Способ дифференциальной диагностики лейомиосарком и пролиферирующих (клеточных) лейомиом матки

Изобретение относится к области медицины. Предложен способ дифференциальной диагностики лейомиосарком и пролиферирующих (клеточных) лейомиом матки, включающий анализ молекулярно-генетических изменений микросателлитных ДНК в образцах опухолевой ткани. Определяют наличие генетических изменений микросателлитов D17S1161, D10S1213, D10S1146, D10S218, D10S24, D9S942, D9S251 и D3S1295 в образце опухолевой и образце смежной нормальной ткани или периферической венозной крови путем проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров. При наличии изменений в форме потери гетерозиготности и/или микросателлитной нестабильности по крайней мере в одном из указанных микросателлитов в образце опухолевой ткани диагностируют злокачественную природу опухоли. Изобретение обеспечивает эффективный способ дифференциальной диагностики лейомиосарком и пролиферирующих (клеточных) лейомиом матки по наличию гетерозиготности и/или микросателлитной нестабильности по крайней мере в одном из указанных микросателлитов в образце опухолевой ткани. 2 ил., 4 пр.

 

Изобретение относится к исследованию биологических материалов, в частности к способам молекулярной диагностики злокачественных новообразований, и может быть использовано при исследовании образца ткани для дифференциальной диагностики лейомиосарком (ЛМС) матки и пролиферирующих (клеточных) лейомиом (пЛМ) матки.

Проблемы, возникающие при необходимости дифференциальной диагностики высокодифференцированной ЛМС и пЛМ, обусловлены тем, что применяемые в настоящее время диагностические методы (морфологические, иммуногистохимические и иные инструментальные исследования) не достаточно информативны. Указанное обстоятельство требует разработки дополнительных критериев для диагностики ЛМС матки.

Известен ряд исследований, посвященных анализу генетических изменений, характерных для ЛМС матки (Frequent loss of heterozygosity for chromosome 10 in uterine leiomyosarcoma in contrast to leiomyoma. // American Journal of Pathology. - 1999. - vol.154, №3. - pp.945-950; Specific loss of heterozygosity of chromosome 3p loci in soft tissue leiomyosarcoma. // Zhonghua Bing Li Xue Za Zhi. - 2003. - 32, pp.124-127; Leiomyosarcoma and malignant fibrous histiocytoma share similar allelic imbalance pattern at 9p. // Virchows Archiv. - 2005. - 446, pp.251-258; Array comparative genomic hybridization analysis of uterine leiomyosarcoma. // Gynecol Oncol. - 2005. - 99(3). - pp.545-51). Авторами известных исследований установлено, что для данного типа сарком характерны аллельные делеции (потеря гетерозиготности (ПГ) и микросателлитная нестабильность (МН)) локусов 3р, 9р, 10р, 10q, 17q. Однако в каждом из перечисленных исследований авторы оценивали генетические изменения в ЛМС матки только в отдельных локусах и не пытались рассмотреть совокупность этих изменений и создать на их основе диагностическую систему для дифференциальной диагностики ЛМС и пЛМ.

Заявляемое изобретение направлено на решение задачи создания достоверной диагностической тест-системы злокачественных гладкомышечных новообразований матки (ЛМС).

Использование в клинической практике заявляемого способа позволяет достичь нескольких технических (лечебных) результатов:

- возможность определения характера опухолевого заболевания путем выявления признаков генетической нестабильности и биологической агрессивности опухоли,

- возможность уточняющей диагностики лейомиосарком матки.

Указанные технические (лечебные) результаты при осуществлении изобретения достигаются за счет того, что также как в известном способе осуществляют анализ молекулярно-генетических изменений микросателлитных ДНК в образцах опухолевой ткани.

Особенность заявляемого способа заключается в том, что определяют наличие генетических изменений в совокупности следующих микросателлитов:

- D17S1161 расположенном в локусе 17q23,

- D10S1213, расположенном в локусе 10q26.13,

- D10S1146 и D10S218, расположенных в локусе 10q22.1,

- D10S24, расположенном в локусе 10р13,

- D9S942, расположенном в локусе 9р21.3,

- D9S251, расположенном в локусе 9р21,

- D3S1295, расположенном в локусе 3р14.3

в образце опухолевой и образце смежной нормальной ткани или периферической венозной крови путем проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров. При наличии изменений в форме ПГ и/или МН по крайней мере в одном из указанных микросателлитов в образце опухолевой ткани диагностируют злокачественную природу опухоли.

Сущность изобретения заключается в следующем.

Известно, что одной из основных причин злокачественных новообразований являются генетических факторы.

К маркерам канцерогенеза относят внутригеномные перестройки микросаттелитных ДНК, происходящие в процессе нарушения процессов репарации. Микросателлитные ДНК - тандемно организованные, высокоповторяющиеся последовательности, расположенные в нетранслируемой области генома, длиной от 1 до 4 пар нуклеотидов. Опухолевый геном характеризуется генетической нестабильностью микросателлитов. Признаками нестабильности повторов являются ПГ - изменение суммарной длины микросателлитов и МН - появление новых микросателлитов. ПГ и МН являются чувствительными маркерами опухолевых клеток.

В результате проведенных исследований авторами заявляемого способа была выявлена высокая частота ПГ и/или МН следующих микросателлитных маркеров:

- D17S1161, расположенном в хромосомном районе ДНК 17q23,

- D10S1213, расположенном в хромосомном районе ДНК 10q26.13,

- D10S1146 и D10S218, расположенных в хромосомном районе ДНК 10q22.1,

- D10S24, расположенном в хромосомном районе ДНК 10р13,

- D9S942, расположенном в хромосомном районе ДНК 9р21.3,

- D9S251, расположенном в хромосомном районе ДНК 9р21,

- D3S1295, расположенном в хромосомном районе ДНК 3р14.3,

что характерно для пациенток с гистологическим диагнозом ЛМС матки. Частота составила в среднем 40%. В группе пациенток с диагнозом пЛМ матки генетические изменения не были выявлены. В результате сравнительного анализа генетических изменений между группами пациенток с диагнозом ЛМС матки и пЛМ матки было установлено, что необходимым и достаточным для дифференциальной диагностики ЛМС и пЛМ матки является определение наличия генетических изменений в совокупности следующих микросателлитов:

- D17S1161, расположенном в хромосомном районе ДНК 17q23,

- D10S1213, расположенном в хромосомном районе ДНК 10q26.13,

- D10S1146 и D10S218, расположенных в хромосомном районе ДНК 10q22.1,

- D10S24, расположенном в хромосомном районе ДНК 10р13,

- D9S942, расположенном в хромосомном районе ДНК 9р21.3,

- D9S251, расположенном в хромосомном районе ДНК 9р21,

- D3S1295, расположенном в хромосомном районе ДНК 3р14.3,

в образце опухоли при сравнении с образцом смежной нормальной ткани.

Специфичность и чувствительность данной системы составляет 96% и 95% соответственно.

Результатом исследований, произведенных авторами заявляемого изобретения, является единая диагностическая тест-система, позволяющая осуществить дифференциальную диагностику ЛМС матки и пЛМ матки.

Способ осуществляют следующим образом.

1. Клинический материал представлен:

- образцом опухолевой ткани. На гистологическом препарате должно быть представлено >70% опухолевых клеток,

- образцом смежной нормальной ткани (без патоморфологических изменений), или/и если на гистологических препаратах такового нет, образцом периферической венозной крови пациентки.

В качестве консерванта для периферической венозной крови используют 0.5 М раствор ЭДТА. При заборе крови в пробирку к 20 мкл консерванта добавляют 1,8 мл крови и тщательно перемешивают.

2. Выделение ДНК.

Выделение ДНК проводят из операционного материала, фиксированного в формалине с последующей парафинизацией, с помощью коммерческого набора «ДНК-Сорб (В/АМ)» (ИнтерЛабСервис, РФ) и/или, для особо малых количеств материала, набором «QIAamp DNA FFPE Tissue kit» (QIAGEN, Германия), в соответствии с приложенным инструкциями. Депарафинизацию материала проводят по стандартной схеме.

3. Микросателлитный анализ.

Идентификацию ПГ и/или МН проводят путем микросателлитного анализа, представляющего собой ПЦР с использованием специфических праймеров, которую осуществляют по следующей схеме:

- к 0.1 мкг геномной ДНК добавляют 0.05 мкМ каждого олигопраймера, 200 мкМ каждого дезоксинуклеотидтрифосфата, 1-2 ед. Taq-полимеразы, 5 мкл однократного буфера для ПЦР следующего состава: 50 мМ KCl, 10 мМ Трис-HCl (рН 8,4), 5 мМ MgCl2;

- добавляют 30 мкл вазелинового масла, прогревают смесь при 94°С в течение 10 мин и проводят 35 циклов по следующей программе: денатурация при 94°С - 40 с, отжиг при 56-60°С - 1 мин 30 с, элонгация при 72°С - 30 с;

- В качестве контроля ПЦР используют ДНК лейкоцитов периферической крови «здоровых» пациентов (без онкологии).

4. Продукты амплификации разделяют в 6%-ном денатурирующем полиакриламидном геле (ПААГ) и окрашивают нитратом серебра.

ПГ оценивают как ослабление или отсутствие полосы одного из аллелей на электрофореграмме относительно нормальной ткани или периферической венозной крови пациента. МН оценивают как появление дополнительной полосы на электрофореграмме относительно нормальной ткани или периферической венозной крови пациента.

Примеры выполнения:

1. Пациентка Б. Возраст: 28 лет. Клинические данные: В середине января 2011 года был удален миоматозный узел. Миоматозный узел впервые обнаружен в июле 2010 года. Консультирована в Научном центре хирургии, где был поставлен диагноз пЛМ. Рекомендован пересмотр стекол гистологических препаратов в МНИОИ им. П.А.Герцена. Нормальная ДНК была получена из периферической венозной крови.

Патологоанатомическое заключение: Формальная морфологическая картина крайне подозрительна по ЛМС, однако низкое число митозов и не специфичекая ИГХ реакция не позволяет подтвердить диагноз категорически.

Заключение ИГХ: Ki67: положительный в 5% клеток опухоли, ГМА (гладкомышечный актин) положительный в клетках опухоли. Новообразование имеет гладкомышечную природу.

Заключение молекулярно-генетического исследования: Проведено молекулярно-генетическое исследование методом микросателлитного анализа районов D17S1161, D10S218, D10S1146, D10S24, D10S1213, D9S942, D9S251, D3S1295. Обнаружена ПГ в микросателлите D10S218 и МН в микросателлите D3S1295.

Заключение: с учетом морфологической картины и данных молекулярно-генетического исследования - ЛМС G1.

2. Пациентка К. Возраст: 49 лет. Клинические данные: Консультативный материал из ЦКБ №2 им. Н.А.Семашко. В 1999 г. при введении ВМС впервые выявлена миома матки малых размеров. В течение последних 5-6 лет отмечалась длительная менструация (до 10 дней). В 2005 г. выявлена цистаденома правого яичника, полип. В 2010 г. произведена Hs+РДВ. В марте 2011 г. операция. Нормальная ДНК была получена из смежной нормальной ткани.

Патологоанатомическое заключение: Гистология ЦКБ №2 им. Н.А.Семашко: Клеточная митотически активная лейомиома.

Патологоанатомическое отделение МНИОИ им. П.А.Герцена: Эндометрий стадии пролиферации, клеточная пЛМ матки с редкими фигурами митозов. Для категорического исключения ЛМС желательно молекулярно-генетическое исследование.

Заключение молекулярно-генетического исследования: Проведено молекулярно-генетическое исследование методом микросателлитного анализа ПГ и МН, характерных для ЛМС матки в микросателлитах D17S1161, D10S218, D10S1146, D10S24, D10S1213, D9S942, D9S251, D3S1295 не обнаружено.

Заключение: с учетом морфологической картины и данных молекулярно-генетического исследования - клеточная пЛМ матки.

3. Пациентка Р. Возраст: 47 лет. Клинические данные: В 2004 г. диагностирована лейомиома матки. В 2009 г. обнаружено новообразование в легком клеточно-волокнистого строения. Материал консультативный из ГКБ 67, невозможно получить более полные клинические данные. Нормальная ДНК получена из смежной нормальной ткани.

Патологоанатомическое заключение: №1 в препаратах стенка матки с очагами аденомиоза, эндометрий с секретирующими железами, участки клеточной атипической (причудливой) лейомиомы. №2 в ткани легкого рост опухоли клеточно-волокнистого строения с мелкими железисто-подобными структурами. Для уточнения гистогенеза и потенциала новообразования в легком необходимо иммунофенотипирование. Для исключения лейомиосаркомы необходимо молекулярно-генетическое исследование.

Заключение ИГХ: Ki67 положительный в 20% клеток опухоли, десмин, ГМА (гладкомышечный актин) положительный в клетках опухоли, S100 положительная в клетках опухоли, CD34 положительная в эндотелиоцитах сосудов, CD117, NSE, кальретинин, НМВЕ1 отрицательная.

Заключение молекулярно-генетического исследования: Проведено молекулярно-генетическое исследование в материале опухоли матки и материале опухоли клеточно-волокнистого строения из легкого методом микросателлитного анализа микросателлитов D17S1161, D10S218, D10S1146, D10S24, D10S1213, D9S942, D9S251, D3S1295. Обнаружена ПГ в микросателлитах D3S1295, D9S942, D10S24, характерная для ЛМС матки. Указанные изменения обнаружены как в образце опухоли матки, так и в образце опухоли легкого.

Заключение: с учетом данных иммуногистохимического и генетического исследований, гистологической картины, опухоль матки следует расценивать как высокодифференцированную ЛМС с низкой митотической активностью, а узел, как метастаз ЛМС.

4. Пациентка С. Возраст: 32 лет. Клинические данные: Материал консультативный из Ижевска, невозможно получить более полные клинические данные. Нормальная ДНК получена из периферической венозной крови.

Патологоанатомическое заключение: Готовые стекла не удовлетворительного качества. В препаратах с парафиновых блоков - лейомиома с участками эпителиоидного клеточного строения, отека и гиалиноза. Фигуры митоза не выявляются. Необходимо проведение молекулярно-генетического исследования.

Заключение молекулярно-генетического исследования: Проведено молекулярно-генетическое исследование методом микросателлитного анализа микросателлитов D17S1161, D10S218, D10S1146, D10S24, D10S1213, D9S942, D9S251, D3S1295. Обнаружена МН в микросателлитах D9S251, D3S1295, характерная для ЛМС матки.

Заключение: результаты молекулярно-генетического исследования свидетельствуют в пользу саркоматозного характера процесса.

На Фиг.1 представлена электрофореграмма продуктов микросателлитного анализа микросателлита D10S218 пациентки Б.

Т - дорожка с продуктами амплификации из опухолевой ДНК. Отсутствие второй полосы - ПГ.

N - дорожка с продуктами амплификации из ДНК смежной нормальной ткани. Наличие двух полос - гетерозиготное состояние.

На Фиг.2 представлена электрофореграмма продуктов микросателлитного анализа микросателлита D3S1295 пациентки Б.

Т - дорожка с продуктами амплификации из опухолевой ДНК. Появление третьей дополнительной полосы - МН.

N - дорожка с продуктами амплификации из ДНК смежной нормальной ткани. Наличие двух полос - гетерозиготное состояние.

Способ дифференциальной диагностики лейомиосарком и пролиферирующих (клеточных) лейомиом матки, включающий анализ молекулярно-генетических изменений микросателлитных ДНК в образцах опухолевой ткани, отличающийся тем, что определяют наличие генетических изменений совокупности следующих микросателлитов:
D17S1161, расположенном в локусе 17q23,
D10S1213, расположенном в локусе 10q26.13,
D10S1146 и D10S218, расположенных в локусе 10q22.1
D10S24, расположенном в локусе 10р13,
D9S942, расположенном в локусе 9р21.3,
D9S251, расположенном в локусе 9р21,
D3S1295, расположенном в локусе 3р14.3
в образце опухолевой и образце смежной нормальной ткани или периферической венозной крови путем проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием специфических праймеров, при наличии изменений в форме потери гетерозиготности и/или микросателлитной нестабильности по крайней мере в одном из указанных микросателлитов в образце опухолевой ткани диагностируют злокачественную природу опухоли.



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к медицине, конкретно к онкологии, и касается способа определения ответа пациента млекопитающего с меланомой на лечение агентом, ингибирующим меланому, а именно CHIR-265 или сорафенибом.

Изобретение относится к области медицины. .

Изобретение относится к медицине и касается способа диагностики рака простаты, включающего определение в образце присутствия и/или количества аннексина A3 с помощью моноклонального антитела, специфического к аннексину A3, которое имеет низкую перекрестную реактивность к другим аннексинам и направлено на N-конец аннексина A3, особенно на эпитоп в области аминокислот 1-16 человеческого аннексина A3.
Изобретение относится к медицине, в частности к онкологии, и может быть использовано при лечении больных раком шейки матки. .
Изобретение относится к области медицины, а именно к урологии, и может найти применение для диагностики рака предстательной железы у пациентов с канцер-негативным результатом биопсии предстательной железы.
Изобретение относится к области медицины, а именно к урологии, и касается способа дифференциальной диагностики доброкачественной гиперплазии и рака предстательной железы.

Изобретение относится к медицине, а именно к биохимическим исследованиям в онкологии, и описывает способ прогнозирования возникновения рецидивов рака шейки матки, включающий биохимическое исследование суточной мочи больной, при котором в суточной моче определяют андростерон и этиохоланолон, вычисляют отношение между ними и при величине отношения 0,75 мг/сут и ниже прогнозируют рецидив болезни в первые 2 года, а при величине, превышающей 0,75 мг/сут, - длительный безрецидивный период до 10 лет и более

Изобретение относится к медицине и касается диагностики онкологических заболеваний, в частности диагностики наличия злокачественных новообразований

Изобретение относится к лабораторной диагностике, а именно к одностадийному способу одновременной детекции раковых клеток толстой кишки или элементов раковых клеток толстой кишки в биологическом образце из лимфатических узлов

Настоящее изобретение относится к медицине и описывает способ определения раковых клеток в плевральном выпоте или асцитической жидкости у больных с подозрением на злокачественные новообразования, предусматривающий взятие экссудата у обследуемого больного в количестве 10 мл, причем серозную жидкость из плевральной или брюшной полости обследуемого больного помещают в искусственную среду, где создают давление, необходимое для прохождения всего исследуемого экссудата через калиброванный фильтр с диаметром пор одна тысяча нанометров, при этом опухолевые клетки задерживаются в осадке на калиброванном фильтре, осадок наносят на предметные стекла, которые предварительно обезжиривают и охлаждают для лучшего прилипания опухолевых клеток и высыхания, затем фиксируют мазки - отпечатки трехпроцентным спиртовым раствором Лейшмана в течение 2-4 минут, далее смывают дистиллированной водой и красят азур-эозиновой смесью в соотношении 3:1 продолжительностью 15 минут, после покраски промывают дистиллированной водой, сушат на воздухе и приступают к просмотру под микроскопом. Изобретение обеспечивает сокращение времени обследования, повышение точности определения первичного диагноза у больного, простоту выполнения и доступность. 2 пр., 3 ил.

Настоящее изобретение относится к прогностическому анализу, а также к способу его применения для определения вероятности продуцирования терапевтического ответа в пораженных клетках или тканях на лечение заболевания, имеющего этиологию, связанную с избыточной пролиферацией клеток, с использованием сердечного гликозида. Способ прогнозирования заключается в определении отношения изоформ α-субъединиц Nа,K-АТФазы в пораженных клетках или тканях. Указанный способ может быть использован для предсказания чувствительности рака или опухоли у индивидуума на терапевтическое лечение сердечным гликозидом. Также предложенный способ может быть применен в способе лечения заболевания или расстройства, имеющего этиологию, связанную с избыточной пролиферацией клеток, с использованием композиции, содержащей сердечный гликозид. 3 н. и 56 з.п. ф-лы, 8 табл., 13 ил., 27 пр.

Группа изобретений относится к медицине и может быть использована для обнаружения злокачественных опухолей, включая рак молочной железы, рак почек. Для этого проводят измерение экспрессии полипептида, обладающего способностью связываться посредством реакции антиген-антитело с антителом против белка CAPRIN-1, имеющего любую из аминокислотных последовательностей с четными номерами SEQ ID NO:2-30 списка последовательностей, в образце, полученном из живого организма, посредством реакции антиген-антитело в образце, выделенном из живого организма. Также предложен агент для обнаружения злокачественной опухоли. Группа изобретений обеспечивает высокую чувствительность при диагностике злокачественных опухолей. 2 н. и 16 з.п. ф-лы, 4 ил., 5 пр.

Изобретение относится к области биохимии. Способ идентификации клеток, которые показывают восприимчивость к ингибированию передачи сигнала, в которую вовлечены рецептор фактора роста фибробластов (FGF-R) или его вариант, включающий определение статуса фосфорилирования субстрата 2 рецептора FGF-R (FRS-2), его варианта или его фрагмента, содержащего тирозин, в биологическом образце, в качестве биомаркера такой чувствительности к ингибированию, где в отношении клеток, которые показывают фосфорилирование тирозина FRS-2, можно ожидать, что они покажут восприимчивость к ингибированию передачи сигнала с участием FGF-R. Способ идентификации фосфорилирования в FRS-2, его варианта или его фрагмента, содержащих тирозин, в качестве биомаркера для клеток, тканей или органов. Применение идентификации фосфорилирования в FRS-2, его варианта или его фрагмента, содержащего тирозин, в качестве биомаркера для клеток, тканей или органов, которые показывают гиперактивную передачу сигнала с участием FGF-R. Применение реагента биоспецифического распознавания FGF-R. Способ идентификации клеток, пролиферация которых требует активации рецептора FGF-R. Использование заявленного изобретения позволяет эффективно идентифицировать клетки, которые показывают восприимчивость к ингибированию передачи сигнала, в которую вовлечены рецептор FGF-R, и клеток, пролиферация которых требует активации рецептора FGF, а также осуществляют идентификацию фосфорилирования идентификации фосфорилирования в FRS-2. 5 н. и 5 з.п.ф-лы, 2 табл., 3 ил., 1 пр.

Изобретение относится к способам определения эффективности лиганда ионного канала. Ex vivo способ определения эффективности лиганда ионного канала in vivo в зависимости от присутствия плазмы, включает стадии: a) приведение клетки, экспрессирующей ионный канал, в контакт с i) плазмой животного и ii) лигандом ионного канала и b) определение эффекта лиганда ионного канала на клетку, или a) приведение клетки, экспрессирующей ионный канал, в контакт с i) плазмой животного и ii) соединением, которое определяют как лиганд ионного канала, и b) определение эффекта соединения на клетку, или a) приведение клетки, экспрессирующей ионный канал, в контакт с плазмой животного, которому был введен лиганд ионного канала, и b) определение эффекта лиганда ионного канала на клетку. Способ по изобретению может использоваться для скрининга лекарственного препарата для предупреждения и/или лечения заболевания, затрагивающего дисфункцию ионного канала, особенно для предупреждения и/или лечения сердечно-сосудистого заболевания или рака. Изобретение обеспечивает повышение эффективности способа и снижение затрат на скрининг лекарственных препаратов. 13 з.п.ф-лы, 4 табл., 2 пр., 3 ил.
Наверх