Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов



Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
Способ масс-спектрометрического анализа циклоспоринов
C07K1/14 - Пептиды (пептиды в пищевых составах A23, например получение белковых композиций для пищевых составов A23J, препараты для медицинских целей A61K; пептиды, содержащие бета-лактамовые кольца, C07D; циклические дипептиды, не содержащие в молекуле любого другого пептидного звена, кроме образующего их кольцо, например пиперазин-2,5-дионы, C07D; алкалоиды спорыньи циклического пептидного типа C07D519/02; высокомолекулярные соединения, содержащие статистически распределенные аминокислотные единицы в молекулах, т.е. при получении предусматривается не специфическая, а случайная последовательность аминокислотных единиц, гомополиамиды и блоксополиамиды, полученные из аминокислот, C08G 69/00; высокомолекулярные продукты, полученные из протеинов, C08H 1/00; получение

Владельцы патента RU 2767432:

Баранова Анна Александровна (RU)

Изобретение относится к области аналитической химии и касается масс-спектрометрического различения изомеров циклических пептидов, содержащих β-гидрокси-N-метиламинокислоты, в том числе идентификации циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А. Сущность способа заключается в регистрации масс-спектра с ионизацией распылением в электрическом поле с дальнейшим анализом фрагментации дважды протонированных ионов. Применение этого способа позволяет различить изомеры таких циклических пептидов за счет подавления характерного для них N-O-ацильного сдвига вследствие протонирования β-гидроксильной группы циклического пептида. 7 ил., 2 пр.

 

Область техники, к которой относится изобретение

Изобретение относится к области аналитической химии и касается способа анализа изомеров циклических пептидов, содержащих β-гидрокси-N-метиламинокислоты, в том числе иммуносупрессора циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А, а также других циклоспоринов.

Предшествующий уровень техники

Среди циклических пептидов, содержащих β-гидрокси-N-метиламинокислоты, наибольшее внимание привлекает циклоспорин А - природный циклический ундекапептид, применяющийся в качестве иммуносупрессора в трансплантации органов и костного мозга. Одной из самых распространенных примесей в препаратах циклоспорина А является изоциклоспорин А, представляющий собой циклический депсипептид, образующийся в результате N-O-ацильного сдвига, возможного для циклических пептидов, содержащих β-гидрокси-N-метиламинокислоты [Bonifacio, F.N. et al. J. Pharm.Biomed.Anal., 2009, 49, 540-546]. Большинство ранее использованных подходов для контроля качества и анализа перпаратов циклоспорина А, а также определения его концентрации in vivo, основаны на различных разновидностях жидкостной хроматографии [Shao Y. et al. J.Anal.Sci., 2016, 6, 23-32; Malaekeh-Nikouei B. et al. Chromatographia, 2011, 73, 817-821]. Методы хроматографического анализа и разделения загрязнений фармакологических композиций, содержащих циклоспорин А, продолжают развиваться. Например, в 2019 году запатентован новый подход к контролю загрязнений в глазном геле на основе циклоспорина А [Patent CN108254457A, EP3502683A1, US 2019194258 A1, 2019]. Недостатком хроматографического подхода к различению циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А заключается в необходимости получения стандартов анализируемых соединений для валидации методики при ее применении.

Существенной сложностью при масс-спектрометрическом различении циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А является спонтанная перегруппировка циклоспорина А в его изомер в процесса эксперимента [Jegorov A., J.Mass.Spectrom., 2001, 36, 633-640]. Масс-спектрометрический анализ циклоспоринов и их изомеров, в течение долгого времени проводившийся различными группами исследователей с привлечением разнообразных методов ионизации, фрагментации и детекции заряженных частиц, показал, что анализ фрагментации ионов [M+H]+ циклоспорина А и его изомера не позволяет различить эти соединеиия [ Org.Mass.Spec., 1993, 28, 1440; Kuzma M., J.Mass.Spectrom., 2002, 37. 292]. Предложенный в 2014 году метод различения циклоспорина А и изоциклоспорина А путем тандемной хроматографии и масс спектрометрии с постколоночным добавлением солей двухвалентных металлов оказался эффективен [Cirigliano A.M, Cabrera G.M. Rapid.Commun.Mass.Spectrom., 2014, 28, 465-470], однако требует преодоления существенных технических сложностей и внесения модификаций в стандартное оборудование для хроматомасс-спектрометрии, что делает его затратным. В 2020 году был предложен метод спектроскопии дифференциальной подвижности в сочетании с масс-спектрометрией для разделения изомеров и конформеров дважды протонированных аналогов циклоспорина [BrianLam K. H., YvesLeBlanc J. C., LarryCampbell J. Anal. Chem., 2020, 92, 11053−11061], однако для него также требуется специализированное оборудование.

Раскрытие изобретения

Сущность изобретения заключается в способе различения циклических пептидов, содержащих - β-гидрокси-N-метиламинокислоты и изомерных депсипептидов, образующихся в результате N-O-ацильного сдвига, в частности циклоспорина А и изоциклоспорина А, за счет изучения фрагментации CID дважды протонированных молекул [M+2H]2+. Авторами изобретения обнаружено, что спектры фрагментации дважды протонированных молекул [M+2H]2+, в отличие от спектров фрагментации протонированных молекул пептида [M+H]+, различаются для циклического пептида и изомерного депсипептида за счет подавления спонтанной перегруппировки в депсипептид.

Техническим результатом заявляемого изобретения является качественное различение циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А. Найденный метод может применяться как для анализа индивидуальных препаратов циклических пептидов и изомерных им депсипептидов, так и при хроматомасс-спектрометрическом изучении смесей этих соединений. Также следует отметить более простое аппаратное оформление данного метода в сравнении с ранее описанными подходами: он не требует предварительного получения стандартных образцов соединений и внесения конструктивных изменений в стандартное масс-спектрометрическое оборудование. Кроме того, для всех подобных соединений наблюдается заметно более высокая интенсивность двухзарядных ионов по сравнению с однозарядными благодаря наличию основной боковой цепи в β-гидрокси-N-метиламинокислотах, таким образом описанный метод может обеспечить более высокую чувствительность по сравнению с масс-спектрометическими подходами, включающими регистрацию или фрагментацию однозарядных ионов анализируемых соединений.

Изобретение поясняется подробным описанием, примером осуществления и иллюстрациями, на которых изображено:

Фиг. 1 Структурные формулы циклоспорина А и изоциклоспорина А

Фиг. 2 Масс-спектры циклоспорина А и изоциклоспорина А

Фиг. 3 Спектры фрагментации однозарядных ионов [M+H]+ циклоспорина А и изоциклоспорина А

Фиг. 4 Спектры фрагментации двухзарядных ионов [M+2H]2+ циклоспорина А и изоциклоспорина А

Фиг. 5 Структурные формулы циклоспорина С и изоциклоспорина С

Фиг. 6 Масс-спектры циклоспорина С и изоциклоспорина С

Фиг. 7 Спектры фрагментации двухзарядных ионов [M+2H]2+ циклоспорина С и изоциклоспорина С

Осуществление изобретения

Для качественного анализа циклических пептидов регистрируют масс-спектр с помощью ионизации электрораспылением (ESI) с последующей детекцией любым масс-спектрометрическим детектором в режиме регистрации положительных ионов с возможностью регистрации фрагментации ионов (MS/MS), осуществляют отбор ионов-прекурсоров, соответствующих по соотношению массы и заряда ионам [M+2H]2+, представляющим собой дважды протонированные молекулы анализируемых соединений, затем регистрируют характеристический набор дочерних ионов, в том числе и двухзарядных.

Пример 1 Анализ циклоспорина А и его изомера - изоциклоспорина А.

Изобретение иллюстрируется следующим примером масс-спектрометрического анализа циклоспорина А и его изомера - депсипептида изоциклоспорина А.

Анализируемые образцы массой 100 мкг растворили в 200 мкл метанола для ВЭЖХ (MeOH, “ Biosolve ”). Объем инжектирования составлял 2 μл. Образец пропускали через колонку YMC-Triart C18 (YMC) (50×2.1 мм, размер частиц 1.9 μм) при 30°C. В качестве элюента А использовали деионизированную воду (тридистиллят) с добавкой муравьиной кислоты (0.1% LC/MS grade formic acid, HCOOH, “Honeywell”), элюент В представлял собой ацетонитрил с такой же добавкой кислоты (LC/MS grade acetonitrile, MeCN, “Biosolve”). Колонку элюировали при 0.35 мл/мин: 0-10 мин 98:2 → 2:98 (A:B); 10-12 мин 2:98 → 98:2 (A:B).

Условия источника ионизации электрораспылением (ESI) в режиме положительных ионов были следующими: температура, 335°C; давление распылителя, 30 psi (N2); Поток газа-осушителя, 10 л/мин (N2); напряжение на капилляре, -3500 V. Параметры регистрации были следующими: MS1 Scan range, m/z 420-2200 Да (8100 Да/сек). Параметры MS2: Scan range, m/z 50-2200 Da (8100 Да/сек); количество ионов-прекурсоров, 3; порог отбора на MS2, 2×106; амплитуда фрагментации, 1.00 V. Программное обеспечение: “Chemstation for LC 3D systems” (rev. B.01.03 SR1) (Agilent Technologies, США), “6300 Series Ion Trap LCMS Software” (6300 Series TrapControl v. 6.2 и DataAnalysis for 6300 Series Ion Trap LC/MS v. 3.4, Bruker Daltonik GmbH) было использовано для просмотра, процессинга (обработки), деконволюции и анализа получаемых спектральных данных.

Масс-спектры образцов, содержащих циклоспорин А и изоциклоспорин А содержали как однозарядные ионы [M+H]+ c m/z 1203 Да, так и двухзарядные дважды протонированные ионы [M+H]2+ с m/z 602 Да и более высокой интенсивностью (Фиг. 2). При этом спектры фрагментации MS/MS однозарядных ионов для циклоспорина А и изоциклоспорина А были полностью идентичны (Фиг. 3).

Для образцов, содержащих циклоспорин А получали спектр фрагментации двухзарядного иона с массой 602 Да (Фиг. 4, верхний спектр), содержащий ключевые характеристические дочерние ионы с высокой интенсивностью: двухзарядные ионы с m/z 546 Да и 482 Да; однозарядные ионы с m/z 907 Да (80-100%), 935 Да (40-60%).

Для образцов, содержащих изоциклоспорин A, получали спектр фрагментации двухзарядного иона с массой 602 Да (Фиг 4, нижний спектр), содержащий ключевые характеристические дочерние ионы с высокой интенсивностью: двухзарядные ионы с m/z 593 Да и 550 Да, однозарядные ионы с m/z 1076 Да (25-50%), 1058 Да (20-40%), а также серию других однозарядных ионов с m/z в интервале 900-1000 Да, имеющих невысокую интенсивность (10-30%) и массовый инкремент в 18 единиц массы, как правило отвечающий потере воды (пары 963-945 Да, 1005-987 Да, 934-916 Да).

Пример 2. Анализ циклоспорина С и его изомера - изоциклоспорина С.

Анализируемые образцы массой 100 мкг растворили в 200 мкл метанола для ВЭЖХ (MeOH, “ Biosolve ”). Объем инжектирования составлял 2 μл. Образец пропускали через колонку YMC-Triart C18 (YMC) (50×2.1 мм, размер частиц 1.9 μм) при 30°C. В качестве элюента А использовали деионизированную воду (тридистиллят) с добавкой муравьиной кислоты (0.1% LC/MS grade formic acid, HCOOH, “Honeywell”), элюент В представлял собой ацетонитрил с такой же добавкой кислоты (LC/MS grade acetonitrile, MeCN, “Biosolve”). Колонку элюировали при 0.35 мл/мин: 0-10 мин 98:2 → 2:98 (A:B); 10-12 мин 2:98 → 98:2 (A:B).

Условия источника ионизации электрораспылением (ESI) в режиме положительных ионов были следующими: температура, 335°C; давление распылителя, 30 psi (N2); Поток газа-осушителя, 10 л/мин (N2); напряжение на капилляре, -3500 V. Параметры регистрации были следующими: MS1 Scan range, m/z 420-2200 Да (8100 Да/сек). Параметры MS2: Scan range, m/z 50-2200 Da (8100 Да/сек); количество ионов-перкурсоров, 3; порог отбора на MS2, 2×106; амплитуда фрагментации, 1.00 V. Программное обеспечение: “Chemstation for LC 3D systems” (rev. B.01.03 SR1) (Agilent Technologies, США), “6300 Series Ion Trap LCMS Software” (6300 Series TrapControl v. 6.2 и DataAnalysis for 6300 Series Ion Trap LC/MS v. 3.4, Bruker Daltonik GmbH) было использовано для просмотра, процессинга (обработки), деконволюции и анализа получаемых спектральных данных.

Масс-спектры образцов, содержащих циклоспорин С и изоциклоспорин С содержали как однозарядные ионы [M+H]+ c m/z 1219 Да, так и двухзарядные дважды протонированные ионы [M+H]2+ с m/z 610 Да и более высокой интенсивностью (Фиг. 6).

Для образцов, содержащих циклоспорин С получали спектр фрагментации двухзарядного иона с массой 610 Да (Фиг.7, нижний спектр), содержащий ключевые характеристические дочерние ионы с высокой интенсивностью: двухзарядный ион с m/z 554 Да; однозарядные ионы с m/z 923 Да (80-100%), 941 Да (40-60%).

Для образцов, содержащих изоциклоспорин С, получали спектр фрагментации двухзарядного иона с массой 610 Да (Фиг. 7, верхний спектр), содержащий ключевые характеристические дочерние ионы с высокой интенсивностью: двухзарядные ионы с m/z 601 Да и 559 Да, однозарядные ионы с m/z 1092 Да (25-50%), 1074 Да (20-40%), а также серию других однозарядных ионов с m/z в интервале 800-1000 Да, имеющих невысокую интенсивность (10-30%) и массовый инкремент в 18 единиц массы, как правило отвечающий потере воды (например, пары 805-823 Да, 922-940 Да).

Промышленная применимость

Изобретение может быть использовано для контроля примесей в лекарственных препаратах на основе циклоспорина А, а также для изучения других циклических пептидов, содержащих - β-гидрокси-N-метиламинокислоты. В настоящих материалах заявки было представлено предпочтительное осуществление заявленного изобретения, которое не должно использоваться как ограничивающее иные, частные воплощения его реализации, которые не выходят за рамки испрашиваемого объема правовой охраны и являются очевидными для специалистов в соответствующей области техники.

Способ идентификациии циклоспорина А и его изомера изоциклоспорина А, заключающийся в регистрации масс-спектров анализируемых соединений при ионизации электрораспылением с последующей регистрацией спектров фрагментации двухзарядных дважды протонированных ионов, за счет характеристических дочерних ионов в таких спектрах, в том числе двухзарядных.



 

Похожие патенты:

Изобретение относится к области аналитического приборостроения, а именно к масс-спектрометрии, время-пролетной масс-спектрометрии. Технический результат - увеличение пропускания ионного тока, упрощение конструкции и технологии изготовления.

Изобретение относится к лабораторной диагностике и может быть использовано для получения сухих образцов крови человека и последующего проведения лабораторного анализа для скринингового полуколичественного определения 11 аминокислот и/или токсичных микроэлементов, таких как свинец, кадмий, мышьяк, таллий, ртуть.

Группа изобретений относится к способам оценки качества партии композиции на основе лекарственных трав. Способ оценки качества и потенциальной in vivo активности тестируемой партии композиции на основе лекарственных трав, включающий анализ тестируемой партии композиции на основе лекарственных трав одним или несколькими методами биологического анализа, выбранными из: (a) анализа ответа, связанного с активностью сигнальной трансдукции, который включает измерение ответа, связанного с активностью сигнальной трансдукции, против одного или более сигнальных путей, выбранных из группы, состоящей из TNFa-NFkB, TLR2-NFkB, TLR4-NFkB, IL6-stat3, IFNg-stat1/1, IFNa-stat1/2, DEX-GR, COX-2, iNOS, NRF2, TGFb-Smad2/3, TPA-AP1, CREB, wnt3a-Lef/b-cat, VD3-VDR, ER-alpha, ER-beta, DHT-AR и альдостерона-MR; и (b) анализа экспрессии генов, где анализ экспрессии генов включает количественное определение одного или нескольких генов, кодирующих белки, выбранных из группы, состоящей из ICAM, IRF5, AKR1C1, HO1, GCLC, GCLM, Axin2, GDF15, IGFBP3, OKL38, PIM1, SERTAD, SOS1, BHMT2, CPT1A, SLC7A11, CD24, EMP2 и KRT23; и затем сравнение результатов биологического анализа тестируемой партии с результатами, полученными для известной партии композиции на основе лекарственных трав, которая имеет известный уровень in vivo активности; где, если результаты, полученные для тестируемой партии, имеют коэффициент корреляции от 0,95 до 1,0 с результатами, полученными для известной партии, тестируемую партию определяют как имеющую качество, в достаточной степени соответствующее качеству известной партии, и потенциальную in vivo активность (варианты).

Изобретение относится к пищевой промышленности. Способ раздельного определения органического и неорганического мышьяка в морепродуктах заключается в отборе образцов, их обработке с получением гомогенизированного влажного или сухого образца, которые помещают в пробирки, проведении экстракции каждого образца раствором 3% по массе перекиси водорода в 0,055 М соляной кислоте на деионизованной воде, на водяной бане с шейкером при температуре 95°С в течение 45 мин, затем охлаждении до комнатной температуры, центрифугировании в течение 10 минут при 4000 об/мин, затем перенесении супернатантов в полипропиленовые пробирки с доведением деионизованной водой до объема 10 см3, определении содержания общего мышьяка в 5 см3 отобранного образца супернатанта, разделении мышьяка на органическую и неорганическую фракции в 3 см3 оставшегося количества отобранного образца, причем дополнительно во время проведения экстракции образец подвергают ручному встряхиванию пробирки через каждые 10 мин, а определение количества общего мышьяка, органического и неорганического мышьяка проводят на квадрупольном масс-спектрометре с индуктивно связанной плазмой ICP-MS автоматически.

Изобретение относится к биотехнологии. Предложен способ диагностики вирусов и вирусных инфекций in vitro и in vivo.

Группа изобретений относится к области химии, а именно к способу неразрушающей идентификации половой характеристики эмбриона Gallus gallus domesticus in ovo и к способу селективной инкубации птенцов видов яйцекладущих со специфической половой характеристикой. Способ неразрушающей идентификации половой характеристики эмбриона Gallus gallus domesticus in ovo включает: получение образца материала, ассоциированного с яйцом, содержащим эмбрион, - аллантоисной жидкости эмбриона, измерение значения оценки на наличие и концентрацию по меньшей мере первого биомаркера - 3-[(2-аминоэтил)сульфанил]бутановой кислоты в образце, указывающего на половую характеристику эмбриона, применение порога к значению оценки и концентрации для идентификации половой характеристики для эмбриона, причем концентрация первого биомаркера, составляющая 50 нг/мл или больше в аллантоисной жидкости эмбриона в дни 7, 8 или 9, коррелирует с эмбрионом женского пола, тогда как наличие первого биомаркера, присутствующего при менее чем 50 нг/мл, коррелирует с эмбрионом мужского пола.

Изобретение относится к медицине и касается способа дифференциальной диагностики стеатоза печени и неалкогольного стеатогепатита у мужчин. Сущность способа заключается в том, что определяют соотношение концентрации 3-гидроксимасляной и 3-метил-2-оксовалериановой кислот, определенных хроматографическим методом в образце венозной крови пациента.

Изобретение относится к медицине и касается способа дифференциальной диагностики стеатоза печени и неалкогольного стеатогепатита у мужчин. Сущность способа заключается в том, что определяют соотношение концентрации 3-гидроксимасляной и 3-метил-2-оксовалериановой кислот, определенных хроматографическим методом в образце венозной крови пациента.

Изобретение относится к cпособу определения концентрации полиглутаматов метотрексата, включающему забор венозной крови пациента, отделение образца эритроцитарной массы, выделение из него полиглутаматов метотрексата посредством проведения реакции преципитации и определение концентрации полиглутаматов метотрексата с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии с масс-спектрометрическим детектированием (ВЭЖХ-МС-МС), причем отделенный образец эритроцитарной массы перед выделением из него полиглутаматов метотрексата замораживают при температуре -80±2°С с последующим размораживанием при температуре 6-10°С, при этом реакцию преципитации проводят при температуре 6-10°С посредством введения в образец подкисленного ацетонитрила, его интенсивного перемешивания с последующим центрифугированием при 12000±10 rpm в течение 15±2 мин и отбора верхнего слоя, содержащего полиглутаматы метотрексата для последующего анализа на ВЭЖХ-МС-МС.

Изобретение относится к медицине, а именно к клинической диагностике, и может быть использовано для выявления сахарного диабета первого типа у беременных. Осуществляют забор образца крови пациента; пробоподготовку образца крови пациента с получением аналита; определение содержания в качестве маркера сахарного диабета первого типа в аналите белка Angiotensinogen и/или Apolipoprotein С-III и/или Vitronectin.

Изобретение относится к области биотехнологии. Предложены гетеродимерные антитела, направленные против PD-1 и CTLA-4.
Наверх