Способ визуальной полуколичественной оценки экспрессии белка cdx-2 в тканях иммуногистохимическим методом


G01N1/30 - Исследование или анализ материалов путем определения их химических или физических свойств (разделение материалов вообще B01D,B01J,B03,B07; аппараты, полностью охватываемые каким-либо подклассом, см. в соответствующем подклассе, например B01L; измерение или испытание с помощью ферментов или микроорганизмов C12M,C12Q; исследование грунта основания на стройплощадке E02D 1/00;мониторинговые или диагностические устройства для оборудования для обработки выхлопных газов F01N 11/00; определение изменений влажности при компенсационных измерениях других переменных величин или для коррекции показаний приборов при изменении влажности, см. G01D или соответствующий подкласс, относящийся к измеряемой величине; испытание

Владельцы патента RU 2758888:

федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО ОмГМУ Минздрава России) (RU)

Изобретение относится к области медицины, а именно к иммуногистохимическим методам исследования. Для оценки экспрессии белка CDX-2 в тканях проводят расчет индекса экспрессии, полученного путем суммирования паттерна экспрессии и произведения протяженности метки на интенсивность метки. Оценивают паттерн экспрессии по расположению позитивно окрашенных клеток. Оценивают протяженность метки, отражающую процент CDX2-позитивных клеток в исследуемом объеме материала. Оценивают интенсивность метки, отражающую окрашивание ядра. Способ позволяет получить интегральный показатель экспрессии CDX-2, ранжировать выраженность изменений в ткани, учитывать случаи с неравномерной экспрессией CDX-2 в пределах исследуемого объема материала, не зависимо от ориентировки биопсийного материала. 2 ил., 2 пр.

 

Ген сdx-2 относится к числу гомеозисных генов, критически важных для обеспечения и поддержания кишечной дифференцировки клеток [J. N. Freund et al., 2015]. Снижение его экспрессии приводит к снижению дифференцировки и экспрессии эпителиоцитами маркеров стволовых клеток (LGR5, BMI1, MSI1) [B. Pereira et al., 2013]. При этом полное исчезновение функции cdx-2, связанное с гомозиготной мутацией гена, является летальным, поскольку приводит к нарушению формирования кишечной трубки.

Помимо влияния на дифференцировку клеток, ген cdx-2 обладает и другими плейотропными эффектами. В частности, cdx-2 оказывает влияние на клеточную миграцию и модифицирует экспрессию молекул адгезии, участвующих в процессах взаимодействия клеток и субстрата, а также клеток между собой: E-кадгерина, LI-кадгерина, Mucdhl, клаудина 2, субъединицы интегрина-β4, цепи ламинина-γ2, гемидсомосомального белка, APC и α-актинина [M. Coskun, et al., 2010]. Кроме того, как фактор транскрипции белок CDX-2 способен тормозить деление клеток за счет связывания с богатыми тимином и аденином участками ДНК, индукции гена-супрессора клеточной пролиферации gut enriched Krupel-like factor ингибирования системы киназ [D. T. Dang et al., 2001].

Таким образом, описанное прямое участие cdx-2 в процессах клеточного деления и дифференцировки позволяет оценить его в качестве онкосупрессора.

Снижение и исчезновение его экспрессии, в частности, ассоциировано с неблагоприятным прогнозом при колоректальном раке [K. Slik et al., 2019]. Диагностическое значение имеет как снижение экспрессии cdx-2, так и появление его аберрантной экспресии. Так, наличие CDX-2-позитивных клеток в слизистой оболочке желудка указывает на изменение программы дифференцировки клеток с желудочной на кишечную и является маркером атрофии – предракового изменения, предшествующего развитию рака желудка (аденокарциномы).

Роль белка CDX-2 в регуляции клеточного цикла и канцерпротекции обусловливает важность его детекции в тканях. Оценку уровня экспрессии CDX-2 в тканях принято проводить иммуногистохимическим методом. Осуществляется она на основе распознавания ядерного окрашивания. Наиболее распространенным подходом является бинарная оценка экспрессии CDX-2 (окрашивание есть / окрашивания нет), позволяющая выделить случаи с полным отсутствием экспрессии CDX-2 с исчезновением его функций. Однако такой упрощенный подход не позволяет распознать ситуации, ассоциированные с развитием предраковых изменений или риском возникновения рака желудка, с учетом недостатка которого B. Peleteiroa и соавт. [B. Peleteiroa et al., 2012] предложили балльную полуколичественную систему оценки уровня экспрессии CDX-2. В их работе, используемой в качестве прототипа, предложено оценивать следующие показатели: процент клеток, экспрессирующих CDX-2 (экспрессия отсутствует (0% клеток), легкая (1–5%), умеренная (5–25%) или выраженная (> 25%)) и паттерн экспрессии (отсутствие – 0, изолированное окрашивание (<3 клеток) – 1, очаговое окрашивание (>3 клеток) – 2, железистое окрашивание (экспрессия в целых железах) – 3).

Такой подход обладает рядом недостатков.

1. Предполагает оценку двух изолированных параметров и не позволяет получить интегральный показатель экспрессии CDX-2 и ранжировать выраженность изменений в ткани.

2. Не учитывает случаи с неравномерной экспрессией CDX-2 в пределах исследуемого объема материала.

3. Низкое пороговое значение для распространенности метки (процента клеток, экспрессирующих CDX-2) приводит к искусственному завышению этого показателя.

Для преодоления недостатков был разработан собственный способ полуколичественной оценки результатов иммуногистохимической окраски белка CDX-2 в тканях. Предлагаемый способ основан на оценке полуколичественного индекса экспрессии CDX-2, учитывающей процент CDX-2-позитивных клеток в биоптате, интенсивность ядерного окрашивания и паттерн экспрессии.

Индекс экспрессии CDX-2 рассчитывается по формуле:

Индекс экспрессии CDX-2 = ПЭ + ПМ × ИМ,

где ПЭ – паттерн экспрессии, оцениваемый в исследуемом материале следующим образом: разрозненные позитивно окрашенные клетки (допускается до трех рядом расположенных клеток) – 1 балл, очаговая экспрессия более чем в трех рядом расположенных клеток без экспрессии во всех клетках железы соответствующей ей зоне покровно-ямочного эпителия – 2, линейная сплошная экспрессия во всей железе и соответствующей ей зоне покровно-ямочного эпителия – 3 балла.

ПМ – протяженность метки со следующей градацией, учитывающей процент CDX-2-позитивных клеток в биоптате: экспрессия отсутствует (0%) – 0 баллов, экспрессия очаговая (1-5%) – 1 балл, фокальная (5-25%) – 2 балла, мультифокальная (25-50%) – 3 балла, распространенная (более 50%) – 4 балла,

ИМ – интенсивность метки, оцениваемая следующим образом: отсутствие метки – 0 баллов; слабая интенсивность, соответствующая светло-коричневому окрашиванию ядра – 1 балл; выраженная интенсивность, соответствующая темно-коричневому окрашиванию ядра – 2 балла.

При сочетании паттернов и/или вариантов интенсивности окрашивания ядра расчет индекса CDX-2 проводится по преобладающему (доминирующему) компоненту.

Преимуществами предлагаемого метода являются.

1. Возможность применения способа в рутинной практике независимо от качества ориентировки биопсийного материала.

2. Позволяет получить интегральный показатель экспрессии CDX-2 и ранжировать выраженность изменений в ткани.

3. Учитывает случаи с неравномерной экспрессией CDX-2 в пределах исследуемого объема материала.

Оценка индекса экспрессии CDX-2 на примере фрагмента слизистой оболочки антрального отдела желудка с признаками очаговой кишечной метаплазии (Фигура 1). При проведении иммуногистохимической реакции в гистологических срезах тканей мы выявили, что позитивные меченые клетки преимущественно представлены во всей железе и соответствующей ей зоне покровно-ямочного эпителия (3 балла). Наличие 75% положительно окрашенных (окрашенных в коричневый цвет) ядер соответствует распространенной протяженности метки (более 50% позитивно окрашенных ядер в клетках в гистологическом препарате – 4 балла). Интенсивность ядерной метки равномерная и выраженная (2 балла). Таким образом, общий индекс экспрессии CDX-2 составил 3 + 4 × 2 = 11 баллов.

Оценка индекса экспрессии CDX-2 на примере фрагмента слизистой оболочки антрального отдела желудка с фенотипически неизмененным желудочным эпителием (Фигура 2). При проведении иммуногистохимической реакции в гистологических срезах тканей мы выявили, что позитивно мечение клетки формируют отдельные скопления из 3-5 линейно скомпонованных клеток (2 балла). Наличие 2% положительно окрашенных (окрашенных в коричневый цвет) ядер клеток соответствует очаговой метке (менее 5% положительно окрашенных ядер в срезе – 1 балл). Интенсивность ядерной метки была выражена равномерно и была низкой (1 балл). Таким образом, общий индекс экспрессии CDX-2 составил 2 + 1 × 1 = 3 балла.

При проведении пробной оценки индекса иммуногистохимической метки белка CDX-2 в гистологических срезах ткани с использованием предлагаемого способа в 131 исследуемом образце тканей слизистой оболочки желудка был получен разброс значений от 0 до 11, что коррелировало с выраженностью атрофических изменений (коэффициент ранговой корреляции Спирмена (r) = 0,4 при р=0,00001).

Способ визуальной полуколичественной оценки экспрессии белка CDX-2 в тканях иммуногистохимическим методом, отличающийся тем, что проводят расчет индекса экспрессии, полученного путем суммирования паттерна экспрессии и произведения протяженности метки на интенсивность метки, где оценивают паттерн экспрессии: при выявлении разрозненных позитивно окрашенных клеток допускается до трех рядом расположенных клеток – 1 балл, при очаговой экспрессии более чем в трех рядом расположенных клетках, без экспрессии во всех клетках железы соответствующей ей зоне покровно-ямочного эпителия – 2 балла, при линейной сплошной экспрессии во всей железе и соответствующей ей зоне покровно-ямочного эпителия – 3 балла; оценивают протяженность метки, отражающую процент CDX2-позитивных клеток в исследуемом объеме материала: при отсутствии экспрессии 0% – 0 баллов, при выявлении очаговой экспрессии 1-5% – 1 балл, при фокальной экспрессии 6-25% – 2 балла, при мультифокальной экспрессии 26-50% – 3 балла, при распространенной более 50% – 4 балла; оценивают интенсивность метки, отражающую полуколичественную визуальную оценку интенсивности метки, отражающую окрашивание ядра: при отсутствии метки – 0 баллов, при выявлении слабой интенсивности, соответствующей светло-коричневому окрашиванию ядра – 1 балл, при выраженной интенсивности, соответствующей темно-коричневому окрашиванию ядра – 2 балла; при этом в случае сочетания паттернов экспрессии и/или вариантов интенсивности метки расчет индекса CDX-2 проводят по доминирующему компоненту.



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к области медицины, а именно к способу деструкции нуклеокапсида бактериофага М.П. Покровской.

Изобретение относится к области измерительной техники, в частности к устройствам и способам выявления примесей в трансмиссионном масле и определения степени его загрязненности. Предложен способ оперативного контроля качества трансмиссионного масла, заключающийся в том, что наличие металлических частиц износа узлов трансмиссии в исследуемом масле фиксируется планарной катушкой Теслы, при этом индуктивность планарной катушки Теслы изменяется в зависимости от количества металлических частиц в трансмиссионном масле.

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложено анти-PD-L1 антитело.
Изобретение относится к медицине, а именно к офтальмологии, и может быть использовано для определения показаний к антиангиогенной терапии при подозрении на влажную форму возрастной макулярной дегенерации (ВМД). В сыворотке крови определяют концентрацию цитокинов HGF и IL-1RA.

Настоящее изобретение относится к области иммунологии. Предложено антитело, способное к специфическому связыванию с полипептидным эпитопом HNL.

Изобретение относится к области радиационных экспериментальных исследований в условиях космоса. Способ включает изготовление из исследуемого материала цилиндрического контейнера с толщиной стенки, равной пробегу протонов с энергией 50 МэВ в данном материале.

Изобретение относится к области экспериментальной техники и может быть использовано для определения параметров уплотнения отходов. Стенд содержит бак (1), выполненный из двух соединенных между собой частей (2, 3), прижимной диск (4), размещенный со стороны верхней части бака (1) и скрепленный с нажимным стержнем (5), имеющим резьбу, с возможностью захода и перемещения внутри полости бака (1) при ручном воздействии на нажимной стержень (5).

Изобретение относится к аналитической химии. Способ количественного определения карбофурана в воде методом анодной вольтамперометрии включает подготовку образцов воды добавлением к ней стандартного раствора карбофурана в метаноле после гидролиза.
Изобретение относится к микрокапсулам для использования в медицине, биологии, экологии и различных отраслях промышленности. Способ изготовления индикаторных микрокапсул с использованием магнитных и плазмонных наночастиц, усиливающих люминесцентные свойства углеродных точек, соединенных с их носителем, заключается в применении центрифугирования для очистки от неприсоединившихся к носителю углеродных точек и добавлении плазмонных наночастиц при завершающей процедуре.

Изобретение относится к области медицины, в частности к онкологии и эпигенетике. Предложен способ прогноза прогрессирования заболевания у больных раком желудочно-кишечного тракта после проведенного лечения.

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложено анти-PD-L1 антитело.
Наверх