Патенты автора Гущин Александр Евгеньевич (RU)
Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретеение представляет собой способ включает в себя выделение ДНК исследуемого образца, включающего ДНК M. genitalium, ПЦР-амплификацию мишеней, включая участок фрагмента гена гиразы указанной M. genitalium GyrB, участок V домена гена 23S рРНК указанной M. genitalium и участок QRDR гена ParC указанной M. genitalium, с флуоресцентной детекцией накопления продуктов амплификации с использованием зондов CGACGAGTTAACTCCCTAGCCTCGTC, Mg23SZwt1-1A и MgParCZwt1, содержащих различные флуорофоры на 5'-концах и гасители – на 3'-концах, с последующим построением кривой накопления продуктов амплификации и с определением k – тангенса угла наклона линейной части кривой накопления продуктов амплификации, F – максимального уровня флуоресцентного сигнала в образце, содержащем M. genitalium и разности десятичного логарифма общей концентрации M. genitalium в исследуемом образце и десятичного логарифма концентрации M. genitalium в исследуемом образце, полученного в результате амплификации ДНК M. genitalium с использованием прямого и обратного праймеров, амплифицирующих мишень, выбранную из участка V домена гена 23S рРНК указанной M. genitalium и участка QRDR гена ParC указанной M. genitalium, при этом, если величина F для фрагмента 23S рРНК составляет менее 15%, или если разность десятичного логарифма общей концентрации M. genitalium в исследуемом образце и десятичного логарифма концентрации M. genitalium в исследуемом образце, полученного в результате амплификации ДНК M. genitalium с использованием прямого и обратного праймеров, амплифицирующих участок V домена гена 23S рРНК M. genitalium, составляет более 0,6, или если k составляет менее 0,9, то делают вывод о наличии в исследуемом образце мутаций, приводящих к резистентности у M. genitalium к макролидным антибиотикам, а если величина F для фрагмента гена ParC составляет менее 15%, или если разность десятичного логарифма общей концентрации M. genitalium в исследуемом образце и десятичного логарифма концентрации M. genitalium в исследуемом образце, полученного в результате амплификации ДНК M. genitalium с использованием прямого и обратного праймеров, амплифицирующих участок QRDR гена ParC M. genitalium, составляет более 1,0, или если k составляет менее 0,6, то делают вывод о наличии в исследуемом образце мутаций, приводящих к резистентности у M. genitalium к фторхинолоновым антибиотикам. Изобретение обеспечивает способ выявления мутаций M. genitalium, использующий ПЦР-РВ, не требующий ни использования дополнительных ферментов, ни осуществления дополнительных стадий анализа, при этом позволяющий выявить наличие у M. genitalium, содержащихся в полученном от пациента исследуемом клиническом материале, мутаций на участке V домена гена 23S рРНК, ассоциированных с резистентностью к макролидным антибиотикам, а также наличие у M. genitalium, содержащихся в полученном от пациента исследуемом клиническом материале, мутаций на участке QRDR гена ParC, ассоциированных с резистентностью M. genitalium к фторхинолоновым антибиотикам. 3 з.п. ф-лы, 2 пр., 3 ил.
Настоящая группа изобретений относится к медицине. Предложен набор реагентов для выявления Chlamydia trachomatis в образце, включающий два олигонуклеотидных праймера для полимеразной цепной реакции (ПЦР), и применение указанного набора для выявления ДНК Chlamydia trachomatis в образце. Предложенный набор включает первый олигонуклеотидный праймер с последовательностью SEQ ID NO:2, и второй олигонуклеотидный праймер с последовательностью SEQ ID NO:3, а также, при необходимости, включает олигонуклеотидный зонд, термостабильную ДНК-полимеразу, буферный раствор для ПЦР, дезоксинуклеозидтрифосфаты. Набор позволяет эффективно выявлять клинически значимые штаммы/генотипы/серовары урогенитального биовара Chlamydia trachomatis с помощью единственной мишени ПЦР при использовании двух олигонуклеотидных праймеров, позволяющих получить продукт амплификации, который имеет размер, входящий в диапазон 70-110 пар нуклеотидов, и обеспечивающих амплификацию фрагмента ДНК Chlamydia trachomatis, лежащего внутри участка критической плазмиды Chlamydia trachomatis с последовательностью SEQ ID NO:1. Группа изобретений может быть использована в лабораторной диагностике Chlamydia trachomatis. 2 н. и 7 з.п. ф-лы, 5 табл., 2 пр.
Группа изобретений относится к биохимии. Описан набор реагентов для выявления ДНК Neisseria gonorrhoeae в образце, включающий по меньшей мере два олигонуклеотидных праймера для полимеразной цепной реакции и, при необходимости, олигонуклеотидный зонд, термостабильную ДНК-полимеразу, буферный раствор для ПЦР, дезоксинуклеозидтрифосфаты, отличающийся тем, что первый олигонуклеотидный праймер имеет нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 1, второй олигонуклеотидный праймер имеет нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 2. Также описан способ выявления ДНК Neisseria gonorrhoeae в образце методом полимеразной цепной реакции, отличающийся тем, что выявление проводят с использованием описанного набора реагентов. Изобретение может быть применено в лабораторной диагностике для выявления ДНК Neisseria gonorrhoeae в биологических образцах методом полимеразной цепной реакции. Группа изобретений позволяет с высокой чувствительностью и специфичностью выявлять все клинически значимые штаммы Neisseria gonorrhoeae с помощью единственной мишени полимеразной цепной реакции. 2 н. и 6 з.п. ф-лы, 4 табл., 3 пр.
СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ТРИХОМОНИАЗА // 2389016
Изобретение относится к медицине и биологии и может быть использовано для диагностики трихомониаза и определения наличия ДНК Trichomonas vaginalis в исследуемом образце
ВОЛОКНИСТЫЙ ФИЛЬТРОВАЛЬНЫЙ МАТЕРИАЛ // 2331726
Изобретение относится к целлюлозно-бумажной промышленности
