Набор или устройство для обнаружения рака пищевода и способ обнаружения - заявка 2017101353 на патент на изобретение в РФ

1. Набор для обнаружения рака пищевода, содержащий нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из следующих маркеров рака пищевода: miR-204-3p, miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6857-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p и miR-6794-5p.
2. Набор по п.1, в котором miR-204-3p представляет собой hsa-miR-204-3p, miR-1247-3p представляет собой hsa-miR-1247-3p, miR-6875-5p представляет собой hsa-miR-6875-5p, miR-6857-5p представляет собой hsa-miR-6857-5p, miR-6726-5p представляет собой hsa-miR-6726-5p, miR-3188 представляет собой hsa-miR-3188, miR-8069 представляет собой hsa-miR-8069, miR-4257 представляет собой hsa-miR-4257, miR-1343-3p представляет собой hsa-miR-1343-3p, miR-7108-5p представляет собой hsa-miR-7108-5p, miR-6825-5p представляет собой hsa-miR-6825-5p, miR-7641 представляет собой hsa-miR-7641, miR-3185 представляет собой hsa-miR-3185, miR-4746-3p представляет собой hsa-miR-4746-3p, miR-6791-5p представляет собой hsa-miR-6791-5p, miR-6893-5p представляет собой hsa-miR-6893-5p, miR-4433b-3p представляет собой hsa-miR-4433b-3p, miR-3135b представляет собой hsa-miR-3135b, miR-6781-5p представляет собой hsa-miR-6781-5p, miR-1908-5p представляет собой hsa-miR-1908-5p, miR-4792 представляет собой hsa-miR-4792, miR-7845-5p представляет собой hsa-miR-7845-5p, miR-4417 представляет собой hsa-miR-4417, miR-3184-5p представляет собой hsa-miR-3184-5p, miR-1225-5p представляет собой hsa-miR-1225-5p, miR-1231 представляет собой hsa-miR-1231, miR-1225-3p представляет собой hsa-miR-1225-3p, miR-150-3p представляет собой hsa-miR-150-3p, miR-4433-3p представляет собой hsa-miR-4433-3p, miR-6125 представляет собой hsa-miR-6125, miR-4513 представляет собой hsa-miR-4513, miR-6787-5p представляет собой hsa-miR-6787-5p, miR-6784-5p представляет собой hsa-miR-6784-5p, miR-615-5p представляет собой hsa-miR-615-5p, miR-6765-3p представляет собой hsa-miR-6765-3p, miR-5572 представляет собой hsa-miR-5572, miR-6842-5p представляет собой hsa-miR-6842-5p, miR-8063 представляет собой hsa-miR-8063, miR-6780b-5p представляет собой hsa-miR-6780b-5p, miR-187-5p представляет собой hsa-miR-187-5p, miR-128-1-5p представляет собой hsa-miR-128-1-5p, miR-6729-5p представляет собой hsa-miR-6729-5p, miR-6741-5p представляет собой hsa-miR-6741-5p, miR-6757-5p представляет собой hsa-miR-6757-5p, miR-7110-5p представляет собой hsa-miR-7110-5p, miR-7975 представляет собой hsa-miR-7975, miR-1233-5p представляет собой hsa-miR-1233-5p, miR-6845-5p представляет собой hsa-miR-6845-5p, miR-3937 представляет собой hsa-miR-3937, miR-4467 представляет собой hsa-miR-4467, miR-7109-5p представляет собой hsa-miR-7109-5p, miR-6088 представляет собой hsa-miR-6088, miR-6782-5p представляет собой hsa-miR-6782-5p, miR-5195-3p представляет собой hsa-miR-5195-3p, miR-4454 представляет собой hsa-miR-4454, miR-6724-5p представляет собой hsa-miR-6724-5p, miR-8072 представляет собой hsa-miR-8072, miR-4516 представляет собой hsa-miR-4516, miR-6756-5p представляет собой hsa-miR-6756-5p, miR-4665-3p представляет собой hsa-miR-4665-3p, miR-6826-5p представляет собой hsa-miR-6826-5p, miR-6820-5p представляет собой hsa-miR-6820-5p, miR-6887-5p представляет собой hsa-miR-6887-5p, miR-3679-5p представляет собой hsa-miR-3679-5p, miR-7847-3p представляет собой hsa-miR-7847-3p, miR-6721-5p представляет собой hsa-miR-6721-5p, miR-3622a-5p представляет собой hsa-miR-3622a-5p, miR-939-5p представляет собой hsa-miR-939-5p, miR-602 представляет собой hsa-miR-602, miR-7977 представляет собой hsa-miR-7977, miR-6749-5p представляет собой hsa-miR-6749-5p, miR-1914-3p представляет собой hsa-miR-1914-3p, miR-4651 представляет собой hsa-miR-4651, miR-4695-5p представляет собой hsa-miR-4695-5p, miR-6848-5p представляет собой hsa-miR-6848-5p, miR-1228-3p представляет собой hsa-miR-1228-3p, miR-642b-3p представляет собой hsa-miR-642b-3p, miR-6746-5p представляет собой hsa-miR-6746-5p, miR-3620-5p представляет собой hsa-miR-3620-5p, miR-3131 представляет собой hsa-miR-3131, miR-6732-5p представляет собой hsa-miR-6732-5p, miR-7113-3p представляет собой hsa-miR-7113-3p, miR-23a-3p представляет собой hsa-miR-23a-3p, miR-3154 представляет собой hsa-miR-3154, miR-4723-5p представляет собой hsa-miR-4723-5p, miR-3663-3p представляет собой hsa-miR-3663-3p, miR-4734 представляет собой hsa-miR-4734, miR-6816-5p представляет собой hsa-miR-6816-5p, miR-4442 представляет собой hsa-miR-4442, miR-4476 представляет собой hsa-miR-4476, miR-423-5p представляет собой hsa-miR-423-5p, miR-1249 представляет собой hsa-miR-1249, miR-6515-3p представляет собой hsa-miR-6515-3p, miR-887-3p представляет собой hsa-miR-887-3p, miR-4741 представляет собой hsa-miR-4741, miR-6766-3p представляет собой hsa-miR-6766-3p, miR-4673 представляет собой hsa-miR-4673, miR-6779-5p представляет собой hsa-miR-6779-5p, miR-4706 представляет собой hsa-miR-4706, miR-1268b представляет собой hsa-miR-1268b, miR-4632-5p представляет собой hsa-miR-4632-5p, miR-3197 представляет собой hsa-miR-3197, miR-6798-5p представляет собой hsa-miR-6798-5p, miR-711 представляет собой hsa-miR-711, miR-6840-3p представляет собой hsa-miR-6840-3p, miR-6763-5p представляет собой hsa-miR-6763-5p, miR-6727-5p представляет собой hsa-miR-6727-5p, miR-371a-5p представляет собой hsa-miR-371a-5p, miR-6824-5p представляет собой hsa-miR-6824-5p, miR-4648 представляет собой hsa-miR-4648, miR-1227-5p представляет собой hsa-miR-1227-5p, miR-564 представляет собой hsa-miR-564, miR-3679-3p представляет собой hsa-miR-3679-3p, miR-2861 представляет собой hsa-miR-2861, miR-6737-5p представляет собой hsa-miR-6737-5p, miR-4725-3p представляет собой hsa-miR-4725-3p, miR-6716-5p представляет собой hsa-miR-6716-5p, miR-4675 представляет собой hsa-miR-4675, miR-1915-3p представляет собой hsa-miR-1915-3p, miR-671-5p представляет собой hsa-miR-671-5p, miR-3656 представляет собой hsa-miR-3656, miR-6722-3p представляет собой hsa-miR-6722-3p, miR-4707-5p представляет собой hsa-miR-4707-5p, miR-4449 представляет собой hsa-miR-4449, miR-1202 представляет собой hsa-miR-1202, miR-4649-5p представляет собой hsa-miR-4649-5p, miR-744-5p представляет собой hsa-miR-744-5p, miR-642a-3p представляет собой hsa-miR-642a-3p, miR-451a представляет собой hsa-miR-451a, miR-6870-5p представляет собой hsa-miR-6870-5p, miR-4443 представляет собой hsa-miR-4443, miR-6808-5p представляет собой hsa-miR-6808-5p, miR-4728-5p представляет собой hsa-miR-4728-5p, miR-937-5p представляет собой hsa-miR-937-5p, miR-135a-3p представляет собой hsa-miR-135a-3p, miR-663b представляет собой hsa-miR-663b, miR-1343-5p представляет собой hsa-miR-1343-5p, miR-6822-5p представляет собой hsa-miR-6822-5p, miR-6803-5p представляет собой hsa-miR-6803-5p, miR-6805-3p представляет собой hsa-miR-6805-3p, miR-128-2-5p представляет собой hsa-miR-128-2-5p, miR-4640-5p представляет собой hsa-miR-4640-5p, miR-1469 представляет собой hsa-miR-1469, miR-92a-2-5p представляет собой hsa-miR-92a-2-5p, miR-3940-5p представляет собой hsa-miR-3940-5p, miR-4281 представляет собой hsa-miR-4281, miR-1260b представляет собой hsa-miR-1260b, miR-4758-5p представляет собой hsa-miR-4758-5p, miR-1915-5p представляет собой hsa-miR-1915-5p, miR-5001-5p представляет собой hsa-miR-5001-5p, miR-4286 представляет собой hsa-miR-4286, miR-6126 представляет собой hsa-miR-6126, miR-6789-5p представляет собой hsa-miR-6789-5p, miR-4459 представляет собой hsa-miR-4459, miR-1268a представляет собой hsa-miR-1268a, miR-6752-5p представляет собой hsa-miR-6752-5p, miR-6131 представляет собой hsa-miR-6131, miR-6800-5p представляет собой hsa-miR-6800-5p, miR-4532 представляет собой hsa-miR-4532, miR-6872-3p представляет собой hsa-miR-6872-3p, miR-718 представляет собой hsa-miR-718, miR-6769a-5p представляет собой hsa-miR-6769a-5p, miR-4707-3p представляет собой hsa-miR-4707-3p, miR-6765-5p представляет собой hsa-miR-6765-5p, miR-4739 представляет собой hsa-miR-4739, miR-4525 представляет собой hsa-miR-4525, miR-4270 представляет собой hsa-miR-4270, miR-4534 представляет собой hsa-miR-4534, miR-6785-5p представляет собой hsa-miR-6785-5p, miR-6850-5p представляет собой hsa-miR-6850-5p, miR-4697-5p представляет собой hsa-miR-4697-5p, miR-1260a представляет собой hsa-miR-1260a, miR-4486 представляет собой hsa-miR-4486, miR-6880-5p представляет собой hsa-miR-6880-5p, miR-6802-5p представляет собой hsa-miR-6802-5p, miR-6861-5p представляет собой hsa-miR-6861-5p, miR-92b-5p представляет собой hsa-miR-92b-5p, miR-1238-5p представляет собой hsa-miR-1238-5p, miR-6851-5p представляет собой hsa-miR-6851-5p, miR-7704 представляет собой hsa-miR-7704, miR-149-3p представляет собой hsa-miR-149-3p, miR-4689 представляет собой hsa-miR-4689, miR-4688 представляет собой hsa-miR-4688, miR-125a-3p представляет собой hsa-miR-125a-3p, miR-23b-3p представляет собой hsa-miR-23b-3p, miR-614 представляет собой hsa-miR-614, miR-1913 представляет собой hsa-miR-1913, miR-16-5p представляет собой hsa-miR-16-5p, miR-6717-5p представляет собой hsa-miR-6717-5p, miR-3648 представляет собой hsa-miR-3648, miR-3162-5p представляет собой hsa-miR-3162-5p, miR-1909-3p представляет собой hsa-miR-1909-3p, miR-8073 представляет собой hsa-miR-8073, miR-6769b-5p представляет собой hsa-miR-6769b-5p, miR-6836-3p представляет собой hsa-miR-6836-3p, miR-4484 представляет собой hsa-miR-4484, miR-6819-5p представляет собой hsa-miR-6819-5p и miR-6794-5p представляет собой hsa-miR-6794-5p.
3. Набор по п.1 или 2, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (a)-(e):
(a) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(b) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675;
(c) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(d) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(e) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (a)-(d).
4. Набор по любому из пп.1-3, в котором набор дополнительно содержит нуклеиновую кислоту, способную специфически связываться с полинуклеотидом(ами), выбранным из других маркеров рака пищевода miR-575 и miR-24-3p.
5. Набор по п.4, в котором miR-575 представляет собой hsa-miR-575 и miR-24-3p представляет собой hsa-miR-24-3p.
6. Набор по п.4 или 5, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (f)-(j):
(f) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(g) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 116 и 676;
(h) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(i) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(j) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (f)-(i).
7. Набор по любому из пп.1-6, где набор дополнительно содержит нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из следующих других маркеров рака пищевода miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 и miR-6879-5p.
8. Набор по п.7, в котором miR-675-5p представляет собой hsa-miR-675-5p, miR-486-3p представляет собой hsa-miR-486-3p, miR-6777-5p представляет собой hsa-miR-6777-5p, miR-4497 представляет собой hsa-miR-4497, miR-296-3p представляет собой hsa-miR-296-3p, miR-6738-5p представляет собой hsa-miR-6738-5p, miR-4731-5p представляет собой hsa-miR-4731-5p, miR-6889-5p представляет собой hsa-miR-6889-5p, miR-6786-5p представляет собой hsa-miR-6786-5p, miR-92a-3p представляет собой hsa-miR-92a-3p, miR-4294 представляет собой hsa-miR-4294, miR-4763-3p представляет собой hsa-miR-4763-3p, miR-6076 представляет собой hsa-miR-6076, miR-663a представляет собой hsa-miR-663a, miR-760 представляет собой hsa-miR-760, miR-4667-5p представляет собой hsa-miR-4667-5p, miR-6090 представляет собой hsa-miR-6090, miR-4730 представляет собой hsa-miR-4730, miR-7106-5p представляет собой hsa-miR-7106-5p, miR-3196 представляет собой hsa-miR-3196, miR-5698 представляет собой hsa-miR-5698, miR-6087 представляет собой hsa-miR-6087, miR-4665-5p представляет собой hsa-miR-4665-5p, miR-8059 представляет собой hsa-miR-8059, и miR-6879-5p представляет собой hsa-miR-6879-5p.
9. Набор по п.7 или 8, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (k)-(o):
(k) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(l) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 190-214;
(m) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(n) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(o) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (k)-(n).
10. Набор по любому из пп.1-9, где набор содержит по меньшей мере две нуклеиновых кислоты, способных специфически связываться по меньшей мере с двумя полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака пищевода по п.1 или 2.
11. Устройство для обнаружения рак пищевода, содержащее нуклеиновую кислоту, способную специфически связываться по меньшей мере с одним полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из следующих маркеров рака пищевода: miR-204-3p, miR-1247-3p, miR-6875-5p, miR-6857-5p, miR-6726-5p, miR-3188, miR-8069, miR-4257, miR-1343-3p, miR-7108-5p, miR-6825-5p, miR-7641, miR-3185, miR-4746-3p, miR-6791-5p, miR-6893-5p, miR-4433b-3p, miR-3135b, miR-6781-5p, miR-1908-5p, miR-4792, miR-7845-5p, miR-4417, miR-3184-5p, miR-1225-5p, miR-1231, miR-1225-3p, miR-150-3p, miR-4433-3p, miR-6125, miR-4513, miR-6787-5p, miR-6784-5p, miR-615-5p, miR-6765-3p, miR-5572, miR-6842-5p, miR-8063, miR-6780b-5p, miR-187-5p, miR-128-1-5p, miR-6729-5p, miR-6741-5p, miR-6757-5p, miR-7110-5p, miR-7975, miR-1233-5p, miR-6845-5p, miR-3937, miR-4467, miR-7109-5p, miR-6088, miR-6782-5p, miR-5195-3p, miR-4454, miR-6724-5p, miR-8072, miR-4516, miR-6756-5p, miR-4665-3p, miR-6826-5p, miR-6820-5p, miR-6887-5p, miR-3679-5p, miR-7847-3p, miR-6721-5p, miR-3622a-5p, miR-939-5p, miR-602, miR-7977, miR-6749-5p, miR-1914-3p, miR-4651, miR-4695-5p, miR-6848-5p, miR-1228-3p, miR-642b-3p, miR-6746-5p, miR-3620-5p, miR-3131, miR-6732-5p, miR-7113-3p, miR-23a-3p, miR-3154, miR-4723-5p, miR-3663-3p, miR-4734, miR-6816-5p, miR-4442, miR-4476, miR-423-5p, miR-1249, miR-6515-3p, miR-887-3p, miR-4741, miR-6766-3p, miR-4673, miR-6779-5p, miR-4706, miR-1268b, miR-4632-5p, miR-3197, miR-6798-5p, miR-711, miR-6840-3p, miR-6763-5p, miR-6727-5p, miR-371a-5p, miR-6824-5p, miR-4648, miR-1227-5p, miR-564, miR-3679-3p, miR-2861, miR-6737-5p, miR-4725-3p, miR-6716-5p, miR-4675, miR-1915-3p, miR-671-5p, miR-3656, miR-6722-3p, miR-4707-5p, miR-4449, miR-1202, miR-4649-5p, miR-744-5p, miR-642a-3p, miR-451a, miR-6870-5p, miR-4443, miR-6808-5p, miR-4728-5p, miR-937-5p, miR-135a-3p, miR-663b, miR-1343-5p, miR-6822-5p, miR-6803-5p, miR-6805-3p, miR-128-2-5p, miR-4640-5p, miR-1469, miR-92a-2-5p, miR-3940-5p, miR-4281, miR-1260b, miR-4758-5p, miR-1915-5p, miR-5001-5p, miR-4286, miR-6126, miR-6789-5p, miR-4459, miR-1268a, miR-6752-5p, miR-6131, miR-6800-5p, miR-4532, miR-6872-3p, miR-718, miR-6769a-5p, miR-4707-3p, miR-6765-5p, miR-4739, miR-4525, miR-4270, miR-4534, miR-6785-5p, miR-6850-5p, miR-4697-5p, miR-1260a, miR-4486, miR-6880-5p, miR-6802-5p, miR-6861-5p, miR-92b-5p, miR-1238-5p, miR-6851-5p, miR-7704, miR-149-3p, miR-4689, miR-4688, miR-125a-3p, miR-23b-3p, miR-614, miR-1913, miR-16-5p, miR-6717-5p, miR-3648, miR-3162-5p, miR-1909-3p, miR-8073, miR-6769b-5p, miR-6836-3p, miR-4484, miR-6819-5p и miR-6794-5p.
12. Устройство по п.11, в котором miR-204-3p представляет собой hsa-miR-204-3p, miR-1247-3p представляет собой hsa-miR-1247-3p, miR-6875-5p представляет собой hsa-miR-6875-5p, miR-6857-5p представляет собой hsa-miR-6857-5p, miR-6726-5p представляет собой hsa-miR-6726-5p, miR-3188 представляет собой hsa-miR-3188, miR-8069 представляет собой hsa-miR-8069, miR-4257 представляет собой hsa-miR-4257, miR-1343-3p представляет собой hsa-miR-1343-3p, miR-7108-5p представляет собой hsa-miR-7108-5p, miR-6825-5p представляет собой hsa-miR-6825-5p, miR-7641 представляет собой hsa-miR-7641, miR-3185 представляет собой hsa-miR-3185, miR-4746-3p представляет собой hsa-miR-4746-3p, miR-6791-5p представляет собой hsa-miR-6791-5p, miR-6893-5p представляет собой hsa-miR-6893-5p, miR-4433b-3p представляет собой hsa-miR-4433b-3p, miR-3135b представляет собой hsa-miR-3135b, miR-6781-5p представляет собой hsa-miR-6781-5p, miR-1908-5p представляет собой hsa-miR-1908-5p, miR-4792 представляет собой hsa-miR-4792, miR-7845-5p представляет собой hsa-miR-7845-5p, miR-4417 представляет собой hsa-miR-4417, miR-3184-5p представляет собой hsa-miR-3184-5p, miR-1225-5p представляет собой hsa-miR-1225-5p, miR-1231 представляет собой hsa-miR-1231, miR-1225-3p представляет собой hsa-miR-1225-3p, miR-150-3p представляет собой hsa-miR-150-3p, miR-4433-3p представляет собой hsa-miR-4433-3p, miR-6125 представляет собой hsa-miR-6125, miR-4513 представляет собой hsa-miR-4513, miR-6787-5p представляет собой hsa-miR-6787-5p, miR-6784-5p представляет собой hsa-miR-6784-5p, miR-615-5p представляет собой hsa-miR-615-5p, miR-6765-3p представляет собой hsa-miR-6765-3p, miR-5572 представляет собой hsa-miR-5572, miR-6842-5p представляет собой hsa-miR-6842-5p, miR-8063 представляет собой hsa-miR-8063, miR-6780b-5p представляет собой hsa-miR-6780b-5p, miR-187-5p представляет собой hsa-miR-187-5p, miR-128-1-5p представляет собой hsa-miR-128-1-5p, miR-6729-5p представляет собой hsa-miR-6729-5p, miR-6741-5p представляет собой hsa-miR-6741-5p, miR-6757-5p представляет собой hsa-miR-6757-5p, miR-7110-5p представляет собой hsa-miR-7110-5p, miR-7975 представляет собой hsa-miR-7975, miR-1233-5p представляет собой hsa-miR-1233-5p, miR-6845-5p представляет собой hsa-miR-6845-5p, miR-3937 представляет собой hsa-miR-3937, miR-4467 представляет собой hsa-miR-4467, miR-7109-5p представляет собой hsa-miR-7109-5p, miR-6088 представляет собой hsa-miR-6088, miR-6782-5p представляет собой hsa-miR-6782-5p, miR-5195-3p представляет собой hsa-miR-5195-3p, miR-4454 представляет собой hsa-miR-4454, miR-6724-5p представляет собой hsa-miR-6724-5p, miR-8072 представляет собой hsa-miR-8072, miR-4516 представляет собой hsa-miR-4516, miR-6756-5p представляет собой hsa-miR-6756-5p, miR-4665-3p представляет собой hsa-miR-4665-3p, miR-6826-5p представляет собой hsa-miR-6826-5p, miR-6820-5p представляет собой hsa-miR-6820-5p, miR-6887-5p представляет собой hsa-miR-6887-5p, miR-3679-5p представляет собой hsa-miR-3679-5p, miR-7847-3p представляет собой hsa-miR-7847-3p, miR-6721-5p представляет собой hsa-miR-6721-5p, miR-3622a-5p представляет собой hsa-miR-3622a-5p, miR-939-5p представляет собой hsa-miR-939-5p, miR-602 представляет собой hsa-miR-602, miR-7977 представляет собой hsa-miR-7977, miR-6749-5p представляет собой hsa-miR-6749-5p, miR-1914-3p представляет собой hsa-miR-1914-3p, miR-4651 представляет собой hsa-miR-4651, miR-4695-5p представляет собой hsa-miR-4695-5p, miR-6848-5p представляет собой hsa-miR-6848-5p, miR-1228-3p представляет собой hsa-miR-1228-3p, miR-642b-3p представляет собой hsa-miR-642b-3p, miR-6746-5p представляет собой hsa-miR-6746-5p, miR-3620-5p представляет собой hsa-miR-3620-5p, miR-3131 представляет собой hsa-miR-3131, miR-6732-5p представляет собой hsa-miR-6732-5p, miR-7113-3p представляет собой hsa-miR-7113-3p, miR-23a-3p представляет собой hsa-miR-23a-3p, miR-3154 представляет собой hsa-miR-3154, miR-4723-5p представляет собой hsa-miR-4723-5p, miR-3663-3p представляет собой hsa-miR-3663-3p, miR-4734 представляет собой hsa-miR-4734, miR-6816-5p представляет собой hsa-miR-6816-5p, miR-4442 представляет собой hsa-miR-4442, miR-4476 представляет собой hsa-miR-4476, miR-423-5p представляет собой hsa-miR-423-5p, miR-1249 представляет собой hsa-miR-1249, miR-6515-3p представляет собой hsa-miR-6515-3p, miR-887-3p представляет собой hsa-miR-887-3p, miR-4741 представляет собой hsa-miR-4741, miR-6766-3p представляет собой hsa-miR-6766-3p, miR-4673 представляет собой hsa-miR-4673, miR-6779-5p представляет собой hsa-miR-6779-5p, miR-4706 представляет собой hsa-miR-4706, miR-1268b представляет собой hsa-miR-1268b, miR-4632-5p представляет собой hsa-miR-4632-5p, miR-3197 представляет собой hsa-miR-3197, miR-6798-5p представляет собой hsa-miR-6798-5p, miR-711 представляет собой hsa-miR-711, miR-6840-3p представляет собой hsa-miR-6840-3p, miR-6763-5p представляет собой hsa-miR-6763-5p, miR-6727-5p представляет собой hsa-miR-6727-5p, miR-371a-5p представляет собой hsa-miR-371a-5p, miR-6824-5p представляет собой hsa-miR-6824-5p, miR-4648 представляет собой hsa-miR-4648, miR-1227-5p представляет собой hsa-miR-1227-5p, miR-564 представляет собой hsa-miR-564, miR-3679-3p представляет собой hsa-miR-3679-3p, miR-2861 представляет собой hsa-miR-2861, miR-6737-5p представляет собой hsa-miR-6737-5p, miR-4725-3p представляет собой hsa-miR-4725-3p, miR-6716-5p представляет собой hsa-miR-6716-5p, miR-4675 представляет собой hsa-miR-4675, miR-1915-3p представляет собой hsa-miR-1915-3p, miR-671-5p представляет собой hsa-miR-671-5p, miR-3656 представляет собой hsa-miR-3656, miR-6722-3p представляет собой hsa-miR-6722-3p, miR-4707-5p представляет собой hsa-miR-4707-5p, miR-4449 представляет собой hsa-miR-4449, miR-1202 представляет собой hsa-miR-1202, miR-4649-5p представляет собой hsa-miR-4649-5p, miR-744-5p представляет собой hsa-miR-744-5p, miR-642a-3p представляет собой hsa-miR-642a-3p, miR-451a представляет собой hsa-miR-451a, miR-6870-5p представляет собой hsa-miR-6870-5p, miR-4443 представляет собой hsa-miR-4443, miR-6808-5p представляет собой hsa-miR-6808-5p, miR-4728-5p представляет собой hsa-miR-4728-5p, miR-937-5p представляет собой hsa-miR-937-5p, miR-135a-3p представляет собой hsa-miR-135a-3p, miR-663b представляет собой hsa-miR-663b, miR-1343-5p представляет собой hsa-miR-1343-5p, miR-6822-5p представляет собой hsa-miR-6822-5p, miR-6803-5p представляет собой hsa-miR-6803-5p, miR-6805-3p представляет собой hsa-miR-6805-3p, miR-128-2-5p представляет собой hsa-miR-128-2-5p, miR-4640-5p представляет собой hsa-miR-4640-5p, miR-1469 представляет собой hsa-miR-1469, miR-92a-2-5p представляет собой hsa-miR-92a-2-5p, miR-3940-5p представляет собой hsa-miR-3940-5p, miR-4281 представляет собой hsa-miR-4281, miR-1260b представляет собой hsa-miR-1260b, miR-4758-5p представляет собой hsa-miR-4758-5p, miR-1915-5p представляет собой hsa-miR-1915-5p, miR-5001-5p представляет собой hsa-miR-5001-5p, miR-4286 представляет собой hsa-miR-4286, miR-6126 представляет собой hsa-miR-6126, miR-6789-5p представляет собой hsa-miR-6789-5p, miR-4459 представляет собой hsa-miR-4459, miR-1268a представляет собой hsa-miR-1268a, miR-6752-5p представляет собой hsa-miR-6752-5p, miR-6131 представляет собой hsa-miR-6131, miR-6800-5p представляет собой hsa-miR-6800-5p, miR-4532 представляет собой hsa-miR-4532, miR-6872-3p представляет собой hsa-miR-6872-3p, miR-718 представляет собой hsa-miR-718, miR-6769a-5p представляет собой hsa-miR-6769a-5p, miR-4707-3p представляет собой hsa-miR-4707-3p, miR-6765-5p представляет собой hsa-miR-6765-5p, miR-4739 представляет собой hsa-miR-4739, miR-4525 представляет собой hsa-miR-4525, miR-4270 представляет собой hsa-miR-4270, miR-4534 представляет собой hsa-miR-4534, miR-6785-5p представляет собой hsa-miR-6785-5p, miR-6850-5p представляет собой hsa-miR-6850-5p, miR-4697-5p представляет собой hsa-miR-4697-5p, miR-1260a представляет собой hsa-miR-1260a, miR-4486 представляет собой hsa-miR-4486, miR-6880-5p представляет собой hsa-miR-6880-5p, miR-6802-5p представляет собой hsa-miR-6802-5p, miR-6861-5p представляет собой hsa-miR-6861-5p, miR-92b-5p представляет собой hsa-miR-92b-5p, miR-1238-5p представляет собой hsa-miR-1238-5p, miR-6851-5p представляет собой hsa-miR-6851-5p, miR-7704 представляет собой hsa-miR-7704, miR-149-3p представляет собой hsa-miR-149-3p, miR-4689 представляет собой hsa-miR-4689, miR-4688 представляет собой hsa-miR-4688, miR-125a-3p представляет собой hsa-miR-125a-3p, miR-23b-3p представляет собой hsa-miR-23b-3p, miR-614 представляет собой hsa-miR-614, miR-1913 представляет собой hsa-miR-1913, miR-16-5p представляет собой hsa-miR-16-5p, miR-6717-5p представляет собой hsa-miR-6717-5p, miR-3648 представляет собой hsa-miR-3648, miR-3162-5p представляет собой hsa-miR-3162-5p, miR-1909-3p представляет собой hsa-miR-1909-3p, miR-8073 представляет собой hsa-miR-8073, miR-6769b-5p представляет собой hsa-miR-6769b-5p, miR-6836-3p представляет собой hsa-miR-6836-3p, miR-4484 представляет собой hsa-miR-4484, miR-6819-5p представляет собой hsa-miR-6819-5p и miR-6794-5p представляет собой hsa-miR-6794-5p.
13. Устройство по п.11 или 12, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (a)-(e):
(a) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(b) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675;
(c) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(d) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 1-115, 117-189 и 666-675, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(e) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (a)-(d).
14. Устройство по любому из пп.11-13, где устройство дополнительно содержит нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться с полинуклеотидом(ами), выбранным из других маркеров рака пищевода miR-575 и miR-24-3p.
15. Устройство по п.14, в котором miR-575 представляет собой hsa-miR-575 и miR-24-3p представляет собой hsa-miR-24-3p.
16. Устройство по п.14 или 15, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (f)-(j):
(f) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(g) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 116 и 676;
(h) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(i) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 116 и 676, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(j) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (f)-(i).
17. Устройство по любому из пп.11-16, где устройство дополнительно содержит нуклеиновую кислоту(ы), способную специфически связываться по меньшей мере с одним полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из следующих других маркеров рака пищевода: miR-675-5p, miR-486-3p, miR-6777-5p, miR-4497, miR-296-3p, miR-6738-5p, miR-4731-5p, miR-6889-5p, miR-6786-5p, miR-92a-3p, miR-4294, miR-4763-3p, miR-6076, miR-663a, miR-760, miR-4667-5p, miR-6090, miR-4730, miR-7106-5p, miR-3196, miR-5698, miR-6087, miR-4665-5p, miR-8059 и miR-6879-5p.
18. Устройство по п.17, в котором miR-675-5p представляет собой hsa-miR-675-5p, miR-486-3p представляет собой hsa-miR-486-3p, miR-6777-5p представляет собой hsa-miR-6777-5p, miR-4497 представляет собой hsa-miR-4497, miR-296-3p представляет собой hsa-miR-296-3p, miR-6738-5p представляет собой hsa-miR-6738-5p, miR-4731-5p представляет собой hsa-miR-4731-5p, miR-6889-5p представляет собой hsa-miR-6889-5p, miR-6786-5p представляет собой hsa-miR-6786-5p, miR-92a-3p представляет собой hsa-miR-92a-3p, miR-4294 представляет собой hsa-miR-4294, miR-4763-3p представляет собой hsa-miR-4763-3p, miR-6076 представляет собой hsa-miR-6076, miR-663a представляет собой hsa-miR-663a, miR-760 представляет собой hsa-miR-760, miR-4667-5p представляет собой hsa-miR-4667-5p, miR-6090 представляет собой hsa-miR-6090, miR-4730 представляет собой hsa-miR-4730, miR-7106-5p представляет собой hsa-miR-7106-5p, miR-3196 представляет собой hsa-miR-3196, miR-5698 представляет собой hsa-miR-5698, miR-6087 представляет собой hsa-miR-6087, miR-4665-5p представляет собой hsa-miR-4665-5p, miR-8059 представляет собой hsa-miR-8059 и miR-6879-5p представляет собой hsa-miR-6879-5p.
19. Устройство по п.17 или 18, в котором нуклеиновая кислота(ы) представляет/представляют собой полинуклеотид(ы), выбранный из группы, состоящей из следующих полинуклеотидов (k)-(o):
(k) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианта, ее производного или ее фрагмента, содержащих 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(l) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, соответствующую любой из SEQ ID NO: 190-214;
(m) полинуклеотид, состоящий из нуклеотидной последовательности, комплементарной нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t, ее варианту, ее производному или ее фрагменту, содержащим 15 или более последовательно расположенных нуклеотидов;
(n) полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, комплементарную нуклеотидной последовательности, соответствующей любой из SEQ ID NO: 190-214, или нуклеотидной последовательности, происходящей из этой нуклеотидной последовательности посредством замены u на t; и
(o) полинуклеотид, гибридизующийся в жестких условиях с любым из полинуклеотидов (k)-(n).
20. Устройство по любому из пп.11-19, где устройство представляет собой устройство для измерения способом гибридизации.
21. Устройство по п.20, где способ гибридизации представляет собой технологию матрицы нуклеиновых кислот.
22. Устройство по любому из пп.11-21, где устройство содержит по меньшей мере две нуклеиновых кислоты, способные специфически связываться по меньшей мере с двумя полинуклеотидами, соответственно, выбранными из всех маркеров рака пищевода по п.11 или 12.
23. Способ обнаружения рака пищевода, включающий: измерение уровня(ей) экспрессии нуклеиновой кислоты-мишени(ей) в образце от индивидуума с использованием набора по любому из пп.1-10 или устройства по любому из пп.11-22; и оценку in vitro наличия или отсутствия у индивидуума рака пищевода с использованием как измеренного уровня(ей) экспрессии, так и контрольного уровня(ей) экспрессии в образце от здорового индивидуума, измеренного аналогичным образом.
24. Способ по п.23, в котором индивидуумом является человек.
25. Способ по п.23 или 24, в котором образец представляет собой кровь, сыворотку или плазму.
Наверх