, Me3Sn и галогена;
R7 независимо выбрана из H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRRʹ, NO2, Me3Sn и атома галогена;
Q независимо выбрана из O, S и NH;
R11 представляет собой H или R или, если Q представляет собой O, SO3M, где M представляет собой катион металла;
R и Rʹ каждый независимо друг от друга выбраны из необязательно замещенной C1-8-алкильной, C3-8-гетероциклильной и C5-20-арильной групп, и необязательно связаны с группой NRRʹ, R и Rʹ совместно с атомом азота, к которому они присоединены, образуют необязательно замещенное 4-, 5-, 6- или 7-членное гетероциклическое кольцо;
R12, R16, R19 и R17 определены в соответствии с R2, R6, R9 и R7, соответственно;
R″ представляет собой C3-12-алкиленовую группу, цепь которой может прерываться одним или более гетероатомами и/или ароматическими кольцами, которые необязательно являются замещенными; и
X и Xʹ независимо выбраны из O, S и N(H).
49. Иммуноконъюгат по п. 48, отличающийся тем, что D имеет структуру:
;
где n равно 0 или 1.
50. Иммуноконъюгат по п. 46, отличающийся тем, что D представляет собой производное неморубицина.
51. Иммуноконъюгат по п. 50, отличающийся тем, что D обладает структурой, выбранной из:
; и
.
52. Иммуноконъюгат по любому из пп. 46-51, отличающийся тем, что указанный линкер представляет собой линкер с возможностью расщепления протеазой.
53. Иммуноконъюгат по любому из пп. 46-51, отличающийся тем, что указанный линкер чувствителен к кислотам.
54. Иммуноконъюгат по п. 53, отличающийся тем, что указанный линкер содержит гидразон.
55. Иммуноконъюгат по п. 46, имеющий формулу, выбранную из:
;
и
.
56. Иммуноконъюгат по любому из пп. 46-55, отличающийся тем, что p находится в диапазоне от 2 до 5.
57. Фармацевтический состав, содержащий иммуноконъюгат по любому из пп. 45-57 и фармацевтически приемлемый носитель.
58. Фармацевтический состав по п. 57, дополнительно содержащий дополнительный терапевтический агент.
59. Фармацевтический состав, содержащий антитело по любому из пп. 1-41 и фармацевтически приемлемый носитель.
60. Фармацевтический состав по п. 59, дополнительно содержащий дополнительный терапевтический агент.
61. Способ лечения индивидуума, имеющего GPC3-положительный рак, включающий введение указанному индивидууму эффективного количества антитела по любому из пп. 1-41, иммуноконъюгата по любому из пп. 45-56 или фармацевтического состава по любому из пп. 56-59.
62. Способ по п. 61, отличающийся тем, что указанный GPC3-положительный рак представляет собой рак печени.
63. Способ по п. 61 или 62, дополнительно включающий введение дополнительного терапевтического агента индивиду.
64. Способ ингибирования пролиферации GPC3-положительной клетки, включающий приведение во взаимодействие указанной клетки и антитела по любому из пп. 1-41 или иммуноконъюгата по любому из пп. 45-56 при условиях, которые допускают связывание указанного антитела или иммуноконъюгата с GPC3 на поверхности указанной клетки, что приводит к ингибированию пролиферации указанной клетки.
65. Способ по п. 64, отличающийся тем, что указанная клетка представляет собой клетку рака печени.
66. Антитело по любому из пп. 1-41, конъюгированное с меткой.
67. Антитело по п. 66, отличающееся тем, что указанная метка представляет собой излучатель позитронов.
68. Антитело по п. 67, отличающееся тем, что указанный излучатель позитронов представляет собой 89Zr.
69. Способ обнаружения GPC3 человека в биологическом образце, включающий приведение в контакт указанного биологического образца с антителом против GPC3 по любому из пп. 1-41 и 66-68 при условиях, которые допускают связывание антитела против GPC3 с встречающимся в природе GPC3 человека, и определение того, образуют ли указанное антитело против GPC3 и встречающийся в природе GPC3 человека комплекс в биологическом образце.
70. Способ по п. 69, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой образец рака печени.
71. Способ обнаружения GPC3-положительного рака, включающий (i) введение меченого антитела против GPC3 субъекту с GPC3-положительным раком или подозрением на него, где указанное меченое антитело против GPC3 содержит антитело против GPC3 по любому из пп. 1-41 и 66-68, и (ii) обнаружение указанного меченого антитела против GPC3 у указанного субъекта, причем обнаружение наличия указанного меченого антитела против GPC3 указывает на GPC3-положительный рак у субъекта.
72. Способ по п. 71, отличающийся тем, что указанное меченое антитело против GPC3 содержит антитело против GPC3, конъюгированное с излучателем позитронов.
73. Способ по п. 72, отличающийся тем, что указанный излучатель позитронов представляет собой 89Zr.
Наверх