Патенты автора Курочкин Владимир Ефимович (RU)
Группа изобретений относится к способу определения и сохранения оптимального качества фокусировки изображения и к системе формирования изображения объектов флуоресценции в проточной ячейке. Изобретения могут быть использованы в приборах массового параллельного секвенирования ДНК путем синтеза. Способ включает определение параметра качества фокусировки координат по оси Z при оптимальном значении параметра качества фокусировки изображения для четырех или более полей зрения, имеющих координаты опорных точек по взаимно перпендикулярным осям X и Y; аппроксимацию зависимости координаты Z от координат опорных точек X и Y непрерывными функциями и управление устройством перемещения микрообъектива по оси Z для всех положений по осям X, Y в соответствии с полученными функциями зависимости координаты Z от координат опорных точек X и Y. Система содержит платформу для образцов с проточной ячейкой, источник излучения, оптический блок, контроллер с устройствами перемещения платформы для образцов и устройством для перемещения микрообъектива, блок определения параметра качества фокусировки, блок оптимизации качества фокусировки изображения и аппаратный модуль, связанный с контроллером (6) и блоком оптимизации качества фокусировки изображения (11), или модуль программного обеспечения контроллера (6), которые определяют функциональную зависимость координаты микрообъектива (5) по оси Z от координат платформы (1) для образцов по осям X и Y для поддержания оптимального качества фокусировки изображения и устанавливают положение микрообъектива по оси Z для всех положений платформы (1) для образцов по осям X и Y. Осуществление группы изобретений обеспечивает упрощение системы формирования изображений объектов флуоресценции анализируемых образцов ДНК, а также ускоряет получение множества изображений с оптимальным качеством фокусировки. 2 н. и 2 з.п. ф-лы, 4 ил.
Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой набор реагентов для выявления и идентификации ДНК возбудителя сибирской язвы методом полимеразной цепной реакции в реальном времени «ОМ-Скрин-Сибирская язва-РВ», который представляет собой расфасованную в стрипованные микропробирки лиофильно высушенную реакционную смесь, состоящую из эквимолярной смеси дезоксинуклеозидтрифосфатов, Taq-ДНК-полимеразы, синтетической ДНК внутреннего положительного контроля, трегалозы, видоспецифических праймеров для индикации хромосомного маркера Bacillus anthracis - фрагмента гена ssp SEQ ID NO 1 (5'-agcaaacgcacaatcagaag-3'), SEQ ID NO 2 (5'-acgtctgtttcagttgcaaattctgtacc-3') и флуоресцентного зонда SEQ ID NO 3 ((R6G)-ctggtgctagcattcaaagcacaaatgct-(BH2)); праймеров для индикации участка гена сарА плазмиды рХO2 SEQ ID NO 4 (5'-tttcaccagcacccacatagtca-3'), SEQ ID NO 5 (5'-cagtaaaagaagccggatttaca-3') и флуоресцентного зонда SEQ ID NO 6 ((ROX)-tggcgaataaccatatga(C-LNA)ggattatg-(BHQ2)); праймеров для индикации участка гена lef плазмиды pXOl SEQ ID NO 7 (5'-tttcaccagcacccacatagtca-3'), SEQ ID NO 8 (5'-cagtaaaagaagccggatttaca-3') и флуоресцентного зонда SEQ ID NO 9 ((FAM)-cgggcggtcatggtgatgtaggtatg-(RTQ1)); праймеров SEQ ID NO 10 (5'-agaactcgtagcgctagctgtag-3'), SEQ ID NO 11 (5'-cgtagaactagctgtagcgct-3') и флуоресцентного зонда SEQ ID NO 12 ((Cy5)-agcggctcctacttctgcagggg-(BHQ2)) внутреннего положительного контроля, а также в отдельных микропробирках: разбавителя; положительного контрольного образца, представляющего лиофильно высушенную смесь из четырех рекомбинантных плазмид pGem-T, содержащих встроенные специфические последовательности ДНК: фрагмент гена ssp, фрагмент гена lef, кодирующего летальный фактор сибиреязвенного микроба (плазмида pXO1), фрагмент гена капсулообразования сарА (плазмида рХO2), специфический фрагмент контрольной ДНК; отрицательного контрольного образца; внутреннего положительного контроля выделения. Набор реагентов позволяет поддерживать диагностику специфической патологии (сибирская язва) при исследовании материала от больного (подозрительного на заболевание) и индикации патогенных биологических агентов в объектах окружающей среды; как ускоренного предварительного теста при выполнении биологического метода исследования и идентификации подозрительных культур; эпидемиологического мониторинга. 20 ил., 5 табл.
Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой набор реагентов для генетического типирования штаммов возбудителя сибирской язвы методом фрагментного анализа «ОМ-Сибирская язва-Генотип», состоящий из расфасованных в стрипованные микропробирки и лиофильно высушенных пяти реакционных смесей, включающих эквимолярную смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов, Taq-ДНК-полимеразу, трегалозу, флюоресцентно-меченые праймеры, а также в отдельных микропробирках - разбавителя реакционных смесей, положительного контрольного образца, раствора для разбавления положительного контрольного образца. Диагностическая роль набора реагентов заключается в возможности его использования в поддержке диагностики специфической патологии (сибирская язва) при исследовании клинических изолятов Bacillus anthracis, выделенных из материала от больного (подозрительного на заболевание); сибиреязвенных изолятов из объектов окружающей среды; в качестве генетического теста идентификации штаммов сибиреязвенного микроба; для эпидемиологического мониторинга. 1 з.п. ф-лы, 5 ил., 5 табл.
Изобретение относится к приборам для качественного и количественного анализа нуклеиновых кислот (ДНК и РНК) и может быть использовано в медицинской практике при диагностике инфекционных, онкологических и генетических заболеваний человека и животных, в исследовательских целях при молекулярно-биологических, генетических исследованиях, при мониторинге экспрессии генов
УСТРОЙСТВО ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОНЦЕНТРАЦИИ ИММУНОАКТИВНЫХ ОБЪЕКТОВ В ПРОБАХ БИОЛОГИЧЕСКИХ ЖИДКОСТЕЙ // 2398233
Изобретение относится к медицинской технике, а именно к устройствам для определения концентрации иммуноактивных объектов в пробах биологических жидкостей
Изобретение относится к области аналитического приборостроения и может найти применение при изготовлении оптических окон детектирования в модифицированном кварцевом капилляре или капиллярной колонке, а также для удаления покрытия на концах капилляра, опускаемых в промывочные и буферные электролиты
Изобретение относится к приборам для качественного и количественного анализа нуклеиновых кислот (ДНК и РНК) и может быть использовано в медицинской практике при диагностике инфекционных, онкологических и генетических заболеваний человека и животных, в исследовательских целях при молекулярно-биологических, генетических исследованиях, мониторинге экспрессии генов
СПОСОБ ОБЕЗЗАРАЖИВАНИЯ ВОДЫ // 2286951
Изобретение относится к технологии обеззараживания воды и может быть использовано для стерилизации природных и сточных вод
СПОСОБ ПРОИЗВОДСТВА НАНОЧАСТИЦ // 2272697
Изобретение относится к порошковой металлургии, к способам получения металлических и оксидных наночастиц
