Лизины ацинетобактеров - заявка 2017102306 на патент на изобретение в РФ

1. Полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20 или SEQ ID NO:21, или фрагмент этого полипептида, причем полипептид или фрагмент обладают антибактериальной активностью.
2. Полипептид по п. 1, отличающийся тем, что состоит из аминокислотной последовательности, имеющей по меньшей мере 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20 или SEQ ID NO:21, или фрагмент этого полипептида, причем полипептид или фрагмент обладают антибактериальной активностью.
3. Полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20 или SEQ ID NO:21, или фрагмент этого полипептида, причем полипептид или фрагмент конъюгирован с антимикробным пептидом для получения конъюгированного полипептида, и конъюгированный полипептид обладает антибактериальной активностью.
4. Полипептид по п. 3, отличающийся тем, что состоит из аминокислотной последовательности, имеющей по меньшей мере 80% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20 или SEQ ID NO:21, или фрагмент этого полипептида, причем полипептид или фрагмент конъюгирован с антимикробным пептидом для получения конъюгированного полипептида, и конъюгированный полипептид обладает антибактериальной активностью.
5. Полипептид по п. 3, отличающийся тем, что состоит из аминокислотной последовательности, имеющей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:13, SEQ ID NO:14, SEQ ID NO:15, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20 или SEQ ID NO:21, или фрагмент этого полипептида, причем полипептид или фрагмент конъюгирован с антимикробным пептидом для получения конъюгированного полипептида, и конъюгированный полипептид обладает антибактериальной активностью.
6. Полипептид по любому из пп. 3, 4 или 5, отличающийся тем, что антимикробный пептид содержит восемь аминокислот C, S, Q, R, S, E и S в произвольном порядке.
7. Полипептид по п. 6, отличающийся тем, что антимикробный пептид имеет аминокислотную последовательность SQSRESQC (SEQ ID NO: 44) или CSQRQSES (SEQ ID NO: 50).
8. Полипептид по любому из пп. 3, 4 или 5, отличающийся тем, что содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45 или SEQ ID NO: 51.
9. Полипептид или фрагмент по любому из пп. 3-8, отличающийся тем, что C-конец полипептида или фрагмента конъюгирован с антимикробным пептидом.
10. Полипептид или фрагмент по п. 9, отличающийся тем, что C-конец полипептида или фрагмента конъюгирован с N-концом антимикробного пептида посредством пептидной связи.
11. Полипептид или фрагмент по любому из пп. 3, 4, 6 или 8, отличающийся тем, что N-конец полипептида или фрагмента конъюгирован с антимикробным пептидом.
12. Полипептид или фрагмент по п. 11, отличающийся тем, что N-конец полипептида или фрагмента конъюгирован с С-концом антимикробного пептида посредством пептидной связи.
13. Полипептид или фрагмент по любому из пп. 1-12, отличающийся тем, что полипептид или фрагмент обладает антибактериальной активностью против грамотрицательной бактерии.
14. Полипептид по п.13, отличающийся тем, что бактерия принадлежит к роду Acinetobacter.
15. Полипептид по п. 13, отличающийся тем, что бактерия представляет собой E.coli, P. aeruginosa или A. baumannii.
16. Полипептид или фрагмент по любому из пп. 1-12, отличающийся тем, что полипептид или фрагмент обладает антибактериальной активностью против грамположительной бактерии.
17. Полипептид по п. 16, отличающийся тем, что бактерия представляет собой S. aureus или B. anthracis.
18. Полипептид по любому из пп. 1-17, отличающийся тем, что является лиофилизированным.
19. Композиция, содержащая один или более полипептидов по любому из пп. 1-17.
20. Композиция по п. 19, отличающаяся тем, что содержит фармацевтически приемлемый носитель, буферный агент или консервант.
21. Композиция по п. 20, отличающаяся тем, что составлена в форме для местного применения, подкожной доставки, внутривенной доставки или пероральной доставки.
23. Композиция по п. 20, дополнительно содержащая антибиотик или коагулирующий агент.
24. Композиция по любому из пп. 19-23, отличающаяся тем, что является лиофилизированной.
25. Способ лечения субъекта, нуждающегося в этом, включающий стадию, в которой субъекту вводят композицию, содержащую один или более полипептид по любому из пп. 1-17 и фармацевтически приемлемый носитель, буферный агент или консервант.
26. Способ по п. 25, отличающийся тем, что субъект имеет бактериальную инфекцию.
27. Способ по п. 26, отличающийся тем, что бактериальная инфекция является резистентной к другим способам лечения.
28. Способ по п. 25 или 26, отличающийся тем, что композицию вводят в комбинации с антибиотиком.
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что антибиотик представляет собой амоксициллин, аугментин, амоксициллин, ампициллин, азлоциллин, флюклоксациллин, мезлоциллин, метициллин, пенициллин G, пенициллин V, цефалексин, цефазедон, цефуроксим, лорацарбеф, цеметазол, цефотетан, цефокситин, ципрофлоксацин, левакин и флоксацин, тетрациклин, доксициклин или миноциклин, гентамицин, амикацин, и тобрамицин, кларитромицин, азитромицин, эритромицин, даптомицин, неомицин, канамицин или стрептомицин.
30. Способ по любому из пп. 25-29, отличающийся тем, что бактериальная инфекция представляет собой раневую инфекцию.
31. Способ по любому из пп. 25-30, отличающийся тем, что композицию применяют местно, вводят подкожно, путем внутривенной инъекции или перорально.
32. Способ по любому из пп. 25-31, отличающийся тем, что композиция представлена в виде единичной лекарственной формы.
33. Способ по п. 25, отличающийся тем, что композиция представлена в форме крема, мази, бальзама, геля, пастилки, спрея или аэрозоля.
34. Способ лечения бактериальной инфекции, включая ингибирование образования или разрушение бактериальной биопленки, включающий стадию, в которой субъекту, нуждающемуся в этом, вводят композицию, содержащую полипептид по любому из пп. 1-17, в количестве, эффективном для уничтожения бактерий в биопленке.
35. Способ дезинфекции предмета, включающий стадию, в которой предмет приводят в контакт с композицией, содержащей полипептид по любому из пп. 1-17.
36. Способ по п. 35, отличающийся тем, что предмет представляет собой твердую поверхность.
37. Способ ингибирования образования или разрушения бактериальной биопленки на предмете включающий стадию, в которой приводят в контакт предмет с пептидом по любому из пп. 1-17, в количестве, эффективном для уничтожения бактерий в биопленке.
38. Способ по любому из пп. 35-37, отличающийся тем, что предмет представляет собой рабочую поверхность, клавиатуру, хирургический инструмент или медицинское устройство.
39. Изделие, содержащее композицию, содержащую полипептид по любому из пп. 1-17.
40. Изделие по п. 39, отличающееся тем, что композиция представляет собой композицию дополнительно содержащую носитель, буферный агент или консервант.
41. Изделие по п. 40, отличающееся тем, что представляет собой флакон или устройство доставки.
42. Изделие по п. 40 или 41, отличающееся тем, что композиция является лиофилизированной.
43. Способ лечения субъекта, имеющего операционную рану, включающий стадию в которой рану орошают композицией, содержащей полипептид по любому из пп. 1-17 и фармацевтически приемлемый носитель, буферный агент или консервант.
44. Способ по п. 43, отличающийся тем, что операционную рану орошают до хирургического закрытия раны.
Наверх