Набор или устройство для обнаружения рака желудка и способ обнаружения - заявка 2017101023 на патент на изобретение в РФ

1. Набор для обнаружения рака желудка, содержащий нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним или несколькими полинуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из следующих маркеров рака желудка: miR-4257, miR-6726-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-6787-5p, miR-6875-5p, miR-1225-3p, miR-8063, miR-6781-5p, miR-4746-3p, miR-1908-5p, miR-6756-5p, miR-204-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-6825-5p, miR-7108-5p, miR-4792, miR-7641, miR-3188, miR-3131, miR-6780b-5p, miR-8069, miR-6840-3p, miR-8072, miR-1233-5p, miR-6887-5p, miR-1231, miR-5572, miR-6738-5p, miR-6784-5p, miR-6791-5p, miR-6749-5p, miR-6741-5p, miR-128-1-5p, miR-4419b, miR-6746-5p, miR-3184-5p, miR-3679-5p, miR-7110-5p, miR-4516, miR-6717-5p, miR-6826-5p, miR-4433b-3p, miR-3679-3p, miR-3135b, miR-3622a-5p, miR-711, miR-4467, miR-6857-5p, miR-6515-3p, miR-1225-5p, miR-187-5p, miR-3185, miR-642b-3p, miR-1249, miR-744-5p, miR-4442, miR-1228-3p, miR-939-5p, miR-6845-5p, miR-887-3p, miR-7845-5p, miR-6729-5p, miR-4632-5p, miR-615-5p, miR-6724-5p, miR-4728-5p, miR-6732-5p, miR-6816-5p, miR-4695-5p, miR-6088, miR-7975, miR-3197, miR-6125, miR-4433-3p, miR-6727-5p, miR-4706, miR-7847-3p, miR-6805-3p, miR-6766-3p, miR-1913, miR-4649-5p, miR-602, miR-3663-3p, miR-6893-5p, miR-6861-5p, miR-4449, miR-6842-5p, miR-4454, miR-5195-3p, miR-663b, miR-6765-5p, miR-4513, miR-614, miR-6785-5p, miR-6777-5p, miR-940, miR-4741, miR-6870-5p, miR-6131, miR-150-3p, miR-4707-5p, miR-1915-3p, miR-3937, miR-937-5p, miR-4443, miR-1914-3p, miR-3620-5p, miR-1268b, miR-1227-5p, miR-6880-5p, miR-4417, miR-6802-5p, miR-6769a-5p, miR-663a, miR-6721-5p, miR-4532, miR-7977, miR-92b-5p, miR-371a-5p, miR-6126, miR-4734, miR-4665-3p, miR-423-5p, miR-1469, miR-4675, miR-1915-5p, miR-6716-5p, miR-718, miR-4281, miR-6820-5p, miR-6795-5p, miR-6779-5p, miR-7109-5p, miR-6798-5p, miR-4648, miR-8059, miR-6765-3p, miR-6132, miR-4492, miR-7107-5p, miR-3195, miR-3180, miR-296-3p, miR-564, miR-1268a, miR-6848-5p, miR-762, miR-2861, miR-1203, miR-1260b, miR-4476, miR-6885-5p, miR-6769b-5p, miR-23b-3p, miR-1343-5p, miR-3621, miR-4688, miR-4286, miR-4640-5p, miR-4739, miR-1260a, miR-4276, miR-7106-5p, miR-6794-5p, miR-6774-5p, miR-4707-3p, miR-4534, miR-4294, miR-6850-5p, miR-6089 и miR-671-5p.
2. Набор по п.1, в котором miR-4257 представляет собой hsa-miR-4257, miR-6726-5p представляет собой hsa-miR-6726-5p, miR-1343-3p представляет собой hsa-miR-1343-3p, miR-1247-3p представляет собой hsa-miR-1247-3p, miR-6787-5p представляет собой hsa-miR-6787-5p, miR-6875-5p представляет собой hsa-miR-6875-5p, miR-1225-3p представляет собой hsa-miR-1225-3p, miR-8063 представляет собой hsa-miR-8063, miR-6781-5p представляет собой hsa-miR-6781-5p, miR-4746-3p представляет собой hsa-miR-4746-3p, miR-1908-5p представляет собой hsa-miR-1908-5p, miR-6756-5p представляет собой hsa-miR-6756-5p, miR-204-3p представляет собой hsa-miR-204-3p, miR-4651 представляет собой hsa-miR-4651, miR-6757-5p представляет собой hsa-miR-6757-5p, miR-6825-5p представляет собой hsa-miR-6825-5p, miR-7108-5p представляет собой hsa-miR-7108-5p, miR-4792 представляет собой hsa-miR-4792, miR-7641 представляет собой hsa-miR-7641, miR-3188 представляет собой hsa-miR-3188, miR-3131 представляет собой hsa-miR-3131, miR-6780b-5p представляет собой hsa-miR-6780b-5p, miR-8069 представляет собой hsa-miR-8069, miR-6840-3p представляет собой hsa-miR-6840-3p, miR-8072 представляет собой hsa-miR-8072, miR-1233-5p представляет собой hsa-miR-1233-5p, miR-6887-5p представляет собой hsa-miR-6887-5p, miR-1231 представляет собой hsa-miR-1231, miR-5572 представляет собой hsa-miR-5572, miR-6738-5p представляет собой hsa-miR-6738-5p, miR-6784-5p представляет собой hsa-miR-6784-5p, miR-6791-5p представляет собой hsa-miR-6791-5p, miR-6749-5p представляет собой hsa-miR-6749-5p, miR-6741-5p представляет собой hsa-miR-6741-5p, miR-128-1-5p представляет собой hsa-miR-128-1-5p, miR-4419b представляет собой hsa-miR-4419b, miR-6746-5p представляет собой hsa-miR-6746-5p, miR-3184-5p представляет собой hsa-miR-3184-5p, miR-3679-5p представляет собой hsa-miR-3679-5p, miR-7110-5p представляет собой hsa-miR-7110-5p, miR-4516 представляет собой hsa-miR-4516, miR-6717-5p представляет собой hsa-miR-6717-5p, miR-6826-5p представляет собой hsa-miR-6826-5p, miR-4433b-3p представляет собой hsa-miR-4433b-3p, miR-3679-3p представляет собой hsa-miR-3679-3p, miR-3135b представляет собой hsa-miR-3135b, miR-3622a-5p представляет собой hsa-miR-3622a-5p, miR-711 представляет собой hsa-miR-711, miR-4467 представляет собой hsa-miR-4467, miR-6857-5p представляет собой hsa-miR-6857-5p, miR-6515-3p представляет собой hsa-miR-6515-3p, miR-1225-5p представляет собой hsa-miR-1225-5p, miR-187-5p представляет собой hsa-miR-187-5p, miR-3185 представляет собой hsa-miR-3185, miR-642b-3p представляет собой hsa-miR-642b-3p, miR-1249 представляет собой hsa-miR-1249, miR-744-5p представляет собой hsa-miR-744-5p, miR-4442 представляет собой hsa-miR-4442, miR-1228-3p представляет собой hsa-miR-1228-3p, miR-939-5p представляет собой hsa-miR-939-5p, miR-6845-5p представляет собой hsa-miR-6845-5p, miR-887-3p представляет собой hsa-miR-887-3p, miR-7845-5p представляет собой hsa-miR-7845-5p, miR-6729-5p представляет собой hsa-miR-6729-5p, miR-4632-5p представляет собой hsa-miR-4632-5p, miR-615-5p представляет собой hsa-miR-615-5p, miR-6724-5p представляет собой hsa-miR-6724-5p, miR-4728-5p представляет собой hsa-miR-4728-5p, miR-6732-5p представляет собой hsa-miR-6732-5p, miR-6816-5p представляет собой hsa-miR-6816-5p, miR-4695-5p представляет собой hsa-miR-4695-5p, miR-6088 представляет собой hsa-miR-6088, miR-7975 представляет собой hsa-miR-7975, miR-3197 представляет собой hsa-miR-3197, miR-6125 представляет собой hsa-miR-6125, miR-4433-3p представляет собой hsa-miR-4433-3p, miR-6727-5p представляет собой hsa-miR-6727-5p, miR-4706 представляет собой hsa-miR-4706, miR-7847-3p представляет собой hsa-miR-7847-3p, miR-6805-3p представляет собой hsa-miR-6805-3p, miR-6766-3p представляет собой hsa-miR-6766-3p, miR-1913 представляет собой hsa-miR-1913, miR-4649-5p представляет собой hsa-miR-4649-5p, miR-602 представляет собой hsa-miR-602, miR-3663-3p представляет собой hsa-miR-3663-3p, miR-6893-5p представляет собой hsa-miR-6893-5p, miR-6861-5p представляет собой hsa-miR-6861-5p, miR-4449 представляет собой hsa-miR-4449, miR-6842-5p представляет собой hsa-miR-6842-5p, miR-4454 представляет собой hsa-miR-4454, miR-5195-3p представляет собой hsa-miR-5195-3p, miR-663b представляет собой hsa-miR-663b, miR-6765-5p представляет собой hsa-miR-6765-5p, miR-4513 представляет собой hsa-miR-4513, miR-614 представляет собой hsa-miR-614, miR-6785-5p представляет собой hsa-miR-6785-5p, miR-6777-5p представляет собой hsa-miR-6777-5p, miR-940 представляет собой hsa-miR-940, miR-4741 представляет собой hsa-miR-4741, miR-6870-5p представляет собой hsa-miR-6870-5p, miR-6131 представляет собой hsa-miR-6131, miR-150-3p представляет собой hsa-miR-150-3p, miR-4707-5p представляет собой hsa-miR-4707-5p, miR-1915-3p представляет собой hsa-miR-1915-3p, miR-3937 представляет собой hsa-miR-3937, miR-937-5p представляет собой hsa-miR-937-5p, miR-4443 представляет собой hsa-miR-4443, miR-1914-3p представляет собой hsa-miR-1914-3p, miR-3620-5p представляет собой hsa-miR-3620-5p, miR-1268b представляет собой hsa-miR-1268b, miR-1227-5p представляет собой hsa-miR-1227-5p, miR-6880-5p представляет собой hsa-miR-6880-5p, miR-4417 представляет собой hsa-miR-4417, miR-6802-5p представляет собой hsa-miR-6802-5p, miR-6769a-5p представляет собой hsa-miR-6769a-5p, miR-663a представляет собой hsa-miR-663a, miR-6721-5p представляет собой hsa-miR-6721-5p, miR-4532 представляет собой hsa-miR-4532, miR-7977 представляет собой hsa-miR-7977, miR-92b-5p представляет собой hsa-miR-92b-5p, miR-371a-5p представляет собой hsa-miR-371a-5p, miR-6126 представляет собой hsa-miR-6126, miR-4734 представляет собой hsa-miR-4734, miR-4665-3p представляет собой hsa-miR-4665-3p, miR-423-5p представляет собой hsa-miR-423-5p, miR-1469 представляет собой hsa-miR-1469, miR-4675 представляет собой hsa-miR-4675, miR-1915-5p представляет собой hsa-miR-1915-5p, miR-6716-5p представляет собой hsa-miR-6716-5p, miR-718 представляет собой hsa-miR-718, miR-4281 представляет собой hsa-miR-4281, miR-6820-5p представляет собой hsa-miR-6820-5p, miR-6795-5p представляет собой hsa-miR-6795-5p, miR-6779-5p представляет собой hsa-miR-6779-5p, miR-7109-5p представляет собой hsa-miR-7109-5p, miR-6798-5p представляет собой hsa-miR-6798-5p, miR-4648 представляет собой hsa-miR-4648, miR-8059 представляет собой hsa-miR-8059, miR-6765-3p представляет собой hsa-miR-6765-3p, miR-6132 представляет собой hsa-miR-6132, miR-4492 представляет собой hsa-miR-4492, miR-7107-5p представляет собой hsa-miR-7107-5p, miR-3195 представляет собой hsa-miR-3195, miR-3180 представляет собой hsa-miR-3180, miR-296-3p представляет собой hsa-miR-296-3p, miR-564 представляет собой hsa-miR-564, miR-1268a представляет собой hsa-miR-1268a, miR-6848-5p представляет собой hsa-miR-6848-5p, miR-762 представляет собой hsa-miR-762, miR-2861 представляет собой hsa-miR-2861, miR-1203 представляет собой hsa-miR-1203, miR-1260b представляет собой hsa-miR-1260b, miR-4476 представляет собой hsa-miR-4476, miR-6885-5p представляет собой hsa-miR-6885-5p, miR-6769b-5p представляет собой hsa-miR-6769b-5p, miR-23b-3p представляет собой hsa-miR-23b-3p, miR-1343-5p представляет собой hsa-miR-1343-5p, miR-3621 представляет собой hsa-miR-3621, miR-4688 представляет собой hsa-miR-4688, miR-4286 представляет собой hsa-miR-4286, miR-4640-5p представляет собой hsa-miR-4640-5p, miR-4739 представляет собой hsa-miR-4739, miR-1260a представляет собой hsa-miR-1260a, miR-4276 представляет собой hsa-miR-4276, miR-7106-5p представляет собой hsa-miR-7106-5p, miR-6794-5p представляет собой hsa-miR-6794-5p, miR-6774-5p представляет собой hsa-miR-6774-5p, miR-4707-3p представляет собой hsa-miR-4707-3p, miR-4534 представляет собой hsa-miR-4534, miR-4294 представляет собой hsa-miR-4294, miR-6850-5p представляет собой hsa-miR-6850-5p, miR-6089 представляет собой hsa-miR-6089 и miR-671-5p представляет собой hsa-miR-671-5p.
3. Набор по п.1, в котором нуклеиновая кислота представляет собой полинуклеотид, выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (a)-(e):
(a) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(b) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642,
(c) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(d) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, и
(e) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (a)-(d).
4. Набор по любому из пп.1-3, где набор дополнительно содержит нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним или несколькими полинуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из следующих других маркеров рака желудка: miR-128-2-5p, miR-125a-3p, miR-92a-2-5p, miR-486-3p, miR-3196, miR-211-3p, miR-4271, miR-6851-5p, miR-149-3p, miR-4667-5p, miR-135a-3p, miR-4486, miR-4697-5p, miR-4725-3p, miR-6510-5p, miR-5001-5p, miR-4673, miR-4466, miR-23a-3p, miR-3656, miR-6782-5p, miR-4689, miR-451a, miR-4446-3p, miR-3180-3p, miR-642a-3p, miR-6889-5p, miR-3178, miR-4665-5p, miR-6722-3p, miR-30c-1-3p, miR-4507, miR-3141 и miR-1199-5p.
5. Набор по п.4, в котором miR-128-2-5p представляет собой hsa-miR-128-2-5p, miR-125a-3p представляет собой hsa-miR-125a-3p, miR-92a-2-5p представляет собой hsa-miR-92a-2-5p, miR-486-3p представляет собой hsa-miR-486-3p, miR-3196 представляет собой hsa-miR-3196, miR-211-3p представляет собой hsa-miR-211-3p, miR-4271 представляет собой hsa-miR-4271, miR-6851-5p представляет собой hsa-miR-6851-5p, miR-149-3p представляет собой hsa-miR-149-3p, miR-4667-5p представляет собой hsa-miR-4667-5p, miR-135a-3p представляет собой hsa-miR-135a-3p, miR-4486 представляет собой hsa-miR-4486, miR-4697-5p представляет собой hsa-miR-4697-5p, miR-4725-3p представляет собой hsa-miR-4725-3p, miR-6510-5p представляет собой hsa-miR-6510-5p, miR-5001-5p представляет собой hsa-miR-5001-5p, miR-4673 представляет собой hsa-miR-4673, miR-4466 представляет собой hsa-miR-4466, miR-23a-3p представляет собой hsa-miR-23a-3p, miR-3656 представляет собой hsa-miR-3656, miR-6782-5p представляет собой hsa-miR-6782-5p, miR-4689 представляет собой hsa-miR-4689, miR-451a представляет собой hsa-miR-451a, miR-4446-3p представляет собой hsa-miR-4446-3p, miR-3180-3p представляет собой hsa-miR-3180-3p, miR-642a-3p представляет собой hsa-miR-642a-3p, miR-6889-5p представляет собой hsa-miR-6889-5p, miR-3178 представляет собой hsa-miR-3178, miR-4665-5p представляет собой hsa-miR-4665-5p, miR-6722-3p представляет собой hsa-miR-6722-3p, miR-30c-1-3p представляет собой hsa-miR-30c-1-3p, miR-4507 представляет собой hsa-miR-4507, miR-3141 представляет собой hsa-miR-3141 и miR-1199-5p представляет собой hsa-miR-1199-5p.
6. Набор по п.4, в котором нуклеиновая кислота представляет собой полинуклеотид, выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (f)-(o):
(f) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(g) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 166-169,
(h) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(i) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t,
(j) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (f)-(i),
(k) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(l) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 170-199,
(m) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(n) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, и
(o) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (k)-(n).
7. Набор по любому из пп.1-3, где набор содержит по меньшей мере две или более нуклеиновых кислоты, способных специфически связываться по меньшей мере с двумя или более полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака желудка по п.1 или 2.
8. Набор по п.4, где набор содержит по меньшей мере две или более нуклеиновых кислоты, способных специфически связываться по меньшей мере с двумя или более полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака желудка по п.1.
9. Устройство для обнаружения рака желудка, содержащее нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним или несколькими полинуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из следующих маркеров рака желудка: miR-4257, miR-6726-5p, miR-1343-3p, miR-1247-3p, miR-6787-5p, miR-6875-5p, miR-1225-3p, miR-8063, miR-6781-5p, miR-4746-3p, miR-1908-5p, miR-6756-5p, miR-204-3p, miR-4651, miR-6757-5p, miR-6825-5p, miR-7108-5p, miR-4792, miR-7641, miR-3188, miR-3131, miR-6780b-5p, miR-8069, miR-6840-3p, miR-8072, miR-1233-5p, miR-6887-5p, miR-1231, miR-5572, miR-6738-5p, miR-6784-5p, miR-6791-5p, miR-6749-5p, miR-6741-5p, miR-128-1-5p, miR-4419b, miR-6746-5p, miR-3184-5p, miR-3679-5p, miR-7110-5p, miR-4516, miR-6717-5p, miR-6826-5p, miR-4433b-3p, miR-3679-3p, miR-3135b, miR-3622a-5p, miR-711, miR-4467, miR-6857-5p, miR-6515-3p, miR-1225-5p, miR-187-5p, miR-3185, miR-642b-3p, miR-1249, miR-744-5p, miR-4442, miR-1228-3p, miR-939-5p, miR-6845-5p, miR-887-3p, miR-7845-5p, miR-6729-5p, miR-4632-5p, miR-615-5p, miR-6724-5p, miR-4728-5p, miR-6732-5p, miR-6816-5p, miR-4695-5p, miR-6088, miR-7975, miR-3197, miR-6125, miR-4433-3p, miR-6727-5p, miR-4706, miR-7847-3p, miR-6805-3p, miR-6766-3p, miR-1913, miR-4649-5p, miR-602, miR-3663-3p, miR-6893-5p, miR-6861-5p, miR-4449, miR-6842-5p, miR-4454, miR-5195-3p, miR-663b, miR-6765-5p, miR-4513, miR-614, miR-6785-5p, miR-6777-5p, miR-940, miR-4741, miR-6870-5p, miR-6131, miR-150-3p, miR-4707-5p, miR-1915-3p, miR-3937, miR-937-5p, miR-4443, miR-1914-3p, miR-3620-5p, miR-1268b, miR-1227-5p, miR-6880-5p, miR-4417, miR-6802-5p, miR-6769a-5p, miR-663a, miR-6721-5p, miR-4532, miR-7977, miR-92b-5p, miR-371a-5p, miR-6126, miR-4734, miR-4665-3p, miR-423-5p, miR-1469, miR-4675, miR-1915-5p, miR-6716-5p, miR-718, miR-4281, miR-6820-5p, miR-6795-5p, miR-6779-5p, miR-7109-5p, miR-6798-5p, miR-4648, miR-8059, miR-6765-3p, miR-6132, miR-4492, miR-7107-5p, miR-3195, miR-3180, miR-296-3p, miR-564, miR-1268a, miR-6848-5p, miR-762, miR-2861, miR-1203, miR-1260b, miR-4476, miR-6885-5p, miR-6769b-5p, miR-23b-3p, miR-1343-5p, miR-3621, miR-4688, miR-4286, miR-4640-5p, miR-4739, miR-1260a, miR-4276, miR-7106-5p, miR-6794-5p, miR-6774-5p, miR-4707-3p, miR-4534, miR-4294, miR-6850-5p, miR-6089 и miR-671-5p.
10. Устройство по п.9, в котором miR-4257 представляет собой hsa-miR-4257, miR-6726-5p представляет собой hsa-miR-6726-5p, miR-1343-3p представляет собой hsa-miR-1343-3p, miR-1247-3p представляет собой hsa-miR-1247-3p, miR-6787-5p представляет собой hsa-miR-6787-5p, miR-6875-5p представляет собой hsa-miR-6875-5p, miR-1225-3p представляет собой hsa-miR-1225-3p, miR-8063 представляет собой hsa-miR-8063, miR-6781-5p представляет собой hsa-miR-6781-5p, miR-4746-3p представляет собой hsa-miR-4746-3p, miR-1908-5p представляет собой hsa-miR-1908-5p, miR-6756-5p представляет собой hsa-miR-6756-5p, miR-204-3p представляет собой hsa-miR-204-3p, miR-4651 представляет собой hsa-miR-4651, miR-6757-5p представляет собой hsa-miR-6757-5p, miR-6825-5p представляет собой hsa-miR-6825-5p, miR-7108-5p представляет собой hsa-miR-7108-5p, miR-4792 представляет собой hsa-miR-4792, miR-7641 представляет собой hsa-miR-7641, miR-3188 представляет собой hsa-miR-3188, miR-3131 представляет собой hsa-miR-3131, miR-6780b-5p представляет собой hsa-miR-6780b-5p, miR-8069 представляет собой hsa-miR-8069, miR-6840-3p представляет собой hsa-miR-6840-3p, miR-8072 представляет собой hsa-miR-8072, miR-1233-5p представляет собой hsa-miR-1233-5p, miR-6887-5p представляет собой hsa-miR-6887-5p, miR-1231 представляет собой hsa-miR-1231, miR-5572 представляет собой hsa-miR-5572, miR-6738-5p представляет собой hsa-miR-6738-5p, miR-6784-5p представляет собой hsa-miR-6784-5p, miR-6791-5p представляет собой hsa-miR-6791-5p, miR-6749-5p представляет собой hsa-miR-6749-5p, miR-6741-5p представляет собой hsa-miR-6741-5p, miR-128-1-5p представляет собой hsa-miR-128-1-5p, miR-4419b представляет собой hsa-miR-4419b, miR-6746-5p представляет собой hsa-miR-6746-5p, miR-3184-5p представляет собой hsa-miR-3184-5p, miR-3679-5p представляет собой hsa-miR-3679-5p, miR-7110-5p представляет собой hsa-miR-7110-5p, miR-4516 представляет собой hsa-miR-4516, miR-6717-5p представляет собой hsa-miR-6717-5p, miR-6826-5p представляет собой hsa-miR-6826-5p, miR-4433b-3p представляет собой hsa-miR-4433b-3p, miR-3679-3p представляет собой hsa-miR-3679-3p, miR-3135b представляет собой hsa-miR-3135b, miR-3622a-5p представляет собой hsa-miR-3622a-5p, miR-711 представляет собой hsa-miR-711, miR-4467 представляет собой hsa-miR-4467, miR-6857-5p представляет собой hsa-miR-6857-5p, miR-6515-3p представляет собой hsa-miR-6515-3p, miR-1225-5p представляет собой hsa-miR-1225-5p, miR-187-5p представляет собой hsa-miR-187-5p, miR-3185 представляет собой hsa-miR-3185, miR-642b-3p представляет собой hsa-miR-642b-3p, miR-1249 представляет собой hsa-miR-1249, miR-744-5p представляет собой hsa-miR-744-5p, miR-4442 представляет собой hsa-miR-4442, miR-1228-3p представляет собой hsa-miR-1228-3p, miR-939-5p представляет собой hsa-miR-939-5p, miR-6845-5p представляет собой hsa-miR-6845-5p, miR-887-3p представляет собой hsa-miR-887-3p, miR-7845-5p представляет собой hsa-miR-7845-5p, miR-6729-5p представляет собой hsa-miR-6729-5p, miR-4632-5p представляет собой hsa-miR-4632-5p, miR-615-5p представляет собой hsa-miR-615-5p, miR-6724-5p представляет собой hsa-miR-6724-5p, miR-4728-5p представляет собой hsa-miR-4728-5p, miR-6732-5p представляет собой hsa-miR-6732-5p, miR-6816-5p представляет собой hsa-miR-6816-5p, miR-4695-5p представляет собой hsa-miR-4695-5p, miR-6088 представляет собой hsa-miR-6088, miR-7975 представляет собой hsa-miR-7975, miR-3197 представляет собой hsa-miR-3197, miR-6125 представляет собой hsa-miR-6125, miR-4433-3p представляет собой hsa-miR-4433-3p, miR-6727-5p представляет собой hsa-miR-6727-5p, miR-4706 представляет собой hsa-miR-4706, miR-7847-3p представляет собой hsa-miR-7847-3p, miR-6805-3p представляет собой hsa-miR-6805-3p, miR-6766-3p представляет собой hsa-miR-6766-3p, miR-1913 представляет собой hsa-miR-1913, miR-4649-5p представляет собой hsa-miR-4649-5p, miR-602 представляет собой hsa-miR-602, miR-3663-3p представляет собой hsa-miR-3663-3p, miR-6893-5p представляет собой hsa-miR-6893-5p, miR-6861-5p представляет собой hsa-miR-6861-5p, miR-4449 представляет собой hsa-miR-4449, miR-6842-5p представляет собой hsa-miR-6842-5p, miR-4454 представляет собой hsa-miR-4454, miR-5195-3p представляет собой hsa-miR-5195-3p, miR-663b представляет собой hsa-miR-663b, miR-6765-5p представляет собой hsa-miR-6765-5p, miR-4513 представляет собой hsa-miR-4513, miR-614 представляет собой hsa-miR-614, miR-6785-5p представляет собой hsa-miR-6785-5p, miR-6777-5p представляет собой hsa-miR-6777-5p, miR-940 представляет собой hsa-miR-940, miR-4741 представляет собой hsa-miR-4741, miR-6870-5p представляет собой hsa-miR-6870-5p, miR-6131 представляет собой hsa-miR-6131, miR-150-3p представляет собой hsa-miR-150-3p, miR-4707-5p представляет собой hsa-miR-4707-5p, miR-1915-3p представляет собой hsa-miR-1915-3p, miR-3937 представляет собой hsa-miR-3937, miR-937-5p представляет собой hsa-miR-937-5p, miR-4443 представляет собой hsa-miR-4443, miR-1914-3p представляет собой hsa-miR-1914-3p, miR-3620-5p представляет собой hsa-miR-3620-5p, miR-1268b представляет собой hsa-miR-1268b, miR-1227-5p представляет собой hsa-miR-1227-5p, miR-6880-5p представляет собой hsa-miR-6880-5p, miR-4417 представляет собой hsa-miR-4417, miR-6802-5p представляет собой hsa-miR-6802-5p, miR-6769a-5p представляет собой hsa-miR-6769a-5p, miR-663a представляет собой hsa-miR-663a, miR-6721-5p представляет собой hsa-miR-6721-5p, miR-4532 представляет собой hsa-miR-4532, miR-7977 представляет собой hsa-miR-7977, miR-92b-5p представляет собой hsa-miR-92b-5p, miR-371a-5p представляет собой hsa-miR-371a-5p, miR-6126 представляет собой hsa-miR-6126, miR-4734 представляет собой hsa-miR-4734, miR-4665-3p представляет собой hsa-miR-4665-3p, miR-423-5p представляет собой hsa-miR-423-5p, miR-1469 представляет собой hsa-miR-1469, miR-4675 представляет собой hsa-miR-4675, miR-1915-5p представляет собой hsa-miR-1915-5p, miR-6716-5p представляет собой hsa-miR-6716-5p, miR-718 представляет собой hsa-miR-718, miR-4281 представляет собой hsa-miR-4281, miR-6820-5p представляет собой hsa-miR-6820-5p, miR-6795-5p представляет собой hsa-miR-6795-5p, miR-6779-5p представляет собой hsa-miR-6779-5p, miR-7109-5p представляет собой hsa-miR-7109-5p, miR-6798-5p представляет собой hsa-miR-6798-5p, miR-4648 представляет собой hsa-miR-4648, miR-8059 представляет собой hsa-miR-8059, miR-6765-3p представляет собой hsa-miR-6765-3p, miR-6132 представляет собой hsa-miR-6132, miR-4492 представляет собой hsa-miR-4492, miR-7107-5p представляет собой hsa-miR-7107-5p, miR-3195 представляет собой hsa-miR-3195, miR-3180 представляет собой hsa-miR-3180, miR-296-3p представляет собой hsa-miR-296-3p, miR-564 представляет собой hsa-miR-564, miR-1268a представляет собой hsa-miR-1268a, miR-6848-5p представляет собой hsa-miR-6848-5p, miR-762 представляет собой hsa-miR-762, miR-2861 представляет собой hsa-miR-2861, miR-1203 представляет собой hsa-miR-1203, miR-1260b представляет собой hsa-miR-1260b, miR-4476 представляет собой hsa-miR-4476, miR-6885-5p представляет собой hsa-miR-6885-5p, miR-6769b-5p представляет собой hsa-miR-6769b-5p, miR-23b-3p представляет собой hsa-miR-23b-3p, miR-1343-5p представляет собой hsa-miR-1343-5p, miR-3621 представляет собой hsa-miR-3621, miR-4688 представляет собой hsa-miR-4688, miR-4286 представляет собой hsa-miR-4286, miR-4640-5p представляет собой hsa-miR-4640-5p, miR-4739 представляет собой hsa-miR-4739, miR-1260a представляет собой hsa-miR-1260a, miR-4276 представляет собой hsa-miR-4276, miR-7106-5p представляет собой hsa-miR-7106-5p, miR-6794-5p представляет собой hsa-miR-6794-5p, miR-6774-5p представляет собой hsa-miR-6774-5p, miR-4707-3p представляет собой hsa-miR-4707-3p, miR-4534 представляет собой hsa-miR-4534, miR-4294 представляет собой hsa-miR-4294, miR-6850-5p представляет собой hsa-miR-6850-5p, miR-6089 представляет собой hsa-miR-6089 и miR-671-5p представляет собой hsa-miR-671-5p.
11. Устройство по п.9, в котором нуклеиновая кислота представляет собой полинуклеотид, выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (a)-(e):
(a) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(b) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642,
(c) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(d) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-165 и 635-642, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, и
(e) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (a)-(d).
12. Устройство по любому из пп.9-11, где устройство дополнительно содержит нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним или несколькими полинуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из следующих других маркеров рака желудка: miR-128-2-5p, miR-125a-3p, miR-92a-2-5p, miR-486-3p, miR-3196, miR-211-3p, miR-4271, miR-6851-5p, miR-149-3p, miR-4667-5p, miR-135a-3p, miR-4486, miR-4697-5p, miR-4725-3p, miR-6510-5p, miR-5001-5p, miR-4673, miR-4466, miR-23a-3p, miR-3656, miR-6782-5p, miR-4689, miR-451a, miR-4446-3p, miR-3180-3p, miR-642a-3p, miR-6889-5p, miR-3178, miR-4665-5p, miR-6722-3p, miR-30c-1-3p, miR-4507, miR-3141 и miR-1199-5p.
13. Устройство по п.12, в котором miR-128-2-5p представляет собой hsa-miR-128-2-5p, miR-125a-3p представляет собой hsa-miR-125a-3p, miR-92a-2-5p представляет собой hsa-miR-92a-2-5p, miR-486-3p представляет собой hsa-miR-486-3p, miR-3196 представляет собой hsa-miR-3196, miR-211-3p представляет собой hsa-miR-211-3p, miR-4271 представляет собой hsa-miR-4271, miR-6851-5p представляет собой hsa-miR-6851-5p, miR-149-3p представляет собой hsa-miR-149-3p, miR-4667-5p представляет собой hsa-miR-4667-5p, miR-135a-3p представляет собой hsa-miR-135a-3p, miR-4486 представляет собой hsa-miR-4486, miR-4697-5p представляет собой hsa-miR-4697-5p, miR-4725-3p представляет собой hsa-miR-4725-3p, miR-6510-5p представляет собой hsa-miR-6510-5p, miR-5001-5p представляет собой hsa-miR-5001-5p, miR-4673 представляет собой hsa-miR-4673, miR-4466 представляет собой hsa-miR-4466, miR-23a-3p представляет собой hsa-miR-23a-3p, miR-3656 представляет собой hsa-miR-3656, miR-6782-5p представляет собой hsa-miR-6782-5p, miR-4689 представляет собой hsa-miR-4689, miR-451a представляет собой hsa-miR-451a, miR-4446-3p представляет собой hsa-miR-4446-3p, miR-3180-3p представляет собой hsa-miR-3180-3p, miR-642a-3p представляет собой hsa-miR-642a-3p, miR-6889-5p представляет собой hsa-miR-6889-5p, miR-3178 представляет собой hsa-miR-3178, miR-4665-5p представляет собой hsa-miR-4665-5p, miR-6722-3p представляет собой hsa-miR-6722-3p, miR-30c-1-3p представляет собой hsa-miR-30c-1-3p, miR-4507 представляет собой hsa-miR-4507, miR-3141 представляет собой hsa-miR-3141 и miR-1199-5p представляет собой hsa-miR-1199-5p.
14. Устройство по п.12, в котором нуклеиновая кислота представляет собой полинуклеотид, выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (f)-(o):
(f) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(g) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 166-169,
(h) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(i) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 166-169, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t,
(j) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (f)-(i),
(k) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(l) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 170-199,
(m) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов,
(n) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 170-199, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, и
(o) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (k)-(n).
15. Устройство по любому из пп.9-11, где устройство представляет собой устройство для измерения способом гибридизации.
16. Устройство по п.15, где способ гибридизации представляет собой технологию матрицы нуклеиновых кислот.
17. Устройство по любому из пп.9-11, где устройство содержит по меньшей мере две или более нуклеиновых кислот, способных специфически связываться по меньшей мере с двумя или более полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака желудка по п.9 или 10.
18. Устройство по п.12, где устройство содержит по меньшей мере две или более нуклеиновых кислот, способных специфически связываться по меньшей мере с двумя или более полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака желудка по п.9.
19. Способ обнаружения рака желудка, включающий измерение уровня(ей) экспрессии нуклеиновой кислоты-мишени(ей) в образце от индивидуума с использованием набора по любому из пп.1-3 или устройства по любому из пп.9-11; и оценку in vitro наличия или отсутствия у индивидуума рака желудка с использованием как измеренного уровня(ей) экспрессии, так и контрольного уровня(ей) экспрессии в образце от здорового индивидуума, измеренного аналогичным образом.
20. Способ обнаружения рака поджелудочной железы, включающий измерение уровня(ей) экспрессии нуклеиновой кислоты-мишени(ей) в образце от индивидуума с использованием набора по п.4 и оценку in vitro наличия или отсутствия у индивидуума рака поджелудочной железы, с использованием как измеренного уровня(ей) экспрессии, так и контрольного уровня(ей) в образце от здорового индивидуума, измеренного аналогичным образом.
21. Способ обнаружения рака поджелудочной железы, включающий измерение уровня(ей) экспрессии нуклеиновой кислоты-мишени(ей) в образце от индивидуума с использованием устройства по п.12 и оценку in vitro наличия или отсутствия у индивидуума рака поджелудочной железы, с использованием как измеренного уровня(ей) экспрессии, так и контрольного уровня(ей) в образце от здорового индивидуума, измеренного аналогичным образом.
22. Способ обнаружения рака поджелудочной железы, включающий измерение уровня(ей) экспрессии нуклеиновой кислоты-мишени(ей) в образце от индивидуума с использованием набора по п.5 или 6 или устройства по п.13 или 14 и оценку in vitro наличия или отсутствия у индивидуума рака поджелудочной железы, с использованием как измеренного уровня(ей) экспрессии, так и контрольного уровня(ей) в образце от здорового индивидуума, измеренного аналогичным образом.
23. Способ по п.19, в котором индивидуумом является человек.
24. Способ по п.19, в котором образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
25. Способ по п.20, в котором образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
26. Способ по п.21, в котором образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
27. Способ по п.22, в котором образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
Наверх