Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления рнк коронавируса



Владельцы патента RU 2720713:

Башкина Ольга Александровна (RU)
Зулькарнеев Эльдар Ринатович (RU)
Гущин Владимир Алексеевич (RU)
Рубальский Евгений Олегович (RU)
Самотруева Марина Александровна (RU)

Изобретение относится к медицине и биологии, а именно к выявлению РНК коронавируса SARS-CoV-2 в образцах биологического материала человека и животных, а также в образцах объектов окружающей среды. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 включает в себя пару праймеров, выбранную из ряда: 5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'. Из пары выбранных праймеров один олигонуклеотид может иметь флуоресцентную метку. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 может дополнительно содержать флуоресцентно-меченный олигонуклеотидный зонд, комплементарный или частично комплементарный нуклеотидной последовательности, фланкированной выбранной парой праймеров. Технический результат изобретения заключается в обеспечении универсальной информативности выявления РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР за счет устранения риска получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР при наличии мутаций в области амплифицируемого участка генома SARS-CoV-2. 2 з.п. ф-лы, 7 пр.

 

Изобретение относится к медицине и биологии, а именно к выявлению РНК коронавируса SARS-CoV-2 в образцах биологического материала человека и животных, а также в образцах объектов окружающей среды.

Коронавирус SARS-CoV-2 является причиной заболевания COVID-2019, вызвавшей пандемию в 2020 году. С целью выявления SARS-CoV-2 Всемирной организацией здравоохранения предложено выделение РНК возбудителя с последующим проведением полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) [https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/laboratory-guidance].

Известные протоколы исследования направлены на выявление специфичных нуклеотидных последовательностей в генах и межгенных промежутках:

- ORF1ab, N [http://ivdc.chinacdc.cn/kyjz/202001/t20200121_211337.html];

- RdRP, Е, N [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2];

- ORF1b-nsp14, N [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/peiris-protocol-16-1-20.pdf?sfvrsn=af1aac73_4];

- S, N [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/method-niid-20200123-2.pdf?sfvrsn=fbf75320_7];

- N [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/conventional-rt-pcr-followed-by-sequencing-for-detection-of-ncov-rirl-nat-inst-health-t.pdf?sfvrsn=42271c6d_4];

- N [https://www.fda.gov/media/134922/download, https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/uscdcrt-pcr-panel-primer-probes.pdf?sfvrsn=fa29cb4b_2];

- RdRP [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/real-time-rt-pcr-assays-for-the-detection-of-sars-cov-2-institut-pasteur-paris.pdf?sfvrsn=3662fcb6_2].

Однако проведенный авторами настоящего изобретения анализ полногеномных нуклеотидных последовательностей SARS-CoV-2, которые получены посредством секвенирования изолятов или клинических образцов, показал частое наличие мутаций (в особенности делеций) в геномах данного коронавируса. В связи с этим основным недостатком приведенных выше аналогов является риск получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР, обусловленных блокированием реакции при наличии мутаций в области амплифицируемого участка. Поэтому выявление РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР с использованием известных синтетических олигонуклеотидов не является универсально информативным при выявлении РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР.

Главной задачей, решаемой изобретением, является обеспечение универсальной информативности выявления РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР за счет устранения риска получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР при наличии мутаций в области амплифицируемого участка генома SARS-CoV-2.

Поставленная задача реализуется за счет того, что набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 включает в себя пару праймеров, выбранную из ряда: 5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'; 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'. Из пары выбранных праймеров один олигонуклеотид может иметь флуоресцентную метку. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 может дополнительно содержать флуоресцентно меченный олигонуклеотидный зонд, комплементарный или частично комплементарный нуклеотидной последовательности, фланкированной выбранной парой праймеров.

В основу заявленного изобретения положена обеспечивающая решение поставленной задачи новая совокупность оригинальных отличительных признаков - выбранных синтетических олигонуклеотидов, которые отжигаются на консервативных участках генома коронавируса SARS-CoV-2 и при этом находятся в геноме SARS-CoV-2 на расстоянии, позволяющем проводить ОТ-ПЦР, а именно: около 300 нуклеотидов или около 900 нуклеотидов.

Указанные консервативные участки генома, фланкирующие вариабельные участки генома и находящиеся на расстоянии друг от друга, составляющем или около 300 нуклеотидов, или около 900 нуклеотидов, которое позволяет проводить ОТ-ПЦР, были выявлены в результате проведенного авторами настоящего изобретения биоинформатического анализа известных полногеномных нуклеотидных последовательностей SARS-CoV-2.

Из патентно-технической литературы и практики лабораторной диагностики COVID-19 неизвестно о наборе синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, который был бы идентичен заявленному.

Отсюда правомерен вывод о соответствия заявленного решения критерию «новизна».

Указанная выше совокупность существенных признаков необходима и достаточна для достижения технического результата - обеспечения универсальной информативности выявления РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР за счет устранения риска получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР при наличии мутаций в области амплифицируемого участка генома SARS-CoV-2.

Предлагаемый набор может быть получен многократно, а, значит, заявленное техническое решение соответствует критерию «промышленная применимость».

Сущность изобретения поясняется на следующих примерах, показывающих получение набора, обеспечивающего универсальную информативность выявления РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР за счет устранения риска получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР при наличии мутаций в области амплифицируемого участка генома SARS-CoV-2. При этом приведенные примеры набора показывают конкретную реализацию заявляемого изобретения, но не ограничивают объем притязаний формулы заявляемого изобретения.

Пример 1. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [http://ivdc.chinacdc.cn/kyjz/202001/t20200121_211337.html]. Проводили обратную транскрипцию с использованием праймера 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля. Затем с использованием полученной кДНК проводили ПЦР в реальном времени с использованием пары праймеров 5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, интеркалирующего красителя SYBR Green I, положительного контроля, отрицательного контроля, с последующим анализом графиков кривых нарастания флуоресценции и кривых плавления продуктов амплификации, анализом продуктов амплификации методом горизонтального гель-электрофореза и секвенирования.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. В результате секвенирования ампликонов ОТ-ПЦР была получена нуклеотидная последовательность, которая подтвердила специфичность ОТ-ПЦР. Анализ графиков кривых плавления и полученных в результате секвенирования нуклеотидных последовательностей показал наличие мутации в геноме коронавируса SARS-CoV-2 из биологического материала в сравнении с положительным контролем.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 2. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3', имеющего флуоресцентную метку, и 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/conventional-rt-pcr-followed-by-sequencing-for-detection-of-ncov-rirl-nat-inst-health-t.pdf?sfvrsn=42271c6d_4]. Проводили обратную транскрипцию с использованием праймера 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля. Затем с использованием полученной кДНК проводили ПЦР в реальном времени с использованием праймера 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', флуоресцентно меченного праймера 5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3', термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля, отрицательного контроля, с последующим анализом графика кривых нарастания флуоресценции.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 3. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/uscdcrt-pcr-panel-primer-probes.pdf?sfvrsn=fa29cb4b_2]. Проводили обратную транскрипцию с использованием праймера 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля. Затем с использованием полученной кДНК проводили ПЦР с использованием пары праймеров 5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля, отрицательного контроля, с последующим анализом продуктов амплификации методом горизонтального гель-электрофореза.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 4. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', - а также флуоресцентно меченный олигонуклеотидный зонд, частично комплементарный нуклеотидной последовательности 5'-TCACTCTTGTAATGTAAACAGATTTAATGTTGCTATTACCAGAGCAAAAGTAGGC-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/method-niid-20200123-2.pdf?sfvrsn=fbf75320_7]. Проводили обратную транскрипцию с использованием праймера 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля. Затем с использованием полученной кДНК проводили ПЦР с использованием пары праймеров 5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', флуоресцентно меченного олигонуклеотидного зонда, частично комплементарного нуклеотидной последовательности 5'-TCACTCTTGTAATGTAAACAGATTTAATGTTGCTATTACCAGAGCAAAAGTAGGC-3', термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля, отрицательного контроля, с последующим анализом графика кривых нарастания флуоресценции.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 5. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/peiris-protocol-16-1-20.pdf?sfvrsn=aflaac73_4]. Проводили обратную транскрипцию с использованием праймера 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля. Затем с использованием полученной кДНК проводили ПЦР с использованием пары праймеров 5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3', термостабильной высокоточной ДНК-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля, отрицательного контроля, с последующим анализом продуктов амплификации методом горизонтального гель-электрофореза и секвенирования по Сэнгеру.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3'. В результате секвенирования ампликонов ОТ-ПЦР была получена нуклеотидная последовательность, которая подтвердила специфичность ОТ-ПЦР.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 6. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из смыва с поверхности предмета быта (расчески) от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/conventional-rt-pcr-followed-by-sequencing-for-detection-of-ncov-rirl-nat-inst-health-t.pdf?sfvrsn=42271c6d_4]. Проводили ОТ-ПЦР в одной пробирке с использованием пары праймеров 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, интеркалирующего красителя SYBR Green I, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля, с последующим анализом графиков кривых нарастания флуоресценции и кривых плавления продуктов амплификации и анализом продуктов амплификации методом горизонтального гель-электрофореза.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'. Анализ графиков кривых плавления показал наличие мутации в геноме коронавируса SARS-CoV-2 из биологического материала в сравнении с положительным контролем.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Пример 7. Был получен набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров: 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3', - а также флуоресцентно меченный олигонуклеотидный зонд, комплементарный нуклеотидной последовательности 5'-GTATGTCCGCAATTTACAACACAGAC-3'. Данный набор был использован для исследования образца РНК, полученного из биологического материала от больного с подозрением на инфекцию COVID-19, который был отрицательным при использовании известной тест-системы для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/peiris-protocol-16-1-20.pdf?sfvrsn=af1aac73_4]. Проводили ОТ-ПЦР в одной пробирке с использованием пары праймеров 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3', флуоресцентно меченного олигонуклеотидного зонда, комплементарного нуклеотидной последовательности 5'-GTATGTCCGCAATTTACAACACAGAC-3', термостабильной ревертазы, ингибитора РНКаз, термостабильного фермента Taq-полимеразы, буфера для постановки реакции, смеси четырех дезоксинуклеотидтрифосфатов, положительного контроля (препарата РНК изолята коронавируса SARS-CoV-2) и отрицательного контроля, с последующим анализом графика кривых нарастания флуоресценции.

В результате проведенного исследования была установлена положительная ОТ-ПЦР с праймерами 5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'.

На основании результатов ОТ-ПЦР была диагностирована инфекция, вызванная коронавирусом SARS-CoV-2.

Таким образом, приведенные примеры доказывают возможность применения при диагностике COVID-19 заявляемого набора синтетических олигонуклеотидов, которые отжигаются на консервативные участки генома коронавируса SARS-CoV-2, что обеспечивает универсальную информативность выявления РНК SARS-CoV-2 на основе ОТ-ПЦР за счет устранения риска получения ложноотрицательных результатов ОТ-ПЦР при наличии мутаций в области амплифицируемого участка генома SARS-CoV-2.

1. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2, включающий в себя пару праймеров, выбранную из ряда:

5'-GGTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-CTTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3';

5'-GTAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TTGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3';

5'-TAAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TGTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3';

5'-AAGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-GTAAAGTTGCCACATTCCTACG-3';

5'-AGAGTCATTTTGCTATTGGCC-3' и 5'-TAAAGTTGCCACATTCCTACG-3';

5'-TGAGTGAAATGGTCATGTGTGG-3' и 5'-AGACCTTGAGATGCATAAGTGC-3'.

2. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 по п. 1, отличающийся тем, что из пары выбранных праймеров один олигонуклеотид имеет флуоресцентную метку.

3. Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 по п. 1, отличающийся тем, что он дополнительно содержит флуоресцентно-меченный олигонуклеотидный зонд, комплементарный или частично комплементарный нуклеотидной последовательности, фланкированной выбранной парой праймеров.



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к биотехнологии, а именно к технологиям поиска новых терапевтических препаратов или комбинаций препаратов (химических соединений), улучшающих существующие терапевтические подходы к лечению рака.

Изобретение относится к биотехнологии. Описаны способы лечения болезни Альцгеймера (AD) у пациентов, страдающих от легкой до умеренной AD, в том числе у пациентов положительным статусом по АроЕ4, и пациентов, страдающих от легкой AD.

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к способу обнаружения c.-124 C>T и c.-146 C>T мутаций в промоторе гена Htert. Упомянутый способ использует реакционную композицию, которая содержит праймеры для амплификации и зонды для генотипирования.

Изобретение относится к области биотехнологии. А именно к: олигонуклеотидному праймеру для выявления гриба Erysiphe necator, выбранному из группы, состоящей из: (I) олигонуклеотидов с нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 1, 3, 4 или 5; (II) олигонуклеотидов с нуклеотидной последовательностью, комплементарной нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 1, 3, 4 или 5; (III) олигонуклеотидов с нуклеотидной последовательностью из по меньшей мере 10 смежных нуклеотидов олигонуклеотидов SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4 или 5 либо из комплементарных им нуклеотидных последовательностей, за исключением (а) конкретного олигонуклеотида с нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 2 и (б) конкретного олигонуклеотида с нуклеотидной последовательностью tcactctgtc, паре олигонуклеотидных праймеров для выявления гриба Erysiphe necator, состоящей из одного прямого олигонуклеотидного праймера и одного обратного олигонуклеотидного праймера, олигонуклеотидному зонду для выявления гриба Erysiphe necator, способу специфичного количественного определения гриба Erysiphe necator, диагностическому набору, используемому для выявления и/или количественного определения гриба Erysiphe necator, включающему по меньшей мере один олигонуклеотидный праймер по п.

Изобретение относится к области медицины. Предложено применение биомаркеров для оценки риска развития осложнений инфекционного мононуклеоза, ассоциированного с вирусом Эпштейна-Барр, где биомаркеры представляют собой гены BCL2L2, BCL2L11, CASP3, CASP7, CASP8, MAP3K14, MCL1, NFKB1 и мРНК BCL2-NM_000633, BCL2L1-NM_138578, BIRC2-NM_001166, TNFRSF10D-NM_003840, TRAF2-NM_021138, RELB-NM_006509, XIAP-NM_001167.

Изобретение относится к области медицины, в частности к онкологии, и предназначено для прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени.

Предложенная группа изобретений относится к области медицины, в частности к биоинформатике. Предложены способ, устройство и носитель долговременного хранения информации для определения степени риска, которая указывает на риск рецидива рака после лечения или риск прогрессирования рака или смерти, где степень риска основана на комбинации выведенных активностей двух или более клеточных сигнальных путей в ткани, и/или клетках, и/или жидкости организма субъекта.

Изобретение относится к области биохимии, в частности к способу идентификации растения канолы, обладающего резистентностью к черной ножке. При этом способ включает детекцию в растении канолы по меньшей мере одного маркера, сцепленного с резистентностью к черной ножке.

Изобретение относится к биотехнологии. Описан олигонуклеотидный ингибитор miR-155, содержащий/состоящий из последовательность/и 5’-lCs.dAs.lCs.dGs.dAs.lTs.lTs.dAs.lGs.dCs.lAs.lTs.lTs.lA-3’ (SEQ ID NO: 25), где l представляет собой замкнутый нуклеотид; d представляет собой дезоксирибонуклеотид; s представляет собой фосфортиоатную связь или олигонуклеотидный ингибитор miR-155, содержащий/состоящий из последовательность/и 5’-lCs.dAs.lCs.dGs.dAs.lTs.lTs.dAs.lGs.lCs.dAs.lTs.lTs.lA-3’ (SEQ ID NO: 53), где l представляет собой замкнутый нуклеотид; d представляет собой дезоксирибонуклеотид; s представляет собой фосфортиоатную связь.

Изобретение относится к области медицины. Предложен автоматизированный способ обнаружения нуклеиновых кислот ВИЧ-1 в образце крови.

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к направляющим РНК, рибонуклеопротеиновым комплексам системы CRISPR/CAS, содержащим направляющие РНК, и наборам, содержащим рибонуклеопротеиновые комплексы системы CRISPR/CAS и специфические олигонуклеотиды для предварительной амплификации высококонсервативных участков генома ВИЧ-1. Изобретение позволяет эффективно выявлять провирусную ДНК ВИЧ-1 после проведения специфической амплификации фрагментов ДНК ВИЧ-1. Изобретение обеспечивает выявление единичных копий провирусной ДНК вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1), интегрированной в геном человека. 3 н. и 2 з.п. ф-лы, 11 ил., 4 табл., 5 пр.
© Патентный поиск, поиск патентов на изобретения - FindPatent.RU 2012-2024
Политика конфиденциальности 2020-03-27 2020-05-13T11:00:03
Наверх