Патенты автора Боронникова Светлана Витальевна (RU)
СПОСОБ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ НЕИЗВЕСТНОГО ОБРАЗЦА ДРЕВЕСИНЫ ХВОЙНЫХ РАСТЕНИЙ // 2760522
Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к способу молекулярно-генетической идентификации неизвестных образцов древесины у видов хвойных растений, при использовании в ПЦР проб ДНК, выделенных непосредственно из древесины бревен в месте ее заготовки или после транспортировки. Способ включает в себя 6 стадий: сбор неизвестных образцов древесины; выделение из них проб ДНК; проведение ISSR (Inter Simple Sequence Repeats)-анализа полиморфизма ДНК с использованием ПЦР; отбор наиболее генетически гетерогенных тестируемых проб ДНК; определение (секвенирование) нуклеотидных последовательностей от одного до трех полиморфных локусов у каждого тестируемого вида хвойных растений в регионе исследований; выявление у тестируемых образцов древесины фрагментов ДНК, характерных для рода (родовых), для вида (видовых) и сочетаний полиморфных популяционных ISSR-PCR, а у некоторых популяций и SNP-маркеров; сопоставление (определение тождества) выявленных фрагментов ДНК с установленными ранее идентификационными фрагментами ДНК для природных популяций тестируемых видов в регионе исследований. Изобретение позволяет эффективно идентифицировать неизвестные образцы древесины у видов хвойных растений и установить соответствие или его отсутствие фрагментов ДНК срубленных деревьев идентификационным фрагментам ДНК деревьев, произрастающих в природной популяции вида в регионе исследований. Изобретение позволяет с высокой точностью устанавливать тождество объектов предусматривает сравнение (тождество) испытуемых образцов, то сеть фрагментов ДНК, амплифицированных с пробами ДНК из древесины, с уже имеющимися изученными объектами, в данном случае с родовыми, видовыми и сочетаниями популяционных идентификационных фрагментов ДНК, выявленными в процессе предварительного молекулярно-генетического анализа природных популяций хвойных растений в регионе исследований. 2 з.п. ф-лы, 2 ил., 2 пр.
Изобретение относится к области биохимии, генной инженерии и биотехнологии, в частности к рекомбинантной плазмидной ДНК pClcRFP. Указанная плазмида pClcRFP кодирует продукцию гибридного флуоресцентного белка RFP для определения биодоступных хлорированных катехолов, их аналогов и тяжелых металлов. Нуклеотидная последовательность плазмиды pClcRFP представлена на Фиг. 2. Указанная плазмида является производной вектора pGEM-T, под Т7-промотор которого введены промоторный участок clc-оперона (421 п.о.), полноразмерный ген clcR (912 п.о.), межгенное пространство clcR-clcA (222 п.о.), начальная часть кодирующей последовательности clcA (252 п.о.) и ген красного флуоресцентного белка rfp. Настоящий ген rfp объединен в рамке считывания с указанной частью кодирующей последовательности гена clcA. Настоящее изобретение позволяет детектировать биодоступные хлорированные катехолы, их аналоги и тяжелые металлы в природных средах. 5 ил., 2 пр.
Группа изобретений относится к области биохимии. Предложен штамм бактерий Escherichia coli BL21 DE3 pClcRFP для детекции ионов меди, биосенсор и способ детекции ионов меди в анализируемой жидкой среде. Биосенсор включает корпус с микроканалами для анализируемой жидкой среды, внутри микроканалов ловушки в виде ряда микропилларов с иммобилизованными агарозными сферами. Причём агарозные сферы содержат способные к синтезу флуоресцентного белка RFP генномодифицированные клетки бактерий Escherichia coli BL21 DE3 pClcRFP. Способ осуществляют с помощью вышеуказанного биосенсора и включает иммобилизацию клеток бактерий Escherichia coli BL21 DE3 pClcRFP в агарозные сферы с диаметром от 50 до 70 мкм, помещение их в ловушки биосенсора, подачу анализируемой жидкой среды в биосенсор, измерение свечения агарозных сфер, обработку и сравнивание результатов с контрольными. Изобретения обеспечивают обнаружение ионов меди в среде и оценку степени загрязнённости с использованием малого объёма пробы и малого количества генномодифицированных клеток бактерий, необходимых для детекции одной пробы. 3 н. и 2 з.п. ф-лы, 5 ил., 3 пр.
Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу молекулярно-генетической идентификации древесных видов растений, который включает выбор эффективных стабильных молекулярных маркеров, сбор материала, проведение молекулярно-генетического анализа с использованием ПЦР, анализ выявленных ISSR-маркеров и определение идентификационных (мономорфных и полиморфных), анализ полученных данных после секвенирования, составление молекулярно-генетической формулы, составление штрихкода, составление генетического паспорта. Способ характеризуется тем, что в молекулярно-генетическую формулу и штрихкод, помимо идентификационных фрагментов ДНК разного размера, амплифицированных в результате полимеразной цепной реакции (ПЦР), вносят и другие структурные изменения геномов, такие как делеции, дупликации, однонуклеотидные замены (SNP - Single Nucleotide Polymorphism), выявленные при сравнительном анализе нуклеотидных последовательностей после секвенирования геномной ДНК. Изобретение позволяет эффективно идентифицировать древесные виды растений на нуклеотидном уровне. 6 з.п. ф-лы, 1 ил.
