Молекулярный диагностический комплекс для определения индивидуальных генетических особенностей злокачественных новообразований молочной железы - заявка 2016151650 на патент на изобретение в РФ

Состав и способ применения генетических маркеров и разработанных для них праймеров и зондов для определения методом количественной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени генетических особенностей злокачественных новообразований молочной железы, отличающимся тем, что набор генетических маркеров включает в себя 50 следующих генов и разработанных для них нуклеотидных последовательностей праймеров и зондов (номер, ген, нуклеотидная последовательность прямого праймера For, обратного праймера Rev, зонда Probe): 1. ANXA1 For 5’-AGCGTCAACAGATCAAAG-3’, Rev 5’-GGCTTTCTTCAGTGTTTC-3’, Probe 5’-TATCTCCAGGAAACAGGAAAGCCC-3’. 2. AR For 5’-TGCTCAAGACGCTTCTAC-3’ Rev 5’-GTGACTTGATTAGCAGGTC-3’ Probe 5’-CAAGCTCCTGGACTCCGTGC-3’ 3. ATP1A1 For 5’- GAAGCTAAAAGTTCAAAGATC-3’ Rev 5’- CACCATTTCGAATCACAA-3’ Probe 5’- AAACATGGTCCCTCAGCAAGC-3’ 4. ATP1A2 For 5’- CATGGATTCCTTCAAGAACA-3’ Rev 5’- CGTTGATCTGCATCTTCTC-3’Probe 5’- CAGCAAGCCCTTGTGATCCG-3’ 5. AURKA For 5’-CTGGCATCAAAACAGAAAA-3’ Rev 5’-GCGACCAATTTCAAAGTC-3’ Probe 5’-TCCAAAGCCCACTGCCTCTT-3’ 6. AURKB For 5’-TCTGCACTTGTCCTCATG-3’ Rev 5’-CACTGCTATTCTCCATCAC Probe 5’-TCCAATGTCCAGCCCACAGC-3’ 7. BIRC5 For 5’-CAGAGAAAGAGCCAAGAA-3’ Rev 5’-CGCAGTTTCCTCAAATTC-3’ Probe 5’-TTCTTCTTATTGTTGGTTTCCTTTGC-3’ 8. BRCA1 For 5’-CGGATACAACCTCAAAAG-3’ Rev 5’-TTGCCTTATTAACGGTATC-3’ Probe 5’-CAGATCCCAATTCAATGTAGACAGACG-3’ 9. BUB1 For 5’-GTTCCTGCAACAACAATA-3’ Rev 5’-GTTCCTGCAACAACAATA-3’ Probe 5’-CACGCCTCACTGAAACCCATTT-3’ 10. CALD1 For 5’-GGAAGAATCCTTGGGACA-3’ Rev 5’-TCCACTTGAGTGTTTGTG-3’ Probe 5’-CTCGTCAGGCACACTGTTCTG-3’ 11. CCNA2 For 5’-GAGGATATTCACACATACC-3’ Rev 5’-GGCTGTTTCTTCATGTAA-3’ Probe 5’-AGGTTTACATTTAACCTCCATTTCCCT-3’ 12. CCND1 For 5’-GAAGCTGTGCATCTACAC-3’ Rev5’- CCACTTGAGCTTGTTCAC-3’ Probe 5’-CATTTGCAGCAGCTCCTCGG-3’ 13. CCNE1 For 5’-GCTTGTTCAGGAGATGAA-3’ Rev 5’-CCAGGACACAATAGTCAG-3’ Probe 5’-AGGGCCTTCATAATCATTAATTCCATG-3’ 14. CENPA For 5’-CCAGTGTTTCTGTCAGTC-3’ Rev 5’-GCAGAATCCATTGGATCTA-3’ Probe 5’-CATGGCTCTGGAGAGTCCCC-3’ 15. CENPF For 5’-AGCAGTCCTCATCTTTTG-3’ Rev 5’-GCGTAGTTCCAACTCATTA-3’ Probe 5’-TCTTGTTTCTTAGCTCTTGATTCTGCG-3’ 16. CHEK1 For 5’-CAGAGATTCTTCCATCAAC-3’ Rev 5’-CTGGTTTAATATCCCTGTG-3’ Probe 5’-CCAATACCATGCAGATAAACCACCC-3’ 17. CKS2 For 5’-GTGTCCAACAGAGTCTAG-3’ Rev 5’-AGAGGTCGTCTAAAGAGA-3’ Probe 5’-TGATTCATGAGCCAGAACCACATATTC-3’ 18. CNKSR3 For 5’-CTGGAGGAAGTTCACTTA-3’ Rev 5’-CCCATCATAGGTTGATTTG-3’ Probe 5’-TGTACATGCCCAGGCCTTCC-3’ 19. EGFR For5’-GAGGGCAAATACAGCTTTG-3’ Rev 5’-CGTGATCTGTCACCACATA-3’ Probe 5’-CACTTCTTCACGCAGGTGGC-3’ 20. ERBB2 For 5’-CTTCCACAAGAACAACCA-3’ Rev 5’-CCCTTACACATCGGAGAA-3’ Probe 5’-ACACTGATAGACACCAACCGCT-3’ 21. ESR1 For 5’-GGCTACCATTATGGAGTC-3’ Rev 5’- GTGGCTGGACACATATAG -3’ Probe 5’-CGTTATGTCCTTGAATACTTCTCTTGA-3’ 22. ESR2 For 5’-CGACAAGGAGTTGGTACA-3’ Rev 5’-CCAACAGCTCTCCAAGAG-3’ Probe 5’-CCAAGAAGATTCCCGGCTTTGTG-3’ 23. FANCA For 5’-GACCTGAATGCCCTTTTG-3’ Rev 5’-GTCACAGTCAATCACTTTG-3’ Probe 5’-TTACACAGTGGACCTTCTACCTCAA-3’ 24. FOXO1 For 5’- GCCCTACTTCAAGGATAA-3’ Rev 5’- GACAGATTATGACGAATTGA-3’ Probe 5’- CGCCGAGCTGTTGCTGTCAC-3’ 25. G0S2 For 5’- GCGTGTCTCAGAGAAAAG-3’ Rev 5’- CGGGAATGACCTTAGTGG-3’ Probe 5’- CCCGGACGCTAAAGCGGTGC-3’ 26. GATA3 For 5’-CTGTGGGCTCTACTACAAG-3’ Rev 5’-CGGTTTCTGGTCTGGATG-3’ Probe 5’-CTTCCTTCTTCATAGTCAGGGGTCTG-3’ 27. GRB7 For 5’-GCACACACTGGTATATCC-3’ Rev 5’-CCCTGGATCTCAGGAAAG-3’ Probe 5’-AGACCTCATCCAGAACTTCCTGAATG-3’ 28. GTPBP4 For 5’-TGAGGAAGGTGTTATTAAAG-3’ Rev 5’-TCCCTTCATTTTGGTTTC-3’ Probe 5’-AGCCTATCGCAAGCCTCTGTT-3’ 29. HSPA14 For 5’-GCTGTTGTTGCTTACTCA-3’ Rev 5’-CTGCTTTACTTTCATTACTGTA-3’ Probe 5’-TTCTACTTTGTTTTGCTGCCAATCCA-3’ 30. ICAM2 For 5’-GGAAGCAGGAGTCAATGA-3’ Rev 5’-GTTGCAGTGTCAGGATGA-3’ Probe 5’-AGCGTGTACCAGCCTCCAAG-3’ 31. LGALS2 For 5’-CAACGGGAAGATCACCTG-3’ Rev 5’-CACCTTGAATTTGTCACTCTC-3’ Probe 5’-TCACTGTGAACTTGACCTCTGACC-3’ 32. LRRN1 For 5’-TCTCCAGACTTCAATTTG-3’ Rev 5’-CTGTGTAGAATTCCAGAG-3’ Probe 5’-AATAATTCATGCCACGGACCTGT-3’ 33. MAD2L1 For 5’-GGAAGCAGGAGTCAATGA-3’ Rev 5’-GTTGCAGTGTCAGGATGA-3’ Probe 5’-AGCGTGTACCAGCCTCCAAG-3’ 34. MKI67 For 5’-GTTCCAAAAGAAGAAGTG-3’ Rev5’- CACCAAGTTTTACTACATC-3’ Probe 5’-CAACAATCAGATTTGCTTCCGAAG-3’ 35. MLPH For 5’-GCCCTATCTTCTGAGAAG-3’ Rev 5’-CACTGATTTCCGATCAAA-3’ Probe 5’-TCATCTTTACCTTGACTTTTCAGGGAA-3’ 36. MTFR2 For 5’-CTCAGATTGCAGCAATTG-3’ Rev 5’-AGCTGACCCAAACTAATG-3’ Probe 5’-TCGTCACTCAAGCCAAAGGAACTA-3’ 37. MYBL2 For 5’-GGTTCTAGCCTCTCTGAA-3’ Rev 5’-GGGAGGTCAAATTTACTCA-3’ Probe 5’-CCAAGCATCAGGGTCCGACT-3’ 38. NEK2 For 5’-GGGATCTGGCTAGTGTAA-3’ Rev 5’-GAGTCATCACTCGAAGAAC-3’ Probe 5’-TTGCCTTTCCTTGGTTCCCTTTG-3’ 39. NTN4 For 5’-CTCCAGTCCTTTTCCATG-3’ Rev 5’-GGTTCTCTGTATCGTATGG-3’ Probe 5’-AGCTTTGAAAATAACCTCTCCTCCAGT-3’ 40. PCNA For 5’-CGAAGATAACGCGGATAC-3’ Rev 5’-CCATCAACTTCATTTCATAGTC-3’ Probe 5’-ACTTTCTCCTGGTTTGGTGCTTC-3’ 41. PGR For 5’-CTGTCATTATGGTGTCCTTA-3’ Rev 5’-TCCAGCACATAAGTAGTTG-3’ Probe 5’-TGCCCTTCCATTGCCCTCTTA-3’ 42. PIEZO2 For 5’-AGGTCTGCAAGAGAAGAA-3’ Rev 5’-GGTCTTCCCATTCCACAG-3’ Probe 5’-TGGATCCTTTCCGCCTTCGT-3’ 43. PTEN For 5’-GTGCTGAAAGACATTATGA-3’ Rev 5’-TGGGTTATGGTCTTCAAA-3’ Probe 5’-CCGCCAAATTTAATTGCAGAGTTG-3’ 44. RAD21 For 5’-GGATGATAATTTTGGAGAAG-3’ Rev 5’-CCGCCATCATTATTACTAA-3’ Probe 5’-TTGTCATCTAATATTCCACCATCATT-3’ 45. RAD51 For 5’-CCCAGCTCCTTTATCAAG-3’ Rev 5’-TGGCACTGTCTACAATAAG-3’ Probe 5’-AGTGCATACCTAGATTCTACCATCATG-3’ 46. TFF3 For 5’-AGTGGTCCTTTATTTCAC-3’ Rev 5’-CCTGTTTGTTCATAATGTTTA-3’ Probe 5’-ACCACTCTCGCTACTGTTCAATACTT-3’ 47. TM4SF1 For 5’-AGTGCTTGGAGGCATATG-3’ Rev 5’-CCTGGGTTGGTTCTTTTAG-3’ Probe 5’-CTGCTCTCACCAACAGCAATATGAC-3’ 48. TOP2A For 5’-CCACCAAAGATGTCAAAG-3’ Rev 5’-TGTCCACATAACTACGAA-3’ Probe 5’-CTTTCTTAATGGAAATAAACTGCCAGT-3’ 49. TTK For 5’-CTGCTTTCAGAGGAGGAA-3’ Rev 5’-CCAAGTGAACCGGAAAATG-3’ Probe 5’-AGCATCTACGGTATTAACTGCCCAA-3’ 50. ZNF439 For 5’-GTACCAAAACCCCAGGAG Rev 5’-GACTGTCTTCTTTAATTTCATTGA Probe 5’-TTCTCTTCTGTGACACTCCTGAAGTT.
Наверх