Патенты автора Лазарева Анна Валерьевна (RU)
Изобретение относится к области биотехнологии. Путем секвенирования была получена нуклеотидная последовательность МITЕKpnl. Для выделения ДНК использовали суточную культуру штамма К. pneumoniae, резистентного к колистину, полученную при посеве на агар Uri-select (BioRad, США). Экстракцию ДНК из бактериальных культур выполняли с помощью коммерческого набора реагентов DNeasy Blood & Tissue Kit (Qiagen, Германия) в соответствии с инструкцией производителя. Установлена и описана нуклеотидная последовательность фрагмента ДНК, нарушающая структуру и функцию гена mgrB у колистин-резистентного штамма K. pneumoniae. Использование описанной нуклеотидной последовательности MYTEKpnl:3GGAAGGTGCGAATAAGTCАССAAACGCААА АAAACGCCTATGTAAGTGATTGAАTTTAATT GACTAAAAGTTTCATTTTCGTTGCGG AGGGTACTTATTCGCАССТТСС-5', способной к интеграции и перемещениям внутри генома, а также способной изменять структуру, функцию и экспрессию гена, ее обнаружение в бактериальном геноме поможет расшифровать механизмы возникновения резистентности бактерий к антибиотикам, что будет способствовать рациональному выбору антимикробных препаратов и разработке мер по преодолению устойчивости. 2 ил.
Изобретение относится к области медицины. Изобретение представляет собой набор специфичных олигонуклеотидных праймеров для видовой идентификации бактерий рода Acinetobacter и определения устойчивости к бета-лактамным антибиотикам, включающий: 2 пары олигонуклеотидных праймеров для амлификации гена rpoB, с нуклеотидными последовательностями atgcgtccaggcgagccaccaac, gcggctgaaa acttattcaa taac, tctg aacgctatga cttatc, atggtcgtgtttgtccaattgaa; 3 пары олигонуклеотидных праймеров для амлификации генов карбапенемаз ОХА-типа (оха-51 и оха-51-like), с нуклеотидными последовательностями gcaccataaggcaaccaccaca, aagtatttaaatgggatggg, agaatgggaaaagaacatgacc, ttggacttgagctcatgtctaag, gcaccataaggcaaccacccgg, aagtatttaaatgggatgcc; 2 пары олигонуклеотидных праймеров для амлификации гена карбапенемазы оха-23, с нуклеотидными последовательностями atctggtgtttaaaatgaataa, gattcatcaatactttgatgaa, tggaagggcgagaaaaggtcat, ggcaagggatataaaaccacaa; 2 пары олигонуклеотидных праймеров для амлификации гена карбапенемазы оха-40, с нуклеотидными последовательностями tgaagctcaaacacagggtgta, taaaaaaagaacttatcctatgtg, ccagtatatcaagagcttgcaag, ccttaaaattacaccagtacaagaag. Способ идентификации бактерий Acinetobacter и определения их устойчивости к бета-лактамным антибиотикам включает выделение ДНК из проб биоматериала или бактериальных культур и проведение ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами, при этом используют предложенный набор олигонуклеотидных праймеров, и в случае обнаружения генов rpoB и оха-51 идентифицируют бактерий рода Acinetobacter, а при наличии генов оха-23 и оха-40, кодирующих карбапенемазы ОХА-23 и ОХА-40, делают вывод об устойчивости анализируемого штамма к антибактериальным препаратам бета-лактамного ряда. Изобретение позволяет идентифицировать бактерии Acinetobacter непосредственно в клиническом материале с одновременным определением устойчивости к карбапенемам ОХА-типа; а также может быть использован при выборе лекарственного препарата, режима лечения и для эпидемиологического контроля. 2 н.п. ф-лы, 2 табл.
Изобретение относится к биохимии, в частности к способу идентификации генов клинически значимых семейств β-лактамаз у грамотрицательных микроорганизмов, например, у различных штаммов Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Burkholderia spp., Enterobacter spp., Stenotrophomonas maltophilia, Elizabethkingia meningoseptica, Serratia marcescens. Способ осуществляют путём амплификации фрагментов генов с помощью полимеразной цепной реакции с набором специфических олигонуклеотидных праймеров и последующим разделением продуктов реакции путём электрофореза в агарозном геле. С помощью указанного способа идентифицируют гены следующих семейств β-лактамаз SHV, СТХ-М, VIM, IMP, NDM, ОХА, KPC, GES, GIM и SPM. Настоящее изобретение позволяет увеличить арсенал средств для идентификации генов семейств β-лактамаз SHV, СТХ-М, VIM, IMP, NDM, ОХА, KPC, GES, GIM и SPM. 4 табл., 2 пр.
Группа изобретений относится вариантам добавок к питательной среде для формирования бактериальных биопленок. Предложена добавка, состоящая из биополимера фибрина в количестве от 0,05 г до 10 г на 1 кг питательной среды и ингибитора протеиназ. Также предложена добавка, которая состоит из фибриногена в количестве от 0,05 г до 10 г на 1 кг питательной среды, плазмокоагулазы в соотношении к фибриногену от 1:128 до 1:10000 (масса:масса) и ингибитора протеиназ. Как вариант, предложена добавка, состоящая из фибриногена в концентрации от 0,01 г/л до 10 г/л, комплекса «тромбин-ионы Са2+», состоящего из тромбина в соотношении к фибриногену 1:10-1:500 и ионов Са2+ в количестве от 0,08 г до 0,2 г на 1 кг питательной среды, и ингибитора протеиназ. Ингибитор протеиназ используют в составе добавок в количестве от 0,002 г до 0,5 г на 1 кг питательной среды. Группа изобретений позволяет получить биопленки на основе штаммов бактерий, которые не способны формировать биопленки на известных питательных средах без предлагаемой добавки. 3 н.п. ф-лы, 2 ил., 3 табл., 3 пр.
